عائلة الفيروسات الهالسبي
عائلة الفيروسات الهالسبيفيريداي هي عائلة من الفيروسات تتكون من جنس واحد، هو سالتربروفيروس ، والذي يضم نوعًا واحدًا معروفًا؛ وهو فيروس هالوفيروس هيس1 (His1، سالتربروفيروس أسترالينس ). عُزل هذا الفيروس من مياه شديدة الملوحة في أستراليا، وتمت زراعته على العتائق المحبة للملوحة هالواركولا هيسبانيكا . ومثل العديد من الفيروسات العتائقية الأخرى، يمتلك فيروس هيس1 جسيمًا فيروسيًا يشبه الليمون تقريبًا. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]
أصل الكلمة
يُشتق اسم العائلة، Halspiviridae ، من كلمتي "محبة للملوحة " و "مغزلية الشكل"، في إشارة إلى الموطن وشكل الفيروس، على التوالي. أما اسم الجنس، Salterprovirus ، فيُشتق من "فيروس البروتين الطرفي المالح " ، حيث يحتوي جينوم الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ثنائي السلسلة الخطي على بروتينات مرتبطة بنهاياته 5′ . [ 1 ]
التصنيف
يتميز الفيروس ببنية مغزلية الشكل، وهو مشابه في شكله للفيروسات التي تصيب العتائق المحبة للحرارة، عائلة Fuselloviridae ، وقد وُصف His1 في البداية بأنه عضو محتمل في هذه المجموعة. [ 1 ] ومع ذلك، تبين لاحقًا عدم وجود علاقة جينية بينهما، وأن استراتيجيات تكاثرهما مختلفة تمامًا، ولذلك صُنِّف His1 ضمن مجموعة جديدة، جنس Salterprovirus، ضمن عائلة Halspiviridae . [ 5 ] لم تُصنَّف عائلة Halspiviridae ضمن أي تصنيفات أعلى رتبة. [ 6 ]
تشير تسلسلات الحمض النووي البيئي المستخرجة من أحواض الملح في ناميب إلى وجود أقارب بعيدة غير معروفة حاليًا لـ His1. [ 7 ]
كان يُعتقد في الأصل أن نوعًا آخر من الفيروسات، يُسمى الآن Gammapleolipovirus His2 (يُشار إليه فيما يلي باسم "His2")، مرتبط بـ His1، [ 2 ] [ 3 ] ولكن التحليل اللاحق لفيروس His2 كشف أن هذا النوع ينتمي في الواقع إلى عائلة Pleolipoviridae . [ 8 ]
بناء
الفيروس مُغلّف، وله شكل ليموني أو مغزلي. جينومه خطي، ويبلغ طوله حوالي 14.5 كيلوبايت. يحتوي الجينوم على 35 إطار قراءة مفتوح. [ 3 ] تظهر على يمين هذه الصفحة صورة مجهرية إلكترونية (EM) مصبوغة سلبًا لفيروسات His1. يوجد بعض التباين في طول الجسيمات (كما في المثال الظاهر على يسار المنتصف)، لكن معظمها يُظهر الغلاف البروتيني الليموني النموذجي مع ذيل قصير. نُشرت صور مجهرية عالية الدقة وإعادة بناء بتقنية المجهر الإلكتروني فائق البرودة (cryoEM) بواسطة هونغ وآخرون (2015)، [ 9 ] الذين ذكروا أبعادًا متوسطة تبلغ 92 × 40 نانومتر مع ذيل طوله 12 نانومتر.
| بناء | كابسيد | الترتيب الجينومي | التجزئة الجينومية |
|---|---|---|---|
| ليمونيفورم | بروتين | خطي | أحادي الجزء |
دورة التكرار
يتكاثر الفيروس في السيتوبلازم. ويدخل إلى الخلية المضيفة عن طريق التصاق الفيروس بها. وقد حدد بيتيلا وآخرون (2013) تجريبيًا ثابت معدل امتصاص His1 بقيمة 1.9 × 10⁻¹² مل/دقيقة . [ 10 ] وتُعد عملية النسخ المعتمدة على قالب الحمض النووي هي طريقة النسخ. وقد يكون فطر Haloarcula hispanica مضيفًا. وينتقل الفيروس عبر الانتشار السلبي. [ 3 ]
| تفاصيل المضيف | التوجه النسيجي | تفاصيل الدخول | تفاصيل الإصدار | موقع النسخ | موقع التجميع | الانتقال |
|---|---|---|---|---|---|---|
| العتائق: هالواركولا هيسبانيكا | لا أحد | حقن | ليتيك | السيتوبلازم | السيتوبلازم | الانتشار السلبي |
الجينوم
يتكون جينوم His1 الخطي ذو الحمض النووي المزدوج من 14464 زوجًا من القواعد النيتروجينية، ويحتوي على تسلسلات تكرارية طرفية معكوسة غير كاملة بطول 105 أزواج من القواعد النيتروجينية، ويُعتقد أنه يحمل 35 جينًا مُشفِّرًا للبروتينات، بما في ذلك جين يُحدد بوليميراز الحمض النووي المُحفَّز بالبروتين (من عائلة B). وترتبط نهايات الجينوم ببروتين. [ 2 ]
مراجع
- 1 2 3 باث سي، ديال سميث إم إل (نوفمبر 1998). "His1، فيروس أثري من فصيلة Fuselloviridae التي تصيب هالواركولا هيسبانيكا" . مجلة علم الفيروسات . 72 (11): 9392– 5. دوى : 10.1128/JVI.72.11.9392-9395.1998 . بمك 110367 . بميد 9765495 .
- 1 2 3 باث سي، كوكالاك تي، بورتر كيه، ديال-سميث إم إل (يونيو 2006). "فيروسا His1 وHis2 فيروسان هالوفيروسيان مغزليان الشكل، تربطهما صلة قرابة بعيدة، وينتميان إلى مجموعة الفيروسات الجديدة، سالتربروفيروس". علم الفيروسات . 350 (1): 228-39 . doi : 10.1016/j.virol.2006.02.005 . PMID 16530800 .
- 1 2 3 4 "المنطقة الفيروسية" . ExPASy . تم الاطلاع عليه بتاريخ 15 يونيو 2015 .
- ↑ "تصنيف الفيروسات: إصدار 2024" . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 مارس 2025 .
- ↑ أدريانسنز إي إم، سوليفان إم بي، كنيزيفيتش بي، فان زيل إل جيه، ساركار بي إل، دوتيل بي إي، وآخرون . (مايو 2020). "تصنيف الفيروسات بدائية النواة: تحديث 2018-2019 من اللجنة الفرعية للفيروسات البكتيرية والأثرية التابعة للجنة الدولية لتصنيف الفيروسات" . أرشيف علم الفيروسات . 165 (5): 1253-1260 . doi : 10.1007/s00705-020-04577-8 . hdl : 2381/43909 . PMID 32162068 .
- ↑ "تاريخ التصنيف: العائلة: Halspiviridae (إصدار 2024، MSL #40)" . اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 مارس 2025 .
- ^ Adriaenssens EM، van Zyl LJ، Cowan DA، Trindade MI (يناير 2016). "Metaviromics of Namib Desert Salt Pans: سلالة جديدة من فيروسات الملح الملحية ومصدر غني لفيروسات ssDNA" . الفيروسات . 8 (1): 14. دوى : 10.3390/v8010014 . بمك 4728574 . بميد 26761024 .
- ^ بامفورد دي إتش، بيتيلا إم كيه، روين إي، أتاناسوفا إن إس، دينستبير أ، أوكسانين إتش إم (ديسمبر 2017). "ملف تصنيف فيروسات ICTV: Pleolipoviridae" . مجلة علم الفيروسات العامة . 98 (12): 2916–2917 . دوى : 10.1099/jgv.0.000972 . بمك 5882103 . بميد 29125455 .
- ↑ هونغ سي، بيتيلا إم كيه، فو سي جيه، شميد إم إف، بامفورد دي إتش، تشيو دبليو (فبراير 2015). "فيروس His1 الأثري ذو الهالة الليمونية الشكل بذيل موحد ولكن ببنية غلاف متغيرة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 112 (8): 2449-54 . Bibcode : 2015PNAS..112.2449H . doi : 10.1073 / pnas.1425008112 . PMC 4345568. PMID 25675521 .
- ↑ بييتيلا إم كيه، أتاناسوفا إن إس، أوكسانين إتش إم، بامفورد دي إتش (يونيو 2013). "بروتين الغلاف المُعدَّل يُشكِّل الفيروس المرن المغزلي الشكل لفيروس هيس1 من عائلة هالواركيا". علم الأحياء الدقيقة البيئية . 15 (6): 1674-1686 . Bibcode : 2013EnvMi..15.1674P . doi : 10.1111/1462-2920.12030 . PMID 23163639 .
روابط خارجية
- فيروسات الحمض النووي المزدوج السلسلة
- أجناس الفيروسات
- عائلات الفيروسات
