تعدد الأشكال التوافقية أحادية السلسلة

يُعرَّف تعدد الأشكال التوافقية للسلسلة المفردة ( SSCP )، أو تعدد الأشكال السلسلية للسلسلة المفردة ، بأنه اختلاف في بنية تسلسلات النيوكليوتيدات أحادية السلسلة ذات الطول المتطابق، والذي ينتج عن اختلافات في التسلسلات في ظل ظروف تجريبية معينة. تسمح هذه الخاصية بتمييز التسلسلات باستخدام الرحلان الكهربائي الهلامي ، الذي يفصل الأجزاء وفقًا لبنيتها المختلفة. ^{[ 1 ]}

لا يمكن التمييز بين تغيير نيوكليوتيد واحد في تسلسل معين، كما هو الحال في الحمض النووي المزدوج، باستخدام تقنيات الفصل الكهربائي الهلامي ، ويعود ذلك إلى أن الخصائص الفيزيائية للسلسلتين المزدوجتين متطابقة تقريبًا لكلا الأليلين. بعد عملية التمسخ، يخضع الحمض النووي أحادي السلسلة لطيّ ثلاثي الأبعاد مميز، وقد يتخذ حالة بنيوية فريدة بناءً على تسلسل الحمض النووي الخاص به. يمكن أن يؤدي اختلاف الشكل بين سلسلتي حمض نووي أحاديتي السلسلة بتسلسلات مختلفة إلى اختلاف هجرتهما عبر هلام الفصل الكهربائي، حتى لو كان عدد النيوكليوتيدات متساويًا، وهذا في الواقع أحد تطبيقات تقنية SSCP.

كانت تقنية SSCP تُستخدم سابقًا لاكتشاف تعدد أشكال الحمض النووي (DNA) الجديد، إلى جانب تقنيات تسلسل الحمض النووي، ولكنها تُستبدل الآن بتقنيات التسلسل نظرًا لكفاءتها ودقتها. ^{[ 2 ]} في الوقت الحاضر، تُعد SSCP أداة تشخيصية أساسية في البيولوجيا الجزيئية . في فحص الطفرات، تُصمم فحوصات SSCP عادةً حول أجزاء PCR قصيرة، لأن حساسية الكشف تنخفض مع زيادة طول المُضخَّم؛ وقد وجدت التقييمات التقليدية أن الطول الأمثل يبلغ حوالي 150 زوجًا قاعديًا، وتشير المراجعات العلمية إلى أن الأجزاء التي يقل طولها عن 300 زوج قاعدي، ويفضل أن يكون أقل من 200 زوج قاعدي، هي النطاق العملي. ^{[ 3 ] [ 4 ]} يمكن استخدامها في تحديد النمط الجيني للكشف عن الأفراد متماثلي الزيجوت ذوي الحالات الأليلية المختلفة، بالإضافة إلى الأفراد غير متماثلي الزيجوت الذين يُفترض أن يُظهر كل منهم أنماطًا مميزة في تجربة الفصل الكهربائي. ^{[ 5 ]} يُستخدم تحليل تعدد الأشكال التوافقية أحادية السلسلة (SSCP) على نطاق واسع في علم الفيروسات للكشف عن الاختلافات في سلالات مختلفة من الفيروس، حيث تقوم الفكرة على أن جسيم فيروسي معين موجود في كلتا السلالتين سيخضع لتغيرات نتيجة للطفرة، وأن هذه التغيرات ستؤدي إلى اتخاذ الجسيمين أشكالًا مختلفة، وبالتالي، يمكن التمييز بينهما على هلام SSCP. ^{[ 6 ]}