علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية

علم الأحياء الدقيقة الجيولوجي هو مجال علمي يقع عند تقاطع الجيولوجيا وعلم الأحياء الدقيقة، ويُعدّ فرعًا رئيسيًا من فروع علم الأحياء الجيولوجي . يهتم هذا العلم بدور الميكروبات في العمليات الجيولوجية والكيميائية الجيولوجية ، وتأثير المعادن والفلزات على نمو الميكروبات ونشاطها وبقائها. [ 2 ] تحدث هذه التفاعلات في الغلاف الأرضي (الصخور والمعادن والتربة والرواسب)، والغلاف الجوي ، والغلاف المائي . [ 3 ] يدرس علم الأحياء الدقيقة الجيولوجي الكائنات الدقيقة التي تُحرك الدورات البيوجيوكيميائية للأرض ، وتُساهم في ترسيب المعادن وإذابتها، وامتصاص الفلزات وتركيزها. [ 4 ] تشمل تطبيقاته، على سبيل المثال ، المعالجة الحيوية ، [ 5 ] والتعدين ، والتخفيف من آثار تغير المناخ ، [ 6 ] وإمدادات مياه الشرب العامة . [ 7 ]
الصخور والمعادن
التفاعلات بين الميكروبات والخزانات المائية
من المعروف أن الكائنات الدقيقة تؤثر على طبقات المياه الجوفية من خلال تعديل معدلات ذوبانها. ففي طبقة إدواردز الجوفية الكارستية ، تعمل الميكروبات التي تستعمر أسطح طبقة المياه الجوفية على تعزيز معدلات ذوبان الصخور المضيفة. [ 8 ]
في طبقة المياه الجوفية القشرية المحيطية ، وهي أكبر طبقة مياه جوفية على وجه الأرض، [ 9 ] يمكن للمجتمعات الميكروبية أن تؤثر على إنتاجية المحيط ، وتركيب مياه البحر، بالإضافة إلى الدورة الجيوكيميائية في جميع أنحاء الغلاف الأرضي . ويؤثر التركيب المعدني للصخور على تكوين ووفرة هذه المجتمعات الميكروبية الموجودة تحت قاع البحر. [ 10 ] ومن خلال المعالجة الحيوية، يمكن لبعض الميكروبات أن تساعد في تطهير موارد المياه العذبة في طبقات المياه الجوفية الملوثة بالنفايات.
المعادن المترسبة ميكروبيًا
تستخدم بعض البكتيريا أيونات المعادن كمصدر للطاقة. فهي تحوّل (أو تختزل كيميائيًا) أيونات المعادن الذائبة من حالة كهربائية إلى أخرى. يُطلق هذا الاختزال طاقةً تستخدمها البكتيريا، كما يُسهم، كمنتج ثانوي، في تركيز المعادن لتكوين ما يُعرف في النهاية برواسب الخامات . في التعدين الحيوي المائي أو التعدين في الموقع ، تُهاجم الخامات منخفضة الجودة بعمليات ميكروبية مدروسة جيدًا في ظل ظروف مُحكمة لاستخلاص المعادن. يُعتقد أن بعض خامات الحديد والنحاس واليورانيوم ، وحتى الذهب، قد تشكلت نتيجةً لنشاط الميكروبات. [ 11 ]
تُعدّ البيئات تحت السطحية، مثل طبقات المياه الجوفية، مواقع جذابة عند اختيار مستودعات النفايات النووية ، أو ثاني أكسيد الكربون (انظر: احتجاز الكربون )، أو كمستودعات اصطناعية للغاز الطبيعي . يُعدّ فهم النشاط الميكروبي داخل طبقة المياه الجوفية أمرًا بالغ الأهمية، إذ قد يتفاعل مع المواد الموجودة داخل المستودع الجوفي ويؤثر على استقرارها. [ 12 ] تُسهم التفاعلات بين الميكروبات والمعادن في التلوث الحيوي والتآكل الناجم عن الميكروبات. وللتآكل الميكروبي للمواد، مثل الفولاذ الكربوني، آثار خطيرة على التخزين الآمن للنفايات المشعة داخل المستودعات وحاويات التخزين. [ 13 ]
المعالجة البيئية
تُجرى دراسات على الكائنات الدقيقة وتُستخدم لتحليل التلوث العضوي وحتى التلوث النووي (انظر: Deinococcus radiodurans ) والمساعدة في تنظيف البيئة. ومن تطبيقات علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية الاستخلاص الحيوي للمعادن ، أي استخدام الكائنات الدقيقة لاستخلاص المعادن من مخلفات المناجم .
التربة والرواسب: المعالجة الميكروبية

تُستخدم المعالجة الميكروبية في التربة لإزالة الملوثات. تلعب الميكروبات دورًا محوريًا في العديد من دورات الكيمياء الحيوية الجيولوجية ، وتؤثر على خصائص التربة المختلفة، مثل التحول الحيوي للمعادن وتحديد أنواعها، والسمية، والحركة، وترسيب المعادن، وذوبانها. كما تساهم الميكروبات في تثبيت وإزالة سمية العديد من العناصر في التربة، مثل المعادن ، والنويدات المشعة ، والكبريت ، والفوسفور . وتُصنف ثلاثة عشر معدنًا ضمن الملوثات ذات الأولوية (الأنتيمون، والزرنيخ، والبريليوم، والكادميوم، والكروم، والنحاس، والرصاص، والنيكل، والسيلينيوم، والفضة، والثاليوم، والزنك، والزئبق). [ 2 ] تعمل التربة والرواسب كمستودعات للمعادن التي تنشأ من مصادر طبيعية كالصخور والمعادن، بالإضافة إلى مصادر بشرية كالزراعة، والصناعة، والتعدين، والتخلص من النفايات، وغيرها.
تُعدّ العديد من المعادن الثقيلة، مثل الكروم (Cr)، عناصر غذائية دقيقة أساسية في التربة بتركيزات منخفضة ، إلا أنها قد تصبح سامة بتركيزات أعلى. وتُضاف المعادن الثقيلة إلى التربة من مصادر بشرية عديدة، كالصناعة والأسمدة. ويتفاعل الكروم مع الكائنات الدقيقة، مما قد يزيد أو يقلل من سميته. وتعتمد مستويات سمية الكروم وحركته وتوافره الحيوي على حالات أكسدته. [ 14 ] ومن أكثر أنواع الكروم شيوعًا الكروم الثلاثي (Cr(III)) والكروم السداسي (Cr(VI)). يتميز الكروم السداسي بحركته العالية وتوافره الحيوي الكبير وسميته العالية للنباتات والحيوانات ، بينما يتميز الكروم الثلاثي بسميته المنخفضة وقلة حركته، ويترسب بسهولة في التربة ذات الرقم الهيدروجيني الأعلى من 6. [ 15 ] ويُعدّ استخدام الكائنات الدقيقة لتسهيل تحويل الكروم السداسي إلى الكروم الثلاثي تقنيةً صديقةً للبيئة ومنخفضة التكلفة للمعالجة الحيوية، تُساعد في الحدّ من السمية في البيئة. [ 16 ]
تصريف المياه الحمضية من المناجم
من التطبيقات الأخرى لعلم الأحياء الدقيقة الجيولوجية الاستخلاص الحيوي للمعادن ، وهو استخدام الميكروبات لاستخلاص المعادن من مخلفات المناجم . فعلى سبيل المثال، تنتج البكتيريا المختزلة للكبريتات كبريتيد الهيدروجين الذي يرسب المعادن على شكل كبريتيد معدني. وقد أزالت هذه العملية المعادن الثقيلة من مخلفات المناجم، وهو أحد أبرز المشكلات البيئية المرتبطة بتصريف المياه الحمضية من المناجم (إلى جانب انخفاض درجة الحموضة ). [ 17 ]
تُستخدم تقنيات المعالجة الحيوية أيضًا لمعالجة المياه السطحية والجوفية الملوثة ، والتي غالبًا ما ترتبط بتصريف المياه الحمضية من المناجم. وقد أظهرت الدراسات أن إنتاج البيكربونات بواسطة الكائنات الدقيقة، مثل البكتيريا المختزلة للكبريتات، يُضيف قلوية لمعادلة حموضة مياه تصريف المناجم. [ 5 ] تُستهلك أيونات الهيدروجين أثناء إنتاج البيكربونات، مما يؤدي إلى زيادة الرقم الهيدروجيني (انخفاض الحموضة). [ 18 ]
التحلل الميكروبي للهيدروكربونات
يمكن أن تؤثر الكائنات الدقيقة على جودة مكامن النفط والغاز من خلال عملياتها الأيضية. [ 19 ] يمكن للكائنات الدقيقة أن تؤثر على تكوين الهيدروكربونات من خلال وجودها وقت ترسب الرواسب المصدرية أو من خلال انتشارها عبر العمود الصخري لاستعمار الخزانات أو الصخور المصدرية بعد تكوين الهيدروكربونات.
مقاومة المعادن في البكتيريا
طوّرت البكتيريا مجموعة من آليات المقاومة للتكيف مع سمية المعادن الثقيلة في بيئاتها. تُعدّ معادن مثل النحاس والزنك والحديد ضرورية بتركيزات منخفضة، لكن الكميات الزائدة منها قد تُعيق العمليات الخلوية أو تُسبب موتها. وللبقاء على قيد الحياة، طوّرت البكتيريا استراتيجيات لمنع امتصاص المعادن، أو إزالة سميتها داخل الخلية، أو عزلها بأمان. تُعدّ آليات المقاومة هذه بالغة الأهمية للتكيف البيئي وجهود المعالجة الحيوية. [ 20 ]
آليات المقاومة
مضخات التدفق الخارجي
تُعدّ مضخات الإخراج إحدى الآليات الرئيسية التي تستخدمها البكتيريا لمقاومة المعادن الثقيلة. تنقل هذه المركبات البروتينية أيونات المعادن السامة بنشاط خارج الخلية البكتيرية، مستخدمةً في الغالب الطاقة الناتجة عن تحلل الأدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP) أو تدرجات الأيونات. توجد عدة عائلات من مضخات الإخراج المشاركة في مقاومة المعادن، بما في ذلك مضخات الأدينوسين ثلاثي الفوسفات من النوع P، ومضخات المقاومة-التكوين-الانقسام (RND)، ومُيسِّرات انتشار الكاتيونات (CDFs). تُساعد هذه المضخات على إزالة أيونات المعادن مثل الكادميوم (Cd²⁺ ) والزنك (Zn²⁺ ) والكوبالت (Co²⁺ ) من الخلية، مانعةً إياها من الوصول إلى تراكيز سامة داخلها. يسمح تنوع أنظمة مضخات الإخراج للبكتيريا بالتكيف مع مختلف الملوثات المعدنية في بيئتها والبقاء على قيد الحياة في بيئات ملوثة مثل مواقع النفايات الصناعية أو المياه الملوثة. [ 21 ] كما أن بعض أنظمة الإخراج قادرة على نقل المضادات الحيوية، مما يُضيف طبقة إضافية من المقاومة للبكتيريا في البيئات التي تتعرض لضغوط المعادن والمضادات الحيوية معًا. [ 22 ]
عزل المعادن
بمجرد دخولها الخلية البكتيرية، يمكن لأيونات المعادن أن تعطل وظائفها الحيوية. ولمنع ذلك، غالبًا ما تعزل البكتيريا المعادن عن طريق ربطها ببروتينات داخلية، مثل الميثالوثيونينات، وهي بروتينات صغيرة غنية بالسيستين ذات ألفة عالية للمعادن الثقيلة. وبالمثل، يمكن لجزيئات شبيهة بالفيتوكيليتين أن ترتبط أيضًا بأيونات المعادن، مما يؤدي إلى تحييدها بفعالية. يخدم هذا العزل عدة أغراض: فهو يبعد المعادن عن المكونات الخلوية التفاعلية كالبروتينات والحمض النووي، ويقلل من الإجهاد التأكسدي، ويسهل أحيانًا نقل المعادن إلى مضخات الإخراج للتخلص منها. تُعد هذه الاستراتيجية بالغة الأهمية في البيئات التي يصعب فيها إزالة المعادن الموجودة عن طريق الإخراج وحده، أو عندما يجب تخزين المعادن مؤقتًا إلى حين التخلص منها بأمان من الخلية. [ 23 ] إن عزل المعادن ليس مجرد تكتيك للبقاء، بل يمكنه أيضًا أن يمكّن البكتيريا من تحمل تركيزات عالية من المعادن لفترات طويلة.
إزالة السموم الأنزيمية
تمتلك البكتيريا أيضًا إنزيمات تُزيل سمية المعادن عن طريق تحويلها كيميائيًا إلى أشكال أقل ضررًا. ومن الأمثلة على ذلك إنزيم مختزل الزئبق، الذي يُختزل أيونات الزئبق السامة (Hg²⁺ ) إلى زئبق عنصري (Hg⁰ ) ، وهو أقل سمية ويمكن تبخيره خارج الخلية. وبالمثل، يُحوّل إنزيم مختزل الزرنيخات الزرنيخات (AsO₄³⁻ ) إلى زرنيخيت (AsO₂⁻ ) ، وهو شكل أقل سمية وأسهل طردًا من الخلية عبر آليات الإخراج. تُعد هذه العمليات الإنزيمية حيوية للبكتيريا التي تعيش في بيئات ملوثة بمعادن مثل الزئبق أو الزرنيخ أو غيرها من المعادن الثقيلة، حيث تُعد القدرة على إزالة سمية هذه المواد ضرورية لبقائها. كما تُبرز عملية إزالة السمية الإنزيمية قدرة البكتيريا ليس فقط على تحمل سمية المعادن، بل أيضًا على التكيف مع التنوع الكيميائي للملوثات المعدنية التي تواجهها. [ 20 ] [ 22 ]
الطفرات ونقل الجينات
تستطيع البكتيريا اكتساب مقاومة للمعادن من خلال الطفرات التلقائية والانتقال الأفقي للجينات. قد تؤدي الطفرات في جينات البكتيريا إلى تغييرات في بنية البروتينات الرابطة للمعادن، أو مضخات الإخراج، أو الإنزيمات المشاركة في إزالة السموم، مما يزيد من قدرة البكتيريا على تحمل الإجهاد الناتج عن المعادن الثقيلة. يلعب الانتقال الأفقي للجينات دورًا محوريًا في انتشار مقاومة المعادن، حيث تحمل العناصر الجينية المتنقلة، مثل البلازميدات والترانسبوزونات والإنترونات، جينات مقاومة المعادن بين أنواع البكتيريا. وهذا يسمح للبكتيريا باكتساب سمات المقاومة ونشرها بسرعة عبر المجتمعات الميكروبية. كما يُسهّل الانتقال الأفقي للجينات النقل المشترك لجينات مقاومة أخرى، بما في ذلك تلك التي تُكسب مقاومة للمضادات الحيوية. غالبًا ما تُنتج هذه العملية بكتيريا قادرة على مقاومة كل من المعادن والمضادات الحيوية في آنٍ واحد، مما يُعقّد جهود العلاج في البيئات السريرية. [ 24 ]
التأثير البيئي على المقاومة
تؤثر عوامل بيئية، مثل درجة حموضة التربة ودرجة الحرارة وتوافر العناصر الغذائية والممارسات الزراعية، على انتشار وفعالية مقاومة المعادن في التجمعات البكتيرية. فعلى سبيل المثال، يمكن للأسمدة والمبيدات أن تزيد من تركيز المعادن الثقيلة في التربة، مما يخلق ضغطًا انتقائيًا يعزز بقاء البكتيريا المقاومة للمعادن. وفي بعض الحالات، قد تُطور التجمعات البكتيرية في هذه البيئات مقاومة للمضادات الحيوية، وهي ظاهرة تُعرف بالانتقاء المشترك. تحدث هذه العملية لأن الآليات نفسها التي تحمي البكتيريا من المعادن الثقيلة، مثل مضخات الإخراج، قد تُخرج المضادات الحيوية أيضًا، مما يؤدي إلى ظهور بكتيريا مقاومة لتهديدات متعددة في آن واحد. يُبرز هذا التفاعل بين التلوث البيئي ومقاومة البكتيريا الحاجة إلى ممارسات زراعية مستدامة واستراتيجيات فعالة لإدارة النفايات للحد من انتشار البكتيريا المقاومة. [ 23 ] [ 25 ]
العلاقة بين المعادن الثقيلة ومقاومة المضادات الحيوية
أظهرت الدراسات أن تعرض البكتيريا للمعادن الثقيلة يعزز مقاومتها لكل من المعادن والمضادات الحيوية. ويمكن لمضخات الإخراج، التي تُعدّ أساسية في مقاومة المعادن، أن تطرد ليس فقط أيونات المعادن، بل المضادات الحيوية أيضًا، مما يخلق بيئةً تُصبح فيها البكتيريا مقاومةً لمجموعة واسعة من المضادات الحيوية بالإضافة إلى المعادن الثقيلة. وتُشكل هذه المقاومة المزدوجة مصدر قلق متزايد للصحة العامة، إذ تُعقّد علاج العدوى لدى البشر والحيوانات. علاوةً على ذلك، يُمكن أن يُساهم استخدام المضادات الحيوية في الزراعة والبيئة في انتقاء بكتيريا مقاومة لكل من السموم البيئية والأدوية، مما يُصعّب السيطرة على العدوى البكتيرية. وتُبرز العلاقة بين مقاومة المعادن والمضادات الحيوية أهمية رصد التلوث المعدني في البيئات الطبيعية، بالإضافة إلى تطوير استراتيجيات للحد من انتشار البكتيريا المقاومة للأدوية المتعددة. [ 26 ]
تكوين الأغشية الحيوية
الأغشية الحيوية عبارة عن تجمعات لزجة من البكتيريا تلتصق بالأسطح. في ظل ظروف الإجهاد، مثل التعرض للمعادن الثقيلة، غالبًا ما تُشكّل البكتيريا أغشية حيوية لحماية نفسها. وبدلًا من العيش بحرية (الطور العائم)، تكون البكتيريا في الأغشية الحيوية ثابتة، مُثبّتة في مكانها ومُحاطة بمصفوفة واقية من عديدات السكاريد الخارجية (EPS). [ 23 ]
دور الأغشية الحيوية في مقاومة المعادن
يمكن للأغشية الحيوية أن تعمل كحواجز وقائية ضد المعادن الثقيلة. فمن خلال احتجاز أيونات المعادن في مصفوفة البوليمرات خارج الخلية، تقلل الأغشية الحيوية من تعرض الخلايا البكتيرية المباشر للمعادن السامة. وتكتسب هذه الآلية أهمية خاصة في البيئات الغنية بالمعادن، حيث يصعب على البكتيريا البقاء على قيد الحياة دون تكوين الأغشية الحيوية. [ 24 ] في عمليات التعدين الحيوي، مثل استخلاص النحاس من خامات الكبريتيد، تساعد الأغشية الحيوية التي تُشكلها البكتيريا المحبة للأحماض على تعزيز ذوبان المعادن. ويُعد الالتصاق بالأسطح المعدنية وتكوين الأغشية الحيوية من الخطوات المبكرة الحاسمة التي تؤثر على نجاح عملية الاستخلاص الحيوي. [ 27 ] وبالمثل، في البيئات الطبيعية كالتربة والمياه الجوفية، تُشكل البكتيريا أغشية حيوية على الأسطح المعدنية لتثبيت نفسها وتحسين تحلل الملوثات، مما يُساعد في جهود المعالجة الحيوية. [ 23 ]
التفاعلات بين المعادن والبكتيريا
تتفاعل الأغشية الحيوية البكتيرية فيزيائيًا وكيميائيًا مع المعادن. غالبًا ما تتضمن مصفوفة البوليمرات خارج الخلية أيونات موجبة مثل الكالسيوم (Ca²⁺ ) والمغنيسيوم (Mg²⁺ ) ، مما يُعزز بنية الغشاء الحيوي. [ 26 ] يمكن أن يُؤدي الانتقاء المعدني، أو تفضيل معادن مُعينة، إلى خلق بؤر ساخنة للحياة الميكروبية في أماكن مثل باطن الأرض. لا تُساهم هذه التفاعلات في استقرار الأغشية الحيوية فحسب، بل تُؤثر أيضًا على مصير الملوثات وكفاءة استراتيجيات المعالجة الحيوية. [ 24 ]
تاريخ الأرض المبكر وعلم الأحياء الفلكي

يُعدّ أصل الحياة على الأرض أو الكواكب الأخرى مجالًا شائعًا للدراسة في علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية. وتُعتبر تفاعلات الصخور مع الماء المختلفة، مثل عملية التمعدن السربنتيني والتحلل الإشعاعي للماء ، [ 12 ] مصادر محتملة للطاقة الأيضية التي تدعم المجتمعات الميكروبية الكيميائية ذاتية التغذية على الأرض في بداياتها وعلى أجرام سماوية أخرى مثل المريخ وأوروبا وإنسيلادوس. [ 28 ] [ 29 ]
تُسجّل التفاعلات بين الميكروبات والرواسب بعضًا من أقدم الأدلة على وجود الحياة على الأرض. وتُسجّل معلومات عن الحياة خلال حقبة الأركي في أحافير بكتيرية وستروماتوليتات محفوظة في صخور مترسبة مثل الصوان أو الكربونات. [ 30 ] [ 31 ] ويمكن العثور على أدلة إضافية على وجود حياة مبكرة على اليابسة منذ حوالي 3.5 مليار سنة في تكوين دريسر في أستراليا ضمن بيئة الينابيع الحارة، مما يشير إلى أن بعضًا من أقدم أشكال الحياة على اليابسة على الأرض نشأت في الينابيع الحارة. [ 32 ] وتوجد التراكيب الرسوبية المُستحثة ميكروبيًا (MISS) في جميع أنحاء السجل الجيولوجي الذي يصل عمره إلى 3.2 مليار سنة. وتتشكل هذه التراكيب من خلال تفاعل الحصائر الميكروبية وديناميكيات الرواسب الفيزيائية، وتسجل بيانات بيئية قديمة، بالإضافة إلى تقديم أدلة على وجود حياة مبكرة. [ 33 ] كما تُستخدم البيئات القديمة للحياة المبكرة على الأرض كنماذج عند البحث عن أحافير محتملة للحياة على المريخ.
محبو التطرف

يُعدّ دراسة الكائنات الدقيقة المحبة للظروف القاسية مجالًا آخر للبحث في علم الأحياء الجيولوجي الدقيق ، وهي الكائنات التي تزدهر في بيئات تُعتبر عادةً معادية للحياة. قد تشمل هذه البيئات بيئات شديدة الحرارة (مثل الينابيع الحارة أو المدخنات السوداء في منتصف المحيط )، أو بيئات شديدة الملوحة ، أو حتى بيئات فضائية مثل تربة المريخ أو المذنبات . [ 4 ]
أظهرت الملاحظات والأبحاث في بيئات البحيرات شديدة الملوحة في البرازيل وأستراليا ، بالإضافة إلى بيئات البحيرات الداخلية قليلة الملوحة في شمال غرب الصين ، أن البكتيريا اللاهوائية المختزلة للكبريتات قد تكون متورطة بشكل مباشر في تكوين الدولوميت . [ 35 ] يشير هذا إلى أن تغيير واستبدال رواسب الحجر الجيري بعملية الدولوميتة في الصخور القديمة ربما تم بمساعدة أسلاف هذه البكتيريا اللاهوائية. [ 36 ]
في يوليو/تموز 2019، كشفت دراسة علمية أجريت في منجم كيد بكندا عن وجود كائنات حية تتنفس الكبريت ، تعيش على عمق 7900 قدم تحت سطح الأرض، وتعتمد على الكبريت في غذائها للبقاء على قيد الحياة. وتتميز هذه الكائنات أيضاً بتناولها صخوراً مثل البيريت كمصدر غذائي أساسي. [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ]
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ سميث، هـ. إي. ك.؛ تيريل، ت.؛ شارالامبوبولو، أ.؛ دوموسو، س.؛ ليج، أو. ج.؛ بيرشينو، س.؛ بيتيت، ل. ر.؛ جارلي، ر.؛ هارتمان، س. إي.؛ هارتمان، م. س.؛ ساجو، ن.؛ دانيلز، س. ج.؛ أختيربيرج، إي. ب.؛ هايدز، د. ج. (21 مايو 2012). "غلبة الكوكوليثوفورات شديدة التكلس عند انخفاض تشبع كربونات الكالسيوم خلال فصل الشتاء في خليج بسكاي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 109 (23): 8845-8849 . Bibcode : 2012PNAS..109.8845S . doi : 10.1073/pnas.1117508109 . PMC 3384182 . PMID 22615387 .
- 1 2 غاد، جي إم (2010). "المعادن والمعادن والميكروبات: علم الأحياء الدقيقة الجيولوجي والمعالجة الحيوية" . علم الأحياء الدقيقة . 156 (3): 609-43 . doi : 10.1099/mic.0.037143-0 . PMID 20019082 .
- ↑ هيئة المسح الجيولوجي الأمريكية (2007). "مواجهة تحديات الغد - علوم هيئة المسح الجيولوجي الأمريكية في العقد 2007-2017" . منشور هيئة المسح الجيولوجي الأمريكية . 1309 : 58.
- 1 2 كونهاوزر، ك. (2007). مقدمة في علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية . مالدن، ماساتشوستس: بلاكويل للنشر. ISBN 978-1-4443-0902-7.
- 1 2 كاكسونين، أ.هـ؛ بوهاكا، ج.أ. (2007). "العمليات الحيوية القائمة على اختزال الكبريتات لمعالجة تصريف المياه الحمضية من المناجم واستخلاص المعادن". الهندسة في علوم الحياة . 7 (6): 541-564 . Bibcode : 2007EngLS...7..541K . doi : 10.1002/elsc.200720216 . S2CID 95354248 .
- ↑ برنامج "التخفيف من آثار تغير المناخ في الزراعة (MICCA)" . منظمة الأغذية والزراعة للأمم المتحدة . مؤرشف من الأصل بتاريخ 3 أكتوبر 2019. تم الاطلاع عليه بتاريخ 2 أكتوبر 2019 .
- ↑ كانفيلد، دي إي؛ كريستنسن، إي؛ ثامدروب، بي. (2005). علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية المائية . المجلد 48 (نُقل إلى طبعة رقمية مطبوعة). لندن: دار النشر الأكاديمية إلسيفير. الصفحات 1-599 . doi : 10.1016/S0065-2881(05)48017-7 . ISBN 978-0-12-158340-8PMID 15797449
{{cite book}}تم|journal=تجاهله ( مساعدة ) - ↑ غراي، سي جيه؛ إنجل، إيه إس (2013). "التنوع الميكروبي وتأثيره على جيوكيمياء الكربونات عبر تدرج جيوكيميائي متغير في طبقة مياه جوفية كارستية" . مجلة ISME . 7 (2): 325-337 . Bibcode : 2013ISMEJ...7..325G . doi : 10.1038/ismej.2012.105 . PMC 3555096. PMID 23151637 .
- ↑ جونسون، إتش بي؛ برويس، إم جيه (2003). "تدفقات السوائل والحرارة من خزان القشرة المحيطية". رسائل علوم الأرض والكواكب . 216 (4): 565-574 . Bibcode : 2003E & PSL.216..565J . doi : 10.1016/S0012-821X(03)00545-4 .
- ↑ سميث، أ. ر.؛ فيسك، م. ر.؛ ثوربر، أ. ر.؛ فلوريس، ج. إ.؛ ماسون، أ. يو.؛ بوبا، ر.؛ كولول، ف. س. (2016). "تخضع المجتمعات القشرية العميقة لسلسلة جبال خوان دي فوكا لعلم المعادن". علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية . 34 (2): 147-156 . doi : 10.1080/01490451.2016.1155001 . S2CID 131278563 .
- ↑ راولينغز، دي إي (2005). "خصائص وقدرة الكائنات الدقيقة المؤكسدة للحديد والكبريت على التكيف، المستخدمة لاستخلاص المعادن من الخامات ومركزاتها" . مصانع الخلايا الميكروبية . 4 (13): 13. doi : 10.1186/1475-2859-4-13 . PMC 1142338. PMID 15877814 .
- 1 2 كولول، إف إس؛ ديهوندت، إس. (2013). "طبيعة ومدى المحيط الحيوي العميق". مراجعات في علم المعادن والكيمياء الجيولوجية . 75 (1): 547-574 . Bibcode : 2013RvMG...75..547C . doi : 10.2138/rmg.2013.75.17 .
- ^ راجالا، بولينا؛ بومبيرج، مالين؛ فيبسالاينن، ميكو؛ كاربن، لينا (2017). "التلوث الميكروبي وتآكل الفولاذ الكربوني في المياه الجوفية القلوية العميقة غير المؤكسدة". الحشف الحيوي . 33 (2): 195– 209. بيب كود : 2017Biofo..33..195R . دوى : 10.1080/08927014.2017.1285914 . بميد 28198664 . S2CID 3312488 .
- ↑ تشيونغ، كيه إتش؛ غو، جي دونغ (2007). "آلية إزالة سمية الكروم سداسي التكافؤ بواسطة الكائنات الدقيقة وإمكانية تطبيق المعالجة الحيوية: مراجعة". التدهور البيولوجي والتحلل البيولوجي الدولي . 59 (1): 8-15 . Bibcode : 2007IBiBi..59....8C . doi : 10.1016/j.ibiod.2006.05.002 .
- ↑ الطاشي، ح؛ جوشي، س. ج؛ براسيجوس، ب؛ الأنصاري، أ (2016). "الجيوميكروبيولوجيا لتلوث الكروم (VI): التنوع الميكروبي وإمكاناته في المعالجة الحيوية" . مجلة التكنولوجيا الحيوية المفتوحة . 10 (ملحق 2، M10): 379-389 . doi : 10.2174/1874070701610010379 .
- ↑ تشوبولا، جي؛ بولان، إن؛ بارك، جيه إتش (2013). "تلوث الكروم وتقييم مخاطره في البيئات المعقدة". في: سباركس، دونالد إل (محرر). التقدم في علم الزراعة . المجلد 120. إلسيفير. الصفحات 129-172 . doi : 10.1016/B978-0-12-407686-0.00002-6 . ISBN 978-0-12-407686-0.
- ↑ لوبتاكوفا، أ؛ كوسنيروفا، م (2005). "المعالجة الحيوية لمياه الصرف الحمضية الملوثة بالبكتيريا المختزلة للكبريتات". علم استخلاص المعادن بالمعالجة المائية . 77 ( 1-2 ): 97-102 . Bibcode : 2005HydMe..77...97L . doi : 10.1016/j.hydromet.2004.10.019 .
- ↑ كانفيلد، دي إي (2001). "الكيمياء الحيوية لنظائر الكبريت". مراجعات في علم المعادن والكيمياء الجيولوجية . 43 (1): 607-636 . Bibcode : 2001RvMG...43..607C . doi : 10.2138/gsrmg.43.1.607 .
- ↑ ليهي، جي جي؛ كولول، آر آر (1990). " التحلل الميكروبي للهيدروكربونات في البيئة" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة . 54 (3): 305-315 . doi : 10.1128/mr.54.3.305-315.1990 . PMC 372779. PMID 2215423 .
- سيلفر ، سيمون؛ فونغ، لي تي. (ديسمبر 2005). " نظرة بكتيرية على الجدول الدوري: الجينات والبروتينات للأيونات غير العضوية السامة" . مجلة علم الأحياء الدقيقة الصناعية والتكنولوجيا الحيوية . 32 ( 11-12 ): 587-605 . doi : 10.1007/s10295-005-0019-6 . ISSN 1367-5435 .
- ^ تيان، جينغيو؛ دو، ينبين؛ يو، كايهونج؛ ليو، ون تشينغ؛ زو، رويهونج؛ تشاو، يون فنغ؛ تشانغ، تاو؛ جيانغ، يوكونغ؛ تيان ، تشيجون (أبريل 2025). "تأثيرات المعادن الثقيلة على ميكروبات التربة C، N، P ومقاومة المعادن الثقيلة في ظل أنظمة التسميد المختلفة" . التلوث البيئي . 370 125915. دوى : 10.1016/j.envpol.2025.125915 . بميد 39993708 .
- 1 2 باندي، فيني؛ باندي، ساتيش تشاندرا؛ ساتي، ديكشا؛ بهات، بانكاج؛ سامانت، موكيش (2022-05-06). " التدخلات الميكروبية في المعالجة الحيوية لملوثات المعادن الثقيلة في النظم الإيكولوجية الزراعية" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 13. doi : 10.3389/fmicb.2022.824084 . ISSN 1664-302X . PMC 9120775. PMID 35602036 .
- 1 2 3 4 بوران، حامد م (2018)، "التفاعل بين الخلية البكتيرية والمعادن، وتأثيراته على تكوين الأغشية الحيوية والمعالجة الحيوية" ، في حسين، شودري مستنصر (محرر)، دليل إدارة المواد البيئية ، تشام: دار نشر سبرينغر الدولية، ص 1-22 ، doi : 10.1007/978-3-319-58538-3_80-1 ، ISBN 978-3-319-58538-3تم الاطلاع عليه بتاريخ 29 أبريل 2025
- 1 2 3 كاسار، كايتلين ب.؛ كروجر، بريتاني ر.؛ أوزبورن، ماجدالينا ر. (2021-04-09). " الأغشية الحيوية تحت السطحية المُحتضنة في الصخور: الانتقائية المعدنية تُحفز بؤر الحياة داخل الأرض" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 12. doi : 10.3389/fmicb.2021.658988 . ISSN 1664-302X . PMC 8062869. PMID 33897673 .
- ↑ بورغاردت، نويليا إي.؛ ميليان، نويليا أ.؛ غونزاليس فليشا، إف. لويس (أغسطس 2024). "مقاومة النحاس في البرد: تحليل الجينوم وتوصيف إنزيم ATPase من نوع P IB-1 في نبات بيزونيا أرجنتينينسيس" . تقارير علم الأحياء الدقيقة البيئية . 16 (4). Bibcode : 2024EnvMR..16E3278B . doi : 10.1111/1758-2229.13278 . ISSN 1758-2229 . PMC 11213822. PMID 38943264 .
- 1 2 تشين، جيان وين؛ لي، جون جيان؛ تشانغ، هونغ؛ شي، وي؛ ليو، يونغ (2019-08-20). " جينات مقاومة البكتيريا للمعادن الثقيلة والمضادات الحيوية في منطقة سد مخلفات النحاس في شمال الصين" . مجلة فرونتيرز في علم الأحياء الدقيقة . 10. doi : 10.3389/fmicb.2019.01916 . ISSN 1664-302X . PMC 6710345. PMID 31481945 .
- ^ بيوتي دينه، أنطوان؛ هيرولد، مالطة؛ كريستيل، ستيفان؛ الحجامي، محمد ال. بيلينبيرج، سورين؛ إيلي، أولغا؛ ويلمز، بول؛ بوتش، أنسجار؛ ساند، وولفجانج؛ فيرا، ماريو؛ بيفكين، ايجور V.؛ دوبسون ، مارك (2020-07-07). "بيولوجيا أنظمة الأغشية الحيوية الحمضية لاستخراج المعادن بكفاءة" . بيانات علمية . 7 (1): 215. بيب كود : 2020NatSD...7..215B . دوى : 10.1038/s41597-020-0519-2 . ISSN 2052-4463 . بمك 7340779 . بميد 32636389 .
- ↑ ماكولوم، توماس م.؛ كريستوفر، دونالدسون (2016). "توليد الهيدروجين والميثان خلال تفاعل تجريبي منخفض الحرارة للصخور فوق المافية مع الماء". علم الأحياء الفلكي . 16 (6): 389-406 . Bibcode : 2016AsBio..16..389M . doi : 10.1089/ast.2015.1382 . PMID 27267306 .
- ↑ أونستوت، تي سي؛ ماكغاون، دي؛ كيسلر، جيه؛ شيروود لولار، بي؛ ليمان، كيه كيه؛ كليفورد، إس إم (2006). "غاز الميثان المريخي: المصادر، والتدفق، والكشف". علم الأحياء الفلكي . 6 (2): 377-395 . Bibcode : 2006AsBio...6..377O . doi : 10.1089/ast.2006.6.377 . PMID 16689653 .
- ↑ نوفكي، نورا (2007). "البنى الرسوبية المُستحثة ميكروبيًا في الأحجار الرملية الأركية: نافذة جديدة على الحياة المبكرة". أبحاث غوندوانا . 11 (3): 336-342 . Bibcode : 2007GondR..11..336N . doi : 10.1016/j.gr.2006.10.004 .
- ↑ بونتونيالي، تي آر آر؛ سيشنز، إيه إل؛ ألوود، إيه سي؛ فيشر، دبليو دبليو؛ غروتزينغر، جيه بي؛ سامونز، آر إي؛ إيلر، جيه إم (2012). "نظائر الكبريت في المادة العضوية المحفوظة في ستروماتولي عمرها 3.45 مليار سنة تكشف عن استقلاب ميكروبي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 109 ( 38): 15146-15151 . Bibcode : 2012PNAS..10915146B . doi : 10.1073/pnas.1207491109 . PMC 3458326. PMID 22949693 .
- ↑ دجوكيتش، تارا؛ فان كرانيندونك، مارتن جيه؛ كامبل، كاثلين إيه؛ والتر، مالكولم آر؛ وارد، كولين آر (2017). "أقدم علامات الحياة على اليابسة محفوظة في رواسب الينابيع الساخنة التي يعود تاريخها إلى حوالي 3.5 مليار سنة" . نيتشر كوميونيكيشنز . 8 15263. Bibcode : 2017NatCo...815263D . doi : 10.1038/ncomms15263 . PMC 5436104. PMID 28486437 .
- ↑ نوفكي، نورا؛ كريستيان، دانيال؛ ويسي، ديفيد؛ هازن، روبرت م. (2013). "البنى الرسوبية المُستحثة ميكروبيًا التي تُسجل نظامًا بيئيًا قديمًا في تكوين دريسر الذي يبلغ عمره حوالي 3.48 مليار سنة، بيلبارا، غرب أستراليا" . علم الأحياء الفلكي . 13 (12): 1103-1124 . Bibcode : 2013AsBio..13.1103N . doi : 10.1089/ast.2013.1030 . PMC 3870916. PMID 24205812 .
- ↑ توماس د. بروك . "يلوستون الملونة" . الحياة في درجات الحرارة المرتفعة . مؤرشف من الأصل بتاريخ 25-11-2005.
- ↑ دينغ، س؛ دونغ، هـ؛ هونغتشين، ج؛ بينغسونغ، ي؛ بيشوب، م (2010). "ترسيب الدولوميت الميكروبي باستخدام البكتيريا المختزلة للكبريتات والمحبة للملوحة: نتائج من بحيرة كويغهاي، هضبة التبت، شمال غرب الصين". الجيولوجيا الكيميائية . 278 ( 3-4 ): 151-159 . Bibcode : 2010ChGeo.278..151D . doi : 10.1016/j.chemgeo.2010.09.008 .
- ↑ ديلون، جيسي (2011). "دور اختزال الكبريتات في الستروماتوليت والحصائر الميكروبية: منظورات قديمة وحديثة". في: تيواري، ف.؛ سيكباخ، ج. (محرران). الستروماتوليت: تفاعل الميكروبات مع الرواسب . الأصل الخلوي، والحياة في البيئات القاسية، وعلم الأحياء الفلكي. المجلد 18. الصفحات 571-590 . doi : 10.1007/978-94-007-0397-1_25 . ISBN 978-94-007-0396-4.
- ↑ لولار، غارنيت س.؛ وار، أوليفر؛ تيلينغ، جون؛ أوزبورن، ماغدالينا ر.؛ لولار، باربرا شيروود (2019). "«تتبع الماء»: القيود الهيدروجيولوجية الكيميائية على الدراسات الميكروبية على عمق 2.4 كم تحت سطح الأرض في مرصد كيد كريك للسوائل العميقة والحياة العميقة. مجلة الجيوميكروبيولوجيا . 36 (10): 859-872 . Bibcode : 2019GmbJ...36..859L . doi : 10.1080/01490451.2019.1641770 . S2CID 199636268 .
- ↑ "أقدم مياه جوفية في العالم تدعم الحياة من خلال التفاعل الكيميائي بين الماء والصخور" . مرصد الكربون العميق . 29 يوليو 2019. مؤرشف من الأصل في 7 مارس 2023. تم الاطلاع عليه في 1 مارس 2025 .
- ↑ باول، كوري س. (2019-09-07). "أشكال حياة غريبة عُثر عليها في أعماق منجم تشير إلى وجود "جزر غالاباغوس" شاسعة تحت الأرض"" . أخبار إن بي سي . تم الاسترجاع في 1 مارس 2025 .
للمزيد من القراءة
- إيرليخ، هنري لوتز؛ نيومان، ديان ك.، محرران. (2008). علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية ( الطبعة الخامسة). هوبوكين: تايلور وفرانسيس المحدودة. ISBN 978-0-8493-7907-9.
- جاين، سودير ك.؛ خان، عبد العارف؛ راي، ماهيندرا ك. (2010). علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية . إنفيلد، نيو هامبشاير: دار النشر العلمية. ISBN 978-1-4398-4510-3.
- كيرشمان، ديفيد ل. (2012). العمليات في علم البيئة الميكروبية . أكسفورد: مطبعة جامعة أكسفورد. ISBN 978-0-19-958693-6.
- لوي، ألكسندر؛ ماندل، مارتن؛ بارتون، لاري ل.، محرران. (2010). علم الأحياء الدقيقة الجيولوجي: منظور جزيئي وبيئي . دوردريخت: سبرينغر. ISBN 978-90-481-9204-5.
- ناجينا، بارمار؛ أجاي، سينغ، محرران. (2014). علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية والكيمياء الحيوية الجيولوجية . برلين، هايدلبرغ: سبرينغر برلين هايدلبرغ. ISBN 978-3-642-41837-2.
روابط خارجية
- قد تتشكل مناجم الذهب بفعل البكتيريا - ملف PDF
- التمعدن الحيوي للمعادن المغناطيسية ( مؤرشف بتاريخ 11 يناير 2007 في أرشيف الإنترنت)
- علم الأحياء الدقيقة الجيولوجية
