التسلسل بواسطة التهجين

📅 آخر تحديث: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٩ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

يُعدّ التسلسل بالتهجين فئة من الطرق لتحديد ترتيب النيوكليوتيدات على شريط الحمض النووي . ويُستخدم عادةً للبحث عن تغييرات طفيفة مقارنةً بتسلسل حمض نووي معروف . [ 1 ] تكون عملية ارتباط أحد شريطي الحمض النووي بشريطه المُكمّل في اللولب المزدوج للحمض النووي (المعروفة بالتهجين ) حساسة حتى لأخطاء القاعدة الواحدة عندما تكون المنطقة المهجنة قصيرة أو في حال وجود بروتينات متخصصة للكشف عن عدم التطابق. ويُستغل هذا الأمر بطرق متنوعة، أبرزها عبر رقائق الحمض النووي أو المصفوفات الدقيقة التي تحتوي على آلاف إلى مليارات من قليل النيوكليوتيدات الاصطناعية الموجودة في جينوم مُحدد، بالإضافة إلى العديد من الاختلافات المعروفة أو حتى جميع اختلافات القاعدة الواحدة المُحتملة. [ 2 ] [ 3 ]

لقد حلت طرق أخرى محل نوع التسلسل بالتهجين الموصوف أعلاه إلى حد كبير، بما في ذلك التسلسل بالتخليق، والتسلسل بالربط (بالإضافة إلى الطرق القائمة على المسام). ومع ذلك، لا يزال تهجين قليل النوكليوتيدات يُستخدم في بعض مخططات التسلسل، بما في ذلك التسلسل القائم على المسام بمساعدة التهجين، والتهجين العكسي. [ 4 ]

أمثلة على الأنظمة التجارية

  • أفيمتريكس (التسلسل الحقيقي عن طريق التهجين)
  • NABsys (التسلسل القائم على المسام بمساعدة التهجين)
  • شركة Complete Genomics Inc. (التهجين العكسي للمجسات التي تحدد قاعدة واحدة مع كل عملية تهجين)

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ درماناك، رادوي؛ درماناك، سنيزانا؛ تشوي، غلوريا؛ دياز، روبرت؛ هو، آرون؛ جين، هوي؛ جين، بول؛ كوون، سون هي؛ لاسي، سكوت؛ موير، بيل؛ شافتو، جاي؛ سوانسون، دون؛ أوكراينتشيك، تاتيانا؛ شو، تشونغجون؛ ليتل، دين (2002). "التسلسل بالتهجين (SBH): المزايا والإنجازات والفرص". تكنولوجيا الرقائق . التقدم في الهندسة الكيميائية الحيوية/التكنولوجيا الحيوية. المجلد  77. الصفحات 75-101 . doi : 10.1007/3-540-45713-5_5 . ISBN  978-3-540-43215-9ISSN 0724-6145 . PMID 12227738 .​  ملف PDF
  2. ↑ بريباراتا، إف بي؛ أوبفال، إي (2000). "التسلسل بالتهجين عند حدود نظرية المعلومات: خوارزمية مثلى". مجلة علم الأحياء الحاسوبي . 7 (3): 621-30 . CiteSeerX 10.1.1.61.3325 . doi : 10.1089/106652700750050970 . PMID 11108482 .  
  3. ↑ حنا، جي جي؛ وآخرون . (يوليو 2000). "مقارنة بين التسلسل بالتهجين والتسلسل الدوري لتحديد النمط الجيني لإنزيم النسخ العكسي لفيروس نقص المناعة البشرية من النوع 1" . مجلة علم الأحياء الدقيقة السريرية . 38 (7): 2715-2721 . doi : 10.1128/JCM.38.7.2715-2721.2000 . PMC 87006. PMID 10878069 .   
  4. ↑ تشرش، جورج م. (يناير 2006). "الجينوم للجميع". مجلة ساينتفك أمريكان . 294 (1): 46-54 . Bibcode : 2006SciAm.294a..46C . doi : 10.1038/scientificamerican0106-46 . PMID 16468433. S2CID 28769137 .