بروتين مستقبل cAMP
بروتين مستقبل cAMP ( CRP ؛ المعروف أيضًا باسم بروتين منشط الهدم ، CAP ) هو بروتين تنظيمي في البكتيريا .
بروتين
يرتبط بروتين CRP بأحادي فوسفات الأدينوزين الحلقي (cAMP)، مما يُحدث تغييرًا في بنيته يسمح له بالارتباط بإحكام بموقع محدد على الحمض النووي في محفزات الجينات التي يتحكم بها. [ 1 ] [ 2 ] ثم يُنشط CRP عملية النسخ من خلال تفاعلات مباشرة بين البروتينات مع بوليميراز الحمض النووي الريبي . [ 1 ] [ 2 ]
تشارك الجينات التي ينظمها البروتين التفاعلي C (CRP) في الغالب في استقلاب الطاقة، مثل الجلاكتوز والسترات ونظام نقل مجموعة PEP . [ 3 ] [ 4 ] في بكتيريا الإشريكية القولونية ، يستطيع البروتين التفاعلي C تنظيم نسخ أكثر من 100 جين. [ 5 ]
تتمثل الإشارة لتنشيط البروتين التفاعلي C (CRP) في ارتباط الأدينوسين أحادي الفوسفات الحلقي (cAMP). يؤدي ارتباط cAMP بالبروتين التفاعلي C إلى نقل إشارة بعيدة المدى من نطاق ارتباط cAMP الطرفي N إلى النطاق الطرفي C للبروتين، وهو المسؤول عن التفاعل مع تسلسلات محددة من الحمض النووي DNA. [ 6 ]
في المحفزات المعتمدة على بروتين CRP من "الفئة الأولى"، يرتبط بروتين CRP بموقع على الحمض النووي يقع في اتجاه التيار من عناصر المحفز الأساسية، وينشط عملية النسخ من خلال تفاعلات بروتين-بروتين بين "المنطقة المنشطة 1" لبروتين CRP والنطاق الطرفي الكربوكسيلي للوحدة الفرعية ألفا من بوليميراز الحمض النووي الريبي . [ 1 ] [ 2 ] [ 7 ] في المحفزات المعتمدة على بروتين CRP من "الفئة الثانية"، يرتبط بروتين CRP بموقع على الحمض النووي يتداخل مع عنصر المحفز -35، وينشط عملية النسخ من خلال مجموعتين من تفاعلات بروتين-بروتين: (1) تفاعل بين "المنطقة المنشطة 1" لبروتين CRP والنطاق الطرفي الكربوكسيلي للوحدة الفرعية ألفا من بوليميراز الحمض النووي الريبي، و(2) تفاعل بين "المنطقة المنشطة 2" لبروتين CRP والنطاق الطرفي الأميني للوحدة الفرعية ألفا من بوليميراز الحمض النووي الريبي. [ 1 ] [ 2 ] في المحفزات المعتمدة على بروتين CRP من "الفئة الثالثة"، يعمل بروتين CRP مع بروتين واحد أو أكثر من البروتينات " المنشطة المساعدة ". [ 1 ] [ 2 ]
في معظم المحفزات المعتمدة على البروتين التفاعلي C، يقوم البروتين التفاعلي C بتنشيط النسخ بشكل أساسي أو حصري من خلال آلية "التجنيد"، حيث تساعد التفاعلات بين البروتين التفاعلي C وإنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي على ارتباط إنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي بالمحفز. [ 1 ]
مراجع
- 1 2 3 4 5 6 Busby S., Ebright RH. (1999). "تنشيط النسخ بواسطة بروتين منشط الهدم (CAP)". مجلة البيولوجيا الجزيئية 293 (2): 199-213 . doi : 10.1006/jmbi.1999.3161 . PMID 10550204 .
- 1 2 3 4 5 لوسون سي إل، سويجون دي، موراكامي كيه إس، دارست إس إيه، بيرمان إتش إم، إبرايت آر إتش (2004). "بروتين منشط الهدم: ارتباط الحمض النووي وتنشيط النسخ" . الرأي الحالي في البيولوجيا الهيكلية . 14 (1): 10-20 . doi : 10.1016/j.sbi.2004.01.012 . PMC 2765107. PMID 15102444 .
- ^ ويكرت إم جي، أدهيا إس (1993). "منظم الجالاكتوز في الإشريكية القولونية" . مول. ميكروبيول . 10 (2): 245–51 . دوى : 10.1111/j.1365-2958.1993.tb01950.x . بميد 7934815 . S2CID 6872903 .
- ↑ بوت م (1997). " استقلاب السترات اللاهوائي وتنظيمه في البكتيريا المعوية". أرشيف علم الأحياء الدقيقة . 167 ( 2-3 ): 78-88 . doi : 10.1007/s002030050419 . PMID 9133329. S2CID 22913073 .
- ↑ فيك، إي.؛ بوناريك، ب.؛ غوريكي، أ.؛ كيدراكا-كروك، س.؛ ميكولاجاك، ج.؛ بوليت، أ.؛ توورزيدلو، م.؛ دزيدزيكا-واسيلفسكا، م.؛ واسيلفسكي، ز. (25-11-2008). "بروتين مستقبل cAMP من الإشريكية القولونية كنموذج لنقل الإشارة في البروتينات - مراجعة" . مجلة علم الأحياء الدقيقة الجزيئي والتكنولوجيا الحيوية . 17 (1): 1-11 . doi : 10.1159/000178014 . ISSN 1464-1801 .
- ↑ بوبوفيتش، ن.؛ تزينغ، س. -ر.؛ تونيللي، م.؛ إبرايت، ر.هـ.؛ كالوديموس، س.ج. (2009). " الأساس البنيوي للتحكم التآزري بوساطة cAMP لبروتين منشط الهدم" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 106 (17): 6927-6932 . doi : 10.1073/pnas.0900595106 . PMC 2678429. PMID 19359484 .
- ↑ هدسون، بي بي؛ كويسب، جيه؛ لارا-غونزاليس، إس؛ كيم، واي؛ بيرمان، إتش إم؛ أرنولد، إي؛ إبرايت، آر إتش؛ لوسون، سي إل (2009). "بنية ثلاثية الأبعاد بالمجهر الإلكتروني لمركب بدء النسخ المعتمد على المنشط" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 106 (47): 19830-19835 . doi : 10.1073/pnas.0908782106 . PMC 2775702. PMID 19903881 .
- البروتينات البكتيرية
