الميثانوبكتيريا

الميثانوبكتيرياتي (المعروفة سابقًا باسم " يوريكياركيوتا "، من اليونانية القديمة εὐρύς eurús، وتعني "واسع") هي مملكة من العتائق . ^{[ 4 ]} تتميز الميثانوبكتيرياتي بتنوعها الكبير، وتشمل الميثانوجينات التي تنتج غاز الميثان وتوجد غالبًا في الأمعاء؛ والبكتيريا المحبة للملوحة التي تتحمل تركيزات عالية من الملح ؛ وبعض الكائنات الهوائية واللاهوائية المحبة للحرارة  الشديدة، والتي تعيش عمومًا في درجات حرارة تتراوح بين 41 و122 درجة مئوية. يتم تمييزها عن العتائق الأخرى بشكل أساسي بناءً على تسلسل الحمض النووي الريبوزي (rRNA) وإنزيم بوليميراز الحمض النووي الفريد الخاص بها. ^{[ 5 ]} الاسم الوحيد المنشور بشكل صحيح لهذه المجموعة بموجب قانون بدائيات النوى هو الميثانوبكتيرياتي . ^{[ 6 ]}

تتميز الميثانوبكتيريا بتنوعها في المظهر والخصائص الأيضية. تضم هذه المملكة كائنات حية ذات أشكال متنوعة، بما في ذلك العصيات والمكورات . قد تظهر الميثانوبكتيريا إما موجبة أو سالبة الغرام ، وذلك تبعًا لوجود البسودومورين في جدار الخلية. ^{[ 7 ]} كما تُظهر الميثانوبكتيريا أنماط حياة متنوعة، تشمل الميثانوجينات، والمحبة للملوحة، والمختزلة للكبريتات، والمحبة للحرارة الشديدة. ^{[ 7 ]} تعيش أنواع أخرى منها في المحيط، معلقةً مع العوالق والبكتيريا. على الرغم من صعوبة استزراع ودراسة هذه الميثانوبكتيريا البحرية في المختبر، إلا أن التسلسل الجينومي يشير إلى أنها كائنات غيرية التغذية متحركة . ^{[ 8 ]}

على الرغم من الاعتقاد السائد سابقًا بأن الميثانوبكتيريا تعيش فقط في بيئات قاسية (من حيث درجة الحرارة، ومحتوى الملح، و/أو الرقم الهيدروجيني)، فقد أظهرت دراسة نشرها كورجينكوف وآخرون في يناير 2019 أن الميثانوبكتيريا تعيش أيضًا في بيئات معتدلة، مثل البيئات الحمضية ذات درجات الحرارة المنخفضة. وفي بعض الحالات، فاق عدد الميثانوبكتيريا عدد البكتيريا الموجودة. ^{[ 9 ]} كما وُجدت الميثانوبكتيريا في بيئات معتدلة أخرى مثل الينابيع المائية، والمستنقعات، والتربة، والجذور . ^{[ 10 ]} تتميز بعض أنواع الميثانوبكتيريا بقدرة عالية على التكيف؛ فرتبة تُسمى هالوباكتيرياليس توجد عادةً في بيئات شديدة الملوحة وغنية بالكبريت، ولكنها قادرة أيضًا على النمو في تركيزات ملحية منخفضة تصل إلى 2.5%، وهي نسبة تركيز الملح في مياه البحر. ^{[ 10 ]} ويبدو أن وجود الميثانوبكتيريا في الجذور يعتمد على وجود الفطريات الجذرية . ارتبط ارتفاع عدد الفطريات بارتفاع تواتر وتنوع بكتيريا الميثانوباكتيريا، بينما ارتبط غياب الفطريات الجذرية بغياب بكتيريا الميثانوباكتيريا. ^{[ 10 ]}

بموجب المدونة الدولية لتسمية بدائيات النوى ، لم يكن هناك (ولا يمكن أن يكون) اسم صالح لهذه المجموعة، لأنها تتجاوز مستوى الشعبة . في عام 2024، عُدّلت المدونة لتشمل مستويي المملكة والنطاق. في العام نفسه، نُشر اسم Methanobacteriati بشكل صحيح لهذه المجموعة، مما يجعله الاسم "الصالح" الأول والوحيد بموجب المدونة . ^{[ 6 ]} تتبنى شبكة LPSN ، التي تتوافق مع المدونة ، هذا الرأي، ^{[ 11 ]} وتُدرج Methanobacteriati السابقة كشعبة منشورة بشكل غير صحيح. ^{[ 12 ]}

لا يمتلك نظام SeqCode المنافس للتصنيفات غير المستزرعة أي مستوى أعلى من الشعبة، وبالتالي فإن مصطلح "Methanobacteriati" غير معترف به هناك أيضًا. كما أن اسم Methanobacteriati غير معترف به أيضًا: إذ لا يقبل نظام SeqCode تلقائيًا أي اسم تم إنشاؤه بموجب قانون بدائيات النوى إلا إذا كان أقدم من عام 2023. ^{[ 13 ]}

أُدرجت شعبة الميثانوبكتيرياتي في متصفح التصنيف التابع للمركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) ^{[ 14 ]} كاسم حالي للشعبة (Methanobacteriati Garrity and Holt 2002 ) حتى سبتمبر 2024، مع اعتبار الميثانوبكتيرياتي مرادفًا غير متجانس. ^{[ 15 ]} ومنذ أكتوبر 2024، أُدرجت أسماء الميثانوبكتيرياتي للمملكة، والهالوباكتيريوتا، والميثانوبكتيرياتي، والثرموبلازماتا للشعب المشمولة. ^{[ 16 ]}

تم إدراج تصنيف Methanobacteriati أيضًا في دليل بيرجي لتصنيف العتائق والبكتيريا، ولكن هذا يرجع إلى أن أحدث إصدار من الفصل قد نُشر في عام 2017. ^{[ 17 ]}

لا يتم إدراج Methanobacteriati / "Euryarchaeota" كتصنيف في قاعدة بيانات تصنيف الجينوم (GTDB)، لأن الخوارزمية لا تولد ممالك.

أشارت تحليلات تطورية أخرى إلى أن العتائق التابعة لمملكة نانوبديلاتي قد تنتمي أيضًا إلى ميثانوبكتيرياتي، بل وربما تكون مجموعة متعددة الأصول تشغل مواقع تطورية مختلفة داخل ميثانوبكتيرياتي. كما يُثار جدل حول ما إذا كان ينبغي تصنيف شعبة ألتياركيوتا ضمن نانوبديلاتي أو ميثانوبكتيرياتي. ^{[ 21 ]} يوضح الرسم البياني أدناه مخططًا تصنيفيًا يلخص هذا المقترح. ^{[ 22 ] [ 23 ]} المجموعات المميزة بين علامتي اقتباس هي سلالات مصنفة ضمن نانوبديلاتي، ولكنها منفصلة تطوريًا عن البقية.

• الكائنات النانوية المحبة للأحماض من منجم ريتشموند الأثري (ARMAN)
• قائمة أجناس العتائق
• مونيرا

• تحليل مقارن لجينومات الميثانوبكتيريا (في نظام IMG التابع لوزارة الطاقة الأمريكية ) 1