عائلة الهالوموناداسيا
Halomonadaceae هي عائلة من البكتيريا المحبة للملوحة من نوع Pseudomonadota .
تاريخ
تم وصف العائلة في الأصل في عام 1988 بأنها تضم جنسي Halomonas و Deleya . [ 3 ]
في عام 1989، أعيد تصنيف بكتيريا Chromobacterium marismortui إلى Chromohalobacter marismortui لتشكل جنسًا ثالثًا في عائلة Halomonadaceae. [ 4 ]
وفي وقت لاحق، في عام 1990 تم اكتشاف نوع واقترح في الأصل تسميته Volcaniella eurihalina لتشكيل جنس جديد في عائلة Halomonadaceae ، [ 5 ] ولكن أعيد تصنيفه لاحقًا (في عام 1995) كعضو في جنس Halomonas . [ 6 ]
لم يتم تصنيف نوع Carnimonas nigrificans (العضو الوحيد في الجنس) ضمن العائلة بسبب افتقاره إلى اثنين من أصل 15 تسلسلًا مميزًا لجين 16S rRNA، [ 7 ] ولكن تم اقتراح إعادة تصنيفه ضمن العائلة. [ 8 ]
في عام ١٩٩٦، أُعيد تنظيم العائلة لاحقًا بتوحيد أجناس ديليا ، وهالوموناس ، وهالوفيبريو ، بالإضافة إلى نوع باراكوكوس هالودينيتريفيكانس، ضمن جنس هالوموناس ، ووضع زيموباكتر ضمن هذه العائلة. [ ٩ ] ومع ذلك، اكتُشف لاحقًا أن سلالتي هالوفيبريو فاريابيليس DSM ٣٠٥١ وDSM ٣٠٥٠ مختلفتان، واعتُبرت الأخيرة السلالة النمطية لهالوفيبريو ، وهو ما لا يزال مُستخدمًا حتى اليوم. [ ١٠ ] [ ١١ ] وتضم الآن نوعين (الآخر هو هالوفيبريو دينيتريفيكانس). [ ١١ ]
في عام 2002، تم نقل Halomonas marina إلى جنسها الخاص Cobetia ، [ 12 ] وفي عام 2009 تم نقل Halomonas marisflavi و Halomonas indalinina و Halomonas avicenniae إلى جنس جديد يسمى Kushneria (5 أنواع).
تم استحداث عدة أجناس أحادية النوع مؤخرًا: ففي عام 2007، وُصف جنس Halotalea alkalilenta ، [ 13 ] وجنس Aidingimonas halophila في عام 2009، [ 14 ] وجنس Halospina denitrificans في عام 2006، [ 11 ] وجنس Modicisalibacter tunisiensis في عام 2009 ، [ 15 ] وجنس Salinicola socius في عام 2009. [ 16 ] ونُقل نوعان إلى الجنس الأخير، وهما Halomonas salaria باسم Salinicola salarius و Chromohalobacter salarius باسم Salinicola halophilus . [ 17 ]
تحتوي العائلة أيضًا على البكتيريا المكتشفة حديثًا ولكن غير المستزرعة " Candidatus Portiera aleyrodidarum" (المتعايشات الداخلية الأولية للذباب الأبيض [ 18 ] ).
الأجناس
- هالوموناس ، الجنس النموذجي
- Aidingimonas halophila [ 23 ]
- كوبيتيا
- كوبيتيا مارينا ، أصلها بسيودوموناس مارينا ، [ 24 ] ثم داليا مارينا ، ثم هالوموناس مارينا .
- Cobetia crustatorum ، معزولة من المأكولات البحرية الكورية المخمرة [ 25 ]
- كارنيموناس
- كروموهالوباكتر
- كروموهالوباكتر ماريسمورتوي
- كروموهالوباكتر بيجيرينكي
- Chromohalobacter canadensis و Chromohalobacter israelensis ، اللذان كانا ينتميان سابقًا إلى جنس Halomonas
- كروموهالوباكتر جابونيكوس
- Chromohalobacter nigrandesensis
- كروموهالوباكتر سالاريوس
- Chromohalobacter salexigens
- كروموهالوباكتر ساريسينسيس ، مقاوم للنباتات
- Halotalea alkalilenta [ 26 ]
- كوشنيريا
- كوشنيريا أورانتيا ، النوع النمطي
- تم تصنيف Kushneria marisflavi و Kushneria indalinina و Kushneria avicenniae سابقًا تحت Halomonas [ 27 ].
- موديسيساليباكتر
- بورتيرا
- Zymobacter ، لا ينبغي الخلط بينها وبين Zymomonas mobilis ، وهي بكتيريا ألفا بروتيو التي يتم دراستها لإنتاج الوقود الحيوي، وهو خطأ سهل حتى أن المدونة الدولية لتسمية البكتيريا وقعت فيه في [ 28 ] كما هو مذكور في [ 29 ].
ملاحظة: أصبحت أنواع من جنسي ديليا وهالوفيبرايو تُعرف الآن باسم هالوموناس
أصل الكلمة
تشتق الأسماء من Halomonas، وهو الجنس النموذجي للعائلة، بالإضافة إلى اللاحقة -aceae، التي تنتهي للدلالة على عائلة [ 30 ].
بحث
تُجري عالمة الأحياء الدقيقة الجيولوجية، فيليسا وولف-سيمون، مع فريق ممول من وكالة ناسا، أبحاثًا على سلالة معينة من عائلة هالوموناداسيا، تُسمى GFAJ-1 ، تم عزلها وزراعتها من رواسب جُمعت على طول شاطئ بحيرة مونو ، بالقرب من منتزه يوسيميتي الوطني في شرق كاليفورنيا . [ 31 ] [ 32 ] تستطيع سلالة GFAJ-1 من هالوموناداسيا النمو في وجود تركيزات عالية من الزرنيخ . [ 33 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ^ "ساليكولا" . www.uniprot.org .
- ↑ "قائمة الأجناس المشمولة في عائلات: Halomonadaceae" . قائمة أسماء بدائيات النوى ذات مكانة في التسمية . تم الاطلاع عليها بتاريخ 25 يونيو 2016 .
- ↑ فرانزمان، ب.د.؛ ويمهير، يو.؛ ستاكبراندت، إي. (1988). "عائلة هالوموناداسيا الجديدة، عائلة جديدة من فئة بروتيوبكتيريا لتضم جنسي هالوموناس وديليا". علم الأحياء الدقيقة التطبيقي المنهجي 11 : 16-19 . doi : 10.1016 /s0723-2020(88)80043-2 .
- ↑ فينتوسا، أ.؛ غوتيريز، م.س.؛ غارسيا، م.ت.؛ رويز-بيراكيرو، ف. (1989). "تصنيف "Chromobacterium marismortui" في جنس جديد، Chromohalobacter gen. nov.، باسم Chromohalobacter marismortui comb. nov., nom. rev" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 39 (4): 382-386 . doi : 10.1099/00207713-39-4-382 .
- ↑ كيسادا (E.)، فالديراما (MJ)، بيجار (V.)، فينتوسا (A.)، جوتيريز (MC)، رويز-بيراكويرو (F.) وراموس-كورمينزانا (A.): Volcaniella eurihalina gen. نوفمبر، س. نوفمبر، وهو قضيب سالب الجرام غير متحرك محب للملوحة إلى حد ما. كثافة العمليات. J. النظام. بكتيريا. ، 1990، 40، 261-267
- ↑ ميلادو، إي.؛ مور، إي. آر. بي.؛ نيتو، جيه. جيه.؛ فينتوسا، أ. (1995). "الاستدلالات التطورية والنتائج التصنيفية لمقارنة تسلسل الحمض النووي الريبوزي 16S لأنواع Chromohalobacter marismortui وVolcaniella eurihalina وDeleya salina، وإعادة تصنيف V. eurihalina إلى Halomonas eurihalina comb. nov" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 45 (4): 712-716 . doi : 10.1099/00207713-45-4-712 . PMID 7547290 .
- ↑ غاريغا، م.؛ إيرمان، م.أ.؛ أرناو، ج.؛ هوغاس، م.؛ فوغل، ر.ف. (1998). "كارنيموناس نيغريفيكانس، جنس جديد، نوع جديد، عامل بكتيري مسبب لظهور البقع السوداء على منتجات اللحوم المعالجة" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 48 (3): 677-86 . doi : 10.1099/00207713-48-3-677 . PMID 9734022 .
- ↑ د. ر. أراهال، و. لودفيج، ك. هـ. شلايفر، و أ. فينتوسا. علم تطور السلالات لعائلة هالوموناداسيا بناءً على تحليلات تسلسل الحمض النووي الريبوزي 23S و16S. المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري ، المجلد 52، 241-249
- ↑ دوبسون، إس. جيه.؛ فرانزمان، بي. دي. (1996). "توحيد أجناس ديليا (باومان وآخرون، 1983)، وهالوموناس (فريلاند وآخرون، 1980)، وهالوفيبرايو (فيندريش، 1988)، ونوع باراكوكوس هالودينيتريفيكانس (روبنسون وجيبونز، 1952) في جنس واحد، هالوموناس ، ووضع جنس زيموباكتر في عائلة هالوموناداسيا" . المجلة الدولية لعلم البكتيريا المنهجي . 46 (2): 550-558 . doi : 10.1099/00207713-46-2-550 .
- ↑ سوروكين، د.ي.؛ تيندال، ب.ج. (2006). "وضع اسم الجنس هالوفيبرايو فيندريش 1989 وهوية السلالتين سودوموناس هالوفيلا DSM 3050 وهالوموناس فاريابيليس DSM 3051. طلب رأي" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 56 (2): 487-489 . doi : 10.1099/ijs.0.63965-0 . PMID 16449462 .
- سوروكين ، د.ي .؛ توروفا، ت.ب.؛ غالينسكي، إ.أ.؛ بيلوش، س.؛ تيندال، ب.ج. (2006). "بكتيريا نازعة للنترات شديدة الملوحة من بحيرات داخلية شديدة الملوحة، هالوفيبرايو دينيتريفيكانس نوع جديد. وهالوسبينا دينيتريفيكانس جنس جديد، نوع جديد، ودليل على أن اسم الجنس هالوفيبرايو فيندريش 1989 مع النوع النمطي هالوفيبرايو فاريابيليس يجب أن يرتبط بالعينة DSM 3050" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 56 (2): 379-388 . doi : 10.1099/ijs.0.63964-0 . PMID 16449444 .
- ↑ أراهال (DR)، كاستيلو (AM)، لودفيج (W.)، شلايفر (KH) وفينتوزا (A.): اقتراح جنس جديد Cobetia marina، تركيبة جديدة، ضمن عائلة Halomonadaceae، ليشمل نوع Halomonas marina. علم الأحياء الدقيقة التطبيقي المنهجي ، 2002، 25، 207-211.
- ↑ نتوغياس، س.؛ زيرفاكيس، ج. إ.؛ فاسيس، س. (2007). "Halotalea alkalilenta gen. Nov., sp. Nov.، بكتيريا جديدة مقاومة للضغط الأسموزي والقلوية من مخلفات معاصر الزيتون القلوية، ووصف مُعدَّل لعائلة Halomonadaceae Franzmann et al. 1989، مُعدَّل بواسطة Dobson and Franzmann 1996" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 57 (9): 1975-1983 . doi : 10.1099/ijs.0.65078-0 . PMID 17766858 .
- ↑ وانغ، ي.؛ تانغ، س. -ك.؛ لو، ك.؛ لي، ج. -س.؛ جيون، س.و.؛ شو، ل. -ه.؛ كيم، س. -ج.؛ لي، و. -ج. (2009). "Aidingimonas halophila gen. Nov., sp. Nov.، بكتيريا محبة للملوحة بشكل معتدل معزولة من بحيرة مالحة" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 59 (12): 3088-3094 . doi : 10.1099/ijs.0.010264-0 . PMID 19643876 .
- ↑ بن علي جام، ز. عبد الكافي، س.؛ كاسالوت، ل.؛ ثولوزان، JL. الوسلاتي، ر.؛ لابات، م. (2007). " Modicisalibacter tunisiensis gen. nov., sp. nov.، بكتيريا هوائية معتدلة المحبة للملوحة معزولة من عينة حقن مياه حقول النفط، والوصف المعدل لعائلة Halomonadaceae Franzmann et al. 1989 emend Dobson and Franzmann 1996 emend. Ntougias et al. 2007" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 57 (10): 2307–13 . دوى : 10.1099/ijs.0.65088-0 . بميد 17911302 .
- ↑Anan'ina, L.N.; Plotnikova, E.G.; Gavrish, E.Y.; Demakov, V.A.; Evtushenko, L.I. (2007). "Salinicola socius gen. nov., sp. nov., a moderately halophilic bacterium from a naphthalene-utilizing microbial association". Microbiology. 76 (3): 324–330. doi:10.1134/s0026261707030095. S2CID 21296220. (translation of Mikrobiologiya, 2007, 76, 369-376)
- ↑De La Haba, R. R.; Sanchez-Porro, C.; Marquez, M. C.; Ventosa, A. (2009). "Taxonomic study of the genus Salinicola: Transfer of Halomonas salaria and Chromohalobacter salarius to the genus Salinicola as Salinicola salarius comb. Nov. And Salinicola halophilus nom. Nov., respectively". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 60 (4): 963–971. doi:10.1099/ijs.0.014480-0. PMID 19661506. S2CID 28728802.
- ↑Thao, M. L.; Baumann, P. (2004). "Evolutionary Relationships of Primary Prokaryotic Endosymbionts of Whiteflies and Their Hosts". Applied and Environmental Microbiology. 70 (6): 3401–3406. doi:10.1128/AEM.70.6.3401-3406.2004. PMC 427722. PMID 15184137.
- ↑Vreeland, R.H.; Litchfield, C.D.; Martin, E.L.; Elliot, E. (1980). "Halomonas elongata, a new genus and species of extremely salt-tolerant bacteria". Int. J. Syst. Bacteriol. 30 (2): 485–495. doi:10.1099/00207713-30-2-485.
- ↑Robinson, J.; Gibbons, N.E. (1952). "The effect of salts on the growth of Micrococcus halodentrificans n. sp". Canadian Journal of Botany. 30 (2): 147–154. doi:10.1139/b52-013.
- ↑Elazari-Volcani 1940
- ↑Hof 1935
- ↑ وانغ، ي.؛ تانغ، س.ك.؛ لو، ك.؛ لي، ج.س.؛ جيون، س.و.؛ شو، ل.هـ.؛ كيم، س.ج.؛ لي، و.ج. (2009). "Aidingimonas halophila gen. nov., sp. nov.، بكتيريا محبة للملوحة بشكل معتدل معزولة من بحيرة مالحة" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 59 (12): 3088-3094 . doi : 10.1099/ijs.0.010264-0 . PMID 19643876 .
- ↑ كوبيت، أ.ب.؛ ويرسن، س.؛ جونز، ج.إ. (1970). "تأثير النيكل على بكتيريا بحرية، أرثروباكتر مارينوس نوع جديد" . مجلة علم الأحياء الدقيقة العام . 62 (2): 159-169 . doi : 10.1099/00221287-62-2-159 . PMID 5493594 .
- ↑ كيم، إم إس؛ روه، إس دبليو؛ بي إيه إي، جيه دبليو (2010). "كوبيتيا كرستاتوروم، نوع جديد من البكتيريا المحبة للملوحة قليلاً، معزولة من المأكولات البحرية المخمرة التقليدية في كوريا" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 60 (3): 620-626 . doi : 10.1099/ijs.0.008847-0 . PMID 19654339 .
- ↑ NTOUGIAS (S.)، ZERVAKIS (GI) و FASSEAS (C.): Halotalea alkalilenta gen. نوفمبر، س. نوفمبر، وهي بكتيريا جديدة متحملة للأسموتول والقلوية من نفايات مطحنة الزيتون القلوية، وتم تعديل الوصف لعائلة Halomonadaceae Franzmann et al. 1989
- ↑ سانشيز-بورو، سي.؛ دي، إل إيه هابا آر آر؛ سوتو-راميريز، إن.؛ ماركيز، إم سي؛ مونتالفو-رودريغيز، آر.؛ فينتوسا، إيه. (2009). "وصف جنس جديد، نوع جديد، كوشنيريا أورانتيا، عضو جديد في عائلة هالوموناداسيا، واقتراح لإعادة تصنيف هالوموناس ماريس فلافي إلى كوشنيريا ماريس فلافي كومب. نوف.، وهالوموناس إندالينينا إلى كوشنيريا إندالينينا كومب. نوف.، وهالوموناس أفيسينيا إلى كوشنيريا أفيسينيا كومب. نوف . " المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 59 (2): 397-405 . دوى : 10.1099/ijs.0.001461-0 . بميد 19196785 .
- ↑ أراهال، د. ر.؛ فريلاند، ر. هـ.؛ ليتشفيلد، س. د.؛ مورميل، م. ر.؛ تيندال، ب. ج.؛ أورين، أ.؛ بيجار، ف.؛ كيسادا، إ.؛ فينتوسا، أ. (2007). "المعايير الدنيا الموصى بها لوصف التصنيفات الجديدة لعائلة هالوموناداسيا" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 57 (الجزء 10): 2436-2446 . doi : 10.1099/ijs.0.65430-0 . PMID 17911321 .
- ↑ أراهال، د. ر.؛ فريلاند، ر. هـ.؛ ليتشفيلد، س. د .؛ وآخرون (2008). "تصويبات. المعايير الدنيا الموصى بها لوصف التصنيفات الجديدة لعائلة هالوموناداسيا (المجلد 57، الصفحة 2436، 2007)" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 58 (2673): 2008. doi : 10.1099/00207713-58-11-2673 .
- ↑ "تصنيف وتصنيف وعلم تصنيف بدائيات النوى (البكتيريا)" . مؤرشف من الأصل في 2011-05-16.
- ↑ بورتمان، هنري (2010-12-02). "بكتيريا تتغذى على الزرنيخ تفتح آفاقًا جديدة للحياة الفضائية" . Space.com . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2010-12-02 .
- ↑ بورتمان، هنري (5 أكتوبر 2009). "البحث عن حياة خارج كوكب الأرض" . مجلة علم الأحياء الفلكي (ناسا) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2 ديسمبر 2010 .
- ↑ كاتسنيلسون، آلا (2 ديسمبر 2010). "ميكروب يتغذى على الزرنيخ قد يعيد تعريف كيمياء الحياة" . مجلة نيتشر . doi : 10.1038/news.2010.645 . تاريخ الاسترجاع: 2 ديسمبر 2010 .
روابط خارجية
- ناسا - مجلة علم الأحياء الفلكي: "البحث عن حياة فضائية على الأرض" — ( أكتوبر 2009 )
- NASA.gov: "بحث ممول من وكالة ناسا يكتشف أن الحياة مبنية على مواد كيميائية سامة" مؤرشف بتاريخ 28-08-2011 في Wayback Machine — (ديسمبر 2010)
- ملخص بحث نُشر في مجلة ساينس إكسبريس بقلم ف. وولف-سيمون وآخرون: "بكتيريا يمكنها النمو باستخدام الزرنيخ بدلاً من الفوسفور." - (ديسمبر 2010)
- أوشينوسبيريلاليس
- علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية
