النمط الظاهري الجزيئي

📅 آخر تحديث: ١ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ١ أغسطس ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

يصف النمط الظاهري الجزيئي تقنية قياس كمية جينات الإبلاغ عن المسارات، أي الجينات المختارة مسبقًا والتي يتم تعديلها بشكل خاص بواسطة مسارات التمثيل الغذائي والإشارات الخلوية ، وذلك لاستنتاج نشاط هذه المسارات. [ 1 ] [ 2 ]

في معظم الحالات، يُستخدم التنميط الجزيئي لتحديد التغيرات في التعبير الجيني للمسارات الخلوية ، وذلك لتوصيف تعديل أنشطة هذه المسارات الناتج عن عوامل خارجية، مثل العوامل العلاجية أو الإجهاد، في نظام خلوي خارج الجسم الحي . في مثل هذه الحالات، غالبًا ما تكون القياسات في المراحل المبكرة أكثر فائدة من الملاحظات اللاحقة، لأنها ترصد الاستجابة الأولية للنظام الخلوي للعامل الخارجي. [ 3 ] وبدمج هذه القياسات مع التغيرات الكمية في النمط الظاهري الناتجة عن العامل الخارجي، يُمكن للتنميط الجزيئي تحديد المسارات التي تُساهم في هذه التغيرات.

تستخدم تقنيات التنميط الجزيئي حاليًا تسلسل الحمض النووي الريبوزي (RNA) وتعبير الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) لاستنتاج أنشطة المسارات. ويمكن أيضًا استخدام تقنيات وقراءات أخرى مثل قياس الطيف الكتلي ووفرة البروتين أو مستويات الفسفرة . [ 4 ]

التطبيق في اكتشاف الأدوية المبكر

تشير البيانات الحالية إلى أن التنميط الجزيئي، من خلال قياس التعبير الجيني للجينات المُبلِّغة في المسارات الجزيئية ، قادر على تجميع المركبات بناءً على خصائص هذه المسارات، وتحليل الارتباطات بين أنشطة هذه المسارات والأنماط الظاهرية للأمراض في آنٍ واحد. [ 5 ] علاوة على ذلك، يُمكن تطبيق التنميط الجزيئي على المركبات ذات نطاق واسع من خصائص الارتباط، كما أنه قادر على فرز النتائج الإيجابية الكاذبة الناتجة عن فحوصات الفحص عالية المحتوى . إضافةً إلى ذلك، يُتيح التنميط الجزيئي دمج البيانات المُستمدة من النماذج المختبرية والحيوية، فضلًا عن بيانات المرضى، في عملية اكتشاف الأدوية.

مراجع

  1. ↑ تشانغ، جيه دي؛ كونغ، إي؛ بوس، إف؛ سيرتا، يو؛ إيبيلينغ، إم (24 أبريل 2015). " جينات الإبلاغ عن المسار تحدد الأنماط الظاهرية الجزيئية للخلايا البشرية" . بي إم سي جينوميكس . 16 (1): 342. doi : 10.1186/s12864-015-1532-2 . PMC 4415216. PMID 25903797 .  
  2. ↑ تشانغ، جيه دي؛ شيندلر، تي؛ كونغ، إي؛ إيبيلينغ، إم؛ سيرتا، يو (5 يوليو 2014). " قياس كمي عالي الحساسية للنسخ الجينية باستخدام تقنية التسلسل شبه الموصل" . بي إم سي جينوميكس . 15 (1): 565. doi : 10.1186/1471-2164-15-565 . PMC 4101174. PMID 24997760 .  
  3. ↑ تشانغ، جيه دي؛ بيرنتينيس، إن؛ روث، إيه؛ إيبيلينغ، إم (يونيو 2014). "يكشف التنقيب في البيانات عن شبكة من جينات الاستجابة المبكرة كبصمة توافقية للسمية الدوائية في المختبر وفي الجسم الحي" . مجلة علم الصيدلة الجينية . 14 (3): 208-216 . doi : 10.1038/tpj.2013.39 . PMC 4034126. PMID 24217556 .  
  4. ↑ موفات، ج. ج. (18 مايو 2017). "إضاءة صندوق الغموض في اكتشاف الأدوية الظاهرية" . بيولوجيا الخلية الكيميائية . 24 (5): 545-547 . doi : 10.1016/j.chembiol.2017.05.005 . PMID 28525769 . 
  5. ↑ دراونيل، إف إم؛ تشانغ، جيه دي؛ كونغ، إي؛ أوياما، إن؛ بن منصور، إف؛ أراوجو ديل روزاريو، إيه؛ جنسن زوفمان، إس؛ ديلوبيل، إف؛ برومر، إم؛ ويبيل، إف؛ كارلسون، سي؛ أنسون، بي؛ إياكون، آر؛ سيرتا، يو؛ سينغر، تي؛ إيبيلينغ، إم؛ برونوتو، إم (18 مايو 2017). "النمط الظاهري الجزيئي يجمع بين المعلومات الجزيئية والأهمية البيولوجية وبيانات المرضى لتحسين إنتاجية اكتشاف الأدوية المبكر" . بيولوجيا الخلية الكيميائية . 24 (5): 624-634.e3. doi : 10.1016/j.chembiol.2017.03.016 . PMID 28434878 .