تسلسل الجينوم الكامل

📅 آخر تحديث: ٢٣ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٣ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 10 صور
الموسوعة الحرة
تُستخدم مخططات الفصل الكهربائي بشكل شائع لتحديد تسلسل أجزاء من الجينومات. [ 1 ]
مخطط الكروموسوم
الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) هو المادة الوراثية للخلية، ويوجد في الكروموسومات داخل نواة الخلية والميتوكوندريا. باستثناء بعض الخلايا (مثل الحيوانات المنوية والبويضات)، تحتوي نواة الخلية على 23 زوجًا من الكروموسومات. يحتوي الكروموسوم على العديد من الجينات. الجين هو جزء من الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) يحمل الشفرة اللازمة لبناء بروتين أو جزيء RNA. جزيء الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) عبارة عن حلزون مزدوج طويل ملتف يشبه السلم الحلزوني. يتكون من سلسلتين، تتألفان من جزيئات السكر (ديوكسي ريبوز) والفوسفات، وترتبطان بأزواج من أربع جزيئات تُسمى القواعد النيتروجينية، والتي تُشكل درجات السلم. في هذه الدرجات، يرتبط الأدينين بالثايمين، ويرتبط الجوانين بالسيتوزين. يرتبط كل زوج من القواعد النيتروجينية برابطة هيدروجينية. يتكون الجين من سلسلة من القواعد النيتروجينية. تشفر تسلسلات من 3 قواعد حمضًا أمينيًا (الأحماض الأمينية هي جزيئات تشكل اللبنات الأساسية للبروتينات) أو معلومات أخرى.

تسلسل الجينوم الكامل ( WGS )، المعروف أيضًا باسم تسلسل الجينوم الكامل أو ببساطة تسلسل الجينوم ، هو عملية تحديد تسلسل الحمض النووي (DNA) الكامل لجينوم الكائن الحي في وقت واحد. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] يتضمن ذلك تسلسل جميع الحمض النووي الصبغي للكائن الحي، بالإضافة إلى الحمض النووي الموجود في الميتوكوندريا ، وفي البلاستيدات الخضراء بالنسبة للنباتات .

استُخدم تسلسل الجينوم الكامل على نطاق واسع كأداة بحثية، وبدأ تطبيقه في العيادات عام ٢٠١٤. [ ٥ ] [ ٦ ] [ ٧ ] وفي مستقبل الطب الشخصي ، قد تُشكّل بيانات تسلسل الجينوم الكامل أداةً مهمةً لتوجيه التدخل العلاجي. [ ٨ ] كما تُستخدم أداة تسلسل الجينات على مستوى تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP) لتحديد المتغيرات الوظيفية من دراسات الارتباط، وتحسين المعرفة المتاحة للباحثين المهتمين بعلم الأحياء التطوري ، وبالتالي قد تُرسي الأساس للتنبؤ بقابلية الإصابة بالأمراض والاستجابة للأدوية.

لا ينبغي الخلط بين تسلسل الجينوم الكامل وتحليل الحمض النووي ، الذي يحدد فقط احتمالية أن تكون المادة الوراثية قد أتت من فرد أو مجموعة معينة، ولا يحتوي على معلومات إضافية حول العلاقات الوراثية أو الأصل أو الاستعداد لأمراض معينة. [ 9 ] بالإضافة إلى ذلك، لا ينبغي الخلط بين تسلسل الجينوم الكامل والأساليب التي تُسلسل مجموعات فرعية محددة من الجينوم - وتشمل هذه الأساليب تسلسل الإكسوم الكامل (1-2% من الجينوم) أو تحديد النمط الجيني للنيوكليوتيدات المفردة (أقل من 0.1% من الجينوم).

تاريخ

كان أول جينوم بكتيري كامل يتم تسلسله هو جينوم بكتيريا Haemophilus influenzae .
كانت دودة Caenorhabditis elegans أول حيوان يتم تحديد تسلسل جينومه بالكامل.
تم تحديد التسلسل الجيني الكامل لذبابة الفاكهة (Drosophila melanogaster ) في عام 2000.
كان نبات رشاد أذن الفأر (Arabidopsis thaliana) أول نبات يتم تسلسل جينومه.
تم نشر جينوم فأر المختبر Mus musculus في عام 2002.
استغرق الأمر عشر سنوات وخمسين عالماً من مختلف أنحاء العالم لفك شفرة جينوم نخيل الزيت ( Elaeis guineensis ). وكان فك شفرة هذا الجينوم صعباً للغاية نظراً لاحتوائه على العديد من التسلسلات المتكررة التي يصعب تنظيمها. [ 10 ]

كانت طرق تسلسل الحمض النووي المستخدمة في سبعينيات وثمانينيات القرن الماضي يدوية؛ على سبيل المثال، تسلسل ماكسام-جيلبرت وتسلسل سانجر . وقد تم تسلسل العديد من جينومات العاثيات البكتيرية والفيروسات الحيوانية الكاملة باستخدام هذه التقنيات، ولكن التحول إلى طرق التسلسل الآلية الأسرع في تسعينيات القرن الماضي سهّل تسلسل الجينومات البكتيرية وحقيقية النواة الأكبر حجماً. [ 11 ]

كان فيروس العاثية MS2 أول فيروس يتم تسلسل جينومه بالكامل عام 1976. [ 12 ] وفي عام 1992، كان كروموسوم الخميرة الثالث أول كروموسوم لأي كائن حي يتم تسلسله بالكامل. [ 13 ] وكان أول كائن حي يتم تسلسل جينومه بالكامل هو المستدمية النزلية عام 1995. [ 14 ] بعد ذلك، تم تسلسل جينومات أنواع أخرى من البكتيريا وبعض العتائق ، ويعود ذلك في الغالب إلى صغر حجم جينوماتها. يبلغ طول جينوم المستدمية النزلية 1,830,140  زوجًا من قواعد الحمض النووي. [ 14 ] في المقابل، تمتلك حقيقيات النوى ، سواء وحيدة الخلية أو متعددة الخلايا مثل الأميبا دوبيا والإنسان ( الإنسان العاقل ) على التوالي، جينومات أكبر بكثير (انظر مفارقة قيمة C ). [ 15 ] تمتلك الأميبا دوبيا جينومًا يتألف من 700 مليار زوج من النيوكليوتيدات موزعة على آلاف الكروموسومات . [ 16 ] يحتوي البشر على عدد أقل من أزواج النيوكليوتيدات (حوالي 3.2 مليار في كل خلية جرثومية - مع ملاحظة أن الحجم الدقيق للجينوم البشري لا يزال قيد المراجعة) مقارنةً بالأميبا  دوبيا، ومع ذلك، فإن حجم جينومهم يفوق بكثير حجم جينوم البكتيريا الفردية. [ 17 ]

تم تسلسل أول جينومات بكتيرية وأثرية، بما في ذلك جينوم المستدمية النزلية ، باستخدام  تقنية التسلسل العشوائي (Shotgun sequencing ). [ 14 ] وفي عام 1996، تم تسلسل أول جينوم حقيقي النواة ( خميرة الخباز ). تُعد خميرة  الخباز كائنًا نموذجيًا في علم الأحياء ، إذ يبلغ عدد أزواج النيوكليوتيدات في جينومها حوالي 12 مليون زوج فقط، [ 18 ] وكانت أول كائن حقيقي النواة وحيد الخلية يتم تسلسل جينومه بالكامل. كانت الدودة الأسطوانية Caenorhabditis elegans أول كائن حي متعدد الخلايا حقيقي النواة، وأول حيوان ، يتم تحديد تسلسل جينومه بالكامل في عام 1998. [ 19 ] يتم تحديد تسلسل جينومات حقيقيات النوى بعدة طرق، بما في ذلك التسلسل العشوائي لقطع الحمض النووي القصيرة، وتسلسل نسخ الحمض النووي الأكبر من مكتبات الحمض النووي مثل الكروموسومات الاصطناعية البكتيرية (BACs) والكروموسومات الاصطناعية الخميرية (YACs). [ 20 ]

في عام ١٩٩٩، نُشر التسلسل الكامل للحمض النووي للكروموسوم البشري ٢٢ ، وهو ثاني أقصر كروموسوم جسمي بشري. [ ٢١ ] وبحلول عام ٢٠٠٠، تم تحديد تسلسل جينوم ثاني حيوان وثاني لافقاري (وأول حشرة حتى الآن ) - وهو جينوم ذبابة الفاكهة دروسوفيلا ميلانوجاستر - وهي كائن نموذجي شائع في البحوث التجريبية. [ ٢٢ ] كما تم تحديد التسلسل الكامل لأول جينوم نباتي - وهو جينوم الكائن النموذجي أرابيدوبسيس ثاليانا - بحلول عام ٢٠٠٠. [ ٢٣ ] وبحلول عام ٢٠٠١، نُشرت مسودة لتسلسل الجينوم البشري الكامل. [ ٢٤ ] واكتمل تحديد تسلسل جينوم فأر المختبر موس موسكولوس في عام ٢٠٠٢. [ ٢٥ ]

في عام 2004، نشر مشروع الجينوم البشري نسخة غير مكتملة من الجينوم البشري. [ 26 ] في عام 2008، أبلغت مجموعة من لايدن، هولندا، عن تسلسل أول جينوم بشري أنثوي ( مارجولين كريك ).

تم حالياً تحديد تسلسل آلاف الجينومات كلياً أو جزئياً .

تفاصيل التجربة

الخلايا المستخدمة في التسلسل

يمكن لأي عينة بيولوجية تقريبًا تحتوي على نسخة كاملة من الحمض النووي - حتى لو كانت كمية ضئيلة جدًا أو حمضًا نوويًا قديمًا - أن توفر المادة الوراثية اللازمة لتسلسل الجينوم الكامل. قد تشمل هذه العينات اللعاب ، والخلايا الظهارية ، ونخاع العظم ، والشعر (طالما أن الشعر يحتوي على بصيلة شعر )، والبذور ، وأوراق النباتات، أو أي شيء آخر يحتوي على خلايا تحتوي على الحمض النووي.

يمكن تحديد تسلسل الجينوم لخلية واحدة مختارة من بين مجموعة مختلطة من الخلايا باستخدام تقنيات تسلسل جينوم الخلية الواحدة . ويُعدّ هذا الأمر ذا أهمية بالغة في علم الأحياء الدقيقة البيئية، حيث يُمكن عزل خلية واحدة من نوع معين من الكائنات الدقيقة من بين مجموعة مختلطة باستخدام المجهر بناءً على خصائصها المورفولوجية أو غيرها من الخصائص المميزة. في مثل هذه الحالات، يُمكن الاستغناء عن الخطوات الضرورية عادةً لعزل الكائن الحي وتنميته في المزرعة، مما يسمح بتسلسل نطاق أوسع بكثير من جينومات الكائنات الحية. [ 27 ]

يجري اختبار تسلسل الجينوم أحادي الخلية كطريقة للتشخيص الجيني قبل الزرع ، حيث تُؤخذ خلية من الجنين الناتج عن التخصيب في المختبر وتُحلل قبل نقله إلى الرحم. [ 28 ] بعد الزرع، يمكن الحصول على الحمض النووي الجنيني الحر من الأم عن طريق سحب عينة دم وريدي بسيطة ، ويُستخدم لتسلسل الجينوم الكامل للجنين. [ 29 ]

التقنيات المبكرة

جهاز تحليل جيني ABI PRISM 3100. ساهمت أجهزة التسلسل الشعيرية هذه في أتمتة الجهود المبكرة لتسلسل الجينومات.

أُنجز تسلسل جينوم بشري كامل تقريبًا لأول مرة عام 2000، جزئيًا باستخدام تقنية التسلسل العشوائي . مع أن التسلسل العشوائي للجينومات الصغيرة (4000-7000 زوج قاعدي ) كان مُستخدمًا بالفعل عام 1979، [ 30 ] إلا أن تطبيقه على نطاق أوسع استفاد من التسلسل الثنائي للأطراف، المعروف شعبيًا باسم التسلسل العشوائي المزدوج . ومع بدء مشاريع التسلسل في تناول جينومات أطول وأكثر تعقيدًا، أدركت مجموعات بحثية متعددة إمكانية الحصول على معلومات مفيدة من خلال تسلسل طرفي قطعة من الحمض النووي. ورغم أن تسلسل طرفي القطعة نفسها وتتبع البيانات المزدوجة كان أكثر صعوبة من تسلسل طرف واحد لقطعتين مختلفتين، إلا أن معرفة أن التسلسلين مُوجهان في اتجاهين متعاكسين، وأن طولهما يُقارب طول قطعة واحدة، كان ذا قيمة في إعادة بناء تسلسل القطعة المستهدفة الأصلية.

نُشر أول وصف لاستخدام تقنية التسلسل المزدوج في عام 1990 كجزء من تسلسل موقع HPRT البشري ، [ 31 ] على الرغم من أن استخدامها اقتصر على سد الفجوات بعد تطبيق أسلوب التسلسل العشوائي التقليدي. أما أول وصف نظري لاستراتيجية التسلسل المزدوج الخالص، بافتراض ثبات طول القطع، فكان في عام 1991. [ 32 ] وفي عام 1995، طُرح ابتكار استخدام قطع بأحجام مختلفة، [ 33 ] مما أثبت إمكانية تطبيق استراتيجية التسلسل المزدوج الخالص على أهداف كبيرة. وقد اعتمد معهد أبحاث الجينوم (TIGR) هذه الاستراتيجية لاحقًا لتسلسل الجينوم الكامل لبكتيريا المستدمية النزلية في عام 1995، [ 34 ] ثم اعتمدتها شركة سيليرا جينوميكس لتسلسل جينوم ذبابة الفاكهة بالكامل في عام 2000، [ 35 ] ثم الجينوم البشري بالكامل. قامت شركة Applied Biosystems ، التي تُعرف الآن باسم Life Technologies ، بتصنيع أجهزة التسلسل الشعيري الآلية التي استخدمتها كل من Celera Genomics ومشروع الجينوم البشري.

التقنيات الحالية

رغم أن تقنية التسلسل الشعيري كانت أول طريقة ناجحة لتسلسل جينوم بشري كامل تقريبًا، إلا أنها لا تزال مكلفة للغاية وتستغرق وقتًا طويلاً جدًا للأغراض التجارية. منذ عام ٢٠٠٥، حلت تقنيات التسلسل عالية الإنتاجية (المعروفة سابقًا باسم "الجيل التالي")، مثل تسلسل صبغة Illumina ، والتسلسل الناري ، وتسلسل SMRT، محل تقنية التسلسل الشعيري تدريجيًا . [ ٣٦ ] وتستمر جميع هذه التقنيات في استخدام استراتيجية التسلسل العشوائي الأساسية، أي التوازي وتوليد القوالب عبر تجزئة الجينوم.

ظهرت تقنيات تسلسل القراءة الطويلة ، بما في ذلك تقنية النانوبور . ورغم أن دقة التسلسل بتقنية النانوبور أقل من التقنيات المذكورة سابقًا، إلا أن طول القراءة فيها أطول بكثير في المتوسط. [ 37 ] يُعد هذا الجيل من القراءات الطويلة ذا قيمة خاصة في تطبيقات تسلسل الجينوم الكامل من الصفر . [ 38 ]

من تيلومير إلى تيلومير

تُنتج تقنيات التسلسل التقليدية قراءات قصيرة تُجمع باستخدام برامج حاسوبية لتشكيل أجزاء متصلة (contigs) ثم تُدمج في تجميعات . لكن هذه التقنية غير فعالة مع المناطق ذات التكرار العالي، إذ تواجه البرامج صعوبة في تحديد طول هذه الأجزاء المتكررة والتمييز بين تكرار وآخر مشابه له. تُترك هذه المناطق على شكل فجوات في السقالات ، وهي عبارة عن مجموعات من الأجزاء المتصلة والفجوات ذات الأحجام التقريبية التي تُمثل كروموسومًا فعليًا. فعلى سبيل المثال، تمكن مشروع الجينوم البشري من قراءة ورسم خريطة 92% من الجينوم البشري، تاركًا 8% على شكل فجوات. [ 39 ]

يُتيح تسلسل القراءة الطويلة قراءات أطول بكثير، قد تغطي كامل المنطقة المتكررة، مما يسمح للباحثين وبرامجهم الحاسوبية بتحديد طول وهوية كل منطقة على حدة بدقة. عندما يكون الجينوم مكتملًا بما يكفي لإنتاج قطعة متصلة واحدة (بدون فجوات) لكل كروموسوم خطي، بدءًا من المناطق التيلوميرية وانتهاءً بها، يُطلق عليه اسم " تيلومير-إلى-تيلومير " (T2T). نُشر جينوم T2T البشري في عام 2022. (يتضمن 24 قطعة متصلة للكروموسومات الجسمية الـ 22، والكروموسوم X، والحمض النووي للميتوكوندريا. [ 40 ] يُمكن القول إنه "شبه-T2T" فقط لأن مصفوفات الحمض النووي الريبوزي لم تُجمّع بعد.) [ 41 ] يختلف الخبراء في تعريفهم لمصطلحي "T2T" و"شبه-T2T" أو "قريب من T2T". [ 42 ]

تحليل

من حيث المبدأ، يُمكن لتسلسل الجينوم الكامل أن يُوفر التسلسل النيوكليوتيدي الخام للحمض النووي للكائن الحي في لحظة زمنية محددة. مع ذلك، لا بد من إجراء تحليلات إضافية لتحديد الدلالة البيولوجية أو الطبية لهذا التسلسل، مثل كيفية استخدام هذه المعرفة للمساعدة في الوقاية من الأمراض. ويجري حاليًا تطوير وتحسين أساليب تحليل بيانات التسلسل.

لأن التسلسل يولد الكثير من البيانات (على سبيل المثال، هناك ما يقرب من ستة مليارات زوج قاعدي في كل جينوم بشري ثنائي الصبغيات)، يتم تخزين مخرجاته إلكترونيًا ويتطلب قدرًا كبيرًا من قوة الحوسبة وسعة التخزين.

على الرغم من أن تحليل بيانات التسلسل الجينومي الكامل قد يكون بطيئًا، إلا أنه من الممكن تسريع هذه الخطوة باستخدام أجهزة مخصصة. [ 43 ]

التسويق التجاري

التكلفة الإجمالية لتسلسل الجينوم البشري الكامل كما حسبها المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري

تتنافس عدة شركات عامة وخاصة لتطوير منصة تسلسل جينومي كاملة تتميز بكفاءتها التجارية العالية، ما يجعلها مناسبة للاستخدام البحثي والسريري على حد سواء، [ 44 ] بما في ذلك Illumina، [ 45 ] وKnome ، [ 46 ] وSequenom ، [ 47 ] و454 Life Sciences ، [ 48 ] وPacific Biosciences، [ 49 ] وComplete Genomics ، [ 50 ] وHelicos Biosciences ، [ 51 ] وGE Global Research ( جنرال إلكتريك )، و Affymetrix ، وIBM ، وIntelligent Bio-Systems، [ 52 ] وLife Technologies، وOxford Nanopore Technologies، [ 53 ] ومعهد بكين للجينوميات . [ 54 ] [ 55 ] [ 56 ] وتحظى هذه الشركات بتمويل ودعم كبيرين من شركات رأس المال المخاطر ، وصناديق التحوط ، والبنوك الاستثمارية . [ 57 ] [ 58 ]

كان الهدف التجاري الشائع لتكلفة التسلسل حتى أواخر العقد الأول من القرن الحادي والعشرين هو 1000 دولار أمريكي ؛ ومع ذلك، تعمل الشركات الخاصة على الوصول إلى هدف جديد يبلغ 100 دولار فقط. [ 59 ]

حافز

في أكتوبر/تشرين الأول 2006، أنشأت مؤسسة إكس برايز ، بالتعاون مع مؤسسة جيه كريج فينتر للعلوم، جائزة أركون إكس برايز لعلم الجينوم، [ 60 ] بهدف منح 10 ملايين دولار أمريكي "لأول فريق قادر على بناء جهاز واستخدامه لتسلسل 100 جينوم بشري في غضون 10 أيام أو أقل، بدقة لا تتجاوز خطأً واحدًا لكل مليون قاعدة متسلسلة، مع تغطية التسلسلات بدقة لا تقل عن 98% من الجينوم، وبتكلفة متكررة لا تتجاوز 1000 دولار أمريكي لكل جينوم". [ 61 ] أُلغيت جائزة أركون إكس برايز لعلم الجينوم في عام 2013، قبل تاريخ انطلاقها الرسمي. [ 62 ] [ 63 ]

تاريخ

في عام 2007، بدأت شركة Applied Biosystems ببيع نوع جديد من أجهزة التسلسل يُسمى نظام SOLiD. [ 64 ] وقد سمحت هذه التقنية للمستخدمين بتسلسل 60 جيجابايت في كل عملية تشغيل. [ 65 ]

في يونيو 2009، أعلنت شركة إلومينا عن إطلاق خدمة تسلسل الجينوم الكامل الشخصي بعمق 30 ضعفًا مقابل 48,000 دولار أمريكي للجينوم الواحد. [ 66 ] [ 67 ] وفي أغسطس، صرّح ستيفن كويك ، مؤسس شركة هيليكوس للعلوم الحيوية، بأنه استخدم جهاز تسلسل الجزيء المفرد الخاص بالشركة لتسلسل جينومه الكامل بأقل من 50,000 دولار أمريكي. [ 68 ] وفي نوفمبر، نشرت شركة كومبليت جينوميكس ورقة بحثية محكمة في مجلة ساينس تُظهر قدرتها على تسلسل جينوم بشري كامل مقابل 1,700 دولار أمريكي. [ 69 ] [ 70 ]

في مايو 2011، خفضت شركة Illumina سعر خدمة تسلسل الجينوم الكامل إلى 5000 دولار أمريكي لكل جينوم بشري، أو 4000 دولار أمريكي عند طلب 50 جينومًا أو أكثر. [ 71 ] ويبدو أن شركات Helicos Biosciences وPacific Biosciences وComplete Genomics وIllumina وSequenom وION Torrent Systems وHalcyon Molecular وNABsys وIBM وGE Global تتنافس بشدة في سباق تسويق تقنية تسلسل الجينوم الكامل. [ 36 ] [ 72 ]

مع انخفاض تكاليف التسلسل الجيني، بدأت عدة شركات بالإعلان عن أن أجهزتها ستصل قريبًا إلى تكلفة 1000 دولار أمريكي لتسلسل الجينوم الكامل: من بين هذه الشركات: لايف تكنولوجيز في يناير 2012، [ 73 ] وأكسفورد نانوبور تكنولوجيز في فبراير 2012، [ 74 ] وإلومينا في فبراير 2014. [ 75 ] [ 76 ] في عام 2015، قدّر المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري (NHGRI) تكلفة الحصول على تسلسل الجينوم الكامل بحوالي 1500 دولار أمريكي. [ 77 ] في عام 2016، بدأت فيريتاس جينيتكس ببيع خدمة تسلسل الجينوم الكامل، بما في ذلك تقرير يتضمن بعض المعلومات الواردة في التسلسل، مقابل 999 دولارًا أمريكيًا. [ 78 ] في صيف 2019، خفّضت فيريتاس جينيتكس تكلفة تسلسل الجينوم الكامل إلى 599 دولارًا أمريكيًا. [ 79 ] في عام 2017، بدأت بي جي آي بتقديم خدمة تسلسل الجينوم الكامل مقابل 600 دولار أمريكي. [ 80 ]

مع ذلك، أشار البعض في عام 2015 إلى أن الاستخدام الفعال لتسلسل الجينات الكاملة قد يكلف أكثر بكثير من 1000 دولار. [ 81 ] كما ورد أن هناك أجزاءً من الجينوم البشري لم يتم تسلسلها بالكامل حتى عام 2017. [ 82 ] [ 83 ]

مقارنة بالتقنيات الأخرى

المصفوفات الدقيقة للحمض النووي

يوفر تسلسل الجينوم الكامل معلومات عن جينوم أكبر بكثير من تلك التي توفرها مصفوفات الحمض النووي ، الرائدة السابقة في تكنولوجيا تحديد النمط الجيني.

بالنسبة للبشر، توفر مصفوفات الحمض النووي حاليًا معلومات جينية تصل إلى مليون متغير جيني، [ 84 ] [ 85 ] [ 86 ] بينما يوفر تسلسل الجينوم الكامل معلومات عن جميع القواعد الستة مليارات في الجينوم البشري، أي ما يعادل 3000  ضعف البيانات. ولهذا السبب، يُعتبر تسلسل الجينوم الكامل ابتكارًا ثوريًا في أسواق مصفوفات الحمض النووي، حيث تتراوح دقة كليهما بين 99.98% و99.999% (في مناطق الحمض النووي غير المتكررة)، وتُعد تكلفة المواد الاستهلاكية لهما، البالغة 5000 دولار لكل 6 مليارات زوج من القواعد، منافسة (في بعض التطبيقات) لمصفوفات الحمض النووي (500 دولار لكل مليون زوج من القواعد). [ 48 ]

التطبيقات

معدلات الطفرات

لقد ساهم تسلسل الجينوم الكامل في تحديد معدل الطفرات في الجينوم البشري الكامل. ويبلغ معدل الطفرات في الجينوم الكامل بين الأجيال البشرية (من الآباء إلى الأبناء) حوالي 70 طفرة جديدة لكل جيل. [ 87 ] [ 88 ] وقد وُجد مستوى أقل من التباين عند مقارنة تسلسل الجينوم الكامل في خلايا الدم لزوج من التوائم المتطابقة (أحادية الزيجوت) يبلغان من العمر 100 عام. [ 89 ] حيث تم العثور على 8 اختلافات جسدية فقط، مع العلم أن التباين الجسدي الذي يحدث في أقل من 20% من خلايا الدم قد لا يُكتشف.

في المناطق المشفرة للبروتينات تحديداً في الجينوم البشري، يُقدّر أن هناك حوالي 0.35 طفرة من شأنها تغيير تسلسل البروتين بين جيل الآباء والأبناء (أقل من بروتين واحد متحور لكل جيل). [ 90 ]

في السرطان، تكون معدلات الطفرات أعلى بكثير، نتيجةً لعدم استقرار الجينوم . وقد يعتمد هذا المعدل أيضًا على عمر المريض، والتعرض لعوامل مُتلفة للحمض النووي (مثل الأشعة فوق البنفسجية أو مكونات دخان التبغ)، ونشاط/عدم نشاط آليات إصلاح الحمض النووي. [ 91 ] علاوة على ذلك، قد يختلف معدل الطفرات بين أنواع السرطان: ففي الخلايا الجرثومية، تحدث الطفرات بمعدل 0.023 طفرة لكل ميغابايت تقريبًا، لكن هذا الرقم أعلى بكثير في سرطان الثدي (1.18-1.66 طفرة جسدية لكل ميغابايت)، وفي سرطان الرئة (17.7)، وفي الأورام الميلانينية (≈33). [ 92 ] بما أن الجينوم البشري أحادي الصيغة الصبغية يتكون من حوالي 3200 ميغابايت، [ 93 ] فإن هذا يترجم إلى حوالي 74 طفرة (معظمها في المناطق غير المشفرة ) في الحمض النووي الجرثومي لكل جيل، ولكن 3776-5312 طفرة جسدية لكل جينوم أحادي الصيغة الصبغية في سرطان الثدي، و56640 في سرطان الرئة و105600 في الأورام الميلانينية.

يتسم توزيع الطفرات الجسدية في الجينوم البشري بعدم التجانس الشديد، [ 94 ] حيث تتلقى المناطق الغنية بالجينات والتي تتضاعف مبكرًا طفرات أقل من مناطق الكروماتين المغاير الفقيرة بالجينات والتي تتضاعف متأخرًا، ويرجع ذلك على الأرجح إلى اختلاف نشاط إصلاح الحمض النووي. [ 95 ] وعلى وجه الخصوص، يرتبط تعديل الهيستون H3K9me3 بترددات طفرات عالية، [ 96 ] بينما يرتبط H3K36me3 بترددات طفرات منخفضة. [ 97 ]

دراسات الارتباط على مستوى الجينوم

في مجال البحث، يمكن استخدام تسلسل الجينوم الكامل في دراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) - وهو مشروع يهدف إلى تحديد المتغير الجيني أو المتغيرات المرتبطة بمرض أو نمط ظاهري آخر. [ 98 ]

الاستخدام التشخيصي

في عام 2009، أصدرت شركة Illumina أول أجهزة تسلسل الجينوم الكامل التي تمت الموافقة عليها للاستخدام السريري بدلاً من الاستخدام البحثي فقط، وبدأ الأطباء في المراكز الطبية الأكاديمية باستخدامها سراً لمحاولة تشخيص ما يعاني منه الأشخاص الذين فشلت معهم الأساليب التقليدية. [ 99 ]

كان أول تطبيق سريري لهذه التقنية في يوليو 2009، وذلك في محاولة لتشخيص طفل كان يتلقى العلاج في مستشفى ميلووكي للأطفال، وكان يعاني من التهاب الأمعاء المزمن المقاوم للعلاج منذ صغره، مما استدعى إجراء حوالي 100 عملية جراحية قبل بلوغه الثالثة من عمره. لجأ طبيبه، آلان ماير، إلى عالم الوراثة الدكتور هوارد جاكوب في كلية الطب في ويسكونسن (MCW) لمعرفة إمكانية استخدام تقنية تسلسل الجينوم الكامل لتحديد المشكلة. تمكن الدكتور وورثي، كبير علماء الأحياء الحاسوبية، باستخدام برنامج طُوّر بسرعة من قِبل فريق صغير من مطوري البرامج، من تحديد طفرة نادرة في جين XIAP كانت تُسبب المشكلة، وقد غيّر هذا التشخيص مسار علاج المريض، وأنقذ حياته. [ 99 ] [ 100 ] [ 101 ] بحلول أوائل عام 2010، أنشأ الدكتوران جاكوب وورثي، بالتعاون مع الدكتور ديفيد ديموك، أول عيادة جينية تعتمد على الجينوم الكامل ومختبرًا للتشخيص الجزيئي، حيث يقومون بشكل روتيني بتسلسل وتحليل جينومات المرضى الذين يعانون من أمراض غير مشخصة. ويقوم هذا المختبر التشخيصي بتشخيص آلاف المرضى المصابين بأمراض نادرة من جميع أنحاء العالم، ولا يزال مستمرًا حتى اليوم.

في عام ٢٠١٠، أجرى فريق من جامعة ستانفورد بقيادة إيوان آشلي تحليلًا للجينوم البشري الكامل، وهو جينوم المهندس الحيوي ستيفن كويك. [ ١٠٢ ] وفي عام ٢٠١١، نشر فريق آشلي تقريرًا عن تشريح جزيئي للجينوم الكامل [ ١٠٣ ] ، وفي العام نفسه، وسّعوا نطاق تفسير النتائج ليشمل عائلة ويست، وهي أول عائلة يتم تسلسل جينومها باستخدام منصة Illumina. [ ١٠٤ ] كانت تكلفة تسلسل الجينوم آنذاك ١٩,٥٠ دولارًا أمريكيًا، وكانت تُدفع للمريض، ولكنها عادةً ما كانت تُغطى من منحة بحثية؛ وقد تقدم شخص واحد في ذلك الوقت بطلب استرداد من شركة التأمين الخاصة به. [ ٩٩ ]

بفضل الانخفاضات الأخيرة في التكاليف (انظر أعلاه)، أصبح تسلسل الجينوم الكامل تطبيقًا عمليًا في تشخيص الحمض النووي. في عام 2013، حصل اتحاد 3Gb-TEST على تمويل من الاتحاد الأوروبي لتجهيز نظام الرعاية الصحية لهذه الابتكارات في تشخيص الحمض النووي. [ 105 ] [ 106 ] يجب وضع خطط لتقييم الجودة ، وتقييم التكنولوجيا الصحية ، ووضع المبادئ التوجيهية اللازمة. وقد حدد اتحاد 3Gb-TEST تحليل بيانات التسلسل وتفسيرها باعتباره الخطوة الأكثر تعقيدًا في عملية التشخيص. [ 107 ] في اجتماع الاتحاد في أثينا في سبتمبر 2014، صاغ الاتحاد مصطلح "الترجمة الجينية" لهذه الخطوة الحاسمة. وتؤدي هذه الخطوة إلى ما يُسمى " التقرير الجيني" . هناك حاجة إلى مبادئ توجيهية لتحديد المحتوى المطلوب لهذه التقارير.

أُنشئت مبادرة Genomes2People (G2P)، وهي مبادرة مشتركة بين مستشفى بريغهام والنساء وكلية الطب بجامعة هارفارد، في عام 2011 لدراسة دمج التسلسل الجيني في الرعاية السريرية للبالغين والأطفال. [ 108 ] وكان مدير مبادرة G2P، روبرت سي. غرين ، قد قاد سابقًا دراسة REVEAL - تقييم المخاطر والتثقيف بشأن مرض الزهايمر - وهي سلسلة من التجارب السريرية التي استكشفت ردود فعل المرضى تجاه معرفة مخاطرهم الجينية للإصابة بمرض الزهايمر. [ 109 ] [ 110 ]

في عام ٢٠١٨، توصل باحثون في معهد رادي لطب الجينوم بمستشفى الأطفال في سان دييغو إلى أن التسلسل السريع للجينوم الكامل (rWGS) يُمكنه تشخيص الاضطرابات الوراثية في الوقت المناسب لتغيير التدبير الطبي أو الجراحي الحاد (الفائدة السريرية) وتحسين نتائج الرضع المصابين بأمراض حادة. في دراسة أترابية استرجاعية شملت رضعًا مرضى داخليين في مستشفى إقليمي للأطفال خلال الفترة من يوليو ٢٠١٦ إلى مارس ٢٠١٧، خضعت اثنتان وأربعون عائلة لفحص التسلسل السريع للجينوم الكامل (rWGS) لتشخيص مسببات الاضطرابات الوراثية. بلغت حساسية التشخيص باستخدام التسلسل السريع للجينوم الكامل ٤٣٪ (١٨ من ٤٢ رضيعًا) مقابل ١٠٪ (٤ من ٤٢ رضيعًا) للاختبارات الجينية القياسية (P = ٠.٠٠٠٥). وكان معدل الفائدة السريرية للتسلسل السريع للجينوم الكامل (٣١٪، ١٣ من ٤٢ رضيعًا) أعلى بكثير من معدل الفائدة السريرية للاختبارات الجينية القياسية (٢٪، واحد من ٤٢؛ P = ٠.٠٠١٥). تجنّب أحد عشر رضيعًا (26%) ممن خضعوا لتشخيص rWGS المضاعفات، وانخفضت احتمالية الوفاة لدى رضيع واحد بنسبة 43%، وبدأ رضيع آخر بتلقي الرعاية التلطيفية. وفي ستة من هؤلاء الرضع الأحد عشر، أدت التغييرات في إدارة الحالة إلى خفض تكلفة الإقامة في المستشفى بمقدار يتراوح بين 800,000 و2,000,000 دولار أمريكي. وقد أكدت هذه النتائج دراسة سابقة حول الفائدة السريرية لـ rWGS في علاج الرضع المرضى بشدة في المستشفيات، وأظهرت تحسنًا في النتائج، وتوفيرًا صافيًا في تكاليف الرعاية الصحية، وإمكانية اعتباره اختبارًا أوليًا في هذا السياق. [ 111 ]

أظهرت مراجعة أجريت عام 2018 لـ 36 منشورًا أن تكلفة تسلسل الجينوم الكامل تتراوح بين 1906 دولارًا أمريكيًا و24810 دولارًا أمريكيًا، وأن هناك تباينًا كبيرًا في العائد التشخيصي يتراوح بين 17% و73% اعتمادًا على مجموعات المرضى. [ 112 ]

دراسة ارتباط المتغيرات النادرة

تُمكّن دراسات تسلسل الجينوم الكامل من تقييم الارتباطات بين الصفات المعقدة والمتغيرات النادرة ، سواءً كانت مشفرة أو غير مشفرة ( تردد الأليل الطفيف < 1%)، عبر الجينوم. عادةً ما تكون تحليلات المتغير الواحد ضعيفة القدرة على تحديد الارتباطات مع المتغيرات النادرة، ولذا اقتُرحت اختبارات مجموعات المتغيرات لاختبار تأثيرات مجموعات معينة من المتغيرات النادرة المتعددة بشكل مشترك. [ 113 ] تساعد بيانات SNP على تحديد أولويات المتغيرات الوظيفية النادرة، ويمكن أن يُعزز دمج هذه البيانات بشكل فعال من قوة تحليل الارتباط الجيني للمتغيرات النادرة في دراسات تسلسل الجينوم الكامل. [ 114 ] طُوّرت بعض الأدوات خصيصًا لتوفير تحليل شامل لارتباط المتغيرات النادرة لبيانات تسلسل الجينوم الكامل، بما في ذلك دمج بيانات النمط الجيني وبياناتها الوظيفية، وتحليل الارتباط، وملخص النتائج، وعرضها بصريًا. [ 115 ] [ 116 ]

يُقدّم التحليل التلوي لدراسات تسلسل الجينوم الكامل حلاً جذاباً لمشكلة جمع عينات كبيرة الحجم لاكتشاف المتغيرات النادرة المرتبطة بالأنماط الظاهرية المعقدة. وقد طُوّرت بعض الطرق لتمكين تحليل ارتباط المتغيرات النادرة المُستند إلى معلومات وظيفية في مجموعات بيانات على نطاق البنوك الحيوية، وذلك باستخدام أساليب فعّالة لتخزين الإحصاءات الموجزة. [ 117 ]

علم الأورام

في هذا المجال، يُمثل تسلسل الجينوم الكامل مجموعةً كبيرةً من التحسينات والتحديات التي تواجه المجتمع العلمي، إذ يُتيح تحليل وتحديد كمية وخصائص الحمض النووي للورم المنتشر في الدم (ctDNA). ويُشكل هذا أساسًا للتشخيص المبكر للسرطان، واختيار العلاج، ومراقبة الانتكاس ، فضلًا عن تحديد آليات المقاومة والانتشار والأنماط التطورية في تطور السرطان. كما يُمكن أن يُساعد في اختيار العلاجات المُخصصة للمرضى الذين يُعانون من هذا المرض، ومراقبة كيفية عمل الأدوية الحالية أثناء تقدم العلاج. يتضمن تسلسل الجينوم الكامل العميق إعادة بناء فرعية للخلايا السرطانية استنادًا إلى الحمض النووي للورم المنتشر في البلازما، مما يسمح بإجراء تحليل كامل للجينوم والجينوم فوق الجيني ، مُظهرًا تعبير الحمض النووي للورم المنتشر في كل حالة. [ 118 ]

فحص حديثي الولادة

في عام ٢٠١٣، أطلق غرين وفريق من الباحثين مشروع BabySeq لدراسة التداعيات الأخلاقية والطبية لتسلسل الحمض النووي للمواليد الجدد. [ ١١٩ ] [ ١٢٠ ] وفي عام ٢٠١٥، نُوقشت إمكانية استخدام تسلسل الجينوم الكامل والإكسوم كأداة لفحص المواليد الجدد [ ١٢١ ] ، وفي عام ٢٠٢١، نُوقشت هذه المسألة بشكل أوسع. [ ١٢٢ ] وفي عام ٢٠٢١، موّلت معاهد الصحة الوطنية الأمريكية دراسة BabySeq2، وهي دراسة تطبيقية وسّعت نطاق مشروع BabySeq، وشملت ٥٠٠ رضيع من عائلات متنوعة، وتتبّعت آثار تسلسل جينومهم على رعايتهم الطبية. [ ١٢٣ ]

في عام 2023، رأت مجلة لانسيت أنه في المملكة المتحدة "قد يكون التركيز على تحسين الفحص من خلال ترقية لوحات الجينات المستهدفة أكثر منطقية على المدى القصير. أما تسلسل الجينوم الكامل على المدى الطويل فيستحق دراسة متأنية وحذراً شاملاً." [ 124 ]

المخاوف الأخلاقية

قد يكون لإدخال تقنية تسلسل الجينوم الكامل آثار أخلاقية. [ 125 ] فمن جهة، يمكن للاختبارات الجينية تشخيص أمراض يمكن الوقاية منها، سواء لدى الشخص الخاضع للاختبار أو لدى أقاربه. [ 125 ] ومن جهة أخرى، تنطوي الاختبارات الجينية على سلبيات محتملة، مثل التمييز الجيني ، وفقدان السرية، وآثار نفسية كالكشف عن عدم الأبوة . [ 126 ]

يُصرّ بعض علماء الأخلاق على ضرورة حماية خصوصية الأفراد الخاضعين للاختبارات الجينية، [ 125 ] ويُعدّ هذا الأمر مصدر قلق بالغ، لا سيما عند خضوع القاصرين لهذه الاختبارات. [ 127 ] وقد ادّعى جاي فلاتلي، الرئيس التنفيذي لشركة إلومينا، خطأً في فبراير 2009، أنه "بحلول عام 2019، سيصبح من الروتيني تحديد جينات الأطفال عند ولادتهم". [ 128 ] ويُعدّ هذا الاستخدام المحتمل لتسلسل الجينوم مثيرًا للجدل، إذ يتعارض مع المعايير الأخلاقية الراسخة للاختبارات الجينية التنبؤية للقاصرين الذين لا تظهر عليهم أعراض، والتي تمّ ترسيخها في مجالي علم الوراثة الطبية والاستشارة الوراثية . [ 129 ] [ 130 ] [ 131 ] [ 132 ] وقد وُضعت المبادئ التوجيهية التقليدية للاختبارات الجينية على مدى عقود عديدة منذ أن أصبح من الممكن لأول مرة اختبار المؤشرات الجينية المرتبطة بالأمراض، قبل ظهور الفحص الجيني الشامل والفعّال من حيث التكلفة.

عندما يخضع شخص ما لتحليل تسلسل الجينوم الكامل، فإنه يكشف معلومات ليس فقط عن تسلسل الحمض النووي الخاص به، بل أيضًا عن تسلسل الحمض النووي المحتمل لأقاربه المقربين. [ 125 ] ويمكن لهذه المعلومات أن تكشف بدورها عن معلومات تنبؤية مفيدة حول المخاطر الصحية الحالية والمستقبلية للأقارب. [ 133 ] ومن ثم، تُطرح تساؤلات مهمة حول الالتزامات، إن وجدت، تجاه أفراد عائلة الشخص الذي يخضع للاختبار الجيني. في المجتمعات الغربية/الأوروبية، يُشجع الأفراد الذين خضعوا للاختبار عادةً على مشاركة المعلومات المهمة حول أي تشخيصات جينية مع أقاربهم المقربين، نظرًا لأن أهمية التشخيص الجيني للأبناء والأقارب المقربين الآخرين تُعد عادةً أحد الأسباب الرئيسية لإجراء الاختبار الجيني. [ 125 ] ومع ذلك، قد تنشأ معضلة أخلاقية كبيرة عندما يرفض المرضى مشاركة معلومات حول تشخيص اضطراب وراثي خطير يمكن الوقاية منه إلى حد كبير، حيث يوجد خطر كبير على الأقارب الذين يحملون نفس الطفرة الجينية. في ظل هذه الظروف، قد يشك الطبيب في أن الأقارب يفضلون معرفة التشخيص، وبالتالي قد يواجه الطبيب تضاربًا في المصالح فيما يتعلق بسرية العلاقة بين المريض والطبيب. [ 125 ]

قد تنشأ مخاوف تتعلق بالخصوصية عند استخدام تسلسل الجينوم الكامل في الدراسات البحثية العلمية. غالبًا ما يحتاج الباحثون إلى إدخال معلومات حول الأنماط الجينية والظاهرية للمرضى في قواعد بيانات علمية عامة، مثل قواعد البيانات الخاصة بمواقع جينية محددة. [ 125 ] على الرغم من أن بيانات المرضى المجهولة فقط هي التي تُرسل إلى قواعد البيانات الخاصة بمواقع جينية محددة، إلا أنه قد يظل بإمكان أقارب المرضى التعرف عليهم في حالة اكتشاف مرض نادر أو طفرة جينية نادرة. [ 125 ] كان النقاش العام حول إدخال تقنيات الطب الشرعي المتقدمة (مثل البحث العائلي المتقدم باستخدام مواقع الويب العامة لتتبع الأنساب الجينية وأساليب تحديد النمط الظاهري للحمض النووي) محدودًا ومشتتًا وغير مركز. مع تقارب علم الوراثة الجنائية وعلم الوراثة الطبية نحو تسلسل الجينوم، تزداد القضايا المتعلقة بالبيانات الجينية ترابطًا، وقد يلزم وضع حماية قانونية إضافية. [ 134 ]

تسلسلات الجينوم البشري العامة

أول البشر الذين تم نشر تسلسل جينومهم

كانت أولى الجينومات البشرية شبه الكاملة التي تم تسلسلها هي جينومات اثنين من الأمريكيين ذوي الأصول الأوروبية الشمالية الغربية في الغالب عام 2007 ( ج. كريج فينتر بتغطية 7.5 أضعاف ، [ 135 ] [ 136 ] [ 137 ] وجيمس واتسون بتغطية 7.4 أضعاف). [ 138 ] [ 139 ] [ 140 ] تبع ذلك في عام 2008 تسلسل جينومات رجل صيني من عرقية الهان (بتغطية 36 ضعفًا)، [ 141 ] ورجل من عرقية اليوروبا من نيجيريا (بتغطية 30 ضعفًا)، [ 142 ] وأخصائية علم الوراثة السريرية ( مارجولين كريك ) من هولندا (بتغطية من 7 إلى 8 أضعاف)، ومريضة سرطان الدم في منتصف الخمسينيات من عمرها (بتغطية 33 و14 ضعفًا للأنسجة الورمية والطبيعية). [ 143 ] كان ستيف جوبز من بين أول 20 شخصًا خضعوا لتسلسل جينومهم بالكامل، ويُقال إن التكلفة بلغت 100 ألف دولار. [ 144 ] اعتبارًا من يونيو 2012 كان هناك 69 جينومًا بشريًا شبه مكتمل متاحًا للعموم. [ 145 ] في نوفمبر 2013، أتاحت عائلة إسبانية بياناتها الجينومية الشخصية للعموم بموجب ترخيص المشاع الإبداعي . قاد هذا العمل مانويل كورباس ، وجُمعت البيانات من خلال اختبارات جينية مباشرة للمستهلكين بالتعاون مع شركتي 23andMe ومعهد بكين للجينوم . يُعتقد أن هذه أول مجموعة بيانات جينومية متاحة للعموم لعائلة بأكملها. [ 146 ]

قواعد البيانات

وفقًا لمجلة ساينس ، فإن قواعد البيانات الرئيسية للجينومات الكاملة هي: [ 147 ]

بنك حيويالجينومات الكاملة المكتملةمعلومات النشر/الوصول
بنك البيانات الحيوية في المملكة المتحدة500,000أُتيحت هذه البيانات عبر منصة إلكترونية في نوفمبر 2021، وهي أكبر مجموعة بيانات عامة للجينومات الكاملة. ترتبط هذه الجينومات بمعلومات طبية مجهولة المصدر، مما يجعلها أكثر سهولة في الوصول إليها لأغراض البحث الطبي الحيوي مقارنةً بمجموعات البيانات السابقة الأقل شمولاً. وقد نُشر 300,000 جينوم إضافي في أوائل عام 2023. [ 147 ] [ 148 ] [ 149 ]
علم الجينوم الشامل للطب الدقيق161,000تتطلب المعاهد الوطنية للصحة (NIH) موافقة خاصة بكل مشروع
برنامج المليون للمحاربين القدامى125,000سيحصل الباحثون من غير المحاربين القدامى على إمكانية الوصول في عام 2022
مشروع الجينومات في إنجلترا: 100,000 جينوم120,000يجب على الباحثين الانضمام إلى التعاون
كلنا90,000تتوقع معاهد الصحة الوطنية الأمريكية إصدار التقرير بحلول أوائل عام 2022

التغطية الجينومية

من حيث التغطية الجينومية والدقة، يمكن تصنيف تسلسل الجينوم الكامل بشكل عام إلى أي مما يلي: [ 150 ]

  • تسلسل أولي ، يغطي ما يقرب من 90% من الجينوم بدقة تقارب 99.9%
  • تسلسل كامل ، يغطي أكثر من 95% من الجينوم بدقة تقارب 99.99%

إنتاج تسلسل نهائي عالي الجودة وفقًا لهذا التعريف مكلف للغاية. لذا، فإن معظم نتائج "تسلسل الجينوم الكامل" البشري هي تسلسلات أولية (أحيانًا أعلى وأحيانًا أقل من الدقة المحددة أعلاه). [ 150 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. ↑ ألبرتس، بروس؛ جونسون، ألكسندر؛ لويس، جوليان؛ راف، مارتن؛ روبرتس، كيث؛ والتر، بيتر (2008). "الفصل 8". البيولوجيا الجزيئية للخلية (  الطبعة الخامسة). نيويورك: جارلاند ساينس. ص  550. ISBN 978-0-8153-4106-2.
  2. ↑ " ما هو تسلسل الإكسوم الكامل وتسلسل الجينوم الكامل؟" . MedlinePlus . المكتبة الوطنية الأمريكية للطب . 28 يوليو 2021. تم الاطلاع عليه في 25 أبريل 2025. هناك طريقة أخرى، تُسمى تسلسل الجينوم الكامل، تُحدد ترتيب جميع النيوكليوتيدات في الحمض النووي للفرد، ويمكنها تحديد الاختلافات في أي جزء من الجينوم.
  3. ↑ "تسلسل الجينوم الكامل" . هيئة الرعاية الصحية بولاية واشنطن . وزارة الصحة بولاية واشنطن . 30 يوليو 2024. تم الاطلاع عليه في 25 أبريل 2025. تسلسل الجينوم الكامل (WGS؛ ويسمى أيضًا تسلسل الجينوم أو تسلسل الجينوم الكامل) هو إجراء مخبري لتحديد تسلسل الحمض النووي الكامل للكائن الحي في إجراء واحد.
  4. ↑ "معايير تسلسل الجينوم الكامل للحصول على الموافقة المسبقة" (ملف PDF) . لجنة الصحة والخدمات الإنسانية في تكساس . أبريل 2024. تم الاطلاع عليه في 25 أبريل 2025. ص 2: يصف تسلسل الجينوم الكامل (WGS) تسلسل الجينوم البشري بأكمله، بما في ذلك المناطق المشفرة للبروتين (الإكسونات) والمناطق غير المشفرة. 
  5. ↑ جيليسن (يوليو 2014). "تحديد الأسباب الرئيسية للإعاقة الذهنية الشديدة من خلال تسلسل الجينوم". مجلة نيتشر . 511 (7509): 344-347 . Bibcode : 2014Natur.511..344G . doi : 10.1038/nature13394 . hdl : 2066/138095 . PMID 24896178. S2CID 205238886 .  
  6. ↑ نونيس، ك؛ واديل، ن؛ وايت، ن؛ باتش، أ.م؛ بيلي، ب؛ نيويل، ف؛ هولمز، أ؛ فينك، ج.ل؛ كوين، م.س؛ تانغ، ي.هـ؛ لامبي، ج؛ كويك، ك؛ لوفلر، ك.أ؛ مانينغ، س؛ إدريس أوغلو، س؛ ميلر، د؛ شو، ك؛ واديل، ن؛ ويلسون، ب.ج؛ بروكسنر، ت.ج؛ كريست، أ.ن؛ هارليوونغ، إ؛ نورس، س؛ نوربخش، إ؛ أندرسون، م؛ كازاكوف، س؛ ليونارد، س؛ وود، س؛ سيمبسون، ب.ت؛ ريد، ل.إ؛ كراوس، ل؛ هاسي، د.ج؛ واتسون، د.إ؛ لورد، ر.ف؛ نانكارو، د؛ فيليبس، و.أ؛ غوتلي، د؛ سميثرز، ب.م؛ وايتمان، د.س؛ هايوارد، ن.ك؛ كامبل، ب.ج؛ بيرسون، ج.ف؛ غريموند، إس إم؛ باربور، إيه بي (29 أكتوبر 2014). "تحدث الكوارث الجينومية بشكل متكرر في سرطان الغدد المريئية وتحفز تكوين الأورام" . نيتشر كوميونيكيشنز . 5 5224. Bibcode : 2014NatCo...5.5224N . doi : 10.1038/ncomms6224 . PMC 4596003. PMID 25351503 .  
  7. ↑ فان إل، سي جي؛ كورنيل، ماك. بوري، ف. هاستينغز، RJ. فيلمان، ف؛ هودجسون، SV. هوارد، HC. كامبون تومسن، أ؛ كنوبيرس، بي إم؛ مايرز هيجبور، ه؛ شيفر، ح؛ ترانيبيرج ، إل. دوندورب، دبليو؛ دي فيرت، GM (يونيو 2013). "تسلسل الجينوم الكامل في الرعاية الصحية. توصيات الجمعية الأوروبية لعلم الوراثة البشرية " . المجلة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية . 21 (ملحق 1): S1-5. دوى : 10.1038/ejhg.2013.46 . بمك 3660957 . بميد 23819146 .  
  8. ↑ موني، شون (سبتمبر 2014). " التقدم نحو دمج علم الصيدلة الجينية في الممارسة العملية" . علم الوراثة البشرية . 134 (5): 459-465 . doi : 10.1007/s00439-014-1484-7 . PMC 4362928. PMID 25238897 .  
  9. ↑ مجلة كيكك، 01 يناير 2009
  10. ↑ ماركس، فيفيان (11 سبتمبر 2013). "التسلسل الجيني من الجيل التالي: أحجية الجينوم" . مجلة نيتشر . 501 (7466): 263-268 . Bibcode : 2013Natur.501..263M . doi : 10.1038/501261a . PMID 24025842 . 
  11. ↑ al.], Bruce Alberts ... [et (2008). Molecular biology of the cell (5th ed.). New York: Garland Science. p. 551. ISBN   978-0-8153-4106-2.
  12. ^ فييرز، دبليو. كونتريراس، ر. دورينك، F .؛ هيجمان، ج.؛ إيزرنتانت، د.؛ ميريجارت، J.؛ مين جو، دبليو؛ مولمانز، ف؛ رايمايكرز، أ؛ فان دن بيرجي، أ؛ فولكيرت، G.؛ يسيبارت، م. (8 أبريل 1976). “تسلسل النيوكليوتيدات الكامل للبكتيريا MS2 RNA: البنية الأولية والثانوية لجين النسخ المتماثل”. طبيعة . 260 (5551): 500– 507. بيب كود : 1976Natur.260..500F . دوى : 10.1038/260500a0 . بميد 1264203 . S2CID 4289674 .  
  13. ↑ أوليفر، إس جي؛ فان دير آرت، كيو جيه إم؛ أغوستوني-كاربون، إم إل؛ وآخرون . (مايو 1992). "التسلسل الكامل للحمض النووي لكروموسوم الخميرة الثالث". نيتشر . 357 (6373): 38-46 . Bibcode : 1992Natur.357...38O . doi : 10.1038/357038a0 . PMID 1574125. S2CID 4271784 .   
  14. 1 2 3 فليشمان، ر.؛ آدامز، م.؛ وايت، أ.؛ كلايتون، ر.؛ كيركنس، إ.؛ كيرلافاج، أ.؛ بولت، س.؛ تومب، ج.؛ دوغيرتي، ب.؛ ميريك، ج.؛ وآخرون. (28 يوليو 1995). "التسلسل العشوائي والتجميع الكامل لجينوم المستدمية النزلية Rd". مجلة ساينس . 269 (5223): 496-512 . Bibcode : 1995Sci...269..496F . doi : 10.1126/science.7542800 . PMID 7542800 . 
  15. ↑ إيدي، شون ر. (نوفمبر 2012). "مفارقة قيمة C، الحمض النووي غير الوظيفي، وبرنامج ENCODE" . علم الأحياء الحالي . 22 (21): R898– R899. Bibcode : 2012CBio...22.R898E . doi : 10.1016/j.cub.2012.10.002 . PMID 23137679 . 
  16. ↑ بيليسر، جاومي؛ فاي، مايكل ف.؛ ليتش، إيليا ج. (15 سبتمبر 2010). "أكبر جينوم حقيقي النواة على الإطلاق؟". المجلة النباتية لجمعية لينيان . 164 (1): 10-15 . doi : 10.1111/j.1095-8339.2010.01072.x .
  17. ↑ اتحاد تسلسل الجينوم البشري الدولي (21 أكتوبر 2004). "إتمام تسلسل الكروماتين الحقيقي للجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 431 (7011): 931-945 . Bibcode : 2004Natur.431..931H . doi : 10.1038/nature03001 . PMID 15496913 . 
  18. ^ جوفو، أ. باريل، بي جي؛ بوسي، ه.؛ ديفيس، RW. دوجون، ب. فيلدمان، هـ؛ جاليبرت، F .؛ هوهيسل، دينار؛ جاك، C.؛ جونستون، م. لويس، إي جيه؛ ميوز، الأب. موراكامي، Y .؛ فيليبسن، ب. تيتيلين، ه.؛ أوليفر، سان جرمان (25 أكتوبر 1996). "الحياة مع 6000 الجينات" . علوم . 274 (5287): 546–567 . بيب كود : 1996Sci...274..546G . دوى : 10.1126/science.274.5287.546 . بميد 8849441 . S2CID 16763139 . تمت أرشفة الملف (PDF) من النسخة الأصلية في 7 مارس 2016.  
  19. ↑ اتحاد تسلسل جينوم الدودة الأسطوانية C. elegans (11 ديسمبر 1998). "تسلسل جينوم الدودة الأسطوانية C. elegans: منصة لدراسة علم الأحياء". مجلة ساينس . 282 (5396): 2012-2018 . رمز Bibcode : 1998Sci...282.2012. doi : 10.1126 /science.282.5396.2012 . PMID 9851916 .   
  20. ↑ ألبرتس، بروس (2008). البيولوجيا الجزيئية للخلية ( الطبعة الخامسة). نيويورك: جارلاند ساينس. ص 552. ISBN   978-0-8153-4106-2.
  21. ↑ دونهام، آي. (ديسمبر 1999). "تسلسل الحمض النووي للكروموسوم البشري 22" . مجلة نيتشر . 402 (6761): 489-495 . Bibcode : 1999Natur.402..489D . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 . 
  22. ↑ آدامز، إم دي؛ سيلنيكر، إس إي؛ هولت، آر إيه؛ وآخرون . (24 مارس 2000). "تسلسل جينوم ذبابة الفاكهة (دروسوفيلا ميلانوجاستر)". مجلة ساينس . 287 (5461): 2185-2195 . رمز Bibcode : 2000Sci...287.2185. CiteSeerX : 10.1.1.549.8639 . doi : 10.1126/science.287.5461.2185 . PMID : 10731132 .   
  23. ↑ مبادرة جينوم نبات الرشاد (14 ديسمبر 2000). "تحليل تسلسل جينوم نبات الرشاد المزهر (Arabidopsis thaliana)" . مجلة نيتشر . 408 (6814): 796-815 . Bibcode : 2000Natur.408..796T . doi : 10.1038/35048692 . PMID: 11130711 . 
  24. ↑ فينتر جيه سي؛ آدامز إم دي؛ مايرز إي دبليو؛ وآخرون . (16 فبراير 2001). "تسلسل الجينوم البشري". مجلة ساينس . 291 (5507): 1304-1351 . رمز Bibcode : 2001Sci...291.1304V . doi : 10.1126/science.1058040 . PMID 11181995 .  
  25. ↑ ووترستون، آر إتش؛ ليندبلاد-توه، كيه؛ بيرني، إي؛ وآخرون . (31 أكتوبر 2002). "التسلسل الأولي والتحليل المقارن لجينوم الفأر" . مجلة نيتشر . 420 (6915): 520-562 . Bibcode : 2002Natur.420..520W . doi : 10.1038/nature01262 . PMID 12466850 .  
  26. ↑ الاتحاد الدولي لتسلسل الجينوم البشري (2004-09-07). "إتمام تسلسل الكروماتين الحقيقي للجينوم البشري" . مجلة نيتشر . 431 (7011): 931-945 . Bibcode : 2004Natur.431..931H . doi : 10.1038/nature03001 . PMID 15496913 . 
  27. ↑ براسلافسكي، إيدو؛ وآخرون (2003). "يمكن الحصول على معلومات التسلسل من جزيئات الحمض النووي المفردة" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 100 ( 7): 3960-3984 . Bibcode : 2003PNAS..100.3960B . doi : 10.1073/pnas.0230489100 . PMC 153030. PMID 12651960 .   
  28. ↑ هيغر، مونيكا (2 أكتوبر 2013). "تسلسل الخلايا المفردة يحقق تقدماً ملحوظاً في المجال السريري مع أولى تطبيقاته في علاج السرطان والتشخيص الجيني قبل الزرع" . أخبار التسلسل السريري .
  29. ↑ يوركويتش، آي آر؛ كورف، بي آر؛ ليمان، إل إس (2014). "تسلسل الجينوم الكامل قبل الولادة - هل السعي لمعرفة مستقبل الجنين أمر أخلاقي؟". مجلة نيو إنجلاند الطبية . 370 (3): 195-197 . doi : 10.1056/NEJMp1215536 . PMID 24428465 . 
  30. ↑ ستادن ر (يونيو 1979). " استراتيجية لتسلسل الحمض النووي باستخدام برامج الحاسوب" . أبحاث الأحماض النووية . 6 (7): 2601-2610 . doi : 10.1093/nar/6.7.2601 . PMC 327874. PMID 461197 .  
  31. ↑ إدواردز، أ؛ كاسكي، ت (1991). "استراتيجيات الإغلاق لتسلسل الحمض النووي العشوائي". طرق: دليل مصاحب لطرق في علم الإنزيمات . 3 (1): 41-47 . doi : 10.1016/S1046-2023(05)80162-8 .
  32. ↑ إدواردز أ؛ فوس هـ؛ رايس ب؛ سيفيتيلو أ؛ ستيجمان ج؛ شواغر س؛ زيمرمان ج؛ إيرفل هـ؛ كاسكي س ت؛ أنسورج و (أبريل 1990). "التسلسل الآلي للحمض النووي لموقع HPRT البشري". علم الجينوم . 6 (4): 593-608 . doi : 10.1016/0888-7543(90)90493-E . PMID 2341149 . 
  33. ↑ روتش جيه سي؛ بويسن سي؛ وانغ كيه؛ هود إل (مارس 1995). "تسلسل النهايات الزوجية: منهج موحد لرسم الخرائط الجينومية والتسلسل". علم الجينوم . 26 (2): 345-353 . doi : 10.1016/0888-7543(95)80219-C . PMID 7601461 . 
  34. ↑ فليشمان آر دي؛ آدامز إم دي؛ وايت أو؛ كلايتون آر إيه؛ كيركنس إي إف؛ كيرلافاج إيه آر؛ بولت سي جيه؛ تومب جيه إف؛ دوغيرتي بي إيه؛ ميريك جيه إم؛ ماكيني؛ ساتون؛ فيتزهيو؛ فيلدز؛ جوسين؛ سكوت؛ شيرلي؛ ليو؛ غلوديك؛ كيلي؛ وايدمان؛ فيليبس؛ سبريجز؛ هيدبلوم؛ كوتون؛ أترباك؛ حنا؛ نغوين؛ ساوديك؛ وآخرون . (يوليو 1995). "التسلسل العشوائي والتجميع الكامل لجينوم المستدمية النزلية Rd". مجلة ساينس . 269 (5223): 496-512 . Bibcode : 1995Sci...269..496F . doi : 10.1126/science.7542800 . PMID 7542800 .  
  35. ↑ آدامز، دكتوراه في الطب؛ وآخرون (2000). "تسلسل جينوم ذبابة الفاكهة (دروسوفيلا ميلانوجاستر)". مجلة ساينس . 287 (5461): 2185-2195 . رمز Bibcode : 2000Sci...287.2185. CiteSeerX 10.1.1.549.8639 . doi : 10.1126 /science.287.5461.2185 . PMID 10731132 .   
  36. 1 2 موخوبادياي ر (فبراير 2009). "أجهزة تسلسل الحمض النووي: الجيل القادم". مجلة الكيمياء التحليلية . 81 (5): 1736-1740 . Bibcode : 2009AnaCh..81.1736M . doi : 10.1021/ac802712u . PMID 19193124 . 
  37. ↑ سيفيم، فولكان؛ لي، جونا؛ إيغان، روبرت؛ كلوم، أليسيا؛ هوندلي، هوب؛ لي، جاني؛ إيفرود، آر. كريغ؛ ديتويلر، أنجيلا م.؛ بيبوت، براد م.؛ بيت-ريدج، جينيفر؛ غوكر، ماركوس؛ موراي، أليسون إي.؛ ليندمان، ستيفن ر.؛ كلينك، هانز-بيتر؛ أومالي، رونان (2019-11-26). "بيانات الميتاجينوم بتقنية التسلسل العشوائي لمجتمع محاكاة محدد باستخدام تقنيات أوكسفورد نانوبور، وباكبيو، وإلومينا" . البيانات العلمية . 6 (1): 285. Bibcode : 2019NatSD...6..285S . doi : 10.1038/s41597-019-0287-z . ISSN 2052-4463 . PMC 6879543. PMID 31772173 .​   
  38. ↑ وانغ، يونهاو؛ تشاو، يو؛ بولاس، أودري؛ وانغ، يورو؛ أو، كين فاي (نوفمبر 2021). "تقنية تسلسل النانوبور، المعلوماتية الحيوية والتطبيقات" . مجلة نيتشر للتكنولوجيا الحيوية . 39 (11): 1348-1365 . doi : 10.1038/s41587-021-01108-x . ISSN 1546-1696 . PMC 8988251. PMID 34750572 .   
  39. ↑ "باحثون يُنتجون أول تسلسل كامل وغير متقطع للجينوم البشري" . www.genome.gov . 2022.
  40. ^ نورك، سيرجي. كورين، سيرجي. ري، أرانج؛ راوتياينن، ميكو؛ بزيكادزه، أندريه ف؛ ميخينكو، علاء؛ فولجر، ميتشل ر. التيموس، نيكولاس. أورالسكي، ليف؛ غيرشمان، أرييل؛ اجانيزوف، سيرجي؛ هويت، سافانا J.؛ ديخانس، مارك؛ لوجسدون، جلينيس أ؛ ألونج يا مايكل. أنتوناراكيس، ستيليانوس إي؛ بورشرز، ماثيو؛ بوفارد، جيرارد G.؛ بروكس، شيليز Y.؛ كالداس، جينا V؛ تشين، ناي تشيون؛ تشنغ، هاويو؛ تشين، تشن شان؛ تشاو ، ويليام. دي ليما، ليوناردو ج.؛ ديشوك، فيليب سي؛ دوربين، ريتشارد. دفوركينا، تاتيانا؛ فيدس، إيان T.؛ فورمينتي، جوليو. فولتون، روبرت س. فونجتاماسان، أركاراتشاي؛ جاريسون، إريك؛ جرادي ، باتريك جي إس. جريفز ليندساي، تينا أ؛ هول، ايرا م. هانسن، نانسي F.؛ هارتلي، غابرييل أ. هوكنيس، مارينا؛ هاو، كيرستين؛ هونكابيلر، مايكل دبليو؛ جاين، شيراج؛ جاين، ميتن؛ جارفيس، إريك د.؛ كيربيدجيف، بيتر؛ كيرش، ميلاني؛ كولموجوروف، ميخائيل؛ كورلاش، جوناس. كريميتسكي، ميلين؛ لي، هنغ؛ مادورو، فاليري ف؛ مارشال، توبياس. مكارتني، آن م. ماكدانيال، جينيفر؛ ميلر، داني E.؛ موليكين، جيمس C.؛ مايرز، يوجين دبليو. أولسون، ناثان د. باتن، بنديكتوس السادس عشر. بيلوسو، بول؛ بيفزنر، بافيل أ. بوروبسكي، ديفيد؛ بوتابوفا، تمارا؛ روجايف، يفغيني الأول؛ روزنفيلد، جيفري أ. سالزبرج، ستيفن L.؛ شنايدر، فاليري أ؛ سيدلازيك، فريتز J.؛ شافين، كيشوار؛ شو، كولن ج. شومات، ألينا؛ سيمز، ينغ؛ سميت، العريان فا؛ سوتو، دانييلا C.؛ سوفيتش، إيفان؛ مخزن، جيسيكا م. شوارع هارون. سوليفان، بيث أ. تيبو نيسن، فرانسواز؛ تورانس، جيمس. فاغنر، جوستين؛ والينز، بريان ب. فينغر، آرون؛ وود ، جوناثان إم دي . شياو، تشونلين؛ يان، ستيفاني م.؛ يونغ، أليس C.؛ زاراتي، سامانثا؛ سورتي، أورفاشي؛ مكوي، راجيف C .؛ دينيس، ميغان ي.؛ ألكسندروف، إيفان أ.؛ جيرتون، جينيفر ل.؛ أونيل، راشيل ج.؛ تيمب، وينستون؛ زوك، جاستن م.؛ شاتز، مايكل س.؛ إيشلر، إيفان إي.؛ ميغا، كارين هـ.؛ فيليبي، آدم م. (أبريل 2022). "التسلسل الكامل للجينوم البشري" . مجلة ساينس . 376 (6588): 44-53 . doi : 10.1126/science.abj6987 . PMC 9186530 . 
  41. ↑ "يوم الحمض النووي 2025: أين نحن في عصر الجينومات من نوع T2T، الجزء 1 |" . gigasciencejournal.com .
  42. ↑ "أين نحن في عصر جينومات T2T، الجزء 2. كروموسومات الجنس T2T |" . gigasciencejournal.com .
  43. ↑ ستريكلاند، إليزا (14 أكتوبر 2015). "تقنيات جينية جديدة لتشخيص الرضع المصابين بأمراض خطيرة خلال 26 ساعة - مجلة IEEE Spectrum" . IEEE . مؤرشف من الأصل في 16 نوفمبر 2015. تم الاطلاع عليه في 11 نوفمبر 2016 .
  44. ↑ "مقال: سباق لخفض تكاليف تسلسل الجينوم الكامل - أخبار الهندسة الوراثية والتكنولوجيا الحيوية - التكنولوجيا الحيوية من المختبر إلى الأعمال التجارية" . Genengnews.com. مؤرشف من الأصل بتاريخ 17 أكتوبر 2006. تم الاطلاع عليه بتاريخ 23 فبراير 2009 .
  45. ↑ "تكاليف تسلسل الجينوم الكامل تستمر في الانخفاض" . Eyeondna.com. مؤرشف من الأصل بتاريخ 25 مارس 2009. تم الاطلاع عليه بتاريخ 23 فبراير 2009 .
  46. ↑ هارمون، كاثرين (28 يونيو 2010). "تسلسل الجينوم للجميع" . مجلة ساينتفك أمريكان. مؤرشف من الأصل في 19 مارس 2011. تم الاطلاع عليه في 13 أغسطس 2010 .
  47. ↑ أخبار التكنولوجيا في سان دييغو/مقاطعة أورانج. "شركة سيكوينوم تُطوّر تقنية تسلسل الجزيئات المفردة القائمة على تقنية النانو المسامية من الجيل الثالث" . Freshnews.com. مؤرشف من الأصل بتاريخ 5 ديسمبر 2008. تم الاطلاع عليه بتاريخ 24 فبراير 2009 .
  48. ١ ٢ "مقال: تسلسل الجينوم الكامل في ٢٤ ساعة - أخبار الهندسة الوراثية والتكنولوجيا الحيوية - التكنولوجيا الحيوية من المختبر إلى الأعمال التجارية" . Genengnews.com. مؤرشف من الأصل بتاريخ ١٧ أكتوبر ٢٠٠٦. تم الاطلاع عليه بتاريخ ٢٣ فبراير ٢٠٠٩ .
  49. ↑ "شركة باسيفيك بايو تكشف النقاب عن جهودها في مجال تسلسل الجينوم عالي السرعة" . فينشر بيت. 10 فبراير 2008. مؤرشف من الأصل في 20 فبراير 2009. تم الاطلاع عليه في 23 فبراير 2009 .
  50. ↑ "عالم تكنولوجيا المعلومات الحيوية" . عالم تكنولوجيا المعلومات الحيوية. 6 أكتوبر 2008. مؤرشف من الأصل في 17 فبراير 2009. تم الاطلاع عليه في 23 فبراير 2009 .
  51. ↑ "مع جهاز جديد، تُقرّب شركة هيليكوس تسلسل الجينوم الشخصي خطوةً أخرى" . إكسكونومي . 22 أبريل 2008. مؤرشف من الأصل في 2 يناير 2011. تم الاطلاع عليه في 28 يناير 2011 .
  52. ↑ «تستمر تكاليف تسلسل الجينوم الكامل في الانخفاض: 300 مليون دولار في عام 2003، ومليون دولار في عام 2007، و60 ألف دولار حاليًا، و5000 دولار بنهاية العام» . Nextbigfuture.com. 25 مارس 2008. مؤرشف من الأصل في 20 ديسمبر 2010. تم الاطلاع عليه في 28 يناير 2011 .
  53. ↑ جرافيتز، لورين. "شريحة هان كاو النانوية السائلة قد تخفض تكاليف تسلسل الحمض النووي بشكل كبير" . مراجعة التكنولوجيا . مؤرشف من الأصل في 29 مارس 2011.
  54. ↑ جوليا كارو (26 أكتوبر 2015). "شركة بي جي آي تطلق جهاز تسلسل مكتبي في الصين؛ وتخطط لتسجيل المنصة لدى إدارة الغذاء والدواء الصينية" . موقع جينوم ويب . تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2018 .
  55. ↑ "شركة BGI تطلق جهاز تسلسل مكتبي جديد في الصين، وتسجل نسخة أكبر منه لدى إدارة الغذاء والدواء الصينية" . 360Dx . GenomeWeb. 11 نوفمبر 2016. تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2018 .
  56. ↑ مونيكا هيغر (26 أكتوبر 2018). "شركة بي جي آي تطلق جهاز تسلسل جديد بعد أن أبلغ العملاء عن بيانات من أجهزة سابقة" . موقع جينوم ويب . تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2018 .
  57. ↑ جون كارول (14 يوليو 2008). "شركة باسيفيك بيوساينسز تربح 100 مليون دولار مقابل تقنية التسلسل الجيني" . فيرس بيوتك. مؤرشف من الأصل في 1 مايو 2009. تم الاطلاع عليه في 23 فبراير 2009 .
  58. ↑ سيبل، ليزا (8 فبراير 2009). "علم الجينوم الكامل يُحقق خفضًا جذريًا في التكلفة" . مجلة وادي السيليكون / سان خوسيه للأعمال . تاريخ الاسترجاع: 23 فبراير 2009 .
  59. ↑ سارة نيفيل (5 مارس 2018). "تسلسل الحمض النووي الأرخص يكشف أسرار الأمراض النادرة" . فايننشال تايمز . تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2018 .
  60. ↑ كارلسون، روب (2007-01-02). "بعض الأفكار حول التسلسل السريع للجينوم وجائزة أركون - التركيب" . Synthesis.cc. مؤرشف من الأصل في 2009-08-08 . تم الاسترجاع في 2009-02-23 .
  61. ↑ "نظرة عامة على الجائزة: جائزة Archon X لعلم الجينوم" .
  62. ↑ ديامانديس، بيتر. "تجاوز الابتكار: إلغاء جائزة إكس برايز" . هافينغتون بوست . مؤرشف من الأصل بتاريخ 25 أغسطس 2013.
  63. ↑ ألدوس، بيتر. "إلغاء جائزة إكس للجينومات قبل بدايتها" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 21-09-2016.
  64. ↑ "نظام SOLiD - منصة تسلسل الحمض النووي من الجيل التالي" . Gizmag.com. 27 أكتوبر 2007. مؤرشف من الأصل في 19 يوليو 2008. تم الاطلاع عليه في 24 فبراير 2009 .
  65. ↑ "مشروع الجينوم بقيمة 1000 دولار: هل هو قادم قريبًا؟" . Dddmag.com. 1 أبريل 2010. مؤرشف من الأصل في 15 أبريل 2011. تم الاطلاع عليه في 28 يناير 2011 .
  66. ↑ "تسلسل الجينوم الفردي - شركة Illumina" . Everygenome.com. مؤرشف من الأصل بتاريخ 19-10-2011 . تم الاطلاع عليه بتاريخ 28-01-2011 .
  67. ↑ «شركة Illumina تطلق خدمة تسلسل الجينوم الشخصي مقابل 48 ألف دولار: مستقبل علم الوراثة» . Scienceblogs.com. مؤرشف من الأصل في 16 يونيو 2009. تم الاطلاع عليه بتاريخ 28 يناير 2011 .
  68. ↑ ويد، نيكولاس (11 أغسطس/آب 2009). "انخفاض تكلفة فك شفرة الجينوم" . صحيفة نيويورك تايمز . مؤرشف من الأصل في 21 مايو/أيار 2013. تم الاطلاع عليه في 3 مايو/أيار 2010 .
  69. ↑ "مؤشر التكنولوجيا" . أخبار ABC . مؤرشف من الأصل في 15 مايو 2016. تم الاطلاع عليه في 29 أبريل 2018 .{{cite web}}: CS1 maint: bot: حالة عنوان URL الأصلي غير معروفة ( رابط )
  70. ↑ درماناك ر، سباركس أ ب، كالو م ج، وآخرون (2010). "تسلسل الجينوم البشري باستخدام قراءات القواعد غير المتسلسلة على مصفوفات نانوية ذاتية التجميع من الحمض النووي" . مجلة ساينس . 327 (5961): 78-81 . Bibcode : 2010Sci...327...78D . doi : 10.1126/science.1181498 . PMID 19892942. S2CID 17309571 .   
  71. ↑ "شركة Illumina تعلن عن تسعير الجينوم بـ 5000 دولار - عالم تكنولوجيا المعلومات الحيوية" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 17-05-2011.
  72. ↑ "المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري يمنح أكثر من 50 مليون دولار لتطوير تقنية تسلسل الحمض النووي منخفضة التكلفة" . موقع جينوم ويب . 2009. مؤرشف من الأصل في 3 يوليو 2011.
  73. ↑ «شركة لايف تكنولوجيز تُطلق جهاز التسلسل الجيني المكتبي Ion Proton™؛ المصمم لفك شفرة الجينوم البشري في يوم واحد مقابل 1000 دولار» (بيان صحفي). مؤرشف من الأصل بتاريخ 23 ديسمبر 2012. تم الاطلاع عليه بتاريخ 30 أغسطس 2012 .
  74. ↑ أندرو بولاك (17 فبراير 2012). "أكسفورد نانوبور تكشف النقاب عن جهاز صغير لتسلسل الحمض النووي - صحيفة نيويورك تايمز" . صحيفة نيويورك تايمز . مؤرشف من الأصل في 7 يناير 2013. تم الاطلاع عليه في 11 نوفمبر 2016 .
  75. ↑ "جهاز تسلسل Illumina يُتيح تسلسل جينوم بتكلفة 1000 دولار". أخبار: علم الجينوم والبروتيوميات. أخبار الهندسة العامة والتكنولوجيا الحيوية (ورقة بحثية). المجلد 34، العدد 4. 15 فبراير 2014. ص 18.   
  76. ↑ راجع هايدن، إريكا (15 يناير 2014). "هل مشروع الجينوم الذي تبلغ تكلفته 1000 دولار حقيقي؟". مجلة نيتشر nature.2014.14530 . doi : 10.1038/nature.2014.14530 . S2CID 211730238 . 
  77. ↑ "تكلفة تسلسل الجينوم البشري" . www.genome.gov . مؤرشف من الأصل بتاريخ 25-11-2016.
  78. ↑ "مع خدمة تسلسل الجينوم الكامل مقابل 999 دولارًا، تنطلق شركة فيريتاس في هدفها المتمثل في إتاحة معلومات الحمض النووي للجميع" . 6 مارس 2016.
  79. ↑ أندروز، جو (1 يوليو 2019). "شركة Veritas Genetics، المنافسة لشركة 23andMe، تخفض سعر تسلسل الجينوم الكامل بنسبة 40% إلى 600 دولار" . سي إن بي سي . تم الاطلاع عليه بتاريخ 2 سبتمبر 2019 .
  80. ↑ ميغان مولتيني (18 مايو 2017). "عملاق الجينوم الصيني يضع نصب عينيه جهاز التسلسل الأمثل" . وايرد . تم الاطلاع عليه في 2 ديسمبر 2018 .
  81. ↑ فيليبس، ك. أ؛ بليتشر، م. ج؛ لاداباوم، يو (2015). "هل مشروع "الجينوم ذو الألف دولار" يكلف ألف دولار حقًا؟ فهم الفوائد والتكاليف الكاملة لتسلسل الجينوم" . التكنولوجيا والرعاية الصحية . 23 (3): 373-379 . doi : 10.3233/THC-150900 . PMC 4527943. PMID 25669213 .  
  82. ↑ "مدونة: الحجم الحقيقي للجينوم البشري | فيريتاس جينيتكس" . فيريتاس جينيتكس . 28 يوليو 2017.
  83. ↑ "همس، لم يتم تسلسل الجينوم البشري بالكامل أبدًا" . statnews.com . 2017-06-20.
  84. ↑ "مركز علم الجينوم" . Gladstone.ucsf.edu. مؤرشف من الأصل في 30 يونيو 2010. تم الاطلاع عليه في 23 فبراير 2009 .
  85. ↑ نيشيدا ن؛ كويكي أ؛ تاجيما أ؛ أوغاساوارا ي؛ إيشيباشي ي؛ أوهارا ي؛ إينوي إ؛ توكوناغا ك (2008). " تقييم أداء منصة Affymetrix SNP Array 6.0 باستخدام 400 فرد ياباني" . BMC Genomics . 9 (1): 431. doi : 10.1186/1471-2164-9-431 . PMC 2566316. PMID 18803882 .  
  86. ↑ بيترون، جاستن (16 يناير 2007). "إلومينا وديكود تُصنّعان شريحة SNP بمليون متغير؛ إطلاقها في الربع الثاني يتزامن مع إصدار مصفوفة Affy's 6.0 SNP | أخبار BioArray | المصفوفات" . GenomeWeb. مؤرشف من الأصل في 16 يوليو 2011. تم الاطلاع عليه في 23 فبراير 2009 .
  87. ↑ روتش جيه سي؛ غلوسمان جي؛ سميت إيه إف؛ وآخرون . (أبريل 2010). "تحليل الوراثة الجينية في عائلة رباعية باستخدام تسلسل الجينوم الكامل" . مجلة ساينس . 328 (5978): 636-639 . Bibcode : 2010Sci...328..636R . doi : 10.1126/science.1186802 . PMC 3037280. PMID 20220176 .   
  88. ↑ كامبل سي دي؛ تشونغ جيه إكس؛ ماليج إم؛ وآخرون . (نوفمبر 2012). "تقدير معدل الطفرات البشرية باستخدام التماثل الجيني في مجموعة مؤسسين" . نات . جينيت . 44 (11): 1277-81 . doi : 10.1038/ng.2418 . PMC 3483378. PMID 23001126 .   
  89. ^ يي ك. بيكمان م . لامير إي دبليو . تشانغ واي . معيد م . فان دن أكر إب. ديلين ج . هوينج دوسترمات جي جي . كريمر د . أنفار سي. لاروس جي اف . جونز د . رين ك . بلاكبيرن ب . بوتلوري س . طويل س؛ جوريف الخامس . فان دير بريجن ر . ويستندورب آر جي . 't هوين السلطة الفلسطينية. دن دونن ج . فان أومين جي جي . ويليمسن جي . بيتس إس جيه . كوكس دكتور . نينغ ز . بومسما دي . سلاجبوم بي (ديسمبر 2013). "الشيخوخة كتراكم متسارع للمتغيرات الجسدية: تسلسل الجينوم الكامل لأزواج توأم أحادية الزيجوت في منتصف العمر ومتوسطة العمر" . التوأم الدقة هوم جينيت . 16 (6): 1026– 32. doi : 10.1017/thg.2013.73 . hdl : 11370/15c5129b-16bd-4dd0-a72b-4ac667584928 . PMID 24182360 . 
  90. ↑ كايتلي، ب. د. (فبراير 2012). "معدلات وعواقب الطفرات الجديدة على اللياقة البدنية لدى البشر" . علم الوراثة . 190 (2): 295-304 . Bibcode : 2012Genet.190..295K . doi : 10.1534/genetics.111.134668 . PMC 3276617. PMID 22345605 .  
  91. ↑ موستجوكي إس، يونغ إن إس. الطفرات الجسدية في الأمراض "الحميدة". مجلة نيو إنجلاند الطبية. 27 مايو 2021؛ 384(21): 2039-2052. doi: 10.1056/NEJMra2101920. PMID: 34042390.
  92. ↑ تونا م؛ آموس سي آي (نوفمبر 2013). "التسلسل الجينومي في السرطان" . رسائل السرطان . 340 (2): 161-170 . doi : 10.1016/j.canlet.2012.11.004 . PMC 3622788. PMID 23178448 .  
  93. ↑ موران، لورانس أ. (24 مارس 2011). "ساندووك: ما حجم الجينوم البشري؟" . sandwalk.blogspot.com . مؤرشف من الأصل في 1 ديسمبر 2017. تم الاطلاع عليه في 29 أبريل 2018 .
  94. ↑ هودجكينسون، آلان؛ تشين، يينغ؛ إير-ووكر، آدم (يناير 2012). "التوزيع واسع النطاق للطفرات الجسدية في جينومات السرطان". الطفرات البشرية . 33 (1): 136-143 . doi : 10.1002/humu.21616 . PMID 21953857. S2CID 19353116 .  
  95. ↑ سوبيك، فران؛ لينر، بن (مايو 2015). "إصلاح عدم تطابق الحمض النووي التفاضلي يكمن وراء تباين معدل الطفرات عبر الجينوم البشري" . نيتشر . 521 ( 7550): 81-84 . Bibcode : 2015Natur.521...81S . doi : 10.1038/nature14173 . PMC 4425546. PMID 25707793 .  
  96. ↑ شوستر-بوكلر، بنيامين؛ لينر، بن (أغسطس 2012). "تنظيم الكروماتين عامل مؤثر رئيسي على معدلات الطفرات الإقليمية في خلايا السرطان البشري". مجلة نيتشر . 488 (7412): 504-507 . Bibcode : 2012Natur.488..504S . doi : 10.1038/nature11273 . PMID: 22820252. S2CID : 205229634 .  
  97. ↑ سوبيك، فران؛ لينر، بن (يوليو 2017). "بصمات الطفرات المتجمعة تكشف أن إصلاح الحمض النووي المعرض للخطأ يستهدف الطفرات في الجينات النشطة" . مجلة Cell . 170 (3): 534–547.e23. doi : 10.1016/j.cell.2017.07.003 . hdl : 10230/35343 . PMID 28753428 . 
  98. ↑ يانو، ك؛ ياماموتو، إ؛ آيا، ك؛ تاكيوتشي، هـ؛ لو، ب.س؛ هو، ل؛ ياماساكي، م؛ يوشيدا، س؛ كيتانو، هـ؛ هيرانو، ك؛ ماتسوكا، م (أغسطس 2016). "دراسة ارتباط على مستوى الجينوم باستخدام تسلسل الجينوم الكامل تحدد بسرعة جينات جديدة تؤثر على الصفات الزراعية في الأرز". علم الوراثة الطبيعية . 48 (8): 927-34 . doi : 10.1038/ng.3596 . PMID 27322545. S2CID 22427006 .  
  99. 1 2 3 بوريل، بريندان (14 سبتمبر 2010). "العيادات الأمريكية تتبنى بهدوء تقنية تسلسل الجينوم الكامل". Nature news.2010.465. doi : 10.1038/news.2010.465 .
  100. ↑ "واحد من بين مليار: حياة صبي، لغز طبي" . Jsonline.com . مؤرشف من الأصل بتاريخ 5 أكتوبر 2013. تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 نوفمبر 2016 .
  101. ↑ ماير إيه إن، ديموك دي بي، أركا إم جيه، وآخرون (مارس 2011). "وصول في الوقت المناسب للطب الجينومي" . مجلة علم الوراثة الطبية . 13 (3): 195-196 . doi : 10.1097/GIM.0b013e3182095089 . PMID 21169843. S2CID 10802499 .   
  102. ↑ آشلي، إي إيه؛ بوت، إيه جيه؛ ويلر، إم تي؛ تشين ، آر ؛ كلاين، تي إي؛ ديوي، إف إي؛ دادلي، جيه تي؛ أورموند، كي إي؛ بافلوفيتش، إيه؛ مورغان، إيه إيه؛ بوشكاريف، دي؛ نيف، إن إف؛ هودجينز، إل؛ غونغ، إل؛ هودجز، إل إم؛ برلين، دي إس؛ ثورن، سي إف؛ سانكول، كيه؛ هيبرت، جيه إم؛ وون، إم؛ ساغريا، إتش؛ وايلي، آر؛ نولز، جيه دبليو؛ تشو، إم إف؛ ثاكوريا، جيه في؛ روزنباوم، إيه إم؛ زارانيك، إيه دبليو؛ تشيرش، جي إم؛ غريلي، إتش تي؛ كويك، إس آر؛ ألتمان، آر بي (1 مايو 2010). "التقييم السريري الذي يتضمن الجينوم الشخصي" . لانسيت . 375 (9725): 1525– 35. doi : 10.1016/S0140-6736(10)60452-7 . PMC 2937184 . PMID 20435227 .  
  103. ↑ ديوي، فريدريك إي.؛ ويلر، ماثيو تي.؛ كورديرو، سيرجيو؛ بيريز، ماركو في.؛ بافلوفيتش، أليكس؛ بوشكاريف، ديمتري؛ فريمان، جيمس في.؛ كويك، ستيف آر.؛ آشلي، إيوان إيه. (أبريل 2011). "التشريح الجزيئي للموت القلبي المفاجئ باستخدام تسلسل الجينوم الكامل". مجلة الكلية الأمريكية لأمراض القلب . 57 (14): E1159. doi : 10.1016/S0735-1097(11)61159-5 .
  104. ^ ديوي، فريدريك إي. تشن رونغ. كورديرو، سيرجيو ب. أورموند، كيلي E.؛ كاليشو، كولين؛ كارشيفسكي، كونراد J .؛ ويرل كاريلو، ميشيل؛ ويلر، ماثيو T.؛ دودلي، جويل T.؛ بيرنز، جيك ك. كورنيجو، عمر E.؛ نولز، جوشوا دبليو؛ وون، مارك؛ سانجكول، كاترين؛ قونغ، لي؛ ثورن، كارولين ف. هيبرت، جوان م. كابريوتي، إيميديو؛ ديفيد، شون ب. بافلوفيتش، ألكسندرا؛ الغرب، آن. ثاكوريا، جوزيف الخامس. الكرة، مادلين P.؛ زارانيك، الكسندر دبليو. ريهم، هايدي ل.؛ الكنيسة، جورج م.؛ الغرب، جون س. بوستامانتي، كارلوس د.؛ سنايدر، مايكل. التمان، روس ب. كلاين، تيري إي؛ بوت، أتول جيه؛ آشلي، إيوان إيه. (15 سبتمبر 2011). "المخاطر الجينية الجينومية الكاملة المرحلية في عائلة رباعية باستخدام تسلسل مرجعي للأليل الرئيسي" . مجلة PLOS Genetics . 7 (9) e1002280. doi : 10.1371/journal.pgen.1002280 . PMC 3174201. PMID 21935354 .  
  105. ↑ "تقديم تطبيقات تشخيصية لاختبار 3 جيجابايت في علم الوراثة البشرية" . مؤرشف من الأصل بتاريخ 10-11-2014.
  106. ^ Boccia S، Mc Kee M، Adany R، Boffetta P، Burton H، Cambon-Thomsen A، Cornel MC، Gray M، Jani A، Knoppers BM، Khoury MJ، Meslin EM، Van Duijn CM، Villari P، Zimmern R، Cesario A، Puggina A، Colotto M، Ricciardi W (أغسطس 2014). "ما وراء جينومات الصحة العامة: مقترحات من مجموعة عمل دولية" . يورو جي للصحة العامة . 24 (6): 877– 879. دوى : 10.1093/eurpub/cku142 . بمك 4245010 . بميد 25168910 .  
  107. ↑ "أخبار RD-Connect، 18 يوليو 2014" . Rd-connect.eu . مؤرشف من الأصل في 10 أكتوبر 2016. تم الاطلاع عليه بتاريخ 11 نوفمبر 2016 .
  108. ↑ "Genomes2People: خارطة طريق للطب الجينومي" . www.frontlinegenomics.com . مؤرشف من الأصل بتاريخ 14 فبراير 2017. تم الاطلاع عليه بتاريخ 29 أبريل 2018 .
  109. ↑ "دراسة تقييم المخاطر والتثقيف بشأن مرض الزهايمر (REVEAL) - مجموعة أبحاث علم الوراثة HBHE" . hbhegenetics.sph.umich.edu . مؤرشف من الأصل بتاريخ 29 سبتمبر 2017. تم الاطلاع عليه بتاريخ 29 أبريل 2018 .
  110. ↑ غرين، روبرت سي. (22 يوليو 2009). "تقييم المخاطر والتثقيف بشأن مرض الزهايمر (REVEAL) II - عرض النص الكامل - ClinicalTrials.gov" . clinicaltrials.gov . مؤرشف من الأصل في 14 فبراير 2017. تم الاطلاع عليه في 29 أبريل 2018 .
  111. ↑ فارنيس، لاوج؛ هيلدريث، آمبر؛ سويني، ناتالي م.؛ كلارك، ميشيل م.؛ تشودري، شيمول؛ نحاس، شريف؛ جاكيسي، جولي أ.؛ بنسون، ويندي؛ كابلان، روبرت هـ.؛ كرونيك، ريتشارد؛ بينبريدج، ماثيو ن.؛ فريدمان، جينيفر؛ جولد، جيفري ج.؛ دينغ، يان؛ فيراراغافان، نارايانان؛ ديموك، ديفيد؛ كينغسمور، ستيفن ف. (ديسمبر 2018). " التسلسل السريع للجينوم الكامل يقلل من معدل اعتلال الرضع وتكلفة الاستشفاء" . مجلة npj للطب الجينومي . 3 (1): 10. doi : 10.1038/s41525-018-0049-4 . PMC 5884823. PMID 29644095 .  
  112. ↑ شوارز، ك؛ بوكانان، ج؛ تايلور، ج.س؛ ووردزورث، س (مايو 2018). "هل تُعدّ مناهج تسلسل الإكسوم الكامل والجينوم الكامل فعّالة من حيث التكلفة؟ مراجعة منهجية للأدبيات" . القيمة في الصحة . 21 : S100. doi : 10.1016/j.jval.2018.04.677 .
  113. ↑ لي، سيونغ جونغ؛ أبيكاسيس، غونزالو ر.؛ بونكه، مايكل؛ لين، شيهونغ (يوليو 2014). "تحليل ارتباط المتغيرات النادرة: تصميمات الدراسات والاختبارات الإحصائية" . المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية . 95 (1): 5-23 . Bibcode : 2014AmJHG..95....5L . doi : 10.1016/ j.ajhg.2014.06.009 . PMC 4085641. PMID 24995866 .  
  114. ↑ لي، شيهاو؛ لي، زيلين؛ تشو، هوفنغ؛ وآخرون . (سبتمبر 2020). "الدمج الديناميكي للعديد من الشروحات الوظيفية الحاسوبية يُعزز تحليل ارتباط المتغيرات النادرة في دراسات تسلسل الجينوم الكامل واسعة النطاق" . مجلة علم الوراثة الطبيعية . 52 (9): 969-983 . doi : 10.1038/s41588-020-0676-4 . PMC 7483769. PMID 32839606 .   
  115. ↑ لي، زيلين؛ لي، شيهاو؛ تشو، هوفنغ؛ وآخرون . (ديسمبر 2022). "إطار عمل للكشف عن ارتباطات المتغيرات النادرة غير المشفرة في دراسات تسلسل الجينوم الكامل واسعة النطاق" . Nature Methods . 19 ( 12): 1599–1611 . doi : 10.1038/s41592-022-01640-x . PMC 10008172. PMID 36303018. S2CID 243873361 .    
  116. ↑ "STAARpipeline: أداة شاملة لتحليل المتغيرات النادرة لبيانات تسلسل الجينوم الكامل على نطاق بنوك البيانات الحيوية". Nature Methods . 19 (12): 1532–1533 . ديسمبر 2022. doi : 10.1038/s41592-022-01641-w . PMID 36316564. S2CID 253246835 .  
  117. ^ لي شيهاو. سريعًا يا كوربين؛ تشو، هوفنغ. جاينور، شيلا م.؛ ليو، ياوو؛ تشين، هان؛ سيلفاراج، مارغريت سونيثا؛ صن، ريان؛ داي روناك. أرنيت ، دونا ك. (يناير 2023). "تحليل تلوي قوي وقابل للتطوير وفعال في استخدام الموارد للارتباطات المتنوعة النادرة في دراسات تسلسل الجينوم الكاملة الكبيرة" . علم الوراثة الطبيعة . 55 (1): 154-164 . دوى : 10.1038 / s41588-022-01225-6 . بمك 10084891 . بميد 36564505 . S2CID 255084231 .   
  118. ↑ هيربرتس، كاميرون؛ أنالا، ماتي؛ سيبولا، جوناتان؛ نغ، سارة دبليو إس؛ تشين، شين يي إي؛ نورمينين، أنسي؛ كورهونين، أولغا في؛ مونزور، أصلي دي؛ بيجا، كيفن؛ شونلاو، إيلينا؛ بيرناليس، سيسيلي كيو؛ ريتش، إيلي؛ بيكون، جاك في دبليو؛ لاك، ناثان إيه؛ نيكتر، ماتي (أغسطس 2022). "التسلسل الزمني العميق للجينوم الكامل لـ ctDNA لسرطان البروستاتا المقاوم للعلاج" . نيتشر . 608 (7921): 199-208 . Bibcode : 2022Natur.608..199H . doi : 10.1038/s41586-022-04975-9 . ISSN 1476-4687 . PMID 35859180 . S2CID 250730778 .   
  119. ↑ "باحثون من بوسطن سيقومون بتسلسل الحمض النووي للأطفال حديثي الولادة" . wbur.org . 2013-09-05.
  120. ↑ هولم، إنغريد أ.؛ أغراوال، بانكاج ب.؛ جيهان-بيرسوي، أوزجي؛ كريستنسن، كورت د.؛ فاير، شون؛ فرانكل، ليزلي أ.؛ جينيتي، كاسي أ.؛ كريير، جويل ب.؛ لاماي، ريبيكا س.؛ ليفي، هارفي ل.؛ ماكغواير، إيمي ل.؛ باراد، ريتشارد ب.؛ بارك، بيتر ج.؛ بيريرا، ستايسي؛ ريم، هايدي ل.؛ شوارتز، تاليا س.؛ وايزبرين، سوزان إ.؛ يو، تيموثي و.؛ غرين، روبرت س.؛ بيغز، آلان هـ. (2018-07-09). "مشروع BabySeq: تطبيق التسلسل الجينومي على حديثي الولادة" . BMC Pediatrics . 18 (1): 225. doi : 10.1186/s12887-018-1200-1 . PMC 6038274 . PMID 29986673 .  
  121. ↑ هوارد، هايدي كارمن؛ كنوبيرز، بارثا ماريا؛ كورنيل، مارتينا سي؛ رايت كلايتون، إيلين؛ سينيكال، كارين؛ بوري، باسكال (28 يناير 2015). "تسلسل الجينوم الكامل في فحص حديثي الولادة؟ بيان حول الأهمية المستمرة للنهج الموجهة في برامج فحص حديثي الولادة" . المجلة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية . 23 (12): 1593-1600 . doi : 10.1038/ejhg.2014.289 . ISSN 1476-5438 . PMC 4795188. PMID 25626707 .   
  122. ↑ وورنر، أودري سي؛ غالاغر، ريناتا سي؛ فوكلي، جيري؛ أدهيكاري، آشيش ن. (19 يوليو 2021). " استخدام تسلسل الجينوم الكامل والإكسوم لفحص حديثي الولادة: تحديات وفرص لصحة السكان" . مجلة فرونتيرز إن بيدياتريكس . 9 663752. doi : 10.3389/fped.2021.663752 . ISSN 2296-2360 . PMC 8326411. PMID 34350142 .   
  123. ↑ تاريني، بيث أ. (23 أغسطس 2021). "تأثير BabySeq على أبحاث طب الأطفال وعلم الجينوم - أكثر من مجرد خطوات صغيرة" . مجلة الجمعية الطبية الأمريكية لطب الأطفال . 175 (11): 1107-1108 . doi : 10.1001/jamapediatrics.2021.2826 . PMID 34424259. S2CID 237267536 .  
  124. ↑ مجلة لانسيت (22 يوليو 2023). "الفحص الجيني لحديثي الولادة: المخاوف والتحديات الحالية". مجلة لانسيت . 402 (10398): 265. doi : 10.1016/s0140-6736(23)01513-1 . ISSN 0140-6736 . PMID 37481265 .  
  125. 1 2 3 4 5 6 7 8 سيجمونز، آر إتش؛ فان لانجن، آي إم (2011). "منظور سريري حول القضايا الأخلاقية في الاختبارات الجينية". المساءلة في البحث: السياسات وضمان الجودة . 18 (3): 148-162 . Bibcode : 2013ARPQ...20..143D . doi : 10.1080/08989621.2011.575033 . PMID 21574071. S2CID 24935558 .  
  126. ↑ أيداي إي؛ دي كريستوفارو إي؛ هوبو جيه بي؛ تسوديك جي (2015). "التشويق والإثارة في تسلسل الجينوم الكامل". arXiv : 1306.1264 [ cs.CR ].
  127. ↑ بوري، باسكال؛ إيفرز-كيبومز، جيري؛ كورنيل، مارثا سي؛ كلارك، أنغوس؛ ديريكس، كريس (2009). "الاختبارات الجينية لدى القاصرين غير المصابين بأعراض: اعتبارات أساسية لتوصيات الجمعية الأوروبية لعلم الوراثة البشرية" . المجلة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية . 17 (6): 711-719 . doi : 10.1038/ejhg.2009.25 . PMC 2947094. PMID 19277061 .  
  128. ↑ هندرسون، مارك (9 فبراير 2009). "الرسم الجيني للأطفال بحلول عام 2019 سيُحدث ثورة في الطب الوقائي" . لندن: تايمز أونلاين. مؤرشف من الأصل في 11 مايو 2009. تم الاطلاع عليه في 23 فبراير 2009 .
  129. ↑ مكابي إل إل؛ مكابي إي آر (يونيو 2001). "الطب ما بعد الجينومي. الاختبارات قبل ظهور الأعراض للتنبؤ والوقاية". مجلة طب الفترة المحيطة بالولادة السريرية . 28 (2): 425-34 . doi : 10.1016/S0095-5108(05)70094-4 . PMID 11499063 . 
  130. ↑ نيلسون آر إم؛ بوتكجين جيه آر؛ كوديش إي دي؛ وآخرون . (يونيو 2001). "قضايا أخلاقية تتعلق بالاختبارات الجينية في طب الأطفال". طب الأطفال . 107 (6): 1451-1455 . doi : 10.1542/peds.107.6.1451 . PMID 11389275. S2CID 9993840 .   
  131. ↑ بوري ب؛ فرينز جيه بي؛ شوتسمانز ب؛ ديريكس ك (فبراير 2006). "فحص حاملي الجينات لدى القاصرين: مراجعة منهجية للمبادئ التوجيهية وأوراق الموقف" . المجلة الأوروبية لعلم الوراثة البشرية . 14 (2): 133-138 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5201509 . PMID 16267502 . 
  132. ↑ بوري ب؛ ستولتينز ل؛ نايس هـ؛ كاسيمان ج ج؛ ديريكس ك (نوفمبر 2006). "الاختبارات الجينية قبل ظهور الأعراض والتنبؤية لدى القاصرين: مراجعة منهجية للمبادئ التوجيهية وأوراق الموقف" . علم الوراثة السريرية . 70 (5): 374-381 . doi : 10.1111/j.1399-0004.2006.00692.x . PMID 17026616. S2CID 7066285 .  
  133. ↑ ماكغواير، إيمي إل؛ كولفيلد، تيموثي (2008). "العلم والمجتمع: أخلاقيات البحث وتحدي تسلسل الجينوم الكامل" . مجلة نيتشر ريفيوز جينيتكس . 9 (2): 152-156 . doi : 10.1038/nrg2302 . PMC 2225443. PMID 18087293 .  
  134. ↑ كورتيس، كايتلين؛ هيريوارد، جيمس؛ مانجلسدورف، ماري؛ هاسي، كارين؛ ديفيرو، جون (18 ديسمبر 2018). "حماية الثقة في علم الوراثة الطبية في العصر الجديد للطب الشرعي" . علم الوراثة في الطب . 21 (7): 1483-1485 . doi : 10.1038/ s41436-018-0396-7 . PMC 6752261. PMID 30559376 .  
  135. ↑ ويد، نيكولاس (4 سبتمبر/أيلول 2007). "في سباق الجينوم، الجزء الثاني شخصي" . صحيفة نيويورك تايمز . مؤرشف من الأصل في 11 أبريل/نيسان 2009. تم الاطلاع عليه في 22 فبراير/شباط 2009 .
  136. ↑ ليدفورد، هايدي (2007). "الوصول: كل شيء عن كريج: أول تسلسل جينومي كامل" . مجلة نيتشر . 449 (7158): 6-7 . Bibcode : 2007Natur.449....6L . doi : 10.1038/449006a . PMID 17805257 . 
  137. ↑ ليفي إس، ساتون جي، إن جي بي سي، فيوك إل، هالبيرن آل، والينز بي بي، أكسلرود إن، هوانغ جي، كيركنيس إي إف، دينيسوف جي، لين واي، ماكدونالد جي آر، بانغ إيه دبليو، شاجو إم، ستوكويل تي بي، تسياموري أ، بافنا الخامس، بانسال الخامس، كرافيتز سا، بوسام دا، بيسون كيه، ماكينتوش تي سي، ريمنجتون كا، أبريل جي إف، جيل جي، بورمان جي، روجرز واي إتش، فريزر إم إي، شيرير إس دبليو، ستراوسبيرج آر إل، فينتر جي سي (سبتمبر 2007). “تسلسل الجينوم الثنائي للإنسان الفردي” . بلوس بيول . 5 (10) هـ254. دوى : 10.1371/journal.pbio.0050254 . PMC 1964779. PMID 17803354 .​  
  138. ↑ ويد، ويد (1 يونيو 2007). "رائد الحمض النووي واتسون يحصل على خريطته الجينومية الخاصة" . إنترناشونال هيرالد تريبيون. مؤرشف من الأصل في 27 سبتمبر 2008. تم الاطلاع عليه في 22 فبراير 2009 .
  139. ↑ ويد، نيكولاس (31 مايو 2007). "فك شفرة جينوم رائد الحمض النووي" . صحيفة نيويورك تايمز . مؤرشف من الأصل في 20 يونيو 2011. تم الاطلاع عليه في 21 فبراير 2009 .
  140. ↑ ويلر، د. أ.؛ سرينيفاسان، م.؛ إيغولم، م.؛ شين، ي.؛ تشين، ل.؛ ماكغواير، أ.؛ هي، و.؛ تشين، ي. ج.؛ ماخياني، ف.؛ روث، ج. ت.؛ غوميز، إكس.؛ تارتارو، ك.؛ نيازي، ف.؛ توركوت، س. ل.؛ إيرزيك، ج. ب.؛ لوبسكي، ج. ر.؛ تشيناولت، س.؛ سونغ، إكس. زد.؛ ليو، ي.؛ يوان، ي.؛ نازاريث، ل.؛ تشين، إكس.؛ موزني، د. م.؛ مارغوليس، م.؛ وينستوك، ج. م.؛ غيبس، ر. أ.؛ روثبيرغ، ج. م. (2008). "الجينوم الكامل لفرد من خلال التسلسل المتوازي الضخم للحمض النووي" . مجلة نيتشر . 452 (7189): 872-876 . Bibcode : 2008Natur.452..872W . doi : 10.1038/nature06884 . PMID 18421352 . 
  141. ^ وانغ ج. وانغ، وي. لي، رويكيانغ؛ لي، ينغروي؛ تيان، قنغ. جودمان، لوري؛ مروحة، وي؛ تشانغ، جونكينج؛ لي، يونيو؛ تشانغ، جوانبين، جوانبين؛ قوه، ييران، ييران؛ فنغ، بينشياو، بينشياو؛ لي، هنغ، هنغ؛ لو، ياو، ياو؛ فانغ، شياو دونغ، شياو دونغ؛ ليانغ، هويكينغ، هويكينغ؛ دو، زينجلين، زينجلين؛ لي، دونغ، دونغ؛ تشاو، ييتشينغ، ييتشينغ؛ هو، يوجي، يوجي؛ يانغ، تشن تشن، تشن تشن؛ تشنغ، هانتشنغ، هانتشنغ؛ هيلمان، إيناس، إيناس؛ إينوي، مايكل، مايكل؛ بركة، جون، جون؛ يي، شين، شين؛ تشاو، جينغ، جينغ؛ دوان، جينجي، جينجي؛ تشو، يان، يان؛ وآخرون . (2008). "تسلسل الجينوم ثنائي الصيغة الصبغية لفرد آسيوي" . مجلة نيتشر . 456 (7218): 60-65 . رمز Bibcode : 2008Natur.456...60W . doi : 10.1038/nature07484 . PMC 2716080. PMID 18987735 .   
  142. ↑ بنتلي دي آر؛ بالاسوبرامانيان إس؛ وآخرون (2008). "تسلسل دقيق للجينوم البشري الكامل باستخدام كيمياء الإنهاء العكسي" . نيتشر . 456 (7218): 53-59 . Bibcode : 2008Natur.456...53B . doi : 10.1038 / nature07517 . PMC 2581791. PMID 18987734 .   
  143. ↑ لي تي جيه؛ مارديس إي آر؛ دينغ إل؛ فولتون بي؛ ماكليلان إم دي؛ تشين كيه؛ دولينغ دي؛ دنفورد-شور بي إتش؛ ماكغراث إس؛ هيكنبوثام إم؛ كوك إل؛ أبوت آر؛ لارسون دي إي؛ كوبولد دي سي؛ بول سي؛ سميث إس؛ هوكينز إيه؛ أبوت إس؛ لوك دي؛ هيلير إل دبليو؛ مينر تي؛ فولتون إل؛ ماغريني في؛ وايلي تي؛ غلاسكوك جيه؛ كونيرز جيه؛ ساندر إن؛ شي إكس؛ أوزبورن جيه آر؛ وآخرون . (2008). "تسلسل الحمض النووي لجينوم سرطان الدم النخاعي الحاد ذي النمط الخلوي الطبيعي" . نيتشر . 456 (7218): 66-72 . Bibcode : 2008Natur.456...66L . doi : 10.1038/nature07485 . PMC 2603574. PMID 18987736 .​   
  144. ↑ لور، ستيف (20 أكتوبر 2011). "كتاب جديد يروي تفاصيل معركة جوبز ضد السرطان" . صحيفة نيويورك تايمز . مؤرشف من الأصل بتاريخ 28 سبتمبر 2017.
  145. ↑ "إضافة مجموعات بيانات تسلسل الجينوم البشري الكاملة إلى مستودع الجينوم العام" . مؤرشف من الأصل في 10 يونيو 2012.
  146. ↑ كورباس م، كارياسو م، كوليتا أ، فايس د، هاريسون أ ب، موران ف، يانغ هـ (12 نوفمبر 2013). "مجموعة بيانات جينومية عائلية كاملة متاحة للعموم". bioRxiv 10.1101/000216 . 
  147. ١ ٢ "توفير ٢٠٠ ألف جينوم كامل للدراسات الطبية الحيوية بفضل جهود المملكة المتحدة" . www.science.org . تاريخ الاطلاع: ١١ ديسمبر ٢٠٢١ .
  148. ↑ "بيانات تسلسل الجينوم الكامل لـ 200,000 مشارك في بنك البيانات الحيوية البريطاني متاحة الآن" . www.ukbiobank.ac.uk . 17 نوفمبر 2021. مؤرشف من الأصل في 11 ديسمبر 2021. تم الاطلاع عليه في 11 ديسمبر 2021 .
  149. ↑ كالاواي، إيوين (30 نوفمبر 2023). "أكبر مجموعة تسلسلات جينوم بشري في العالم متاحة للعلماء" . مجلة نيتشر . 624 (7990): 16-17 . Bibcode : 2023Natur.624...16C . doi : 10.1038/d41586-023-03763-3 . PMID 38036674 . 
  150. 1 2 كريس أ. ويترستراند، ماجستير "تكلفة تسلسل الجينوم البشري" . المعهد الوطني لأبحاث الجينوم البشري .آخر تحديث: 1 نوفمبر 2021
  • تسلسل الجينوم الشخصي لجيمس واتسون
  • الجمعية الأمريكية لتقدم العلوم/مجلة ساينس: ملصق تسلسل الجينوم