RuvABC

📅 آخر تحديث: ٤ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٤ أغسطس ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 1 صور
الموسوعة الحرة

يُعدّ RuvABC مُركّباً من ثلاثة بروتينات تُسهّل هجرة الفروع وتُحلّ وصلة هوليداي التي تتكوّن أثناء إعادة التركيب المتماثل في البكتيريا. [ 1 ] ولذلك، يُعتبر RuvABC بالغ الأهمية لإصلاح الحمض النووي البكتيري .

متغاير معقد RuvA-RuvB، ثيرموس ثيرموفيلوس

يرتبط بروتينا RuvA وRuvB ببنية الحمض النووي الرباعية المتكونة في مرحلة وسيطة من وصلة هوليداي، ويُحركان الخيوط عبر بعضها البعض، باستخدام آلية لفّ افتراضية. [ 2 ] يستطيع مُركّب RuvAB القيام بنشاط إنزيم فكّ اللولب ، مما يُساعد على فكّ لولب الحمض النووي المزدوج. يُعتقد أن ارتباط بروتين RuvC بمُركّب RuvAB يُؤدي إلى قطع خيوط الحمض النووي، وبالتالي حلّ وصلة هوليداي.

مركب بروتيني

يُعدّ RuvABC مُركّبًا من ثلاثة بروتينات تعمل على حلّ وصلات هوليداي المتشكّلة أثناء إعادة التركيب المتماثل في البكتيريا . في بكتيريا الإشريكية القولونية ، تتوقّف شوكات تضاعف الحمض النووي مرة واحدة على الأقل في كل دورة خلوية، لذا يجب إعادة بدء تضاعف الحمض النووي لضمان بقاء الخلية. [ 3 ] إعادة بدء التضاعف عملية متعددة الخطوات في الإشريكية القولونية تتطلّب عملًا متسلسلًا لعدة بروتينات. عندما يتعثّر تقدّم شوكة التضاعف، يكون بروتين الربط أحادي السلسلة وإنزيم RecG الحلزوني، بالإضافة إلى مُركّب RuvABC، ضروريًا للإنقاذ. [ 3 ] يتطلّب حلّ وصلات هوليداي التي تتكوّن بعد التضاعف على قوالب الحمض النووي التالفة في الإشريكية القولونية مُركّب RuvABC. [ 4 ]

روفا

بروتين RuvA هو بروتين رابط للحمض النووي DNA، يرتبط بوصلات هوليداي بانجذاب عالٍ. وقد تم توضيح بنية هذا المركب باستخدام تقنيات مختلفة، منها علم البلورات بالأشعة السينية وبيانات المجهر الإلكتروني. [ 5 ] يشكل RuvA رباعيًا يرتبط بوصلة هوليداي ويجبرها على اتخاذ شكل مستوٍ. [ 2 ] [ 6 ] في بعض الحالات، يرتبط رباعي ثانٍ بالوجه المقابل للحمض النووي DNA، مكونًا غلافًا حول الوصلة. [ 2 ] [ 6 ] يحتوي رباعي RuvA على دبابيس حمضية بالقرب من مركزه، تُسهّل عملية فك الالتفاف وتساهم في خصوصية الركيزة. [ 1 ] [ 6 ]

روف ب

إنزيم RuvB هو إنزيم ATPase يعتمد على الحمض النووي ، ويُشكّل حلقة سداسية حول أذرع وصلة هوليداي. [ 2 ] [ 5 ] يُعتقد أن RuvB يضخ الحمض النووي عبر RuvA باستخدام الطاقة الناتجة عن تحلل ATP. هذا يحوّل الحمض النووي المتماثل إلى حمض نووي غير متماثل. [ 1 ]

RuvC

إنزيم RuvC هو الإنزيم المحلل الذي يقطع وصلة هوليداي. يرتبط RuvC بوصلات هوليداي على شكل ثنائي متجانس. [ 1 ] يحتوي هذا الثنائي المتجانس على موقعين نشطين للإنزيم الداخلي ، كل منهما قادر على إحداث قطع في سلسلتي الحمض النووي. [ 2 ] يمكن لـ RuvC الارتباط بالمركب بأي اتجاه، وبالتالي حل وصلات هوليداي أفقيًا أو رأسيًا. [ 5 ] توجد عدة نظريات حول كيفية وصول RuvC إلى مركب هجرة الفروع. [ 6 ] إحدى هذه النظريات هي أن رباعي RuvA يرتبط بجانب واحد فقط من الحمض النووي، تاركًا سطحًا مكشوفًا ليرتبط به RuvC. نظرية أخرى هي أن RuvA لا يحافظ على البنية الشبيهة بالقشرة التي يشكلها في البداية حول الوصلة، بل ينفتح ليسمح لـ RuvC بالوصول إلى الحمض النووي. [ 2 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 3 4 وايت، هايلي دي إم؛ ويست، ستيفن سي. (1 سبتمبر 2014). " إنزيمات حل تقاطع هوليداي" . وجهات نظر كولد سبرينغ هاربور في علم الأحياء . 6 (9) a023192. doi : 10.1101/cshperspect.a023192 . PMC 4142969. PMID 25183833 .  
  2. 1 2 3 4 5 6 هينكين، تينا م.؛ بيترز، جوزيف إي. (2020). "الآليات الجزيئية لإعادة التركيب المتماثل". علم الوراثة الجزيئية للبكتيريا ( الطبعة الخامسة). الجمعية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة. ص 371-373 . ISBN   978-1-68367-357-6.
  3. بيانكو ، بييرو ر.؛ لو، يو (7 مايو 2021). "نظرة على مستوى الجزيء الواحد لإنقاذ شوكة التضاعف المتوقفة في الإشريكية القولونية " . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 49 (8): 4220-4238 . doi : 10.1093/nar/ gkab142 . PMC 8096234. PMID 33744948 .  
  4. ↑ دونالدسون، جانيت ر.؛ كورسيل، شارمين ت.؛ كورسيل، جاستن (سبتمبر 2006). "يُعدّ RuvABC ضروريًا لحلّ تقاطعات هوليداي التي تتراكم بعد التضاعف على قوالب تالفة في الإشريكية القولونية " . مجلة الكيمياء البيولوجية . 281 (39): 28811-28821 . doi : 10.1074/jbc.M603933200 . PMID 16895921 . 
  5. 1 2 3 إيجلستون، أنجيلا ك؛ ميتشل، أليسون هـ؛ ويست، ستيفن س (مايو 1997). "إعادة بناء المراحل المتأخرة من إعادة التركيب الجيني في بكتيريا الإشريكية القولونية في المختبر" . مجلة الخلية . 89 (4): 607-617 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80242-1 . PMID 9160752 . 
  6. 1 2 3 4 يامادا، كازوهيرو؛ أريوشي، ماريكو؛ موريكاوا، كوسوكي (أبريل 2004). "مناظر هيكلية ثلاثية الأبعاد لهجرة الفروع وحلها في إعادة التركيب المتماثل للحمض النووي". الرأي الحالي في البيولوجيا الهيكلية . 14 (2): 130-137 . doi : 10.1016/j.sbi.2004.03.005 . PMID 15093826 . 

للمزيد من القراءة

  • ويست، ستيفن سي. (يونيو 2003). "نظرة جزيئية على بروتينات إعادة التركيب وآليات التحكم بها". مجلة نيتشر ريفيوز لعلم الأحياء الخلوي الجزيئي . 4 (6): 435-445 . doi : 10.1038/nrm1127 . PMID 12778123. S2CID 28474965 .  
  • كوالتشيكوفسكي، ستيفن سي (أبريل 2000). "بدء إعادة التركيب الجيني والتضاعف المعتمد على إعادة التركيب". اتجاهات في العلوم البيوكيميائية . 25 (4): 156-165 . doi : 10.1016/S0968-0004(00)01569-3 . PMID 10754547 .