تيمبل إف. سميث

تيمبل فيريس سميث (مواليد 7 مارس 1939) أستاذ فخري في الهندسة الطبية الحيوية [ 3 ] [ 4 ] ، وهو من طور خوارزمية سميث-واترمان مع مايكل واترمان عام 1981. [ 1 ] تُعدّ خوارزمية سميث-واترمان أساسًا لمقارنات التسلسلات المتعددة، حيث تُحدد الجزء ذو أعلى تشابه محلي في التسلسل، انظر محاذاة التسلسل . تُستخدم هذه الخوارزمية لتحديد أجزاء الحمض النووي DNA و RNA والبروتينات المتشابهة . شغل منصب مدير مركز أبحاث الهندسة الجزيئية الحيوية [ 3 ] في جامعة بوسطن لمدة عشرين عامًا، وهو الآن أستاذ فخري .

تعليم

حصل سميث على درجة البكالوريوس في عام 1963 من قسم الفيزياء بجامعة بوردو ، ثم حصل على درجة الدكتوراه في عام 1969 من قسم الفيزياء بجامعة كولورادو في بولدر . [ 5 ]

البحث والمسار الوظيفي

بعد حصوله على درجة الدكتوراه، أجرى سميث أبحاث ما بعد الدكتوراه من مارس 1969 إلى أغسطس 1971 في قسم الفيزياء الحيوية وعلم الوراثة، كلية الطب بجامعة كولورادو، بولدر.

يركز بحثه على تطبيق مختلف أساليب علوم الحاسوب والرياضيات لاكتشاف الأنماط التركيبية والدلالية في تسلسلات الأحماض النووية والأحماض الأمينية. وقد انصبّ اهتمامه في السنوات الأخيرة على التطور الجزيئي لعائلات البروتينات، مثل بروتينات بيتا ذات التكرارات WD، وبروتينات GTPase المرتبطة بالترجمة، والبروتينات الريبوزومية. [ 6 ] وهو معروف بابتكاره خوارزمية سميث-واترمان . [ 1 ]

شغل سميث المناصب التالية:

  • 1965-1966: مُدرِّس ، سلاح الجو الأمريكي، لوري، دنفر، كولورادو
  • 1971–1984: أستاذ ، قسم الفيزياء، جامعة شمال ميشيغان، ماركيت، ميشيغان
  • 1985-1991: مدير موارد أبحاث الحاسوب في علم الأحياء الجزيئي، معهد دانا فاربر للسرطان، كلية الطب بجامعة هارفارد وكلية هارفارد للصحة العامة
  • 1991-2009: مدير مركز موارد الهندسة الجزيئية الحيوية، جامعة بوسطن
  • 1999–  : منظم مشارك ، يوم اكتشاف التكنولوجيا الحيوية، معهد النهوض الأكاديمي بالشباب، 1999
  • 2000–  : المؤسس المشارك والرئيس التنفيذي للمعلومات ، شركة Modular Genetics, Inc.
  • 2000–  : مدرب هوكي الشباب

منشورات مختارة

  • M. Mariotti, TF Smith, PH Sudmant and G. Goldberger, “Pseudogenization of testis-specific Lfg5 predates human / Neanderthal vethence”, Journal of Human Genetics 59, 288–291 (2014)
  • هايمان هارتمان وتيمبل إف. سميث "تطور الريبوسوم والشفرة الوراثية"، مجلة لايف، 4(2)، 227-249 (2014)
  • هارتمان، إتش وتي إف سميث، "GTPases وأصل الريبوسوم"، بيولوجي دايركت، 5:36-39، (2010)
  • هارتمان، هايمان وسميث، تمبل إف. "تطور الهدب والخلية حقيقية النواة" حركة الخلية والهيكل الخلوي. 66: 215-219. (2009)
  • هو، لان، سميث، تمبل إف. وغولدبيرغر، غابرييل. "LFG: عائلة جينات تنظيمية محتملة للاستماتة". الاستماتة. 14: 1255-1265. (2009)
  • سميث، تمبل إف، لي، جونغ سي، غوتيل، روبن آر، وهارتمان، هايمان. "أصل وتطور الريبوسوم" بيولوجي دايركت 3: 16، 1-13 (2008)
  • سميث، تمبل ف. "الفصل 2: ​​تنوع بروتينات تكرار WD" عائلة بروتينات كورونين، 20-30 (2008)
  • بهوتكار، أرجون ف.، جيلبارت، ويليام م.، وسميث، تمبل ف. (2007). استنتاج علم الوراثة لإعادة ترتيب الجينوم وترتيب الجينات السلفية: دراسة حالة ذبابة الفاكهة. علم الأحياء الجينومي 8، R236
  • بهوتكار، أرجون، روسو، سوزان م.، سميث، تمبل ف. وجيلبارت، ويليام م. "تحليل على نطاق الجينوم للجينات المعاد تحديد موقعها" أبحاث الجينوم 17: 1880-1887 (2007)
  • هارتمان، هايمان، فافاريتو، باولا وسميث، تمبل إف. "الأصول الأثرية لنظام الترجمة حقيقي النواة" أركيا 2: 1-9 (2006)
  • بينكوفسكا، جادويغا، هارتمان، هايمان وسميث، تمبل ف. (2003). طريقة بحث عن نظائر البروتينات الصغيرة، البروتينات الشبيهة باليوبيكويتين في الخلايا بدائية النواة؟ هندسة البروتين 16 (12)، 897-904.
  • فينكاتيسان، كافيتا، ماكمانوس، هيذر ر.، ميلو، كريج س.، سميث، تمبل ف.، وهانسن، أولا. (2003). الحفاظ الوظيفي بين أفراد عائلة عامل النسخ المكرر القديم، LSF/Grainyhead. أبحاث الأحماض النووية 31(15)، 4304-4316.
  • Zhang YX1, Fox JG, Ho Y, Zhang L, Stills HF Jr, Smith TF. مقارنة جين البروتين الرئيسي للغشاء الخارجي (MOMP) لسلالتي التهاب الرئة الفأري (MoPn) والتهاب الرئة الفأري الحاد (SFPD) من الكلاميديا ​​التراخومية مع سلالات أخرى من الكلاميديا. Mol Biol Evol. 1993 نوفمبر؛ 10(6): 1327-42.
  • فيج جيه، سميث تي إف. نمط تسلسل انقسام الخلية. نيتشر 334 (6178)، 109 (14 يوليو 1988) |pmid=3290690 |doi=10.1038/334109a0.

الجوائز والتكريمات

حصل سميث على جائزة العالم الأول من الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي [ 2 ] وانتُخب زميلًا في الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي في عام 2009. [ 7 ]

في عام 2002، تم إدخاله إلى المعهد الأمريكي للهندسة الطبية والبيولوجية (AIMBE) "لمساهماته الاستثنائية في تحديد وتطوير مجال المعلوماتية الحيوية، مع التركيز على أساليب الهندسة الجديدة للتنبؤ ببنية البروتين ووظيفته".

مراجع

  1. سميث، ت.؛ ووترمان ، م.س. (1981). "تحديد التسلسلات الجزيئية الفرعية الشائعة". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 147 (1): 195-197 . CiteSeerX 10.1.1.63.2897 . doi : 10.1016/0022-2836(81)90087-5 . PMID 7265238 .  
  2. 1 2 مايسل، م. (2007). "المؤتمر الدولي لعلم الأحياء الحاسوبي يُكرّم تمبل ف. سميث وإيران سيغال" . مجلة PLOS لعلم الأحياء الحاسوبي . 3 (6): e128. رمز Bibcode : 2007PLSCB...3..128M . doi : 10.1371/journal.pcbi.0030128 . PMC 1904388. PMID 17604447 .  
  3. 1 2 "مركز أبحاث الهندسة الجزيئية الحيوية | جامعة بوسطن" . Bmerc-www.bu.edu . تاريخ الاسترجاع: 24-03-2017 .
  4. "تيمبل سميث" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 7 يوليو 2007. تم الاطلاع عليه بتاريخ 3 مايو 2007 .
  5. سميث، تمبل فيريس (1969). سعات الديوتريوم من نظرية التشتت النووي للجسيمات المركبة ( أطروحة دكتوراه). جامعة كولورادو في بولدر. OCLC 50252533. ProQuest 302393082 .  
  6. "تيمبل ف. سميث، دكتوراه » علم الأحياء الدقيقة » مركز بوسطن الطبي الجامعي" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 4 أبريل 2012. تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 أكتوبر 2011 .  
  7. "زملاء الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي" . iscb.org . الجمعية الدولية لعلم الأحياء الحاسوبي . 2017. مؤرشف من الأصل بتاريخ 20-03-2017.