قائمة حلقات مسلسل فريق النينجا العلمي غاتشامان

يهاجم روبوت ضخم على شكل سلحفاة، يُدعى "ملك السلاحف"، منشأة لتخزين اليورانيوم. تشعر المنظمة الدولية للعلوم (ISO) ومندوبو الدول المختلفة بقلق بالغ. نامبو، الشخص الوحيد الذي كان على علم بغالاكتور سابقًا، يُعلن الآن رسميًا عن وجود هذه المنظمة الإجرامية وفريق النينجا العلمي الذي شُكّل لهزيمتها. ^{[ 2 ]}

يتلقى فريق النينجا العلمي أوامر نامبو، ويتحدون في "طائر الفينيق الإلهي"، وينطلقون على الفور إلى قاعدة إطلاق الصواريخ حيث شوهدت الآلة العملاقة.

يوقف كين جو، المتلهف لخوض أول قتال حقيقي له. يأخذ كين جون معه ويتسللان إلى داخل الآلة. بمساعدة كين، يدخل غود فينيكس إلى الآلة، وينضم جو وجينبي وريو إلى المعركة ضد أعضاء جالاكتور.

في مكان آخر، يُخبر قائد الآلة بيرغو كاتسي، الرجل الثاني في قيادة غالاكتور، بوجود فريق النينجا العلمي. ثم يُبلغ كاتسي سوساي إكس، الكائن الخارق الذي يقود المنظمة الإجرامية. وبناءً على تعليمات إكس، يأمر كاتسي بتدمير فريق النينجا العلمي، وذلك بأن تقوم الآلة بانقضاضة انتحارية، حاملةً معها طائر الفينيق الإلهي، لدفن الفريق. ولكن في اللحظة الأخيرة، ينجو طائر الفينيق الإلهي من الآلة باستخدام تأثير طائر النار، مُذيبًا سفينة العدو.

تختفي مركبة فضائية، إلى جانب جهاز يمكنه الإبلاغ عن موقع موارد الأرض وتسجيله.

يتلقى فريق النينجا العلمي تعليمات نامبو ويتجه نحو قاع البحر، بالقرب من الموقع الذي انقطع فيه الاتصال بالمركبة الفضائية. هناك، تغادر جرافات على شكل روبيان حاملة طائرات ضخمة راسية في قاع البحر لبناء مصنع لليورانيوم. يوقف كين ريو، الذي كان يريد إطلاق صاروخ على شكل طائر، ويتسلل إلى حاملة الطائرات بمفرده.

يكتشف كين كبسولة المركبة الفضائية داخل حاملة الطائرات، لكن رواد الفضاء الذين كانوا على متنها قد احتُجزوا كرهائن. يحاول كين إنقاذهم، إلا أن الحقيقة هي أن الطيارين قد قُتلوا بالفعل. كان تصويرهم على أنهم ما زالوا على قيد الحياة فخًا.

يتسلل جينبي إلى حاملة الطائرات، متتبعًا كين بناءً على أوامر جو. ويتمكن من إنقاذ كين أثناء اقتياده إلى باطن الأرض. ويجمع الاثنان الجهاز ويهربان، مدمرين بذلك جهاز الكمبيوتر الموجود في حاملة الطائرات.

يُلقي كاتسي باللوم على قائد حاملة الطائرات لفشل العملية، فيتسلل إلى عقل ملك السلاحف ليُلقي بنفسه على طائر الفينيق الإلهي. ولكن بفضل سرعة بديهة كين، يتحول طائر الفينيق الإلهي إلى طائر النار، وتلتهم النيران كل شيء.

تتكرر حوادث تحطم الطائرات المدنية المميتة. كين، الذي يحقق في هذه الحوادث، يلتقي بصبي يُدعى ماكوتو، ينتظر عودة والده الذي أُبلغ عن فقدانه في إحدى هذه الحوادث.

والد ماكوتو هو الشقيق الأصغر للدكتور تاكاهارا، مخترع عنصر "يورانليس" الجديد. وقد تبين أن سلسلة حوادث تحطم الطائرات كانت من فعل جالاكتور، الذي يسعى للحصول على عنصر "يورانليس" لقدرته على تعطيل وسائل دفع مومياءه العملاقة.

سبق أن واجه كين المومياء في طائرته من طراز سيسنا، وبسبب تلك الحادثة، لديه بيانات تتعلق بنظام دفع المومياء. يتصل كين بالدكتور تاكاهارا للحصول على الكائن الفضائي. يلتقي بوالد ماكوتو، الذي نجا بأعجوبة من التحطم، لكن في الحقيقة بيروجو كاتسي متنكرًا هو من يقاتل كين ويهرب. يلوم ماكوتو كين على تعذيب والده، ويعده كين بإعادته، وعندها يحصل على الدبوس الذي يخفي الكائن الفضائي.

تظهر المومياء العملاقة في المطار، ويتمكن كين من هزيمتها بإطلاق النار عليها. لكن ماكوتو يشاهد كاتسي، الذي لا يزال متنكرًا في زي والده، وهو يفرّ في صاروخ هروب. ويتهم ماكوتو كين بنقض وعده بإعادة والده.

يتقبل كين كراهية ماكوتو بصمت، لأنه فقد والده قبل 10 سنوات بطريقة مماثلة، وكانت لديه نفس الأفكار - وهي أن والده سيعود يوماً ما.

أثناء التحقيق في حادثة ما، يزور كين معهد أبحاث الزلازل. وبسبب زلزال تسبب فيه روبوت عملاق، يسقط هو ومدير المعهد، ناكاهارا، في شق أرضي. يتحول كين وينجو، لكنه لا يستطيع إنقاذ ناكاهارا.

يقف كين أمام قبر المخرج، فتهاجمه ناومي ناكاهارا، ابنة المخرج، التي تعتقد جازمةً أنه عضو في جالاكتور. يتفهم كين غضبها لعدم قدرته على الانتقام لوالدها، فيقرر إخبارها بهويته الحقيقية كعضو في فريق النينجا العلمي. وبناءً على ذلك، يسمح لها بالانضمام إلى الفريق في مهمته.

خلال التحقيق، تم تحديد الموارد التي من المرجح أن يهاجمها الروبوت العملاق لاحقًا، وواجه غود فينيكس الروبوت العملاق في قاعدة. في الداخل، أراد كين أن تنتقم ناومي لوالدها، فطلب من الدكتور نامبو الإذن بإطلاق صواريخ الطيور. رفض نامبو الإذن، لكن كين تجاهله وأمر ناومي بإطلاق الصواريخ على أي حال. ترددت ناومي في الضغط على زر الإطلاق، فأمسك كين بيدها وأجبرها على إطلاق الصواريخ.

عند قبر المخرج، يُسلّم كين سواره إلى نامبو. يقول إنه يريد تحمّل مسؤولية إجبار نعومي على الضغط على زر إطلاق النار دون إذن، والاستقالة من الفريق. لكن نامبو يقول إن كين ضروري لتحقيق السلام العالمي، وتعده نعومي بعدم الكشف عن هويته الحقيقية.

تستمر سفن المحيطات التابعة لمنظمة ISO في الاختفاء. ويحدث ذلك دائمًا بالقرب من مكان يُسمى مقبرة البحار. يطلب المدير أنداسون ونامبو من فريق نينجا العلوم التوجه إلى قاعدة في قاع المحيط يُرجح أن تتعرض للهجوم التالي.

تلقى فريق النينجا العلمي رسالة نامبو، وانطلقوا بطائر الفينيق الإلهي نحو القاعدة في قاع البحر. ثم صادف الفريق غواصة غامضة، قادتهم إلى مقبرة البحار، حيث شاهدوا عددًا لا يُحصى من السفن الغارقة. لكن عندما قال جو إن جميع السفن هي في الواقع سفن حربية، شكّ كين في الأمر، فأمر طائر الفينيق الإلهي بالصعود إلى السطح. كان الضباب يغطي السطح بالكامل، ومن وسطه، هاجم أسطولٌ من الأشباح الفريق، لكنهم خمنوا بشكل صحيح أن الضباب من صنع الإنسان. دمّر الفريق الجهاز الذي يُسبب الضباب، لكن من أسطول الأشباح ظهرت أقراص لا حصر لها هاجمتهم بأشعة ضوئية. اضطر فريق النينجا العلمي لخوض معركة شرسة.

في اللحظة التي نفدت فيها جميع الصواريخ ولم يعد لديهم ما يفعلونه، ظهرت ثلاث طائرات حمراء وأسقطت طائرات العدو بتقنيات طيران متطورة. عرّف قائد وحدة الطائرات المقاتلة نفسه لفريق النينجا العلمي المذهول باسم "الاندفاع الأحمر". ثم طار بعيدًا، تاركًا وراءه عبارة "سنلتقي مجددًا".

سُرقت سبائك الذهب من خزائن البنك الدولي. هذا من فعل روبوتات جالاكتور الصغيرة.

يتلقى فريق النينجا العلمي تعليماته ويبدأ عملية بحث في الجزر المحيطة بالمكان الذي يُعتقد أن سبائك الذهب قد سُرقت منه. يتأكد جو من أن كين وجون وجينبي، بملابسهم المدنية، يجذبون انتباه العدو ويقتادون إلى القاعدة. يقترح جو أنه إذا كانت هذه هي المقر الرئيسي، فيجب تدميرها فورًا. لكن نامبو يوقفه قائلًا إن الهجوم ليس من واجب فريق النينجا العلمي. يترك جو ريو، الذي يشعر بالملل، في طائر الفينيق الإلهي في قاع البحر، ويتسلل إلى القاعدة استعدادًا لاستعادة سبائك الذهب.

بينما يُثير كين والآخرون فوضى عارمة داخل القاعدة، ينطلق جو بحثًا عن سبائك الذهب. يكتشف أن صاروخًا على وشك الإطلاق على مركبة "غود فينيكس" عندما ترصده كاميرات المراقبة. يتصل جو بريو الموجود داخل المركبة فورًا. ريو، الذي يكون دائمًا على أهبة الاستعداد، كان نائمًا، لكنه تمكن من تفادي الصاروخ بأعجوبة. بتوجيه من جو، يُخبئون سبائك الذهب المسروقة داخل "غود فينيكس".

يتم الاتصال بكين والآخرين ويهربون من القاعدة. يقوم جالاكتور بتدمير القاعدة وجميع سكانها بسبب سبائك الذهب المفقودة.

هناك نوع جديد من الطائرات لا يلوث البيئة. في منتصف رحلة كين التجريبية لهذه الطائرة التي طورتها منظمة ISO، تعرض لهجوم من طائرة ذات جناحين، يقودها رجل يُعرّف نفسه باسم كاتزن بيروجو، الذي لوّح بسوطه نحو طائرة ISO، مما تسبب في تحطمها، لكن كين أنقذ نفسه في اللحظة الأخيرة باستخدام مظلة.

يشتبه نامبو، من الاسم، في تورط جالاكتور، ويأمر سفينة غود فينيكس بالهجوم فورًا، لكن ذيل السفينة يتضرر من السوط. يكشف تحليل المادة العالقة في هيكل غود فينيكس أن هذا النوع من المعدن، المسمى "الشعيرات"، هو شيء بحثت عنه منظمة ISO لكن لم يتم تصنيعه. يُذهل نامبو من القدرة العلمية لجالاكتور، لكن عندما يُكتشف مصنع الإنتاج، يُصدر الأمر لفريق النينجا العلمي بتدميره.

أثناء قيام فريق النينجا العلمي بعملية بحث باستخدام مركبة "فينيكس الإلهية" في منطقة تعدين، اكتشفوا منجمًا ضخمًا. عندما علم الفريق أن هذا هو موقع مصنع جالاكتور السري، تسلل أعضاؤه إليه. في نهاية المعركة، نجحوا في تدمير الحاسوب والمفاعل النووي. حاول الفريق الفرار باستخدام "فينيكس الإلهية" لكنهم وقعوا في قبضة جاذبية المنجم المغناطيسية القوية. لجأ الفريق إلى الدفع النفاث وتمكنوا من الفرار بأعجوبة، تاركين المصنع المتفجر خلفهم.

في محاولةٍ لمقاومة عدوه اللدود، فكّر نامبو في بناء قاعدةٍ لفريق النينجا العلمي. لكن خوفًا من تدخّل العدو، أصدر أوامره للفريق بالقيام بدوريةٍ جويةٍ عند النقطة "ج" في جنوب المحيط الهادئ. امتثالًا للأوامر بعدم التدخّل هناك، أطلق غود فينيكس ستارًا دخانيًا وفرّ هاربًا عند مصادفته لآلةٍ عملاقةٍ على شكل شقائق نعمان بحرية. في تلك الليلة، كان جينبي مع أعضاء الفريق الأربعة الآخرين، لكنه لم يكن متعبًا على الإطلاق. أخذ المركبة "جي-4" وغاص إلى قاع البحر. أخبره أطفالٌ في حديقةٍ أن شعبية "جي-4" هي الأقل بين جميع أعضاء الفريق، وهو ينوي كسب ودّهم بأن يكون الأفضل. رغم مخاوف أعضاء الفريق الآخرين، تجوّل في قاع البحر باحثًا عن الآلة العملاقة. لم يلحظ أبدًا أن الآلة نفسها التي يبحث عنها كانت تلاحقه.

يعثر جينبي على ما يبدو أنه قاعدة قيد الإنشاء، لكن الآلة العملاقة تحاصره. يتصل بكين، لكن القاعدة تُفجّر أمام عينيه. تُدمّر الآلة العملاقة بواسطة طائر الفينيق الإلهي، وينجو كاتسي مجددًا.

يشكو جينبي من أن القاعدة قد دُمرت بسبب تصرفاته الأنانية، لكن نامبو يخبره أن القاعدة المدمرة لم تكن سوى فخ. كان فريق النينجا العلمي مجرد طعم لجذب انتباه العدو.

يحلق طائر الفينيق الإلهي عالياً في السماء. وفي الأسفل، يمتد حاجز مرجاني هلالي الشكل. وتختبئ قاعدته تحت الحاجز، القادر على تغيير موقعه.

في سماء حالكة السواد، يسطع القمر ذو اللون الأزرق والأبيض.

فجأة، يسقط نيزك على الأرض. ووفقًا للتحليل، فإن تركيب النيزك مطابق لتركيب القمر. لذا يقترح كين الاقتراب من القمر على متن مركبة "غود فينيكس" لاستكشافه.

عند اقترابه من القمر، يواجه الإله فينيكس سربًا من النيازك المتجهة نحو الأرض. يكتشف كين جثة ملفوفة وسط السرب، ولأنها ليست نيزكًا، يهاجمها. لكن صواريخ الطيور لا تُجدي نفعًا. تسقط الجثة على الأرض، وتتحول إلى آلية عملاقة على شكل عقرب، وتهاجم مصفاة نفط.

بعد تلقي تعليمات نامبو من الأرض للعثور على مصدر الموجات الراديوية التي توجه الآلة والنيازك، يطلب كين من جون تتبع الإشارة التي اكتشفوها أثناء توجه الآلة إلى الأرض.

يعثر فريق النينجا العلمي على حاملة الطائرات وهي تُرسل إشارة التحكم، فيتركون ريو في مركبة غود فينكس بينما يتسللون إلى داخل الآلية. يستجوب باقي الأعضاء القائد، لكنه لا يُفصح عن شيء. يفقد جو صبره ويُطلق النار عشوائيًا على لوحات التحكم بمدفع رشاش. بعد وقت قصير من هروب فريق النينجا العلمي، تصطدم النيازك بحاملة الطائرات نتيجة لتدمير جهاز الكمبيوتر.

في هذه الأثناء على الأرض، أبلغت فرقة Reddo Imparusu أنه تم تدمير ميكا العقرب غير الموجهة الآن.

فجأة، انقطعت الكهرباء عن مدينة بأكملها. كان كين، في طائرته من طراز سيسنا، يفكر في خلل ما في محطة الطاقة عندما تلقى رسالة من نامبو تفيد بأن محطة الطاقة النووية قد تعرضت لهجوم من قبل مجموعة كبيرة من النمل.

يتوجه فريق النينجا العلمي إلى الموقع المذكور، ولكن بما أن الصواريخ لن يكون لها تأثير يُذكر على المجموعات الصغيرة، يقوم الفريق بإزالتها عن طريق هدم سد قريب واستخدام قوة المياه. عند تحليل نملة أحضرها الفريق إلى القاعدة، يكتشفون أنها روبوت مصنّع بدقة متناهية.

تم إصلاح النملة الآلية، وعادت إلى قاعدتها بعد تلقيها إشارة التحكم. تبعها ريو في طائر الفينيق الإلهي في السماء، وبقية الأربعة على الأرض. سرعان ما اكتشفوا تلال نمل ضخمة، وانتهى بهم المطاف في كهف نمل هائل عندما حاولوا التسلل إلى داخله. كان كاتسي بانتظارهم، فسقطوا واحتُجزوا في قبة مصنوعة من الزجاج المقوى. كان الهواء على وشك النفاد، ولم يعرفوا ماذا يفعلون، لكن في النهاية، تمكن الفريق من النجاة بأعجوبة باستخدام قنبلة. في هذه الأثناء، هاجمت أسراب من النمل الشوارع، لكن فرقة ريدو إمباروسو أبادتها بقاذفات اللهب.

في هذه اللحظة، يُطلق كاتسي روبوتًا ضخمًا على شكل نملة. يقود ريدو إمباروس وإله العنقاء الروبوت إلى نفق تحت الماء. يجمع إله العنقاء ضوء الشمس بواسطة مرآة مدمجة في أنفه، ثم يحرق كل شيء بشعاع حراري قوي، لكن كاتسي ينجح في الفرار.

أثناء تحليقه، فوجئ كين بمواجهة طائرة قائد ريد إمبلس. طارده، لكن ريد إمبلس تمكن من الفرار بفضل تقنية طيران رائعة؛ وتمنى كين لو كان بإمكانه استخدام تقنيات مماثلة.

يتلقى فريق النينجا العلمي أوامر بحماية الطائرة فائقة القوة "بلو هوك"، فخر دولة توريتان. لكن طاقم الطائرة قُتل قبل الإقلاع واستُبدل بأعضاء من جالاكتور.

يعلم نامبو بهذا الوضع بعد الإقلاع. فيقوم بتعبئة ريد إمبلس لحماية فريق النينجا العلمي من بلو هوك، لأنه أقوى من غود فينيكس.

يواصل غود فينيكس مرافقة بلو هوك دون أن يعلم بالوضع على متنها. يظهر ريد إمبلس ويهاجم بلو هوك، وبعد أن يطلق قنبلة موقوتة عليها، يختفي مجدداً. يرى كين ذلك ويؤمن إيماناً راسخاً بأن ريد إمبلس عدوٌّ بالفعل. متجاهلاً نامبو الذي يريد إيقافه، يلاحق ريد إمبلس بمفرده في مركبة جي-1.

أثناء غياب كين، يُختطف الأعضاء الأربعة الآخرون ويُقتادون إلى قاعدة تقع داخل بركان. لكن كين يتبع ريد إمبلس، الذي بدوره يتبع الإشارة المنبعثة من القنبلة الموقوتة. يصلان معًا وينقذان الفريق قبل إعدامهم مباشرة.

يخبرهم نامبو أن ريد إمبلس حليفٌ يقاتل إلى جانبهم. تحلق طائرة جي-1 وطائرة ريد إمبلس في السماء جنبًا إلى جنب، في مشهدٍ يُذكّر بأبوين طائرين يطيران مع صغارهما. لم يكن أحدٌ في ذلك الوقت يعلم معنى الدمعة التي ظهرت في عين قائد ريد إمبلس.

يتم سرقة المواد الخام العالمية للسكر بواسطة الآلة العملاقة جالاكتور، إيبوكورون، ويصبح مخزون السكر العالمي في حالات الطوارئ منخفضًا للغاية.

يندفع ريو وجينبي إلى الشارع لشراء الحلوى. وفي تلك اللحظة، يتلقيان الأمر من نامبو بالتحرك لمتابعة إيبوكورون والعثور على القاعدة السرية.

أثناء المطاردة، ينجذب طائر الفينيق الإلهي نحو الآلة العملاقة بفعل قوته المغناطيسية الهائلة التي يستخدمها لامتصاص المواد الخام. يستغل كين هذه القوة للتسلل إلى داخل الآلة، برفقة جو وريو.

لكن يتضح أن الداخل مصنع سكر، ويُسحب أعضاء الفريق الثلاثة إلى داخل عملية الإنتاج. يكادون يسقطون في قدر طهي ضخم مليء بالمواد الخام المغليّة، لكنهم يتمكنون بطريقة ما من الفرار. ثم يدخلون جهاز طرد مركزي ويصبحون عاجزين تمامًا.

في هذه الأثناء، وصل إيبوكورون إلى القاعدة الواقعة في جبل ثلجي، وتسلل جون وجينبي إلى غرفة الطاقة النووية. قاما بإيقاف تشغيل مصدر الطاقة، لكنهما وقعا في قبضة العدو. ومع انقطاع التيار الكهربائي، تمكن كين والآخرون من الفرار والوصول لإنقاذهما. وقبل هروبهم مباشرة، زرع جون قنبلة موقوتة، ونتيجة لذلك، اختفت القاعدة وسط انهيار جليدي.

قام فريق "ساينس نينجا" بتوزيع السكر الذي استعادوه من إيبوكورون في إحدى الحدائق. وقد عاد الأطفال إلى سعادتهم.

تختفي بحيرة تخزين أنشأتها منظمة ISO، كجزء من خطة لجعل الصحراء خصبة. يسافر فريق النينجا العلمي إلى أفريقيا للتحقيق في الأمر. هناك، يروي لهم أحد الشيوخ أسطورة الرمال الحمراء المتحركة. يُقال إن هذه الرمال تحترق إلى الأبد، وأنها قادرة على ازدهار الحضارات وتدميرها في آنٍ واحد. يسأل كين الشيخ عن سرّ هذه الرمال، لكن الشيخ لا يُفصح عن شيء.

يعثر جينبي، أثناء تتبعه للشيخ الذي كان على وشك أن يختطفه جالاكتور، على قلادة. يُرسل الرمل الأحمر الموجود بداخلها إلى نامبو، ويكشف التحليل أنه نوع جديد من البكتيريا، ومصدر طاقة قوي لم يُكتشف من قبل. تبلغ قوته ألف ضعف قوة اليورانيوم، وإذا أُضيف إليه الماء، فإنه ينشطر ويُحدث انفجارًا هائلًا.

بسبب بحث جالاكتور عن الرمال الحمراء، غيّر روبوت عملاق على شكل نملة الأسد موقع البحيرة عبر قناة تحت الأرض. غاص طائر الفينيق الإلهي عميقًا تحت الأرض، واكتشف الكهوف التي يستخدمها الروبوت، وتسلل إلى القاعدة التي عثروا عليها. لكن جالاكتور علم بوصول فريق النينجا العلمي، فأطلقوا النار على الشيخ بعد أن كشف السر. توجهوا إلى الموقع الذي تُحفظ فيه الرمال الحمراء، متقدمين بخطوة على فريق النينجا العلمي. قبل موته، أخبر الشيخ فريق النينجا العلمي بالموقع أيضًا. وصل طائر الفينيق الإلهي متأخرًا جدًا، فقد سرق الروبوت الرمال الحمراء بالفعل. كملاذ أخير، تحول طائر الفينيق الإلهي نحو الروبوت بهيئة طائر الفينيق الناري. عندما لامست النيران الرمال الحمراء، احترقت طموحات جالاكتور العالية، مع الرمال.

وتشير التقارير إلى أن جميع أنواع السفن النووية (سفن الرحلات البحرية، والغواصات، والسفن الحربية، وما إلى ذلك) تختفي.

إن الاختفاء هو نتيجة لآلة غالاكتور الميكانيكية آيسكاندر، التي تستهدف الطاقة النووية.

أثناء التحقيق في هذه الحوادث، تلقى فريق النينجا العلمي رسالةً تفيد بأن جبلًا جليديًا مشبوهًا يتحرك عكس تيار البحر. تتبعت سفينة "فينيكس الإلهية" الجبل الجليدي متجهةً إلى القطب الشمالي، حيث اكتشفت قاعدةً وسط جبال جليدية. تسلل كين وجون إلى القاعدة.

في القاعدة، وأثناء محاولتهم تدمير المفاعل النووي، تُنفَّذ عمليةٌ تهدف إلى تحويل طاقم السفن وركابها إلى أعضاء في منظمة جالاكتور. بهذه الاستراتيجية، تسعى جالاكتور إلى الحصول على الطاقة النووية واستقطاب أعضاء جدد في آنٍ واحد.

في تلك اللحظة بالذات، أراد كاتسي إجراء العملية على فتاة صغيرة، إحدى ركاب السفن السياحية. اقتحم كين وجون الغرفة وأوقفا العملية، لكن كاتسي حبسهما ووضع قنبلة موقوتة في الغرفة. في هذه اللحظة، أمسك رجل مسن على كرسي متحرك، كان على متن السفينة نفسها مع الفتاة، بالقنبلة الموقوتة وضحى بنفسه، لينقذ الآخرين من الانفجار.

يخرج كين والآخرون من غرفة العمليات. في البداية يحررون الركاب المختطفين ويسمحون لهم بالعودة إلى السفينة، ثم يفجرون القاعدة ويهربون.

يلاحقهم آيسكاندر، لكن غود فينيكس يصطدم به باستخدام طائر الفينيق الناري، ويشتعل الميكا في اللهب.

دُمِّرت مدينة الأشباح قبل عشر سنوات بسبب التلوث البيئي. وانقطع الاتصال بفريق التحقيق الذي كان يرسل البيانات منها. يتوجه فريق النينجا العلمي إلى هناك على متن مركبة "فينيكس الإلهية"، التي تستخدم غشاءً رقيقًا لحمايتها من التلوث. ولكن ما إن يدخلوا المدينة حتى يواجهوا هجومًا من جالاكتور. ويتضح لاحقًا وجود قاعدة عسكرية هناك.

يأمر نامبو قوات الأمم المتحدة العسكرية بالهجوم. ويبدو أن كل شيء قد تم تطهيره بعد الهجوم. لكن في الواقع، تستمر عدسة قنديل البحر التي صنعها سوساي إكس في النمو في قاع البحر بالقرب من المدينة. وتستخدم مياه البحر الملوثة كسائلها الأمنيوسي.

بعد اكتمال نموها، تقوم عدسة قنديل البحر، التي تحول ضوء الشمس إلى طاقة أقوى بمئات المرات، بتدمير طائرات مقاتلة تابعة لقوات الأمم المتحدة تدميراً كاملاً. ثم تبدأ بمهاجمة مدن الأرض.

يغوص طائر الفينيق الإلهي في البحر قرب المدينة ويكتشف القاعدة وعدسة قنديل البحر المختبئة. يهاجمون بالصواريخ، ولكن على الرغم من تدميرهم للقاعدة، فإن عدسة قنديل البحر تنطلق من البحر، وتطارد طائر الفينيق الإلهي.

يُنزع الغشاء الواقي لطائر الفينيق الإلهي، مما يضعه في موقف حرج. في تلك اللحظة، تتلقى مجموعة "النبضة الحمراء" تعليمات من نامبو مفادها أنه لتبديد الغاز السام الذي تتنفسه عدسة قنديل البحر، يجب عليهم قذف الأكسجين عالي الضغط عليها. وبحماية أجهزة "النبضة الحمراء"، يُحلّق كين بطائر الفينيق الناري نحو عدسة قنديل البحر. يشتعل الأكسجين عالي الضغط، وتتحول عدسة قنديل البحر إلى رماد على سطح البحر.

يستخدم جالاكتور أحدث مصنع أسلحة ISO، وهو يُصنّع آلات ميكانيكا. هذه الآلة، وفقًا للمخطط الموجود على ميكروفيلم، قادرة على تغيير شكلها باستمرار.

يتبع فريق النينجا العلمي ميكانيكا. ولكن عندما يفقدون أثرها، يواصلون البحث بشكل فردي قبل أن يلتقوا في منزل نامبو.

أثناء بحثهم في نفقٍ فقدوا فيه أثر ميكانيكا، اكتشف جينبي قاعدةً من خلال ثقبٍ في السطح وتسلل إليها. وبينما كان يحاول تدميرها، عثر على شريطٍ صغير. وانطلاقًا من سلوك أعضاء جالاكتور، بدا هذا الشريط بالغ الأهمية، فأخذه جينبي معه أثناء فراره. يحتوي الشريط على المخططات اللازمة لتغيير شكل ميكانيكا. وضع نامبو خطةً جديدةً، استنادًا إلى الشريط، وأرشد فريق النينجا العلمي إلى كيفية تثبيت هذه الخطة في ميكانيكا.

أثناء تحوّل ميكانيكا، ظهرت فجوة بين أجزاء الغلاف. تسلّل كين إلى داخل ميكانيكا عبر إحدى هذه الفجوات، محاولًا إدخال شريط نامبو في الحاسوب، لكنه دخل في عراك مع كاتسي الذي كان يجلس في مقعد القيادة. انقضّ كين من تحت ذراع كاتسي، وتمكّن بطريقة ما من إدخال الشريط.

بحسب خطة نامبو، تتحول ميكانيكا إلى مدينة ملاهي. وعندما يرى كاتسي ذلك، يفر هارباً.

يُطلق "إكس"، الذي يعتزم استغلال نزعات التدمير القوية لدى البشر، وخاصة الأطفال، "كابوتورون" في المدينة. يقوم هذا الروبوت بتدمير الأشياء باستخدام موجات دماغ الأطفال.

يشعر الأطفال بالسعادة عندما يعثرون على خنافس كبيرة في إحدى المناطق المفتوحة، وهو أمر نادر الحدوث في المدينة. كما يعثر جينبي على إحدى هذه الخنافس ويأخذها إلى المنزل.

في تلك الليلة، كبرت خنافس الأيل الخاصة بكل طفل، وسحبت الأطفال إلى داخل أجسامها، وطارت خارج الغرفة، وبدأت في تدمير المدينة.

أثناء تحليقه، يكتشف كين كيف يهاجم كابوتورون محطة نووية. ولكن بما أن جينبي مفقود، فإن غود فينيكس لا يستطيع الإقلاع.

يتحول كين إلى طائرته من طراز G1 ويستخدم جهاز الأشعة السينية على كابوتورون. ولأنه يرى طفلاً في الداخل، يتوقف عن الهجوم. يراقب أعضاء فريق النينجا العلمي الأربعة كابوتورون ويكتشفون قاعدة مخفية في أطلال قديمة.

داخل القاعدة، على وشك البدء عمليةٌ تهدف إلى استئصال أدمغة الأطفال وزرعها في كابوتورون. كاد مثقابٌ أن يلامس رأس جينبي لولا أن أنقذه كين وجون بأعجوبة. أنقذوا بقية الأطفال بمساعدة جو. صعد كين والآخرون إلى غود فينكس. بعد قصفٍ من ريد إمبلس، انفجرت كابوتورون مع القاعدة.

يستمر حوت ضخم في مهاجمة الموانئ. أثناء تحقيق فريق النينجا العلمي في أمر مجموعة من الحيتان، يكتشفون حوتًا ضخمًا يتجه نحوها. يطلق الحوت الضخم صاروخًا مستهدفًا طائر الفينيق الإلهي، ثم يفر هاربًا، دافعًا الحيتان الأخرى جانبًا. في الحقيقة، إنها غواصة جالاكتور مموهة على هيئة حوت.

أرادوا تتبع غواصة الحوت الضخمة، لكن لإنقاذ حوت صغير يتعرض لهجوم من حيتان قاتلة، انطلقت طائرة G4 بعيدًا. وخلال ذلك، أفلتت الغواصة. وبخهم نامبو على خوفهم، ووضع جهاز إرسال على الحوت الصغير ليساعد في البحث عن الحوت الكبير.

تتجه سفينة "فينيكس الإلهية" إلى الدائرة القطبية الشمالية، متتبعةً الحوت الصغير. بحثًا عن القاعدة، يغادر كين وجو السفينة ويصادفان رجلين يُعرّفان نفسيهما بأنهما حارسا غابة، لكنهما يتعرضان لهجوم من الخلف. يصاب كين بالحيرة. يقول جو إن هذه خدعة من غالاكتور، وأن والديه قُتلا بنفس الخدعة.

يكتشف فريق النينجا العلمي القاعدة ويتسلل إليها. يعلمون أن مجموعة من الغواصات على وشك المغادرة لمهاجمة الموانئ في العالم. فيقومون بزرع متفجرات في القاعدة وفي الغواصات.

لكن، في سبيل مساعدة الحوت الصغير الذي انتهى به المطاف في القاعدة، غاص جينبي معه في البحر. لم يتمكن فريق النينجا العلمي من إيقاف العملية عند هذه النقطة، فهربوا تاركين جينبي. ولكن بعد انفجار القاعدة والغواصات، اتصل بهم جينبي ليخبرهم أن الحوت الصغير أنقذه، فشعر الجميع بارتياح كبير.

تُعرف مملكة رومان باسم "مملكة القمار". يقوم غالاكتور، الذي يضمن منصب الملك، بتحويل ملايين الثروات إلى خارج البلاد. يتألم الأمير لوغا بشدة من تذمر الشعب من الضرائب الباهظة التي تفرضها المملكة. لذلك، يتصل بمنظمة الأمن الدولية (ISO) ويعرض عليهم تسليم فيلم ميكروفيلم يحتوي على مواقع قواعد غالاكتور ومقراتها. يفعل ذلك وهو يعلم أنه يخالف أوامر والده الملك.

في محاولةٍ للاستيلاء على الفيلم، يشارك فريق النينجا العلمي في سباقٍ برعاية الأمير، سباقٌ مفتوحٌ للجميع. لكنهم يواجهون عقباتٍ وضعها جالاكتور، الذي يعلم بخطط الأمير. فيتم استدراجهم، مع الأمير، إلى قاعدةٍ تقع في قلب المملكة.

يريد كاتسي إجبارهم على مقايضة الفيلم بحياة الملك. لكن الأمير كان قد سلّم الفيلم بالفعل إلى كين. يغضب كاتسي ويطلق النار على الملك. يتشبث الأمير بجثة والده ويبكي. لكنه الآن مُلزم بواجبه تجاه شعب المملكة.

يريد كاتسي استعادة الفيلم بالقوة. ولتحقيق ذلك، يعتزم شق بطن جينبي، لأنه تظاهر بابتلاع الفيلم. بعد الشجار الذي تلا ذلك، حاصر جو كاتسي وكاد أن ينزع قناعه، لكن كاتسي أفلت منه في اللحظة الأخيرة. ورغم أنهم أنقذوا حياة الأمير، إلا أن الفيلم، الذي كلف تضحية كبيرة، احترق أيضاً.

يظهر روبوت عملاق على شكل خلد جالاكتور. يتم التواصل مع فريق النينجا العلمي ويبدأون بالاجتماع، لكن في طريقهم، يريد جو إنقاذ كلب صغير بجانب والدته التي قُتلت في الهجوم. يتعرض جو لهجوم صاروخي. يبدأ الروبوت بمهاجمة طائر الفينيق الإلهي أيضًا، لكن نظرًا لضعفه تحت أشعة الشمس، يضطر للانسحاب عند الفجر.

خلال الفحص، تبيّن أن جو أصيب في رأسه بشظية من الصاروخ. ونظرًا لخطورة المنطقة، استحال إجراء العملية. كما فشلت المحاولة في جهاز الطرد المركزي عالي السرعة. ثم وصلت رسالة تفيد بظهور الآلة العملاقة مجددًا.

تم استدعاء الأعضاء الأربعة الآخرين، لكن أفكارهم ظلت مع جو. ولأن سيارة G2 لم تلحق بهم، لم يتمكن غود فينيكس من استخدام قواه المعتادة. في تلك اللحظة، ظهر جو في سيارة G2. تم نقله فورًا إلى غود فينيكس، ولكن بينما كانوا لا يزالون يفكرون في لم الشمل، وقعوا في قبضة الآلة. أراد غود فينيكس الهروب من مصيره المحتوم، لكن ذلك كان مستحيلاً. ضغط جو زر إطلاق الصواريخ وفجر الآلة. علق غود فينيكس في موجة الصدمة الناتجة وقُذف بعيدًا يدور بشدة، لكن بفضل قدرات ريو على التوجيه، استعادوا توازنهم. أدت الصدمة الناتجة إلى إخراج الشظية من رأس جو ونجا حيًا.

يشارك حصانٌ يملكه طبيبٌ خبيرٌ في مجال السايبورغ في سباق الجائزة الكبرى العالمي للخيول، ويفوز بأداءٍ مذهل. عندما يشاهد نامبو هذا الفيديو، يظنّ أن هذا الحصان سايبورغ. فيأمر فريق النينجا العلمي بحماية الطبيب لضمان عدم إساءة استخدام تقنيته المذهلة في مجال السايبورغ.

لكن عندما وصل كين والآخرون، كان الأوان قد فات. لم يتبق سوى شارة جالاكتور واحدة، واختفى الطبيب.

تم إحضار الدكتور هينجمان إلى القاعدة حيث تعرف على وجه إكس الحقيقي. هدد الدكتور هينجمان إكس قائلاً إنه سيكشف سره إن لم يُعيّن ممثلاً له. وافق إكس على مضض.

تهاجم خيول الطبيب الآلية مرجًا. يطاردها فريق النينجا العلمي ويتسللون إلى القاعدة. في الداخل، يجدون الطبيب واقفًا أمام إكس ليكشف عن وجهه، كما أراد. يسقط الطبيب أرضًا بعد أن أصابته أشعة ضوئية أطلقها إكس عندما ضغط كاتسي على زر. يأمر كاتسي الخيول بمهاجمة المدينة ويهرب. ينجو فريق النينجا العلمي ويفجر القاعدة.

قبل وفاته، يطلب الطبيب منهم الضغط على الأزرار الموجودة على ظهور الخيول. وبعد أن يضغط فريق النينجا العلمي على الأزرار الموجودة على كل حصان، يقوم بتفعيل آلية التدمير الذاتي للخيول ويموت في صمت.

تعرض مصنع تعدين اليورانيوم في قاع البحر لهجوم من قبل الآلية العملاقة "كينغ دراغون". ولأن سفينة حراسة تفوق قوة "غود فينيكس" بكثير قد هُزمت خلال الهجوم، لم يأمر نامبو بنشر فريق النينجا العلمي. لكن كين عصى أوامر نامبو وذهب لمواجهة الآلية في "غود فينيكس".

لكن طائر الفينيق الإلهي لا يُضاهي العدو، وحتى ورقتهم الرابحة، طائر النار، تهزمها درجات الحرارة الأعلى بكثير.

يأمر نامبو مجموعة ريد إمبلس بمهاجمة الآلة، لكن قائد ريد إمبلس يعتقد أن كين يجب أن يواجه العدو مرة أخرى ويرفض أمر نامبو.

لذا، يبتكر نامبو خطة أخرى. يريد تركيب جهاز تبريد في غود فينيكس، والذي من المفترض أن يتفاعل مع قنبلة سالبة تُزرع داخل الآلة لتجميد العدو. ولأن كين يعلم أن هذا الأمر بالغ الخطورة، يتقدم بطلب لوظيفة تركيب القنبلة السالبة.

يتسلل كين، مختبئًا بين سرب من أسماك التونة، إلى داخل الآلة العملاقة. ينجح في زرع القنبلة، لكن لا يملك المزيد من الوقت للهرب إذ تبدأ الآلة بالتجمد بفعل طائر النار الجليدي.

يشعر فريق النينجا العلمي بالقلق والتساؤل بشأن كين، عندما يظهر فجأة أمامهم من خلال شق في الآلة، مثل طائر خالد.

من قبو صالة البولينج، تظهر "الكرة الميكانيكية" وتبدأ في تدمير المدينة.

بسبب بساطة بنية كرة ميكا، يصبح الهجوم عديم الجدوى لعدم وجود نقطة ضعف. وعلى عكس رغبة زملائه الأربعة المتحمسين، قرر كين عدم المشاركة، قائلاً إن الهجوم دون فرصة للفوز لن يؤدي إلا إلى موتهم عبثاً.

في الوقت نفسه، يراقب كين جينبي وهو يحرك كرة الباتشينكو باستخدام مغناطيس، ويحصل على فكرة عن كيفية هزيمة الآلة.

عندما يسمع نامبو اقتراح كين، يقوم على الفور ببناء مغناطيس كهربائي ضخم في وسط جبال الألب ويقرر أن إله العنقاء يجب أن يجذب الآلة إلى هناك.

لكن بعد أن انجذبت الآلة العملاقة إلى منتصف الطريق نحو وجهتها، غيّرت مسارها نحو محطة نووية دولية. أراد كين أن يدخل الآلة بنفسه ويقودها نحو المغناطيس. حاول جو منعه، لكن كين أقنعه وانطلق بعيدًا عن غود فينيكس.

بعد أن دخل كين إلى الآلة بمفرده، هزم أعضاء جالاكتور وغير مسار الآلة. ثم دمر لوحة التحكم، ليضمن عدم إمكانية تغيير المسار مرة أخرى.

بينما تحبس جون أنفاسها وتراقب، تنجذب الكرة الآلية نحو المغناطيس وتنفجر. ينعكس شكل كين في عيون زملائه الأربعة المليئة بالدموع، كما لو كان طائرًا يحلق في السماء.

يُقتل العلماء من مقر منظمة الأمن الدولي واحداً تلو الآخر، ويأمر نامبو فريق النينجا العلمي بالعمل كحراس شخصيين.

انفصل فريق النينجا العلمي لأداء مهمتهم في الحراسة. أثناء حراسة كين، التقى بشكل مفاجئ بطيور النينجا السوداء التابعة لجالاكتور، فتبعها، لكنه فقد أثرها قرب مدينة ملاهي. في الوقت نفسه، تعرض جون وجينبي لهجوم من عملاق نيون ظهر مصحوبًا بأصوات مزمار. ولإتاحة الفرصة للعالمين للهرب، قدّما نفسيهما كطعم، لكنهما سقطا من الشارع. أفاد جون أن عملاق النيون يشبه التمثال الهندي القائم أمام مدينة الملاهي حيث اختفت الطيور السوداء. لهذا السبب، انتظر فريق النينجا العلمي حلول الليل وتسللوا إلى المدينة لبدء التحقيق.

بعد أن قالت جون إنها سمعت صوت مزمار، يتبع كين عازف مزمار يقوده إلى قاعدة تحت الأرض. إنه كاتسي متنكرًا. يخبر كاتسي كين أن نامبو ستتعرض للهجوم هذه الليلة.

يتواصل كين مع جو وريو، ويطلب منهما الإسراع إلى موقع نامبو، لكنه يقع في هجوم عنيف من الطيور السوداء. أمام عينيه، يقود كاتسي العملاق النيون بنغمة الناي. عندما يقتحم جون وجينبي المكان، يرمي كين الناي بعيدًا، ويأمر جينبي بالعزف عليه. وبسبب لحن جينبي غير المفهوم، يسخن العملاق النيون بشدة وينفجر. لقد فشلت خطة اغتيال نامبو.

يتعرض مركز أبحاث بركانية تابع لمنظمة ISO لهجوم. يفاجأ إله العنقاء، الذي بدأ التحقيق، بالعملاق البركاني، فيهرب إلى البحر حيث لا يستطيع العملاق اللحاق به.

عندما يقول جو إن وجه عملاق الحمم البركانية يشبه وجه السيد المسيح المنحوت على منحدر شديد الانحدار في الحديقة الوطنية، يتوجه فريق النينجا العلمي إلى هناك للتحقيق. يشتبه جو في أن فتاة تتسلق تمثال السيد المسيح عميلة لغالاكتور، فيستجوبها، لكنها تجيب بأنها هنا لنحت التمثال، مواصلةً بذلك تقليد عائلتها في الجيل الثالث.

ينطلقون مع الفتاة إلى الكهف الواقع في المنحدر الشديد، ليكتشفوا قاعدة. وجه السيد المسيح المنحوت في المنحدر، مغمور في الحمم البركانية المتدفقة داخل القاعدة، ليخرج منها عملاقًا من الحمم. عند رؤية ذلك، يستدعي كين الإله فينيكس. في أعلى القاعدة، توجد قطعة زجاجية خاصة، مغمورة في قاع بحر. يُستخدم البحر كعدسة لتسخين الحمم البركانية باستخدام ضوء الشمس. بصاروخ، يحطمون الزجاج، فيدمرون القاعدة.

عندما وردت رسالة من نامبو تفيد بأن عملاق الحمم البركانية يتجه نحو مدينة، انقسم فريق النينجا العلمي في مركباتهم الفردية واستدرجوا عملاق الحمم البركانية نحو البحر. لم يستطع عملاق الحمم البركانية المقاومة ودخل البحر. تجمد في مياه البحر على الفور وتحول إلى قطعة صخرية سوداء، ثابتة في مكانها.

ثم تحضر الفتاة إزميلها لتبدأ النحت مرة أخرى.

تتعرض سفن منظمة ISO لهجوم متتالٍ من شعاع غالاكتور الأسود. ولأن ريو نائم في طائر الفينيق الإلهي، فلا يمكن استدعاؤه.

يشعر ريو بالمسؤولية ويعيد سواره إلى نامبو، متجاهلاً زملائه الذين حاولوا منعه. ثم يعود إلى قرية الصيد التي وُلد فيها. خلال هذه الفترة، تتلوث مناطق الصيد في القرية لأسباب مجهولة. ولأن والد ريو هو رئيس التعاونية، يُحمّله أهل القرية المسؤولية. يطلب ريو من والده أن يطلب من نامبو تحليل مياه البحر.

في التحليل، تم العثور على مادة ناتجة عن عملية إنتاج المعادن. يعتقد نامبو أن هذا من فعل جالاكتور، ويصل إلى قرية الصيد برفقة فريق النينجا العلمي.

ظنّ ريو، برفقة كين الذي كان يتبعه، أن البحر غريب، فاكتشفا آلةً في الماء على شكل سمكة راي، قادرة على الطيران في السماء والغوص في البحر. وبعد تتبعهما لها، عثرا على قاعدة وتسللا إليها، لكنهما وقعا في الأسر. وبعد أن نجحا في الفرار بصعوبة، كان جالاكتور على وشك نشر آلات الراي لمهاجمة العالم. تحصّن الرجلان في غرفة القيادة وهزما جالاكتور بضخّ الماء إلى القاعدة، لكنهما وقعا في الأسر داخلها أيضاً.

يُبلغ كين نامبو بأن ريو هو من دمر القاعدة، ويطلب إعادته إلى الخدمة الفعلية. يتم إنقاذ الرجلين، اللذين كانا ينتظران مصيرهما المحتوم، بواسطة آلة G4. بعد عودتهما إلى السطح، يستعيد ريو سواره من نامبو.

تلقّت منظمة الأمن الدولي رسالةً من لوسي، إحدى المديرات التنفيذيات في شركة جالاكتور، تُفيد برغبتها في الكشف عن موقع مقرّهم الرئيسي مقابل 10 مليارات دولار. ولذلك، تواصلوا مع لوسي عبر تكليف جو بالانضمام إليها في سباق تحمّل سيارات العملاء العالمي عبر أفريقيا. أما الأعضاء الأربعة الآخرون في الفريق، فسيتولون مهمة حماية الكشّاف.

بعد أن يركب جو السيارة، يتوقع الحصول على المعلومات على الفور، لكن لوسي تقول إنه من غير الممكن الحصول عليها حتى ينتهي الرالي.

في طريقهم، يتعرضون لهجوم من آليات عملاقة مموهة على هيئة حيوانات. لقد علمت جالاكتور بخيانة لوسي. لكن بمساعدة كين والآخرين، ينجون من الهجمات ويواصلون السباق. ومع اقترابهم من خط النهاية، تسأل لوسي صديقها القديم جو إن كانا لا يرغبان في التعاون والسيطرة على جالاكتور.

بعد تجاوز جميع أنواع العقبات، فاز فريق لوسي وجو بالسباق وحصل على جائزة قدرها 100 ألف دولار. في غرفة الشاي، طالب جو لوسي بإعطائه المعلومات كما وعدت. عندما حاولت لوسي الإجابة، بدأت فجأة بالتحرك بشكل غريب، ثم اخترقت جدارًا وسقطت على الأرض حيث انفجرت. كانت لوسي سايبورغًا صنعه جالاكتور، وتسببت إشارة لاسلكية صادرة من إكس في تدميرها الذاتي.

يُصاب جو بالذهول عندما يرى لوسي وقد تحولت إلى كومة من شظايا الحديد. ويشتعل غضبه تجاه جالاكتور من جديد.

يختفي الأطفال فجأةً. حتى أعضاء فريق النينجا العلمي يشهدون إحدى حالات الاختفاء. يتبع كين آثار إطارات على الأرض ويدخل متاهة مرايا. هناك يكتشف بعض الروبوتات الحلزونية، لكنها تصبح شفافة وتختفي.

يجمع غالاكتور أطفالًا ذوي موجات دماغية قوية لإنتاج وحش الموجات الدماغية ألفاجيلا. يقرأ هذا الوحش أسرار منظمة ISO في مؤسساتها، ثم يدمرها. تُعزز نامبو موجات دماغ جون لفترة وجيزة وتجعلها تتظاهر بأنها طعم. يحدد فريق النينجا العلمي موقع إشارتها اللاسلكية، ويتسلل إلى القاعدة أسفل متاهة المرايا وينقذ الأطفال.

ثم، بناءً على المعلومات التي حصل عليها، سيذهب كاتسي إلى غرفة تخزين اليورانيوم في الصحراء.

لكن، ولأن باطن الغرفة يتحول إلى قبة عاكسة، تصبح الآليات التي تسللت، والتي كان من المفترض أن تكون شفافة، مرئية. في الواقع، تقع هذه الآليات في الفخ الذي أعده نامبو. ويدفعها إله العنقاء، الذي يقترب بسرعة، جانبًا.

يعتقد فريق النينجا العلمي أنهم حاصروا كاتسي بالتأكيد هذه المرة، لكنه يهرب مرة أخرى، ويختفي في ألسنة اللهب الزرقاء والبيضاء.

يزور جينبي وريو دار أيتام شيرايوكي حيث نشأ جينبي، للعب مع أصدقائهم. يتوسل إليهم الأطفال لأخذهم لمشاهدة بعض مباريات الكيك بوكسينغ. في الوقت نفسه، تحدث أمور غريبة في منطقة بركانية. يذهب كين والآخران للتحقيق، لكنهم لا يجدون شيئًا غير عادي.

بعد مشاهدة النزال، ذهب الأطفال ليطلبوا من الفائز، غالاك إكس، توقيعه. لكنهم اكتشفوا أنه كان يتدرب على استخدام أسلحة فتاكة مخبأة في قفازات الملاكمة. أمسكت بهم المساعدة واقتادتهم بعيدًا. تبع ريو غالاك إكس بناءً على طلب جينبي، وخاض معه نزالًا، لكنه أصيب. اتصل ريو بكين والآخرين.

يتسلل جينبي، متتبعًا الأطفال، إلى مبنى خلف دار الأيتام. هناك قاعدة جالاكتور، ومساعدها هو كاتسي متنكرًا. ينوي كاتسي تفجير البركان الخامد حاليًا وحرق المدينة. يضغط جينبي على الزر، فيبدأ الثوران. يهرب كاتسي في صاروخ.

بمساعدة كين وآخرين وصلوا حديثًا، تمكنوا من هزيمة غالاك إكس وإنقاذ الأطفال. لكن الحمم البركانية كانت تتدفق من الجبل باتجاه المدينة، مُحرقةً دار الأيتام، واستمرت في طريقها. رغم إصاباته، ظهر ريو فجأةً مُحلقًا في طائر الفينيق الإلهي. اتحدوا معًا ودمروا الجبل بصاروخ، ونجحوا في سد الحمم. نُقذت المدينة، لكن دار الأيتام احترقت بالكامل. بدأ فريق النينجا العلمي بإعادة بنائها، بمساعدة الأطفال.

يُعاني العالم من نقص حاد في المياه. وكأن عدوًا خفيًا يُلاحق عدوًا مهزومًا، يواصل قصفه، مُدمرًا السدود وخزانات المياه. لقد باتت الأرض في وضع حرج.

يتم استدعاء طائر الفينيق الإلهي، ويكتشف وجود الآلة الطائرة كاميسورال التي تحولت إلى ظل أبيض. مجرد المرور بجانبها يُلحق بها أضرارًا جسيمة، والصواريخ عديمة الجدوى لأنها قابلة للقطع بمنجل الآلة.

تمكن فريق النينجا العلمي بطريقة ما من الفرار والوصول إلى نامبو. وخلال ذلك، وردت رسالة من كاتسي تفيد بأن غدًا سيكون آخر يوم للبشرية.

يتوقع نامبو أن يهاجم الميكا محطة طاقة نووية تالياً. ولخلق اضطرابات وفراغ، وهما نقطة ضعف الميكا، تم تغيير خطة توليد مطر اصطناعي إلى حجم إعصار.

بفضل فلتر خاص، يتوجه طائر الفينيق الإلهي إلى محطة الطاقة وينجح في استدراج الآلة إلى منطقة الاختبار من أجل هطول الأمطار الاصطناعية.

أثناء انتظار الإعصار الاصطناعي، يقع طائر الفينيق الإلهي في قبضة الآلة ويضطر إلى القتال بشراسة. لم تُجدِ الصواريخ نفعًا، وانجرف طائر الفينيق الإلهي، المحاصر في منجل الآلة، إلى قلب الإعصار معها.

في إحدى الحالات، تضاءلت قوة منجل الآلة بسبب صدمة العاصفة الرعدية. تمكن طائر الفينيق الإلهي من الفرار. انجذبت الآلة إلى عين الإعصار بفعل الفراغ وانفجرت. انتهت أزمة الأرض.

تتعرض سيارة نامبو لهجوم من جالاكتور. ولكن بفضل جو، الذي يبدو أنه يتذكر قنبلة الوردة الخاصة بنجمة الشيطان، ينجون بأعجوبة.

يرغب الجميع في التركيز كليًا على حماية نامبو لأنه مُستهدف. لكن جو لا يوافقهم الرأي ويغادر الفيلا. وللسيطرة على غضبه، يقود جو سيارته حول حلبة سباق. عندما قُتل والداه، أصيب هو الآخر بجرح قاتل جراء قنبلة ورد. تعود ذكرياته إلى الحياة ويفكر في الانتقام. في تلك اللحظة، يضطر لإنقاذ امرأة من حادث على الحلبة. قبل أن يفترقا، يتفقان على التسابق معًا على الحلبة في اليوم التالي.

في هذه الأثناء، يصعد نامبو إلى القطار العابر للقارات، برفقة سكرتيرة الرئيس أندرسون، لإجراء تحقيق. يظن كين أنها خدعة من غالاكتور، فيصعد إلى القطار أيضًا. يختبئ أعضاء الفريق الثلاثة المتبقون وينتظرون وصول نجوم الشيطان في مركباتهم. يهزم كين أعضاء نجوم الشيطان في القطار، لكن السكرتيرة، بعد أن تحولت إلى القائدة، تتمكن من الفرار في طائرة قرصية الشكل. يهزم جون أعضاء نجوم الشيطان الذين يريدون تدمير المسارات في الأمام. يواجه جو آخر عضو متبقٍ من نجوم الشيطان. كان يعرف الموقع من خلال نجمة نينجا تركها كين على الخريطة. تتصادم أسلحتهما. تخترق قنبلة الوردة صدر نجم الشيطان مع نجمة النينجا. يمران بجانب بعضهما البعض، ومن خلف جو، يسقط قناع نجم الشيطان. يظهر وجهها، إنها الفتاة التي كان جو يخطط لمنافستها.

يستهدف غالاكتور مدينة لونبارك، التي استنفدت منظمة ISO جميع مواردها لإنجازها. يظهر ميكا جيزورا ويبدأ بالهجوم. يتصدى له غود فينيكس، لكن الميكا يهرب باستخدام ستار دخاني.

بعد تلقي تحذير من جالاكتور، اندمج فريق النينجا العلمي مع المواطنين الآخرين وبدأوا بالتحقيق. لكن ظنًا منهم أن الأمر قد يكون فخًا من جالاكتور، خلعوا أساورهم وتفرقوا في أنحاء المدينة.

أثناء بحثهما، أنقذت جون وجينبي امرأةً من هجوم مجرمين عنيفين، ودُعيا إلى قصر. شكّت جون في الأمر وقبلت الدعوة عمدًا. استقبلتهما سيدة المنزل بحفاوة ودعتهما إلى وليمة شهية. غلبه النعاس بسبب مخدر في القهوة، بينما تظاهرت جون بالشرب والنوم. راقبت جون ما يجري بحذر. عندما أمرت سيدة المنزل رجالها بقتلهم، قاومت جون، لكن تم القبض عليها. اعتذرت جون قائلةً إنها ضابطة شرطة، لكن سيدة المنزل اقتنعت بأنها عضوة في فريق النينجا العلمي، فحبستهما في سجن تحت الأرض.

يشعر كين والآخرون بالقلق عندما لا يظهر جون وجينبي في الوقت المتفق عليه وينفصلون مرة أخرى.

في هذه الأثناء، يحاول جيزورا استدراج الأعضاء الثلاثة المتبقين من فريق نينجا العلوم إلى العراء عن طريق مهاجمة مصنع كيميائي.

فريق النينجا العلمي لا يعرف مكان جون وجينبي، ويبدأ جيزورا بالهجوم. ولكن مع غياب اثنين منهم، يصبح تسجيل النقاط صعباً على الفريق.

يظهر كاتسي في ساحة المدينة الكبيرة ويعلن جهارًا أنه سيواصل الهجوم حتى يظهر فريق النينجا العلمي. وبينما تُصوَّب بنادق جالاكتور نحو بعض الأطفال الذين يرمون الحجارة، يطير بوميرانغ كين، وينتهز جو وريو الفرصة للظهور أيضًا. يُحاصر كاتسي، لكنه يتباهى بأن اثنين من فريق النينجا العلمي أسيران لديه. يُناقض كين هذا الادعاء، قائلًا إن العضوين المتبقيين موجودان داخل طائر الفينيق الإلهي. يصعد كاتسي إلى جيزورا ويهرب.

كان جون وجينبي على وشك الإعدام على يد سيدة المنزل عندما، وفقًا لخطة كين، ظهر طائر الفينيق الإلهي الذي يحمل خمسة أشكال بشرية على الشاشة. فتوقف الإعدام.

بينما يتسلل كين إلى قصرٍ بدا له مريبًا، يجد رسالةً تقول إنه إذا أراد إنقاذ الاثنين، فعليه التوجه إلى مبنى تخزين اليورانيوم. يهرع طائر الفينيق الإلهي إلى هناك. هناك، تحلق جيزورا حاملةً المبنى بين يديها. يتسلل كين إلى داخل جيزورا وينقذ عضوي الفريق. بعد أن يزرع جون قنبلة، يهربون معًا.

يظهر فريق النينجا العلمي، المؤلف من خمسة أعضاء، ويتجه نحو كاتسي. تنفجر جيزورا عند ملامستها لليورانيوم، ومرة ​​أخرى، كاتسي هي الوحيدة التي تنجو.

تهاجم موجات راديو غريبة الناس مصحوبةً بظاهرة الشفق القطبي. وبعد ذلك، تنتشر هذه الموجات بشكلٍ عشوائي وتتسبب في حوادث خطيرة. أثناء صيد السمك، يتعرض ريو أيضًا لهذه الموجات. ولأن كلام ريو وسلوكه غريبان بعد عودته إلى القاعدة، يُجرى تحقيقٌ في الأمر. ويتضح أن موجات دماغه تشبه موجات دماغ القطط.

بالإضافة إلى ذلك، تأثر نامبو بتلك الموجات اللاسلكية أيضًا. وفي نوبة غضب، حاول تفعيل زر آلية التدمير الذاتي لكريسنت كورال. لكن جو لكمه بقوة.

يصطحب كين وجو ريو معهما ويتوجهان إلى المكان الذي أصيب فيه ريو بموجات الراديو، بحثًا عن أدلة. ولأنهم لم يجدوا أي إجابات، يغضب جو ويلكم ريو، الذي يصطدم بدوره بلوحة القارب ويتعرض لصدمة كهربائية. إلا أن هذا يعيده إلى شخصيته الحقيقية. يعتقدون أن الصدمة الكهربائية قد تكون السبب في حالة نامبو أيضًا، ولكن نظرًا لتغير تردد موجات دماغ نامبو باستمرار، يضطرون إلى تدمير الجهاز الذي يُصدر موجات الراديو. ولذلك، يتم استدعاء طائر الفينيق الإلهي، ويبحثون عن الشفق القطبي المريب الذي رآه ريو.

ما يجدونه في النهاية هو ثاندرسورس، لكن فريق النينجا العلمي يضطر للقتال بشراسة بسبب حاجز الموجات الراديوية الذي يحيط بالآلة. يُطلق صاروخ، لكنه يعلق ولا يعمل. ومع زيادة الجهد الكهربائي للآلة، ينفجر غلافها الواقي. لقد أعدّ جون جميع التجهيزات اللازمة لخلق وضع يتسبب فيه الجهد المتزايد في حدوث انفجار. تُدمّر الآلة ويعود جميع الأشخاص الذين كانوا يجوبون الشوارع إلى طبيعتهم.

في دولة دوريا، تم اكتشاف ينابيع نفطية. اندلع صراع بين الملك، الطامع بحقوق التعدين، والأمير، المتحالف مع الشعب الفقير الثائر. تحوّل الأمر إلى حرب أهلية. والآن، هناك قوة لا تهدأ، عازمة على تحويل هذا الصراع إلى حرب عالمية.

الملك، الذي يجد نفسه في موقف لا يُحسد عليه في هذه الحرب، يطلب المساعدة من فريق النينجا العلمي. يتسلل طائر الفينيق الإلهي إلى البلاد متخذًا هيئة طائر النار. يتصل كين بالأمير علي ويقنعه بالتحدث مرة أخرى مع والده الملك. يتوجهان معًا إلى القصر. لكن رد الملك يكون وابلًا من الرصاص، موجهًا نحو الأمير ورفاقه. يوقف كين الأمير الذي كان ينوي مهاجمة الملك. يُلقى كلاهما عبر فتحة في الأرض إلى سجن تحت الأرض، حيث يعثران على هيكل عظمي للملك الحقيقي. يطلب كين من طائر الفينيق الإلهي أن يأتي ويأخذهما، فيهرب.

في القصر، يتجمع الناس للمطالبة بالإفراج عن الأمير علي. يهاجمهم ميكا موسكون بالقنابل. كاتسي، متنكرًا في زي الملك، يضحك ساخرًا وهو يشاهد هذا. يظهر كين أمامه ويقطع حبل النجاة الذي كان كاتسي ممسكًا به. يسقط كاتسي في شوارع المدينة المشتعلة.

في مكان آخر، انكشفت طبيعة الآلة العملاقة في تتبع كل حركة، وتمكن طائر الفينيق الإلهي من استدراجها إلى حقل النفط. أطلق عليها طائر الفينيق الإلهي النار، فاشتعلت النيران فيها مع حقل النفط. رأى سكان دوريان طائر الفينيق الإلهي يخرج من اللهب على هيئة طائر ناري، وبدأوا يعبدون إله الطائر الناري، فبدأوا يؤمنون بإمكانية إعادة بناء بلادهم.

تعرضت سفينة أبحاث تابعة لمنظمة ISO للهجوم، وفُقدت معها بيانات تتعلق بموارد اليورانيوم في قاع البحر.

في خضم التحقيق، يكتشف فريق النينجا العلمي ثلاثة أشخاص، أب وابنيه، يطفون في البحر. يدّعون أنهم شاهدوا ما حدث أثناء الصيد. لكن في القرية التي يعيشون فيها، يُعرف الأخوان تارو وجيرو ووالدهما بالكذب. لا أحد يُصدّق شهادتهم بأنهم رأوا شبح جراد البحر ومنارة متحركة. يكتشف كين أن الحبار الذي اصطادته العائلة كان صاروخًا. يقرر فريق النينجا العلمي إلقاء نظرة على المنارة.

ينقذ كين تارو وشقيقه من وشقٍّ كان يحوم بالقرب من المنارة. كانا يقلدان فريق النينجا العلمي بارتداء عباءات مصنوعة من ريش الدجاج. يتضح أن الوشق كان سايبورغ من جالاكتور. بعد ذلك، يقول تارو إنه يعرف ممرًا سريًا إلى المنارة ويقود كين إليه.

أسفل المنارة، تقع قاعدة جالاكتور. وفي خضم الفوضى التي تلت ذلك، صعد تارو وجيرو على متن صاروخ المنارة الذي يحمل أيضًا بيانات موارد اليورانيوم. ظن قائد جالاكتور أنه أسر فريق النينجا العلمي، فتوجه إلى القاعدة حيث كانت كاتسي تنتظره.

تتعرض سفينة "غود فينيكس"، التي تتبع آلية جراد البحر، لهجوم من أعشاب بحرية معدنية خاصة وحبار صاروخي. يكتشفون القاعدة بالقرب من موقع الهجوم، وينقذون الأطفال ويستعيدون البيانات. يتمكن كاتسي، رغم محاصرته من قبل أعضاء الفريق الخمسة، من الفرار مجددًا باستخدام جدار زجاجي فاصل.

يجري الدكتور ميوا أبحاثًا حول إمكانية استخدام سطح بحيرة سانجو، المتجمدة طوال العام، لتوليد طاقة شمسية قوية، بدلًا من استخدام الزجاج المستقطب. وقد اختفى فجأة. كانت لديه تساؤلات لأن البحيرة لم تكن متجمدة هذا العام، ويبدو أنه بدأ تحقيقًا في الأمر. يأمر نامبو فريق النينجا العلمي بالبحث عنه، ليس فقط خوفًا من إساءة استخدام أبحاثه، بل أيضًا لأنه صديقه.

يتجه فريق النينجا العلمي، بقيادة تارو، حيوان الطبيب الأليف الذي تمكن من الوصول إلى نامبو بكاميرا، نحو الجبال الثلجية. وهناك يكتشفون قاعدة جالاكتور. ينخدع فريق النينجا العلمي وتارو بانعكاس الطبيب. يجرف الماء المتساقط من سقف القاعدة، حيث يقع سطح البحيرة، تارو. يُحاصر فريق النينجا العلمي بجدران مصنوعة من الزجاج المقوى.

لكن بمساعدة تارو، ينجح فريق النينجا العلمي في الفرار ويتدخل في منطقة اختبار الآلة باستخدام أبحاث الطبيب. يخترق بوميرانغ كين قناع كاتسي، فيخفي كاتسي وجهه ويهرب.

يصطحب كين الطبيب معه، ويسرق زلاجات العدو الثلجية، ثم يهرب من القاعدة. يهاجم تارو زلاجات أعضاء جالاكتور الذين كانوا على وشك مهاجمة الطبيب، فينجو الطبيب، لكن تارو يختفي عن الأنظار في قاع الوادي.

انفجرت لينجيرا لعدم وجود الطبيب أثناء التجربة، واختفت مع القاعدة. أما مصير تارو فغير معروف.

كجزء من خطة مانتل، يجري بناء مدينة خالية من التلوث في الصحراء. وصل نامبو وفريق نينجا العلوم إلى المدينة لحضور حفل الافتتاح. وفي منتصف الموكب، كان رجل يُعرّف نفسه بأنه عالم الآثار الدكتور موكاشيسكي، يوزع منشورات لمعرض ديناصورات.

في تلك الليلة، هاجمت الديناصورات المدينة، فتسلل كين إلى معرض الديناصورات التابع للدكتور موكاشيسكي. اتضح أنه غابة من عصر الديناصورات. علق كين في نبات اللبلاب المعدني، وتمكن من الهرب إلى مجاري الصرف الصحي تحت الأرض، لكن سواره سُلب منه هذه المرة. أخذ الطبيب السوار، وأخفاه لينسب الفضل لنفسه.

يوبخ نامبو كين بشدة، ثم يأمر فريق النينجا العلمي باستعادة السوار بأي ثمن. ويترك نامبو مهمة مهاجمة الديناصورات لريد إمبلس. يتسلل كين عائدًا إلى المجاري التي هرب منها، ويكتشفه العدو، لكن جي-4 يلحق به وينقذه. يتسللان معًا إلى القاعدة وينقذان أعضاء الفريق الثلاثة الآخرين الذين حوصروا داخلها. كما يستعيدان السوار من الدكتور موكاشيسكي. بعد أن دمر فريق النينجا العلمي جهاز التحكم عن بعد، تنفجر طاقة الدفع المغناطيسي للديناصورات، فتُدمر هي والقاعدة معًا.

تظهر سفينة ديفيلستار خارج الغلاف الجوي للأرض. وتطلق كاتسي جراثيم نبات جيجوكيلر باتجاه الأرض.

في ليلة ممطرة، تتعرض النساء (فقط النساء) للهجوم. جون، التي كانت وحيدة في متجرها، تتعرض للهجوم أيضاً. تحضر جون نسيجاً من إحدى الزهور التي أحرقتها قنبلتها إلى نامبو. يكشف التحليل أن الزهرة نبتة آكلة للحوم من العصور القديمة. لكن لم يُحدد بعد ما هي نقاط ضعفها وعاداتها، وما إلى ذلك. ولأن النساء فقط هن من يتعرضن للهجوم، تستعير جون ببساطة بدلة واقية تسمح لمرتديها بالتنفس حتى في أعماق المحيط، وتقود دراجتها النارية بسرعة عبر المدينة، لتكون بمثابة طعم. يتبعها جينبي، فتبتلعها نبتة "قاتلة الجيغ" أمامه.

يفرّ قاتل الجيجوكيلر. أثناء بحث فريق النينجا العلمي عن جون، يتلقون أوامر بحرق بعض نباتات قاتل الجيجوكيلر للقضاء عليها نهائيًا. تقع هذه النباتات عند خزان مياه يخدم عشرة ملايين نسمة. يتردد أعضاء الفريق خشية أن يكون جون لا يزال حيًا في إحدى تلك النباتات، لكن كين يقول إن هذا واجب فريق النينجا العلمي، وعلى الرغم من حزنه، يُسقط وقود طائرته على الأزهار. ولأن طائر الفينيق الإلهي يعلم بمشاعر كين، يُشعل الأزهار بصواريخ. في هذه الأثناء، يُحاصر جون داخل إحدى الأزهار. تشتعل النيران، وتنطلق من داخل الأزهار أبواغ بيضاء، أبواغ لا يزال سرها مجهولًا لفريق النينجا العلمي.

يغرق جينبي في حزنه داخل متجر جون الخالي. وفي مكان آخر، ينهمك نامبو في أبحاثه حول نباتات جيجوكيلر.

بدأت نباتات "جيجوكيلر" المخفية في المجاري نشاطها، وتلتها تقارير عديدة عن الأضرار. رفض كين أمر الإخلاء، مدفوعًا بندمه على هجره لجون. شددت عليه "ريد إمبلس" على أهمية مسؤوليته، وأنه من واجبه على الأقل العثور على جثتها إن كانت جون قد ماتت.

تلقى سوار كين إشارة تحذيرية من الطيور. ورغم احتمال كونها فخًا، تم استدعاء فريق النينجا العلمي. مدينة ويلي مجهزة بشبكة صرف صحي متطورة. حددوا موقع الإشارة في قاعدة تحت الأرض، وهي مثالية لنباتات جيجوكيلر، لأنها ضعيفة تحت أشعة الشمس وتنمو في الظلام والماء. بعد اقتحام القاعدة، تمكنوا بصعوبة من إنقاذ جون المربوط إلى سقالة.

في هذه الأثناء، يكتشف نامبو بالصدفة أن دمه يُفشل خطة "قاتل الجيج". وبسبب ذلك، يكتشف أن النبتة لا تتحمل وجود الكروموسوم Y الموجود لدى كل رجل. فيُسلّم نامبو "النبضة الحمراء" قنبلة خاصة تحتوي على الكروموسوم Y.

بسبب القنبلة التي ألقاها ريد إمبلس، يهطل مطر من كروموسوم Y، فتذبل جميع نباتات جيغوكيلر. انتهت أزمة البشرية.

بدعوة من جون، يزور فريق النينجا العلمي حفلاً موسيقياً لفرقة الروك الشهيرة ديمون 5، والذين يتم اختطافهم من قبل جالاكتور أمام أعينهم مباشرة.

يُشغّل غالاكتور الشيطان الخامس موسيقى القتل التي ألفها إكس. باستخدام آلة سونيك ميكا، يبدأون بعزف هذه الموسيقى عالياً فوق المدينة. تُدمّر الموسيقى المباني وتُصيب الناس بالجنون. يتم استدعاء طائر الفينيق الإلهي، لكنه يُجبر على التراجع مؤقتاً بعد مواجهة هجوم مضاد.

بعد نجاح العملية، استعاد كاتسي نشاطه، فأمر الشيطان رقم 5 بعزف موسيقى قتل قوية أخرى، لكن هذه المرة، استخدم عازف الطبول عصيه لإضافة إشارة مورس. لاحظ جون هذه الإشارة المدمجة في الموسيقى. وكشف التحليل أن الإشارات تدل على موقع قاعدة جالاكتور.

يسرع فريق النينجا العلمي في مركبة "غود فينيكس" لإنقاذ الشيطان رقم 5 قبل إعدامه مباشرةً. لكنهم يتعرضون لهجوم من "سونيك ميكا". يتلقى الفريق نصيحة من نامبو بأن يصدروا نفس الأصوات، ولكن بتأخير نصف ثانية. وبينما يتبعون هذه النصيحة، تتعطل الموجات المغناطيسية الصادرة من "سونيك ميكا" مما يؤدي إلى تدميرها الذاتي.

بعد عودتهم سالمين إلى ديارهم، يعود فريق الشياطين الخمسة إلى تقديم حفلهم الموسيقي. كما يحضر فريق النينجا العلمي، ويستمعون إلى الموسيقى كأي شخص عادي.

أثناء إجازته، سأل ريو سيارة عابرة إن كان بإمكانهم اصطحابه معهم. لكن السيارة كانت جزءًا من خطة جالاكتور لتحرير السجناء. ونتيجة لذلك، وقع ريو في قبضة جالاكتور واقتادوه إلى سجن جينجين الذي يضم فقط سجناء محكوم عليهم بالإعدام حاولوا الهرب سابقًا. عند وصول جالاكتور إلى السجن، قتل الحراس وجمع السجناء في ساحة السجن. كانت الخطة هي ضمهم إلى جالاكتور. كان ريو وسط هؤلاء السجناء، لكن لأنه خلع سواره، لم يتمكن من التواصل مع كين والآخرين. فقرر الذهاب معهم إلى قاعدة جالاكتور.

بعد أن علم نامبو بالحادثة، بدأ يخطط لعملية خداعية لنصب كمين لجالاكتور.

كين، متنكرًا في زي القائد، يُدخل جميع السجناء إلى مركبة "فينيكس الإلهية" المموهة على هيئة طائرة نقل تابعة لغالاكتور. يريد كين استخلاص معلومات من زعيم غالاكتور الذي جاء لاصطحاب السجناء حول موقع قاعدتهم الرئيسية. يصبح كين مشتبهًا به، فيُفقد وعيه. لكن بقية فريق النينجا العلمي، ومعهم شريط يحتوي على مقاطع صوتية لكاتسي، يتمكنون من مواصلة العملية. ينخدع السجناء بمنظر طبيعي مزيف بُني في ساحة السجن، وينتهي بهم المطاف عائدين إلى السجن نفسه. يلتقي ريو بأصدقائه، ويتذكر الرجل الوحيد الذي قابله في السجن والذي يحلم بالعودة إلى عائلته.

تعاني دولتا بيان وأميريا من حرب طويلة. وعندما تُبرم الدولتان السلام أخيرًا، تتزوج ممثلتاهما عن السلام، رومينا وجوليا، كرمزٍ للسلام. إلا أن جالاكتور يُخطط لمنع زواجهما، لإشعال حربٍ جديدة في كلا البلدين.

يقوم فريق النينجا العلمي بدور الحراسة الشخصية خلال رحلة شهر العسل. يشك جو في الرجل الذي قابله في المطار، والذي يُفترض أنه يحمل نفس قناعات رومينا، فيتبعه، لكنه يفقد أثره قرب معبد قديم. في هذه الأثناء، تقع رومينا وجوليا في قبضة روبوتات جالاكتور. يتبعهما كين والآخرون، الذين ما زالوا يؤدون واجب الحراسة، لكنهم يفقدون أثرهما.

أثناء بحثهم في الجوار، عثروا على المعبد القديم. تسلل فريق النينجا العلمي إلى الداخل، فهاجمهم روبوت عملاق على شكل حمامة. قاتلوا بشراسة، لكن شعاع الشمس المنعكس من حجر جون الصغير الذي سقط، تسبب في تدمير الروبوت العملاق ذاتيًا.

عندما يتدخلون داخل القاعدة السرية، يكتشفون رومينا جوليا، وقد حوّل غالاكتور جسديهما بالكامل إلى سايبورغ. يعرض عليهما كين إمكانية الهروب، لكنهما يختاران الموت، ليصبحا سببًا للسلام، بدلًا من أن يعيشا كدمى في يد غالاكتور. يتعانقان ويتبادلان القبلات، ثم يلفّ البرق جسديهما السايبورغيين المتحولين، محطمًا مؤامرة غالاكتور إربًا إربًا.

يهاجم أركيو التابع لجالاكتور مدينة موروي. لكن نامبو يرى أن فريق النينجا العلمي لا يُضاهي قوة الموجة الصدمية للآلية، لذا لا يتلقون أوامر بالتحرك. حتى عندما يصل إعلان من جالاكتور، لا يتلقى فريق النينجا العلمي سوى أمر بالبقاء على أهبة الاستعداد. يتجاهل الفريق محاولة نامبو إيقافهم ويستعدون للتحرك. لكنهم يجدون أنفسهم في موقف خطير عندما تصيبهم الموجة الصدمية للآلية. وينقذهم ريد إمبلس.

يصرخ كين في وجه نامبو الغاضب قائلاً إنه لا يمانع في تسليم الأساور إلى فرقة ريد إمبلس. يسأل قائد ريد إمبلس نامبو عما إذا كان من الممكن تسليم كين والآخرين إليه. في قاعدة ريد إمبلس، الواقعة في البحر الجنوبي، يبدأون تدريباً خاصاً. يواصل كين وقائد ريد إمبلس تكرار تمرين رفع طائراتهم بسرعة. يراقب الأربعة الآخرون كين بتعاطف. إنه سعيد للغاية، يشعر وكأنه مع والده، رغم استمراره في الاحتجاج. ينتظر أعضاء ريد إمبلس الآخرون هؤلاء الأربعة أيضاً، ويخضعون لتدريب خاص.

في منتصف التدريب، يرى كين الأمواج الناتجة عن حصاة ألقاها ريو في الماء، ويفهم فجأة هدف هذا التدريب - وهو غزو مركز الموجة الصدمية.

مرة أخرى، ورد إعلان عن الهجوم التالي الذي يشنّه أركيو، وانطلق غود فينيكس مع فرقة ريد إمبلس. وباختراقهم الموجة الصدمية وإلقاء القنابل على الآلة نفسها، تمكنوا من تفجيرها.

كين، المرافق لريد إمبلس، لا يعلم أن قائد ريد إمبلس هذا هو والده الذي يسعى إليه بشدة.

يتعرض مصنع تعدين سري تابع لمنظمة ISO لهجوم، وتحاصر جالاكتور الجزيرة التي يقع عليها المصنع. في المنجم، يُستخرج خام يحتوي على طاقة تفوق طاقة اليورانيوم. إذا وقع هذا الخام في أيدي جالاكتور، ستكون العواقب وخيمة. يعارض نامبو منظمة ISO التي تطالب بحماية الخام، ويصر على أن إنقاذ الناس هو الأولوية. يتجه فريق النينجا العلمي ومجموعة من سفن النقل نحو جزيرة الفقمة حيث يقع المصنع.

الجزيرة مخفية طوال العام في ضباب كثيف، وجالاكتور يقف هناك عاجزًا عن التدخل. تتسلل مجموعة، متفاديةً هجوم جالاكتور، وتقترب من الجزيرة. يرسلون جي-4 إلى الجزيرة، فيقرر إخراج العمال منها إلى السفن. يتمكن من إخفائهم بين مجموعة من الفقمات التي فوجئت بهجوم جالاكتور، والتي كانت تبحث عن مأوى في البحر.

تنجح الخطة ويُنقذ العمال، لكنّ خام الحديد يُسرق بواسطة آلة غالاكتور. كما يُكشف عن إمكانية هروب العمال. تُهاجم سفن النقل ويُؤخذ العمال رهائن. يُهدد كاتسي بقتل العمال إن لم يظهر فريق النينجا العلمي. يظهر فريق النينجا العلمي في القبة أعلى سفينة غود فينكس، ولكن في اللحظة التي تُصوّب فيها البنادق نحوهم، يقفز صغير الفقمة الذي أخذه جينبي معه إلى البحر. يتشتت انتباه أعضاء غالاكتور للحظات بسبب هذا الصوت، ويستغل فريق النينجا العلمي الفرصة لشنّ هجوم مضاد. ينجحون في استعادة خام الحديد من الآلة.

كان كين يُجري صيانة لطائرته المحبوبة في المطار عندما أجبره رجلٌ مُسلّح على قيادة طائرة أخرى. ولأن طائرة كين لا تتسع إلا لشخص واحد، أجبره الرجل على قيادة طائرة أخرى مُصممة لشخصين. أثناء الرحلة، انتهز كين الفرصة وحاول انتزاع سلاح الرجل. لكن الرجل أطلق رصاصة أصابت سلكًا في زعانف ذيل طائرة السيسنا، مما جعل السيطرة عليها مستحيلة. استخدم الرجل المظلة الوحيدة الموجودة على متن الطائرة وهرب، مُدّعيًا أنه سيبيع معلومات لمنظمة الأمن الدولي. اضطر كين للهبوط اضطراريًا، لكن بسبب الصدمة، توقف جهاز الراديو الموجود في سواره عن العمل.

يرى كين روبوتًا عملاقًا من طراز جالاكتور، فيتبع الرجل الذي يتجه نحو وادٍ. هناك منجم جالاكتور مهجور. يُقبض على كين والرجل ويُعلقان في بئر قديمة. خان الرجل جالاكتور طمعًا في المال، وأخفى شريطًا في البئر يحتوي على محادثة مسربة بين كاتسي ورئيس وزراء دولة ما. يُحوّل كين نفسه وينقذ الرجل، ويهزم جميع أعضاء جالاكتور في المبنى. لكن في انفجار وقع في ذلك الوقت، يُصاب الرجل، الذي رأى وجه كين الحقيقي وتبعه، بجروح بالغة.

كان قائد الجالاكتور، الذي نجا، على وشك مهاجمتهم بآلية عملاقة. سلّم الرجل الشريط إلى كين، مع رسالة إلى والدته المقيمة في هونتوال، ثم ألقى بنفسه وقائد الجالاكتور نحو قاع الوادي. لم يتبقَّ سوى الشريط الذي حطّمه القائد، واسم واحد: "كيلي، اسمي آرثر كيلي".

لإتمام بناء حاسوب فائق، يقوم المدير أندرسون بنفسه بنقل نواة هذا الحاسوب على متن طائرته الخاصة إلى معهد الأبحاث في هضبة جيتول. يتوقع جالاكتور ذلك، ويبدأ بالتحرك لسرقة المكون قبل وصوله إلى معهد الأبحاث شديد التحصين.

يتولى فريق النينجا العلمي، على متن طائرة "فينيكس الإلهية"، مهمة حراسة الطائرة الخاصة بالمدير. لكن كاتسي المتنكرة كانت قد حلت محل مضيفة طيران. تقضي كاتسي على الطيار وتوجه الطائرة إلى القاعدة مسترشدةً بموجات الراديو. يلاحظ المدير أندرسون الكارثة ويرسل إشارة مورس عبر جهاز الراديو المثبت على المقعد. يستقبل كين والآخرون الإشارة ويتبعون جهاز المدير فورًا بهدف استعادته. لكن ينتهي بهم المطاف في قاعدة جالاكتور. قبل وصولهم إلى القاعدة، يهرب المدير باستخدام مقعد القذف. لكن نواة الكمبيوتر تسقط داخل القاعدة. يندلع قتال بين فريق النينجا العلمي وأعضاء جالاكتور في إحدى الغرف، لكن بفضل العمل الجماعي المتقن، يستعيد فريق النينجا العلمي المكون.

بعد استعادة الوزير والوحدة، قاموا بتفجير قاعدة جالاكتور بصاروخ، ثم توجهوا إلى معهد الأبحاث في مركبة غود فينيكس.

يخطط جالاكتور لاستخدام جهاز "شاتر كيلر" لنسخ البيانات من مؤسسات منظمة الأمن الدولي (ISO) ثم تدمير تلك المؤسسات. وتتعرض مؤسسات منظمة الأمن الدولي للهجوم تباعاً.

يحرس فريق النينجا العلمي المؤسسة الأكثر عرضة للهجوم، وبعد تظاهرهم بالهزيمة، يتبعون الآلية العملاقة في مركبة G-4. يعثر جينبي على قاعدة جالاكتور وسط الصحراء، ويواصل الحفر في الأرض بمركبته. يتبعه أعضاء الفريق الأربعة الآخرون ويتسللون إلى القاعدة. لكن عند دخولهم، يجدون مركبة G-4 خالية. يبدأون البحث عن جينبي، ويعثرون على مصنع يستعيد بيانات ISO المنسوخة. يتفرقون، ويواصلون تدمير المصنع والبحث عن جينبي.

في هذه الأثناء، تم نقل جينبي بواسطة مركبة فضائية كان من المفترض أن تبث أشعة من الآلة العملاقة. نجا جينبي ودُمر المصنع، لكن كاتسي صعد إلى الآلة العملاقة وهرب. قام كين والآخرون بتوصيل سلك بالآلة، وتبعوه. أراد كاتسي إطلاق النار عليهم بوميض الليزر الإلكتروني المنبعث من الآلة.

لاحظ كين ذلك فألقى ببوميرانغه على جزء الغالق في الآلة. ونتيجة لذلك، لم تتمكن الآلة من فتح الغالق، فأصاب الليزر داخلها، مما أدى إلى انفجارها.

بعد أن تضررت سفينتهم، يعود فريق النينجا العلمي إلى قاعدته. لكن كاتسي سيعود، كاشفاً عن أنيابه.

يرافق فريق النينجا العلمي نامبو، الذي حضر إلى مقر منظمة ISO لحضور مؤتمر. يكتشف جينبي سيارة تحمل شعار جالاكتور، فيختبئ فيها ويتوجه إلى قاعدة جالاكتور. لكن عندما يحاول التواصل مع كين، يُقبض عليه.

في هذه الأثناء، تصل رسالة من كاتسي إلى مكتب نامبو تُهدده بتفجير مباني منظمة الأمن الدولي ما لم يُسلّم فريق النينجا العلمي بياناتٍ تتعلق بخام اليورانيوم المكتشف حديثًا. ورغم علمه بأنها فخ، يُحشد نامبو فريق النينجا العلمي.

أثناء توجهها إلى الموقع المتفق عليه، تعرضت سفينة "غود فينيكس" لهجوم صاروخي من روبوت عملاق. استخدم كين جراد البحر المنتشر في المنطقة لتغيير مسار الصواريخ. تظاهر كين بأنه قد هُزم، فألقى بحقيبة البيانات في البحر، لتظهر وسط بعض الحطام.

تجمع الآلية الحقيبة وتعود إلى القاعدة. في تلك القاعدة، يهرب جينبي الأسير، مما يُثير ذعر الطيور. من تلك الإشارة، يُحدد فريق النينجا العلمي موقع القاعدة ويقتحمها، مُنقذًا جينبي.

بعد أن أدرك جالاكتور أن الحقيبة فارغة، ضغط على الزر لتفجير مباني منظمة ISO، ولكن من خلال خدعة من جينبي، انفجرت قاعدة جالاكتور.

يتظاهر جينبي بأنه لا يعرف شيئاً على الإطلاق بينما يندهش أعضاء الفريق الأربعة الآخرون بشدة من انفجار القاعدة.

في دولة إنديريا، تتكرر حالات الجفاف والأمطار الغزيرة سنويًا. وبالتعاون مع منظمة ISO، يجري العمل على خطة لبناء سد في المناطق الداخلية لتوفير مساحات شاسعة من الأراضي الصالحة للزراعة. ولكن بسبب أحداث غامضة تتكرر باستمرار حول ضريح سيغمره السد، فإن الخطة لا تتقدم إلا ببطء شديد. وأخيرًا، يظهر هيكل عظمي لتوراكودون.

يتلقى فريق النينجا العلمي أمرًا بالتحقيق ويتسلل إلى البلاد. تكشف أحداثٌ مثل انفجار طائرة نقل تهبط على المدرج الذي كان من المفترض أن يستخدمه إله العنقاء، عن بصمات جالاكتور. يتورط جينبي وريو، المقيمان في فندق رخيص، في قضية قتل.

يسمع كين أن جريمة القتل قد تكون مرتبطة بالعثور على عملة ذهبية في موقع البناء. يعتقد أن الصورة المنقوشة على العملة تُظهر ممرًا سريًا تحت الأرض يؤدي إلى الضريح، فيبدأ بالتحقيق في أمره.

أثناء هروبهما، تسلل ريو وجينبي إلى قاعدة جالاكتور المبنية في قبو المعبد، واكتشفا أن هدف توراكودون هو إبعاد الناس عن مخططات بناء الصواريخ في تلك القاعدة. تسلل كين والآخرون من الشارع، وتمكنوا معًا من تدمير الصواريخ. فجروا آلية التحكم في توراكودون، وهزموا أعضاء جالاكتور. بعد ذلك، تركوا الباقي للشرطة المحلية، وغادروا البلاد.

ثم، بمجرد وصول كاتسي إلى إنديريا، تنفجر القاعدة أمام عينيه.

ينفذ فريق النينجا العلمي أوامر نامبو بالقدوم إلى هانتوال لقضاء وقت فراغهم هناك. لكن كين وحده لا يثق بتلك التعليمات. في تلك اللحظة، يظهر رجل يرتدي بدلة بيضاء، تطارده الشرطة، فيساعده كين. ولكن عندما يسمعون من قائد الشرطة أن ذلك الرجل هو جالاكتور، يصبح فريق النينجا العلمي في حالة تأهب.

أثناء تحليقه بطائرته من طراز سيسنا، تعرض كين لهجوم، لكن قائد ريد إمبلس أنقذه. الرجل الذي يرتدي البدلة البيضاء هو قائد ريد إمبلس. طلب ​​من كين مساعدته في الحصول على الدليل القانوني الذي يثبت أن وزير دفاع تلك الدولة قد أبرم اتفاقًا مع جالاكتور. ثم أخبر كين أنه أمضى عشر سنوات في محاولة إحباط خطة جالاكتور، متخليًا عن عائلته.

يتسلل الاثنان إلى قصر وزير الدفاع ويستوليان على الفيلم الذي يثبت الاتفاق. لكن يتم اكتشاف أمرهما. يطلب قائد "الاندفاع الأحمر" من كين تسليم الفيلم إلى الرئيس، ثم ينفصلان.

في اليوم التالي، عندما وصلوا إلى القصر الرئاسي لتسليم الفيلم، ظهرت آلة غالاكتور العملاقة "كاتارولر" فجأةً وسط حفل عيد ميلاد الرئيس. رفعت الآلة القصر في الهواء، لكن بفضل فريق النينجا العلمي، تمكن الناس من الفرار، وبعد فشل الآلة في اغتيال الرئيس، انصرفت.

يسمع كين من نامبو أنه يستطيع مقابلة والده بمجرد الانتهاء من هذه المهمة، فينطلق وقلبه مليء بأفكار الشوق.

أن يرى والده! يحمل كين هذه الأمنية في قلبه، فيتبع أثر الآلة. أمامه، يُصاب أحدهم بطلق ناري. إنه سابو، صديق كين منذ الطفولة. عندما يقول سابو إنه رأى والد كين في هانتوال، يذهبان معًا إلى هناك.

في مكتب نامبو، يظهر كاتسي متنكرًا بجرأة. يغادر قائلًا إنه إذا لم يستسلم العالم لجالاكتور في هانتوال، فسيتم تنفيذ خطة V2. خطة V2 هي مؤامرة رهيبة لإنزال حزام فان ألين بصاروخ خاص، وبالتالي إفناء البشرية بنيران مشعة...

يأمر نامبو أعضاء الفريق الأربعة المتبقين بإيقاف الصاروخ دون كين. لكن العمل الجماعي ينهار، ولا يستطيعون استخدام صواريخهم. يُفاجأ غود فينيكس بالآلية، وبمهارةٍ يتمكنون من هزيمتها، لكنهم كانوا في وضعٍ غير مواتٍ.

في هذه الأثناء، التقى كين بخائن سابو، ويحتجزه وزير الدفاع معزولاً لاستدراج الجاسوس كينتارو واشيو إلى فخ. لكن ريد إمبلس يتدخل لإنقاذه، فيوبخ كين قائلاً إن الوقت غير مناسب لسؤاله عن حال والده، ثم يشرح له حقيقة الوضع.

وصل جو والآخرون إلى هونتوال، وانطلق الصاروخ أمام أعينهم في السماء. وبسبب غياب كين، أخبرهم نامبو أن ريد إمبلس نفسه هو والد كين.

ينفجر صاروخ جالاكتور في حزام فان ألين وتدخل البشرية في أسوأ أزمة على الإطلاق.

بعد تلقي رسالة من جالاكتور تُفيد بإطلاق صاروخ لإعادة بناء الحزام إذا استسلم العالم خلال 24 ساعة، اجتمع ممثلو جميع الدول. شعروا بضيق الوقت ورغبوا في التوصل إلى قرار. نصحهم نامبو بالوثوق بفريق النينجا العلمي، ووضع قفلًا آليًا على الأبواب بحيث لا تُفتح حتى صباح اليوم التالي.

تم حشد فريق النينجا العلمي لاستعادة صاروخ جالاكتور واستعادة حزام فان ألين. في ذلك الوقت تقريبًا، تسلل كين بمفرده إلى منشأة بناء الصاروخ. ولإتمام الصاروخ في الوقت المحدد، تم تحويله من التحكم الآلي إلى التحكم اليدوي. وبينما كان كين وسط أعضاء جالاكتور النائمين، منهكين من العمل المتواصل الذي انتهى، أطلق إشارة طائر. لكن فجأة وُجّه مسدس كاتسي نحوه. تحوّل كين إلى هيئة طائر. ثم وُجّه مسدس قائد ريد إمبلس، الذي تسلل هو الآخر، نحو كاتسي. اقتحم غود فينيكس المكان، وهرب كاتسي، وسقط وزير الدفاع ميتًا.

يتحمل كين المسؤولية ويقول إنه سيصعد إلى الصاروخ بنفسه. ثم يخبره جون أن ريد إمبلس هو والد كين.

يتحول حلم كين بلقاء والده إلى فراق أبدي في الوقت نفسه. يرمي قائد ريد إمبلس كين بعيدًا ويصعد إلى الصاروخ. يركض كين خلفه مناديًا والده. في ذهن ريد إمبلس، تظهر صورة كين في شبابه وهو يستدير. يتشتت الصاروخ في السماء، وتنجو الأرض.

كاتسي، الذي استعاد قوته بعد جنازة ريد إمبلس، يخطط لتدمير المؤسسات المتعلقة باليورانيوم في جميع أنحاء العالم.

يجتمع ممثلو جميع الدول في منظمة الأمن الدولي، ويُفتتح مؤتمر لمناقشة التدابير المضادة. يتولى فريق النينجا العلمي مهمة الحراسة. ينعزل كين عن أصدقائه، غارقًا في حزنه على وفاة والده. في تلك اللحظة، يكتشف جثة هامدة في وسط نافورة. ولأن علم دولة أتاري كان معلقًا بالجثة، يتسلل كين إلى قاعة المؤتمرات ويقبض على الجالاكتور الذي ينتحل صفة ممثل دولة أتاري. بعد عودتهم إلى كريسنت كورال، يُجبر كين الرجل على البوح بموقع المقر الرئيسي بتعذيبه المستمر. يصفع نامبو كين، قائلًا إن سلوكه لا يُبرر بكون الرجل جالاكتور. يدير كين ظهره لنامبو ويجبر باقي أعضاء فريق النينجا العلمي على مرافقته. وبإرشاد الرجل، يتوجهون إلى الموقع.

لكن عند القاعدة، وهي قاعدة عادية، يقعون في كمين نصبه كاتسي. وينتهي بهم الأمر محاصرين في غرفة جدرانها مصنوعة من جليد القطب الشمالي. يرفع كاتسي درجة حرارة الغرفة، مما يتسبب في ذوبان الجليد ببطء. ثم يغادر لمهاجمة منشآت اليورانيوم.

يلوم جو والآخرون كين، معتبرين أن سلوكه، الذي لا يهدف إلا للانتقام، هو سبب كل هذا. يتساءل كين بحزن عما إذا كانوا يعرفون شعور فقدان الأب. يوبخه جون قائلاً إنه ليس الوحيد الذي فقد والديه. هذه الكلمات تُعيد لكين هدوءه.

تمكن فريق النينجا العلمي من الفرار من الحجرة الجليدية وتفجير القاعدة. ثم لاحقوا الآلة العملاقة في طائر الفينيق الإلهي ودمرواها بصواريخهم.

يُغطي البحر 70% من سطح الأرض. يُجبر غالاكتور نامبو وفريق النينجا العلمي على الاختيار بين حياتهم وتلوث البحار بمادة ثنائي الفينيل متعدد الكلور (PCB).

يتظاهر غود فينيكس بالموافقة، ويتجه إلى المنطقة المحددة مسبقًا في البحر، ولكن عندما يفجرون الغواصات الصغيرة المقتربة، تتدفق المواد الملوثة وتلوث بحر تاروشيا. يكتشف كين ثلاث ناقلات يبدو أنها تتحكم في الغواصات الصغيرة، ويستخدم الغواصة الصغيرة المحملة في غود فينيكس للتسلل إلى هناك. هناك، تُجرى أعمال التنظيف للغواصات الصغيرة العائدة. يكتشف غالاكتور أمر كين، فيهزمهم ويتجه نحو مكان كاتسي، ولكن في هذه الأثناء، تتحول الناقلات إلى ناقلة ضخمة واحدة تُصدر قوة مغناطيسية تجذب غود فينيكس الذي يبدأ هيكله بالتصدع.

يسحب كين ذراع التحكم. يقوم كاتسي بتفعيل آلية التدمير الذاتي للناقلة، ويهرب إلى ممر أسفل الأرضية. يطارده كين، لكن كاتسي يهرب في صاروخ. يخرج كين وأعضاء جالاكتور إلى البحر، لكن المواد الملوثة المتدفقة من الناقلات تقترب منهم. يموت كل عضو من أعضاء جالاكتور بمجرد لمسه للمواد الملوثة. في لحظة حرجة، يلتقط ذراع ميكانيكي ممتد من طائر الفينيق الإلهي كين، فينجو بذلك من الخطر.

سرعان ما يتم إطلاق كبسولات التنظيف الخاصة بـ "جالاكتور" في البحر، ويستعيد جماله السابق.

تتعرض جون لهجوم من قبل مجموعة من راكبي الدراجات النارية. ينقذها كوجي، وهو بطل سباقات سابق وصديق جون منذ الطفولة.

أصبح الآن قائدًا لفرقة "الطيور السوداء" وهو في طريقه لتفجير قاعدة صواريخ تابعة لدولة ما. وبينما كان يهمّ بزرع القنبلة الموقوتة، خطرت بباله صورة جون، وكيف التقى بها. فهرب من القاعدة دون زرع القنبلة. رأت جون هيئته وأبلغت نامبو. لكنها عارضت بشدة رأي رفاقها الذين زعموا أن كوجي من "غالاكتور".

أُمر كوجي، الذي لم ينجز مهمته، من قبل كاتسي باغتيال الرئيس أثناء سباق الدراجات الذي سيشاهده الرئيس.

تذهب جون إلى ذلك السباق، الذي يشارك فيه كوجي، على مضض شديد. لكنها توافق عندما يقول كين إنهم سيحاولون إنقاذه إن أمكن. وتُحبط محاولة كوجي لاغتيال الرئيس بفضل مهارة جو في الرماية، وتنتهي بالفشل.

يلجأ كوجي إلى قصر الضباط. يتبعه جون ويرى كيف يتلقى كوجي الأوامر من كاتسي. يلاحظ كوجي جون أيضاً.

تتحول دراجات فرقة الطائر الأسود وتتحد لتشكل آلية عملاقة على شكل ثعبان، تبدأ بمهاجمة إله العنقاء. ولإلحاق الهزيمة بهذه الآلية، يضغط جون زر إطلاق الصواريخ. وعندما يهزم فريق النينجا العلمي كوجي، يقرر أن هذا عقابٌ على جرائمه.

أُطلق سراح مايك ميلر، وهو قناص، من السجن بعد 35 عامًا. أعطاه جالاكتور دبابة صغيرة مزودة بمسدس تجميد وأمره بالقضاء على فريق النينجا العلمي.

أُسقطت ثلاثة أقمار صناعية للمراقبة فوق القطب الجنوبي. ظنّ فريق النينجا العلمي أن غالاكتور هو السبب، فتوجهوا نحو المنطقة. كان كاتسي ينتظرهم برفقة دبابة صغيرة. طلب ​​جو من كين مطاردة كاتسي، وانطلق هو الآخر خلف الدبابة، لكن مسدس التجميد جمّده مع سيارة G2.

ينطلق باقي الفريق للقتال في آلاتهم الفردية، ولكن عندما يرى ريو كيف انتهى أمر جينبي، يتجه نحو الدبابة دون تفكير، وتتجمد مركبة G-5 أيضًا.

لكن عندما صوب مايك نحو جون، تردد للحظة فأخطأت الرصاصة هدفها. إضافة إلى ذلك، بدأ السلاح يحترق من كثرة الاستخدام. زاد جهاز G1 من حدة النيران، فاشتعلت الدبابة المقلوبة. اقترب كين وجون من مايك، فسألهما عن سبب عدم استخدامهما للأسلحة. أجاب كين بأن آلاتهما غير مجهزة بأسلحة. أراه مايك مخلفات الرصاص التي أخذها سرًا، وأخبره أن رفاقه ما زالوا على قيد الحياة. قال أيضًا إنه أخطأ جون لأنه رأى فيها ابنته التي انفصل عنها قبل 35 عامًا. ثم فارق الحياة.

داخل مركبة "غود فينيكس"، التي كانت في طريقها إلى الوطن، يقول كين إنه إذا تمنوا الحصول على أسلحة، فلن يكونوا هم من يحاولون التفوق على جالاكتور.

سُرقت مركبة "جيت كتر"، التي طورتها منظمة ISO لتوليد الطاقة دون التسبب في التلوث. أصدر نامبو الأمر باستعادتها. اعترض كين، متسائلاً عما إذا كان عليهم دفع ثمن أخطاء ISO. كان ذلك بسبب غياب المنطق، مما جعله يعتقد أن نامبو يريد مهاجمة أعداء والده. بدأ جينبي بالبكاء أثناء الجدال بين الرجلين. عندما رأى كين ذلك، وافق على مضض على الانضمام إلى القوات.

يدخل كين وجو الكهف الذي اختفى فيه ميكابوتا، فيتعرضان لهجوم من تماثيل بوذا التي تعمل كأجهزة مراقبة. يتجاهل كين اقتراح جو بالعودة إلى غود فينيكس مؤقتًا، ويركض نحو الداخل. يتبعه جو، لكن النيران المتصاعدة من تماثيل بوذا تعيقه. يكتشف كين قاعدة جالاكتور وميكابوتا داخل الكهف، لكنه يفقد وعيه عندما يلمس شبكة حديدية ذات جهد كهربائي عالٍ فتسقط. عندما يستيقظ كين في غود فينيكس، يكون ميكابوتا قد غادر القاعدة بالفعل ويتجه نحو مصنع لتعدين اليورانيوم.

يلاحق غود فينيكس ميكابوتا، لكنّ جيت كتر مُحمّل على متن الآلة ويُطلق حرارةً مستمرةً تبلغ 40,000 درجة مئوية من جوانبه الأربعة. يضطر غود فينيكس إلى خوض معركةٍ شرسةٍ ضدّه.

لكن كين، باستخدام شكل طائر النار المتعدد، سمح لقاطع النفاثات بإطلاق النار دون توقف، مما تسبب في تدمير ميكابوتا ذاتيًا بسبب ارتفاع درجة الحرارة.

في سفينة "غود فينيكس"، وفي طريق عودتهم إلى المنزل، يعتذر كين عن تهوّره بسبب رغبته في قتال أعداء والده. ويخبره جو أنه إذا هزموا غالاكتور واحدًا تلو الآخر، فستُحاصر كاتسي.

كان قارب صيد بالقرب من جزيرة الأشباح، وشهد بأم عينه سمكة راي ضخمة وحبارًا. بعد ذلك، ابتلعه إعصار مائي هائل وتحطم.

بأوامر من نامبو، هبط كين وجون على الجزيرة وبدآ التحقيق. مع حلول الليل، شاهدا كيف انفجرت آليات جالاكتور التي هُزمت سابقًا وهي تُبتلعها دوامة مائية. اقتنعا بوجود مصنع للآليات. هزما أعضاء جالاكتور الذين جاؤوا يبحثون عن المتسللين، واستوليا على مكانهم، ثم تسللا إلى القاعدة.

في القاعدة، كان الدكتور أوغاوارا ومساعده ناكامورا على وشك شرح آلية كوماكينغ الجديدة لكاتسي. طلب ​​كين من جون الاتصال بإله العنقاء، ثم صعد إلى الآلية. لكن جون تبعه وتسلل إلى الداخل أيضًا.

يخوض غود فينيكس معركةً شرسةً ضدّ دوامة الماء التي أحدثها كوماكينغ. لكن كين وجون يُدمّران مولد الطاقة الخاص بالآلة، فتبدأ بالسقوط. يمسك كين كاتسي في غرفة القيادة ويعيده إلى غود فينيكس. مُحققًا أمنيةً راودته طويلًا، ينزع كين قناع كاتسي. لكن الوجه الذي يظهر تحته هو وجه ناكامورا.

لقد هربت كاتسي بالفعل.

عندما يذرف كين دموع الغضب، يبدو أن كلمات والده تتردد في أذنه، تشجعه.

أثناء تجربة أجريت على الآلة الميكانيكية الجديدة كلياً التابعة لجالاكتور، تعطلت آلة البحث. أصدر كاتسي أمراً بتصفية الناجين.

وصل فريق النينجا العلمي إلى موقع تحطم الآلة. لم يتضح الغرض منها. عثروا على شاب وأعادوه إلى الحياة. كان الشاب فاقدًا للذاكرة. أصبح هو وجينبي صديقين حميمين. عندما ذُكر اسم جالاكتور، بدا على الشاب توتر شديد. خرج على دراجة نارية مع كين. هاجمهما جالاكتور، ومن شدة الصدمة، تذكر الشاب موقع القاعدة، ونقاط ضعف الآلة، وأنه هو نفسه جالاكتور.

يرغب كين في مواجهة الآلة العملاقة واصطحاب الشاب معهم. يرفض الشاب، متألمًا لكونه من سكان جالاكتور. مع ذلك، يقنعه كين بالذهاب معهم. ثم يناديه جينبي بـ"فريق النينجا العلمي جي-6".

يتسلل كين والشاب إلى داخل الآلة. بينما يجذب كين العدو، يبحث الشاب عن الجهاز الذي يعكس اللهب ومسدس الليزر، نقطة ضعف الآلة. لكن القائد يقبض عليه ويأمره بإطلاق النار على كين بالمسدس الذي أعطاه له. يطلب منه كين التفكير مليًا. يوجه الشاب المسدس نحوه، قائلاً إن هذا قدره. تنطلق الرصاصة وبوميرانغ كين في آن واحد. تخترق الرصاصة القائد، ويصيب البوميرانغ الشاب. يخبر الشاب كين بمكان آلية العكس، ثم يلفظ أنفاسه الأخيرة.

في تقريره إلى نامبو، يقول كين ما يلي: من خلال عمل جي-6 الذي تحدى الموت، يمكن تفجير الآلة.

كان كين يحلق فوق مدينة هونتوال بطائرته من طراز G1. انتابته الصدمة عندما رأى طائرات ريد إمبلس الثلاث. كان الشخص الموجود في إحدى الطائرات بلا شك والده. عندما سأله قائد ريد إمبلس عما إذا كان عليه أن يصطحب كين إلى القاعدة الجديدة، تواصل كين مع نامبو. لكن، متجاهلاً محاولات نامبو لمنعه، توجه كين نحو القاعدة. أمر نامبو غود فينكس بالتحقيق في الأمر. لكن غود فينكس صادفت روبوتًا عملاقًا بدون طائرة G1 على متنه، فتم القبض عليه وإحضاره إلى القاعدة.

يسأل كين ريد إمبلس عن سبب عدم إخباره بأنه ما زال على قيد الحياة. يجيب ريد إمبلس بأنه كان يبحث عن مقر جالاكتور. ويطلب من كين تسليم حقيبة إلى نامبو تحتوي على معلومات حول مواقع بعض القواعد.

عندما أحضر كين الحقيبة إلى نامبو، علم أنهم لم يتلقوا أي تقرير من الإله فينيكس. وللتأكد من نوايا ريد إمبلس الحقيقية، عاد كين إلى القاعدة. ولأن ريد إمبلس استخدم كلمات ملتوية، أدرك كين أنه دجال. كان القائد هو كاتسي متنكرًا، وكان هناك جهاز إرسال مزروع في الحقيبة. غضب كين وأمسك كاتسي من ياقته. لكن كاتسي استغل ثغرة وهرب. أُلقي كين في سجن تحت الأرض، حيث كان زملاؤه المختطفون.

يهرب كين من السجن تحت الأرض ويتصل بنامبو، ويطلب منه التخلص من الحقيبة. ينقطع بث جهاز الإرسال، ويتبع الروبوت جهاز الإرسال الصغير الذي ثبته كين على كاتسي. ينتهي الأمر بقاعدة جالاكتور والروبوت بمهاجمة بعضهما البعض، فيُدمران.

أُقيم احتفالٌ لتكريم إنجازات فريق النينجا العلمي. لكنّ المشاركين كانوا روبوتاتٍ خارقة، اخترعها نامبو لغرضٍ مُحدد. خطته هي أن يُوقعهم جالاكتور في الأسر عمدًا، ثمّ بناءً على رسالتهم، معرفة موقع قاعدة العدو، وزرع فريق النينجا العلمي الحقيقي للتسلل إليها. لكنّ كين يعتقد أنّ العدو لن ينخدع بهم، لذا حلّ محلّ روبوته.

كما خطط نامبو، ظهر ميكا جالاكتور، وجمد الروبوتات وكين بشعاع تجميد، ونقلهم إلى القاعدة. بعد ذوبان الجليد، اندمج كين مع الروبوتات وأطلق إشارة استغاثة. استقبلت طائر الفينيق الإلهي الإشارة وانطلقت مسرعة نحو القاعدة. لكن الروبوتات انفجرت عند ملامستها تيارًا كهربائيًا عالي الجهد. اتضح أنها مزيفة. تم نشر الميكا. تسلل كين إلى داخل الميكا وألقى حطام الروبوتات في نظام الدفع. تحطم الميكا واشتعلت فيه النيران.

مات كين. حبس رفاقه أنفاسهم، ونظروا مطولاً إلى الشاشة في مركبة غود فينيكس. ظهر أمامهم شبح كين وهو يسقط ببطء، بعد أن نجا مستخدماً عباءات الروبوت كمظلة.

يختفي لاعبو البيسبول المحترفون أمام أنظار المتفرجين خلال انقطاع قصير للتيار الكهربائي في منتصف المباراة.

يعتقد نامبو أن غالاكتور هو السبب، وبناءً على تعليماته، يقوم فريق النينجا العلمي بحراسة الملعب بأكمله. خلال مباراة أخرى، يحدث انقطاع مماثل للتيار الكهربائي، ويختفي اللاعبون أمام أعينهم مرة أخرى. لكن هذه المرة، يختفي جينبي، الذي كان يعمل جامعًا للكرات في الملعب، أيضًا.

يتوجه أعضاء الفريق الأربعة المتبقون لاستكشاف الأرض بدقة في منتصف الليل. لكن فجأةً، ينشق سطح الأرض ويسقط كين وجون في قاعدة سرية تحت الأرض. يُجبران على استنشاق غاز معين ويُقتادان إلى زنزانة. جينبي موجود بالفعل في الزنزانة. يقول إن اللاعبين خضعوا لغسيل دماغ بنوع من المخدرات، وسيخضعون لتدريب خاص لتحويلهم إلى أعضاء في جالاكتور. يهرب الثلاثة من الزنزانة. يخبرهم كاتسي أنه خلال مباراة هذا المساء تحت الأضواء الكاشفة، قد تنفجر قنبلة هيدروجينية قادرة على تدمير البلاد بأكملها. ثم يهرب. يتصل كين بنامبو. يبدأ جو وريو البحث فورًا عن القنبلة على السطح، لكن المباراة قد بدأت بالفعل.

يتلقى كين معلومات من القائد تفيد بأنه في حال اصطدام كرة الهوم رن بالشاشة الخلفية، سيتم تفعيل الصمام. تُضرب كرة الهوم رن. يصوّب جو والآخرون نحو الكرة المتجهة نحو الشاشة الخلفية. تخطئ الأسلحة الأربعة جميعها الهدف. مع ذلك، تُدفع الكرة بعيدًا قبل اصطدامها بالشاشة الخلفية مباشرةً. تسقط الكرة على الأرض ويخترقها بوميرانغ كين.

قبل عام، هربت دولة فلانبل الشمالية من حكم الديكتاتور العام سومور. لكن غالاكتور، الذي يُملي الأوامر على سومور، يظهر في قصر رئيس الوزراء ويُخيّره بين الطاعة أو الموت. وبناءً على طلب الحاكم، يتسلل فريق النينجا العلمي عبر الباب الخلفي السري.

في يوم ذكرى السلام، يوزع الحاكم الهدايا على الأطفال. لكن مجموعة سويموسا، التي التقى بها جينبي، سُرقت هداياها من قبل أطفال من الحي العلوي للمدينة.

في تلك الليلة، وخلال دورية، اكتشف فريق النينجا العلمي أن جميع العائلات التي فتحت الهدايا قد ماتت. وعلموا أن الحاكم تابع لسوموري، وأنه وضع غازًا سامًا في الهدايا.

في هذه الأثناء، توجهت مجموعة سويموسا إلى موقع الاحتفال لهدم رجل الثلج انتقامًا لغضبهم. لكن رجل الثلج كان مجرد تمويه لآلية جالاكتور. ظن جالاكتور أن مجموعة سويموسا هي فريق النينجا العلمي، فقبض عليهم. لكن فريق النينجا العلمي أنقذهم، فتبعوهم وأخذوهم على متن غود فينيكس وهربوا. طاردتهم الآلية. كان الحاكم وسوموري في الداخل. دفنت غود فينيكس الآلية مع سوموري والحاكم، ثم غادرت. في الداخل، قال فريق النينجا العلمي إنهم يريدون تقديم هدية بديلة عن الهدايا التي فاتت مجموعة سويموسا. ردت مجموعة سويموسا بأن أفضل هدية كانت القتال جنبًا إلى جنب مع جاتشامان.

ترددت أصوات الأطفال قائلة: "العدالة ستنتصر بالتأكيد!"

تستمر سرقة أدمغة الأطباء المشهورين المحفوظة. حتى أن وحشًا يسرق دماغ الدكتور ياماشينا، الخبير في هندسة الروبوتات. يلاحقه فريق النينجا العلمي، لكنه يتركه يهرب.

لكن نامبو يتمكن من انتزاع أحد مخالب الوحش. ويُظهر التحليل أن الوحش هو كائن فضائي من فصيلة بيم، وهي كائن حيّ متدنٍّ. يخشى نامبو أنه إذا استطاعت قوى جالاكتور العلمية السيطرة على الكائنات الفضائية، فقد يتمكنون من إحياء تلك الأدمغة الميتة.

في معرض علمي، من المقرر الكشف عن ابتكار الدكتور ياماشينا، الروبوت X1. ولتحقيق ذلك، يطلب المدير أندرسون حمايته. في المعرض، يظهر بيم، ويتحد مع X1، ثم يهرب. يطارده إله العنقاء، ويعثر على بيم مجددًا في المكان الذي فقده فيه سابقًا.

يجمع غالاكتور بين بيم والروبوت. وبفضل طاقة أدمغة الأطباء، يكتمل سوبربيم. يتبعه كين، ثم يتسلل إلى القاعدة بنفسه برفقة غود فينيكس.

في القاعدة، لاحظ القائد المسؤول عن بيم أن دماغه لا يُنتج طاقة كافية. في الواقع، كان دماغ الدكتورة ياماسينا المسروق مجرد نسخة مقلدة زرعها نامبو عمدًا. تسلل كين إلى هناك ودمر مصدر طاقة بيم. بعد فشل خطته، أمر كاتسي بتدمير بيم ذاتيًا. انفجر بيم والقاعدة معًا، وهرب غود فينيكس، متحدًا مع جي 1، من الانفجار مستخدمًا فايربيرد.

ملكة البلاد، مونارينس، من أشد المعجبين بفريق النينجا العلمي. تتبرع سنويًا بمبالغ طائلة لمنظمة الأمن الدولي. يأتي كاتسي إلى البلاد بنفسه، عازمًا على إضعاف أنشطة فريق النينجا العلمي بقتل تلك المرأة.

في مكان آخر، يُتوقع وقوع هجوم من جالاكتور خلال عرض الأزياء، ويتم تكليف فريق النينجا العلمي بحراسة المكان. يتسلل كين والآخرون إلى البلاد كسياح عاديين.

في منتصف الليل، بينما كان كين وجو يتفقدان محيط القصر، غمرتهما النيران جراء قنابل خواتم الأصابع التي أطلقها بعض الأشخاص المشؤومين. أدرك كين صعوبة النجاة من هذا الهجوم، فقرر استخدام أسلوب لعبة الرول، وهي لعبة مميزة لبلاد المونارين.

كما يتم توظيف جون كعارض أزياء من قبل المصمم المسؤول عن عرض الأزياء. ومع ذلك، بعد فترة وجيزة، يحل كاتسي ونجوم الشيطان محل جميع المشاركين باستثناء جون، الذي يدخل القصر ويخبر الملكة أن فريق نينجا العلوم سيكون دائمًا إلى جانبها.

في المراحل الأخيرة من العرض، يُعلن المصمم عن تصميم أصلي يتضح أنه "نجوم الشيطان". الملكة، المحاصرة من قِبل "نجوم الشيطان"، تستدعي فريق "نينجا العلوم" كرمز للعدالة. نتيجةً للتدريب الخاص، يتفادى فريق "نينجا العلوم" قنابل "نجوم الشيطان" المزروعة في الخواتم. يدرك كاتسي أنه في موقف لا يُحسد عليه، فيستدعي دبابة حفرية للهروب بمفرده.

يعارض كاتسي أوامر سوساي إكس بتدمير خطة مانتل، ويتساءل عما إذا كان من الأفضل غزو الأرض بعد إتمام الخطة. يعد إكس كاتسي برتبة الرئيس زد، ويسمح له ببدء العملية. لكنه يضحك في الخفاء ويقول إن زد رمز للقتل.

تتعرض مؤسسات خطة مانتل لهجوم متواصل من قبل آلية على شكل قنديل بحر. يواجهها غود فينيكس، لكن صواريخه لا تُحدث أي تأثير. بل على العكس، تُصاب منصة الإطلاق. يحاول غود فينيكس الفرار حاملاً معه عدة طيور نارية. لكن تُزرع ألغام عليه، فيلتهمه اللهب في لحظات. يهبط غود فينيكس اضطرارياً في الصحراء وينفجر في النهاية.

بينما تُجري منظمة ISO عملية إعادة إحياء طائر الفينيق الإلهي، لا يملك فريق النينجا العلمي أي وسيلة للتدخل، ولا يسعهم سوى مشاهدة هجمات جالاكتور. وقد استشاطوا غضبًا عندما تلقوا رسالة تفيد بنهاية إحياء طائر الفينيق الإلهي. تم تجهيز كل آلية من آلياتهم بسلاح. لكن نامبو أخبر أعضاء الفريق الخمسة أن الغرض من هذه الأسلحة ليس القتل، بل الدفاع عن أنفسهم.

عندما تصل الرسالة التي تفيد بأن الروبوت العملاق على شكل قنديل البحر يهاجم مقر منظمة ISO، يتم نشر طائر الفينيق الإلهي على الفور. يقود الروبوت إلى منطقة جبلية، ويهزمه باستخدام أسلحة روبوتاتهم الفردية وصواريخ سوبر بيرد.

لكن في قلب كين، يساوره الشك بأنه إذا استمر تطوير الأسلحة الجديدة، فقد يظل السلام بعيد المنال.

في أحد الأيام، وقع انفجار نووي على جزيرة صغيرة في البحر الجنوبي.

تحطمت طائرات الأبحاث التابعة لمنظمة ISO واشتعلت فيها النيران في منطقة ذات نشاط إشعاعي عالٍ. ومن السجلات المتبقية، علموا بوجود نشاط إشعاعي في محيط الجزيرة، وليس في مركزها. كان من المفترض أن تذهب سفينة God Phoenix للتحقيق، ولكن لتجاوز حزام الإشعاع، كان عليهم استخدام سفينة Firebird في الذهاب والعودة. ولهذا السبب، طلبوا سفينة أبحاث لتزويدهم بالوقود.

عند دخولهم الجزيرة، لم يجدوا أي إشعاع، وكانت المباني سليمة. لكن لم يكن هناك أحد. رأى جو أشكالًا بشرية في عربة ترام تعرضت لحرارة شديدة وانصهرت على الفور. اقتنع جو بأن تجربة نووية قد جرت. في تلك اللحظة، بدأت جدران المباني فجأة بالتفكك واشتدّ الإشعاع بشكل كبير.

يستقلون مركبة "غود فينيكس" ويهربون من الجزيرة، لكن بسبب الصدمة الناجمة عن اختفاء حزام الإشعاع، يفقدون جميعًا وعيهم. وعندما يستيقظون، يجدون أنفسهم على متن سفينة الأبحاث.

هناك، ينتظر نامبو ويقول إنه بسبب تغيير في الخطط، سيعودون إلى القاعدة في مركبة غود فينيكس. كان كين على وشك الامتثال، لكن عندما قال ريو إنهم لم يستخدموا أي وقود لعبور حزام الإشعاع، استدار نحو نامبو وألقى ببوميرانغه. كان نامبو هو كاتسي متنكرًا.

فشلت استراتيجية جالاكتور، والمتمثلة في التظاهر بأنه نامبو والذهاب إلى القاعدة في مركبة غود فينيكس. هربت كاتسي في طائرة على شكل قرص.

يتسلل جالاكتور إلى دولة شوسكين، التي تغطي صحراء أوهارا والمناطق الجبلية 80% من مساحتها. تنقطع الاتصالات مع فرقة خاصة كانت قد ذهبت إلى هناك للتحقيق في المقابر القديمة. وللبحث عنهم، ينقسم فريق النينجا العلمي ويختلط بالسكان. تظن امرأة أن جينبي هو ابنها المتوفى، لكنه يرى فيها ملامح والدته أيضًا، فيذهب إلى منزلها. هناك يسمع قصة اختفاء القوافل وسكان القرية في المقابر القديمة، التي تُعرف باسم مقبرة الشيطان.

يشك جينبي في تلك المقابر، فيتسلل إليها بمفرده. يعثر على قاعدة تابعة لغالاكتور حيث يحاولون استخراج اليورانيوم من الرمال المتحركة تحت الأرض. يُجبر الأشخاص الذين اختفوا على العمل هناك.

يستدعي جينبي كين والآخرين، فينضمون إليه. ويحاصرون كاتسي معًا. لكن جالاكتور يحتجز أهل القرية كرهائن، فيُجبرون على إطلاق سراح كاتسي. ومع ذلك، يُريد جالاكتور إلقاء الرهائن في الرمال المتحركة. لكن بوميرانغ كين يطير نحوهم. ويكاد أعضاء جالاكتور يسقطون في آلية التدمير الذاتي للقاعدة. فتُفعّل آلية التدمير الذاتي.

يهرب كاتسي وأعضاء جالاكتور. يقود كين والآخرون سكان القرية المحتجزين كرهائن خارج القاعدة. تشعر المرأة بالقلق على جينبي وتريد العودة إلى المقبرة، لكن يتم منعها فتنهار باكية.

يظهر جينبي كعضو في فريق النينجا العلمي، ولا يستطيع أن يكشف عن وجهه للمرأة. بعد عودته إلى طائر الفينيق الإلهي، ينفجر في بكاءٍ حار وهو متشبث بصدر جون.

يستمر العثور على جثث محنطة. ونظرًا لاستمرار الأضرار، يأمر نامبو فريق النينجا العلمي باكتشاف سبب كل هذا.

أثناء قيامه بدورية، أنقذ جو فتاة من سيارة أجرة تعرضت لهجوم من قبل روبوتات على شكل دمى. نقلها إلى المستشفى، لكن كين لامه لعدم اتصاله به من هناك، ولم يثق بالفتاة.

يعود جو إلى المستشفى ويرى الفتاة تهرب من غرفتها. يرى أيضاً الممرضة التي تعرضت للاعتداء. يتبع جو الفتاة، فتلاحظه الفتاة، وتظهر على وجهها ابتسامة خفيفة.

كين، الذي تلقى رسالةً وجاء إلى المستشفى، أحضر قطعةً بلاستيكيةً من سرير الفتاة. هناك، تلقى رسالةً من جو يقول فيها "مقبرة الدمى" ثم انقطعت. ربط فريق النينجا العلمي القطعة البلاستيكية برسالة جو، وبدأوا البحث عن مكان التخلص من الدمى. لكن جون وريو وقعا في قبضة مايا، الفتاة التي تتحكم بالدمى.

بفضل مهارة "التدافع بين الطيور" الخاصة بريو، يتسلل كين وجينبي إلى القاعدة وينقذان الثلاثة الآخرين. ثم يهزمون التماثيل.

سُمح لمايا بمغادرة جالاكتور إذا نجحت في القضاء على فريق النينجا العلمي. لكن كاتسي أطلق النار على مايا، التي فشلت، ورحل قائلاً إنه من المستحيل مغادرة جالاكتور على قيد الحياة. سقط القناع عن وجه مايا. أخبرت فريق النينجا العلمي عن تدمير القاعدة ذاتيًا، وهمست أنها كانت ستحب العيش تحت الشمس، ثم فارقت الحياة.

تكتشف منظمة ISO مصدراً جديداً للطاقة في جبال الهيمالايا، لكن فرقة التحقيق التي أُرسلت إلى هناك تُباد على يد اليتي.

بسبب شائعات عديدة حول اليتي، يذهب جينبي إلى جبال الهيمالايا بمفرده. هناك، يتعرض لهجوم من اليتي، لكنه في الواقع روبوت عملاق من طراز جالاكتور. يتوجه فريق غود فينيكس إلى جبال الهيمالايا للبحث عن القوات المفقودة بناءً على أوامر نامبو. يتلقون رسالة من جينبي حول ظهور اليتي، ويتوجهون إلى الموقع الذي وردت منه الرسالة.

في مكان آخر، تطورت الأمور بحيث أنقذ أعضاء جالاكتور جينبي، وهو يعمل الآن خادمًا في القاعدة. أثناء عمله، يرسل سرًا إشارة تشويش الطيور. بالإضافة إلى ذلك، عندما يحضر الطعام إلى غرفة كاتسي، يسمعها تتحدث مع إكس.

يظهر طائر الفينيق الإلهي بالقرب من القاعدة، فيتجه جالاكتور نحوه ويهاجمه بالصواريخ وقاذفات اللهب. لكن بفضل تكتيك كين، يستمر طائر الفينيق الإلهي في التراجع، وبينما يتعرض لإطلاق نار متواصل، يبدأ انهيار جليدي ويتعرض لضربة قوية في القاعدة. يقتحم طائر الفينيق الإلهي القاعدة، ويحاصر كين والآخرون كاتسي مجددًا.

يمزق كين قناع كاتسي. يغطي كاتسي وجهه، ومن خلفه يظهر إكس فجأةً ويُعرّف نفسه بأنه حاكم جالاكتور. يُصاب فريق النينجا العلمي بالعمى المؤقت من الضوء ويفقدون وعيهم. عندما يستيقظون، يختفي كل من كاتسي وإكس.

ينتابهم الآن شعورٌ بالقلق بعد أن علموا بوجود "إكس". ولا تزال جبال الهيمالايا تخفي ذلك السر.

في منطقة الأمازون، لاحظ عالم الحشرات العجوز تودا، الذي يواصل أبحاثه، سلوكًا غير عادي لدى الجراد. فأبلغ جميع السلطات والجهات المعنية، لكن لم يؤخذ كلامه على محمل الجد. فعاد جينبي، الذي سمع قصته، معه إلى الأمازون.

يُعدّ ظهور الجراد غير المألوف عملاً من أعمال جالاكتور. فبواسطة إشارة لاسلكية موجهة صادرة عن آلية جراد، يتم إرسال سرب من الجراد لمهاجمة المدينة.

في كوخ الأبحاث الخاص بتودا، هاجمهم سرب من الجراد. وبينما كانوا يحمون الكوخ بمبيد حشري، تمكنوا من أسر الجراد الآلي الذي يقود السرب، واكتشف تودا تردد الإشارة اللاسلكية. لكن بسبب تداخل الإشارات اللاسلكية، لم يتمكن جينبي من الاتصال بكين والآخرين. فخطرت له فكرة، فقام برش شكل رأس طائر في مرج بالمبيد. بعد أن تلقى إله العنقاء رسالةً حول المظهر غير المألوف للجراد، وصل إلى الأمازون. اكتشفوا العلامة وانضموا إلى جينبي وتودا.

بسبب ظهور طائر الفينيق الإلهي، يُسرّع كاتسي خطته ويطلق أسراب الجراد الآلي وأسراب الجراد التابعة له، متجهة نحو عواصم العالم.

يسمع كين قصة الإشارة اللاسلكية من جينبي، فيجعل طائر الفينيق الإلهي يُصدر نفس التردد. ثم يستدرج أسراب الجراد التي انتشرت في العالم نحو البحر، ويفجرها بصاروخ.

وحدهما كين والآخر يعلمان أن الفضل الحقيقي يعود للعالم العجوز الذي جمع سنوات من البحث وتجاهله الجميع.

تمكن فريق النينجا العلمي من هزيمة آلية أخرى، مما سمح لكاتسي بالفرار مجددًا. وبفضل بث نامبو، تتبعوا مسار صاروخ كاتسي. لكن كاتسي انتقل إلى سيارة واتجه نحو غابة. انطلق فريق النينجا العلمي نحو الغابة أيضًا في مطاردته، وانقسموا إلى ثلاث مجموعات للبحث عنه.

يتلقى X إشارة استغاثة من كاتسي، وبالتزامن مع إرسال وحدة كوماندوز، يتخذ خطوات إضافية عن طريق نصب الفخاخ في الغابة.

ينتقد جو ريو لدخوله الفخ دون استعداد. لكن عندما يشك جو في غزال صغير جريح، يرد ريو قائلاً إنه لا يوجد أحد أكثر قسوة من جو.

في هذه الأثناء، يكتشف جينبي كاتسي ويحاصره، لكن وحدة الكوماندوز تقبض عليه بدورها.

أمام ماموث مغطى بالجليد، يكتشف جو وريو أن جينبي على وشك أن يُضحى به بشريًا. ينقذانه ويحاصران كاتسي، الذي تحول إلى كاهن شينتو. لكن كاتسي يلجأ إلى الماموث العملاق ويهاجم جو والآخرين. ينقذهم إله العنقاء في اللحظة الأخيرة، ويريد جو إطلاق صاروخ على العملاق. لكن عندما يرى مجموعة من الغزلان أسفله، يتردد.

بعد استدراج العملاق الآلي إلى الجبال، أطلقوا صاروخًا على الأرض أسفله، فاختفى العملاق في انهيار جليدي.

يخطئ فريق النينجا العلمي في افتراضه أن المقر الرئيسي قريب بسبب وجود الأدغال المليئة بالفخاخ. ومع ذلك، لا يزال وجوده غامضاً.

يظهر الماموث، الذي كان من المفترض أن يكون مدفونًا في نهر جليدي، في مدينة ملاهي حيث ذهب جون وجينبي. وأثناء إنقاذ الأطفال، يسقط حذاء جون ويعلق بين مخالب الآلة العملاقة.

أبلغت جون عن فقدان حذائها. فنصحها نامبو بالبحث عنه. وقال إنه بفضل القدرات العلمية لغالاكتور، قد يتمكنون من اكتشاف سر التحول من خلال الحذاء.

في قاعدة جالاكتور، أمر كاتسي بتحليل الحذاء الذي بقي سليمًا تمامًا بعد احتراقه في المحرقة. وأخيرًا، اكتشفوا تردد الموجات الكهربائية التي تسببت في تحول الحذاء إلى حذاء أبيض. طلب ​​إكس من الدكتورة ميزونو البدء في تطوير سلاح لعكس هذا التحول. بالإضافة إلى ذلك، بدأوا البحث عن جي-3 بناءً على البيانات التي تم الحصول عليها من حذاء فتيات في السادسة عشرة من العمر تم تجنيدهن في مركز تجميل. تقدمت جون، التي كانت تعاني من الاكتئاب بسبب فقدان حذائها، للوظيفة، على الرغم من أنها تعلم أنها فخ. قامت القائدة، التي أسرت المرشحات الأربع الأخريات إلى جانب جون، بتخديرهن ونقلهن إلى القاعدة. تظاهرت جون بالنوم وأرسلت إشارة تشويش.

تُقتاد جون إلى القاعدة وتستجوبها كاتسي. وعندما يكاد الوقت يفوت، يظهر طائر الفينيق الإلهي. تغتنم جون الفرصة وتنقذ الفتيات، وتستعيد حذاءها، ثم تركب طائر الفينيق الإلهي.

يقوم كاتسي بإطلاق صواريخ الآلة، ولكن بسبب نظام التوجيه الذي بناه كين، تعود الصواريخ وتنفجر القاعدة مع الآلة.

أثناء حشد آلية جالاكتور، فقدت إحدى الطائرات الصغيرة سرعتها واصطدمت بقارب الصيد الذي كان والد ريو على متنه. وغرق القارب.

عندما هرع سيجي، شقيق ريو الأصغر، إلى مكانه وأخبره بغرق سفينة والده، صدر أمر التعبئة العامة في نامبو. نفض ريو أخاه عنه بيأس، بينما كان يبكي ويتشبث به. لكنه تأخر عن التعبئة، وكان معهد الأبحاث الرئيسي قد دُمّر بالفعل. بعد ذلك بوقت قصير، وبينما كانا يقومان بواجب الحراسة على ناقلة نفط، كان ريو قلقًا بشأن غرق سفينة والده أيضًا، ففقد مساره. في هذه الأثناء، تعرضت الناقلة للهجوم.

يوبخه نامبو لأنه لم يبذل قصارى جهده. يدافع كين عن ريو ويخبر نامبو أنهم ليسوا آلات تنفذ الأوامر فحسب. يخبرهم نامبو أنهم رهن الإقامة الجبرية. مع ذلك، يسمع كين وجون من سيجي عن غرق سفينة والد ريو، فيخرجان في مركبة "غود فينيكس" بحثًا عنه دون أوامر من نامبو.

في إحدى جزر أمانا، يكتشفون دخانًا وينقذون والد ريو ورفاقه الذين هم في أمان. في ذلك الوقت، يخبرهم والد ريو، دون أن يعلم أن ريو ابنه، عن نقطة ضعف الآلة. وهي أنه عندما تنفصل الطائرات الصغيرة عن الجزء الرئيسي من الآلة، يصبح الجزء الداخلي مرئيًا.

يظهر الروبوت العملاق مجدداً، مستهدفاً مخزناً لليورانيوم. يتم استدعاء طائر الفينيق الإلهي. وكما تعلم من والده، يُصيب ريو الجزء الرئيسي من الروبوت العملاق بصاروخ بدقة متناهية فور انفصال الطائرات الصغيرة. يُهزم الروبوت العملاق.

عندما صدر أمر التعبئة من نامبو، كان جو في منتصف سباق. ولأنه أنهى السباق، فقد فات الأوان.

في طريقه إلى الاجتماع، يتحول. تعترض غالاكتور الموجات الكهربائية المنبعثة أثناء التحول، ويستهدف الميغازينر المكتمل جو. تصيب الموجات عالية التردد ساقه، فيُبطل تحوله. يختبئ جو خلف صخرة، لكن الدكتور ميسونو يخشى حدوث انفجار بسبب الاستخدام المتواصل، فيتراجع.

في مكان آخر، يصل أعضاء الفريق الأربعة الآخرون إلى مدينة تحت الأرض محترقة. ويبدأون البحث عن مصدر بعض الموجات الكهربائية المشبوهة، لكنها فخٌّ نصبه جالاكتور.

تأخر جو وعاد إلى مكان نامبو، مُبلغًا عن السلاح القادر على عكس التحول. حاول نامبو الاتصال بكين، لكنه لم ينجح. تبع جو أعضاء الفريق الأربعة الآخرين.

في هذه الأثناء، ينخدع كين بتنكر كاتسي ويتلقى ضربة مباشرة من الميغازينر. لكن ينقذه عضوان من ريد إمبلس في اللحظة الأخيرة. لقد أتيا بناءً على طلب نامبو لإنقاذ فريق النينجا العلمي. يُقبض على جون وجينبي وريو أيضًا، ويُقرر تعريضهم للتردد العالي. يهرع جو إلى المكان وينقذهم. يستمر كاتسي في التصويب بعناد على جو والآخرين. هناك، يظهر قائد ريد إمبلس ويطلق صاروخًا. يُكشف التنكر ويظهر كين. يلعب بالميغازينر مع أصدقائه، فيسخن الجهاز بشدة وينفجر.

تلاحق طائرات ريد إمبلس كاتسي الهارب. شاهد كين ريد إمبلس وهي تغادر. يرمي جو قبعة ريد إمبلس على كين الذي ينظر إلى القبعة التي يحملها لفترة طويلة.

دولة دوكوال غنية بموارد الأرض. ولكن بسبب رفضها دفع الأموال اللازمة لدعم جالاكتور، أصبحت حياة الرئيس مهددة.

تلقى فريق النينجا العلمي نداء استغاثة وصل إلى منظمة الأمن الدولي. أخفوا طائر الفينيق الإلهي في قاع البحر وتسللوا سرًا إلى مقر إقامة الرئيس. وُضعت عدة فخاخ في القصر، لكن قيل لهم إنها لحماية الرئيس فقط. التقى الخمسة بالرئيس، لكن من خلال إمساكه بالعصا في اليد المقابلة لساقه المصابة، كشفوا تنكر الطائر الأسود.

يُطردون بواسطة الفخاخ داخل المنزل ويُحبسون خلف دروع زجاجية. يُسكب عليهم غاز سام، ولكن لأن الدروع الزجاجية تُفتح عندما تُحاول الطيور السوداء إطلاق النار عليهم، يتمكنون من الهرب. ولكن عندما يخرج الخمسة إلى المدينة، يتعرضون لهجوم من السكان. كانت الطيور السوداء تُرسل موجات راديو لغسل الأدمغة. في ذلك الوقت، يُفتح غطاء بالوعة وينقذ صبي الخمسة. لقد حوّل محطة مترو الأنفاق إلى ملعب، ولذلك لم يتأثر بموجات الراديو. يقول إنه يريد العودة إلى منزل والديه. يتبع كين والآخرون مجرى الصرف الصحي، متجهين نحو مصدر موجات الراديو. يُقاتلون الطيور السوداء التي كانت تنتظرهم ويُدمرون الآلية التي تُنتج الموجات. ومع ذلك، يظهر كاتسي على الشاشة في نفس الوقت ويُخبرهم أنه استولى على موارد هذا البلد. بالإضافة إلى ذلك، يتباهى بوجود آلية تسببت في انفجار القاعدة أيضًا عندما تم تدميرها.

رغم هروبهم، لم يستطع فريق النينجا العلمي إخفاء غضبه من هزيمتهم الكاملة الأولى. وكان العون الوحيد هو رؤية الصبي بين ذراعي أمه.

يرى جو والديه يُقتلان كل ليلة في أحلامه، مما يُسبب له إرهاقاً شديداً.

انقطع اتصال معهد أبحاث قشرة الأرض، الواقع في قاع وادٍ بحري عميق على عمق 10000 متر تحت سطح البحر. ذهب كين وجو إلى معهد الأبحاث في مارين ساتورن للتحقيق في الأمر.

أثناء الغوص إلى الأعماق، يأخذ جو قيلولة مريحة. وبينما تصل رسالة من السطح تُخبره بوجود غواصة غامضة، يسمعها جو، فيُصاب بكابوس، فيسحب سلك جهاز الراديو، فيُمزقه إرباً.

الغواصة في الواقع تابعة لغالاكتور. لقد تقمّص أعضاء غالاكتور شخصيات مهندسي معهد الأبحاث. دخلوا إلى مارين ساتورن برفقة كين وجو، وانتهزوا الفرصة، فوجهوا أسلحتهم نحوهما. ثم اقتادوا مارين ساتورن إلى حاملة طائرات، وقادوا الرجلين إلى غرفة غاز.

لكن كين يتسلل بعيدًا دون عناء يُذكر. يترك جو خلفه لأنه ليس على ما يُرام، وينطلق لتدمير حاملة الطائرات. يشتعل الوقود ويحدث انفجار. يذهب كين ليُحضر جو فيراه واقفًا بلا حراك أمام ألسنة اللهب.

بعد أن استنتج كين أن مصدر الكوابيس يكمن في الضوء، جعل جو يواجه النيران. استعاد جو ذاكرته، وصرخ بأنه هو نفسه ابن جالاكتور. نجا الرجلان بأعجوبة من انفجار حاملة الطائرات في مارين ساتورن.

في طريق عودتهما إلى المنزل، يكتشف الرجلان المهندسين الذين غرقوا في مياه غامضة وماتوا هناك. يبلغ كين نامبو بهذه المعلومات في رسالة. يسأل جو كين إن كان يريد إخبار نامبو بأنه جالاكتوري. يجيبه كين: "أنت فريق النينجا العلمي G-2".

يقف الرجلان على متن سفينة مارين ساتورن، ويشاهدان غروب شمس المساء.

تم سرقة معلومات سرية تتعلق بفريق النينجا العلمي.

يأمر نامبو فريق النينجا العلمي بالتحقيق في سبب تصرف عالم منظمة الأمن الدولية بورونبو كجاسوس ومنع وصول أي بيانات إلى جالاكتور.

يتظاهر كين بأنه من جالاكتور ويتصل ببورونبو. يعلم من قصة بورونبو أن ابنته قد أُخذت رهينة، ولكن قبل أن يتمكن كين من تقديم نفسه، يحبسه بورونبو في منزله ويهرب بالبيانات.

بفضل رسالة كين، عثر جو ورفاقه على سيارة بورونبو قرب مقر منظمة الأمن الدولي. وتحت سيارة رياضية حمراء، بجانب سيارة بورونبو، وجدوا مدخل قاعدة تحت الأرض. سقط الأربعة من مصعد، لكن كين، الذي وصل متأخرًا، أنقذهم.

يُحاصر أعضاء جالاكتور فريق النينجا العلمي. وفي خضم الفوضى، يلاحق كين كاتسي الهارب وينضم إليه سرًا في آلية متجهة إلى قاعدة أخرى. بعد أن يلاحظ كاتسي كين، يُريد تفجيره مع القاعدة. فيزرع قنبلة موقوتة ويهرب بالبيانات. يكتشف كين ابنة بورونبو في القاعدة ويأخذها معه، ثم يهرب منها.

في مكان آخر، تشعر كاتسي بالحيرة إزاء اختفاء البيانات. لقد رتب بورونبو بذكاء أن تُمسح البيانات عند تشغيل المفتاح.

تقول رومي إنها ترغب برؤية وجه من أحسن إليها. يغطي كين وجهه ويسلمها إلى بورونبو. في القطار أثناء عودتهم، يكون كين قد أزال التحول، وعندما تمر رومي بجانبه دون أن تلاحظه وهي تبحث عن غاتشامان، يلتقط وردتها الساقطة وينظر إليها مطولاً.

في دولة آشام، اندلعت انتفاضة. ظهرت آثار شعاع تشويش على جثة الزعيم الذي أُطلق عليه النار. ظنًا منهم أن بضع مئات من الأشخاص قد تعرضوا لهذا الشعاع، تسلل فريق النينجا العلمي إلى البلاد.

أثناء التحقيق، لاحظ كين وجينبي أن الطواويس، وهي الطيور الوطنية للبلاد والتي تُربى وتُطلق محليًا، عبارة عن روبوتات. غطت روبوتات الطاووس الرجلين بأشعة تشويش. دفع كين جينبي بعيدًا وأنقذه من الأشعة، لكنه تعرض لهجوم من شيطان الطاووس، وهو روبوت عملاق على شكل طاووس، والذي استولى على السيارة التي كان كين مختبئًا فيها. وبقي بوميرانغ كين في مكانه.

تلقى فريق النينجا العلمي بثًا يُظهر تدمير السيارة التي كان كين بداخلها. انتابهم الحزن عندما وصلتهم رسالة تفيد بظهور الآلة العملاقة مجددًا. قال فريق النينجا العلمي إنها معركة تخليدًا لذكرى كين، وانطلقوا.

يخوض غود فينيكس معركةً شرسةً ضدّ الآلة العملاقة، مُتعرّضًا لشعاع التشويش. لكن كين ينجو من السيارة ويُدمّر جهاز الإطلاق في الآلة. تُحدث الكرة الحديدية، التي كانت على وشك الإطلاق، ثقبًا في هيكل الآلة، فيتمكّن كين من الخروج إلى خارجها. يتصل كين بجو ويطلب منه إطلاق صاروخ مزوّد بجهاز توقيت على الآلة.

بسبب إطلاق الصاروخ على الآلية، ساد الذعر وتمكن كاتسي من الفرار. وقبل لحظات من تحطم الآلية على الأرض، انفصل كين عن هيكلها. تحرك جهاز التوقيت وانفجرت الآلية.

يشعر رفاقه بالسعادة لنجاة كين. يعيد جون البوميرانج إلى يد كين.

جزيرة بي سي هي جزيرة يحكمها جالاكتور. يزور رجل قبر جوزيبي أساكورا وزوجته، الذي لم يزره أحد منذ عشر سنوات. ولأن الرجل في الصورة المرسلة متنكر ويشبه جوزيبي، يذهب كاتسي إلى الجزيرة. يُقال إن طفل جوزيبي توفي في المستشفى الذي نُقل إليه، ولكن عندما يعلم كاتسي أن الرجل الذي أحضر ذلك الطفل هو نامبو، يأمر بفتح قبر الطفل. فيجده فارغًا.

صدر الأمر بالقبض على الرجل إلى جميع سكان الجزيرة.

أثناء هروبه من مطاردة جالاكتور المستمرة، يلتقي جو بصديق طفولته، الأب آلان. عند منتصف الليل، يظهر جو، المصاب، في الكنيسة ويطلب منه أن يؤويه. وبينما يعالجه آلان، يعلم جو من كلامه أن فتاة نجمة الشيطان التي قتلها سابقًا كانت خطيبة آلان. يتسلل جالاكتور من جانب آلان الذي غادر، ويدخل الكنيسة، فينهار جو متأثرًا بالرصاص. في تلك اللحظة، يكون فريق النينجا العلمي قد علم بماضي جو، فيسارعون إليه.

هزم فريق النينجا العلمي غالاتور، لكن فجأةً ظهر آلان ممسكًا بمسدس. وجّه آلان المسدس نحوهم، سائلًا عن هوية جو، الكوندور. أجاب كين بأنه هو. عندما ضغط آلان على الزناد، اخترقت رصاصة جو صدر آلان. لكن مسدس آلان لم يكن يحوي رصاصة.

ينوح جو قائلاً إن آلان كان أكثر الرجال حاجةً في هذه الجزيرة. وبحضور سكان الجزيرة، تُقام جنازة مهيبة لآلان. وخلف صفوف الناس، ينطلق طائر الفينيق الإلهي.

نجح الدكتور ميسونو، وهو من سكان جالاكتور، في إضعاف جهاز الكشف الذي تم اختراعه سابقًا، والذي يكشف الموجات الكهربائية المنبعثة عند تحول فريق النينجا العلمي. يخطط جالاكتور لاستخدامه في عملية لتعقب فريق النينجا العلمي ومتابعتهم إلى قاعدتهم.

يعيدون بناء بعض الآليات القديمة ويجعلونها تثور في كل مكان. وباستغلالهم اللحظة القصيرة التي يتحول فيها فريق النينجا العلمي، ينجحون في خطتهم.

فريق النينجا العلمي، غير مدركٍ لخطة جالاكتور، يجتمع مجدداً في مركبة غود فينيكس، ويعتزم مهاجمة الآليات. إلا أن نامبو يشك في أنها فخٌّ من جالاكتور، فيأمرهم بالعودة إلى كريسنت كورال، تاركاً الآليات لقوات الأمم المتحدة.

لكنّ مركبة "غود فينيكس" تتبعها جرافات على شكل سرطان البحر. وعندما تلاحظ هذه الجرافات وجود أتباعها، تكون "كريسنت كورال" قد ظهرت بالفعل. تتصل "كريسنت كورال" بالقاعدة وتطلب منها تغيير موقعها. إلا أن القاعدة ومركبة "غود فينيكس" كانتا محاصرتين بالفعل ببعض الآليات. تستهدف جرافات سرطان البحر نظام الدفع في القاعدة، لكن يتم استدعاء "جي-4" لحماية النظام من الجرافات.

في محاولة يائسة للرد على النيران، تمكنوا من هزيمة الآليات العملاقة وإنقاذ القاعدة. لكن تم رصد كريسنت كورال، بالإضافة إلى كشف سر قدرته على تغيير موقعه. وفي آذان فريق النينجا العلمي، كانت خطوات جالاكتور تقترب باستمرار.

أثناء بناء مصنع تحت الأرض تابع لمنظمة ISO، هاجم جالاكتور وسقطت حفارة في شق بالأرض. وبما أن مصدر طاقة الحفارة هو اليورانيوم، فمن المتوقع أنه عندما تلامس الحفارة الصهارة، سيحدث زلزال هائل بقوة تزيد عن 8 درجات.

ينطلق فريق النينجا العلمي، برفقة عالم الجيولوجيا الدكتور كاريج، في سيارة استكشافية أرضية، يقودها الروبوت G-4، لجلب جهاز الحفر. المهلة الزمنية عشر ساعات. وفي طريقهم، يتعرضون لكمين من روبوت عملاق. يصعد كين إلى الروبوت G-4، ويستخدمه كطعم لاستدراج الروبوت بعيدًا عن السيارة. ثم يطلق عليه بوميرانغه، المحوّل إلى قنبلة موقوتة.

سرعان ما توقفت العربة بسبب طبقة صخرية. أراد جو والآخرون تفجير الصخرة بواسطة القرد الذي أحضره الدكتور كاريج، لكن سُمع صوت كاتسي من طوق القرد. عائلة كاريج محتجزة كرهائن، وكان يرافقهم كجاسوس. عاد جي-4 إليهم ثم حفر طريقه أسفل الحفارة مباشرة.

من خلال رسالة كاتسي، علم الدكتور كاريج أنه قد تُرك وحيدًا. أراد إيقاف الانفجار بجعل القرد يعضّ كابلًا داخل الحفارة. لكن الآلة العملاقة ظهرت وبدأت بمهاجمتهم. فقام كين بتفجير القنبلة الموقوتة. أوقف الانفجار هبوط الحفارة، لكن الدكتور كاريج دُفن تحتها وفقد حياته.

يتولى جينبي رعاية المثقاب، الذي يتم جمعه بواسطة رافعة، ثم يقوم بنزع جهاز الاستقبال من طوق القرد ويدوس عليه.

يحاول العالم ديمون بيع اختراعه لجالاكتور باستخدامه لمهاجمة طائرة شحن تحمل بضائع للمحتاجين. يكره نامبو، الذي كان ينافسه على منصب في منظمة الأمن الدولي (ISO) منذ أيام الدراسة. وبسبب تسريبه معلومات عن الآلة العملاقة، وبالتالي استدراجه لنامبو، يشترط كاتسي الكشف عن الوجوه الحقيقية لفريق النينجا العلمي.

وافق نامبو على دعوة ديمون وتوجه إلى مهبط طائرات. لاحظ ديمون أن فريق النينجا العلمي يتصرف سرًا كحراس شخصيين لنامبو. التقط صورة لهم بكاميرا صغيرة مخبأة في رقعة عينه، ثم ألقى قنبلة صغيرة. أدرك فريق النينجا العلمي أن وجوههم المكشوفة قد صُوّرت، ففقدوا شجاعتهم.

سرعان ما تقلع طائرة شحن أخرى، ويرافقها طائر الفينيق الإلهي كحارس شخصي. يأمرهم كين بالتحليق داخل شبكة العنكبوت الخاصة بالآلة العملاقة الظاهرة. وبفضل المعلومات الواردة من ديمون، فإنّ G-4 مُجهّز بغشاء إلكتروني، ويستطيع قطع الخيوط بمنشاره الدائري، مما يمكّن طائر الفينيق الإلهي من التحليق داخل الآلة العملاقة.

يصوّب ديمون مسدسه نحو فريق النينجا العلمي. تصيب الرصاصة سوار جون، فيزول التحوّل. يوجّه ديمون كاميرته نحو جون، لكن يظهر كين وجو أمامه، يمدّان عباءتيهما ويحميان جون.

يقترب فريق النينجا العلمي من ديمون. يستقيل، وعندما يسلم الصورة، يضغط على زر آلية التدمير الذاتي.

بعد هروبهم، نظر كين والآخرون إلى الصورة في طائر الفينيق الإلهي. سُمعت أصوات ضحكات ارتياح. في الصورة، لم يظهر سوى أرجل خمسة أشخاص على وشك الطيران بعيدًا.

تم اعتراض الرسالة التي تفيد بأن جواسيس جالاكتور سيتسللون إلى مدينة أوتولاند.

بنظرة ساخرة إلى فريق النينجا العلمي، الذين يحرسون الحدود، دخل الجواسيس ببساطة.

في هذه الأثناء، يلتقي جينبي بشابٍّ هيبي يُدعى ديف، ويقرر أن يُوظّفه في المطعم. يترك جينبي العمل لديف ويخرج بعربته. يُوقفه شرطيٌّ مُريبٌ لقيادته دون رخصة وهو قاصر. ينتهز جينبي الفرصة ويهرب، لكنه يُصاب. يُبادر ديف بالتظاهر بأنه مُمرض جينبي، ويبدأ جينبي بالشعور نحوه بمشاعر أبوية. لكن جو يشك في ديف ويُراقبه وهو يتحدث مع كاتسي. يستخدم كين والآخرون ديف لنصب فخٍّ. لا يُخبرون جينبي عمدًا، لكنه يسمع المحادثة عبر سواره. يشعر جينبي بالمسؤولية ويذهب وحيدًا إلى المكان الذي يُفترض أن تُستدرج إليه كاتسي.

عندما علموا بذلك، سارع أعضاء الفريق الأربعة الآخرون وديف إلى المكان. هناك، كانت آلة الشطرنج الآلية بانتظارهم. أراد ديف إنقاذ جون وجينبي، اللذين كانا معلقين من سقف جسر. ضغط عليه كاتسي ليخبره كيف تبدو الوجوه الحقيقية لفريق نينجا العلوم. لم ينطق ديف بكلمة وسحب عضوي الفريق. فقام كاتسي بتفجير الجسر.

تم إنقاذ جينبي بواسطة المركبة G-5. وهو يعتقد أن ديف لم يرحل كجاسوس لغالاكتور، بل كصديق.

أوشك مخزون السكر العالمي على النفاد. تم تطوير المُحلي الصناعي "شوغاري" كبديل، ولكن عندما بدأ التوزيع، اشترى أحدهم الكمية كلها.

بسبب ورود أنباء عن العثور على شوغاري في المياه المتدفقة من جبال بيكويرو، توجهت فرقة غود فينيكس إلى هناك. وهناك عثروا على حطام طائرة شحن. ومن خلال الحطام، تبين أن الرجل الذي كان يشتري كل الشوغاري هو تاجر أسلحة يُدعى غيلمان. ومن الصندوق الأسود، استنتجوا أن مكان تحميل الطائرة ربما كان في أربعة مواقع مختلفة. فقسموا العمل وبدأوا البحث.

يتنكر جينبي وريو في زي أمير وخادمه، ويعرضان فدية مقابل أماكن تجمع النمل. عندما يخرجان للتحقق من رسالة امرأة تُدعى ماي، يُقبض عليهما ويُقتادان على متن غواصة. إنها سكرتيرة جيلمان. كين، الذي اتصل به جينبي، يرفض مساعدتهما، ويقترح عليهما إرشادهما إلى القاعدة الرئيسية. ثم يبدأ كين بمتابعة الغواصة.

بعد وصوله إلى محطة ترحيل في قاع البحر، كشف كاتسي، الذي تحوّل إلى ماي، عن هويته وأطلق النار على غيلمان. كان ذلك لأن عملية الشراء قد انتهت، ولم يعد بحاجة إليه. إضافةً إلى ذلك، أراد إعادة تحميل شوغاري والتوجه إلى القاعدة الرئيسية. لكن ريو وجينبي انتهزا الفرصة وهربا. التقيا بطائر الفينيق الإلهي الذي كان يحلق نحو القاعدة. عند خروجهما من القاعدة، أطلقت غواصة كاتسي صواريخ موجهة نحو طائر الفينيق الإلهي، لكنها أصابت محطة الترحيل. أثناء هروبهما، قام ريو بخدعة جعلت الغواصة عاجزة عن الحركة، فانفجرت بصاروخ الطائر.

أثناء قيامه بدورية، يقع جينبي في حب فتاة من النظرة الأولى في منزل لقضاء العطلات في الجبال. عند عودته، يرى في الأخبار أن ماريا، ابنة ملياردير، قد اختُطفت. يكتشف أن تلك الفتاة هي ماريا. ينقذ جينبي ماريا بمفرده. لكن صبيًا تغلب على ستة رجال بالغين واختفى دون أن يكشف عن اسمه، يثير شكوك قائد الشرطة المحلي، الذي هو أحد رجال جالاكتور.

بسبب وجود رجال شرطة رأوا وجه جينبي، تم إرسال القسم بأكمله للبحث عن الصبي.

تصل رسالة من ماريا إلى جينبي. يلتقي بها جينبي في مدينة الملاهي التي ذكرتها في رسالتها. تقول ماريا إن جينبي طلب منها الحضور إلى هنا. يدرك جينبي أن الأمر فخ. كاتسي، من برج المراقبة، يأمر باتوجيلا بكشف حقيقة جينبي.

في هذه الأثناء، يتم استدعاء فريق "فينيكس الإلهي" بسبب وجود روبوت جراد البحر. ومع ذلك، لا يمكنهم الاتصال بجينبي بسبب تداخل موجات الراديو. ولأن جينبي تلقى دعوةً عبر رسالة، ورغم أنه عضو في فريق "نينجا العلوم"، إلا أن عنوانه مجهول، مما يثير شكوكهم ويدفعهم للذهاب إلى مدينة الملاهي.

عندما وصل الأربعة إلى مدينة الملاهي، كان معهم دمية لجينبي، وعرضوا وجهها في القبة العلوية. ألقى جون بالدمية إلى الجانب الآخر من المبنى الذي كان فيه جينبي. تحوّل جينبي وانضم إليهم في طائر الفينيق الإلهي. الآن بإمكانهم هزيمة باتوجيلا بصواريخ الطيور.

يزور جينبي ماريا التي نُقلت إلى المستشفى، ويراقبه رفاقه بقلق. يغادر جينبي غرفتها، ويتحمل ألم عدم رؤيتها مجدداً حتى هزيمة جالاكتور.

هناك رجلٌ اكتشف سرّ كاتسي، وقد شقّ طريقه في صفوف غالاكتور. لكنه الآن في السجن، ويبحث عن المساعدة في مكانٍ آمنٍ للغاية.

يُري نامبو فريق النينجا العلمي صورًا وسجلات لتلميذة كان الرجل قد درّسها. على ظهر إحدى الصور، التي يُعتقد أنها تُظهر القائدة، كُتب اسم: "كاتسي". بحثًا عن سر كاتسي، يذهب كين وجون إلى مدرسة الفتاة التي تظهر في الصور، بينما يتوجه الأعضاء الثلاثة المتبقون إلى السجن.

سمع كين وجون من البروفيسور هوارد، أستاذ تلك المدرسة، أن الفتاة كانت تتمتع بمعدل ذكاء 280، وأنها كانت تنتقل بين المدارس كل عام. قبل انتقالها، كان أداء تلك الطالبة دون المتوسط، فضلاً عن كونها طالبة. علاوة على ذلك، سمع البروفيسور أنه في نفس وقت تخرجهما، أُحرقت غرف تسجيلهما. بعد مغادرة كين وجون، أُطلق صاروخ على غرفة البروفيسور.

في مكان آخر، يخوض جو والآخرون الذين كان من المفترض أن يذهبوا إلى السجن معركةً شرسةً ضدّ روبوت عملاق. ينضمّ إليهم كين، وبفضل ذكائه، ينجون من كارثة محققة. مع ذلك، يتسلّل قائد جالاكتور إلى الداخل بمفرده ويقتل الرجل. يضطرّ فريق النينجا العلميّ إلى القتال بشدّة ضدّ القائد الشرس. لكنّه ينهار عندما يُصيب قصبة جو الهوائية بمسدسه الهوائيّ، الذي كان يسخر منه ظنًّا منه أنّه لعبة.

في سعيهم لكشف لغز كاتسي، زار كين ورفاقه منزل البروفيسور هيوم، لكنهم كانوا متأخرين بخطوة، فقد قُتل البروفيسور بالفعل. أدرك فريق النينجا العلمي أن الرجل العجوز الذي بالكاد يمكن ملاحظته والذي مروا به على الدرج لم يكن سوى كاتسي متنكرًا. ارتجفوا من تنكر كاتسي الخارق.

يضحك ريو على جينبي، الذي يستخدم آلة G-4 لتحريك الأرض وتشكيل الشعاب المرجانية على هيئة هلال. الهدف هو تحويل هذه الشعاب إلى طعم لجذب جالاكتور. يوافق نامبو على الخطة ويسلم سائلاً خاصاً يصبغ الأشياء باللون الأحمر. عندما يتلون شيء ما بهذا السائل، يصبح مرئياً على رادار خاص ولا يستطيع الهرب.

كانت وحدة G-4 متمركزة في قاع البحر. بعد قليل، اكتشف قمر التجسس التابع لجالاكتور الشعاب المرجانية الهلالية الشكل. صدر الأمر بالتحرك إلى خزانات قاع البحر في جميع القواعد. اقتربت جالاكتور. عندما أطلق جينبي السائل الملون، تحول قاع البحر إلى اللون الأحمر أيضًا، وأصبح الرادار عديم الفائدة. عندما علموا أنها قاعدة وهمية، صعدت خزانات قاع البحر إلى السطح وعادت إلى قواعدها.

يتتبعهم جي-4 بالرادار ويكتشف ست قواعد منفصلة يدمرها فريق النينجا العلمي تدميراً كاملاً. يتبع جينبي الآلة الضخمة لكاتسي العائدة إلى القاعدة الرئيسية. يعلم كاتسي بوجود تابعه من خلال اتصال من إكس، وبعد إطلاق طوربيدات، يُفعّل آلية التدمير الذاتي ويهرب.

بمساعدة رسالة جينبي، يتبع فريق النينجا العلمي كاتسي. لكن ريو وحده كان قلقًا على جينبي، الذي كان يتبع الآلة، فلحق به. ورغم إصابته عندما وضع نفسه بين جي-4 والطوربيدات الموجهة إليها، إلا أنهما ظهرا معًا، هاربين من التدمير الذاتي للآلة.

يحاصر الثلاثة الآخرون طائرة كاتسي، لكن في مقعد الطيار لا يوجد سوى دمية. مرة أخرى، سمح فريق النينجا العلمي لكاتسي بالهروب، لكن ريو وجينبي في حالة معنوية عالية.

جو، الذي كان منهمكاً في صيانة سلاحه، أخبره كين أن استخدام الأسلحة خطأ، مما أدى إلى نشوب خلاف.

أمام قبر والده، يتساءل كين عما إذا كان حتى لو هزموا جالاكتور، ستولد منظمة شريرة جديدة.

في جزيرة ميكرون، يوجد بركان خامد في المنتصف. وحوله، تتوسع سبع مدن متباعدة بالتساوي. تتخذ الآلية ماتانغا موقعها على قمة الجبل، وترسل رسالة إلى نامبو تُفيد بأنها ستهاجم مدينة كل 12 ساعة ما لم تُرسل نامبو فريق النينجا العلمي.

يذهب فريق النينجا العلمي إلى الجزيرة، لكن كين يلتقط صوراً متتالية للآلة العملاقة فقط، ثم يعود إلى القاعدة.

قام بتحميض الصور وفحصها بحثًا عن نقطة ضعف في الآلة. لو فُجِّرت الآلة ذات الدرع السميك، لدُمّرت الجزيرة بأكملها. سرعان ما لاحظ كين وجود فتحة تهوية في الآلة، فطلب من نامبو تصنيع رصاصة خاصة.

يقف الفينيكس في الهواء مُقاوماً للآلة. يُوجّه جو آلة الكوندور، المُحمّلة برصاصة خاصة واحدة، نحو طرفه. يُعطي كين تعليماته بإطلاق الرصاصة عبر فتحة التهوية، التي يزيد قطرها قليلاً عن سنتيمتر واحد. يتحوّل باطن الآلة إلى بحر من اللهب. تُمسك الآلة بالفينيكس الإلهي على صدرها وتتجه نحو البحر. يراهن كين على أن درع البطن أرق، فيُطلق صاروخ جون من أعلى القبة.

يفوز كين بالرهان. يتم تفجير الآلة بواسطة الصاروخ.

يُرسل غالاكتور جاسوسًا للتسلل إلى سفينة ركاب تحمل على متنها عددًا كبيرًا من مهندسي منظمة ISO. يقوم الجاسوس بتثبيت نظام توجيه على السفينة، ثم يتم تفجيرها بإطلاق طوربيدات عليها.

خوفًا من تكرار مثل هذا الحادث، أرسل نامبو فريق النينجا العلمي في دورية. غاصت سفينة "غود فينيكس" في موقع غرق السفينة، وصادفت دبابات على شكل سرطان البحر. مستغلةً انشغال فريق النينجا العلمي بالدبابات، التصقت غواصة ببطن "غود فينيكس". عندما تأكدت الدبابات من ذلك، تراجعت. لم يثق فريق النينجا العلمي بهذه الخطوة، لكنهم مع ذلك عادوا إلى قاعدتهم امتثالًا لأمر نامبو. تمكنت غواصة "غالاكتور" من التسلل بسهولة إلى "كريسنت كورال". قتل الطاقم بعض المهندسين، وتنكروا، وثبتوا نظام التوجيه في القاعدة.

تم اكتشاف المهندسين المعتدى عليهم، ويشتبه نامبو في أنه تم تركيب نظام توجيه مماثل للنظام الموجود في سفينة الركاب. يأمر كين وجون بالعثور على النظام، ويأمر جو وبقية الطاقم بالعثور على الغواصة التي تطلق الطوربيدات.

يُفتّش كين وجون داخل القاعدة، ويكتشفان أعضاء جالاكتور متنكرين في زي مهندسين، ويُحاصرانهم. لكن أعضاء جالاكتور يضغطون زرًا، بناءً على تعليمات كاتسي، مما يُؤدي إلى انفجار الغواصة بالكامل، وتدمير أي دليل يُشير إلى موقع جهاز التتبع. يكاد يكون من المستحيل تفتيش القاعدة الضخمة ذات التصميم المُعقد.

وفي مكان آخر، يبحث طائر الفينيق الإلهي في قاع البحر، لكنه لا يستطيع اكتشاف الغواصة التي تختبئ في مكان قريب.

بعد أن تأكد كاتسي من انتصاره، دوى ضحكه بينما تم إطلاق الطوربيدات باتجاه كريسنت كورال.

واحدة تلو الأخرى، أصابت الطوربيدات هدفها بدقة. علقت دعامات الشعاب المرجانية المموهة في القاعدة التي فقدت توازنها وبدأت تغرق نحو قاع البحر. في الداخل، لم يرغب المهندسون في ترك أبحاثهم، لكن كين وجون أقنعاهم بأن الأهم هو حياتهم. فساعدوهم على الهرب. في هذه الأثناء، بينما كان نامبو يُدمر البيانات، سقط حاسوب ضخم وحاصر ساقه، مما جعله عاجزًا عن الحركة.

لاحظ غود فينيكس صوت الانفجارات وعاد إلى القاعدة. بعد التأكد من ذلك، هاجمت مجموعة أخرى من الطوربيدات القاعدة. انقلبت القاعدة، وعلقت بجدار خندق بحري عميق، ولم يتمكن غود فينيكس من الخروج من الحظيرة. تمكن كين وجون من الوصول إلى غرفة نامبو، لكنهما لم يستطيعا فتح الباب لانقطاع التيار الكهربائي. جلسا ينتظران ساعتهما الأخيرة. ومع ذلك، بدأت القاعدة بالسقوط نحو الخندق البحري العميق مرة أخرى، ومن خلال هذه الصدمة، حطم غود فينيكس مصراع الحظيرة ودخل إلى الداخل. ذهب جو وجينبي إلى غرفة نامبو، وعبروا المناطق المغمورة بالمياه. التقوا بكين وجون. باستخدام موقد بندقية جو الهوائية، كسروا الباب وأنقذوا نامبو. انفصل غود فينيكس عن القاعدة الغارقة. راقب فريق النينجا العلمي لفترة طويلة كيف غرقت قاعدتهم في أعماق الخندق البحري. أمرهم نامبو بتفجير القاعدة. عندما أخبرهم أنه سيكون من السهل على جالاكتور حفظ البيانات من القاعدة الموجودة في الخندق البحري العميق، ضغط كين على زر إطلاق صواريخ بيرد.

لم يعد فريق "كريسنت كورال"، الذي كان أساس فريق "ساينس نينجا"، موجوداً.

يشعر كاتسي بالسعادة لهزيمته فريق النينجا العلمي. ثم يأتي أمر من شخص يُدعى "إكس" بالتأكد من القضاء على فريق النينجا العلمي.

في هذه الأثناء، يقضي فريق النينجا العلمي أيامه في فيلا نامبو، عاجزًا عن فعل أي شيء بعد الخسارة الفادحة المتمثلة في فقدان القاعدة، وبيانات خطة مانتل، ومكان إنتاج الصواريخ. ثم تصلهم رسالة تفيد بتعرض مدينة سياحية عديمة الأهمية الاستراتيجية لهجوم. يرغب فريق النينجا العلمي في التعبئة، لكن نامبو يمنعهم ويترك الأمر لقوات الأمم المتحدة.

رغم الهجوم على المدينة، لم يظهر فريق النينجا العلمي. اقتنع كاتسي بأن الفريق قد مات، فشرع في مهمته لتدمير قواعد الأمم المتحدة ومصانعها باستخدام طوربيدات تحت الأرض.

استنادًا إلى المواقع المدمرة، استنتج نامبو من أين انطلقت الطوربيدات وأرسل فريق النينجا العلمي إلى هناك. تسلل فريق النينجا إلى القاعدة واكتشفوا غرفة تخزين للطوربيدات. جمع جو أجهزة الكشف الصغيرة الخاصة بالجميع وثبّتها على الطوربيدات.

أثناء الاحتفال بتدمير فريق النينجا العلمي، كان كاتسي يلقي خطابًا وفي يده شريطٌ يحوي أحدث خطة لـ X للغزو. تفاجأ كاتسي وأعضاء جالاكتور بظهور فريق النينجا العلمي فجأة. فانتهزوا الفرصة وانتزعوا الشريط. أمر كاتسي بإطلاق الطوربيدات وتدمير القاعدة، ثم فرّ منها.

تتبع طائر الفينيق الإلهي الآلية وتطلق صاروخ الطائر الأخير. تم تركيب جهاز إرسال في الصاروخ، وتنطلق الطوربودات تباعاً باتجاه الآلية.

يعيدون الشريط إلى نامبو، ولكن عندما يحاولون تشغيله، يتلاشى في عمود من الدخان الأبيض.

تُزوّد ​​محطة توراشو للطاقة مدينة أوتولاند بالكهرباء. ويكلف نامبو رئيسها، الدكتور كوميبي، باختبار ما إذا كانت كبسولة فضائية مقاومة للحريق أم لا، وهو اختبار يتطلب استخدام محرقة النفايات عالية القدرة في المحطة.

في ذلك المساء، وصل كين والآخرون إلى المحطة لتوديع ريو، الذي كان يستقل قطار الليل لأن والده في حالة حرجة. ولكن بينما كان جو متجهاً نحو المحطة، صدم طفلاً ونقله هو ووالدته إلى المستشفى.

أثناء رحلة تجريبية للآلية "أنغلر"، هبط كاتسي قرب محطة الطاقة وأجبرهم على إعادة شحنها، مما تسبب في انقطاع التيار الكهربائي عن المدينة. ونتيجة لذلك، توقع ريو عودة التيار الكهربائي في منتصف القطار، بينما كان جو في المستشفى حيث كانوا يخضعون لعملية جراحية، أما الثلاثة الآخرون فكانوا في مطعم. لكن كين والآخرين شكوا في طول مدة انقطاع التيار، فتوجهوا إلى محطة الطاقة. هناك، تنكر كاتسي في زي كوميبي، وألقى بهم الثلاثة في المحرقة، ثم زرع قنبلة معلقة داخل المحطة.

تم تشغيل المحرقة، لكنهم نجوا من الخطر باللجوء إلى الكبسولة التي تركها نامبو. هزموا أعضاء جالاكتور الذين جاؤوا للتحقق من الوضع. ثم خطط جون، بمساعدة كوميبي، لإعادة تشغيل مصدر الطاقة، وقام كين بربط القنبلة المعلقة التي اكتشفها جينبي ببوميرانجه وألقاها خلف الآلة الهاربة.

عندما أراد كاتسي تفجير محطة الطاقة وضغط على الزر، انفجرت الآلة نفسها.

عادت الكهرباء إلى مدينة أوتولاند. علم ريو عبر الهاتف في القطار أن والده قد تجاوز حالته الحرجة. في المستشفى، شعر جو بالارتياح لنجاح العملية الجراحية التي أُجريت للطفل.

في جبال جوبيتر، توجد أطلال حصن يُقال إن النينجا القدماء بنوه. وقد عُثر على بعض الجثث الغريبة. يُكلف نامبو جون، الخبير بهذه المنطقة، بالتحقيق في الأمر.

عثر جون على جينبي في جبال جوبيتر. تقرر أن يكون هذا اليوم عيد ميلاد جينبي، ويُحتفل به منذ ذلك الحين. مع ذلك، يشعر جينبي بالضيق لأن جون سافر هذا العام بسبب التحقيق. يخبره ريو أنه بما أنه لا يعرف متى عيد ميلاده الحقيقي، فلا يهم متى يحتفل به. يذهب جينبي إلى جبال جوبيتر للبحث عن تاريخ ميلاده الحقيقي وأصله.

ينام جينبي في كوخ رجل عجوز التقاه، لكنهما يتعرضان لهجوم من مجموعة نينجا. يعلم جينبي من الرجل العجوز أنه كان واحدًا من هؤلاء النينجا، وأنه بسبب معارضته لكاتسي، سُحقت عيناه وقُتل الزعيم وعائلته. لم يبقَ سوى شخص واحد مفقودًا، وهو ابن الزعيم، الذي كان يبلغ من العمر ثلاث سنوات آنذاك. مع ذلك، يقول الرجل العجوز إنه لو التقى بذلك الطفل، لتمنى لو استطاع أن يوصل إليه رسالة مفادها أن معرفة المرء لأصله ليست فألًا حسنًا. ثم يلفظ أنفاسه الأخيرة.

سرعان ما يلتقي جينبي بكين والآخرين، الذين سرقوا عربات مجموعة النينجا، ويقودون الخيول، ويتوجهون مسرعين إلى القاعدة برفقة جون، الذي تسلل هو الآخر إلى القاعدة. يخوضون معركة ضد مجموعة النينجا، التي أخضعها جيش جالاكتور، ويهزمون رجل الشيطان العملاق، المؤلف من النينجا المتحدين، باستخدام مقاتلة تورنادو.

لم يتمكنوا من معرفة أصل جينبي أو تاريخ ميلاده الحقيقي. لكن كتعويض، قدم ريو لجينبي هدية عيد ميلاد. تحطمت الهدية في القتال، لكن جينبي كان راضيًا رغم ذلك.

عندما قام مكتب استخبارات منظمة الأمن الدولي بتحليل قرن آلي سقط في وادي ماموث، استنتجوا بنسبة 80% أن مقر قيادة جالاكتور يقع في المجرى العلوي لنهر ليلو. ولأن النهر عبارة عن وادٍ ضيق، لم يتمكن طائر الفينيق الإلهي من الطيران إليه، فبقي ريو مع طائر الفينيق الإلهي عند مدخل الوادي. أما الأربعة الآخرون، فقد توجهوا نحو المجرى العلوي للنهر في زورق. ولكن في طريقهم، اعترضهم أحدهم. وفي مكان آخر، أصبح هذا الأمر عائقًا أمام عملية جالاكتور لعرض مقر القيادة، مما أدى إلى استدراج فريق النينجا العلمي إلى هناك. فقاموا بالقبض على الرجل.

أثناء صعودهم النهر، صادفوا بحرًا عميقًا تحت الأرض، يمتد في منتصف كهف. لكنه كان قاعدة جالاكتور. قبل أن يُغلق الباب في السقف، تمكن جينبي من الهرب، لكن الثلاثة الآخرين وقعوا في الأسر. اتصل جينبي بطائرة الفينيق الإلهية. خشي ريو أن يتنصت أحدهم، فتظاهر بالنوم ولم يُجب على المكالمة. ثم انطلق سرًا وقاد طائرة الفينيق الإلهية نحو القاعدة.

بينما كان الرجل محاصرًا في القاعدة، سمع ما دار بين فريق النينجا العلمي وجالاكتور. فانتهز الفرصة وفتح السقف. ألقى جينبي قنبلة على الفور وحرر قيود كين والآخرين. هرب الأربعة من القاعدة آخذين الرجل معهم. أمر كين بإطلاق صاروخ على القاعدة، فانفجرت قاعدة جالاكتور.

بعد إنقاذه، أخبرهم الرجل أنه في معركة بين جالاكتور وفريق النينجا العلمي، دُمرت شجرة الصفصاف خاصته في قاع البحر، وأنه تأثر بشدة. لكنه أقرّ بأنه أخطأ. قال كين إنه يعلم بوجود بشر متورطين في معركته، وأن عبء منصبه ثقيل عليه.

من موقع إطلاق الصواريخ التابع للأمم المتحدة، تم إطلاق الصاروخ ليونا 3، الذي يحمل شخصين، بهدف حل ألغاز سديم درب التبانة.

يغادر نامبو موقع الإطلاق برفقة الرئيس على متن طائرة خاصة، لكن يُبلغ عن اختفائهما لاحقًا. وقد قُتل الرئيس الحقيقي قبل الإطلاق.

فجأةً، انحرفت ليونا 3 عن مسارها. تعطلت آلية التحكم في كلٍّ من المركبة ومركز التحكم. ويبدو أن الصاروخ سيسقط على شبه جزيرة شاكو، ما سيؤدي إلى مقتل وإصابة 20 ألف شخص. كُلِّف فريق النينجا العلمي بالبحث عن نامبو، الذي شارك في تطوير آلية التحكم.

تم حبس نامبو في محطة طاقة نووية في شبه جزيرة شاكو. تمكن من الاتصال بجهاز إرسال. قام كاتسي بتعطيل موجات الراديو المتداخلة عمدًا، مستدرجًا بذلك فريق النينجا العلمي إلى هناك. ثم حبسهم في محطة الطاقة مع نامبو. أخبرهم أن ليونا 3 ستسقط على المحطة، ثم هرب كاتسي في مركبة قرصية على شكل نجمة شيطانية.

لقد نجوا بأعجوبة من محطة الطاقة، ولكن بما أنه قد فات الأوان لتصحيح مسار ليونا 3، أمرهم نامبو بإطلاق صاروخ عليها. كان طاقم ليونا 3 مستعدًا بالفعل وقطع الاتصال. كان كين في حيرة من أمره. ولكن عندما أراد جو الضغط على الزر، ضغط كين عليه.

تتفكك ليونا 3. ولا يتبقى سوى المسبحة، التي تحتوي على آخر صلاة للطاقم، وهي تطفو نحو الأرض.

بينما كان جو متجهاً نحو نقطة الالتقاء، أعمته انعكاسات الضوء فاصطدم بامرأة. رأى وجه أمه فيها، فاعتنى بها، لكن إعماءً آخر جعله يشعر بالخوف.

في ذلك الوقت، يضطر غود فينيكس لخوض معركة شرسة بسبب اختفاء جي-2. يعود جو، لكنه لا يُفصح عن وجود خلل ما في جسده، ويتصرف بوقاحة تجاه نامبو. يأمره نامبو بإنقاذ ميكر، أخصائي تلوث الهواء الشاب، الذي يبدو أنه يعمل على تطوير الآليات. كما يطلب نامبو من كين مساعدة جو سرًا.

يصعد جو على متن صاروخ طائر، ويطلق عليه إله العنقاء النار دون أن يلاحظه أحد، ليصيب الآلة التي ظهرت. تعود الآلة إلى القاعدة. يتسلل جو إلى غرفة ميكر، ويتهمه بقتل الناس بالغاز السام الذي أنتجه، ثم يطرحه أرضًا. يبكي ميكر قائلًا إن العالم تجاهله، بينما غالاكتور قدّره وساعده. يستفزه جو، قائلاً إنه سيسمح له بإخراج المسدس وإطلاق النار عليه.

في اللحظة التي أطلق فيها ميكر النار، تعرض جو لهجوم آخر أعمى. لكن كين اقتحم المكان وأنقذه. انطلق صوت كاتسي من مكبرات الصوت مصحوبًا بغاز سام، وأدرك ميكر أنه قد تم استغلاله. أخذ كين والآخرون ميكر معهم وهربوا من القاعدة. ثم تم تفجير الآلة والقاعدة.

بعد عودته، يزور جو غرفة المرأة. إنه يخشى أن يتم استبعاده من فريق النينجا العلمي بسبب مرضه، وأنه لن يتمكن من الانتقام.

طارد النينجا العلمي كاتسي ووصل إلى قاعدة. أمر إكس كاتسي بالقضاء على فريق النينجا العلمي.

يرغبون في الردّ عندما تُطلق عليهم الصواريخ من القاعدة، لكن جو لا يستطيع التركيز جيدًا، وبالتالي لا يستطيع تحديد هدف. يُدمّر صاروخ الطائر الذي يُطلقه عشوائيًا الجزء العلوي من الحصن. يقتحم الخمسة القاعدة، لكنهم يُقادون إلى فخّ ويكادون يُدفنون تحت الرمال. يهربون بالمقاتلة الإعصارية، لكن بسبب فقدان جو للتركيز، يفشلون في المحاولة الأولى. يلاحظ كين حالة جو ويأمره بالبقاء متيقظًا في مركبة غود فينيكس. يعود جو إلى غود فينيكس وهو مُنزعج لأن العدو أمامه ولا يستطيع فعل أي شيء. يوجّه لكمة إلى لوحة تحكم فتُدمى قبضته.

يكتشف كين ورفاقه مخزنًا للذخيرة ويخططون لاستخدامه لتضليل العدو، لكن بفضل خدعة من إكس، يُحبسون في غرفة مثبت في أسفلها مثقاب. تتحرك الغرفة إلى أعماق الأرض، متجهةً نحو الصهارة. وبسبب قوة الطرد المركزي للمثقاب، لا يستطيعون فعل شيء. يتصل كين بجو في مركبة غود فينيكس، ويطلب منه إطلاق صاروخ طائر مزود بجهاز توقيت أسفل المثقاب مباشرةً. عندما يقول جو إنه يفتقر إلى الثقة بالنفس، يقتنع كين بأن هناك خطبًا ما في جسد جو. مع ذلك، يخبره كين أنه يثق بحياتهم بين يديه، ويخبره بموقع المثقاب باستخدام إشارة صوتية. يدعو جو أن يعود كل شيء إلى طبيعته ولو لثانية واحدة. تعود عيناه إلى طبيعتها للحظة. يضغط جو بقبضته بقوة على زر الإطلاق.

ينجو فريق النينجا العلمي سالمين معافين، لكن كين، دون سبب، يشعر بالخوف عند رؤية الدم على يد جو.

طارد النينجا العلمي كاتسي ووصل إلى قاعدة. أمر إكس كاتسي بالقضاء على فريق النينجا العلمي.

يشعر كين بالقلق على حالة جو، ويخشى جو أن يُستبعد من النزال. يُقاطع نامبو النزال بينهما برسالة.

يتم التنصت على دوائر ISO السرية، وبسبب التداخلات الكهرومغناطيسية، يتعذر تحديد موقع العدو. عندما يقول جون إنه قد يكون بإمكانهم تحديد الموقع باستخدام أساورهم، يريد جو الهرب، لكن كين يوقفه. يقول كين إنه من الأفضل أن يكون هناك اثنان فقط، ويقترح أن يذهب مع جون. يتلقى جو الأمر بالبقاء على أهبة الاستعداد، ويسلم كين بندقيته الهوائية.

يشكّ الاثنان في وجود مروحية على سطح مقرّ منظمة الأمن الدولي. يصعدان إليها ويرافقانها إلى القاعدة حيث يستعيدان الشريط من كاتسي. لكنهما يكتشفان أن الشريط قد نُسخ بالفعل. يطلقان سلكًا على قرص ديفيلستار الهارب، لكنهما يهبطان في وسط مستنقع كبير لا مكان للاختباء فيه. تطاردهما مركبات جالاكتور. يُقيّدان ويُسحبان خلفها. كان جو يتتبع جهاز الإرسال الموجود في مدفع الهواء، فيطلق النار على الحبال التي تُقيّدها. يُسقط جو مركبة تلو الأخرى. تتحد المركبات وتتحول إلى روبوت عملاق، يواجهه جو في مركبته جي-2. يتفادى أشعة الضوء، ويطلق النار على رأسه بآلة كوندور ويفجره.

لقد عاد وجه جو الجريء المبتسم إلى وجهه. ومع ذلك، فإن جانبيه المتناقضين، الثقة بالنفس والحيرة، يفوقان قدرته على التحمل.

تصل رسالة تفيد بظهور روبوت عملاق، ولكن نظرًا لعدم تمكنه من الاتصال بنامبو، يخرج كين بمحض إرادته. إلا أن هذا الروبوت ليس إلا فخًا لإبعاد الفريق عن نامبو.

في هذه الأثناء، يزور جو طبيباً غير مرخص. تظهر القائدة دون أن يلاحظها جو. يراقب الطبيب نامبو، الذي انزوى في منزله منكباً على تحليلاته. يُختطف نامبو على يد جالاكتور. يرى جو، الذي زار الطبيب مجدداً، القائدة، فيتبعها ويصل إلى الآلة حيث يُحتجز نامبو.

يقول نامبو لكاتسي المنتصر إنه لأمر مؤسف أنه لا يستطيع كشف وجهه الحقيقي، الذي ظلّ يخفيه طوال شهر. في تلك اللحظة، يقتحم جو المكان لإنقاذ نامبو. يُصاب جو برصاصة من سلاح ميغازينر، فيزول التحوّل ويبقى فاقدًا للوعي. يُحاط جو بفوهات بنادق جالاكتور. في تلك اللحظة، يقوم فريق النينجا العلمي، الذي دخل بناءً على رسالة جو، بحصد أعضاء جالاكتور. يُصوّب كاتسي سلاح ميغازينر مرة أخرى نحو فريق النينجا العلمي. يستعيد جو وعيه، فيُطلق سلك بندقيته الهوائية في فوهة سلاح ميغازينر، مما يُفجّره. يطير القناع بفعل موجة الصدمة الناتجة عن الانفجار، ويُغطّي كاتسي وجهه. يُفضي نامبو إليهم بالسر: كان من المفترض أن يُولد كاتسي توأمين، ذكر وأنثى، لكنه مُتحوّل.

في تلك اللحظة، كشف إكس عن هيئته أمام نامبو والآخرين. تردد كين للحظة قبل أن يرمي بوميرانغه على كاتسي الهارب. ارتجف فريق النينجا العلمي من وجود إكس وقوته.

يتفاقم مرضه، فيذهب جو إلى حلبة السباق ليتخلص من خوفه. هناك، يقع في قبضة جالاكتور ويُقتاد أمام كاتسي. يضغط عليه كاتسي ليكشف عن حقيقة رفاقه. ولأنه يرفض، ينطلق جو ليفتك بأفراد جالاكتور الذين اعتدوا عليه، لكنه يتعرض لهجوم آخر يُعميه. في طريقه إلى الزنزانة، يهرب بالقفز من على الآلة، لكنه ينهار في الشارع ويُنقل إلى المستشفى. بعد أن يستعيد وعيه، يسمع جو نامبو والطبيب يتحدثان عبر الهاتف، ويعلم أنه لم يتبق له سوى أسبوع أو عشرة أيام من الحياة.

تبدأ جالاكتور عمليتها الأخيرة. بالإضافة إلى ذلك، تبدأ عملية الاهتزاز كطعم.

في كل مكان على الأرض، تستمر الزلازل متفاوتة الشدة بالحدوث. يُصدر نامبو الأوامر بالتحقيق في العلاقة بين الزلازل وجالاكتور، لكن جو يُترك لإجراء فحص طبي. يطلب جو من كين أن يأخذ سيارة G-2 معه. عندما يغادر فريق النينجا العلمي، يرى جو لحظة إهمال من نامبو فيهرب.

بناءً على كلمات كاتسي الطائشة، يصل جو أخيرًا إلى كروس كاراكوروم ويقتنع بأن المقر الرئيسي هناك. عندما يحاول الاتصال بكين، تُحطم رصاصة من جالاكتور سواره. يقاتل جو أفراد جالاكتور المحيطين به، لكنه في النهاية ينهار تحت وطأة رصاصاتهم.

في ذلك الوقت، في مرصد فلكي، تمت ملاحظة انطفاء نجم محدد في سديم أندروميدا.

تم تدمير الآلة العملاقة التي كانت تُستخدم كطعم بواسطة طائر الفينيق الإلهي. ثم صدر الأمر من نامبو بالبحث عن جو.

يشعر إكس بالانفعال بسبب اختفاء سيلكتور. ويخبرهم عن طريق الخطأ أنه سيقضي على الأرض، ويأمر كاتسي بضبط المؤقت في الوشاح.

صدرت الأوامر لفريق النينجا العلمي بالعودة إلى ديارهم. قيل إن الأرض تتحول إلى ثقب أسود، وأن تفاعلات نيوترونية تحدث. يقول نامبو إن جالاكتور يتسبب في انفجارات نووية في باطن طبقة الوشاح. لكنهم لم يتمكنوا من تحديد الموقع. في تلك اللحظة، استقبل سوار كين رسالة بلغة مورس تفيد باكتشاف المقر. يشك نامبو في وجود فخ، لكنه يرسل فريق النينجا العلمي لتتبع الإشارة مع علمه باحتمالية كونها فخًا. كان مُرسلو الإشارة هما عضوا ريد إمبلس اللذان تسللا إلى المقر.

يُعطى جو دواءً يُساعده على التعافي مؤقتًا، ثم يُسحب أمام كاتسي. عند سماعه عن عملية الثقب الأسود، يُلقي جو نجمة نينجا ريشية باتجاه كاتسي، لكن كاتسي يتفاداها. ثم يسحبها العداد إلى داخل الآلة. في عين جو المُنهار، ينعكس طائر الفينيق الإلهي على الشاشة.

وصل طائر الفينيق الإلهي، لكن الضباب كثيف ولا يعرفون المدخل. ثم ظهر أعضاء ريد إمبلس وقادوا فريق النينجا العلمي. لكنهم وقعوا في فخ جالاكتور وسقط الرجلان تحت وابل الرصاص. عاد فريق النينجا العلمي، بإرادة ريد إمبلس في قلوبهم، إلى الخارج. تفرقوا في اتجاهات مختلفة، باحثين عن المدخل.

تظهر تماثيل حجرية غريبة وسط الضباب. يتجول فريق النينجا العلمي باحثًا عن المدخل. غالاكتور موجود هناك، وقد نشر شبكة لاسلكية منتظرًا إرسال إشارة. جو، الذي علم بوصول فريق النينجا العلمي، حشد ما تبقى من قواته وتسلل خارج القاعدة، حيث كان الناس يحاولون الفرار.

وسط الضباب، حاصر جالاكتور جون، لكن شوريكن جو الريشي أنقذها. عبر جهاز اللاسلكي، أُبلغ أعضاء الفريق الأربعة الآخرون باكتشاف مكان جو، فاجتمعوا حوله، لكن ساعته الأخيرة كانت قد اقتربت. ودعهم جو بكلمات أخيرة، قائلاً إن مدخل القاعدة هنا. اعترض جالاكتور الاتصال اللاسلكي، ليُفسد عليهم فرحة التجمع.

يتجه كين والآخرون نحو المدخل، تاركين جو خلفهم. عند اقتحامهم، يكتشفون كاتسي، ويطالبه كين بإيقاف العملية. لكن سوساي إكس يتدخل، ويخبرهم أن مشروع الثقب الأسود قد بدأ بالفعل، وأن الأرض ستُدمر خلال 30 دقيقة. يصاب كاتسي بالصدمة لأنه كان يعتقد أن سوساي إكس سيمنحه السيطرة على العالم، لا الدمار. يخبرهم إكس أن اختفاء نجمه الأم مؤخرًا دفعه لتغيير خططه. ثم يُلقي بنفسه في الثقب الأسود داخل سفينة عملاقة على شكل قلم رصاص. يحاول الفريق بكل الوسائل إيقاف الآلية، لكن كاتسي، وهو يبكي، يقول إنه وثق بتعليمات إكس ولم يفكر أبدًا في جهاز تحكم. ثم يُلقي بنفسه في الصهارة المحيطة بالمقر السابق لجالاكتور.

لا يزال كين مصراً على الصعود إلى الآلية وإيقافها، لكن جون يمنعه. في تلك اللحظة، يتسبب نجم البحر الريشي الذي رماه جو على كاتسي في حلقة سابقة في ارتخاء ترس داخل الآلة. وبسبب انفجار قنبلة جزيئية داخلها، توقفت الآلية عن العمل. مع ذلك، لا أحد يعلم بذلك. يخرج كين والآخرون ويقفون بلا حراك على الأرض الصلبة، فلا يوجد ناجون حولهم.

أعلن نامبو في مؤتمر صحفي عن تدمير جالاكتور. وقال إنه لا يعرف من أو ما هو سوساي إكس، ولا يعرف ما الذي دفعه لشن الحرب على الأرض. لكن نامبو طلب من الجميع أن يضعوا في اعتبارهم أن جوهر الشر قد يكون كامنًا في أي شخص.