ثقب الأوكسيانيون

📅 آخر تحديث: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٣ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 1 صور
الموسوعة الحرة
يعمل ثقب الأوكسي أنيون لبروتياز السيرين (الأسود) على تثبيت تراكم الشحنة السالبة على الحالة الانتقالية للركيزة (الأحمر) باستخدام روابط الهيدروجين من أميدات العمود الفقري للإنزيم (الأزرق).

يُعدّ تجويف الأوكسي أنيون جيبًا في الموقع النشط للإنزيم ، يعمل على تثبيت الشحنة السالبة لحالة الانتقال على ذرة أكسجين منزوعة البروتون أو ألكوكسيد . [ 1 ] يتكون هذا الجيب عادةً من أميدات السلسلة الرئيسية أو بقايا مشحونة إيجابيًا. يُقلل تثبيت حالة الانتقال من طاقة التنشيط اللازمة للتفاعل، وبالتالي يُعزز عملية التحفيز . [ 2 ] على سبيل المثال، تحتوي البروتيازات ، مثل الكيموتريبسين، على تجويف أوكسي أنيون لتثبيت الأنيون الوسيط رباعي السطوح المتكون أثناء التحلل البروتيني، وحماية ذرة الأكسجين سالبة الشحنة في الركيزة من جزيئات الماء . [ 3 ] بالإضافة إلى ذلك، قد يسمح هذا التجويف بإدخال أو تحديد موضع الركيزة، التي قد تُعاني من إعاقة فراغية إذا لم تتمكن من شغل التجويف (مثل BPG في الهيموجلوبين ). يمكن أن تحتوي الإنزيمات التي تُحفز التفاعلات متعددة الخطوات على عدة تجاويف أوكسي أنيون تُثبت حالات انتقالية مختلفة في التفاعل. [ 4 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ^ سترير إل، بيرج جي إم، تيموشكو جي إل (2002). "9 استراتيجيات تحفيزية" . الكيمياء الحيوية (  الطبعة الخامسة). سان فرانسيسكو: دبليو إتش فريمان. رقم ISBN 978-0-7167-4955-4تمت أرشفة هذا النص من المصدر الأصلي في 10 ديسمبر 2010.
  2. ↑ سيمون، لويس؛ غودمان، جوناثان م. (19 مارس 2010). "التحفيز الإنزيمي بواسطة الروابط الهيدروجينية: التوازن بين ارتباط الحالة الانتقالية وارتباط الركيزة في ثقوب الأوكسي أنيون". مجلة الكيمياء العضوية . 75 (6): 1831-1840 . doi : 10.1021/jo901503d . ISSN 0022-3263 . PMID 20039621 .  
  3. ↑ مينارد، روبرت؛ ستورر، أندرو سي. (1992). "تفاعلات ثقب الأوكسي أنيون في بروتيازات السيرين والسيستين". الكيمياء الحيوية هوب-سيلر . 373 (2): 393-400 . doi : 10.1515/bchm3.1992.373.2.393 . PMID 1387535 . 
  4. ↑ كورسولا، بيتري؛ أوجالا، جوها؛ لامبير، آن ماري؛ ويرنغا، ريك ك. (1 ديسمبر 2002). "الدورة التحفيزية لإنزيم الثيولاز الحيوي: رحلة بنيوية لمجموعة أسيتيل عبر أربعة أنماط ارتباط وثقبين للأوكسي أنيون‡". الكيمياء الحيوية . 41 (52): 15543-15556 . doi : 10.1021/bi0266232 . ISSN 0006-2960 . PMID 12501183 .