التصنيف الداكن

📅 آخر تحديث: ١ أغسطس ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ١ أغسطس ٢٠٢٦
الموسوعة الحرة

يُستخدم مصطلح "التصنيف الخفي " ( جمع: التصنيفات الخفية ) للإشارة عمومًا إلى التصنيفات التي تنتمي إلى مجموعات يتجاوز عدد أنواعها المُقدَّر عدد الأنواع الموصوفة حاليًا . [ 1 ] [ 2 ] وقد ظهر هذا المفهوم استجابةً لتطور التقنيات الجزيئية، مثل الترميز الشريطي للحمض النووي ، والتي مكّنت علماء التصنيف من تقدير عدد الأنواع غير الموصوفة في المجموعة التصنيفية بدقة أكبر. [ 3 ] [ 4 ] [ 2 ]

على الرغم من أن التعريف الدقيق للمصطلح قد يختلف بين الدراسات التي تتناول فروعًا مختلفة من شجرة الحياة ، تبعًا لأساليب الدراسة الرئيسية المتبعة، إلا أن التصنيفات غير الواضحة يصعب عمومًا تحديدها وعزلها عن التصنيفات الأخرى المشابهة أو ذات الصلة. وقد أبرز ظهور مفهوم التصنيف غير الواضح التباين بين الأساليب المورفولوجية التقليدية في علم التصنيف والأساليب الجزيئية الحديثة . [ 5 ] [ 1 ]

التعريفات

نظراً لاختلاف أساليب تحديد ووصف الأنواع الجديدة في شجرة الحياة، توجد تعريفات متعددة لما يُعرف بالتصنيف الخفي. وقد صاغ رودريك دي إم بيج مصطلح "التصنيف الخفي" لأول مرة في تدوينة عام 2011، مُسلطاً الضوء على العدد المتزايد من التسلسلات في بنك الجينات (GenBank) التي تفتقر إلى أسماء تصنيفية. [ 6 ] [ 2 ] وفي ورقة بحثية نُشرت عام 2016، توسع بيج في تعريفه، [ 3 ] حيث استخدم مصطلح "التصنيف الخفي" للإشارة تحديداً إلى الرموز الشريطية المُستخرجة من التسلسلات الموجودة في قواعد البيانات والتي لم تُنسب إلى نوع معروف وموصوف رسمياً. [ 3 ] [ 6 ] ومنذ ظهور هذا المصطلح، توسع تعريف "التصنيف الخفي" وتنوع بما يتناسب مع التحديات الخاصة بدراسة التصنيفات عبر فروع مختلفة في شجرة الحياة.

في علم الحشرات وعلم الفطريات ، تُستخدم الطرق الجزيئية، مثل الترميز الشريطي للحمض النووي واسع النطاق والترميز الشريطي الفائق للحمض النووي البيئي، لتقدير عدد الأنواع غير الموصوفة في مجموعة تصنيفية، وذلك بحساب نسبة الوحدات التصنيفية التشغيلية (OTUs) المرتبطة بأنواع موصوفة معروفة، من إجمالي عدد الوحدات التصنيفية التشغيلية التي تم الحصول عليها من خلال أخذ عينات واسعة النطاق من الحشرات. [ 4 ] [ 1 ] تُعرف المجموعات التصنيفية التي يفوق فيها عدد "الأنواع" المُستخلصة من تجميع التسلسلات في وحدات تصنيفية تشغيلية عدد الأنواع الموصوفة المعروفة باسم التصنيفات المظلمة. [ 2 ] يُعرّف هارتوب وآخرون (2022) التصنيفات المظلمة بأنها مجموعات تصنيفية يتجاوز فيها عدد الأنواع المُقدّرة 1000 نوع، بينما يقل عدد الأنواع الموصوفة حاليًا عن 10% من هذا التقدير. يُبرز هذا التعريف التنوع الكبير في المجموعة التصنيفية، في مقابل العدد الأقل بكثير من التصنيفات التي تم وصفها في تلك المجموعة. [ 2 ]

نيلسون وآخرون (2023) يعرّفون التصنيفات المظلمة (في سياق علم الفطريات) بأنها تلك التي لا يبدو أنها تنتج أي بنية مورفولوجية قابلة للملاحظة والتي يبدو من المستحيل زراعتها في ظروف المختبر .

لا ينبغي الخلط بين التصنيفات المظلمة والتنوع المظلم ، وهو مفهوم بيئي يشير إلى الأنواع الغائبة عن المجتمع المحلي على الرغم من الظروف البيئية المناسبة.

أسباب وجود التصنيفات الداكنة

يوجد مفهوم التصنيف الخفي في جميع الدراسات المتعلقة بالتنوع في الكائنات الحية، ولكن العوامل التي تخلق التصنيفات الخفية يمكن أن تختلف بين المجموعات التصنيفية المختلفة.

في علم تصنيف الحشرات، يُعزى وجود أنواع غير معروفة في كثير من الأحيان إلى صعوبة التصنيف . [ 7 ] [ 8 ] ويُعزى التباين بين عدد أنواع الحشرات الموصوفة والمُقدَّرة إلى عدة عوامل، منها نقص علماء التصنيف، وقلة التمويل المخصص لهذا العلم، وبطء وتيرة دراسة بعض المجموعات التصنيفية الأكثر تعقيدًا. [ 7 ] [ 9 ] [ 10 ]

بينما توجد هذه العقبة التصنيفية في مجموعات تصنيفية أخرى، إلا أن تحديات أخرى قد تُبطئ وتيرة وصف الأنواع الجديدة، مما يُسبب التباين بين التصنيفات المُقدَّرة والمعروفة، ويؤدي إلى تصنيفها ضمن فئة "التصنيفات غير المعروفة". في علم الفطريات، يصعب عادةً استزراع بعض أنواع الفطريات في المختبر، أو أنها تفتقر إلى السمات المورفولوجية المميزة. [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] وبموجب إرشادات تسمية الأنواع، يشترط القانون الدولي لتسمية الطحالب والفطريات والنباتات (ICN) تحديد عينة نموذجية عند وصف نوع جديد من الفطريات، وغالبًا ما تكون هذه العينة مُستزرعة. [ 14 ] [ 11 ] يُبطئ هذا الأمر بشكل ملحوظ عملية وصف الأنواع الجديدة، مما يُفاقم انتشار "التصنيفات غير المعروفة" في علم الفطريات.

اعتبارات التصنيف والتسمية

تختلف المناهج المتبعة لوصف التصنيفات غير المعروفة بين التخصصات. وقد اقترح بعض علماء التصنيف الاستغناء عن استخدام الأساليب المورفولوجية التقليدية لصالح الأساليب الجزيئية لمعالجة مشكلة التصنيفات غير المعروفة. [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] وبموجب هذه الأنظمة المقترحة، يمكن وصف الأنواع الجديدة بالكامل من خلال تحليل تسلسلات الحمض النووي. ومع ذلك، يتباين مستوى قبول هذا النظام الجديد بين التخصصات، وقد ثبطه العديد من علماء التصنيف لصالح نظام أكثر تكاملاً يستخدم كلاً من الأساليب الوصفية الجزيئية والمورفولوجية. [ 5 ] [ 19 ] [ 2 ] [ 7 ] [ 20 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. هارتوب ، إميلي ؛ لي ، ليشون؛ سريفاتسان، أمريتا؛ جونز، ميركا؛ بينا-أغيليرا، بابلو؛ أوفاسكاينن، أوتسو؛ روزلين، توماس؛ ماير، رودولف (27-09-2024). "كشف غموض المادة المظلمة في علم الأحياء: ثراء الأنواع، والتوزيع المكاني والزماني، وتكوين مجتمع تصنيفي غامض" . مجلة BMC Biology . 22 (1): 215. doi : 10.1186/s12915-024-02010-z . ISSN 1741-7007 . PMC 11438253. PMID 39334308 .   
  2. 1 2 3 4 5 6 هارتوب، إميلي؛ سريفاتسان، أمريتا؛ رونكويست، فريدريك؛ ماير، رودولف (12 أكتوبر 2022). دايرات، بينوا (محرر). "نحو تصنيف تكاملي واسع النطاق (LIT): حل معضلة البيانات للتصنيفات غير المعروفة" . علم الأحياء المنهجي . 71 (6): 1404-1422 . doi : 10.1093/sysbio/syac033 . ISSN 1063-5157 . PMC 9558837. PMID 35556139 .   
  3. الصفحة 1 2 3 ، رودريك دي إم (5 سبتمبر 2016). "الترميز الشريطي للحمض النووي والتصنيف: التصنيفات الغامضة والنصوص الغامضة" . المعاملات الفلسفية للجمعية الملكية ب: العلوم البيولوجية . 371 (1702) 20150334. doi : 10.1098/rstb.2015.0334 . PMC 4971186. PMID 27481786 .  
  4. 1 2 سريفاتسان، أمريتا؛ أنج، يوشين. هيراتي، جون م. هوانج، وي سونج؛ جوسوه، وان فا؛ كوتي، سوجاثا نارايانان؛ بونيامورثي، جايانثي؛ يو دارين. روزلين، توماس؛ ماير ، رودولف (يوليو 2023). "تقارب السيادة والإهمال في تنوع الحشرات الطائرة" . بيئة الطبيعة والتطور . 7 (7): 1012–1021 . بيب كود : 2023NatEE...7.1012S . دوى : 10.1038/s41559-023-02066-0 . ISSN 2397-334X . بمك 10333119 .  
  5. 1 2 سيبرغ، أولي؛ همفريز، كريس جيه؛ كناب، ساندي؛ ستيفنسون، دينيس ويليام؛ بيترسن، جيت؛ شارف، نيكولاي؛ أندرسن، نيلز مولر (فبراير 2003). "هل توجد طرق مختصرة في علم التصنيف؟ تعليق على التصنيف القائم على الحمض النووي" . اتجاهات في علم البيئة والتطور . 18 (2): 63-65 . Bibcode : 2003TEcoE..18...63S . doi : 10.1016/S0169-5347(02)00059-9 .
  6. الصفحة 1 ، رودريك (12 أبريل 2011). "التصنيفات الخفية: بنك الجينات في عالم ما بعد التصنيف" . iPhylo . doi : 10.59350/xhvv2-xjt24 . تاريخ الاسترجاع : 28 أغسطس 2025 .
  7. 1 2 3 ماير، رودولف؛ سريفاتسان، أمريتا؛ أوليفيرا، سارة سيكويرا؛ بالبي، ماريا إيزابيل بنسلفانيا؛ أنج، يوشين. يو دارين. كياراندسن، جوستين؛ أموريم، دالتون دي سوزا (2025). ""التصنيف الخفي: بروتوكول جديد للتغلب على المعوقات التصنيفية للأصناف الخفية وتوسيع قاعدة التصنيف لتقييم التنوع البيولوجي" . علم التصنيف التفرعي . 41 (2): 223-238 . doi : 10.1111/cla.12609 . ISSN 1096-0031 . PMC 11891956. PMID 39956942 .   
  8. ↑ كاروسو، فاليريو؛ هارتوب، إميلي؛ شيمينو، كارولين؛ نوري، سجاد؛ سريفاتسان، أمريتا؛ هاس، مايكل؛ لي، ليشون؛ ماير، رودولف؛ ويتمور، دانيال (2024). "إطار عمل متكامل لتقييم التنوع البيولوجي للأنواع غير المعروفة على نطاق واسع: دراسة حالة باستخدام ميغاسيليا (ذوات الجناحين، فوريداي)" . حفظ وتنوع الحشرات . 17 (6): 968-987 . doi : 10.1111/icad.12762 . ISSN 1752-4598 . 
  9. ^ هوسمان، أكسل. كروغمان، لارس. بيترز، رالف س. ردوخ، فيرا؛ شميدت ، ستيفان (2020-07-10). "Gbol III: التاكسا المظلمة" . نشرة الباركود IBOL . 10 (1). دوى : 10.21083/ibol.v10i1.6242 . ردمك 2371-4646 . 
  10. ^ دي كارفالو، مارسيلو ر.؛ بوكمان، فلافيو أ؛ أموريم، دالتون S.؛ دي فيفو، ماريو؛ دي توليدو بيزا، مونيكا؛ مينيزيس، نايرسيو أ؛ دي فيغيريدو، خوسيه L.؛ كاسترو، ريكاردو إم سي؛ جيل، أنتوني C.؛ ماكيتشران، جون د.؛ كومبانيو، ليونارد جي في؛ شيلي، روبرت C.؛ بريتز، رالف. لوندبيرج، جون ج. فاري ، ريتشارد ب. (21/01/2005). “إعادة النظر في العائق التصنيفي” . علوم . 307 (5708): 353. دوى : 10.1126/science.307.5708.353b . ISSN 0036-8075 . 
  11. 1 2 ويجاياواردين، نالين ن.؛ بهرام، محمد؛ سانشيز كاسترو، إيفان؛ داي، دونغ تشين؛ أرياوانسا، كاهانداوا GSU؛ جايالال، أوديني؛ سواناراخ، ناكارين؛ تيدرسو ، ليهو (2021-08-28). "البصيرة الحالية في الأساليب المعتمدة على الثقافة والمستقلة عن الثقافة في اكتشاف الأصناف غير المتجانسة" . مجلة الفطريات . 7 (9): 703. دوى : 10.3390/jof7090703 . ISSN 2309-608X . بمك 8467358 . بميد 34575741 .   
  12. ↑ وو، بينغ؛ حسين، مزمل؛ تشانغ، ويوي؛ ستادلر، مارك؛ ليو، شينغتشونغ؛ شيانغ، ميتشون (2019-07-03). " رؤى حديثة حول تنوع أنواع الفطريات ومنظور تسمية تسلسلات الحمض النووي البيئي للفطريات" . علم الفطريات . 10 (3): 127-140 . doi : 10.1080/21501203.2019.1614106 . ISSN 2150-1203 . PMC 6691916. PMID 31448147 .   
  13. ↑ وانغ، تشنغ؛ نيلسون، ر. هنريك؛ جيمس، تيموثي ي.؛ داي، يوتشنغ؛ تاونسند، جيفري ب. (2016)، "الآفاق والتحديات المستقبلية لتصنيف الفطريات في عصر البيانات الضخمة"، في لي، دي-وي (محرر)، بيولوجيا الفطريات المجهرية ، تشام: دار نشر سبرينغر الدولية، ص 25-46 ، doi : 10.1007/978-3-319-29137-6_3 ، ISBN  978-3-319-29137-6
  14. ↑ سيفرت، كيث أ.؛ روسمان، إيمي ي. (ديسمبر 2010). " كيفية وصف نوع فطري جديد" . مجلة IMA للفطريات . 1 (2): 109-111 . doi : 10.5598/imafungus.2010.01.02.02 . ISSN 2210-6359 . PMC 3348772. PMID 22679569 .   
  15. ↑ شاركي، مايكل جيه؛ جانزن، دانيال إتش؛ هالواكس، ويني؛ تشابمان، إريك جي؛ سميث، إم. أليكس؛ دابكي، تانيا؛ براون، أليسون؛ راتناسينغهام، سوجيفان؛ نايك، سوريش؛ مانجوناث، راميا؛ بيريز، كيت؛ ميلتون، ميغان؛ هيبرت، بول؛ شو، سكوت آر؛ كيتل، ريبيكا إن. (2021-02-02). "مراجعة ووصف مُبسطان لـ 403 أنواع جديدة ضمن 11 فصيلة فرعية من دبابير براكونيد الطفيلية في كوستاريكا، بما في ذلك سجلات العوائل لـ 219 نوعًا" . ZooKeys (1013): 1–665 . Bibcode : 2021ZooK.1013....1S . doi : 10.3897/zookeys.1013.55600 . ISSN 1313-2970 . PMC 8390796. PMID 34512087 .​   
  16. ↑ تشو، لي-وي (2024-06-01). "قد تتضمن استراتيجية تسمية "التصنيفات الخفية" للفطريات فترة انتقالية وعلم الجينوم" . مراجعات بيولوجيا الفطريات . 48 100358. رمز Bibcode : 2024FunBR..4800358Z . doi : 10.1016/j.fbr.2024.100358 . ISSN 1749-4613 . 
  17. ↑ رايبيرغ، مارتن؛ نيلسون، ر. هنريك (23 فبراير 2018). " نظرة جديدة على أسماء وتسمية التصنيفات غير المعروفة" . MycoKeys (30): 31-39 . doi : 10.3897/mycokeys.30.24376 . ISSN 1314-4049 . PMC 5904500. PMID 29681731 .   
  18. ↑ نيلسون، ر. هنريك؛ ريبيرغ، مارتن؛ فورزباخر، كريستيان؛ تيدرسو، ليهو؛ أنسلان، ستين؛ بولمي، سيرجي؛ سبيرين، فياتشيسلاف؛ ميكريوكوف، فلاديمير؛ سفانتسون، ستين؛ هارتمان، مارتن؛ لينارتسدوتر، شارلوت؛ بيلفورد، بولين؛ خوميتش، ماريا؛ ريتر، أليس؛ كوركول، ناتاليا (10 أبريل 2023). "كيف، وليس هل، هو السؤال الذي ينبغي على علماء الفطريات طرحه بشأن التصنيف القائم على الحمض النووي؟" . MycoKeys ( 96): 143–157 . doi : 10.3897/mycokeys.96.102669 . ISSN 1314-4049 . PMC 10194844. PMID 37214179 .   
  19. ↑ أهرنز، ديرك؛ أهيونغ، شين ت.؛ باليريو، ألبرتو؛ باركلي، ماكسويل ف. ل.؛ إيبرلي، جوناس؛ إسبيلاند، ماريان؛ هوبر، برنارد أ.؛ مينغوال، زيمو؛ باتشيكو، ثاينارا ل.؛ بيترز، رالف س.؛ روليك، بيورن؛ فاز-دي-ميلو، فرناندو؛ ويسنر، توماس؛ كريل، فرانك-ثورستن (31 أغسطس/آب 2021). "هل حان الوقت لوصف أنواع جديدة دون تشخيص؟ - تعليق على شاركي وآخرون (2021)" . زوتاكسا . 5027 (2): 151-159 . doi : 10.11646/zootaxa.5027.2.1 . ISSN 1175-5334 . PMID 34811237 .  
  20. ^ زماني، علي رضا؛ فريك، زدينيك فالتينيك؛ جانتي، هوغو F.؛ هوبكنز، تاباني؛ أورفينجر، الكسندر ب. شيرز، مارك د. بارتونوفا، ألينا سوتشاكوفا؛ بوس ، دافيد دال (يوليو 2022). "الرموز الشريطية للحمض النووي في حد ذاتها ليست كافية لوصف نوع ما" . علم الحشرات المنهجي . 47 (3): 385– 389. بيب كود : 2022SysEn..47..385Z . دوى : 10.1111/syen.12538 . ISSN 0307-6970 .