5-بروموريدين

5-بروموريدين (يُختصر إلى BrUrd أو 5BrU أو br5Urd أو نادرًا ما يُرمز له بالحرف B) [ 2 ] هو مشتق من اليوريدين يحتوي على مجموعة برومو في ذرة الكربون الخامسة. [ 3 ] يندمج BrUrd في الحمض النووي الريبوزي (RNA) ويمكن الكشف عنه باستخدام الكيمياء المناعية الخلوية وتحليله بواسطة قياس التدفق الخلوي. يُسبب تلفًا في الحمض النووي (DNA) من خلال استبدال القواعد، ويزيد من عدد الطفرات. [ 4 ]

الاستخدامات

الكشف عن نشاط نصف العمر

استُخدم 5-برومويوريدين أيضًا للكشف عن نصف عمر جزيئات الحمض النووي الريبي (RNA). في طريقة تُسمى تحليل التسلسل العميق المُتبوع بالترسيب المناعي لـ 5'-برومويوريدين (BRIC-seq)، يُستخدم 5'-برومويوريدين لوسم الحمض النووي الريبي (RNA) وتمكين قياس مستوياته بمرور الوقت. استُخدمت هذه الطريقة في دراسة تاني وآخرون لتحديد أنصاف أعمار الحمض النووي الريبي (RNA) لدراسة وظيفة الحمض النووي الريبي غير المشفر. [ 5 ]

عملية تضفير الحمض النووي الريبوزي الرسول الأولي

استُخدم 5-بروموريدين أيضًا لدراسة عملية التضفير في المختبر للرنا الرسول الأولي في دراسة أجراها وانسينك. استُخدم 5-بروموريوريدين 5'-ثلاثي الفوسفات (BruUTP) لوسم الرنا الرسول الأولي ودراسة كفاءة التضفير. ووجد الباحثون أن التضفير يُثبط عند استبدال اليوريدينات في نسخة الرنا بـ BrU، مما يشير إلى أن اليوريدينات ضرورية لتفاعل التضفير. [ 6 ]

الكشف عن تخليق الحمض النووي الريبي في الخلايا الفردية

تم الكشف عن دمج 5-برومويوريدين بواسطة الخلايا الفردية باستخدام تقنية الكيمياء المناعية الخلوية باستخدام الأجسام المضادة ضد BrdU متبوعة بقياس التدفق الخلوي. [ 7 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 5-برومويوريدين في لينستروم، بيتر جيه؛ مالارد، ويليام جي (محرران)؛ NIST Chemistry WebBook ، قاعدة بيانات NIST المرجعية القياسية رقم 69 ، المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا، غايثرسبيرغ (ماريلاند) (تم استرجاعه في عام 2012)
  2. لجنة IUPAC-IUB المعنية بالتسمية الكيميائية الحيوية (1970). "الاختصارات والرموز للأحماض النووية، والبولينوكليوتيدات، ومكوناتها". الكيمياء الحيوية . 9 (20): 4022-4027 . doi : 10.1021/bi00822a023 .
  3. CSID:82616، http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.82616.html (تم الوصول إليه في الساعة 22:51، 19 أكتوبر 2012)
  4. "5-برومويوريدين (CHEBI:20553)." EBI.ac.uk. المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية، 30 نوفمبر 2010. موقع إلكتروني. 26 أكتوبر 2012. < http://www.ebi.ac.uk/chebi/advancedSearchFT.do;jsessionid=29B3462C81CE2E1F80223B50A927F832?chebiId=20553&structureSearchMethod=substructure >
  5. تاني، هـ؛ ميزوتاني، ر؛ سلام، ك.أ؛ تانو، ك؛ إيجيري، ك؛ واكاماتسو، أ؛ إيسوغاي، ت؛ سوزوكي، ي؛ أكيميتسو، ن (2012). "تحديد استقرار الحمض النووي الريبوزي على مستوى الجينوم يكشف عن مئات النسخ غير المشفرة قصيرة العمر في الثدييات" . أبحاث الجينوم . 22 (5): 947-956 . doi : 10.1101/gr.130559.111 . PMC 3337439. PMID 22369889 .  
  6. وانسينك، دي جي؛ نيلسن، آر إل؛ دي جونغ، إل (1994). "التضفير المختبري للرنا الرسول الأولي المحتوي على برومويوريدين" . تقارير البيولوجيا الجزيئية . 19 (2): 109-113 . doi : 10.1007/BF00997156 . hdl : 11245/1.105890 . PMID 8072491. S2CID 10367635 .  
  7. لارسن، جيه كيه؛ جنسن، بي. أو.؛ ​​لارسن، جيه (2001). تحليل تخليق الحمض النووي الريبي باستخدام قياس التدفق الخلوي عن طريق الكشف عن دمج البرومويوريدين . المجلد 12. الصفحات 7.12.1–7.12.11. doi : 10.1002/0471142956.cy0712s12 . ISBN   978-0471142959PMID 18770724 . S2CID 39703414 .​  {{cite book}}تم |journal=تجاهله ( مساعدة )
  • 5-برومويوريدين فيلينستروم، بيتر جيه؛ مالارد، ويليام جي (محرران)؛ كتاب NIST Chemistry WebBook ، قاعدة بيانات NIST المرجعية القياسية رقم 69 ، المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا، غايثرسبيرغ (ماريلاند) (تم استرجاعه في عام 2012)