ديبسيببتيد

الموسوعة الحرة

الديبسيببتيد هو ببتيد يتم فيه استبدال مجموعة أميد واحدة أو أكثر، -C(O)NHR-، بالإستر المقابل ، -C(O)OR-. [1] تحتوي العديد من الديبسيببتيدات على روابط ببتيدية وإسترية. [2] يؤدي إزالة مجموعة N-H في بنية الببتيد إلى انخفاض قدرة الرابطة الهيدروجينية، وهي المسؤولة عن البنية الثانوية وأنماط طي الببتيدات، وبالتالي تحريض التشوه الهيكلي للهياكل الحلزونية وصفائح بيتا. [2] [3] بسبب انخفاض عدم توطين الرنين في الإسترات بالنسبة للأميدات، فإن الديبسيببتيدات لها حواجز دورانية أقل لمزامرة السيس-ترانس وبالتالي لديها هياكل أكثر مرونة من نظائرها الأصلية. [2] [3] توجد بشكل أساسي في المنتجات الطبيعية البحرية والميكروبية. [4]

مثال على ديبسيببتيد به 3 مجموعات أميد (مميزة باللون الأزرق ) ومجموعة إستر واحدة (مميزة باللون الأخضر ). R1 ​​و R3 عبارة عن مجموعات عضوية (مثل الميثيل) أو ذرة هيدروجين موجودة في أحماض ألفا هيدروكسي كربوكسيلية. R2 و R4 و R5 عبارة عن مجموعات عضوية أو ذرة هيدروجين موجودة في الأحماض الأمينية الشائعة.

منتجات طبيعية من الديبسيببتيد

إنتروشيلين هو ديبسيببتيد وهو ناقل للحديد. [5]

لقد وجد أن العديد من الديبسيببتيدات لها خصائص مضادة للسرطان. [6]

يشتمل مثبط إنزيم الديبسيببتيد على روميديبسين ، وهو عضو في فئة الببتيد ثنائي الحلقة، وهو مثبط معروف لإزالة أسيتيل الهيستون (HDACi). تم عزله لأول مرة كمنتج تخمير من Chromobacterium violaceum بواسطة شركة Fujisawa Pharmaceutical Company. [7]

أظهرت البيانات الأولية في عام 2010 أن إيتاميسين يتمتع بنشاط قوي ضد المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسيلين في نموذج فأر. [8] تُظهر العديد من ديبسيببتيدات Streptomyces نشاطًا مضادًا للميكروبات. [9] [10] تشكل هذه فئة جديدة محتملة من المضادات الحيوية تُعرف باسم أسيلديببتيدات ( ADEPs ). تستهدف أسيلديببتيدات وتنشط إنزيم البروتيناز المحلل للكازين ( ClpP ) لبدء تحلل الببتيد غير المنضبط والبروتين غير المطوي، مما يؤدي إلى قتل العديد من البكتيريا إيجابية الجرام. [11] [12] [13]

يمكن تكوين الديبسيببتيدات من خلال تفاعل Passerini . [14]

مراجع

  1. ^ IUPAC ، Compendium of Chemical Terminology ، الطبعة الثانية ("الكتاب الذهبي") (1997). النسخة المصححة على الإنترنت: (2006–) "depsipeptides". doi :10.1351/goldbook.D01604
  2. ^ abc Avan, Ilker; Tala, Srinivasa R.; Steel, Peter J.; Katritzky, Alan R. (17 يونيو 2011). "التوليفات الوسيطة للبنزوتريازولين للديبسيببتيدات والأوليجويسترات". مجلة الكيمياء العضوية . 76 (12): 4884– 4893. doi :10.1021/jo200174j. PMID  21452874.
  3. ^ ab Avan, Ilker; Hall, C. Dennis; Katritzky, Alan R. (2014). "محاكاة الببتيد عبر تعديلات الأحماض الأمينية والروابط الببتيدية". مراجعات الجمعية الكيميائية . 43 (10): 3575– 3594. doi :10.1039/C3CS60384A. PMID  24626261.
  4. ^ Yasumasa Hamada؛ Takayuki Shioiri (2005). "التقدم الأخير في الدراسات التركيبية للببتيدات الحلقية البحرية النشطة بيولوجيًا وديبسيببتيدات الجزيئية". Chem . Rev. 105 (12): 4441– 4482. doi :10.1021/cr0406312. PMID  16351050.
  5. ^ والش؛ كريستوفر ت.؛ جون ليو؛ فرانك روسناك؛ ماساهيرو ساكايتاني (1990). "دراسات جزيئية حول الإنزيمات في عملية التمثيل الغذائي للكوريزمات ومسار التخليق الحيوي للإنتروباكتين". المراجعات الكيميائية . 90 (7): 1105-1129 . doi :10.1021/cr00105a003.
  6. ^ Kitagaki, J.; Shi, G.; Miyauchi, S.; Murakami, S.; Yang, Y. (2015). "الديبسيببتيدات الحلقية كعلاجات محتملة للسرطان". الأدوية المضادة للسرطان . 26 (3): 259– 71. doi :10.1097/CAD.00000000000000183. PMID  25419631. S2CID  22071968.
  7. ^ يوريك جورج، ألكسندر؛ سيسيل، ألكسندر ريتشارد ليام؛ مو، أليكس هون كيت؛ وين، شيجون؛ روجرز، هيلين؛ هابينز، فاي؛ مايدا، ساتوكو؛ يوشيدا، مينورو؛ وآخرون (2007). "أول نظائر اصطناعية نشطة بيولوجيًا لـ FK228، مثبط ديسيببتيد هيستون دياسيتيلاز". مجلة الكيمياء الطبية . 50 (23): 5720-5726 . doi :10.1021/jm0703800. PMID  17958342.
  8. ^ التسرع ، نينا م. بيريرا ، فاراهيناج آر . مالوني ، كاثرين ن. تران ، دان ن. جنسن، بول. فينيكال، وليام. نيزيت، فيكتور؛ هينسلر، ماري إي (2010). "نشاط المضاد الحيوي الستربتوجرامين إيتامايسين ضد المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسيلين". مجلة المضادات الحيوية . 63 (5): 219-24 . دوى :10.1038 / ja.2010.22. بمك 2889693 . بميد  20339399. 
  9. ^ KH Michel, RE Kastner (Eli Lilly and Company), US 4492650, 1985 [ملخص الكيمياء 1985، 102، 130459]
  10. ^ أوسادا، هيرويوكي؛ يانو، تاتسويا؛ كوشينو، هيرويوكي؛ إيسونو، كيوشي (1991). "إينوببتين أ، مضاد حيوي جديد من فئة ديبسيبيبتيد له نشاط مضاد للبكتيريا". مجلة المضادات الحيوية . 44 (12): 1463– 1466. doi : 10.7164/antibiotics.44.1463 . PMID  1778798.
  11. ^ لي. هيم شون، دومينيك؛ غوارني، ألبا؛ موريزي، مايكل ر.؛ تشنغ، يي تشيانغ؛ رايت، جيرارد د. غيرلاندو، رودولفو؛ جوزيف إبنيزر. جلويد ميلاني. سيون تشونغ، يو؛ أورتيجا ، جواكين (2010). “المضادات الحيوية Acyldepsipeptide تحفز تكوين قناة محورية منظمة في ClpP: نموذج لحالة ClpX / ClpA-Bound لـ ClpP”. الكيمياء والبيولوجيا . 17 (9): 959-969 . دوى :10.1016/j.chembiol.2010.07.008. بمك 2955292 . بميد  20851345. 
  12. ^ هينزين ، بيرتهولد. لابيشينسكي، هارالد. الأماكن القريبة : اندرمان، راينر. بينيت-بوتشولز، جوردي؛ هيلويج، فيرونيكا؛ حبيتش، ديتر. شوماخر، أندرياس؛ لامب، توماس. بولسن، هولجر. راداتز، سيغفريد (2006). "تحسين الكيمياء الطبية لأسيلديبسيببتيدات المضادات الحيوية من فئة الإينوبيبتين". كيممدتشيم . 1 (7): 689-693 . دوى :10.1002/cmdc.200600055. بميد  16902918. S2CID  36525372.
  13. ^ كارني، دانيال دبليو؛ شمتز، كارل ر؛ ترونج، جوناثان ف؛ ساور، روبرت ت؛ سيلو، جيسون ك. (2014). "تقييد الديناميكيات التكوينية للمضادات الحيوية أسيلديبسيببتيد الدوري يحسن نشاطها المضاد للبكتيريا". مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 136 (5): 1922-1929 . doi : 10.1021/ja410385c . PMC 4004210. PMID  24422534 . 
  14. ^ لي، جيه جاك (2021)، "تفاعلات باسريني"، تفاعلات الاسم ، شام: دار النشر سبرينغر الدولية، ص.  424-426 ، doi :10.1007/978-3-030-50865-4_115، ISBN 978-3-030-50864-7تم الاسترجاع بتاريخ 2022-10-26

قراءة إضافية

  • بابواميد فورد، PW؛ جوستافسون، KR. ماكي، TC. شيجيماتسو ، ن . موريزي، LK. بانيل، LK. ويليامز، DE؛ دي سيلفا، إد؛ لاسوتا، ف. ألين، TM؛ فان سوست، ر؛ أندرسن، آر جيه؛ بويد، السيد (1999). “Papuamides AD، Depsipeptides المثبطة لفيروس نقص المناعة البشرية والسامة للخلايا من الإسفنج Theonella mirabilis و Theonella swinhoei تم جمعها في بابوا غينيا الجديدة”. ج. صباحا. الكيمياء. شركة نفط الجنوب . 121 : 5899-5909 . دوى :10.1021 / ja990582o.
  • نيامفاميد أ. أوكو، ن؛ جوستافسون، كيه آر؛ كارتنر، إل كيه؛ ويلسون، جيه إيه؛ شيجيماتسو، إن؛ هيس، إس؛ بانيل، إل كيه؛ بويد، إم آر؛ ماكماهون، جيه بي (2004). "نيامفاميد أ. ديبسيبيبتيد مثبط جديد لفيروس نقص المناعة البشرية من إسفنجة بابوا غينيا الجديدة البحرية نيامفيوس هكسلي ". مجلة الإنتاج الطبيعي . 67 (8): 1407-11 . doi :10.1021/np040003f. PMID  15332865.
  • كاليبلتين أ زامبيلا، أ؛ دوريا، إم في؛ بالوما، إل جي؛ كاسابولو، أ؛ مينالي ، إل. ديبيتوس، سي؛ هينين، ي (1996). "Callipeltin A، وهو Depsipeptide دوري مضاد لفيروس نقص المناعة البشرية من Lithistida Sponge Callipelta sp من كاليدونيا الجديدة . " ج. صباحا. الكيمياء. شركة نفط الجنوب . 118 (26): 6202– 9. دوى :10.1021 / ja954287p.
  • ميراباميدات AD بلازا، أ؛ جوستشينا، إي؛ بيكر، إتش إل؛ كيلي، إم؛ بيولي، سي إيه (2007). "ميراباميدات AD. ديبسيببتيدات من الإسفنجة Siliquariaspongia mirabilis التي تمنع اندماج فيروس نقص المناعة البشرية من النوع 1". مجلة الإنتاج الطبيعي 70 (11): 1753– 60. doi :10.1021/np070306k. PMID  17963357.؛ Andjelic, CD؛ Planelles, V؛ Barrows, LR (2008). "توصيف النشاط المضاد لفيروس نقص المناعة البشرية لبابواميد أ." Mar Drugs . 6 (4): 528– 49. doi : 10.3390/md20080027 . PMC 2630844. PMID  19172193 . 
تم الاسترجاع من "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ديبسيببتيد&oldid=1173448267"
Original text
Rate this translation
Your feedback will be used to help improve Google Translate