بروتوبيديا

📅 آخر تحديث: ٢٧ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٧ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

بروتوبيديا هي موسوعة ثلاثية الأبعاد على شكل ويكي ، تضم معلومات عن البروتينات والجزيئات الأخرى . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]

موقع إلكتروني

يحتوي الموقع على صفحة لكل مدخلات بنك بيانات البروتين (PDB)، بالإضافة إلى صفحات أخرى تُقدم وصفًا أكثر تفصيلًا لبنية البروتينات بشكل عام، مثل أستيل كولين إستراز [ 5 ] ، والهيموجلوبين [ 6 ] ، والنظام الضوئي الثاني [ 7 ]، مع عرض Jmol يُبرز المواقع الوظيفية والروابط . ويستخدم الموقع أداةً لإنشاء المشاهد، مما يُغني المستخدمين عن تعلم لغة برمجة JSmol لإنشاء مشاهد جزيئية مُخصصة. ويمكن ربط المشاهد المُخصصة بسهولة بـ "روابط خضراء" في نص وصفي، لعرض تلك المشاهد في JSmol. كل ما يلزم للوصول إلى الموقع ومعلومات ثلاثية الأبعاد هو متصفح ويب؛ ولا يتطلب الأمر تثبيت أي برامج عرض.

فاز موقع Proteopedia بجائزة أفضل موقع إلكتروني لعام 2010 من مجلة The Scientist . [ 8 ]

شروط الترخيص

جميع المحتويات التي يضيفها المستخدمون مجانية وتخضع لرخصة جنو للوثائق الحرة . يتم استضافة بروتوبيديا في مركز البروتينات البنيوية الإسرائيلي [ 9 ] التابع لمعهد وايزمان للعلوم .

مراجع

  1. ↑ هوديس إي، بريلوسكي جيه، مارتز إي، سيلمان آي، مولت جيه، سوسمان جيه إل (2008). "بروتوبيديا - موسوعة علمية تربط بين البنية ثلاثية الأبعاد ووظيفة الجزيئات الحيوية الكبيرة" . علم الأحياء الجينومي . 9 (8): R121. doi : 10.1186/gb-2008-9-8-r121 . PMC 2575511. PMID 18673581 .  
  2. ↑ مارتز إي (2009). "Proteopedia.Org: موسوعة علمية تربط بين البنية ثلاثية الأبعاد ووظيفة الجزيئات الحيوية الكبيرة" . Biopolymers . 92 (1): 76–7 . doi : 10.1002/bip.21126 . PMID 19117028 . 
  3. ↑ هوديس إي، بريلوسكي جيه، سوسمان جيه إل (2010). "بروتوبيديا: مورد ويب ثلاثي الأبعاد افتراضي تعاوني لبنية ووظيفة البروتينات والجزيئات الحيوية". تعليم الكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية . 38 (5): 341-342 . doi : 10.1002/bmb.20431 . PMID 21567857 . 
  4. ↑ بريلوسكي، ج؛ هوديس، إ؛ كانر، د؛ ديكاتور، و.أ؛ أوبرهولسر، ك؛ مارتز، إ؛ بيرشانسكي، أ؛ هاريل، م؛ سوسمان، ج.ل (أغسطس 2011). "بروتوبيديا: تقرير حالة عن الموسوعة الإلكترونية التعاونية ثلاثية الأبعاد للبروتينات والجزيئات الحيوية الأخرى". مجلة البيولوجيا التركيبية . 175 (2): 244-252 . doi : 10.1016/j.jsb.2011.04.011 . PMID 21536137 . 
  5. ↑ "أستيل كولين إستراز" . بروتيوبيديا.
  6. ↑ "الهيموجلوبين" . بروتوبيديا.
  7. ↑ "النظام الضوئي الثاني" . بروتيوبيديا.
  8. ↑ لويجي سي (سبتمبر 2010). "جواهر الويب: تقديم الفائزين في النسخة الأولى من جوائز لابيز، جوائزنا لأفضل محتوى وسائط متعددة على الإنترنت من المختبرات: الفائز: بروتوبيديا" . مجلة ساينتست . 24 (9): 47. مؤرشف من الأصل في 12 أبريل 2011. تم الاطلاع عليه في 15 ديسمبر 2010. شيق للغاية. أبقاني أتصفحه وأستمتع به (وأتعلم منه) لفترة طويلة . غني بالمعلومات ومصدر قيّم.
  9. ↑ "مركز إسرائيل لعلم البروتينات الهيكلية" . 12 نوفمبر 2015.