اتحاد علم الجينوم البنيوي لمرض السل

📅 آخر تحديث: ٤ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٤ أغسطس ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

يُعدّ اتحاد علم الجينوم البنيوي لمرض السل (TBSGC) اتحادًا عالميًا للعلماء، يعمل على تطوير أساس لتشخيص وعلاج مرض السل من خلال تحديد البنى ثلاثية الأبعاد للبروتينات المستخلصة من بكتيريا السل ( M. tuberculosis). تأسس الاتحاد عام 2000 كجزء من مبادرة بنية البروتين . [ 1 ] [ 2 ] ويسعى الاتحاد إلى تحديد بنى البروتينات التي تحظى باهتمام كبير من مجتمع علم الأحياء المتخصص في مرض السل. [ 3 ] ومن أهم أهداف الاتحاد تحديد وظيفة افتراضية لكل إطار قراءة مفتوح (ORF) في جينوم السل .

أنشطة

اعتبارًا من يونيو 2006، تم تحديد 82 بنية بروتينية لمرض السل، 15 منها منذ 1 يناير 2006. ويمكن لقاعدة البيانات التي تم إنشاؤها باستخدام هذه المعلومات، والتي تتضمن معلومات هيكلية ووظيفية مترابطة ، أن تشكل أساسًا دائمًا لفهم مسببات مرض السل ولتصميم الأدوية القائم على البنية.

اعتبارًا من يونيو 2006، يتألف اتحاد علم الجينوم البنيوي لمرض السل من 430 عضوًا نشطًا في 148 مختبرًا من 83 مؤسسة في 15 دولة. [ 3 ] وتُعدّ مختبرات الاتحاد مسؤولة مجتمعةً عن 3.3% من جميع هياكل البروتينات في بنك بيانات البروتينات ، ولديها سجلات واسعة النطاق لتطوير المناهج. وقد نفّذ أعضاء الاتحاد مشروعًا تجريبيًا حول علم الجينوم البنيوي لكائن حيّ محبّ للحرارة الشديدة ، حدّد من خلاله معوقات في عملية تحديد البنية، وأسفر عن تطوير منهجيات لتحديد البنية وتحليلها بكفاءة عالية. يمتلك الاتحاد خمسة مرافق أساسية (تقع في مختبر لورانس ليفرمور الوطني ، ومختبر لوس ألاموس الوطني ، ومختبر لورانس بيركلي الوطني ، وجامعة كاليفورنيا في لوس أنجلوس، وجامعة تكساس إيه آند إم ) تُنفّذ نسبة متزايدة من المهام الروتينية، مثل إنتاج البروتينات، والتبلور، وجمع بيانات الأشعة السينية. يُحسّن أعضاء التحالف إنتاجيتهم من خلال إرسال المواد إلى هذه المرافق، واستلام المنتجات أو البيانات الناتجة، وإبلاغ قاعدة البيانات بهذا النشاط. وهذا يُساعد على تقليل الجهود المُكرّرة في البحث عن الأهداف. هذه المعلومات الهيكلية والوظيفية مُتاحة للعموم.

توفر المرافق الأساسية الخمسة المتاحة لأعضاء الاتحاد خدمات استنساخ البروتينات، والتعبير عنها، وتنقيها، بالإضافة إلى بلورتها وتحليل حيودها وبياناتها. [ 4 ] علاوة على ذلك، تم تطوير قاعدة بيانات لتسجيل جميع الأنشطة التي تُجرى داخل الاتحاد. كما تتتبع هذه القاعدة حركة المواد بين الأعضاء، وتتيح تسجيل الحالة اللحظية وإتاحتها لجميع الأعضاء الآخرين.

مراجع

  1. ↑ غرابوفسكي، ماريك؛ نيدزيالكوفسكا، إيفا؛ زيمرمان، ماثيو د.؛ مينور، فلاديك (2016-03-01). "أثر علم الجينوم البنيوي: أول خمسين عامًا" . مجلة علم الجينوم البنيوي والوظيفي . 17 (1): 1-16 . doi : 10.1007/s10969-016-9201-5 . ISSN 1570-0267 . PMC 4834271. PMID 26935210 .   
  2. ↑ تيرويليجر، ت. س؛ بارك، م. س؛ والدو، ج. س؛ بيريندزن، ج؛ هونغ، ل. -و؛ كيم، س. -ي؛ سميث، س. ف؛ ساكيتيني، ج. س؛ بيلينزوني، م؛ بوسي، ر؛ دي روسي، إ (1 أغسطس/آب 2003). "اتحاد علم الجينوم البنيوي لمرض السل: مورد لعلم أحياء المتفطرة السلية" . السل . 83 (4): 223-249 . doi : 10.1016/S1472-9792(03)00051-9 . ISSN 1472-9792 . PMID 12906835 .  
  3. 1 2 تشيم، نيكولاس؛ هابيل، جيف إي.؛ جونستون، جودي إم.؛ كريجر، إينا؛ ميالاو، ليندا؛ سانكارانارايانان، راماسامي؛ مورس، روبرت ب.؛ برونينغ، جون؛ سوانسون، ستيفاني؛ كيم، هايلي؛ كيم، تشانغ يوب (مارس 2011). " اتحاد علم الجينوم البنيوي لمرض السل: عقد من التقدم" . السل (إدنبرة، اسكتلندا) . 91 (2): 155-172 . doi : 10.1016/j.tube.2010.11.009 . ISSN 1873-281X . PMC 3310434. PMID 21247804 .   
  4. ↑ روب، ب.؛ سيجلكه، ب.و.؛ كروبكا، هـ.إ.؛ ليكين، ت.؛ شيفر، ج.؛ زيملا، أ.؛ توباني، د.؛ سنيل، ج.؛ إرنست، ت. (26-09-2002). "مرفق التبلور التابع لاتحاد علم الجينوم البنيوي لمرض السل: نحو الأتمتة من البروتين إلى كثافة الإلكترون" . مجلة أكتا كريستالوغرافيكا، القسم د: علم البلورات البيولوجية . 58 (10): 1514-1518 . رمز Bibcode : 2002AcCrD..58.1514R . doi : 10.1107/s0907444902014282 . PMID 12351851. تاريخ الاسترجاع: 05-03-2022 .