بالات سلفولو
Sulfolobales هي رتبة من العتائق في فئة Thermoprotei . [ 1 ]
نسالة
يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) [ 2 ] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) [ 1 ].
| LTP القائم على 16S rRNA _06_2022 [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] | 53 بروتينًا دالًا على GTDB 10-RS226 [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
نقل الحمض النووي
يؤدي تعريض بكتيريا Sulfolobus solfataricus لعوامل تلف الحمض النووي ، كالأشعة فوق البنفسجية أو البليوميسين أو الميتوميسين سي، إلى تكتل الخلايا. [ 9 ] لا تُحفز عوامل الإجهاد الفيزيائي الأخرى، مثل تغيرات الرقم الهيدروجيني أو درجة الحرارة، التكتل، مما يشير إلى أن تلف الحمض النووي هو السبب الرئيسي لتكتل الخلايا. وقد أظهر أجون وآخرون [ 10 ] أن تكتل الخلايا الناتج عن الأشعة فوق البنفسجية يُحفز تبادل العلامات الكروموسومية بتردد عالٍ. وتجاوزت معدلات إعادة التركيب تلك الموجودة في المزارع غير المُحفزة بثلاثة أضعاف. وافترض كل من فرولز وآخرون [ 9 ] [ 11 ] وأجون وآخرون [ 10 ] أن عملية نقل الحمض النووي المُحفزة بالأشعة فوق البنفسجية، وما يتبعها من إصلاح متماثل، تُمثل آلية مهمة للحفاظ على سلامة الكروموسومات. قد يكون هذا التفاعل شكلاً بدائياً من أشكال التفاعل الجنسي، على غرار التحول البكتيري الذي دُرِسَ على نطاق أوسع، والذي يرتبط أيضاً بانتقال الحمض النووي بين الخلايا، مما يؤدي إلى إصلاح تلف الحمض النووي عن طريق إعادة التركيب المتماثل. وفي نوع آخر ذي صلة، وهو Sulfolobus acidocaldarius ، يزيد التعرض للأشعة فوق البنفسجية أيضاً من وتيرة إعادة التركيب نتيجة للتبادل الجيني. [ 12 ]
شركة UPS
يُحفَّز جين ups (الشعيرات المُحفَّزة بالأشعة فوق البنفسجية) في أنواع بكتيريا Sulfolobus بشكل كبير بواسطة الأشعة فوق البنفسجية. وتُستخدم الشعيرات المشفرة بواسطة هذا الجين في تعزيز التجمع الخلوي، وهو أمر ضروري لتبادل الحمض النووي بين الخلايا لاحقًا، مما يؤدي إلى إعادة التركيب المتماثل . [ 13 ]
أظهرت دراسةٌ لأوبيرون ups الخاص ببكتيريا Sulfolobales acidocaldarius أن أحد الجينات الواقعة أسفل الأوبيرون، وهو saci-1497 ، يُشفّر إنزيمًا نوويًا داخليًا من النوع III يقوم بقطع الحمض النووي المتضرر بالأشعة فوق البنفسجية؛ بينما يُشفّر جينٌ آخر من الأوبيرون، وهو saci-1500 ، إنزيمًا حالًا للولب شبيهًا بـ RecQ قادرًا على فكّ لولب وسائط إعادة التركيب المتماثل، مثل وصلات هوليداي . [ 13 ] وقد اقتُرح أن يعمل كلٌ من saci-1497 وsaci-1500 في آلية إصلاح الحمض النووي القائمة على إعادة التركيب المتماثل، والتي تستخدم الحمض النووي المنقول كقالب. [ 13 ] وبالتالي، يُعتقد أن نظام ups، بالاشتراك مع إعادة التركيب المتماثل، يُوفّر استجابةً لتلف الحمض النووي، مما يُنقذ بكتيريا Sulfolobales من التهديدات التي تُلحق الضرر بالحمض النووي. [ 13 ]
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 سايرز وآخرون . "سلفولوباليس" . قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 10 مايو 2023 .
- ↑ جيه بي أوزيبي. "سلفولوباليس" . قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 10 مايو 2023 .
- ↑ "برنامج التدريب طويل الأمد" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 مايو 2023 .
- ↑ "شجرة LTP_all بتنسيق نيوك" . تم الاطلاع عليها بتاريخ 10 مايو 2023 .
- ↑ "ملاحظات إصدار LTP_06_2022" (ملف PDF) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 مايو 2023 .
- ↑ "إصدار GTDB 10-RS226" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- ↑ "ar53_r226.sp_label" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- ↑ "تاريخ التصنيف" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- 1 2 فرولز إس، أجون إم، فاغنر إم، تيخمان دي، زولغادر بي، فوليا إم، بوكيما إي جيه، دريسن إيه جيه، شليبر سي، ألبرز إس في (2008). "التجمع الخلوي المحفز بالأشعة فوق البنفسجية للأركيا المحبة للحرارة المفرطة Sulfolobus solfataricus يتوسطه تكوين الشعيرات" (ملف PDF) . علم الأحياء الدقيقة الجزيئي . 70 (4): 938-52 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2008.06459.x . PMID 18990182 .
- 1 2 أجون م، فرولز س، فان وولفيرين م، ستوكر ك، تايخمان د، دريسن أ ج، غروغان د و، ألبرز س ف، شليبر س (2011). "تبادل الحمض النووي المحفز بالأشعة فوق البنفسجية في العتائق المحبة للحرارة المفرطة بوساطة الشعيرات من النوع الرابع" (ملف PDF) . علم الأحياء الدقيقة الجزيئي . 82 (4): 807-17 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2011.07861.x . PMID 21999488 .
- ↑ فرولز إس، وايت إم إف، شليبر سي (2009). "ردود الفعل تجاه أضرار الأشعة فوق البنفسجية في الأركيا النموذجية Sulfolobus solfataricus". معاملات الجمعية الكيميائية الحيوية 37 (الجزء 1): 36-41 . doi : 10.1042/BST0370036 . PMID 19143598 .
- ↑ وود إي آر، غاني إف، غروغان دي دبليو (1997). "الاستجابات الجينية للأركيا المحبة للحرارة Sulfolobus acidocaldarius للأشعة فوق البنفسجية ذات الطول الموجي القصير" . مجلة علم البكتيريا . 179 (18): 5693-5698 . doi : 10.1128/jb.179.18.5693-5698.1997 . PMC 179455. PMID 9294423 .
- 1 2 3 4 فان وولفيرين م، ما إكس، ألبرز إس في (2015). "بروتينات معالجة الحمض النووي المشاركة في استجابة الإجهاد الناجم عن الأشعة فوق البنفسجية في بكتيريا السلفولوباليس" . مجلة علم البكتيريا . 197 (18): 2941-51 . doi : 10.1128/JB.00344-15 . PMC 4542170. PMID 26148716 .
للمزيد من القراءة
المجلات العلمية
- اللجنة القضائية للجنة الدولية لتصنيف بدائيات النوى (2005). "الأنواع التصنيفية لرتب Acholeplasmatales وHalanaerobiales وHalobacteriales وMethanobacteriales وMethanococcales وMethanomicrobiales وPlanctomycetales وProchlorales وSulfolobales وThermococcales وThermoproteales وVerrucomicrobiales هي الأجناس Acholeplasma و Halanaerobium و Halobacterium و Methanobacterium و Methanococcus و Methanomicrobium و Planctomyces و Prochloron و Sulfolobus و Thermococcus و Thermoproteus و Verrucomicrobium ، على التوالي. الرأي رقم 79" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 55 (الجزء الأول): 517-518 . دوى : 10.1099/ijs.0.63548-0 . بميد 15653928 .
- دريسن، أرنولد. يانغ ، نوان (8 يناير 2014). “حذف جينات cdvB المشابهة لـ Sulfolobus acidocaldarius يضعف انقسام الخلايا”. المتطرفون . 18 (2): 331-339 . دوى : 10.1007 / s00792-013-0618-5 . اتش دي ال : 11370/1d8fcfed-2de2-454e-9f0b-f9b942d25d5c . بميد 24399085 . S2CID 14445065 .
- يوزيبي جيه بي؛ تيندال بي جيه (2001). "النوع التسمي للأوامر: التصحيحات اللازمة وفقًا للقاعدتين 15 و21أ من مدونة علم البكتيريا (مراجعة 1990)، وتحديد الأنواع التسميوية المناسبة للفئات والفئات الفرعية. طلب رأي" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 51 (الجزء 2): 725-727 . doi : 10.1099/00207713-51-2-725 . PMID 11321122 .
- كافاليير-سميث، ت. (2002). "الأصل النيوموري للبكتيريا القديمة، والجذر النيجيبكتيري للشجرة العالمية، والتصنيف الضخم للبكتيريا" . المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 52 (الجزء 1): 7-76 . doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
الكتب العلمية
- ريسنباخ، أ. ل. (2001). "الفئة الأولى. فئة ثيرموبروتي الجديدة" . في: د. ر. بون؛ ر. و . كاستنهولز (محرران). دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا، المجلد 1: العتائق والبكتيريا المتفرعة بعمق والبكتيريا الضوئية ( الطبعة الثانية). نيويورك: سبرينغر فيرلاغ. ص 169. ISBN 978-0-387-98771-2.
- ستيتر، ك.و. (1989). "الرتبة الثالثة. سلفولوباليس، رتبة جديدة. عائلة سلفولوباسيا، عائلة جديدة". في: ج. ت. ستالي؛ م. ب. براينت؛ ن. بفينيغ؛ ج. ج. هولت (محررون). دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا . المجلد 3 ( الطبعة الأولى). بالتيمور: شركة ويليامز وويلكنز. ص 169.
- رتب تصنيف العتائق
- ثيرموبروتيوتا