ترجمة نيك

تُعدّ تقنية ترجمة النيك [ 1 ] (أو ترجمة الرأس )، التي طوّرها بيتر ريغبي وبول بيرغ عام 1977، تقنية وسم في البيولوجيا الجزيئية ، حيث يُستخدم بوليميراز الحمض النووي الأول لاستبدال بعض نيوكليوتيدات تسلسل الحمض النووي بنظائرها الموسومة، مما يُنتج تسلسل حمض نووي موسوم يُمكن استخدامه كمسبار في التهجين الموضعي الفلوري (FISH) أو تقنيات التلطيخ . كما يُمكن استخدامها أيضًا للوسم الإشعاعي . [ 2 ]

تُسمى هذه العملية "ترجمة الشقوق" لأن الحمض النووي المراد معالجته يُعالج بإنزيم DNAase لإنتاج "شقوق" أحادية السلسلة، حيث تكون إحدى السلسلتين مفقودة من النيوكليوتيدات. يتبع ذلك استبدال النيوكليوتيدات في مواقع الشقوق بواسطة بوليميراز الحمض النووي الأول ، الذي يزيل النيوكليوتيدات من الطرف 3' (الطرف السفلي) للشق بنشاطه الإكسونوكليازي 3'-5'، ويضيف نيوكليوتيدات dNTPs جديدة موسومة من الوسط إلى الطرف 5' للشق، مما يؤدي إلى تحريك الشق باتجاه الطرف السفلي. [ 3 ] لوسم قطعة من الحمض النووي إشعاعيًا لاستخدامها كمسبار في إجراءات التلطيخ، يُوسم أحد النيوكليوتيدات المُدمجة في التفاعل إشعاعيًا في موضع الفوسفات ألفا ، غالبًا باستخدام الفوسفور-32 . وبالمثل، يمكن ربط فلوروفور بدلًا من ذلك للوسم الفلوري، أو مستضد للكشف المناعي. عندما ينفصل بوليميراز الحمض النووي الأول في النهاية عن الحمض النووي، فإنه يترك شقًا آخر في هيكل الفوسفات. يتحرك الشق مسافة معينة تبعًا لفعالية البوليميراز . يمكن إغلاق هذا الشق بواسطة إنزيم ربط الحمض النووي ، أو يمكن أن تعمل مجموعة الهيدروكسيل الموجودة في الطرف 3' كقالب لمزيد من نشاط بوليميراز الحمض النووي الأول. تتوفر تجاريًا خلطات إنزيمية خاصة لإجراء جميع خطوات العملية في حضانة واحدة.

قد يؤدي حدوث انقطاع في الحمض النووي المزدوج إلى حدوث كسور فيه، إذا صادف إنزيم بوليميراز الحمض النووي الأول انقطاعًا آخر على السلسلة المقابلة، مما ينتج عنه قطعتان أقصر. ولا يؤثر هذا على أداء المجس الموسوم في التهجين الموضعي.

مراجع

  1. ريغبي، ب. و.، ديكمان، م.، رودس، س.، بيرغ، ب. (يونيو 1977). "وسم الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين بنشاط نوعي عالٍ في المختبر عن طريق ترجمة الشق باستخدام بوليميراز الحمض النووي الأول". مجلة البيولوجيا الجزيئية 113 (1): 237-251 . doi : 10.1016/0022-2836(77)90052-3 . PMID 881736 . 
  2. ماثيو سي جي (1985). "الوسم الإشعاعي للحمض النووي عن طريق ترجمة النيك". الأحماض النووية . طرق البيولوجيا الجزيئية. المجلد 2. الصفحات 257-261 . doi : 10.1385/0-89603-064-4:257 . ISBN   0-89603-064-4PMID 21374202 
  3. كارشر، سوزان (1991). وقائع ورشة العمل/المؤتمر الثاني عشر لجمعية تعليم مختبرات علم الأحياء (ABLE) . الصفحات 1-31 .