نظام بيانات الباركود للحياة
نظام بيانات الباركود الحيوي (المعروف اختصارًا بـ BOLD أو BOLDSystems ) هو منصة ويب مخصصة لترميز الحمض النووي . [ 1 ] [ 2 ] وهو منصة سحابية لتخزين البيانات وتحليلها، طُوّرت في مركز علم جينوم التنوع البيولوجي في كندا. يتكون النظام من أربع وحدات رئيسية: بوابة بيانات، وبوابة تعليمية، وسجل لأنواع الكائنات الحية المحتملة (BINs)، ومنصة لجمع البيانات وتحليلها، توفر منصة إلكترونية لتحليل تسلسلات الحمض النووي . [ 2 ] منذ إطلاقه عام 2005، تم توسيع نطاق BOLD ليشمل مجموعة من الوظائف، بما في ذلك تنظيم البيانات والتحقق من صحتها وعرضها ونشرها. أُطلق أحدث إصدار من النظام، وهو الإصدار الخامس، عام 2004. أما الإصدار الرابع، الذي أُطلق عام 2017، فقد جلب معه مجموعة من التحسينات لدعم جمع البيانات وتحليلها، بالإضافة إلى وظائف جديدة تُحسّن من نشر البيانات والاستشهاد بها وشرحها. [ 3 ] قبل 16 نوفمبر 2020، احتوت قاعدة بيانات BOLD بالفعل على تسلسلات الباركود لـ 318,105 نوعًا موصوفًا رسميًا، تشمل الحيوانات والنباتات والفطريات والطلائعيات (مع ما يقرب من 8.9 مليون عينة). [ 4 ]
يُتاح برنامج BOLD مجانًا لأي باحث مهتم بترميز الحمض النووي . ومن خلال تقديم خدمات متخصصة، يُسهم في نشر السجلات التي تستوفي المعايير اللازمة للحصول على تصنيف BARCODE في قواعد بيانات تسلسل النيوكليوتيدات الدولية. وبفضل تقديمه عبر الإنترنت ونموذج أمان البيانات المرن، فهو أيضًا في وضع جيد لدعم المشاريع التي تشمل تحالفات بحثية واسعة النطاق. [ 3 ]
يعود الفضل في نشر بيانات مشروع BOLD بشكل أساسي إلى مشروع BARCODE 500K [ 5 ] الذي نفذه اتحاد الباركود الدولي للحياة (iBOL) بين عامي 2010 و2015. وقد هدف المشروع إلى جمع بيانات الباركود الجيني لخمسة ملايين عينة تمثل 500 ألف نوع. وقد ساهم عدد كبير من العلماء والمتعاونين والمرافق من مختلف أنحاء العالم في جمع العينات وتحديد التسلسلات وفرز المعلومات. ويؤدي تراكم البيانات إلى زيادة دقة تحديد الباركود الجيني، ويسهل الوصول إلى ترميز الحياة.
مراجع
- ↑ راتناسينغهام، سوجيفان؛ هيبرت، بول دي إن (2013). "سجل قائم على الحمض النووي لجميع أنواع الحيوانات: نظام رقم فهرس الباركود (BIN)" . PLOS ONE . 8 (7) e66213. Bibcode : 2013PLoSO...866213R . doi : 10.1371/journal.pone.0066213 . ISSN 1932-6203 . PMC 3704603. PMID 23861743 .
- 1 2 راتناسينغهام، سوجيفان؛ هيبرت، بول دي إن (24 يناير 2007). "الترميز الشريطي: نظام بيانات الترميز الشريطي للحياة" . ملاحظات علم البيئة الجزيئية . 7 (3): 355-364 . doi : 10.1111/j.1471-8286.2007.01678.x . ISSN 1471-8278 . PMC 1890991. PMID 18784790 .
- 1 2 "دليل الطباعة BOLD لإصدار BOLD 4" . www.boldsystems.org . مؤرشف من الأصل بتاريخ 23 أبريل 2021. تم الاطلاع عليه بتاريخ 16 نوفمبر 2020 .
- ↑ "ممالك الحياة تُرمّز بالباركود | BOLDSYSTEMS" . www.boldsystems.org . مؤرشف من الأصل في 16 أبريل 2021. تم الاطلاع عليه في 16 نوفمبر 2020 .
- ↑ "الباركود 500 ألف" . ibol.org . مؤرشف من الأصل بتاريخ 16 أغسطس 2021. تم الاطلاع عليه بتاريخ 16 نوفمبر 2020 .
روابط خارجية
- قواعد البيانات البيولوجية
