شوشانا ووداك

شوشانا ووداك عالمة بيولوجيا حاسوبية نمساوية ، ورائدة في مجال دراسة تفاعل البروتينات . ^{[ 1 ]} كانت ووداك من أوائل من قاموا بدراسة تفاعل البروتينات باستخدام برنامج حاسوبي. ^{[ 2 ] [ 3 ]}

حصلت ووداك على شهادة الليسانس في الكيمياء من جامعة بروكسل الحرة، ثم على درجة الدكتوراه في الفيزياء الحيوية من جامعة كولومبيا عام 1974. ومنذ عام 1981، شغلت مناصب تدريسية وبحثية في جامعة بروكسل الحرة، وفي عام 1990 أصبحت أستاذة مشاركة في كلية العلوم. وبين عامي 1995 و2002، شغلت أيضًا منصب رئيسة مجموعة في المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية (EBI). ^{[ 4 ]}

انتُخبت ووداك زميلةً في الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي (ISCB) عام 2016 ^{[ 5 ]} ، وهي إحدى مؤسسي الجمعية. ^{[ 6 ]} وقد ساهمت في تنظيم التقييم النقدي لتوقع التفاعلات ، والذي عملت ضمن فريق إدارته منذ تأسيسه عام 2002. ^{[ 7 ] [ 8 ]}

عملت ووداك في معهد البحوث التابع لمستشفى سيك كيدز في تورنتو، كندا، حيث أصبحت في عام 2004 المديرة العلمية لمركز البيولوجيا الحاسوبية. ^{[ 9 ]}

ووداك إس جيه، بو إس، فلاسبلوم جيه، سيرافين بي. (2008)، "تحديات ومكافآت علم البروتينات التفاعلية"، علم البروتينات الخلوية الجزيئية . 17 سبتمبر، ص 1535-9484.

Malevanets A, Sirota FL, Wodak SJ. (2008), "آلية ومخطط الطاقة لتبادل النطاقات في النطاق B1 من البروتين G.، مجلة علم الأحياء الجزيئي . 26 سبتمبر، 382 (1)، ص 223-35.

بو إس، رونين ك، فلاسبلوم ج، جرينبلات ج، ووداك إس جيه. (2008)، "التماسك المحلي في أنماط التفاعل الجيني يكشف عن تنوع وظيفي سائد"، المعلوماتية الحيوية . 20 أغسطس، ص 1460-2059.

روكا م، دي ماريا ل، ووداك إس جيه، مولينر ف، تونون آي، جيرالدو جيه (2008)، "اقتران تأكيد الرابطة الجليكوسيدية للجوانوازين وتفاعل انقسام الريبونوكليوتيد: الآثار المترتبة على تحفيز البارناز"، بروتينات . 1 فبراير، 1097-0134.

Sirota FL, Héry-Huynh S, Maurer-Stroh S, Wodak SJ.(2008), "دور تسلسل الأحماض الأمينية في تبادل النطاق B1 للبروتين G"، البروتينات ، 10 يناير، 1097-0134.

Dessailly BH, Lensink MF, Orengo CA, Wodak SJ. (2008), "LigASite--a database of biologically relevant binding sites in proteins with known apo-structures", Nucleic Acids Res. Jan 36, Database issue:D667-73.

Pu S, Vlasblom J, Emili A, Greenblatt J, Wodak SJ. (2007), "تحديد الوحدات الوظيفية في التفاعل الفيزيائي لـ Saccharomyces cerevisiae"، Proteomics 7، ص 944-60.

Lensink MF, Mendez R, Wodak SJ. (2007), "Docking and scoreing protein complexes," CAPRI 3rd Edition Proteins 69, pp. 704–18.

Croes D, Couche F, Wodak SJ, van Helden J. (2006) "استنتاج المسارات ذات المعنى في الشبكات الأيضية الموزونة"، J Mol Biol. ، فبراير 10، 356 (1)، ص 222-36.

كروغان نيوجيرسي، كاجني جي، يو إتش، تشونغ جي، غو إكس، إجناتشينكو إيه، لي جي، بو إس، داتا إن، تيكويسيس أب، بونا تي، بيريجرين ألفاريز جي إم، شاليز إم، تشانغ إكس، ديفي إم، روبنسون إم دي، باكانارو إيه، براي جي، شيونغ إيه، بيتي بي، ريتشاردز دي بي، كاناديان في، لاليف إيه، مينا إف، وونغ بي، ستاروستين أ، كانيتي مم، فلاسبلوم ي، وو إس، أورسي ج، كولينز إس آر، تشاندران إس، هاو آر، ريلستون جي جي، غاندي ك، طومسون نيوجيرسي، موسو جي، سانت أونج بي، غاني إس، لام إم إتش، بوتلاند جي، ألطاف أول آم، كانايا إس، شيلاتيفارد أ، أوشيه إي، وايزمان جي إس، إنجلز سي جيه، هيوز TR، باركنسون J، غيرستين M, Wodak SJ, Emili A, Greenblatt JF. (2006), "Global landscape of protein complexes in the yeast Saccharomyces cerevisiae," Nature , March 30, 440 (7084), pp. 637–43.

Billingsley G، Santhiya ST، Paterson AD، Ogata K، Wodak S، Hosseini SM، Manisastry SM، Vijayalakshmi P، Gopinath PM، Graw J، Heon E. (2006)، "CRYBA4، وهو جين جديد لإعتام عدسة العين البشرية، يشارك أيضًا في صغر العين،" Am J Hum Genet. ، أكتوبر، 79(4)، ص 702-9.

Vlasblom J, Wu S, Pu S, Superina M, Liu G, Orsi C, Wodak SJ. (2006), "GenePro: إضافة لبرنامج cytoscape للتصور والتحليل المتقدم لشبكات التفاعل"، المعلوماتية الحيوية ، 1 سبتمبر؛ 22 (17)، ص 2178-9.

سيمونيس ن، جونز د، أورسي سي، فان هيلدن جي، ووداك إس جيه. (2006)، "نمطية الاستجابة النسخية لمجمعات البروتين في الخميرة"، J Mol Biol. ، 20 أكتوبر؛ 363(2)، ص 589-610.

Croes D, Couche F, Wodak SJ, van Helden J. (2005), "Metabolic PathFinding: inferring relevant pathways in biochemical networks,” Nucleic Acids Res. , July 1;33 (Web Server issue):W326-30.

Jaramillo A, Wodak SJ. (2005), "تصميم البروتين يمثل تحديًا لنماذج الذوبان الضمنية"، Biophysical J. ، يناير 88 (1)، ص 156-71.