قائمة علامات Y-STR

📅 آخر تحديث: ٢٥ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٥ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

تُستخدم علامات Y-STR في القائمة التالية بشكل شائع في اختبارات الحمض النووي الجنائية [ 1 ] واختبارات الأنساب .

يُعد DYS454 الأقل تنوعًا، بينما يُعد DYS464 متعدد النسخ أكثر علامات Y-STR تنوعًا .

يمكن تحديد موقع علامات Y-STR المرقمة على الكروموسوم Y تقريبًا باستخدام التحديد الخلوي الجيني . على سبيل المثال، يقع DYS449 في Yp11.2 - أي الكروموسوم Y، الذراع الصغير، النطاق 1، النطاق الفرعي 1، النطاق الفرعي الفرعي 2 - DYS449. [ 2 ]

تستخدم مختبرات الطب الشرعي عادةً مجموعات PowerPlex Y (من شركة بروميج) وYfiler (من شركة أبلايد بيوسيستمز) التي تفحص 12 أو 17 علامة Y-STR على التوالي. أما مختبرات اختبار الحمض النووي للأنساب فتفحص ما يصل إلى 700 علامة Y-STR.

معدلات الطفرات

معدلات الطفرات هي تلك التي تحدث لكل جيل، كما هو مُقدَّر في دراسة تشاندلر (2006). [ 3 ] تتراوح نسبة الخطأ المُقدَّرة عادةً بين ± 15-20%. تتوفر أيضًا تقديرات بديلة (لأغراض الطب الشرعي ، وبالتالي لا تشمل جميع المؤشرات) من الأنساب المرصودة في قاعدة بيانات مرجع النمط الفرداني للكروموسوم Y.

يبدو أن بعض المؤشرات ثلاثية النوكليوتيدات قد تُظهر معدلات طفرات أعلى بكثير عند أطوال تكرار معينة مقارنةً بأطوال أخرى. على سبيل المثال، يكون تباين ثلاثي النوكليوتيدات DYS388 بطيئًا جدًا بشكل عام في معظم المجموعات الفردانية، حيث تتراوح قيمه بين 11 و13. ولكن يبدو أن هناك تباينًا أكبر وطفرة أسرع في المجموعة الفردانية J ، حيث تتراوح قيمه عادةً بين 14 و18. وبالمثل، يُذكر أن ثلاثي النوكليوتيدات DYS392 "سريع" في المجموعتين الفردانيتين N و Q ، حيث تتراوح قيمه بين 14 و16، وهي قيم نادرة في المجموعات الأخرى. [ 4 ]

علامات Y-STR

القوةملحوظاتنمط تكرار تسلسل الحمض النوويالأليلاتمعدل الطفرةروابط
DYS19=14انظر DYS394————
DYS385DYS385 هو مؤشر متعدد النسخ، ويشمل DYS385a وDYS385b. يمكن عكس ترتيب DYS385a وDYS385b، ويُشار إلى تسلسلهما بترتيب كيتلر.GAAA13-180.00226صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS388AT&T170.00022 [ 5 ]
DYS389DYS389 هو مؤشر متعدد النسخ، ويشمل DYS389i وDYS389ii. يشير DYS389ii إلى الطول الإجمالي لـ DYS389. لذلك، عند حدوث طفرة أحادية الخطوة في DYS389i، ستظهر أيضًا في DYS389ii.(TCTG) (TCTA) (TCTG) (TCTA)i:13 ii:300.00186، 0.00242صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS390(TCTA) (TCTG)230.00311صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS391TCTA110.00265صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS392TAT110.00052 [ 5 ]صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS393يُعرف DYS393 أيضًا باسم DYS395 .أغات120.00076صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS394يُعرف DYS394 أيضًا باسم DYS19 .تاجا140.00151صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS413يوجد في المنطقة المتناظرة من الحمض النووي Y21-22
DYS425يُعدّ DYS425 مستقرًا للغاية عند إمكانية قياسه. مع ذلك، فهو في الواقع نسخة واحدة من علامة متعددة الأجزاء، DYF371 (المذكورة أدناه)، ولذلك قد تجعله طفرات recLOH غير قابل للقياس في كثير من الأحيان عندما تستبدله النسخ الأخرى. على سبيل المثال، يرتبط هذا المؤشر بالعلامة الجينية المحددة للسلالة I-M38 (I2a2a1a1؛ سابقًا I1b2a1)، حيث يمكن أن تُعطي العلامة الجينية M284 قيمة فارغة عند هذه العلامة. كما تُعطي معظم أفراد السلالة E-M96 وفروعها قيمًا فارغة أيضًا. مع ذلك، كان هذا المؤشر من بين عدد قليل من العلامات التي قدمتها شركة Oxford Ancestors في البداية ، واختارت شركة Family Tree DNA لاحقًا تقديمه لعلماء الأنساب أيضًا.TGT12[ 5 ]
DYS426جي تي تي110.00009 [ 5 ]صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS434TAAT (CTAT)9صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS435TGGA 11
DYS436جي تي تي12[ 5 ]
DYS437TCTA140.00099صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS438TTTTC100.00055صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS439يُعرف DYS439 أيضًا باسم Y-GATA-A4 . ويرتبط DYS439 بالعلامة الجينية المحددة للمجموعة الفردانية R1b1c9a، حيث يمكن أن تُنتج هذه العلامة قيمة فارغة عند هذا المؤشر.أغات120.00477صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS441CCTT15نظام تفاعل البوليميراز المتعدد الجديد
DYS442TATC110.00324نظام تفاعل البوليميراز المتعدد الجديد
DYS443TTCC 0
DYS444تاجا11نظام تفاعل البوليميراز المتعدد الجديد
DYS445TTTA11نظام تفاعل البوليميراز المتعدد الجديد
DYS446TCTCT14تفاصيل علامة سورنسون
DYS447تا وا​260.00264صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS448أجاجات200.00135صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS449TTTC250.00838تفاصيل علامة سورنسون
DYS450TTTTA8
DYS452Y ATAC29
DYS453AAAT0
DYS454
يُعدّ DYS454 أقلّ علامات Y-STR تباينًا، ويُستخدم عادةً في اختبارات الحمض النووي للأنساب. من بين مدخلات DYS454 في قاعدة بيانات Ybase ، تحتوي 96% منها على 11 تكرارًا، و3% على 10 تكرارات، و2% على 12 تكرارًا ( المصدر ).AAAT110.00016
DYS455AAAT110.00016تفاصيل علامة سورنسون
DYS456أغات140.00735تفاصيل علامة سورنسون
DYS458GAAA180.00814تفاصيل علامة سورنسون
DYS459هذا علامة متعددة النسخ، ويتضمن DYS459a و DYS459b.TAAA8-90.00132
DYS460كان DYS460 يُعرف في الأصل باسم Y-GATA-A7.1.أتاغ100.00402صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS461كان DYS461 يُعرف في الأصل باسم Y-GATA-A7.2.(تاغا) كاغا11صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS462TATG11
DYS463AA R GG22
DYS464
DYS464 هو مؤشر متناظر متعدد النسخ. عادةً ما يمتلك الرجال أربع نسخ منه، وتُعرف هذه النسخ بـ DYS464a وDYS464b وDYS464c وDYS464d. قد يكون عدد النسخ أقل من أربع، أو أكثر، وفي هذه الحالة تُعرف بـ DYS464e وDYS464f، وهكذا. يتميز DYS464 بنطاق قيم واسع للغاية، وهو الأكثر تنوعًا بين جميع مؤشرات Y-STR ( المصدر ). يمكن أحيانًا تحديد نمط هذا المؤشر باستخدام نمطين منفصلين g وc لزيادة الدقة. يعتمد تباين النمط على تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP) الموجود لدى معظم ذكور المجموعة الفردانية R1b. وهو جزء من المنطقة المتناظرة في الحمض النووي Y.CCTT12-14-16-170.00566القيمة الجنائية لعلامة Y-STR متعددة النسخ DYS464

اختبار DYS464X التناقضات في DYS464

DYS481CTT26[ 5 ]
DYS485TTA15[ 5 ]
DYS487AT&T13[ 5 ]
DYS490TTA12[ 5 ]
DYS494TAT9[ 5 ]
DYS495AAT15[ 5 ]
DYS497TAT15[ 5 ]
DYS50414
DYS505TCCT13
DYS508TATC0
DYS518AAAG0مجموعات الاتصالات التابعة للمعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS520أتا إس21
DYS522غاتا13
DYS525تاجا10
DYS531AAAT11
DYS532CTTT10
DYS533ATCT11
DYS534CTTT15
DYS540TTAT11
DYS549أغات13
DYS556AATA12
DYS557TTTC18
DYS565TAAA11
DYS570TTTC12-230.00790
DYS572AAAT12
DYS573TTTA0
DYS575AAAT8-12
DYS576AAAG170.01022
DYS578AAAT8
DYS589TTATT11
DYS590TTTTG8
DYS594تااا10
DYS607AAGG140.00411
DYS612
DYS614
DYS626AAAG
DYS627AAAG0مجموعات الاتصالات التابعة للمعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYS632قطة8
DYS635يُعرف أيضًا باسم Y-GATA-C4مركب T S STA210.0046صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا (NIST) مؤرشفة بتاريخ 23 يناير 2018 على موقع Wayback Machine
DYS63611
DYS638TTTA11
DYS641TAAA10
DYS643CTTTT9
DYS710GAAA36
DYS714TTTTC25
DYS716CCATT27
DYS717TGTAT20
DYS724متناظر؛ يُعرف أيضًا باسم CDY33-350.03531
DYS725متناظر
DYS726علامة YSTR في المنطقة المحيطة بالمركز.12
DYF371DYF371 هو مؤشر منطقة متناظرة متعددة النسخ. يتضمن المؤشر DYS425 ويمكن أن يكون مفيدًا في حالات القيم الصفرية عند هذا المؤشر.12
DYF385S1علامة YSTR مكررة بالقرب من DYS4598-9
DYF387S1 أ/براج0مجموعات الاتصالات التابعة للمعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
DYF397DYF397 هو علامة منطقة متناظرة.
DYF399
موقع STR غير متماثل بثلاثة أليلات يمكن استخدامه لمراقبة عمليات الحذف وإعادة الترتيبات التأشيبية في المنطقة المتناظرة من الكروموسوم Y.17-29 (العديد من الأليلات غير المكتملة)التسمية
DYF401DYF401 هو علامة منطقة متناظرة.
DYF406S111
DYF408DYF408 هو علامة منطقة متناظرة.
DYF411DYF411 هو علامة منطقة متناظرة.
DXYS156
YCAIIYCAII عبارة عن علامة متعددة النسخ تتضمن YCAIIa و YCAIIb22-220.00123
Y-GATA-H4تاجا100.00208صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
Y-GATA-C4انظر DYS635
Y-GATA-A10تاجا14صحيفة حقائق المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
Y-GGAAT-1B0711

تسميات أليلات Y-STR

تستخدم شركات أو مختبرات فحص الحمض النووي في بعض الحالات تسميات مختلفة للإشارة إلى نفس أليل Y-STR. لذا، يجب تطبيق تحويل في هذه الحالات لمقارنة نتائج Y-STR التي تم الحصول عليها من شركات مختلفة بدقة. وتستند التسمية الأكثر شيوعًا إلى إرشادات المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا (NIST) لعلامات Y-STR التي تم الإبلاغ عنها تاريخيًا بشكل مختلف من قبل الشركات المختلفة. ويُعد معيار NIST هو اقتراح الجمعية الدولية لعلم الأنساب الجيني ( ISOGG ) لشركات علم الأنساب الجيني. [ 6 ] [ 7 ]

ملاحظات ومراجع

  1. ↑ "مقابلة مع جون بتلر وأعضاء فريق مشروع الهوية البشرية التابع للمعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا" . JoGG. مؤرشف من الأصل في 1 يوليو 2016. تم الاطلاع عليه في 11 أغسطس 2012 .
  2. ↑ DYS449 في قاعدة بيانات الجينوم البشري GDB
  3. ↑ تشاندلر (2006) مؤرشف بتاريخ 29-06-2016 في Wayback Machine (ولكن انظر أيضًا مناقشة القائمة البريدية هذه )
  4. ↑ "أرشيفات علم الأنساب - الحمض النووي - L - معدل طفرة DYS 388؟" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 2007-10-03 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2007-02-27 .
  5. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 ثلاثي النوكليوتيدات - انظر معدلات الطفرات
  6. ↑ "معايير العلامات" . مؤسسة سورنسون لعلم الأنساب الجزيئي. مؤرشف من الأصل في 21 يوليو 2012. تم الاطلاع عليه في 11 أغسطس 2012 .
  7. ↑ ماثيسن، ديانا غيل (19 يوليو 2011). "تحويل نتائج اختبار Y-DNA STR بين SMGF و AncestryDNA و FamilyTreeDNA" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 أغسطس 2012 .
  • كايزر وآخرون (2004)، دراسة شاملة للميكروساتلايتات على الكروموسوم Y البشري ، المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية، 74، 1183-1197. ملاحظة: ملف بيانات متاح عبر الإنترنت فقط
  • كراهن، توماس. "بصمة Y-STR - لوحات" (ملف PDF) . قائمة أسعار بصمة الحمض النووي - خدمات اختبار الأنساب . مؤرشف من الأصل (ملف PDF) بتاريخ 27 مارس 2023. تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 أغسطس 2012 .
  • باتلر، جون م. (9 يناير 2012). "تكرارات ترادفية قصيرة على الكروموسوم Y" . الحمض النووي لتكرارات ترادفية قصيرة . قاعدة بيانات المراجع القياسية للمعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا SRD 130. مؤرشف من الأصل في 5 فبراير 2023. تم الاطلاع عليه في 11 أغسطس 2012 .
  • باتلر، جون؛ كلاين، ديكر (29 يونيو 2009). "قائمة موجزة لمواقع STR على الكروموسوم Y والبيانات المتاحة" . قاعدة بيانات المراجع القياسية NIST SRD 130. مؤرشفة من الأصل في 9 يونيو 2019. تم الاطلاع عليها في 11 أغسطس 2012 .

انظر أيضاً