أنطون يوريف
أنطون يوريف عالم روسي أمريكي . شارك في تأسيس شركة أريادني جينوميكس، التي استحوذت عليها شركة إلسيفير في عام 2011. بعد استحواذ إلسيفير على أريادني، أصبح مدير الخدمات المهنية. [ 1 ]
سيرة
وُلد أنطون يوريف في موسكو ، روسيا عام 1966. وهو ابن ديمتري فورمان ، عالم السياسة وعالم الاجتماع الروسي والخبير في الأديان. [ 2 ]
تعليم
حصل يوريف على درجة البكالوريوس في الفيزياء من معهد موسكو للفيزياء والتكنولوجيا عام 1987. [ 3 ] وحصل على درجة الماجستير في البيولوجيا الجزيئية والكيمياء العضوية الحيوية من معهد شيمياكين-أوفشينيكوف للكيمياء العضوية الحيوية عام 1989. [ 2 ] [ 4 ]
حصل أنطون يوريف على درجة الدكتوراه في علم الأحياء الجزيئي وعلم الوراثة من جامعة جونز هوبكنز في عام 1995. [ 4 ]
ضمت اللجنة الاستشارية لرسالة الدكتوراه الخاصة بيوريف في جامعة جونز هوبكنز العديد من علماء الأحياء الجزيئية البارزين: عالم الوراثة الخميرية جيف بوك والحائز على جائزة نوبل دانيال ناثانز . [ 3 ]
حصل يوريف على درجة الدكتوراه من جامعة جونز هوبكنز لاكتشافه عائلة جديدة من البروتينات التي تتفاعل مع النطاق الطرفي الكربوكسيلي لإنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي II باستخدام فحص التفاعل الثنائي في الخميرة . [ 5 ] يشير تشابه تسلسل هذه البروتينات مع عوامل التضفير إلى وجود ارتباط فيزيائي بين النسخ والتعديل ما بعد النسخي للحمض النووي الريبي الرسول .
واصل أبحاثه كباحث ما بعد الدكتوراه في شركة نوفارتس للأدوية، حيث أثبت إمكانية استيراد بروتين كيناز ARAF من الثدييات إلى الميتوكوندريا . وخلال إتمام مشروع تسلسل الجينوم البشري، بدأ العمل في مجال المعلوماتية الحيوية الناشئ.
في عام ١٩٩٥، كتب عدد من أعضاء هيئة التدريس في جامعة جونز هوبكنز رسائل توصية بشأن عمل أنطون يوريف خلال دراساته العليا. [ ٤ ] وُجّهت هذه الرسائل إلى مشرفه على أبحاث ما بعد الدكتوراه في شركة سيبا-جايجي ، الدكتور وينوجل، وكتبها أعضاء هيئة تدريس من مختلف الرتب، بمن فيهم دانيال ناثانز ، وفيل هايتر ، وجيف كوردن، وجيف بوك، وقدمت تقييمات معاصرة لمساهمات يوريف العلمية وإمكاناته البحثية في مرحلة مبكرة من مسيرته المهنية. [ ٢ ]
حياة مهنية
أثناء عمله في شركة Orchid Biosciences بين عامي 2001 و2003، قام بتأليف العديد من الخوارزميات لتصميم بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) باستخدام النمذجة الإحصائية. [ 1 ] كان أنطون يوريف أحد المالكين الأصليين لشركة Ariadne Genomics Inc، حيث طور أساليب لمعالجة اللغة الطبيعية ، وتحليل المسارات الحاسوبية ، ودرس خصائص الشبكات البيولوجية . [ 5 ] خلال فترة عمله في Ariadne Genomics، تعاون يوريف مع مقصود العالم في تحليل جينومات أشجار المطاط والجوت، بالإضافة إلى جينومات العديد من الكائنات المحبة للظروف القاسية . [ 6 ]
قام يوريف بتحرير العديد من الكتب العلمية والمقالات البحثية. استحوذت دار النشر "إلسيفير" على شركة "أريادني جينوميكس " عام ٢٠١١. بعد الاستحواذ، تولى يوريف منصب مدير الاستشارات والخدمات المهنية في "إلسيفير". [ ٢ ] في هذا المنصب، شارك في تطوير حلول معلوماتية حيوية متخصصة ، مستفيدًا من برامج "إلسيفير" وقواعد معارفها وتقنيات الذكاء الاصطناعي ، لتطبيقات في تطوير الأدوية، والطب الشخصي، وعلم الأحياء الزراعي والتركيبي . [ ٧ ] تشمل أعماله الأخيرة في "إلسيفير" استكشاف استخدام مخططات المعرفة الطبية الحيوية والذكاء الاصطناعي لإعادة توظيف الأدوية، لا سيما للأمراض النادرة وفي علم الأورام الدقيق. [ ٨ ]
بحث
خلال دراسته للدكتوراه، أفاد يوريف بتحديد عائلة من البروتينات التي تربط عملية النسخ بمعالجة الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) بعد النسخ، وذلك باستخدام طريقة فحص التفاعل الثنائي في الخميرة . [ 9 ] وبصفته باحثًا ما بعد الدكتوراه، أثبت فائدة فحص التفاعل الثنائي في الخميرة في تحديد التفاعلات البروتينية الوظيفية والخاصة بنظائر البروتين ، بما في ذلك أدلة على استيراد كيناز A-RAF إلى الميتوكوندريا. [ 10 ]
بعد إتمام مشروع تسلسل الجينوم البشري ، حوّل يوريف تركيزه البحثي نحو المعلوماتية الحيوية وعلم الأحياء الحاسوبي . [ 11 ] وقد طوّر خوارزميات لتصميم بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) [ 12 ] ، وتحليل المسارات البيولوجية [ 13 ] والشبكات ، بالإضافة إلى مناهج معالجة اللغة الطبيعية (NLP) لبناء مخططات المعرفة الطبية الحيوية . ومن خلال دمج المسارات المُعاد بناؤها من مخططات المعرفة الطبية الحيوية مع رسم الخرائط المتماثلة ، ساهم في إعادة بناء أنظمة التمثيل الغذائي والإشارات في العديد من الكائنات الحية التي قام مقصود العالم وزملاؤه بتسلسل جينوماتها. [ 13 ]
في دراسة تعاونية، أثبت يوريف وزملاؤه أن شبكات تفاعل البروتين-بروتين على مستوى الجينوم تحتوي على تردد أعلى بكثير للبروتينات المتفاعلة ذاتيًا (المتجانسات) والبروتينات المتماثلة المتفاعلة مما هو متوقع عشوائيًا. واقترحوا أن هذه الملاحظة تتوافق مع نموذج التضاعف والتباعد للتطور البيولوجي. [ 14 ]
نشر يوريف أكثر من 50 مقالة علمية محكمة، بالإضافة إلى كتب وفصول في كتب أخرى، تغطي مواضيع تشمل تحليل المسارات الحاسوبية، وعوامل النسخ ، وعلم الأحياء الحاسوبي، وأبحاث السرطان الموجهة . [ 15 ] ومن بين منشوراته مقالة بعنوان "البناء التلقائي للمسارات في شبكات الارتباط البيولوجية"، نُشرت في مجلة BMC Bioinformatics عام 2006، والتي استُشهد بها في أبحاث علم الأحياء النظمي وتحليل الشبكات. [ 16 ]
يركز بحثه الحالي على تطوير أساليب إحصائية لإعادة استخدام الأدوية وتوسيع نطاق استخدامها. [ 17 ] يستخدم هذا العمل مخطط المعرفة البيولوجية من إلسيفير لتحديد التطبيقات العلاجية الجديدة المحتملة للأدوية الموجودة. [ 15 ]
منشورات مختارة
المجلات
- يوريف، أنطون (2 يناير 2015). "تحليل التعبير الجيني لعلاج السرطان الموجه" . رأي الخبراء في اكتشاف الأدوية . 10 (1): 91-99 . doi : 10.1517/17460441.2015.971007 . ISSN 1746-0441 . PMID 25306865 .
- يوريف، أنطون (2006). "استهداف عوامل النسخ في تنظيم الخلية" . رأي الخبراء في الأهداف العلاجية . 10 (3): 345-349 . doi : 10.1517/14728222.10.3.345 . ISSN 1472-8222 . PMID 16706674 .
- يوريف، أنطون (1 يوليو 2000). " التوطين الخاص بنظائر A-RAF في الميتوكوندريا" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 20 (13): 4870-4878 . doi : 10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000 . PMC 85938. PMID 10848612 .
- يوريف، أنطون (1 أغسطس 2008). "تحليل المسارات الحاسوبي: الحدود النهائية نحو تصميم دوائي عقلاني تمامًا" . رأي الخبراء في اكتشاف الأدوية . 3 (8): 867-876 . doi : 10.1517/17460441.3.8.867 . ISSN 1746-0441 . PMID 23484964 .
- الرحمن، أحمد يمين عبد؛ أوشاراج ، أبهيلاش أو ؛ ميسرا، بيسوابريا ب؛ ثوتاثيل ، جينسي بي . جاياسيكاران، كانداكومار؛ فنغ، يون؛ هو، شاوبين؛ أونج، سو يان؛ نج، فوي لينغ. لي، لينغ سزي. تان، هوك سيو؛ سكاف، محمد خيرول لقمان محمد؛ تيه، بنج سون؛ خو بي فيونج؛ بادي ، سيتي سورياواتي (2 فبراير 2013). "مشروع تسلسل الجينوم لشجرة المطاط Hevea brasiliensis" . بي إم سي الجينوم . 14 (1): 75. بيب كود : 2013BMCG...14...75R . دوى : 10.1186/1471-2164-14-75 . ردمك 1471-2164 . PMC 3575267 . PMID 23375136 .
- إسلام، محمد شهيدول؛ سايتو، جينيفر أ.؛ امداد، امداد المنان؛ أحمد، برهان؛ إسلام، محمد معينول؛ حليم، عبد؛ حسين، القاضي محمد مصدق؛ حسين، محمد ذاكر؛ أحمد، رسل؛ حسين، محمد صابر؛ كبير، شاه محمد تميم؛ خان، دكتوراه ساروار علم؛ خان، ماريلاند مورسالين؛ حسن، راجني؛ أكتر ، نسيمة (2017-01-30). "علم الجينوم المقارن لنوعين من الجوت ونظرة ثاقبة للتكوين الحيوي للألياف" . نباتات الطبيعة . 3 (2): 16223. بيب كود : 2017NatPl...316223I . دوى : 10.1038/nplants.2016.223 . ISSN 2055-0278 . PMID 28134914 .
- جيمي، إتش دبليو ساو؛ يوريف، أنطون؛ كانبي، ماساومي؛ هو، شاوبين؛ يونغ، آرون جي؛ أيزاوا، شين-إيتشي؛ علم، مقصودول (5 مارس 2012). "التسلسل الجينومي الكامل لسلالة Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus النمطية (QLW-P1DMWA-1T)" . معايير في علوم الجينوم . 6 (1): 84-93 . Bibcode : 2012SGenS...6...84S . doi : 10.4056/sigs.2445005 . ISSN 1944-3277 . PMC 3368406. PMID 22675601 .
- أونغ، سو يان؛ نغ، فوي لينغ؛ سيتي سورياواتي باداي؛ يوريف، أنطون؛ مقصود العالم (2010). "تحليل وبناء مسارات تنظيم جزر الإمراضية في السالمونيلا المعوية نمط مصلي التيفية" . مجلة المعلوماتية الحيوية التكاملية . 7 (1). مكتبة جامعة بيليفيلد، جامعة بيليفيلد، BieColl، Publikationsdienste.Ub@Uni-Bielefeld.De، كلية التكنولوجيا وعلوم الحاسوب التطبيقية: 63-96 . doi : 10.2390/BIECOLL-JIB-2010-145 . PMID 20861532 .
- دانفيلد، بيتر ف؛ يوريف، أنطون؛ سينين، بافيل؛ سميرنوفا، أنجيلا ف؛ ستوت، ماثيو ب؛ هو، شاوبين؛ لي، بينه؛ ساو، جيمي هـ؛ تشو، زيمين؛ رين، يان؛ وانغ، جيانمي؛ علم، مقصودول (2007). "أكسدة الميثان بواسطة بكتيريا شديدة الحموضة من شعبة فيروكوميكروبيا" . مجلة نيتشر . 450 (7171): 879-882 . Bibcode : 2007Natur.450..879D . doi : 10.1038/nature06411 . ISSN 0028-0836 . PMID 18004300 .
الكتب
- يوريف، أنطون؛ داراسيليا، نيكولاي، محرران. (2012). من شبكات المعرفة إلى النماذج البيولوجية . أوك بارك، إلينوي: بنثام إي بوكس. ISBN 978-1-60805-436-7.
- يوريف، أنطون، محرر. (2007). تصميم بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل . طرق في البيولوجيا الجزيئية. توتوا، نيوجيرسي: دار هومانا للنشر. ISBN 978-1-61737-743-3.
- يوريف، أنطون، محرر. (2008). تحليل المسارات لاكتشاف الأدوية: البنية التحتية الحاسوبية والتطبيقات . سلسلة وايلي حول تقنيات صناعة الأدوية. هوبوكين، نيوجيرسي: جون وايلي وأولاده. ISBN 978-0-470-39926-2.
الكتب المحررة
- يوريف، أنطون، محرر (2007). تصميم بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل . طرق في البيولوجيا الجزيئية. المجلد 402. doi : 10.1007/978-1-59745-528-2 . ISBN 978-1-58829-725-9ISSN 1064-3745
- يوريف، أنطون، محرر. (2008). تحليل المسارات لاكتشاف الأدوية: البنية التحتية الحاسوبية والتطبيقات . سلسلة وايلي حول تقنيات صناعة الأدوية. هوبوكين، نيوجيرسي: جون وايلي وأولاده. ISBN 978-0-470-39927-9.
- نيستيروفا، أناستاسيا ب.؛ كليموف، يوجين أ.؛ زاركوفا، ماريا؛ سوزين، سيرجي؛ سوبوليف، فلاديمير؛ شكروب، ماريا؛ يوريف، أنطون، محررون. (2020). مسارات الأمراض: أطلس لمسارات إشارات الأمراض البشرية . كامبريدج، ماساتشوستس: إلسيفير. ISBN 978-0-12-817086-1. OCLC 1057290845 .
- يوريف، أنطون؛ داراسيليا، نيكولاي، محرران. (2012). من شبكات المعرفة إلى النماذج البيولوجية . أوك بارك، إلينوي: بنثام إي بوكس. ISBN 978-1-60805-436-7.
مراجع
- 1 2 "إعادة استخدام الأدوية للأمراض النادرة والسرطان وما وراء ذلك" . www.elsevier.com . تم الاطلاع عليه في 1 مايو 2025 .
- 1 2 3 4 "أنطون يوريف" . تعاونات إلسيفير البحثية . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- يوريف ، أنطون ( 3 يوليو 2017). "عن قرب وبشكل شخصي: كيف يمكن لصناعة علوم الحياة تحسين النتائج من خلال الطب الدقيق" . أخبار ميدسيتي . تم الاطلاع عليه في 1 مايو 2025 .
- 1 2 3 "Anton Yuryev ORCID" . orcid.org . تم الاطلاع عليه في 1 مايو 2025 .
- 1 2 "اكتشف أنطون يوريف بروتينات تربط فعليًا بين نسخ الجينات وmRNA" . مؤتمر الطب الدقيق العالمي (PMWC) . تم الاطلاع عليه في 1 مايو 2025 .
- ^ أونج، سو يان؛ نج، فوي لينغ. باداي, سيتي سورياواتي; يوريف، أنطون؛ علام مقصود (1 مارس 2010). "تحليل وبناء المسارات التنظيمية للجزيرة المسببة للأمراض في السالمونيلا المعوية serovar Typhi" . مجلة المعلوماتية الحيوية التكاملية . 7 (1): 63–96 . دوى : 10.2390/biecoll-jib-2010-145 . ردمك 1613-4516 . بميد 20861532 .
- ^ "أنطون يوريف" . www.elsevier.com .
- ↑ يوريف، د. أنطون (26 أغسطس 2021). "كيف يساعد الطب الدقيق المدعوم بالذكاء الاصطناعي في إيجاد علاجات جديدة لأورام الدماغ لدى الأطفال" . بي إف ميديا .
- ↑ يوريف، أ؛ باتوراجان، م؛ ليتينغتونغ، ي؛ جوشي، ر.ف؛ جنتيلي، س؛ جيبارا، م؛ كوردن، ج.ل (9 يوليو 1996). "يتفاعل النطاق الطرفي الكربوكسيلي لأكبر وحدة فرعية من بوليميراز الحمض النووي الريبي II مع مجموعة جديدة من البروتينات الغنية بالسيرين/الأرجينين" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 93 (14): 6975-6980 . Bibcode : 1996PNAS...93.6975Y . doi : 10.1073/pnas.93.14.6975 . ISSN 0027-8424 . PMC 38919. PMID 8692929 .
- ↑ يوريف، أنطون؛ أونو، ماكوتو؛ جوف، ستيفن أ.؛ ماكالوسو، فرانك؛ وينوجل، لورانس ب. (1 يوليو 2000). " التوطين الخاص بنظائر A-RAF في الميتوكوندريا" . علم الأحياء الجزيئي والخلوي . 20 (13): 4870-4878 . doi : 10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000 . ISSN 1098-5549 . PMC 85938. PMID 10848612 .
- ↑ ساو، جيمي إتش دبليو؛ يوريف، أنطون؛ كانبي، ماساومي؛ هو، شاوبين؛ يونغ، آرون جي؛ أيزاوا، شين-إيتشي؛ علم، مقصودول (19 مارس 2012). "التسلسل الجينومي الكامل وتحليل بكتيريا سابروسبيرا غرانديس سلالة ليوين، وهي بكتيريا بحرية مفترسة" . معايير في علوم الجينوم . 6 (1): 84-93 . Bibcode : 2012SGenS...6...84S . doi : 10.4056/sigs.2445005 . ISSN 1944-3277 . PMC 3368406. PMID 22675601 .
- ↑ يوريف، أنطون، محرر. (2007). تصميم بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل . طرق في البيولوجيا الجزيئية. المجلد 402. doi : 10.1007/978-1-59745-528-2 . ISBN 978-1-58829-725-9ISSN 1064-3745
- يوريف ، أنطون؛ موليوكوف، زوفار؛ كوتيلنيكوفا، إيكاترينا؛ ماسلوف، سيرجي؛ إيغوروف، سيرجي؛ نيكيتين، ألكسندر؛ داراسيليا، نيكولاي؛ مازو، إيليا (24 مارس 2006). " بناء المسارات التلقائي في شبكات الارتباط البيولوجية" . BMC Bioinformatics . 7 (1): 171. doi : 10.1186/1471-2105-7-171 . ISSN 1471-2105 . PMC 1435941. PMID 16563163 .
- ↑ إسبولاتوف، ياروسلاف؛ يوريف، أنطون؛ مازو، إيليا؛ ماسلوف، سيرجي (2005). "خصائص الارتباط وتطور المتجانسات الثنائية في شبكات تفاعل البروتين-البروتين" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 33 (11): 3629-3635 . doi : 10.1093/nar/gki678 . ISSN 0305-1048 . PMC 1160523. PMID 15983135 .
- 1 2 "أنطون يوريف" . تعاونات البحث في إلسيفير . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- ↑ يوريف، أنطون؛ موليوكوف، زوفار؛ كوتيلنيكوفا، إيكاترينا؛ ماسلوف، سيرجي؛ إيغوروف، سيرجي؛ نيكيتين، ألكسندر؛ داراسيليا، نيكولاي؛ مازو، إيليا (24 مارس 2006). " بناء المسارات التلقائي في شبكات الارتباط البيولوجية" . BMC Bioinformatics . 7 (1): 171. doi : 10.1186/1471-2105-7-171 . ISSN 1471-2105 . PMC 1435941. PMID 16563163 .
- ↑ يوريف، أنطون؛ تروبشا، أليكس؛ ميتشل، غرانت (7 يناير 2025). "استكشاف إعادة استخدام الأدوية للأمراض النادرة: الاستفادة من مخططات المعرفة الطبية الحيوية والوصول إلى الأدبيات العلمية". medRxiv 10.1101/2024.12.31.24319817 .
- الناس الأحياء
- مواليد عام 1966
- خريجو معهد موسكو للفيزياء والتكنولوجيا
- خريجو جامعة جونز هوبكنز
- علماء من موسكو
