راسمول

RasMol هو برنامج كمبيوتر مكتوب لتصور الرسومات الجزيئية ، ويهدف إلى استخدامه بشكل أساسي لتصوير واستكشاف هياكل الجزيئات الكبيرة البيولوجية ، مثل تلك الموجودة في بنك بيانات البروتين (PDB).

تاريخ

تم تطويره في الأصل بواسطة روجر سايل في أوائل التسعينيات. [ 1 ]

تاريخيًا، كان برنامج RasMol أداةً بالغة الأهمية لعلماء الأحياء الجزيئية، إذ سمح برنامجه المُحسَّن للغاية بتشغيله على أجهزة حاسوب شخصية ذات قدرات متوسطة آنذاك . قبل RasMol، كانت برامج التصور تعمل على محطات عمل رسومية، والتي كانت، نظرًا لتكلفتها، أقل توفرًا للباحثين. ولا يزال RasMol ذا أهمية بالغة في أبحاث البيولوجيا التركيبية، وقد اكتسب أهميةً في مجال التعليم.

يتمتع برنامج RasMol بتاريخ ترخيص معقد . بدءًا من سلسلة الإصدارات 2.7، [ 2 ] يخضع كود مصدر RasMol لترخيص مزدوج بموجب رخصة جنو العمومية (GPL)، أو رخصة RASLIC المخصصة . [ 3 ] بدءًا من الإصدار 2.7.5، أصبحت رخصة جنو العمومية (GPL) هي الرخصة الوحيدة السارية لتوزيعات البرامج الثنائية.

يتضمن RasMol لغة برمجة نصية ، لأداء العديد من الوظائف مثل تحديد سلاسل بروتينية معينة ، وتغيير الألوان، وما إلى ذلك. وقد أدرجت برامج Jmol و Sirius هذه اللغة في أوامرها.

يمكن تنزيل ملفات بنك بيانات البروتين (PDB) لعرضها من أعضاء بنك بيانات البروتين العالمي (wwPDB). وقد قام الباحثون بتحميل هذه الملفات بعد أن قاموا بتوصيف بنية الجزيئات باستخدام تقنيات مثل علم البلورات بالأشعة السينية ، أو مطيافية الرنين النووي المغناطيسي للبروتين ، أو المجهر الإلكتروني فائق البرودة .

التواصل بين العمليات

يستطيع برنامج Rasmol التواصل مع البرامج الأخرى عبر Tcl / Tk على منصات Unix ، وعبر تبادل البيانات الديناميكي (DDE) على نظام التشغيل Microsoft Windows .

باستخدام برنامج محاذاة التسلسلات المتعددة ، يمكن استخدام فئة جافا المسؤولة بحرية في تطبيقات أخرى. [ 4 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. روجر سايل وإي. جيمس ميلنر-وايت. "راسمول: رسومات جزيئية حيوية للجميع"، مجلة "اتجاهات في العلوم البيوكيميائية" (TIBS)، سبتمبر 1995، المجلد 20، العدد 9، ص 374
  2. هربرت ج. بيرنشتاين، "التغييرات الأخيرة على RasMol، إعادة تركيب المتغيرات"، اتجاهات في العلوم البيوكيميائية (TIBS)، سبتمبر 2000، المجلد 25، العدد 9، الصفحات 453-455
  3. رخصة RASLIC
  4. برنامج محاذاة متعدد