مكتبة برامج FMRIB

الموسوعة الحرة

أمثلة على واجهات المستخدم الرسومية للغة FSL

مكتبة برامج FMRIB ، المختصرة بـ FSL ، هي مكتبة برامج تحتوي على أدوات تحليل الصور والأدوات الإحصائية لبيانات التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي والهيكلي والانتشاري للدماغ .

يتوفر برنامج FSL كملفات ثنائية مُجمّعة مسبقًا وكبرنامج مصدري لأجهزة كمبيوتر Apple وPC ( Linux ). وهو متاح مجانًا للاستخدام غير التجاري.

وظائف FSL

التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي
فابرFABBER هي أداة لتركيب النماذج البايزية مخصصة للاستخدام في نمذجة المهام لبيانات ASL.
إنجازتحليل التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي القائم على النموذج مع واجهة مستخدم رسومية بسيطة ولكنها قوية: معالجة البيانات المسبقة (بما في ذلك تصحيح توقيت الشريحة، وتصحيح حركة MCFLIRT، وفك تشوه EPI PRELUDE+FUGUE)؛ تحليل السلاسل الزمنية FILM GLM مع التبييض المسبق؛ التسجيل على صور الفضاء الهيكلي و/أو القياسي؛ وتحليل المجموعة المختلطة التأثيرات المعممة بالكامل باستخدام تقنيات بايزية متقدمة.
لحنيتحليل التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي بدون نموذج باستخدام تحليل المكونات المستقلة الاحتمالية (PICA). يقوم برنامج MELODIC تلقائيًا بتقدير عدد مصادر الضوضاء والإشارة المهمة في البيانات، وبفضل "نموذج الضوضاء" المرتبط به، فإنه قادر على تحديد دلالات إحصائية ("قيم p") للخرائط المكانية الناتجة.
فلوبستوليد دوال الأساس المثلى لـ HRF وتقدير التنشيط البايزي.
التسويق عبر وسائل التواصل الاجتماعينمذجة الخليط المكاني - اختبار الفرضيات البديلة باستخدام نمذجة خليط المدرج التكراري مع التنظيم المكاني لتصنيف الفوكسل إلى تنشيط وعدم تنشيط.
التصوير بالرنين المغناطيسي الهيكلي
BET /

BET2

أداة استخلاص الدماغ – تفصل الدماغ عن غير الدماغ في البيانات الهيكلية والوظيفية، وتقوم بنمذجة أسطح الجمجمة وفروة الرأس. [ 1 ]
سوزانتقليل الضوضاء غير الخطي.
سريعأداة التجزئة الآلية لـ FMRIB - تجزئة الدماغ (إلى أنواع مختلفة من الأنسجة) وتصحيح مجال الانحياز.
يعاكسأداة تسجيل الصور الخطية من FMRIB - التسجيل الخطي بين الوسائط وداخلها. [ 2 ]
فوغيزيل التشوه الهندسي في صور EPI باستخدام خرائط المجال B 0 .
سييناتحليل التغيرات الهيكلية في الدماغ، لتقدير ضمور الدماغ.
التصوير بالرنين المغناطيسي الانتشار
FDTمجموعة أدوات الانتشار من FMRIB - أدوات لإعادة بناء معلمات الانتشار منخفضة المستوى والتصوير المقطعي الاحتمالي.
TBSSالإحصاءات المكانية القائمة على المسارات (جزء من مجموعة أدوات الانتشار الخاصة بـ FMRIB) - تحليل على مستوى الفوكسل لبيانات الانتشار متعددة المواضيع. [ 3 ]
أدوات أخرى
الاستدلالأدوات الاستدلال/التحديد المختلفة، بما في ذلك: Randomise (أداة استدلال قائمة على التبديل لتحديد العتبة الإحصائية غير البارامترية)، cluster (تحديد العتبة القائم على التجميع باستخدام نظرية GRF للاستدلال)، FDR (استدلال معدل الاكتشاف الخاطئ) و Glm (واجهة مستخدم رسومية لإنشاء مصفوفات تصميم النموذج).
عيون FSLأداة عرض تفاعلية لبيانات ثلاثية ورباعية الأبعاد.
AVWUTILSأدوات متنوعة لتحويل ومعالجة الصور.

التاريخ والتطور

يُكتب برنامج FSL بشكل رئيسي من قِبل أعضاء مجموعة تحليل التصوير بالرنين المغناطيسي الوظيفي للدماغ (FMRIB) بجامعة أكسفورد في المملكة المتحدة. صدرت النسخة الأولى من FSL عام 2000، ومنذ ذلك الحين، صدرت نسخة رئيسية جديدة كل عام تقريبًا. وتتلقى مجموعة تحليل FMRIB تمويلها الأساسي من مؤسسة ويلكوم ترست ومجلسي أبحاث العلوم الفيزيائية والهندسية (EPSRC) ومجلس البحوث الطبية (MRC) في المملكة المتحدة .

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ إس إم سميث. استخلاص سريع وقوي وآلي للدماغ . رسم خرائط الدماغ البشري، 17(3):143-155، نوفمبر 2002.
  2. ↑ جينكينسون، م.، بانيستر، ب.، برادي، ج.م. وسميث، س.م. تحسين التحسين للتسجيل الخطي القوي والدقيق وتصحيح الحركة لصور الدماغ . NeuroImage، 17(2)، 825-841، 2002.
  3. ↑ إس إم سميث، إم جينكينسون، إتش جوهانسن-بيرج، دي روكيرت، تي إي نيكولز، سي إي ماكاي، كي إي واتكينز، أو سيكاريلي، إم زد كادر، بي إم ماثيوز، وتي إي جيه بيرنز. الإحصاءات المكانية القائمة على المسارات: تحليل بيانات الانتشار متعددة المواضيع على مستوى الفوكسل . مجلة NeuroImage، 31: 1487-1505، 2006.