مولدن

برنامج Molden هو برنامج عام لمعالجة البنية الجزيئية والإلكترونية.

• يقرأ المخرجات من حزم ab initio مثل GAMESS (US) و Gaussian و MOLPRO و PySCF ومن الحزم شبه التجريبية مثل MOPAC ، ويدعم عددًا من التنسيقات الأخرى.
• يعرض المدارات الجزيئية أو كثافة الإلكترون على شكل مخططات كونتورية أو مخططات شبكية ثلاثية الأبعاد ويخرجها إلى عدد من التنسيقات الرسومية.
• يحرك مسارات التفاعل والاهتزازات الجزيئية.
• محرر مصفوفة Z.

تم اختبار برنامج Molden على منصات مختلفة، وهي Linux و Windows NT و Windows95 و Windows2000 و WindowsXP و MacOSX و Silicon Graphics IRIX و Sun SunOS و Solaris.

يُعدّ Ambfor، وحدة مجال القوى الرئيسية في برنامج Molden، برنامجًا خارجيًا يُمكن تهيئته من داخل Molden. يدعم Ambfor مجالي قوى البروتين Amber وGAFF (مجال قوى Amber العام). يتم استخدام Ambfor تلقائيًا عند دراسة بروتين باستخدام Molden. يُستخدم مجال قوى GAFF للجزيئات الصغيرة فقط. يعتمد كل من Amber وGAFF على الشحنات الذرية، ويكمن الاختلاف الرئيسي بينهما في التكلفة الحسابية، حيث يُعدّ GAFF مكلفًا للغاية.

يستطيع برنامج Molden قراءة العديد من تنسيقات الملفات التي تحتوي على معلومات بلورية.

• قائمة أنظمة الرسومات الجزيئية
• قائمة برامج نمذجة الميكانيكا الجزيئية
• CMBI

مولدن: برنامج للمعالجة المسبقة واللاحقة للهياكل الجزيئية والإلكترونية. ^{[ 1 ]}