بروتين ربط الحمض النووي أحادي السلسلة
بروتين ربط الحمض النووي أحادي السلسلة ( SSB ) هو بروتين موجود في بكتيريا الإشريكية القولونية ( E. coli ) ، ويرتبط بمناطق أحادية السلسلة من الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين ( DNA ). [ 1 ] يُنتَج الحمض النووي أحادي السلسلة خلال جميع مراحل استقلاب الحمض النووي: التضاعف، وإعادة التركيب، والإصلاح. بالإضافة إلى تثبيت هذا الحمض النووي أحادي السلسلة، ترتبط بروتينات SSB بالعديد من البروتينات المشاركة في هذه العمليات وتُعدِّل وظائفها.
يتكون بروتين SSB النشط في بكتيريا الإشريكية القولونية من أربع وحدات فرعية متطابقة، وزن كل منها 19 كيلو دالتون . يمكن أن يحدث ارتباط الحمض النووي أحادي السلسلة بالرباعي في أنماط مختلفة، حيث يشغل بروتين SSB عددًا مختلفًا من قواعد الحمض النووي اعتمادًا على عدة عوامل، بما في ذلك تركيز الملح. على سبيل المثال، يُفضل نمط الارتباط (SSB) 65 ، حيث يلتف حوالي 65 نيوكليوتيدًا من الحمض النووي حول رباعي بروتين SSB ويتصل بجميع وحداته الفرعية الأربع، عند تركيزات الملح العالية في المختبر . أما عند تركيزات الملح المنخفضة، فيميل نمط الارتباط (SSB) 35 إلى التكوّن، حيث يرتبط حوالي 35 نيوكليوتيدًا بوحدتين فرعيتين فقط من بروتين SSB. ولا يزال هناك حاجة إلى مزيد من الدراسات لتوضيح وظائف أنماط الارتباط المختلفة داخل الكائن الحي .
SSB البكتيري
تُعدّ نطاقات بروتين SSB في البكتيريا مهمة في وظيفتها المتمثلة في الحفاظ على استقلاب الحمض النووي، وتحديدًا تضاعف الحمض النووي وإصلاحه وإعادة تركيبه. [ 2 ] يتكون هذا البروتين من ثلاثة خيوط بيتا إلى صفيحة بيتا سداسية الخيوط لتشكيل ثنائي بروتيني . [ 3 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ شيشماريف د، وانغ ي، ماسون سي إي، سو إكس سي، أوكلي إيه جيه، غراهام ب، وآخرون . (فبراير 2014). "نمط الارتباط داخل الجزيء للنهاية الكربوكسيلية لبروتين ربط الحمض النووي أحادي السلسلة في الإشريكية القولونية، كما تم تحديده بواسطة مطيافية الرنين المغناطيسي النووي" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 42 (4): 2750-2757 . doi : 10.1093/nar/gkt1238 . PMC 3936761. PMID 24288378 .
- ↑ ماير آر آر، لاين بي إس (ديسمبر 1990). "بروتين ربط الحمض النووي أحادي السلسلة في الإشريكية القولونية" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة . 54 (4): 342-380 . doi : 10.1128/MMBR.54.4.342-380.1990 . PMC 372786. PMID 2087220 .
- ↑ راغوناثان إس، ريكارد سي إس، لومان تي إم، واكسمان جي (يونيو 1997). "البنية البلورية لنطاق ارتباط الحمض النووي المتجانس رباعي الوحدات لبروتين ارتباط الحمض النووي أحادي السلسلة في بكتيريا الإشريكية القولونية، والتي تم تحديدها بواسطة حيود الأشعة السينية متعدد الأطوال الموجية على بروتين السيلينوميثيونيل بدقة 2.9 أنغستروم" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 94 (13): 6652-6657 . doi : 10.1073/pnas.94.13.6652 . PMC 21213. PMID 9192620 .
روابط خارجية
- البروتينات المرتبطة بالحمض النووي أحادي السلسلة في رؤوس الموضوعات الطبية (MeSH) التابعة للمكتبة الوطنية الأمريكية للطب
- SSB في PFAM
- عائلات البروتينات
- تضاعف الحمض النووي
- البروتينات
- المواد الرابطة للحمض النووي
- البروتينات الرابطة للحمض النووي
