الهيدروكسيلازات المعتمدة على ألفا كيتوغلوتارات

📅 آخر تحديث: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 3 صور
الموسوعة الحرة

تُعدّ الهيدروكسيلازات المعتمدة على ألفا-كيتوغلوتارات فئة رئيسية من البروتينات الحديدية غير الهيمية التي تحفز نطاقًا واسعًا من التفاعلات. تشمل هذه التفاعلات تفاعلات الهيدروكسيل ، وإزالة الميثيل، وتوسيع الحلقات، وإغلاقها، وإزالة التشبع. [ 1 ] [ 2 ] وظيفيًا، تُشابه الهيدروكسيلازات المعتمدة على ألفا-كيتوغلوتارات إنزيمات السيتوكروم P450 . يستخدم كلاهما الأكسجين وعوامل الاختزال كركائز مشتركة، وينتج كلاهما الماء . [ 3 ]

الوظيفة البيولوجية

تؤدي الهيدروكسيلازات المعتمدة على ألفا-كيتوغلوتارات أدوارًا متنوعة. [ 4 ] [ 5 ] في الكائنات الدقيقة كالبكتيريا، تشارك ثنائيات الأكسجين المعتمدة على ألفا-كيتوغلوتارات في العديد من المسارات الحيوية والتخليقية والأيضية؛ [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] على سبيل المثال، في بكتيريا الإشريكية القولونية ، يرتبط إنزيم AlkB بإصلاح الحمض النووي التالف . [ 9 ] [ 10 ] في النباتات، تشارك ثنائيات الأكسجين المعتمدة على ألفا-كيتوغلوتارات في تفاعلات متنوعة في استقلاب النبات. [ 11 ] وتشمل هذه التفاعلات التخليق الحيوي للفلافونويدات ، [ 12 ] والتخليق الحيوي للإيثيلين. [ 13 ] في الثدييات والبشر، تلعب إنزيمات الديوكسيجيناز المعتمدة على αKG أدوارًا وظيفية في عمليات التخليق الحيوي (مثل تخليق الكولاجين [ 14 ] وتخليق الكارنيتين [ 15 ] )، والتعديلات ما بعد الترجمة (مثل هيدروكسيل البروتين [ 16 ] )، والتنظيمات فوق الجينية (مثل إزالة مثيلة الهيستون والحمض النووي [ 17 ] )، بالإضافة إلى كونها مستشعرات لعملية استقلاب الطاقة . [ 18 ]

تحفز العديد من ثنائيات الأكسجين المعتمدة على ألفا-كيتوغلوتارات أيضًا عملية تحويل غير مقترنة، حيث تتم عملية نزع الكربوكسيل التأكسدي لألفا-كيتوغلوتارات إلى سكسينات وثاني أكسيد الكربون في غياب الركيزة. يعتمد النشاط التحفيزي للعديد من ثنائيات الأكسجين المعتمدة على ألفا-كيتوغلوتارات على عوامل الاختزال (وخاصة الأسكوربات)، على الرغم من أن الأدوار الدقيقة لهذه العوامل غير مفهومة. [ 19 ] [ 20 ]

الآلية التحفيزية

تحفز ثنائيات الأكسجين المعتمدة على ألفا-كيتوغلوتارات تفاعلات الأكسدة عن طريق دمج ذرة أكسجين واحدة من الأكسجين الجزيئي (O₂ ) في ركائزها. ويقترن هذا التحويل بأكسدة الركيزة المساعدة ألفا-كيتوغلوتارات إلى سكسينات وثاني أكسيد الكربون. [ 1 ] [ 2 ] عند استخدام O₂ الموسوم كركيزة ، يظهر وسم واحد في السكسينات وآخر في الركيزة المهدرجة: [ 21 ] [ 22 ]

R 3 CH + O 2 + − O 2 CC(O)CH 2 CH 2 CO 2 − → R 3 C O H + CO 2 + − O O CCH 2 CH 2 CO 2 −

تتضمن الخطوة الأولى ارتباط αKG والركيزة بالموقع النشط . يرتبط αKG كرابط ثنائي السن مع Fe(II)، بينما تُثبَّت الركيزة بقوى غير تساهمية في جواره. بعد ذلك، يرتبط الأكسجين الجزيئي من طرفه بذرة الحديد Fe في الوضع cis بالنسبة لذرتي مانحتي الأكسجين في αKG. يهاجم الطرف غير المرتبط لرابطة فوق الأكسيد ذرة الكربون الكيتونية، مما يؤدي إلى إطلاق ثاني أكسيد الكربون وتكوين وسيط Fe(IV)-oxo . يقوم مركز Fe=O هذا بعد ذلك بأكسدة الركيزة عبر آلية ارتداد الأكسجين . [ 1 ] [ 2 ]

فشلت الآليات البديلة في الحصول على الدعم. [ 23 ]

آلية التحفيز المتفق عليها لعائلة الديوكسيجيناز المعتمدة على αKG.

بناء

بروتين

تحتوي جميع ثنائيات الأكسجين المعتمدة على αKG على طية حلزونية مزدوجة السلسلة محفوظة (DSBH، والمعروفة أيضًا باسم كوبين)، والتي تتكون من صفيحتين بيتا. [ 24 ] [ 25 ]

ميتالوكو فاكتور

يحتوي الموقع النشط على وحدة ثلاثية من الأحماض الأمينية محفوظة للغاية، تتكون من 2-هيستيدين-1-كربوكسيلات (HXD/E...H)، حيث يرتبط الحديد الثنائي (Fe(II)) الضروري للتحفيز باثنين من بقايا الهيستيدين وبقايا حمض الأسبارتيك/حمض الجلوتاميك. ترتبط وحدة N₂O الثلاثية بأحد أوجه مركز الحديد، تاركةً ثلاثة مواقع غير مستقرة متاحة على ثماني السطوح لارتباط αKG وO₂ . [ 1 ] [ 2 ] توجد وحدة ربط حديدية مماثلة، ولكنها تتميز بترتيب هيستيدين-هيستيدين-هيستيدين، في ديوكسيجيناز السيستين .

ارتباط الركيزة والركيزة المساعدة

تم تحليل ارتباط αKG بالركيزة باستخدام علم البلورات بالأشعة السينية، وحسابات الديناميكا الجزيئية ، وطيف الرنين النووي المغناطيسي. وقد لوحظ ارتباط الكيتوغلوتارات باستخدام مثبطات الإنزيم. [ 26 ]

ترتبط بعض ثنائيات الأكسجين المعتمدة على ألفا-كيتوغلوتارات بركائزها عبر آلية التوافق المُستحث. على سبيل المثال، لوحظت تغيرات هيكلية بروتينية كبيرة عند ارتباط الركيزة بنظير البروليل هيدروكسيلاز البشري 2 (PHD2)، [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ] وهو ثنائي أكسجين معتمد على ألفا-كيتوغلوتارات يشارك في استشعار الأكسجين، [ 30 ] وسينثاز إيزوبنسيلين N (IPNS)، وهو ثنائي أكسجين ميكروبي معتمد على ألفا-كيتوغلوتارات. [ 31 ]

عرض مبسط للموقع النشط لإنزيم بروليل هيدروكسيلاز إيزوفورم 2 (PHD2)، وهو ديوكسيجيناز بشري يعتمد على ألفا-كيتوغلوتارات (αKG). يرتبط الحديد الثنائي (Fe(II)) بجزيئين من الإيميدازول ومجموعة كربوكسيلية واحدة يوفرها البروتين. تم حذف الروابط الأخرى المرتبطة بالحديد، وهي ألفا-كيتوغلوتارات (αKG) والأكسجين (O2) بشكل مؤقت، لتوضيح الصورة.

المثبطات

نظراً للأدوار البيولوجية الهامة التي يؤديها إنزيم ثنائي الأكسجين المعتمد على ألفا-كيتوغلوتارات (αKG)، فقد تم تطوير العديد من مثبطات هذا الإنزيم. تشمل المثبطات التي استُخدمت بانتظام لاستهداف هذا الإنزيم: N-أوكساليغليسين (NOG)، وحمض بيريدين-2،4-ثنائي الكربوكسيل (2،4-PDCA)، و5-كربوكسي-8-هيدروكسي كينولين، وFG-2216، وFG-4592، والتي صُممت جميعها لمحاكاة الركيزة المساعدة αKG والتنافس على ارتباطها بموقع الحديد الثنائي (Fe(II)) النشط في الإنزيم. [ 32 ] [ 33 ] على الرغم من كونها مثبطات فعالة لإنزيم ثنائي الأكسجين المعتمد على αKG، إلا أنها تفتقر إلى الانتقائية، ولذلك يُشار إليها أحياناً باسم مثبطات "واسعة الطيف". [ 34 ] كما طُوِّرت مثبطات تتنافس مع الركيزة، مثل المثبطات القائمة على الببتيد التي تستهدف نطاق هيدروكسيلاز البروليل البشري 2 (PHD2) [ 35 ] ، وميلدرونات ، وهو جزيء دوائي شائع الاستخدام في روسيا وأوروبا الشرقية يستهدف ديوكسيجيناز غاما-بوتيروبيتين . [ 36 ] [ 37 ] [ 38 ] وأخيرًا، نظرًا لأن ديوكسيجينازات ألفا-كيتوغلوتارات تتطلب الأكسجين الجزيئي كركيزة مشتركة، فقد ثبت أيضًا أن الجزيئات الغازية مثل أول أكسيد الكربون [ 39 ] وأكسيد النيتريك [ 40 ] [ 41 ] تُعد مثبطات لديوكسيجينازات ألفا-كيتوغلوتارات، على الأرجح من خلال التنافس مع الأكسجين الجزيئي على الارتباط بأيون الحديد الثنائي في الموقع النشط.

مثبطات شائعة لأنزيمات الديوكسيجيناز المعتمدة على αKG. تتنافس هذه المثبطات مع الركيزة المساعدة αKG للارتباط بالموقع النشط Fe(II).

التحليلات

طُوِّرت العديد من المقايسات لدراسة ثنائي أوكسيجينازات ألفا-كيتوغلوتارات (αKG) بهدف الحصول على معلومات مثل حركية الإنزيم، وتثبيطه، وارتباطه بالليجاندات. يُستخدم مطياف الرنين المغناطيسي النووي (NMR) على نطاق واسع لدراسة هذه الإنزيمات. [ 42 ] فعلى سبيل المثال، طُوِّرت مقايسات لدراسة ارتباط الليجاندات، [ 43 ] [ 44 ] [ 45 ] وحركية الإنزيم، [ 46 ] وأنماط التثبيط ، [ 47 ] بالإضافة إلى التغيرات في بنية البروتين. [ 48 ] كما يُستخدم مطياف الكتلة على نطاق واسع، حيث يُمكن استخدامه لتوصيف حركية الإنزيم، [ 49 ] وتوجيه تطوير مثبطات الإنزيم، [ 50 ] ودراسة ارتباط الليجاندات والمعادن ، [ 51 ] فضلاً عن تحليل التغيرات في بنية البروتين. [ 52 ] استُخدمت أيضًا فحوصات باستخدام قياس الطيف الضوئي، [ 53 ] على سبيل المثال تلك التي تقيس أكسدة 2OG، [ 54 ] وتكوين السكسينات كمنتج ثانوي ، [ 55 ] أو تكوين المنتج. [ 56 ] كما طُبقت تقنيات فيزيائية حيوية أخرى، بما في ذلك (على سبيل المثال لا الحصر) قياس السعرات الحرارية بالمعايرة متساوية الحرارة (ITC) [ 57 ] والرنين المغناطيسي الإلكتروني (EPR). [ 58 ] كما طُوّرت واستُخدمت فحوصات إشعاعية تستخدم ركائز موسومة بالكربون -14 . [ 59 ] نظرًا لأن ثنائي أوكسيجينازات ألفا-كيتوغلوتارات (αKG) تتطلب الأكسجين لنشاطها التحفيزي، فقد طُبّق أيضًا فحص استهلاك الأكسجين. [ 60 ]

للمزيد من القراءة

مراجع

  1. 1 2 3 4 فلاشمان إي، سكوفيلد سي جيه (فبراير 2007). "الوسيط التفاعلي الأكثر تنوعًا؟" . نات. كيم. بيول . 3 (2): 86-87 . doi : 10.1038/nchembio0207-86 . PMID 17235343 . 
  2. 1 2 3 4 هاوسينجر آر بي (يناير - فبراير 2004). "الهيدروكسيلازات المعتمدة على الحديد الثنائي/ألفا-كيتوغلوتارات والإنزيمات ذات الصلة". مراجعات نقدية في الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية . 39 (1): 21-68 . doi : 10.1080/10409230490440541 . PMID 15121720. S2CID 85784668 .  
  3. ↑ سولومون إي آي، ديكر إيه، لينرت إن (أبريل 2003). "إنزيمات الحديد غير الهيمية: مقارنة مع التحفيز الهيمي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 100 (7): 3589-3594 . doi : 10.1073/pnas.0336792100 . PMC 152966. PMID 12598659 .  
  4. ↑ بريسكوت إيه جي، لويد إم دي (أغسطس 2000). "إنزيمات ثنائي الأكسجين المعتمدة على الحديد (II) وحمض 2-أوكسو ودورها في الأيض". تقارير المنتجات الطبيعية 17 (4): 367-383 . doi : 10.1039/A902197C . PMID 11014338 . 
  5. ↑ لونارز سي، سكوفيلد سي جيه (يناير 2011). "الجوانب الفيزيولوجية والكيميائية الحيوية لعمليات الهيدروكسيل وإزالة الميثيل المحفزة بواسطة أوكسيجينازات 2-أوكسوغلوتارات البشرية". تريندز بيوكيم ساينس . 36 (1): 7-18 . doi : 10.1016/j.tibs.2010.07.002 . PMID 20728359 . 
  6. ↑ سكوتي جيه إس، ليونغ آي كيه، جي دبليو، بنتلي إم إيه، بابس جيه، كرامر إتش بي، لي جيه، آيك دبليو، تشوي إتش، بولسن إس إم، بومان إل إيه، لويك إن دي، هوريتا إس، هو سي إتش، كيرشو إن جيه، تانغ سي إم، كلاريدج تي دي، بريستون جي إم، ماكدونو إم إيه، سكوفيلد سي جيه (سبتمبر 2014). "قد يكون لاستشعار الأكسجين لدى الإنسان أصول في هيدروكسيل البرولين لعامل استطالة Tu في بدائيات النوى" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 111 (37): 13331-13336 . Bibcode : 2014PNAS..11113331S . doi : 10.1073/pnas.1409916111 . PMC 4169948 . PMID 25197067 .  
  7. ↑ كليفتون آي جيه، دوان إل إكس، سليمان إم سي، توبف إم، سوزوكي إتش، ويلموث آر سي، سكوفيلد سي جيه (يونيو 2003). "البنية البلورية لإنزيم كاربابينيم سينثاز (CarC)" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 278 ( 23): 20843-20850 . doi : 10.1074/jbc.M213054200 . PMID 12611886. S2CID 9662423 .  
  8. ^ كيرشو نيوجيرسي، كاينز إم إي، سليمان إم سي، شوفيلد سي جيه (سبتمبر 2005). "إنزيمات التخليق الحيوي للكلافام والكاربابينيم". الكيمياء. مشترك. (34): 4251-4263 . دوى : 10.1039 / b505964j . بميد 16113715 . 
  9. ↑ يو، بومينا؛ هانت، جون ف. (25 أغسطس 2009). "دراسات إنزيمية وبنيوية لآلية التعرف على الركائز المتعددة بواسطة إنزيم إصلاح الحمض النووي التأكسدي AlkB" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم بالولايات المتحدة الأمريكية . 106 (34): 14315-14320 . Bibcode : 2009PNAS..10614315Y . doi : 10.1073/pnas.0812938106 . PMC 2725012. PMID 19706517 .  
  10. ↑ إرجل، بورتشي؛ جيل، ميشيل ل.؛ براون، لويس؛ يو، بومينا؛ بالمر الثالث، آرثر ج.؛ هانت، جون ف. (24 أكتوبر 2014). "ديناميكيات البروتين تتحكم في تقدم وكفاءة دورة التفاعل التحفيزي لإنزيم إصلاح الحمض النووي AlkB في بكتيريا الإشريكية القولونية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 289 (43): 29584-29601 . doi : 10.1074/jbc.M114.575647 . PMC 4207975. PMID 25043760 .  
  11. ↑ فارو إس سي، فاكيني بي جيه (أكتوبر 2014). "التنوع الوظيفي لإنزيمات ثنائي الأكسجين المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات/حديد (II) في استقلاب النبات" . فرونت . بلانت ساينس . 5 : 524. Bibcode : 2014FrPS....5..524F . doi : 10.3389/fpls.2014.00524 . PMC 4191161. PMID 25346740 .  
  12. ↑ تشنغ إيه إكس، هان إكس جيه، وو واي إف، لو إتش إكس (يناير 2014). "وظيفة وتحفيز الأكسيجينازات المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات المشاركة في التخليق الحيوي للفلافونويدات النباتية" . المجلة الدولية للعلوم الجزيئية . 15 (1): 1080-1095 . Bibcode : 2014IJMSc..15.1080C . doi : 10.3390/ijms15011080 . PMC 3907857. PMID 24434621 .  
  13. ↑ تشانغ ز، رين جيه إس، كليفتون آي جيه، سكوفيلد سي جيه (أكتوبر 2004). "البنية البلورية والآثار الآلية لأكسيداز حمض 1-أمينوسيكلوبروبان-1-كربوكسيليك - الإنزيم المُكوِّن للإيثيلين" . الكيمياء الحيوية . 11 (10): 1383-1394 . doi : 10.1016/j.chembiol.2004.08.012 . PMID 15489165 . 
  14. ↑ ميليهارجو ج (مارس 2003). "بروليل 4-هيدروكسيلاز، الإنزيمات الرئيسية في التخليق الحيوي للكولاجين". بيولوجيا المصفوفة . 22 (1): 15-24 . doi : 10.1016/S0945-053X(03)00006-4 . PMID 12714038 . 
  15. ↑ ليونغ آي كيه، كروجر تي جيه، كوتشان جي تي، هنري إل، فون ديلفت إف، كلاريدج تي دي، أوبرمان يو، ماكدونو إم إيه، سكوفيلد سي جيه (ديسمبر 2010). "دراسات بنيوية وآلية على هيدروكسيلاز غاما-بوتيروبيتين" . كيم. بيول . 17 (12): 1316-1324 . doi : 10.1016/j.chembiol.2010.09.016 . PMID 21168767 . 
  16. ↑ ماركولوفيتش، سوزانا؛ ويلكينز، سارة إي؛ سكوفيلد، كريستوفر جيه. (21 أغسطس/آب 2015). "هيدروكسيل البروتين المحفز بواسطة أوكسيجينازات معتمدة على 2-أوكسوغلوتارات" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 290 (34): 20712-20722 . doi : 10.1074/jbc.R115.662627 . ISSN 1083-351X . PMC 4543633. PMID 26152730 .   
  17. ↑ والبرت إل جيه، هوبكنسون آر جيه، سكوفيلد سي جيه (ديسمبر 2012). "آليات إنزيمات إزالة مثيل الهيستون والحمض النووي البشري". الرأي الحالي في الكيمياء الحيوية . 16 ( 5-6 ): 525-534 . doi : 10.1016/j.cbpa.2012.09.015 . PMID 23063108 . 
  18. ↑ سالمينين، أ؛ كوبينين، أ؛ كارنيرانتا، ك (2015). "إنزيمات ثنائي الأكسجين المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات هي مستشعرات لعملية استقلاب الطاقة، وتوافر الأكسجين، وتوازن الحديد: دور محتمل في تنظيم عملية الشيخوخة" . مجلة علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 72 (20): 3897-914 . doi : 10.1007/s00018-015-1978-z . PMC 11114064. PMID 26118662. S2CID 14310267 .   
  19. ↑ ميليلا ر، ماجاما ك، غونزلر ف، هاناوسكي-أبيل هـ م، كيفيريكو ك إ (مايو 1984). "يُستهلك الأسكوربات بنسبة قياسية في التفاعلات غير المقترنة التي يحفزها إنزيم بروليل 4-هيدروكسيلاز وإنزيم ليسيل هيدروكسيلاز" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 259 (9): 5403-5405 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)91023-9 . PMID 6325436 . 
  20. ↑ فلاشمان إي، ديفيز إس إل، يوه كيه كيه، سكوفيلد سي جيه (مارس 2010). "دراسة اعتماد هيدروكسيلازات عامل تحفيز نقص الأكسجين (عامل تثبيط HIF ومجال بروليل هيدروكسيلاز 2) على الأسكوربات وعوامل الاختزال الأخرى" (ملف PDF) . مجلة الكيمياء الحيوية 427 (1): 135-142 . doi : 10.1042/BJ20091609 . PMID 20055761 . 
  21. ↑ ويلفورد، ر. و.، كيركباتريك، ج. م.، ماكنيل، ل. أ.، بوري، م.، أولدهام، ن. ج.، سكوفيلد، س. ج. (سبتمبر 2005). "دمج الأكسجين في الناتج الثانوي السكسينات لأنزيمات الأكسدة المعتمدة على الحديد (II) و2-أوكسوغلوتارات من البكتيريا والنباتات والبشر". رسائل FEBS . 579 ( 23): 5170-5174 . Bibcode : 2005FEBSL.579.5170W . doi : 10.1016/j.febslet.2005.08.033 . hdl : 10536/DRO/DU:30019701 . PMID 16153644. S2CID 11295236 .  
  22. ^ Grzyska PK، Appelman EH، Hausinger RP، Proshlyakov DA (مارس 2010). "نظرة ثاقبة لآلية ديوكسيجيناز الحديد من خلال تحليل الخطوات التالية لأنواع FeIV = H O" . بروك. ناتل. أكاد. الخيال العلمي. الولايات المتحدة الأمريكية . 107 (9): 3982–3987 . دوى : 10.1073/pnas.0911565107 . بمك 2840172 . بميد 20147623 .  
  23. ↑ تارهونسكايا هـ، زولوسي أ، ليونغ إي ك، بوش جيه تي، هنري ل، تشودري ر، إقبال أ، كلاريدج تي دي، سكوفيلد سي جيه ، فلاشمان إي (أبريل 2014). "دراسات على إنزيم دي أسيتوكسي سيفالوسبورين سي سينثاز تدعم آلية توافقية للأكسيجينازات المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات". الكيمياء الحيوية . 53 (15): 2483-2493 . doi : 10.1021/bi500086p . PMID 24684493 . 
  24. ↑ ماكدونو إم إيه، لونارز سي، تشودري آر، كليفتون آي جيه، سكوفيلد سي جيه (ديسمبر 2010). "دراسات بنيوية على الأكسيجينازات البشرية المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات". الرأي الحالي في البيولوجيا البنيوية . 20 (6): 659-672 . doi : 10.1016/j.sbi.2010.08.006 . PMID 20888218 . 
  25. ↑ كليفتون، آي. جيه.، ماكدونو، إم. إيه.، إهريسمان، دي.، كيرشو، إن. جيه.، غرانينو، إن.، سكوفيلد، سي. جيه. (أبريل 2006). "دراسات بنيوية على أوكسيجينازات 2-أوكسوغلوتارات والبروتينات ذات الطي الحلزوني بيتا المزدوج". مجلة الكيمياء الحيوية غير العضوية 100 (4): 644-669 . Bibcode : 2006JIBio.100..644C . doi : 10.1016/j.jinorgbio.2006.01.024 . PMID 16513174 . 
  26. ↑ يو، ز.؛ أومورا، س.؛ إيكيدا، هـ.؛ كين، د. إي.؛ جوغل، ج. (2007). " البنية البلورية لإنزيم ديوكسيجيناز الحديد غير الهيمي PtlH في التخليق الحيوي للبنتالينولاكتون" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 282 (2): 36552-36560 . doi : 10.1074/jbc.M706358200 . PMC 3010413. PMID 17942405 .  
  27. ↑ ماكدونو، إم. أ.، لي، في.، فلاشمان، إي.، تشودري، آر.، موهر، سي.، ليينارد، بي. إم.، زوندلو، ج.، أولدهام، إن. ج.، كليفتون، آي. ج.، لويس، ج.، ماكنيل، إل. أ.، كورزيجا، آر. ج.، هيويتسون، ك. إس.، يانغ، إي.، جوردان، إس.، سيد، آر . إس .، سكوفيلد، سي . ج . (يونيو 2006). "استشعار الأكسجين الخلوي: التركيب البلوري لهيدروكسيلاز البروليل لعامل نقص الأكسجين (PHD2)". وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 103 (26): 9814-9819 . Bibcode : 2006PNAS..103.9814M . doi : 10.1073/pnas.0601283103 . PMC 1502536 . PMID 16782814 .  
  28. ↑ تشودري ر، ماكدونو إم إيه، ميسينوفيتش ج، لونارز سي، فلاشمان إي، هيويتسون كيه إس، دومين سي ، سكوفيلد سي جيه (يوليو 2009). "الأساس البنيوي لارتباط عامل نقص الأكسجين المحفز بإنزيمات بروليل هيدروكسيلاز الحساسة للأكسجين" . ستراكشر . 17 (7): 981-989 . doi : 10.1016/j.str.2009.06.002 . PMID 19604478 . 
  29. ↑ تشودري ر، ليونغ إي كيه، تيان واي إم، عبود إم آي، جي دبليو، دومين سي ، كانتريل إف إكس، لاندريو آي، هاردي إيه بي، بو سي دبليو، راتكليف بي جيه، كلاريدج تي دي، سكوفيلد سي جيه (أغسطس 2016). " الأساس البنيوي لانتقائية نطاق تحلل الأكسجين لهيدروكسيلازات بروليل HIF" . نات. كوميون . 7 12673. Bibcode : 2016NatCo...712673C . doi : 10.1038/ncomms12673 . PMC 5007464. PMID 27561929 .  
  30. ↑ ويليام سي، نيكولز إل، راتكليف بي، بو سي، ماكسويل بي (2004). "إنزيمات بروليل هيدروكسيلاز التي تعمل كمستشعرات للأكسجين تنظم تدمير عامل نقص الأكسجين ألفا". مجلة تنظيم الإنزيمات المتقدمة 44 : 75-92 . doi : 10.1016/j.advenzreg.2003.11.017 . PMID 15581484 . 
  31. ↑ روتش، ب. ل.، كليفتون، إ. ج.، هينسجينز، س. م.، شيباتا، ن.، سكوفيلد، س. ج. ، هاجدو، ج.، بالدوين، ج. إ. (يونيو 1997). "بنية إنزيم إيزوبنسلين ن سينثاز المرتبط بالركيزة وآلية تكوين البنسلين" . مجلة نيتشر . 387 (6635): 827-830 . Bibcode : 1997Natur.387..827R . doi : 10.1038/42990 . PMID: 9194566. S2CID : 205032251 .  
  32. ↑ روز، ن. ر.، ماكدونو، م. أ.، كينغ، أ. ن. ، كاوامورا، أ.، سكوفيلد، س. ج. ( أغسطس 2011). "تثبيط الأكسيجينازات المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات". مجلة الجمعية الكيميائية ، 40 (8): 4364-4397 . doi : 10.1039/c0cs00203h . PMID 21390379 . 
  33. ↑ Yeh TL, Leissing TM, Abboud MI, Thinnes CC, Atasoylu O, Holt-Martyn JP, Zhang D, Tumber A, Lippl K, Lohans CT, Leung IK, Morcrette H, Clifton IJ, Claridge TD, Kawamura A, Flashman E, Lu X, Ratcliffe PJ, Chowdhury R, ​​Pugh CW, Schofield CJ (سبتمبر 2017). "الآليات الجزيئية والخلوية لمثبطات هيدروكسيلاز بروليل HIF في التجارب السريرية" . Chem . Sci . 8 (11): 7651–7668 . doi : 10.1039/C7SC02103H . PMC 5802278. PMID 29435217 .  
  34. ↑ هوبكنسون آر جيه، تومبر إيه، ياب سي، تشودري آر، آيك دبليو، تشي كيه إتش، لي إكس إس، كريستنسن جيه بي، كينغ أو إن، تشان إم سي، يوه كيه كيه، تشوي إتش، والبرت إل جيه، ثينيس سي سي، بوش جيه تي، ليجون سي، ريدزيك إيه إم، روز إن آر، باغ إي إيه، ماكدونو إم إيه، كروجر تي، يو دبليو دبليو، نغ إس إس، أولسن إل، برينان بي إي، أوبرمان يو، مولر-كناب إس، كلوز آر جيه، راتكليف بي جيه، سكوفيلد سي جيه ، كاوامورا إيه (أغسطس 2013). "5-كربوكسي-8-هيدروكسي كينولين هو مثبط واسع الطيف لأوكسيجيناز 2-أوكسوغلوتارات، ويسبب انتقال الحديد" . مجلة العلوم الكيميائية . 4 (8): 3110– 3117. doi : 10.1039/C3SC51122G . PMC 4678600 . PMID 26682036 .  
  35. ↑ كوون إتش إس، تشوي واي كيه، كيم جيه دبليو، بارك واي كيه، يانغ إي جي، آهن دي آر (يوليو 2011). "تثبيط نطاق بروليل هيدروكسيلاز (PHD) بواسطة ببتيدات مماثلة للركيزة". رسائل الكيمياء الطبية الحيوية العضوية . 21 (14): 4325-4328 . doi : 10.1016/j.bmcl.2011.05.050 . PMID 21665470 . 
  36. ↑ سيستي سي، سيمخوفيتش بي زد، كالفينش آي، كلونر آر إيه (مارس 2006). "ميلدرونات، مثبط جديد لأكسدة الأحماض الدهنية وعامل مضاد للذبحة الصدرية، يقلل من حجم احتشاء عضلة القلب دون التأثير على ديناميكا الدم" . مجلة علم الأدوية القلبية الوعائية . 47 (3): 493-499 . doi : 10.1097/01.fjc.0000211732.76668.d2 . PMID 16633095. S2CID 45844835 .  
  37. ↑ ليبينش إي، فيلسكيرستس آر، لوكا دي، كيرجانوفا أو، بوغوفيتشس أو، كالفينش آي، دامبروفا إم (ديسمبر 2006). "يحفز الميلدرونات، وهو مثبط لتخليق الكارنيتين، زيادة في محتوى غاما-بوتيروبيتين وحماية القلب في احتشاء قلب الفئران المعزول" . مجلة علم الأدوية القلبية الوعائية . 48 (6): 314-319 . doi : 10.1097/01.fjc.0000250077.07702.23 . PMID 17204911. S2CID 1812127 .  
  38. ↑ هاياشي واي، كيريموتو تي، أساكا إن، ناكانو إم، تاجيما كيه، مياكي إتش، ماتسورا إن (مايو 2000). "الفوائد العلاجية لـ MET-88، وهو مثبط لهيدروكسيلاز غاما-بوتيروبيتين، في الفئران المصابة بفشل القلب بعد احتشاء عضلة القلب". المجلة الأوروبية لعلم الأدوية . 395 (3): 217-224 . doi : 10.1016/S0014-2999(00)00098-4 . PMID 10812052 . 
  39. ↑ Mbenza NM، Nasarudin N، Vadakkedath PG، Patel K، Ahmad AZ، Hanif M، Wright LJ، Sarojini V، Hartinger CG، Leung IK (يونيو 2021). "أول أكسيد الكربون هو مثبط لمجال HIF prolyl hydroxylase 2". كيمبيوكيم . 22 (15): 2521–2525 . دوى : 10.1002/cbic.202100181 . اتش دي ال : 11343/298654 . بميد 34137488 . S2CID 235460239 .  
  40. ↑ ميتزن إي، تشو جيه، جيلكمان دبليو، فاندري جيه، برون بي (أغسطس 2003). "أكسيد النيتريك يعيق التحلل الطبيعي لـ HIF-1α عن طريق تثبيط بروليل هيدروكسيلاز" . علم الأحياء الجزيئي للخلية . 14 (8): 3470-3481 . doi : 10.1091/mbc.E02-12-0791 . PMC 181582. PMID 12925778 .  
  41. ↑ بيرشنر-فانشميدت يو، ياماك إتش، ترينيداد بي، فاندري جيه (يناير 2007). "يُعدِّل أكسيد النيتريك استشعار الأكسجين عن طريق تحفيز بروليل هيدروكسيلاز 2 المعتمد على عامل نقص الأكسجين 1" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 282 (3): 1788-1796 . doi : 10.1074/jbc.M607065200 . PMID 17060326. S2CID 26185260 .  
  42. ^ مبينزا إن إم، فاداككيداث بي جي، ماكجيليفراي دي جي، ليونج آي كيه (ديسمبر 2017). "دراسات الرنين المغناطيسي النووي للحديد غير الهيم (II) والأكسجيناز المعتمد على 2 أوكسوجلوتارات". جيه إنورج. الكيمياء الحيوية . 177 : 384– 394. دوى : 10.1016/j.jinorgbio.2017.08.032 . بميد 28893416 . 
  43. ↑ ليونغ آي كيه، ديميتريادس إم، هاردي إيه بي، ليجون سي، سمارت تي جيه، زولوسي إيه، كاوامورا إيه، سكوفيلد سي جيه ، كلاريدج تي دي (يناير 2013). "طريقة فحص الرنين النووي المغناطيسي باستخدام الليجاند المُبلغ لمثبطات أوكسيجيناز 2-أوكسوغلوتارات" . مجلة الكيمياء الطبية . 56 (2): 547-555 . doi : 10.1021/jm301583m . PMC 4673903. PMID 23234607 .  
  44. ↑ ليونغ آي كيه، فلاشمان إي، يوه كيه كيه، سكوفيلد سي جيه ، كلاريدج تي دي (يناير 2010). "استخدام استرخاء الماء في مذيب الرنين المغناطيسي النووي لدراسة تفاعلات ارتباط الإنزيمات المعدنية بالروابط". مجلة الكيمياء الطبية . 53 (2): 867-875 . doi : 10.1021/jm901537q . PMID 20025281 . 
  45. ↑ خان أ، ليسنياك ر.ك، بريم ج، ريدزيك أ.م، تشوي هـ، ليونغ إ.ك، ماكدونو م.أ، سكوفيلد س.ج ، كلاريدج ت.د (فبراير 2017). "تطوير وتطبيق فحوصات فحص الرنين النووي المغناطيسي القائمة على الربيطة لهيدروكسيلاز غاما-بوتيروبيتين" . مجلة الاتصالات في الكيمياء الطبية . 7 (5): 873-880 . doi : 10.1039/C6MD00004E . hdl : 2292/30083 .
  46. ↑ هوبكنسون آر جيه، حامد آر بي، روز إن آر، كلاريدج تي دي، سكوفيلد سي جيه (مارس 2010). "رصد نشاط إنزيمات إزالة مثيل الهيستون المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات باستخدام مطيافية الرنين النووي المغناطيسي: الملاحظة المباشرة للفورمالديهايد". ChemBioChem . 11 ( 4): 506-510 . doi : 10.1002/cbic.200900713 . PMID 20095001. S2CID 42994868 .  
  47. ↑ بوب إل، تيجلي سي إم، لي في، لويس جيه، زوندلو جيه، يانغ إي، كورزيجا آر جيه، سيد آر (نوفمبر 2009). "أنماط مختلفة لارتباط المثبط بهيدروكسيلاز البروليل باستخدام تقنية حيود الأشعة السينية وطيف الرنين النووي المغناطيسي للمركبات البارامغناطيسية" . مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 131 (46): 16654-16655 . Bibcode : 2009JAChS.13116654P . doi : 10.1021/ja907933p . PMID 19886658 . 
  48. ↑ بليليفنز ب، شيفاراتان ت، فلاشمان إي، يانغ واي، سيمبسون بي جيه، كويفيستو ب، سيدجويك ب، سكوفيلد سي جيه ، ماثيوز إس جيه (سبتمبر 2008). "الحالات الديناميكية لإنزيم إصلاح الحمض النووي AlkB تنظم إطلاق المنتج" . EMBO Rep . 9 (9): 872–877 . doi : 10.1038 / embor.2008.120 . PMC 2529343. PMID 18617893 .  
  49. ↑ فلاشمان إي، باج إي إيه، تشودري آر، ميسينوفيتش جيه، لونارز سي، ماكدونو إم إيه، هيويتسون كيه إس، سكوفيلد سي جيه (فبراير 2008). "الأساس الحركي للانتقائية تجاه ركائز نطاق التحلل المعتمد على الأكسجين في الطرفين الأميني والكربوكسيلي، بوساطة منطقة حلقية من هيدروكسيلازات البروليل لعامل نقص الأكسجين المحفز" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 283 (7): 3808-3815 . doi : 10.1074/jbc.M707411200 . PMID 18063574. S2CID 34893579 .  
  50. ↑ ديميتريادس م، ليونغ إي كيه، تشودري ر، تشان إم سي، ماكدونو إم إيه، يوه كيه كيه، تيان واي إم، كلاريدج تي دي، راتكليف بي جيه، وون إي سي، سكوفيلد سي جيه (يوليو 2012). "الكيمياء التوافقية الديناميكية التي تستخدم أحماض البورونيك/إسترات البورونات تؤدي إلى مثبطات قوية للأكسيجيناز". Angew. Chem. Int. Ed . 51 (27): 6672–6675 . Bibcode : 2012ACIE...51.6672D . doi : 10.1002/anie.201202000 . PMID 22639232 . 
  51. ↑ ميسينوفيتش ج، تشودري ر، ليينارد ب م، فلاشمان إي، باك م ر، أولدهام ن ج، سكوفيلد س ج (أبريل 2008). "دراسات مطياف الكتلة بالترذيذ الأيوني الكهربائي على نطاق بروليل هيدروكسيلاز 2 تكشف عن موقع ارتباط معدني جديد". ChemMedChem . 3 ( 4): 569–572 . doi : 10.1002/cmdc.200700233 . PMID 18058781. S2CID 37628097 .  
  52. ↑ ستوبس سي جيه، لونارز سي، ميسينوفيتش جيه، يوه كيه كيه، هيندلي إن، ليينارد بي إم، سوبوت إف، سكوفيلد سي جيه، فلاشمان إي (مايو 2009). "تطبيق طريقة التحليل البروتيني/مطياف الكتلة لدراسة تأثير المثبطات على بنية الهيدروكسيلاز". مجلة الكيمياء الطبية . 52 (9): 2799-2805 . doi : 10.1021/jm900285r . PMID 19364117 . 
  53. ↑ بروشلياكوف، د. أ.، ماكراكين، ج.، هاوسينجر، ر. ب. (أبريل 2016). "التحليلات الطيفية للأكسيجينازات المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات: تاو د كدراسة حالة" . مجلة الكيمياء غير العضوية البيولوجية. 22 ( 2-3 ) : 367-379 . doi : 10.1007/s00775-016-1406-3 . PMC 5352539. PMID 27812832 .  
  54. ↑ ماكنيل إل إيه، بيثج إل، هيويتسون كيه إس، سكوفيلد سي جيه (يناير 2005). "فحص قائم على التألق الضوئي للأكسيجينازات المعتمدة على 2-أوكسوغلوتارات". مجلة الكيمياء الحيوية التحليلية . 336 (1): 125-131 . doi : 10.1016/j.ab.2004.09.019 . PMID 15582567 . 
  55. ↑ لو إل، بابالاردي إم بي، تومينو بي جيه، كوبلاند آر إيه، فريزر إم إي، جرزيسكا بي كيه، هاوسينجر آر بي (يونيو 2006). "طريقة لتحليل ثنائي أوكسيجينازات الحديد الثنائي/2-أوكسوجلوتارات عن طريق الكشف المقترن بالإنزيم عن تكوين السكسينات". مجلة الكيمياء الحيوية التحليلية . 353 (1): 69-74 . doi : 10.1016/j.ab.2006.03.033 . PMID 16643838 . 
  56. ↑ ريدزيك إيه إم، ليونغ آي كيه، كوتشان جي تي، ثالهمر إيه، أوبرمان يو، كلاريدج تي دي، سكوفيلد سي جيه (يوليو 2012). "تطوير وتطبيق فحص فلوري قائم على الكشف عن الفلورايد لهيدروكسيلاز غاما-بوتيروبيتين". ChemBioChem . 13 ( 11): 1559-1563 . doi : 10.1002/cbic.201200256 . PMID 22730246. S2CID 13956474 .  
  57. ↑ هوانغ سي دبليو، ليو إتش سي، شين سي بي، تشين واي تي، لي إس جيه، لويد إم دي، لي إتش جيه (مايو 2016). "الأدوار التحفيزية المختلفة للروابط المعدنية في إنزيم ديوكسيجيناز 4-هيدروكسي فينيل بيروفات البشري" (ملف PDF) . مجلة الكيمياء الحيوية. 473 ( 9): 1179-1189 . doi : 10.1042/BCJ20160146 . PMID 26936969 . 
  58. ↑ فلاغ إس سي، مارتن سي بي، تابازوينغ سي واي، هولمز بي إي، كناب إم جيه (أغسطس 2012). " فحص مثبطات التخليب لمجال هيدروكسيلاز البروليل HIF-2 (PHD2) وعامل تثبيط HIF (FIH)" . مجلة الكيمياء الحيوية غير العضوية . 113 : 25-30 . doi : 10.1016/j.jinorgbio.2012.03.002 . PMC 3525482. PMID 22687491 .  
  59. ↑ كونليف سي جيه، فرانكلين تي جيه، جاسكل آر إم (ديسمبر 1986). "تحليل بروليل 4-هيدروكسيلاز عن طريق التحديد الكروماتوغرافي لحمض السكسينيك [ 14C ] على أعمدة التبادل الأيوني المصغرة" . مجلة الكيمياء الحيوية 240 (2): 617-619 . doi : 10.1042/bj2400617 . PMC 1147460. PMID 3028379 .  
  60. ↑ إهريسمان د، فلاشمان إي، جين دي إن، ماثيوداكيس ن، هيويتسون كيه إس، راتكليف بي جيه، سكوفيلد سي جيه (يناير 2007). " دراسات حول نشاط هيدروكسيلازات عامل نقص الأكسجين باستخدام اختبار استهلاك الأكسجين" . مجلة الكيمياء الحيوية. 401 ( 1): 227-234 . doi : 10.1042/BJ20061151 . PMC 1698668. PMID 16952279 .