محاكي الأجسام المضادة

محاكيات الأجسام المضادة هي مركبات عضوية، مثل الأجسام المضادة ، قادرة على الارتباط بالمستضدات بشكل انتقائي ، ولكنها لا ترتبط بها بنيوياً. وهي عادةً ببتيدات أو بروتينات اصطناعية بكتلة مولية تتراوح بين 3 و20 كيلو دالتون . (الأجسام المضادة تبلغ كتلتها المولية حوالي 150 كيلو دالتون).  

تعتبر الأحماض النووية والجزيئات الصغيرة أحيانًا من محاكيات الأجسام المضادة أيضًا، ولكن ليس الأجسام المضادة الاصطناعية، وشظايا الأجسام المضادة ، والبروتينات الاندماجية المكونة من هذه.

تتمثل المزايا الشائعة مقارنةً بالأجسام المضادة في سهولة الذوبان ، واختراق الأنسجة، والثبات تجاه الحرارة والإنزيمات، وانخفاض تكاليف الإنتاج نسبيًا. ويجري تطوير محاكيات الأجسام المضادة كعوامل علاجية وتشخيصية . [ 1 ]

أمثلة

محاكي الأجسام المضادةسقالةالكتلة الموليةمثال على دواء
جزيئات أفيبودي [ 2 ]نطاق Z من البروتين A6 كيلو دالتونABY-025
الأفلينات [ 3 ]كريستالين جاما-ب20 كيلو دالتون
يوبيكويتين10 كيلو دالتونSPVF 2801
أفيمرز [ 4 ] (أدهيرونز)سيستاتين12-14 كيلو دالتون
الأفيتينات [ 5 ]Sac7d (من Sulfolobus acidocaldarius )7 كيلو دالتون
الأجسام ألفا [ 6 ]ملف حلزوني ثلاثي10 كيلو دالتونCMPX-1023
مضادات الكالين [ 7 ]ليبوكالين20 كيلو دالتون
أفيمرز [ 8 ]نطاقات مستقبلات غشائية متنوعة9-18 كيلو دالتون
DARPins [ 9 ]نمط تكرار أنكيرين10-19 كيلو دالتونMP0112
Fynomers [ 10 ]نطاق SH3 لـ Fyn7 كيلو دالتون
الأجسام المعدية [ 11 ]مثبط التربسين من نوع كونيتز في فول الصويا20 كيلو دالتون
ببتيدات نطاق كونيتز [ 12 ]نطاقات كونيتز لمثبطات البروتياز المختلفة6 كيلو دالتونإيكالانتيد (كالبيتور)
الأجسام الأحادية [ 13 ]المجال العاشر من النوع الثالث من الفيبرونيكتين10 كيلو دالتونبيجدينتانيب (أنجيوسيبت)
nanoCLAMPs [ 14 ]وحدة ربط الكربوهيدرات 32-2 (من كلوستريديوم بيرفرينجنز NagH)16 كيلو دالتون
المُحسِّنون [ 15 ]هيكل مرن قائم على الأحماض النووية ؛ رباعي G8-15 كيلو دالتون
Repebodies [ 16 ]تكرارات غنية بالليوسين
Pronectin™[17]fourteenth fibronectin type-III scaffold  of Human Fibronectin (14Fn3)10 kDa
Centyrins[18]highly stable fibronectin type III (FN3) domain10 kDa
Obodies[19]a high affinity binding protein domain engineered to bind to Hen Egg-white Lysozyme

See also

References

  1. Gebauer M, Skerra A (June 2009). "Engineered protein scaffolds as next-generation antibody therapeutics". Curr Opin Chem Biol. 13 (3): 245–255. doi:10.1016/j.cbpa.2009.04.627. PMID 19501012.
  2. Nygren PA (June 2008). "Alternative binding proteins: affibody binding proteins developed from a small three-helix bundle scaffold". FEBS J. 275 (11): 2668–76. doi:10.1111/j.1742-4658.2008.06438.x. PMID 18435759.
  3. Ebersbach H, Fiedler E, Scheuermann T, et al. (September 2007). "Affilin-novel binding molecules based on human gamma-B-crystallin, an all beta-sheet protein". J. Mol. Biol. 372 (1): 172–85. doi:10.1016/j.jmb.2007.06.045. PMID 17628592.
  4. Johnson A, Song Q, Ko Ferrigno P, Bueno PR, Davis JJ (Aug 7, 2012). "Sensitive Affimer and antibody based impedimetric label-free assays for C-reactive protein". Anal. Chem. 84 (15): 6553–60. doi:10.1021/ac300835b. PMID 22789061.
  5. Krehenbrink M, Chami M, Guilvout I, Alzari PM, Pécorari F, Pugsley AP (November 2008). "Artificial binding proteins (Affitins) as probes for conformational changes in secretin PulD". J. Mol. Biol. 383 (5): 1058–68. doi:10.1016/j.jmb.2008.09.016. PMID 18822295.
  6. Desmet J, Verstraete K, Bloch Y, Lorent E, Wen Y, Devreese B, et al. (October 2014). "Structural basis of IL-23 antagonism by an Alphabody protein scaffold". Nature Communications. 5: 5237. doi:10.1038/ncomms6237. PMC 4220489. PMID 25354530.
  7. Skerra A (June 2008). "Alternative binding proteins: anticalins - harnessing the structural plasticity of the lipocalin ligand pocket to engineer novel binding activities". FEBS J. 275 (11): 2677–83. doi:10.1111/j.1742-4658.2008.06439.x. PMID 18435758. S2CID 19992238.
  8. Silverman J, Liu Q, Lu Q, et al. (December 2005). "Multivalent avimer proteins evolved by exon shuffling of a family of human receptor domains". Nat. Biotechnol. 23 (12): 1556–61. doi:10.1038/nbt1166. PMID 16299519. S2CID 84757398.
  9. Stumpp MT, Binz HK, Amstutz P (August 2008). "DARPins: a new generation of protein therapeutics". Drug Discov. Today. 13 (15–16): 695–701. doi:10.1016/j.drudis.2008.04.013. PMID 18621567.
  10. Grabulovski D, Kaspar M, Neri D (February 2007). "A novel, non-immunogenic Fyn SH3-derived binding protein with tumor vascular targeting properties". The Journal of Biological Chemistry. 282 (5): 3196–204. doi:10.1074/jbc.M609211200. PMID 17130124.
  11. Wicke N, Bedford MR, Howarth M (August 2021). "Gastrobodies are engineered antibody mimetics resilient to pepsin and hydrochloric acid". Communications Biology. 4 (1): 960. doi:10.1038/s42003-021-02487-2. PMC 8358037. PMID 34381153.
  12. Nixon AE, Wood CR (March 2006). "Engineered protein inhibitors of proteases". Curr Opin Drug Discov Dev. 9 (2): 261–8. PMID 16566296.
  13. Koide A, Koide S (2007). "Monobodies: antibody mimics based on the scaffold of the fibronectin type III domain". Protein Engineering Protocols. Methods Mol. Biol. Vol. 352. pp. 95–109. doi:10.1385/1-59745-187-8:95. ISBN 978-1-59745-187-1. PMID 17041261.
  14. سودرمان آر جيه، رايس دي إيه، جيبسون إس دي، ستريك إي جيه، تشاو دي إم (17 أبريل 2017). "تطوير محاكيات الأجسام المضادة المستجيبة للبوليول لتنقية البروتين بخطوة واحدة" . التعبير عن البروتين وتنقيته . 134 : 114-124 . doi : 10.1016/j.pep.2017.04.008 . PMID 28428153 . 
  15. "التعرف السريع على مُحسِّنات انتقائية لفيروس SARS-CoV-2 وتطويرها" . مجموعة الأبتامر . 11 ديسمبر 2020. تم الاطلاع عليه بتاريخ 3 أغسطس 2021 .
  16. هانتشل ، أو. (2017-11-20). "الأجسام أحادية النواة كعلاجات بروتينية محتملة من الجيل التالي - منظور" . المجلة الطبية السويسرية الأسبوعية . 147 (4748): w14545. doi : 10.4414/smw.2017.14545 . PMC 7316567. PMID 29185244 .  
  17. "تقنية برونكتين" . بروتيليكا . تم الاسترجاع في 26-09-2021 .
  18. غولدبيرغ إس دي، كاردوسو آر إم، لين تي، سبينكا-دومز تي، كلاين دي، جاكوبس إس إيه، وآخرون . (ديسمبر 2016). "هندسة منصة توصيل موجهة باستخدام السنتيرينات" . هندسة البروتين، التصميم والاختيار . 29 (12): 563-572 . doi : 10.1093/protein/gzw054 . PMID 27737926 .  
  19. تشونيرا في كي (2018). هندسة وتوصيف الأجسام المضادة للبروجسترون (رسالة ماجستير). جامعة وايكاتو.