أركيوغلوبوس
Archaeoglobus هو جنس من العتائق في شعبة Euryarchaeota . [ 1 ] يمكن العثور على Archaeoglobus في حقول النفط ذات درجات الحرارة العالية حيث قد تساهم في زيادة حموضة حقول النفط.
الاسْتِقْلاب
تنمو بكتيريا Archaeoglobus لا هوائياً في درجات حرارة عالية للغاية تتراوح بين 60 و95 درجة مئوية، مع نمو مثالي عند 83 درجة مئوية (النوع الفرعي A. fulgidus VC-16). [ 2 ] وهي من العتائق المختزلة للكبريتات ، حيث تجمع بين اختزال الكبريتات إلى كبريتيد وأكسدة العديد من مصادر الكربون العضوية المختلفة، بما في ذلك البوليمرات المعقدة.
يعيش نوع A. lithotrophicus كيميائياً ذاتياً التغذية معتمداً على الهيدروجين والكبريتاتوثاني أكسيد الكربون . كماينمو نوع A. profundus أيضاً بطريقة التغذية الحجرية ، ولكن على الرغم من أن هذا النوع يحتاج إلى الأسيتات وثاني أكسيد الكربون للتخليق الحيوي ، إلا أنه غير ذاتي التغذية . [ 3 ]
كشف التسلسل الجينومي الكامل لبكتيريا A. fulgidus عن وجود مجموعة شبه كاملة من الجينات المسؤولة عن إنتاج الميثان . ولا تزال وظيفة هذه الجينات في A. fulgidus غير معروفة، في حين أن غياب إنزيم مختزلة ميثيل-CoM لا يسمح بحدوث إنتاج الميثان بآلية مشابهة لتلك الموجودة في أنواع أخرى من البكتيريا المنتجة للميثان .
الوصف والأهمية
تُعدّ بكتيريا Archaeoglobus من الكائنات الحية المحبة للحرارة الشديدة، وتوجد في الفتحات الحرارية المائية، ورواسب النفط، والينابيع الساخنة. تُنتج هذه البكتيريا أغشية حيوية عند تعرضها لضغوط بيئية مثل درجات الحموضة أو الحرارة القصوى، أو التركيزات العالية من المعادن، أو إضافة المضادات الحيوية، أو المواد الغريبة، أو الأكسجين. ومن المعروف أن هذه البكتيريا تُسبب تآكل الحديد والصلب في أنظمة معالجة النفط والغاز عن طريق إنتاج كبريتيد الحديد. ومع ذلك، قد يكون لأغشيتها الحيوية تطبيقات صناعية أو بحثية، مثل إزالة سمية العينات الملوثة بالمعادن، أو جمع المعادن بطريقة اقتصادية قابلة للاستخلاص.
بنية الجينوم
يُعدّ جينوم Archaeoglobus fulgidus كروموسومًا دائريًا يبلغ نصف حجم جينوم E. coli تقريبًا ، إذ يتكون من 2,178,000 زوج قاعدي. يُشفّر ربع الجينوم بروتينات محفوظة لم تُحدد وظائفها بعد، ولكنها تُعبّر عنها أنواع أخرى من العتائق مثل Methanococcus jannaschii . بينما يُشفّر ربع آخر بروتينات خاصة بمجال العتائق. ومن الملاحظات المهمة حول هذا الجينوم وجود العديد من تضاعفات الجينات، وأن البروتينات المتضاعفة ليست متطابقة. يشير هذا إلى تمايز أيضي، لا سيما فيما يتعلق بمسارات تحلل الكربون وإعادة تدويره عبر الأحماض الدهنية المُستخلصة. كما تُضفي الجينات المتضاعفة على جينوم Archaeoglobus حجمًا أكبر من جينوم M. jannaschii . يُذكر أيضًا أن Archaeoglobus لا يحتوي على أي إنتينات في المناطق المشفرة، بينما يحتوي M. jannaschii على 18 إنتينًا.
بصمات جزيئية تُظهر صلة قرابة مع الميثانوجينات والثيرموكوكس
تُقدّم الدراسات الجينومية المقارنة على جينومات العتائق أدلةً على أن أفراد جنس Archaeoglobus هم أقرب الأقارب للعتائق المنتجة للميثان. ويدعم هذا وجود 10 بروتينات مميزة محفوظة، توجد حصريًا في جميع أنواع العتائق المنتجة للميثان وفي جنس Archaeoglobus. بالإضافة إلى ذلك، تم تحديد 18 بروتينًا توجد حصريًا في أفراد أجناس Thermococci وArchaeoglobus والميثانوجينات ، مما يُشير إلى أن هذه المجموعات الثلاث من العتائق ربما تشترك في سلف مشترك لا يوجد في أنواع العتائق الأخرى. مع ذلك، لا يُمكن استبعاد احتمال أن يكون وجود هذه البروتينات المميزة في هذه السلالات من العتائق ناتجًا عن انتقال جيني أفقي. [ 4 ]
علم البيئة
تستغل أنواع بكتيريا Archaeoglobus بيئتها من خلال العمل ككائنات متغذية على العديد من مصادر الكربون المحتملة. فهي تحصل على الكربون من الأحماض الدهنية، وتحلل الأحماض الأمينية، والألدهيدات، والأحماض العضوية، وربما ثاني أكسيد الكربون أيضًا. تُعد درجات الحرارة المرتفعة (حوالي 83 درجة مئوية) مثالية لنمو بكتيريا Archaeoglobus ، على الرغم من أن بيئة الغشاء الحيوي توفر بعض المرونة البيئية. يتكون الغشاء الحيوي من عديدات السكاريد والبروتينات والمعادن.
الدواء
يصعب تدمير الخلايا المحمية بالغشاء الحيوي باستخدام العلاج التقليدي المضاد للميكروبات، مما يمنحها إمكانيات طبية. [ 2 ]
نسالة
يعتمد التصنيف المقبول حاليًا على قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) [ 5 ] والمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI). [ 1 ]
| LTP القائم على 16S rRNA _06_2022 [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] | 53 بروتينًا مؤشرًا استنادًا إلى إصدار GTDB 10-RS226 (16 أبريل 2025). [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 سايرز وآخرون . "Archaeoglobaceae" . قاعدة بيانات التصنيف التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) . تم الاسترجاع في 2021-06-05 .
- 1 2 كلينك وآخرون. التسلسل الجينومي الكامل للأركيون المحب للحرارة الشديدة والمختزل للكبريتات Archaeoglobus fulgidus PDF Nature 390، 364-370 (نوفمبر 1997)؛ doi : 10.1038/37052
- ↑ ج. فورهولت وآخرون. إنزيمات ومرافقات إنزيمية لمسار نازعة هيدروجين أول أكسيد الكربون لتثبيت ثاني أكسيد الكربون ذاتي التغذية في بكتيريا Archaeoglobus lithotrophicus، وغياب نازعة هيدروجين أول أكسيد الكربون في بكتيريا A. profundus غيرية التغذية. أرشيف علم الأحياء الدقيقة 163، 112-118 (1995). doi : 10.1007/s002030050179
- ↑ غاو، ب. وغوبتا، ر.س. (2007). التحليل الجينومي التطوري للبروتينات المميزة للعتائق ومجموعاتها الفرعية الرئيسية وأصل إنتاج الميثان. بي إم سي جينوميكس. 8:86. doi:10.1186/1471-2164-8-86.
- ↑ جيه بي يوزيبي. "Archaeoglobaceae" . قائمة أسماء بدائيات النوى ذات المكانة في التسمية (LPSN) . تم الاسترجاع في 17 نوفمبر 2021 .
- ↑ "برنامج التدريب طويل الأمد" . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 مايو 2023 .
- ↑ "شجرة LTP_all بتنسيق نيوك" . تم الاطلاع عليها بتاريخ 10 مايو 2023 .
- ↑ "ملاحظات إصدار LTP_06_2022" (ملف PDF) . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 مايو 2023 .
- ↑ "إصدار GTDB 10-RS226" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- ↑ "ar53_r226.sp_label" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
- ↑ "تاريخ التصنيف" . قاعدة بيانات تصنيف الجينوم . تم الاسترجاع في 1 مايو 2025 .
للمزيد من القراءة
المجلات العلمية
- شتتر، ك.و. (1988). "Archaeoglobus fulgidus gen. nov., sp. nov. a new taxon of the Archaebacteria severe thermophilist". Syst. Appl. Microbiol . 10 (2): 172– 173. doi : 10.1016/s0723-2020(88)80032-8 .
الكتب العلمية
- ماديجان، إم تي؛ مارتينكو، جيه إم (2005). بيولوجيا الكائنات الدقيقة لبروك، الطبعة الحادية عشرة . بيرسون برنتيس هول.
- هوبر هـ، ستيتر ك.أو (2001). "العائلة الأولى. Archaeoglobaceae fam. nov. Stetter 1989, 2216" . في د. ر. بون، ر. و. كاستنهولز (محرران). دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا، المجلد 1: العتائق والبكتيريا المتفرعة بعمق والبكتيريا الضوئية ( الطبعة الثانية). نيويورك: سبرينغر فيرلاغ. ISBN 978-0-387-98771-2.
- ستيتر، ك.و. (1989). "المجموعة الثانية. البكتيريا القديمة المختزلة للكبريتات. رتبة البكتيريا القديمة العالمية". في: ج.ت. ستالي؛ م.ب. براينت؛ ن. بفينيغ؛ ج.ج. هولت (محررون). دليل بيرجي لعلم تصنيف البكتيريا، المجلد 3 (الطبعة الأولى ). بالتيمور: شركة ويليامز وويلكنز.
روابط خارجية
- أجناس العتائق
- الميثانوبكتيريا
