Mycobacterium africanum

Mycobacterium africanum is a species of Mycobacterium that is most commonly found in West African countries, where it is estimated to cause up to 40% of pulmonary tuberculosis.^[2] The symptoms of infection resemble those of M. tuberculosis.

It is a member of the Mycobacterium tuberculosis complex.^[3]

There are seven major lineages in the Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC), with lineages 5 and 6 classified as Mycobacterium africanum. MTBC lineage 5 is M. africanum type 1, West African 1 (MAF1), and is classified based on a characteristic deletion of Region of Differentiation (RD) 711. MAF1 is commonly found around the Gulf of Guinea. MTBC lineage 6 is also known as M. africanum type 1, West African 2 (MAF2), and is classified based on a deletion of RD702. MAF2 is prevalent in Western Africa. M. africanum type 2, East African, was previously recognized as a strain of Mycobacterium africanum; it was recently reclassified as Mycobacterium tuberculosis genotype "Uganda" in a sublineage of MTBC lineage 4.^[4]

M. africanum was first described as a subspecies within the MTBC, with phenotypic characteristics intermediate between M. tuberculosis and M. bovis, based on biochemical testing by Castets in 1968. Early genetic analysis showed that it was distinct from M. tuberculosis due to a genomic RD9 deletion and distinct GyrB nucleotide sequence, and distinct from M. bovis due to an intact RD12 and RD4.^[5]

M. africanum is grown in pyruvate-containing media under low oxygen conditions, and forms characteristic "dysgonic" colonies. Unlike M. tuberculosis, M. africanum shows catalase activity, is nitrate negative, and is susceptible to thiopene-2-carboxylic acid hydrazide (TCH) and pyrazinamide (PZA). M. africanum is also slower growing than M. tuberculosis, typically taking 10 weeks to develop colonies rather than 3 to 4 for M. tuberculosis.^[6]

M. africanum is most commonly found in West African countries.^[7] It is an infection of humans only and is spread by an airborne route from individuals with open cases of disease.

لا يزال سبب اقتصار انتشار المتفطرة الأفريقية على غرب أفريقيا، مع وجود حالات متفرقة فقط في مناطق أخرى، غير مفهوم تمامًا. ^{[ 8 ]} تشير الأدلة الوراثية إلى أن المتفطرة الأفريقية تفرعت في مرحلة مبكرة من سلالات المتفطرة السلية الحديثة في أمريكا وأوروبا وآسيا. تشير بعض الأبحاث إلى أن المتفطرة الأفريقية متكيفة مع سكان غرب أفريقيا. قد تكون المتفطرة الأفريقية مُعرَّضة للتنافس من قِبَل سلالات أخرى من المتفطرة السلية في مناطق أخرى؛ ومع ذلك، لم تجد الدراسات الجينية أي فرق في عدد جينات الضراوة أو التنوع الجيني بين المتفطرة السلية والمتفطرة الأفريقية . لم يتم تحديد أي مستودع حيواني للمتفطرة الأفريقية على الرغم من العثور عليها في العديد من الحيوانات البرية. ^{[ 9 ]}

تتمتع هذه البكتيريا بدرجة عدوى مماثلة لبكتيريا السل المتفطرة العادية ، ولكن احتمالية تطورها إلى مرض سريري لدى الأفراد ذوي المناعة السليمة أقل. ^{[ 10 ]} مع ذلك، فإن احتمالية تطور بكتيريا المتفطرة الأفريقية من العدوى إلى التسبب بالمرض لدى مرضى فيروس نقص المناعة البشرية أكبر. في البلدان التي تتوطن فيها هذه البكتيريا ، فإنها تمثل عدوى انتهازية مهمة في المراحل المتأخرة من مرض فيروس نقص المناعة البشرية. ^{[ 11 ]}

لا يزال فهم كيفية تسبب الاختلافات الجينية بين المتفطرة الأفريقية والمتفطرة السلية في انخفاض ضراوة الأولى غير مكتمل. ومع ذلك، من المعروف أن منطقة الاختلاف 9 (RD9) غائبة في المتفطرة الأفريقية ولكنها موجودة في المتفطرة السلية . ^{[ 12 ]}

يُظهر فطر M. africanum اختلافات ملحوظة في هدم الدهون واستقلابها. بالإضافة إلى ذلك، تتعطل مسارات الضراوة، مثل منظم dosR/Rv0081 أو تنظيم ESAT-6، في هذا الفطر . ^{[ 13 ]}

نظراً لتشابه الأعراض واختلاف ظروف النمو بين المتفطرة السلية والمتفطرة الأفريقية ، فإن طرق الزرع غير موثوقة للتشخيص. وقد حسّن التنميط الجيني القائم على البيولوجيا الجزيئية من عملية التحديد. وعلى وجه الخصوص، يُعدّ "التنميط الجيني باستخدام تسلسل النيوكليوتيدات الفاصلة" (spoligotyping) طريقة سريعة تعتمد على تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) لتحديد النمط الجيني لسلالات معقد المتفطرة السلية (MTBC). ومؤخراً، طُوّرت اختبارات التدفق الجانبي السريعة استناداً إلى مستضد mpt64 الموجود في جميع أفراد معقد المتفطرة السلية. ^{[ 14 ]}

يتميز فطر المتفطرة الأفريقية (M. africanum) بمعدل تطور أقل من مرحلة الكمون إلى مرحلة المرض النشط مقارنةً بفطر المتفطرة السلية (M. tuberculosis) . يُعالج السل الناتج عن المتفطرة الأفريقية بنفس نظام العلاج المُستخدم في علاج السل الناتج عن المتفطرة السلية . معدل الشفاء الإجمالي متقارب، ولكن نظرًا لأن نسبة أكبر من مرضى المتفطرة الأفريقية يُحتمل أن يكونوا مصابين بفيروس نقص المناعة البشرية، فقد يكونون أكثر عرضة للوفاة بسبب أمراض أخرى مرتبطة بفيروس نقص المناعة البشرية. ^{[ 15 ]}

ATCC 25420 = CIP 105147

• سكيرمان، في. بي. دي.؛ ماكجوان، في.؛ سنيث، بي. إتش. إيه. (يناير 1980). "قوائم معتمدة لأسماء البكتيريا" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 30 (1): 225-420 . doi : 10.1099/00207713-30-1-225 .

• المتفطرة الأفريقية في متصفح التصنيف التابع للمركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية
• السلالة النموذجية لبكتيريا المتفطرة الأفريقية في قاعدة بيانات التنوع البكتيري Bac Dive