مؤشر الملف التحليلي

مؤشر الملف التحليلي ( API ) هو نظام تصنيف للبكتيريا يعتمد على الاختبارات البيوكيميائية. طُوّر هذا النظام لتسريع عملية تحديد البكتيريا ذات الأهمية السريرية . يُستخدم فقط لتحديد الأنواع المعروفة من خلال مؤشر. [ 1 ] البيانات المُستقاة هي سمات ظاهرية . تُستخدم طرق تسلسل الحمض النووي ، بما في ذلك تحديد النمط التسلسلي متعدد المواقع وحتى تسلسل الجينوم الكامل ، بشكل متزايد في تحديد أنواع وسلالات البكتيريا. يمكن استخدام هذه الطرق الحديثة لتكملة أو حتى استبدال استخدام اختبار API في البيئات السريرية.
تاريخ
تم ابتكار مؤشر الملف التحليلي (API) في سبعينيات القرن الماضي في الولايات المتحدة الأمريكية على يد بيير جانين من شركة Analytab Products Inc. [ 2 ] ويتم تصنيع نظام اختبار API حاليًا بواسطة شركة bioMérieux . [ 3 ] وقد قدمت مجموعة API نسخة موحدة ومصغرة من التقنيات الموجودة، والتي كانت تعتبر معقدة في التنفيذ ويصعب قراءتها.
وصف
لا يمكن تحديد نوع البكتيريا إلا من خلال زراعة ميكروبيولوجية . تتكون شرائط اختبار API من حُفر تحتوي على ركائز مجففة، مثل ركائز الأكسدة والاختزال، والركائز المولدة للكهرباء، والركائز المضيئة، وذلك للكشف عن النشاط الإنزيمي ، المرتبط عادةً بتخمر الكربوهيدرات أو هدم البروتينات أو الأحماض الأمينية بواسطة الكائنات الحية المُلقحة. يُستخدم معلق بكتيري لإعادة ترطيب كل حفرة، ثم تُحضن الشرائط. خلال فترة التحضين، ينتج عن عملية الأيض تغيرات لونية، إما تلقائية أو تُكشف بإضافة الكواشف. على سبيل المثال، عند تخمر الكربوهيدرات، ينخفض الرقم الهيدروجيني داخل الحفرة، ويُشار إلى ذلك بتغير لون مؤشر الرقم الهيدروجيني. تُجمع جميع نتائج الاختبار للحصول على رقم تعريف، والذي يُقارن بعد ذلك بأرقام التعريف في دليل ترميز تجاري (أو عبر الإنترنت) لتحديد نوع البكتيريا. [ 4 ]
API-20E
قبل البدء بالاختبار، يجب التأكد من أن البكتيريا المزروعة تنتمي إلى عائلة الأمعائيات (Enterobacteriaceae)، ويتم ذلك عن طريق اختبار سريع للأكسيداز لسيتوكروم سي أوكسيداز . عادةً ما تكون الأمعائيات سالبة الأكسيداز، مما يعني أنها إما لا تستخدم الأكسجين كمستقبل للإلكترونات في سلسلة نقل الإلكترون ، أو أنها تستخدم إنزيم سيتوكروم مختلفًا لنقل الإلكترونات إلى الأكسجين. [ 5 ] إذا تبين أن المزرعة موجبة الأكسيداز، فيجب إجراء اختبارات بديلة لتحديد نوع البكتيريا بدقة. يُعد نظام API-20E متخصصًا في التمييز بين أفراد عائلة البكتيريا سالبة الغرام الأمعائية . [ 6 ] [ 7 ] أما نظام API-Staph، فهو متخصص في البكتيريا موجبة الغرام ، بما في ذلك أنواع المكورات العنقودية ، وأنواع المكورات الدقيقة ، والكائنات الحية ذات الصلة. [ 7 ]
API 20E/NE
يُعد نظام API 20E/NE نظام اختبار بيوكيميائي واسع الانتشار، مصمم للتعرف السريع على البكتيريا سالبة الغرام. ويستهدف تحديدًا مجموعتين: البكتيريا المعوية (API 20E) والبكتيريا غير المعوية (API 20NE). يُعد هذا النظام مفيدًا بشكل خاص في علم الأحياء الدقيقة السريري والدراسات البيئية لتحديد البكتيريا بناءً على أنشطتها البيوكيميائية.
كيف يعمل
- شرائط الاختبار: يتكون النظام من شريط بلاستيكي يحتوي على 20 أنبوب تفاعل صغير (أنابيب دقيقة)، يحتوي كل منها على ركائز مجففة مختلفة.
- إعادة الترطيب والتلقيح: لإجراء الاختبار، تُعاد ترطيب الأنابيب الدقيقة بمحلول معلق من البكتيريا. صُمم كل أنبوب دقيق للكشف عن أنشطة إنزيمية محددة أو تخمير الكربوهيدرات الذي يميز البكتيريا قيد الاختبار.
- الحضانة: بعد التلقيح، تُحضن الشريحة لفترة تتراوح عادةً بين 18 و24 ساعة، عند درجة حرارة محددة (غالباً 35-37 درجة مئوية). خلال فترة الحضانة، تتفاعل البكتيريا مع الركائز، مما يؤدي إلى تغيرات لونية مرئية في حال حدوث التفاعلات.
- قراءة النتائج: بعد فترة الحضانة، تُفسَّر النتائج بملاحظة تغيرات اللون في كل أنبوب، والتي تدل على تفاعلات إيجابية أو سلبية. تُقارن أنماط التفاعلات بقاعدة بيانات مرجعية لتحديد الكائن الحي.
- التعريف: يتم تسجيل كل تفاعل رقميًا، وتشكل النتيجة التراكمية رقمًا تعريفيًا، والذي يستخدم بعد ذلك لتحديد الكائن الحي من خلال قاعدة بيانات أو برنامج تعريف.
مراجع
- ↑ "مكتشف اختبارات واجهة برمجة التطبيقات | فهرس الملفات التحليلية | BacDive" . bacdive.dsmz.de . تم الاطلاع عليه بتاريخ 8 مارس 2024 .
- ↑ US3936356A ، جانين، بيير ر.، "طريقة وجهاز التعرف على الملامح لتحديد البكتيريا"، صدر في 3 فبراير 1976
- ↑ "شرائط API® - الابتكار - التشخيص السريري من شركة بيوميريو" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 25 مايو 2009. تم الاطلاع عليه بتاريخ 9 نوفمبر 2009 .
- ↑ تانكيشوار، أشاريا (28-02-2024). "API وRAPID ID لتحديد هوية الميكروبات • Microbe Online" . Microbe Online . تم الاسترجاع في 08-03-2024 .
- ↑ أوكتافيا، صوفي؛ لان، رويتينغ (2014). "عائلة الأمعائيات" . بدائيات النوى . ص 225-286 . doi : 10.1007/978-3-642-38922-1_167 . ISBN 978-3-642-38921-4.
- ↑ هولمز، ب؛ ويلكوكس، و.ر؛ لاباج، س.ب (1978-01-01). "تحديد البكتيريا المعوية باستخدام نظام API 20E" . مجلة علم الأمراض السريرية . 31 ( 1): 22-30 . doi : 10.1136/jcp.31.1.22 . ISSN 0021-9746 . PMC 476713. PMID 342546 .
- 1 2 "دليل مرجع API الإصدار 7" (PDF) . بيوميريو . 2019.
للمزيد من القراءة
- البكتيريا
- تفاعلات الكشف عن الكيمياء الحيوية
- تقنيات علم الأحياء الدقيقة
- علم التصنيف (علم الأحياء)
