قاعدة بيانات تفاعل المسارات بين المعهد الوطني للسرطان والطبيعة

قاعدة بيانات تفاعلات المسارات (PID) هي قاعدة بيانات طبية حيوية مجانية لمسارات الإشارات الخلوية البشرية. ^{[ 1 ]} تحتوي قاعدة البيانات على معلومات حول التفاعلات والتفاعلات الجزيئية التي تحدث في الخلايا، مع التركيز بشكل خاص على العمليات التي قد تكون ذات صلة بأبحاث وعلاج السرطان. أُنشئت قاعدة البيانات بالتعاون بين المعهد الوطني للسرطان التابع للمعاهد الوطنية للصحة الأمريكية ومجموعة نيتشر للنشر في عام 2005 ، وتم إطلاقها في نوفمبر 2006. في سبتمبر 2012، توقف التحديث النشط، وأصبحت بيانات PID متاحة الآن في منصة تبادل البيانات الشبكية (NDEx) .

اعتبارًا من نوفمبر 2007، احتوت قاعدة البيانات على 59 مسارًا (تضم 3309 تفاعلًا جزيئيًا) أشرف عليها فريق التحرير المشترك بين المعهد الوطني للسرطان ومجلة نيتشر. وتُضاف مسارات جديدة شهريًا. كما تحتوي قاعدة البيانات على 254 مسارًا (تضم 3003 تفاعلات) تم استيرادها من إصدار يونيو 2004 من قاعدة بيانات مسارات BioCarta .

تُجمع البيانات المُنسقة من قِبل المعهد الوطني للسرطان ومجلة نيتشر من الأبحاث المنشورة، ويراجعها علماء متخصصون قبل نشرها. تُخصص رموز أدلة لكل تفاعل جزيئي، مما يُمكّن المستخدمين من تقييم موثوقية التفاعلات أو البحث عن التفاعلات التي تم تحديدها بتقنيات تجريبية محددة.

يمكن عرض محتوى قاعدة البيانات في مسارات مستقلة ومحددة مسبقًا. كما يمكن لقاعدة البيانات إنشاء شبكات تفاعلية ديناميكيًا لعرض نتائج عمليات البحث. تُعرض المسارات والشبكات المُنشأة ديناميكيًا في صور GIF وSVG، ويمكن تنزيلها بصيغة XML (بما في ذلك صيغة تبادل المسارات القياسية BioPAX ). قاعدة البيانات كاملة متاحة للتنزيل أيضًا.

• رياكتوم
• كيغ
• قاعدة بيانات مرجعية للبروتين البشري
• مشروع جينوم السرطان

• مقدمة لقاعدة بيانات تفاعل المسارات بين المعهد الوطني للسرطان ومجلة نيتشر
• تحديد العمليات الرئيسية الكامنة وراء الأنماط الظاهرية للسرطان باستخدام تحليل المسارات البيولوجية

• http://www.ndexbio.org
• صفحات جزيئات الطبيعة من جامعة كاليفورنيا في سان دييغو
• بيوكارتا
• PharmGKB
• شبكة الإشارات البشرية المُنسقة من الأدبيات، وهي أكبر قاعدة بيانات لشبكات الإشارات البشرية