BioJS

📅 آخر تحديث: ٢٠ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٠ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

BioJS هو مشروع مفتوح المصدر لبيانات المعلوماتية الحيوية على الويب. [ 1 ] يهدف إلى تطوير مكتبة مفتوحة المصدر لمكونات جافا سكريبت لعرض البيانات البيولوجية بصريًا. [ 2 ] يقوم BioJS بتطوير وصيانة وحدات بناء صغيرة (مكونات) يمكن إعادة استخدامها من قبل الآخرين. وللتعرف على المكونات المتاحة، يحتفظ BioJS بسجل. ( مؤرشف بتاريخ 13 مارس 2018 على Wayback Machine) .

تاريخ

صدرت النسخة الأولى من BioJS عام 2012 على يد جون غوميز كارفاخال. طُوّرت كمكتبة جافا سكريبت لمكونات الويب لعرض البيانات البيولوجية في تطبيقات الويب. تضمنت النسخة 2.0 إعادة تصميم كاملة للمكتبة، وصدرت عام 2014 كمشروع ضمن برنامج Google Summer of Code بقيادة مانويل كورباس، وطوّرها ديفيد داو وسيباستيان ويلزباخ. ومنذ ذلك الحين، ساهم أكثر من 100 شخص في المشروع. يتوفر حاليًا أكثر من 150 مكونًا في سجل BioJS.

قائمة مختارة من المكونات المنشورة

  • عارض DAG [ 3 ]
  • عارض محتوى الحمض النووي [ 4 ]
  • عارض الميزات [ 5 ]
  • عارض الخرائط الحرارية [ 6 ]
  • تحليل بين المناجم [ 7 ]
  • نقاط نهاية التعدين [ 8 ]
  • KEGGViewer [ 9 ]
  • التفاعلات بين البروتينات [ 10 ]
  • PsicquicGraph [ 11 ]
  • التسلسل [ 12 ]
  • wigExplorer [ 13 ]
  • treeWidget [ 14 ]

المؤسسات التي تستخدم BioJS

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ كورباس ؛ خيمينيز، رافائيل؛ كاربون ، سيث ج . جارسيا، اليكس. جارسيا، ليلى؛ غولدبرغ، تاتيانا؛ جوميز، جون. كالديريميس، الكسيس. لويس، سوزانا إي؛ مولفاني، إيان؛ بوليك، ألكسندرا؛ رولاند، فرانسيس؛ سالازار، غوستافو؛ شرايبر، فابيان. سيليتوي، إيان؛ سبونر ، ويليام هـ ؛ ثانكي، أنيل؛ فيلافيسيس ، خوسيه م. ياشداف، غي؛ هيرمياكوب، هينينج (2014). "BioJS: معيار مفتوح المصدر للتصور البيولوجي - حالته في عام 2014" . F1000 للأبحاث . 3 : 55. دوى : 10.12688/f1000research.3-55.v1 . ISSN 2046-1402 . PMC 4103492 . PMID 25075290 .   
  2. ↑ "رؤية ورسالة BioJS" . BioJS. مؤرشف من الأصل بتاريخ 10 أغسطس 2014. تم الاطلاع عليه بتاريخ 29 أغسطس 2014 .
  3. ↑ كالديريميس، أليكسيس؛ ستيبان، راديك؛ سوليفان، جولي؛ لين، راشيل؛ لين، مايكل؛ ميكليم، جوس (2014). " BioJS DAGViewer: مكون جافا سكريبت قابل لإعادة الاستخدام لعرض الرسوم البيانية الموجهة" . F1000Research . 3 : 51. doi : 10.12688/f1000research.3-51.v1 . ISSN 2046-1402 . PMC 3945768. PMID 24627804 .   
  4. ↑ ثانكي، أنيل س.؛ كايم، شابونام؛ كورباس، مانويل ؛ ديفي، روبرت ب. (2014). "DNAContentViewer: مكون BioJS لعرض محتوى GC/AT" . F1000Research . 3 : 54. doi : 10.12688/f1000research.3-54.v1 . ISSN 2046-1402 . 
  5. ↑ غارسيا، ليلى؛ ياتشداف، غاي؛ مارتن، ماريا-خيسوس (2014). "FeatureViewer، مكون BioJS لعرض التعليقات التوضيحية القائمة على الموقع في تسلسلات البروتين" . F1000Research . 3 : 47. doi : 10.12688/f1000research.3-47.v2 . ISSN 2046-1402 . PMC 3983936. PMID 24741440 .   
  6. ↑ ياشداف، غاي؛ هيشت، ماكسيميليان؛ باسمانيك-تشور، ميتسادا؛ يحسكيل، أدفا؛ روست، بوركهارد (2014). " عارض الخرائط الحرارية: عرض تفاعلي للبيانات ثنائية الأبعاد في علم الأحياء" . F1000Research . 3 : 48. doi : 10.12688/f1000research.3-48.v1 . ISSN 2046-1402 . PMC 4023661. PMID 24860644 .   
  7. ↑ كالديريميس، أليكسيس؛ ستيبان، راديك؛ سوليفان، جولي؛ لين، راشيل؛ لين، مايكل؛ ميكليم، جوس (2014). "تحليل قوائم إنترماين باستخدام BioJS: مكون BioJS لعرض التحليل البياني أو الإحصائي لمجموعات العناصر من نقاط نهاية إنترماين" . F1000Research . 3 : 45. doi : 10.12688/f1000research.3-45.v1 . ISSN 2046-1402 . 
  8. ↑ كالديريميس، أليكسيس؛ ستيبان، راديك؛ سوليفان، جولي؛ لين، راشيل؛ لين، مايكل؛ ميكليم، جوس (2014). "مكوّن BioJS InterMineTable: مكوّن BioJS لعرض البيانات من نقاط نهاية خدمة الويب المتوافقة مع InterMine" . F1000Research . 3 : 46. doi : 10.12688/f1000research.3-46.v1 . ISSN 2046-1402 . 
  9. ↑ فيلافيسيس، خوسيه م.؛ خيمينيز، رافائيل س.؛ هابرمان، بيانكا هـ. (2014). "KEGGViewer، مكون BioJS لعرض مسارات KEGG" . F1000Research . 3 : 43. doi : 10.12688/f1000research.3-43.v1 . ISSN 2046-1402 . PMC 3954160. PMID 24715980 .   
  10. ↑ سالازار، غوستافو أ.؛ مينتجيس، أيتون؛ مولدر، نيكولا (2014). "تخطيطات تفاعلات البروتين-بروتين: مكونات BioJS لعرض تفاعلات البروتين-بروتين" . F1000Research . 3 : 50. doi : 10.12688/f1000research.3-50.v1 . ISSN 2046-1402 . PMC 4103490. PMID 25075288 .   
  11. ↑ فيلافيسيس، خوسيه م.؛ خيمينيز، رافائيل س.؛ هابرمان، بيانكا هـ. (2014). "PsicquicGraph، مكون BioJS لتصوير التفاعلات الجزيئية من خوادم PSICQUIC" . F1000Research . 3 : 44. doi : 10.12688/f1000research.3-44.v1 . ISSN 2046-1402 . PMC 4097353. PMID 25075287 .   
  12. ↑ غوميز، جون؛ خيمينيز، رافائيل (2014). " Sequence، مكون BioJS لعرض التسلسلات" . F1000Research . 3 : 52. doi : 10.12688/f1000research.3-52.v1 . ISSN 2046-1402 . PMC 4103491. PMID 25075289 .   
  13. ↑ ثانكي، أنيل س.؛ خيمينيز، رافائيل س.؛ كايثاكوتيل، جيمي ج.؛ كورباس، مانويل ؛ ديفي، روبرت ب. (2014). " wigExplorer، مكون BioJS لعرض بيانات الشعر المستعار" . F1000Research . 3 : 53. doi : 10.12688/f1000research.3-53.v2 . ISSN 2046-1402 . PMC 5054804. PMID 27781080 .   
  14. ↑ شريبر، فابيان (2014). "treeWidget: مكون BioJS لعرض الأشجار التطورية" . F1000Research . 3 : 49. doi : 10.12688/f1000research.3-49.v1 . ISSN 2046-1402 .