منحنى كارلسون

التكلفة الإجمالية لتسلسل الجينوم البشري بمرور الوقت كما تم حسابها بواسطة المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري (NHGRI) .

منحنى كارلسون مصطلح يُستخدم لوصف معدل تسلسل الحمض النووي أو تكلفة كل قاعدة متسلسلة كدالة للزمن. [ 1 ] وهو المكافئ التقني الحيوي لقانون مور . توقع كارلسون أن يكون زمن تضاعف تقنيات تسلسل الحمض النووي (مقاسًا بالتكلفة والأداء) على الأقل بنفس سرعة قانون مور. [ 2 ]

تاريخ

صاغت مجلة الإيكونوميست هذا المصطلح [ 3 ] وهو مشتق من اسم الكاتب روب كارلسون . [ 1 ]

توضح منحنيات كارلسون الانخفاضات السريعة (في بعض الحالات أعلى من النمو الأسي ) في التكلفة، والزيادات في الأداء، لمجموعة متنوعة من التقنيات، بما في ذلك تسلسل الحمض النووي، وتخليق الحمض النووي ، ومجموعة من الأدوات الفيزيائية والحسابية المستخدمة في إنتاج البروتين وفي تحديد هياكل البروتين .

تقنية التسلسل من الجيل التالي

قسم التسلسل في شركة BGI هونغ كونغ، يعرض أجهزة التسلسل Illumina Hiseq 2000

بدأ قانون مور في التخلف بشكل كبير في يناير 2008 عندما انتقلت المراكز من تسلسل سانجر إلى تقنيات تسلسل الحمض النووي الأحدث: [ 4 ] تسلسل 454 بمتوسط ​​طول قراءة = 300-400 قاعدة (10 أضعاف) تسلسل Illumina و SOLiD بمتوسط ​​طول قراءة = 50-100 قاعدة (30 ضعفًا).

مراجع

  1. 1 2 روبرت هـ. كارلسون (أبريل 2011). علم الأحياء هو التكنولوجيا  : الوعد والمخاطر والأعمال التجارية الجديدة لهندسة الحياة . كامبريدج، ماساتشوستس: مطبعة جامعة هارفارد .
  2. روبرت كارلسون (سبتمبر 2003). "وتيرة وانتشار التقنيات البيولوجية" . الأمن البيولوجي والإرهاب البيولوجي: استراتيجية الدفاع البيولوجي وممارسته وعلمه . 1 (3: 203-214): 203-214 . doi : 10.1089/153871303769201851 . PMID 15040198 . 
  3. "الحياة 2.0" . مجلة الإيكونوميست. 31 أغسطس 2006.
  4. "تكاليف تسلسل الحمض النووي" . المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري .