فوسيدا

تُدمج قاعدة بيانات PHOSIDA ، المتخصصة في فسفرة البروتينات ، آلاف مواقع الفسفرة عالية الموثوقية التي تم تحديدها في كائنات حية مختلفة باستخدام تقنية قياس الطيف الكتلي . لكل موقع فسفرة، تُدرج PHOSIDA أنماط الكيناز المطابقة ، والبنى الثانوية المتوقعة، وأنماط الحفظ، وتنظيمه الديناميكي استجابةً للمحفزات أو المعالجات الأخرى، مثل تثبيط الكيناز. وتشمل هذه القاعدة بروتينات الفسفرة لكائنات حية متنوعة، بدءًا من حقيقيات النوى كالإنسان والخميرة، وصولًا إلى البكتيريا كالإشريكية القولونية واللاكتوكوكوس اللبني . بل إنها تُوفر أيضًا بروتينات الفسفرة لكائن حي من العتائق، وهو بكتيريا هالوباكتيريوم ساليناريوم . يُمكّن دمج بروتينات الفسفرة المُحددة في الكائنات الحية، والتي تُغطي الشجرة التطورية بشكل تمثيلي، من دراسة أحداث الفسفرة من منظور شامل، بما في ذلك الحفظ والتطور عبر الزمن. [ 1 ]

علاوة على ذلك، يتنبأ برنامج PHOSIDA أيضًا بمواقع الفسفرة على أساس آلات المتجهات الداعمة .

مراجع

  1. 1 2 غناد، فلوريان؛ غوناواردينا، جيريمي؛ مان، ماتياس (يناير 2011). "فوسيدا 2011: قاعدة بيانات التعديلات ما بعد الترجمة" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 39 (عدد قواعد البيانات): D253-60. doi : 10.1093/nar/gkq1159 . PMC 3013726. PMID 21081558 .