ديسلفيتوباكتيريوم هافنيينس

📅 آخر تحديث: ٢٨ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٨ يوليو ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

Desulfitobacterium hafniense هو نوع من البكتيريا موجبة الجرام، وسلالته النموذجية هي DCB-2T. [ 1 ] ( NCBI taxonomy ID 272564؛ DSM 10664).

بكتيريا Desulfitobacterium hafniense هي بكتيريا لاهوائية مكونة للأبواغ. معظم العزلات الموصوفة هي بكتيريا اختيارية التنفس للهاليدات العضوية، قادرة على إزالة الكلور بالاختزال من الهاليدات العضوية مثل الكلوروفينولات ورباعي كلورو الإيثيلين . خلايا D. hafniense عصوية الشكل، يتراوح طولها بين 3.3 و6 ميكرومتر وعرضها بين 0.6 و0.7 ميكرومتر، وهي متحركة ، حيث تحتوي كل خلية على سوط طرفي واحد أو اثنين . جميع السلالات المختبرة مقاومة للمضاد الحيوي فانكومايسين . [ 2 ] [ 3 ]

على مر السنين، وُصفت عدة سلالات إضافية تنتمي إلى نوع hafniense من بيئات متنوعة. نُشرت السلالات PCP-1 وTCE1 وDP7 وTCP-A وG2 في الأصل كأفراد من نوع منفصل يُدعى Frappieri، ولكنها تُعتبر اليوم جميعها منتمية إلى نوع hafniense . [ 4 ] [ 5 ]

عزلات D. hafniense
أَضْنَىمصدرالدليل التشخيصي والإحصائي للاضطرابات النفسية
DCB-2 T [ 1 ]حمأة الصرف الصحي10664
PCP-1 [ 6 ]حمأة الصرف الصحي12420
TCP-A [ 7 ]رواسب النهر13557
GBFH [ 4 ]رواسب النهر---
Y51 [ 8 ]التربة الملوثة---
TCE1 [ 9 ]التربة الملوثة---
PCE-S [ 10 ]التربة الملوثة14645
G2 [ 11 ]باطن الأرض16228
DP7 [ 12 ]براز بشري13498
LBE [ 13 ]غير موصوف---

الجينومات

يحتوي جينوم بكتيريا Desulfitobacterium hafniense على الآلية اللازمة لكل من البيروليسين والسيلينوسيستين ، مما يجعلها الكائن الحي الوحيد المعروف الذي يحتمل أن يستخدم 22 حمضًا أمينيًا في ترجمة البروتين. [ 14 ] تمتلك سلالة Desulfitobacterium hafniense DCB-2 T جينومًا دائريًا واحدًا يبلغ طوله 5.78 مليون زوج قاعدي ، ويشفر 5045 جينًا. يحتوي جينوم هذه السلالة على سبعة جينات تشفر إنزيمات اختزال الهالوجين، خمسة منها وظيفية على ما يبدو، بينما يتعطل اثنان منها نتيجة طفرات. [ 15 ]

تتوفر معلومات التسلسل الجينومي الكامل لتسعة سلالات من بكتيريا ديسلفيتوباكتيريوم هافنيينس . يتراوح حجم جينوماتها بين 5 و5.7 مليون زوج قاعدي، ولا تحتوي أي من السلالات التي تم تسلسلها على بلازميدات. تحتوي جينوماتها على عدد محدود من إنزيمات نزع الهالوجين المختزلة ، بالإضافة إلى جينات لاستخدام مجموعة واسعة من مانحات ومستقبلات الإلكترونات.

أَضْنَىحجم الجينوم (ميغا بايت)عدد الاختزالي

إنزيمات نزع الهالوجين

تم وصف الجينوم
Y515.712006 [ 16 ]
DCB-2 T5.372012 [ 15 ]
PCE-S5.722015 [ 17 ]
DH5.402016 [ 18 ]
TCE15.712017 [ 19 ]
PCP-15.672017 [ 19 ]
LBE5.522017 [ 19 ]
DP75.202017 [ 19 ]
TCP-A552017 [ 19 ]

مراجع

  1. 1 2 كريستيانسن ن، أهرينغ ب ك (1996). "ديسلفيتوباكتيريوم هافنيينس نوع جديد، بكتيريا لاهوائية مُختزلة للكلور" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 46 (2): 442-448 . doi : 10.1099/00207713-46-2-442 .
  2. ↑ كالان إل، إيبرت إس، كيلي تي، رايت جي دي (يوليو 2009). "مجموعة مقاومة غير نمطية للفانكومايسين من بكتيريا ديسلفيتوباكتيريوم هافنيينس Y51" . العوامل المضادة للميكروبات والعلاج الكيميائي . 53 (7): 2841-2845 . doi : 10.1128/AAC.01408-08 . PMC 2704641. PMID 19414574 .  
  3. ↑ كروز تي، ليفيسون إم، دي فوس دبليو إم، سميدت إتش (سبتمبر 2014). "vanI: مجموعة جينات جديدة لمقاومة الفانكومايسين من نوع D-Ala-D-Lac تم اكتشافها في بكتيريا Desulfitobacterium hafniense" . التكنولوجيا الحيوية الميكروبية . 7 (5): 456-466 . doi : 10.1111/1751-7915.12139 . PMC 4229326. PMID 25042042 .  
  4. 1 2 نيغيمير أ، سبرينغ س، ستاكبراندت إي، روزنزويغ آر إف (ديسمبر 2001). "عزل وتوصيف بكتيريا جديدة مختزلة للزرنيخ (V): دلالات على تعبئة الزرنيخ وجنس ديسلفيتوباكتيريوم" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 67 (12): 5568-80 . doi : 10.1128/AEM.67.12.5568-5580.2001 . PMC 93345. PMID 11722908 .  
  5. ^ Villemur R، Lanthier M، Beaudet R، Lépine F (سبتمبر 2006). "جنس الديسولفيتوبكتيريوم" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة FEMS . 30 (5): 706-33 . دوى : 10.1111/j.1574-6976.2006.00029.x . بميد 16911041 . 
  6. ↑ بوشارد ب، بوديه ر، فيليمور ر، ماكسوين ج، ليبين ف، بيسايون ج ج (أكتوبر 1996). "عزل وتوصيف بكتيريا Desulfitobacterium frappieri sp. nov.، وهي بكتيريا لاهوائية تقوم بإزالة الكلور من خماسي كلوروفينول إلى 3-كلوروفينول عن طريق الاختزال" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 46 (4): 1010-1015 . doi : 10.1099/00207713-46-4-1010 . PMID 8863430 . 
  7. ↑ بريتنشتاين أ، سانو أ، سالكينوجا-سالونين م، أندريسن جيه آر، ليشنر يو (فبراير 2001). "تحليل مزرعة إثراء لإزالة الهالوجين من 2،4،6-ثلاثي كلوروفينول وعزل سلالة Desulfitobacterium frappieri TCP-A المُزيلة للهالوجين". أرشيف علم الأحياء الدقيقة . 175 (2): 133-142 . doi : 10.1007/s002030000248 . PMID 11285741. S2CID 25261490 .  
  8. ↑ سوياما أ، إيواكيري ر، كاي ك، توكوناغا ت، سيرا ن، فوروكاوا ك (يوليو 2001). "عزل وتوصيف سلالة Desulfitobacterium sp. Y51 القادرة على إزالة الهالوجين بكفاءة من رباعي كلورو الإيثيلين ومتعدد كلورو الإيثان" . العلوم الحيوية، والتكنولوجيا الحيوية، والكيمياء الحيوية . 65 (7): 1474-1481 . doi : 10.1271/bbb.65.1474 . PMID 11515528. S2CID 11762181 .  
  9. ↑ جيريتس جيه، دريزجا أو، كلوتسترا جي، كيجمال إم، ويرسوم إل بي، هاتسون آر، كولينز إم دي، جوتشال جيه سي (ديسمبر 1999). "تأثير مانحات ومستقبلات الإلكترونات المختلفة على عملية إزالة الهالوجين من رباعي كلورو الإيثيلين بواسطة بكتيريا ديسلفيتوباكتيريوم فرابيري TCE1" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 65 (12): 5212-21 . doi : 10.1128/AEM.65.12.5212-5221.1999 . PMC 91707. PMID 10583967 .  
  10. ↑ ميلر إي، وولفارث جي، ديكرت جي (ديسمبر 1997). "دراسات مقارنة حول إزالة الكلور الاختزالية لرباعي كلورو الإيثيلين بوساطة سلالة Desulfitobacterium sp. PCE-S". أرشيف علم الأحياء الدقيقة . 168 (6): 513-519 . doi : 10.1007/s002030050529 . PMID 9385143. S2CID 11883954 .  
  11. ↑ شيلوبولينا إي إس، فان براغ سي جي، لوفلي دي آر (مارس 2003). "استخدام المعادن المحتوية على الحديديك والحديدوز في عملية التنفس بواسطة بكتيريا ديسلفيتوباكتيريوم فرابيري". مجلة علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية . 20 (2): 143-156 . doi : 10.1080/01490450303884 . S2CID 93574898 . 
  12. ↑ فان دي باس، ب. أ.، هارمسن، هـ. ج.، رانغز، ج. س.، دي فوس، و. م.، شرا، ج.، ستامز، أ. ج. (يونيو 2001). "سلالة من بكتيريا ديسلفيتوباكتيريوم معزولة من براز بشري لا تزيل الكلور من الكلوروإيثينات أو الكلوروفينولات". أرشيف علم الأحياء الدقيقة . 175 (6): 389-394 . doi : 10.1007/s002030100276 . PMID 11491079. S2CID 35998991 .  
  13. ↑ كومينسولي إل، مايلارد جيه، ألبيني إم، ساندوز إف، جونييه بي، جوزيف إي (مايو 2017). "استخدام البكتيريا لتثبيت الحديد الأثري" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 83 (9). doi : 10.1128/AEM.03478-16 . PMC 5394308. PMID 28283522 .  
  14. ↑ هيرينغ، س.؛ أمبروجيلي، أ.؛ بوليكاربو، سي آر؛ سول، د. التعرف على الحمض النووي الريبوزي الناقل للبيروليسين بواسطة إنزيم سينثيتاز بيروليسيل-حمض نووي ريبوزي ناقل من بكتيريا ديسلفيتوباكتيريوم هافنيينس. مجلة أبحاث الأحماض النووية 2007، 35 (4)، 1270-1278. https://doi.org/10.1093/nar/gkl1151
  15. 1 2 كيم إس إتش، هارزمان سي، ديفيس جيه كيه، هاتشيسون آر، برودريك جيه بي ، مارش تي إل، تيدجي جيه إم (فبراير 2012). "تسلسل جينوم بكتيريا ديسلفيتوباكتيريوم هافنيينس DCB-2، وهي بكتيريا لاهوائية موجبة الجرام قادرة على إزالة الهالوجين واختزال المعادن" . بي إم سي ميكروبيولوجي . 12 : 21. doi : 10.1186/1471-2180-12-21 . PMC 3306737. PMID 22316246 .  
  16. ^ Nonaka H، Keresztes G، Shinoda Y، Ikenaga Y، Abe M، Naito K، Inatomi K، Furukawa K، Inui M، Yukawa H (مارس 2006). "تسلسل الجينوم الكامل لبكتيريا Dehalorespiring Desulfitobacterium hafniense Y51 والمقارنة مع Dehalococcoides ethenogenes 195" . مجلة علم البكتيريا . 188 (6): 2262– 74. دوى : 10.1128/JB.188.6.2262-2274.2006 . بمك 1428132 . بميد 16513756 .  
  17. ↑ جوريس تي، هورنونج بي، كروز تي، راينهولد إيه، ويسترمان إم، شاب بي جيه، سميدت إتش، ديكرت جي (2015). " مسودة تسلسل الجينوم وتوصيف بكتيريا ديسلفيتوباكتيريوم هافنيينس PCE-S" . معايير في علوم الجينوم . 10 : 15. doi : 10.1186/1944-3277-10-15 . PMC 4511579. PMID 26203328 .  
  18. ↑ تشانغ إكس، لي جي إكس، تشين إس سي، جيا إكس واي، وو كيه، كاو سي إل، باو بي (فبراير 2016). "مسودة تسلسل الجينوم لسلالة Desulfitobacterium hafniense DH، وهي بكتيريا مختزلة للكبريتات معزولة من تربة حقول الأرز" . إعلانات الجينوم . 4 (1). doi : 10.1128/genomeA.01693-15 . PMC 4751313. PMID 26868389 .  
  19. 1 2 3 4 5 كروز تي، جوريس تي، مايلارد جيه، وويك تي، ليشنر يو، دي فوس دبليو، سميدت إتش (ديسمبر 2017). "علم الجينوم المقارن لجنس ديسلفيتوباكتيريوم" . مجلة FEMS لعلم الأحياء الدقيقة البيئية . 93 (12). doi : 10.1093/femsec/fix135 . PMID 29040502 . 

للمزيد من القراءة