دينامو الحمض النووي
DNADynamo هو برنامج تجاري لتحليل تسلسل الحمض النووي، من إنتاج شركة Blue Tractor Software Ltd [1]، ويعمل على أنظمة تشغيل مايكروسوفت ويندوز، وماك أو إس إكس، ولينكس [ 2 ] . يستخدمه علماء الأحياء الجزيئية [ 3 ] لتحليل تسلسلات الحمض النووي والبروتينات . تتوفر نسخة تجريبية مجانية على موقع مطوري البرنامج.
سمات
DNADynamo عبارة عن حزمة برامج عامة لتحليل تسلسل الحمض النووي والبروتين، ويمكنها تنفيذ معظم الوظائف المطلوبة من قبل مختبر أبحاث بيولوجيا جزيئية قياسي.
- عرض وتحرير وشرح تسلسل الحمض النووي والبروتين
- تجميع القطع المتجاورة وتحرير مخطط الكروماتوجرام ، بما في ذلك المقارنة بتسلسل مرجعي لتحديد الطفرات.
- محاذاة التسلسل العالمي باستخدام ClustalW و MUSCLE والتحرير.
- حدد واسحب لتحرير محاذاة التسلسل لإجراء محاذاة يدوية بين الحمض النووي والبروتين
- تحليل مواقع التقييد - لعرض مواقع قطع التقييد في الجداول وعلى الخرائط الخطية والدائرية.
- أداة استنساخ فرعي لتجميع التركيبات باستخدام مواقع التقييد أو تجميع جيبسون ،
- محاكاة هلام الأغاروز .
- البحث في قواعد البيانات عبر الإنترنت - ابحث في قواعد البيانات العامة في المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) مثل Genbank و UniProt .
- عمليات البحث عبر الإنترنت باستخدام BLAST .
- تحليل البروتين بما في ذلك تقدير الوزن الجزيئي ومعامل الامتصاص ونقطة التعادل الكهربائي.
- تصميم بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) ، بما في ذلك واجهة لبرنامج Primer3
- عرض الهيكل ثلاثي الأبعاد عبر واجهة Jmol
تاريخ
تم تطوير DNADynamo منذ عام 2004 بواسطة BlueTractorSoftware Ltd، وهي شركة لتطوير البرمجيات مقرها في شمال ويلز، المملكة المتحدة [ 4 ].
مراجع
- ↑ "الرئيسية" . bluetractorsoftware.co.uk .
- ↑ "متطلبات النظام لتشغيل DNADynamo" .
- ↑ اقتباسات جوجل سكولار
- ↑ "نبذة عن شركة بلو تراكتور سوفتوير المحدودة" .
روابط خارجية
فئات :
- برامج المعلوماتية الحيوية
- العلوم الحاسوبية
