الحمض النووي البيئي

📅 آخر تحديث: ٢٦ يوليو ٢٠٢٦
✍️ نُشر في: ٢٦ يوليو ٢٠٢٦
📷 يحتوي على 15 صور
الموسوعة الحرة

تُعد خنفساء القرون الطويلة ، Leptura quadrifasciata ، مثالاً على الحشرات التي تزور الأزهار والتي تم العثور عليها في دراسة أظهرت أن الحمض النووي البيئي (eDNA) من المفصليات يتم ترسيبه على الأزهار البرية بعد التفاعلات [ 1 ].

الحمض النووي البيئي ( eDNA) هو حمض نووي يُجمع من عينات بيئية متنوعة، مثل التربة والرواسب والمياه العذبة ومياه البحر والثلج والهواء ، بدلاً من أخذه مباشرةً من كائن حي فردي . فعندما تتفاعل الكائنات الحية المختلفة مع البيئة، يُطلق الحمض النووي ويتراكم في محيطها من مصادر متعددة. [ 2 ] ويمكن تحليل تسلسل هذا الحمض النووي البيئي باستخدام تقنيات علم الجينوم البيئي للكشف عن معلومات حول الأنواع الموجودة في النظام البيئي، حتى تلك المجهرية التي لا يمكن رؤيتها أو اكتشافها بطرق أخرى. ويتيح هذا النهج إجراء عمليات جرد للتنوع البيولوجي بتكلفة منخفضة وعلى نطاق واسع وبطريقة موحدة، دون أي تأثير سلبي على النظم البيئية.

في السنوات الأخيرة، استُخدم الحمض النووي البيئي كأداة للكشف عن الحيوانات البرية المهددة بالانقراض التي لم تكن تُرى لولا ذلك. وفي عام 2020، بدأ باحثو الصحة البشرية في إعادة توظيف تقنيات الحمض النووي البيئي لتتبع جائحة كوفيد-19. [ 3 ]

تشمل مصادر الحمض النووي البيئي، على سبيل المثال لا الحصر، البراز ، والمخاط ، والأمشاج ، والجلد المتساقط ، والجيف ، والشعر . [ 2 ] [ 4 ] يمكن تحليل العينات باستخدام طرق تسلسل الحمض النووي عالية الإنتاجية ، والمعروفة باسم علم الجينوم البيئي ، والترميز الفائق ، والكشف عن الأنواع المفردة، وذلك للرصد السريع وقياس التنوع البيولوجي . ولتمييز الكائنات الحية داخل العينة بشكل أفضل، يُستخدم الترميز الفائق للحمض النووي ، حيث تُحلل العينة باستخدام مكتبات الحمض النووي التي دُرست سابقًا، مثل BLAST ، لتحديد الكائنات الحية الموجودة. [ 5 ]

يُعدّ الترميز الفائق للحمض النووي البيئي (eDNA metabarcoding) طريقةً مبتكرةً لتقييم التنوع البيولوجي ، حيث تُؤخذ عينات من البيئة عبر الماء أو الرواسب أو الهواء، ويُستخلص منها الحمض النووي، ثم يُضخّم باستخدام بادئات عامة أو شاملة في تفاعل البوليميراز المتسلسل ، ويُسلسل باستخدام تقنيات التسلسل من الجيل التالي لتوليد آلاف إلى ملايين القراءات. ومن خلال هذه البيانات، يُمكن تحديد وجود الأنواع، وتقييم التنوع البيولوجي بشكل عام. وهي طريقة متعددة التخصصات تجمع بين علم البيئة الميداني التقليدي والأساليب الجزيئية المتعمقة والأدوات الحاسوبية المتقدمة. [ 6 ]

يتمتع تحليل الحمض النووي البيئي بإمكانيات هائلة، ليس فقط لرصد الأنواع الشائعة، بل أيضًا للكشف الجيني عن الأنواع الأخرى الموجودة وتحديدها، والتي قد تؤثر على جهود الحفاظ على البيئة. [ 7 ] تتيح هذه الطريقة الرصد البيولوجي دون الحاجة إلى جمع الكائن الحي، مما يُمكّن من دراسة الكائنات الغازية أو المراوغة أو المهددة بالانقراض دون تعريضها لضغوط بشرية (يعتمد ذلك على دقة الطرق المستخدمة، انظر أدناه). يُسهم الوصول إلى هذه المعلومات الجينية إسهامًا بالغ الأهمية في فهم حجم التجمعات السكانية، وتوزيع الأنواع ، ودينامياتها ، لا سيما بالنسبة للأنواع غير الموثقة جيدًا. ومن الجدير بالذكر أن الحمض النووي البيئي غالبًا ما يكون أقل تكلفة مقارنةً بطرق أخذ العينات التقليدية. [ 8 ] وتعتمد سلامة عينات الحمض النووي البيئي على حفظها في البيئة.

تُعدّ التربة، والتربة الصقيعية ، والمياه العذبة، ومياه البحر بيئاتٍ واسعة النطاق دُرست جيدًا، حيث استُخلصت منها عينات الحمض النووي البيئي (eDNA)، ويشمل كلٌّ منها العديد من البيئات الفرعية المُهيأة . [ 9 ] ونظرًا لتعدد استخداماته، يُطبَّق الحمض النووي البيئي في العديد من البيئات الفرعية ، مثل أخذ عينات المياه العذبة، وأخذ عينات مياه البحر، وأخذ عينات التربة الأرضية (التربة الصقيعية في التندرا)، وأخذ عينات التربة المائية (رواسب الأنهار والبحيرات والبرك والمحيطات)، [ 10 ] أو غيرها من البيئات التي قد تُصبح فيها إجراءات أخذ العينات العادية مُشكلة. [ 9 ]

في 7 ديسمبر 2022، أفادت دراسة نُشرت في مجلة Nature باستخراج حمض نووي بيئي عمره مليونا عام من رواسب في جرينلاند، وهو يُعتبر حاليًا أقدم حمض نووي تم تسلسله حتى الآن. [ 11 ] [ 12 ]

يُستخدم الحمض النووي البيئي (eDNA) عبر مجموعة واسعة من بروتوكولات أخذ العينات والتحليل، وتعتمد موثوقية النتائج بشكل كبير على دقة الطرق المستخدمة. في البيئات المائية (المياه العذبة والمالحة)، تُعد استراتيجية أخذ العينات عاملاً حاسماً في نجاح الكشف. فكلما زادت كمية المياه المُرشحة، زادت كمية الحمض النووي المُستخلص، مما يزيد من احتمالية الكشف عن الكائنات الحية الموجودة في الموقع. ولأن الحمض النووي البيئي غالباً ما يكون غير متجانس مكانياً وموزعاً محلياً، فإن ترشيح كميات أكبر من المياه على طول مسارات متكاملة يوفر صورة أكثر تمثيلاً ودقة للتنوع البيولوجي. [ 13 ]

تلعب الإجراءات المختبرية دورًا حاسمًا، لا سيما عدد مرات تكرار تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR). يشير تكرار تفاعل PCR إلى التضخيم المتكرر لنفس مستخلص الحمض النووي في تفاعلات مستقلة. يؤدي زيادة عدد مرات التكرار إلى تحسين احتمالية الكشف، نظرًا لأن تفاعل PCR يخضع لتغيرات عشوائية، وقد يفشل تضخيم الحمض النووي لنوع معين في بعض التفاعلات بينما ينجح في تفاعلات أخرى. على سبيل المثال، يتضمن استخدام 12 تكرارًا لتفاعل PCR تضخيم الحمض النووي المأخوذ في 12 عينة فرعية مستقلة، مما يقلل من خطر النتائج السلبية الكاذبة.

يُعد عمق التسلسل عاملاً رئيسياً آخر يؤثر على قدرة الكشف. ويشير إلى العدد الإجمالي لتسلسلات الحمض النووي (القراءات) المُولَّدة والمُحلَّلة من العينة. يزيد عمق التسلسل الأعلى من احتمالية الكشف عن شظايا الحمض النووي النادرة أو قليلة التواجد. يُمكن لتسلسل مئات الآلاف من القراءات في أنظمة المياه العذبة (حتى 500 ألف قراءة) أو ما يصل إلى مليون قراءة تقريباً في الأنظمة البحرية أن يُحسِّن الكشف بشكل كبير مقارنةً ببروتوكولات العمق الأقل، لا سيما بالنسبة للأنواع الموجودة بتراكيز منخفضة. [ 14 ]

عند تطبيق استراتيجيات قوية لأخذ العينات والتكرار والتسلسل، تكون أساليب الحمض النووي البيئي فعالة بشكل خاص في الكشف عن الأنواع النادرة أو المراوغة أو الخفية، بما في ذلك الأنواع المحمية والمهددة والغازية.

ملخص

يُشير مصطلح الحمض النووي البيئي (eDNA) إلى المادة الوراثية الموجودة في العينات البيئية، مثل الرواسب والماء والهواء، بما في ذلك الخلايا الكاملة والحمض النووي خارج الخلوي، وربما الكائنات الحية الكاملة. [ 15 ] [ 16 ] يبدأ تحليل الحمض النووي البيئي بجمع عينة بيئية مُراد دراستها. ثم يُستخلص الحمض النووي من العينة ويُنقى . بعد ذلك، يُضخّم الحمض النووي المُنقّى لاستهداف جين مُحدد، ما يُتيح تسلسله وتصنيفه بناءً على تسلسله. [ 17 ] ومن خلال هذه المعلومات، يُمكن الكشف عن الأنواع وتصنيفها. [ 6 ]

يمكن الحصول على الحمض النووي البيئي من الجلد، والمخاط، واللعاب، والحيوانات المنوية، والإفرازات، والبيض، والبراز، والبول، والدم، والجذور، والأوراق، والثمار، وحبوب اللقاح، وجثث الكائنات الحية الكبيرة المتحللة، بينما يمكن الحصول على الكائنات الدقيقة كاملةً. [ 18 ] [ 7 ] [ 16 ] يعتمد إنتاج الحمض النووي البيئي على الكتلة الحيوية، وعمر الكائن الحي، ونشاطه الغذائي، بالإضافة إلى وظائفه الفسيولوجية، ودورة حياته، واستخدامه للمساحة. [ 2 ] [ 19 ] [ 16 ] [ 20 ] [ 21 ] [ 6 ]

يمكن للحمض النووي البيئي أن يُكمّل الطرق التقليدية، ولكنه لا يحل محلها، وذلك من خلال استهداف عينات من تنوع بيولوجي مختلف، وربما زيادة الدقة التصنيفية . [ 22 ] [ 23 ] إضافةً إلى ذلك، يُمكن للحمض النووي البيئي الكشف عن الأنواع النادرة ، [ 24 ] [ 19 ] ولكنه لا يُمكنه تحديد معلومات جودة التجمعات السكانية، مثل نسب الجنس والحالة البدنية، لذا فهو مثالي لتكملة الدراسات التقليدية. [ 20 ] [ 22 ] ومع ذلك، فإنه يُستخدم في تطبيقات مفيدة للكشف عن الظهور الأول للأنواع الغازية، واستمرار وجود الأنواع المحلية التي يُعتقد أنها انقرضت أو مهددة بالانقراض، وغيرها من الأنواع المراوغة التي توجد بكثافة منخفضة ويصعب الكشف عنها بالوسائل التقليدية. [ 6 ]

من المهم ملاحظة أن التحديد الكمي المطلق لوفرة الأنواع لا يكون ممكنًا إلا في ظل ظروف محددة للغاية. عمليًا، يقتصر هذا إلى حد كبير على الأنهار التي يمكن الخوض فيها، حيث يمكن استيفاء مجموعة محدودة من المعايير البيئية الخاضعة للتحكم، وحيث تكون الطرق المرجعية مثل الصيد الكهربائي قابلة للتطبيق. خارج هذه السياقات المحدودة، لا توفر تقنيات المسح البيئي التقليدية ولا أساليب الحمض النووي البيئي (eDNA) عمومًا سوى معلومات شبه كمية. في الأطر شبه الكمية، غالبًا ما تتفوق أساليب الحمض النووي البيئي على تقنيات الرصد التقليدية. فهي توفر معلومات بيئية موثوقة مثل وجود الأنواع أو غيابها، وأنماط الوفرة النسبية، والاتجاهات المكانية والزمانية. تُستخدم هذه الأنواع من البيانات على نطاق واسع في تقييم التنوع البيولوجي والرصد طويل الأجل. كما توفر أساليب الحمض النووي البيئي العديد من المزايا العملية مقارنةً بالعديد من الطرق التقليدية. وتشمل هذه المزايا: قابلية اكتشاف أعلى، لا سيما للأنواع النادرة أو الخفية أو منخفضة الكثافة؛ وتحسين التوحيد القياسي عبر المواقع والفصول والمشغلين؛ وانخفاض التكاليف التشغيلية الإجمالية؛ وأخذ عينات غير جراحي يتجنب إزعاج الكائنات المستهدفة أو نفوقها.

يُحدّ تحلل الحمض النووي البيئي في البيئة من نطاق دراسات الحمض النووي البيئي، إذ غالبًا ما لا يتبقى سوى أجزاء صغيرة من المادة الوراثية، لا سيما في المناطق الاستوائية الدافئة. [ 25 ] إضافةً إلى ذلك، فإن اختلاف مدة التحلل تبعًا للظروف البيئية وقدرة الحمض النووي على الانتقال عبر وسائط مثل الماء، قد يؤثر على استنتاج الاتجاهات المكانية والزمانية الدقيقة للأنواع والمجتمعات. [ 19 ] [ 26 ] [ 18 ] [ 27 ] [ 20 ] [ 22 ] [ 21 ]

تُظهر الدراسات أن آثار الحمض النووي في كل من المواقع المائية العذبة والمحيطات لا تدوم إلا بضعة أيام، وأحيانًا تصل إلى أسبوع. ولهذا السبب، يُشبه الحمض النووي البيئي لقطةً فوتوغرافية: فهو يُسجل أنواع الكائنات الحية التي كانت موجودة، في ذلك الموقع، وفي تلك اللحظة الزمنية بالتحديد. [ 13 ]

على الرغم من هذه العيوب، لا يزال الحمض النووي البيئي (eDNA) يمتلك القدرة على تحديد الوفرة النسبية أو الترتيبية، إذ وجدت بعض الدراسات أنه يتوافق مع الكتلة الحيوية، مع أن التباين المتأصل في العينات البيئية يجعل من الصعب قياسه كميًا. [ 7 ] [ 16 ] وبينما يمتلك الحمض النووي البيئي تطبيقات عديدة في مجالات الحفظ والرصد وتقييم النظم البيئية، فضلًا عن تطبيقات أخرى لم تُحدد بعد، فإن التباين الكبير في تركيزاته وعدم تجانسه المحتمل في المسطح المائي يجعل من الضروري تحسين الإجراء، ويُفضل إجراء دراسة تجريبية لكل تطبيق جديد لضمان ملاءمة تصميم أخذ العينات للكشف عن الهدف. [ 28 ] [ 20 ] [ 22 ] [ 6 ]

عند مقارنة النتائج المُتحصَّل عليها باستخدام مرشحات مختلفة (عينات المياه)، أو عند رصد تغيرات التنوع البيولوجي بمرور الوقت، أو عبر الفصول، أو بين السنوات، يصبح توحيد البيانات ضروريًا. يُصحِّح التوحيد الانحيازات المنهجية التي قد تحدث خلال عملية التحليل، إذ يمكن تضخيم الحمض النووي من أنواع مختلفة وتسلسله بكفاءات متفاوتة. يعتمد هذا التوحيد عادةً على تقديرات العدد الأولي لجزيئات الحمض النووي الموجودة في العينة قبل التضخيم، والتي يُشار إليها غالبًا بأعداد نسخ الحمض النووي، بالإضافة إلى مقاييس الوفرة النسبية المُستمدة من بيانات التسلسل. تُمكِّن مجموعات البيانات الموحدة من إجراء مقارنات أكثر موثوقية بين العينات والمواقع والفترات الزمنية.

الحمض النووي المجتمعي

على الرغم من أن تعريف الحمض النووي البيئي (eDNA) يبدو واضحًا، إلا أن الحدود بين أشكال الحمض النووي المختلفة تصبح غير واضحة، لا سيما بالمقارنة مع الحمض النووي المجتمعي ، الذي يُوصف بأنه عينات من الكائنات الحية. [ 22 ] يثور تساؤل حول الكائنات الحية الدقيقة الكاملة الموجودة في عينات الحمض النووي البيئي: هل تُغير هذه الكائنات تصنيف العينة إلى عينة حمض نووي مجتمعي؟ بالإضافة إلى ذلك، يُعد تصنيف المادة الوراثية من البراز إشكاليًا، وغالبًا ما يُشار إليها باسم الحمض النووي البيئي. [ 22 ] يُعد التمييز بين النوعين مهمًا، إذ يُشير الحمض النووي المجتمعي إلى وجود الكائن الحي في وقت ومكان مُحددين، بينما قد يكون الحمض النووي البيئي قد أتى من موقع مختلف، من براز الحيوانات المفترسة، أو من وجود سابق، إلا أن هذا التمييز غالبًا ما يكون مستحيلاً. [ 29 ] [ 22 ] ومع ذلك، يُمكن تصنيف الحمض النووي البيئي بشكل عام ليشمل العديد من قطاعات أبحاث التنوع البيولوجي للحمض النووي، بما في ذلك تحليل البراز والعينات المجمعة عندما تكون قابلة للتطبيق على أبحاث التنوع البيولوجي وتحليل النظام البيئي. [ 6 ]

الحمض النووي الذاتي

ينبع مفهوم الحمض النووي الذاتي من اكتشافات علماء من جامعة نابولي فيدريكو الثاني ، نُشرت عام 2015 في مجلة "نيو فايتولوجيست " [ 30 ]، حول التأثير التثبيطي الذاتي للحمض النووي خارج الخلية في النباتات [ 31 ] ، وكذلك في البكتيريا والفطريات والطحالب والنباتات والبروتوزوا والحشرات [ 32 ] . يُقترح أن يكون المصدر البيئي لهذا الحمض النووي خارج الخلية هو مخلفات النباتات ، بالإضافة إلى مصادر أخرى في مختلف النظم البيئية والكائنات الحية، حيث ثبت تجريبياً أن حجم شظايا الحمض النووي له تأثير تثبيطي على الكائنات الحية من نفس النوع، ويتراوح عادةً بين 200 و500 زوج قاعدي. وقد افترض أن ظاهرة الحمض النووي الذاتي تُحرك التفاعلات البيئية، وأنها تتوسطها آلياً أنماط جزيئية مرتبطة بالضرر (DAMPs) [ 33 ] [ 34 ] ، وأن لها إمكانات لتطوير تطبيقات مبيدة للجراثيم [ 35 ] .

الترميز الفائق للحمض النووي البيئي

بحلول عام 2019، توسعت أساليب أبحاث الحمض النووي البيئي (eDNA) لتشمل تقييم مجتمعات كاملة من عينة واحدة. تتضمن هذه العملية الترميز الفائق ، والذي يمكن تعريفه بدقة بأنه استخدام بادئات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) العامة أو الشاملة على عينات الحمض النووي المختلطة من أي مصدر، متبوعًا بتسلسل الجيل التالي عالي الإنتاجية (NGS) لتحديد التركيب النوعي للعينة. شاع استخدام هذه الطريقة في علم الأحياء الدقيقة لسنوات، لكنها بدأت تتبلور مؤخرًا في تقييم الكائنات الحية الكبيرة. [ 36 ] [ 26 ] [ 29 ] [ 22 ] تتمتع تطبيقات الترميز الفائق للحمض النووي البيئي على مستوى النظام البيئي بإمكانية ليس فقط وصف المجتمعات والتنوع البيولوجي، بل أيضًا الكشف عن التفاعلات وعلم البيئة الوظيفي على نطاقات مكانية واسعة، [ 37 ] على الرغم من أنها قد تكون محدودة بسبب القراءات الخاطئة الناتجة عن التلوث أو أخطاء أخرى. [ 36 ] [ 7 ] [ 38 ] [ 29 ] [ 21 ] إجمالاً، يزيد الترميز الفائق للحمض النووي البيئي من السرعة والدقة والتعرف على الأنواع مقارنةً بالترميز التقليدي، ويقلل التكلفة، ولكنه يحتاج إلى توحيد وتعميم، ودمج التصنيف والأساليب الجزيئية لإجراء دراسة بيئية شاملة. [ 26 ] [ 39 ] [ 40 ] [ 41 ] [ 21 ] [ 6 ] [ 42 ]

تُستخدم تقنية الترميز الجيني البيئي (eDNA metabarcoding) في رصد التنوع البيولوجي عبر جميع الموائل والمجموعات التصنيفية، وإعادة بناء النظم البيئية القديمة، ودراسة تفاعلات النباتات مع الملقحات ، وتحليل النظام الغذائي، والكشف عن الأنواع الغازية، والاستجابة للتلوث، ورصد جودة الهواء. وتُعدّ هذه التقنية طريقة فريدة لا تزال قيد التطوير، ومن المرجح أن تبقى كذلك لبعض الوقت مع تقدم التكنولوجيا وتوحيد الإجراءات. ومع ذلك، فمع تحسين تقنية الترميز الجيني البيئي وانتشار استخدامها، يُتوقع أن تصبح أداة أساسية للرصد البيئي ودراسات الحفظ العالمية. [ 6 ]

الحمض النووي خارج الخلية والحمض النووي المتبقي

الحمض النووي خارج الخلوي، والذي يُسمى أحيانًا الحمض النووي المتبقي، هو الحمض النووي الناتج عن الكائنات الدقيقة الميتة. يُعد الحمض النووي خارج الخلوي العاري (eDNA)، الذي يُطلق معظمه عند موت الخلايا، موجودًا في كل مكان تقريبًا في البيئة. قد يصل تركيزه في التربة إلى 2 ميكروغرام/لتر، وفي البيئات المائية الطبيعية إلى 88 ميكروغرام/لتر. [ 44 ] وقد اقتُرحت وظائف عديدة محتملة للحمض النووي خارج الخلوي: فقد يشارك في النقل الأفقي للجينات ؛ [ 45 ] وقد يُوفر المغذيات؛ [ 46 ] وقد يعمل كمنظم لجذب أو معايرة الأيونات أو المضادات الحيوية. [ 47 ] يعمل الحمض النووي خارج الخلوي كمكون وظيفي للمصفوفة خارج الخلوية في الأغشية الحيوية للعديد من أنواع البكتيريا. وقد يعمل كعامل تعرف لتنظيم التصاق وانتشار أنواع معينة من الخلايا في الغشاء الحيوي؛ [ 48 ] وقد يُساهم في تكوين الغشاء الحيوي. [ 49 ] وقد يساهم ذلك في القوة الفيزيائية للغشاء الحيوي ومقاومته للإجهاد البيولوجي. [ 50 ]

تحت مسمى الحمض النووي البيئي، شهد الحمض النووي البيئي استخدامًا متزايدًا في العلوم الطبيعية كأداة مسح لعلم البيئة ، حيث يُستخدم لرصد تحركات ووجود الأنواع في الماء أو الهواء أو على الأرض، وتقييم التنوع البيولوجي في منطقة ما. [ 51 ] [ 52 ]

في الرسم البياني على اليمين، تتحدد كمية الحمض النووي المتبقي في البيئة الميكروبية بالمدخلات المرتبطة بنفوق الأفراد القادرين على البقاء والذين يمتلكون حمضًا نوويًا سليمًا، وبالخسائر المرتبطة بتحلل الحمض النووي المتبقي. إذا كان تنوع التسلسلات الموجودة في مجموعة الحمض النووي المتبقي مختلفًا بشكل كافٍ عن تنوعها في مجموعة الحمض النووي السليم، فقد يؤدي الحمض النووي المتبقي إلى تحريف تقديرات التنوع البيولوجي الميكروبي (كما هو موضح بالمربعات ذات الألوان المختلفة) عند أخذ عينات من مجموعة الحمض النووي الكلية (السليم + المتبقي). [ 43 ] وقد اقتُرحت مبادرة البيانات الموحدة للمبادرات (STARDIT) كإحدى طرق توحيد البيانات المتعلقة بأساليب أخذ العينات والتحليل، والعلاقات التصنيفية والوجودية. [ 53 ]

مجموعة

الرواسب الأرضية

تكمن أهمية تحليل الحمض النووي البيئي (eDNA) في إدراك القيود التي تفرضها الدراسات القائمة على الاستزراع . [ 7 ] فقد تكيفت الكائنات الحية لتزدهر في الظروف الخاصة ببيئاتها الطبيعية. ورغم سعي العلماء لمحاكاة هذه البيئات، إلا أنه لا يمكن عزل العديد من الكائنات الميكروبية واستزراعها في المختبر. [ 9 ] بدأ أول تحليل من هذا النوع بتحليل الحمض النووي الريبوزي ( rRNA ) في الميكروبات لفهم أفضل للميكروبات التي تعيش في بيئات قاسية. [ 55 ] وبالتالي، لا يمكن الوصول إلى التركيب الجيني لبعض الميكروبات إلا من خلال تحليل الحمض النووي البيئي. طُبقت تقنيات تحليل الحمض النووي البيئي لأول مرة على الرواسب الأرضية ، مما أسفر عن الحصول على الحمض النووي من الثدييات والطيور والحشرات والنباتات المنقرضة والحية. [ 56 ] تُعرف العينات المستخرجة من هذه الرواسب الأرضية باسم "الحمض النووي الرسوبي القديم" ( seda DNA أو dirt DNA). [ 57 ] يمكن أيضًا استخدام تحليل الحمض النووي البيئي لدراسة المجتمعات الحرجية الحالية، بما في ذلك كل شيء من الطيور والثدييات إلى الفطريات والديدان. [ 9 ] يمكن الحصول على عينات من التربة، والبراز، و"الحمض النووي الناتج عن لدغات الحشرات" من أماكن لدغ الأوراق، والنباتات والأوراق التي تواجدت فيها الحيوانات، ومن وجبات الدم التي تتغذى عليها البعوضات التي ربما تكون قد تغذت على دم أي حيوانات في المنطقة. [ 58 ] يمكن لبعض الطرق أيضًا محاولة التقاط الخلايا باستخدام مصائد الشعر وورق الصنفرة في المناطق التي تعبرها الأنواع المستهدفة بشكل متكرر.

الرواسب المائية

استُخدم الحمض النووي الرسوبي (sedaDNA) لاحقًا لدراسة تنوع الحيوانات القديمة، وتم التحقق منه باستخدام السجلات الأحفورية المعروفة في الرواسب المائية. [ 9 ] تفتقر الرواسب المائية إلى الأكسجين، مما يحمي الحمض النووي من التحلل. [ 9 ] بالإضافة إلى الدراسات القديمة، يمكن استخدام هذا النهج لفهم التنوع الحيواني الحالي بحساسية عالية نسبيًا. فبينما قد يتحلل الحمض النووي في عينات المياه العادية بسرعة نسبية، يمكن أن تحتوي عينات الرواسب المائية على حمض نووي مفيد لمدة شهرين بعد وجود الكائن الحي فيها. [ 59 ] إحدى المشكلات المتعلقة بالرواسب المائية هي عدم معرفة مكان ترسب الحمض النووي البيئي (eDNA) للكائن الحي، إذ يُحتمل أنه قد يكون قد تحرك في عمود الماء.

مائي (عمود الماء)

يمكن أن تشير دراسة الحمض النووي البيئي في عمود الماء إلى تكوين مجتمع الكائنات الحية في المسطح المائي. قبل ظهور الحمض النووي البيئي، كانت الطرق الرئيسية لدراسة تنوع المياه المفتوحة هي استخدام الصيد الكهربائي، والشباك، والفخاخ. [ 10 ] هذه الطريقة فعالة لأن درجة حموضة الماء لا تؤثر على الحمض النووي بالقدر الذي كان يُعتقد سابقًا، ويمكن زيادة الحساسية بسهولة نسبية. [ 10 ] [ 61 ] الحساسية هي مدى احتمالية وجود مؤشر الحمض النووي في عينة الماء، ويمكن زيادتها ببساطة عن طريق أخذ المزيد من العينات، أو زيادة حجمها، أو زيادة تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) . [ 61 ] يتحلل الحمض النووي البيئي بسرعة نسبية في عمود الماء، وهو أمر مفيد للغاية في دراسات الحفظ قصيرة الأجل، مثل تحديد الأنواع الموجودة. [ 9 ]

توصل باحثون في منطقة البحيرات التجريبية في أونتاريو، كندا ، وجامعة ماكجيل، إلى أن توزيع الحمض النووي البيئي يعكس تدرج طبقات المياه في البحيرات . [ 62 ] ومع تغير الفصول ودرجة حرارة المياه، تتغير كثافة المياه أيضًا، مما يؤدي إلى تكوين طبقات متميزة في البحيرات الشمالية الصغيرة صيفًا وشتاءً. وتختلط هذه الطبقات خلال فصلي الربيع والخريف. [ 63 ] ويرتبط استخدام الأسماك للموائل بتدرج الطبقات (فعلى سبيل المثال، تبقى أسماك المياه الباردة مثل سمك السلمون المرقط في المياه الباردة)، وكذلك توزيع الحمض النووي البيئي، كما وجد هؤلاء الباحثون. [ 62 ]

مراقبة الأنواع

يمكن استخدام الحمض النووي البيئي (eDNA) لرصد الأنواع على مدار العام، وهو أداة بالغة الأهمية في رصد جهود الحفاظ على البيئة. [ 19 ] [ 64 ] [ 65 ] وقد نجح تحليل الحمض النووي البيئي في تحديد العديد من التصنيفات المختلفة، بدءًا من النباتات المائية، [ 66 ] والثدييات المائية، [ 24 ] [ 19 ] والأسماك، [ 36 ] [ 65 ] وبلح البحر، [ 64 ] والفطريات ، [ 67 ] [ 68 ] وحتى الطفيليات. [ 69 ] [ 55 ] وقد استُخدم الحمض النووي البيئي لدراسة الأنواع مع تقليل أي تفاعل بشري مُسبب للإجهاد، مما يسمح للباحثين برصد وجود الأنواع على نطاقات مكانية أوسع بكفاءة أكبر. [ 70 ] [ 71 ] ويتمثل الاستخدام الأكثر شيوعًا في الأبحاث الحالية في استخدام الحمض النووي البيئي لدراسة مواقع الأنواع المُعرّضة للخطر، والأنواع الغازية، والأنواع الرئيسية في جميع البيئات. [ 70 ] يُعدّ الحمض النووي البيئي (eDNA) مفيدًا بشكل خاص لدراسة الأنواع ذات التجمعات السكانية الصغيرة، نظرًا لحساسيته العالية التي تُمكّنه من تأكيد وجود نوع ما بجهد قليل نسبيًا لجمع البيانات، وهو ما يُمكن تحقيقه غالبًا باستخدام عينة من التربة أو الماء. [ 7 ] [ 70 ] يعتمد الحمض النووي البيئي على كفاءة التسلسل والتحليل الجينومي، بالإضافة إلى أساليب المسح المستخدمة التي تتطور باستمرار لتصبح أكثر كفاءة وأقل تكلفة. [ 72 ] وقد أظهرت بعض الدراسات أن الحمض النووي البيئي المأخوذ من الجداول والبيئات الساحلية يتحلل إلى مستويات غير قابلة للكشف في غضون 48 ساعة تقريبًا. [ 73 ] [ 74 ]

يمكن استخدام الحمض النووي البيئي كأداة للكشف عن الكائنات الحية قليلة التواجد، سواءً في شكله النشط أو السلبي. تستهدف مسوحات الحمض النووي البيئي النشطة أنواعًا فردية أو مجموعات من التصنيفات للكشف عنها باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي عالي الحساسية والمحدد للأنواع [ 75 ] [ 76 ] أو علامات تفاعل البوليميراز المتسلسل الرقمي بالقطرات [77 ] . كما طُبقت تقنية كريسبر-كاس للكشف عن أنواع مفردة من الحمض النووي البيئي [ 78 ] ، وذلك باستخدام إنزيم كاس 12 أ ، مما يسمح بمزيد من الدقة عند الكشف عن التصنيفات المتواجدة في نفس المنطقة. أما مسوحات الحمض النووي البيئي السلبية، فتستخدم تسلسل الحمض النووي المتوازي على نطاق واسع لتضخيم جميع جزيئات الحمض النووي البيئي في العينة دون تحديد هدف مسبق ، مما يوفر دليلًا شاملًا على الحمض النووي لتكوين المجتمع الحيوي [ 79 ] .

انخفاض أعداد المفصليات الأرضية

تشهد المفصليات الأرضية انخفاضًا هائلًا في أعدادها في أوروبا والعالم أجمع، [ 80 ] [ 81 ] [ 82 ] [ 83 ] على الرغم من أن جزءًا ضئيلًا فقط من أنواعها قد خضع للتقييم، وأن غالبية الحشرات لا تزال غير موصوفة علميًا. [ 84 ] فعلى سبيل المثال، تُعدّ النظم البيئية للمراعي موطنًا لمجموعات تصنيفية ووظيفية متنوعة من المفصليات الأرضية ، مثل الملقحات والحشرات العاشبة والمفترسات، التي تستخدم الرحيق وحبوب اللقاح كمصادر للغذاء، وأنسجة السيقان والأوراق للغذاء والنمو. وتضم هذه المجتمعات أنواعًا مهددة بالانقراض ، نظرًا لاختفاء العديد من الموائل أو تعرضها لتهديدات كبيرة. [ 85 ] [ 86 ] ولذلك، تُبذل جهود مكثفة لاستعادة النظم البيئية للمراعي الأوروبية والحفاظ على التنوع البيولوجي . [ 87 ] على سبيل المثال، تُمثل الملقحات كالنحل والفراشات مجموعة بيئية هامة شهدت انخفاضًا حادًا في أوروبا، مما يُشير إلى خسارة كبيرة في التنوع البيولوجي للمراعي. [ 88 ] [ 89 ] [ 90 ] [ 91 ] يتم تلقيح الغالبية العظمى من النباتات المزهرة بواسطة الحشرات والحيوانات الأخرى في كل من المناطق المعتدلة والاستوائية. [ 92 ] غالبية أنواع الحشرات هي حيوانات عاشبة تتغذى على أجزاء مختلفة من النباتات، ومعظمها متخصص، يعتمد على نوع واحد أو بضعة أنواع من النباتات كمصدر غذائي رئيسي. [ 93 ] ومع ذلك، نظرًا للفجوة المعرفية حول أنواع الحشرات الموجودة، وحقيقة أن معظم الأنواع لا تزال غير موصوفة، فمن الواضح أن هناك معرفة محدودة بالنسبة لمعظم أنواع النباتات في العالم حول مجتمعات المفصليات التي تؤويها وتتفاعل معها. [ 1 ]

لطالما جُمعت مجتمعات المفصليات الأرضية ودُرست باستخدام طرق مثل مصائد ماليز ومصائد الحفر ، وهي طرق فعالة للغاية ولكنها مُرهقة نوعًا ما وقد تكون مُتطفلة. في بعض الحالات، تعجز هذه التقنيات عن إجراء مسوحات فعالة وموحدة، وذلك لأسباب منها، على سبيل المثال، المرونة الظاهرية ، والأنواع وثيقة الصلة، وصعوبة تحديد المراحل اليافعة. علاوة على ذلك، يعتمد التحديد المورفولوجي بشكل مباشر على الخبرة التصنيفية ، وهي خبرة آخذة في التراجع. [ 94 ] [ 95 ] [ 96 ] وقد أدت كل هذه القيود المفروضة على رصد التنوع البيولوجي التقليدي إلى خلق طلب على مناهج بديلة. في الوقت نفسه، يوفر التقدم في تقنيات تسلسل الحمض النووي باستمرار وسائل جديدة للحصول على البيانات البيولوجية. [ 7 ] [ 97 ] [ 29 ] [ 9 ] ومن ثم، فقد اقتُرحت مؤخرًا العديد من المناهج الجزيئية الجديدة للحصول على بيانات سريعة وفعالة حول مجتمعات المفصليات وتفاعلاتها من خلال تقنيات وراثية غير مُتطفلة. يشمل ذلك استخلاص الحمض النووي من مصادر مثل العينات المجمعة أو حساء الحشرات، [ 98 ] [ 99 ] [ 100 ] [ 101 ] وبقايا أوراق الشجر الفارغة، [ 102 ] وشبكات العنكبوت، [ 103 ] وسوائل نبات الإبريق ، [ 104 ] والعينات البيئية مثل التربة والماء والهواء، وحتى الأزهار الكاملة (الحمض النووي البيئي [eDNA])، [ 105 ] [ 106 ] [ 107 ] [ 9 ] [ 108 ] وتحديد النظام الغذائي للنباتات المضيفة والمفترسات من مستخلصات الحمض النووي للحشرات، [ 109 ] [ 110 ] وبراز المفترسات من الخفافيش. [ 111 ] [ 112 ] ومؤخرًا، استُخدم أيضًا الحمض النووي من حبوب اللقاح الملتصقة بالحشرات لاستخلاص معلومات حول تفاعلات النباتات مع الملقحات . [ 113 ] [ 114 ] تعتمد العديد من هذه الدراسات الحديثة على الترميز الفائق للحمض النووي - التسلسل عالي الإنتاجية لتضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل باستخدام البادئات العامة.[ 115 ] [ 106 ] [ 1 ]

الثدييات

مسار الثلج

يستخدم باحثو الحياة البرية في المناطق الثلجية عينات الثلج لجمع واستخلاص المعلومات الجينية عن الأنواع التي تهمهم. وقد استُخدم الحمض النووي المستخلص من آثار الأقدام على الثلج لتأكيد وجود أنواع نادرة ومراوغة مثل الدببة القطبية، والثعالب القطبية، والوشق، والظربان، والسمور. [ 116 ] [ 117 ] [ 118 ] [ 119 ]

الحمض النووي من الهواء

في عام 2021، أثبت الباحثون إمكانية جمع الحمض النووي البيئي من الهواء واستخدامه لتحديد الثدييات. [ 120 ] [ 121 ] [ 122 ] [ 123 ] وفي عام 2023، طوّر العلماء مسبارًا متخصصًا لأخذ العينات ومسحًا جويًا لتقييم التنوع البيولوجي للعديد من المجموعات التصنيفية، بما في ذلك الثدييات، باستخدام الحمض النووي البيئي الموجود في الهواء. [ 124 ]

أثبتت الدراسات أن الحمض النووي البيئي المحمول جوًا (airDNA) أداة عملية لمسح الفقاريات البرية، حتى في بيئات الغابات الاستوائية المعقدة. وأظهرت دراسة أجريت عام 2026 في مدغشقر أن أخذ عينات الحمض النووي البيئي المحمول جوًا، باستخدام مضخات تعمل بالبطارية لترشيح كميات كبيرة من الهواء، كشف باستمرار عن وجود الثدييات في مختلف أنحاء الغابات المجزأة، وأظهر انخفاضًا متوقعًا في التنوع البيولوجي مع ازدياد تجزئة الغابات. [ 125 ] ورغم أن الحمض النووي البيئي المحمول جوًا استخلص عددًا أقل من التصنيفات مقارنةً بالحمض النووي المستخلص من اللافقاريات (iDNA)، إلا أنه أثبت موثوقية تشغيلية أكبر في الظروف الميدانية، ونجح في تحديد الأنواع المستوطنة والمهددة بالانقراض، مما يسلط الضوء على قيمته المتزايدة كطريقة غير جراحية لرصد الحياة البرية في الموائل النائية أو التي يصعب الوصول إليها. [ 125 ]

إدارة مصايد الأسماك

في هذا المثال، تترك السمكة الحمض النووي البيئي خلفها في أثر أثناء تحركها عبر الماء، لكن الأثر يتلاشى ببطء مع مرور الوقت (انقر للتكبير).

يعتمد نجاح إدارة مصائد الأسماك التجارية على إجراء مسوحات موحدة لتقدير كمية وتوزيع مخزونات الأسماك . يُعد سمك القد الأطلسي ( Gadus morhua ) مثالًا بارزًا يُبيّن كيف يمكن أن تؤدي البيانات غير الدقيقة واتخاذ القرارات غير المدروسة إلى انخفاض كارثي في ​​المخزون وما يترتب عليه من مشاكل اقتصادية واجتماعية. [ 127 ] اعتمدت التقييمات التقليدية لمخزونات أنواع الأسماك القاعية بشكل أساسي على مسوحات الجر ، التي وفرت مصدرًا قيّمًا للمعلومات لصناع القرار. [ 128 ] ومع ذلك، توجد بعض العيوب الملحوظة لمسوحات الجر القاعية، بما في ذلك التكلفة، [ 129 ] وانتقائية/قابلية الصيد لأدوات الصيد، [ 130 ] وتدمير الموائل ، [ 131 ] ومحدودية التغطية (مثل بيئات القاع الصلبة، والمناطق البحرية المحمية). [ 132 ]

برز الحمض النووي البيئي (eDNA) كبديل قوي محتمل لدراسة ديناميكيات النظام البيئي. يُخلّف الفقدان المستمر للمادة الوراثية من الكائنات الحية الكبيرة بصمة جزيئية في العينات البيئية، يمكن تحليلها لتحديد وجود أنواع مستهدفة محددة [ 15 ] [ 133 ] أو لتوصيف التنوع البيولوجي [ 134 ] [ 135 ] . وقد طُبّق بنجاح الجمع بين تقنيات التسلسل الجيني من الجيل التالي وأخذ عينات الحمض النووي البيئي في الأنظمة المائية لتوثيق الأنماط المكانية والزمانية في تنوع الأسماك [ 136 ] [ 137 ] [ 138 ] [ 139 ]. ولزيادة تطوير استخدام الحمض النووي البيئي في إدارة مصايد الأسماك، يُعدّ فهم قدرة كميات الحمض النووي البيئي على عكس الكتلة الحيوية للأسماك في المحيط خطوةً مهمةً تالية [ 132 ] .

لقد ثبت وجود علاقات إيجابية بين كميات الحمض النووي البيئي وكتلة الأسماك ووفرتها في الأنظمة التجريبية. [ 140 ] [ 141 ] [ 142 ] ومع ذلك، من المتوقع أن تؤدي الاختلافات المعروفة بين معدلات إنتاج الحمض النووي البيئي [ 143 ] [ 144 ] وتحلله [ 145 ] [ 146 ] [ 147 ] [ 148 ] إلى تعقيد هذه العلاقات في الأنظمة الطبيعية. علاوة على ذلك، في الأنظمة المحيطية، من المرجح أن تؤدي أحجام الموائل الكبيرة والتيارات القوية إلى تشتت أجزاء الحمض النووي بعيدًا عن الكائنات المستهدفة. [ 149 ] وقد اعتُبرت هذه العوامل المربكة سابقًا من العوامل التي تحد من تطبيق الرصد الكمي للحمض النووي البيئي في البيئات المحيطية. [ 149 ] [ 132 ]

على الرغم من هذه القيود المحتملة، فقد وجدت دراسات عديدة في البيئات البحرية علاقات إيجابية بين كميات الحمض النووي البيئي وجهود المسح التكميلية، بما في ذلك الوسم اللاسلكي [ 150 ] ، والمسوحات البصرية [ 139 ] [ 151 ] ، والقياس بالصدى [ 152 ] ، ومسوحات الجر [ 138 ] [ 153 ] . ومع ذلك، فإن الدراسات التي تُحدد كميًا تركيزات الحمض النووي البيئي المستهدف لأنواع الأسماك التجارية باستخدام مسوحات الجر المعيارية في البيئات البحرية نادرة جدًا [ 153 ] .

مقارنة بين أساليب تقييم البيئة: الصيد بشباك الجر القاعية التقليدية (أعلى) مقابل الترميز الجيني البيئي (أسفل). تُستخدم كلتا الطريقتين في حسابات المؤشر لتحديد حالة الجودة البيئية، باستخدام الوفرة المطلقة مقابل الوفرة النسبية على التوالي.

في هذا السياق، تُعدّ المقارنات المباشرة بين تركيزات الحمض النووي البيئي ومقاييس تقييم الكتلة الحيوية والمخزون، مثل معدل الصيد لكل وحدة جهد (CPUE)، ضرورية لفهم مدى إمكانية تطبيق رصد الحمض النووي البيئي للمساهمة في جهود إدارة مصايد الأسماك. [ 132 ] وقد وسّعت الدراسات الحديثة نطاق هذه التطبيقات، مُظهرةً إمكانية دمج الحمض النووي البيئي في مؤشرات أسماك مصبات الأنهار للتقييم البيئي [ 154 ] واستخدامه لإدارة مصايد الأسماك في البيئات الاستوائية حيث تكون البيانات التقليدية محدودة في كثير من الأحيان. [ 25 ]

رواسب أعماق البحار

يُعدّ الحمض النووي خارج الخلوي في رواسب أعماق البحار السطحية أكبر مستودع للحمض النووي في محيطات العالم. [ 156 ] وتتمثل المصادر الرئيسية للحمض النووي خارج الخلوي في هذه النظم البيئية في إطلاق الحمض النووي في الموقع من الكائنات القاعية الميتة، و/أو عمليات أخرى تشمل تحلل الخلايا نتيجة العدوى الفيروسية، وإفراز الخلايا الحية، وتحلل الفيروسات، والمدخلات الخارجية من عمود الماء. [ 156 ] [ 157 ] [ 158 ] [ 159 ] وقد قدمت دراسات سابقة أدلة على أن جزءًا كبيرًا من الحمض النووي خارج الخلوي يمكن أن يفلت من عمليات التحلل، ويبقى محفوظًا في الرواسب. [ 160 ] [ 161 ] ويمثل هذا الحمض النووي، على الأرجح، مستودعًا جينيًا يسجل العمليات البيولوجية التي تحدث بمرور الوقت. [ 162 ] [ 163 ] [ 155 ]

كشفت دراسات حديثة أن الحمض النووي المحفوظ في الرواسب البحرية يتميز بوجود عدد كبير من التسلسلات الجينية شديدة التنوع. [ 162 ] [ 163 ] [ 164 ] وعلى وجه الخصوص، استُخدم الحمض النووي خارج الخلوي لإعادة بناء التنوع السابق للكائنات بدائية النواة وحقيقية النواة في النظم البيئية القاعية التي تتميز بانخفاض درجات الحرارة و/أو ظروف انعدام الأكسجين الدائمة. [ 164 ] [ 165 ] [ 166 ] [ 167 ] [ 168 ] [ 155 ]

يُظهر الرسم البياني على اليمين شبكة وحدات التصنيف التشغيلي (OTU ) لمجموعات الحمض النووي خارج الخلوي من رواسب الهوامش القارية المختلفة. يتناسب حجم النقاط داخل الشبكة مع وفرة التسلسلات لكل وحدة تصنيف تشغيلي. تمثل النقاط المحاطة بدوائر حمراء وحدات التصنيف التشغيلي الأساسية خارج الخلوية، والنقاط المحاطة بدوائر صفراء تمثل وحدات تصنيف تشغيلي مشتركة جزئيًا (بين مجموعتين أو أكثر)، والنقاط المحاطة بدوائر سوداء تمثل وحدات تصنيف تشغيلي حصرية لكل مجموعة. تظهر وحدات التصنيف التشغيلي الأساسية التي تُساهم بما لا يقل عن 20 تسلسلًا. تُشير الأرقام بين قوسين إلى عدد الروابط بين وحدات التصنيف التشغيلي والعينات: 1 لوحدات التصنيف التشغيلي الحصرية، و2-3 لوحدات التصنيف التشغيلي المشتركة جزئيًا، و4 لوحدات التصنيف التشغيلي الأساسية. [ 155 ]

أشارت دراسات سابقة إلى أن الحفاظ على الحمض النووي قد يكون مفضلاً أيضاً في النظم القاعية التي تتميز بارتفاع معدلات تدفق المواد العضوية والترسيب، مثل هوامش القارات. [ 169 ] [ 170 ] وتُعد هذه النظم، التي تمثل حوالي 15% من قاع البحر العالمي، بؤراً ساخنة للتنوع البكتيري القاعي، [ 171 ] [ 172 ] [ 173 ] وبالتالي، يمكن أن تمثل مواقع مثالية لدراسة التنوع البكتيري المحفوظ داخل الحمض النووي خارج الخلية. [ 155 ]

دُرست التوزيعات المكانية لتنوع بدائيات النوى بشكل مكثف في النظم البيئية القاعية في أعماق البحار [ 174 ] [ 175 ] [ 176 ] [ 177 ] من خلال تحليل "الحمض النووي البيئي" (أي المادة الوراثية المستخلصة مباشرة من العينات البيئية دون أي مؤشرات واضحة على وجود مصدر بيولوجي). [ 9 ] ومع ذلك، لا يزال مدى تأثير تسلسلات الجينات الموجودة في الحمض النووي خارج الخلية على تقديرات تنوع تجمعات بدائيات النوى الحالية غير معروف. [ 178 ] [ 155 ]

الحمض النووي الرسوبي القديم

أحدثت تحليلات الحمض النووي القديم المحفوظ في مختلف المحفوظات نقلة نوعية في فهمنا لتطور الأنواع والنظم البيئية. فبينما ركزت الدراسات السابقة على الحمض النووي المستخلص من عينات ذات تصنيف محدد (مثل العظام أو الأنسجة المجمدة)، فإن التقدم في تقنيات التسلسل عالي الإنتاجية والمعلوماتية الحيوية يسمح الآن بتحليل الحمض النووي القديم المستخلص من المحفوظات الرسوبية، [ 179 ] والذي يُعرف باسم الحمض النووي الرسوبي (sedaDNA). وقد خضع تراكم وحفظ الحمض النووي الرسوبي المدفون في رواسب اليابسة والبحيرات لبحوث وتفسيرات مكثفة. [ 180 ] ومع ذلك، فإن دراسة ترسب الحمض النووي في قاع المحيط وحفظه في الرواسب البحرية أكثر تعقيدًا، لأن الحمض النووي يجب أن ينتقل عبر عمود مائي لعدة كيلومترات. [ 181 ] وعلى عكس البيئة الأرضية، حيث ينتشر نقل الكتلة الحيوية شبه الأحفورية من اليابسة، فإن الجزء الأكبر من الحمض النووي الرسوبي البحري مشتق من مجتمع العوالق ، الذي تهيمن عليه الكائنات الدقيقة البحرية والطلائعيات البحرية . [ 182 ] بعد موت العوالق السطحية، يخضع حمضها النووي (DNA) لعملية نقل عبر عمود الماء، حيث يُعرف أن جزءًا كبيرًا من المواد العضوية المرتبطة به يُستهلك ويُعاد تدويره . [ 183 ] ​​قد تستغرق هذه العملية ما بين 3 و12 يومًا، اعتمادًا على حجم وشكل الهيكل. [ 184 ] ومع ذلك، لا يزال من غير الواضح كيف ينجو الحمض النووي البيئي للعوالق، والذي يُعرَّف بأنه إجمالي الحمض النووي الموجود في البيئة بعد موت العوالق، [ 185 ] من هذه العملية، وما إذا كان التحلل أو النقل مرتبطًا بالفرز أو الحمل الجانبي ، وأخيرًا، ما إذا كان الحمض النووي البيئي الذي يصل إلى قاع البحر يُحفظ في الرواسب البحرية دون مزيد من التشويه في تركيبه. [ 186 ]

على الرغم من التعرض الطويل للتحلل في ظل ظروف مؤكسدة أثناء انتقالها في عمود الماء، وانخفاض تركيز المواد العضوية في قاع البحر بشكل ملحوظ، إلا أن هناك أدلة تشير إلى أن الحمض النووي البيئي للعوالق محفوظ في الرواسب البحرية ويحتوي على إشارات بيئية قابلة للاستغلال. [ 187 ] وقد أظهرت دراسات سابقة حفظ الحمض النووي البيئي للرواسب في الرواسب البحرية المترسبة في ظروف نقص الأكسجين مع كميات عالية بشكل غير عادي من المواد العضوية المحفوظة، [ 188 ] ولكن تشير دراسات لاحقة إلى أنه يمكن أيضًا استخلاص الحمض النووي البيئي للرواسب من الرواسب البحرية العادية، التي تهيمن عليها الكسور المعدنية الفتاتية أو الحيوية . [ 189 ] [ 190 ] [ 191 ] بالإضافة إلى ذلك، تضمن درجة الحرارة المنخفضة لمياه أعماق البحار (0-4  درجة مئوية) حفظًا جيدًا للحمض النووي البيئي للرواسب. [ 185 ] [ 187 ] وباستخدام المنخربات العوالقية كـ"حجر رشيد"، مما يسمح بتقييم بصمات الحمض النووي البيئي للرواسب من خلال مقارنة الأصداف الأحفورية المصاحبة لهذه الكائنات، قام مورارد وآخرون... أظهرت دراسة أجريت عام 2017 أن البصمة البيئية للحمض النووي للعوالق التي تصل إلى قاع البحر تحافظ على البصمة البيئية لهذه الكائنات على نطاق جغرافي واسع. [ 188 ] يشير هذا إلى أن الحمض النووي البيئي لمجتمعات العوالق يترسب في قاع البحر، جنبًا إلى جنب مع التجمعات والهياكل العظمية وغيرها من المواد العوالقية الغارقة. إذا صحّ ذلك، فمن المفترض أن يكون الحمض النووي الرسوبي قادرًا على تسجيل بصمات الهيدروغرافيا السطحية للمحيط، والتي تؤثر على تكوين مجتمعات العوالق، بنفس الدقة المكانية التي تتميز بها البقايا الهيكلية للعوالق. إضافةً إلى ذلك، إذا كان الحمض النووي البيئي للعوالق يصل إلى قاع البحر مرتبطًا بالتجمعات أو الأصداف، فمن المحتمل أن يقاوم النقل عبر عمود الماء عن طريق التثبيت على الأسطح المعدنية. وقد تم اقتراح الآلية نفسها لتفسير حفظ الحمض النووي الرسوبي في الرواسب، [ 189 ] [ 190 ] [ 191 ] مما يعني أن تدفق الحمض النووي البيئي العوالقي المغلف في قشرة الكالسيت والذي يصل إلى قاع البحر مشروط بالحفظ عند الدفن. [ 186 ]

يُعد الحمض النووي البيئي (eDNA) للكائنات الحية الدقيقة العوالقية من نوع المنخربات مؤشرًا مثاليًا، سواءً "أفقيًا" لتقييم الدقة المكانية لإعادة بناء السمات الهيدروغرافية لسطح المحيط في الماضي، أو "رأسيًا" لتتبع دفن إشارته عبر عمود الرواسب بدقة. في الواقع، ينبغي أن يكون تدفق الحمض النووي البيئي للكائنات الحية الدقيقة العوالقية متناسبًا مع تدفق أصداف المنخربات الميتة الغارقة إلى قاع البحر، مما يسمح بتقييم إشارة الحمض النووي البيئي بشكل مستقل. يُعد الحمض النووي البيئي أداةً فعّالة لدراسة النظام البيئي لأنه لا يتطلب معرفة تصنيفية مباشرة، مما يسمح بجمع معلومات عن كل كائن حي موجود في العينة، حتى على المستوى الخفي . مع ذلك، يتم ربط تسلسلات الحمض النووي البيئي بالكائنات الحية المعروفة من خلال مقارنتها بتسلسلات مرجعية (أو رموز شريطية ) متاحة في المستودعات العامة أو قواعد البيانات المُنسقة. [ 192 ] يُعدّ تصنيف المنخربات العوالقية مفهومًا جيدًا [ 193 ] ، وتوجد رموز شريطية تسمح برسم خرائط شبه كاملة لتضخيمات الحمض النووي البيئي على التصنيف بناءً على مورفولوجيا أصداف المنخربات. [ 194 ] [ 195 ] ومن المهم أن نذكر أن تكوين مجتمعات المنخربات العوالقية يرتبط ارتباطًا وثيقًا بالهيدروغرافيا السطحية، ويتم الحفاظ على هذه الإشارة من خلال الأصداف الأحفورية المترسبة في قاع البحر. [ 196 ] [ 197 ] وبما أنه يمكن استخلاص الحمض النووي البيئي للمنخربات المتراكم في رواسب المحيط، فإنه يمكن استخدامه لتحليل التغيرات في المجتمعات العوالقية والقاعية بمرور الوقت. [ 198 ] [ 199 ] [ 200 ] [ 201 ] [ 186 ]

في عام 2022، تم اكتشاف وتسلسل مادة وراثية من الحمض النووي البيئي (eDNA) عمرها مليونا عام في جرينلاند، وتُعتبر حاليًا أقدم حمض نووي تم اكتشافه حتى الآن. [ 11 ] [ 12 ]

البحث التشاركي وعلم المواطنين

ما هو الحمض النووي البيئي؟ (فيديو توضيحي قصير من منظمة أرضنا ومياهنا ، نيوزيلندا)

تُسهّل سهولة أخذ عينات الحمض النووي البيئي (eDNA) تنفيذ المشاريع التي تسعى إلى إشراك المجتمعات المحلية في المشاريع البحثية، بما في ذلك جمع عينات الحمض النووي وتحليلها. وهذا من شأنه تمكين المجتمعات المحلية (بما فيها الشعوب الأصلية) من المشاركة الفعّالة في رصد الأنواع في بيئتها، والمساعدة في اتخاذ قرارات مستنيرة كجزء من نموذج البحث الإجرائي التشاركي. وقد قدّمت مؤسسة "العلوم للجميع" الخيرية مثالاً على هذا النوع من المشاريع من خلال مشروع "الحمض النووي البري". [ 202 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. 1 2 3 4 تومسن، فيليب فرانسيس؛ سيغسغارد، إيفا إي. (2019). "التحليل الجيني البيئي للزهور البرية يكشف عن مجتمعات متنوعة من المفصليات الأرضية" . علم البيئة والتطور . 9 (4): 1665-1679 . Bibcode : 2019EcoEv...9.1665T . doi : 10.1002/ece3.4809 . PMC 6392377. PMID 30847063. S2CID 71143282 .   تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  2. 1 2 3 ستيوارت، كاثرين أ. (1 أبريل 2019). "فهم تأثير العوامل الحيوية وغير الحيوية على مصادر الحمض النووي البيئي المائي" . التنوع البيولوجي والحفظ . 28 (5): 983-1001 . Bibcode : 2019BiCon..28..983S . doi : 10.1007/s10531-019-01709-8 . hdl : 11245.1/1caeb8dd-3d0b-493c-90dd-c180c9c8f21c . ISSN 1572-9710 . S2CID 61811470 .  
  3. ↑ فاريل، جيسيكا؛ دافي، ديفيد؛ ويتمور، ليام (21 أبريل 2021). هوديك، كيت (محررة). "الحمض النووي البيئي - كيف ساهمت أداة استُخدمت للكشف عن الحياة البرية المهددة بالانقراض في مكافحة جائحة كوفيد-19" . doi : 10.64628/AAI.k6pmcngcx .
  4. ↑ "ما هو الحمض النووي البيئي؟" . صندوق حماية الموائل المائية العذبة .
  5. ↑ فاهنر، نيكول (2016). "الرصد واسع النطاق للنباتات من خلال الترميز الجيني البيئي للتربة: استخلاص أربعة مؤشرات جينية، ودقتها، وشرحها" . PLOS ONE . 11 (6): 1-16 . Bibcode : 2016PLoSO..1157505F . doi : 10.1371/journal.pone.0157505 . ISSN 1932-6203 . PMC 4911152. PMID 27310720 – عبر دليل المجلات مفتوحة الوصول .   
  6. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 روبرت، كريستا م.؛ كلاين، ريتشارد ج.؛ رحمن، محمد سيدور (2019). "الماضي والحاضر والمستقبلي لتقنية الترميز الفائق للحمض النووي البيئي (EDNA): مراجعة منهجية في أساليب الرصد والتطبيقات العالمية للحمض النووي البيئي" . علم البيئة العالمي والحفظ . 17 e00547. Bibcode : 2019GEcoC..1700547R . doi : 10.1016/j.gecco.2019.e00547 . S2CID 133855497 . تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  7. ١ ٢ ٣ ٤ ٥ ٦ ٧ بومان، كريستين؛ إيفانز، أليس؛ جيلبرت، م. توماس ب.؛ كارفاليو، غاري ر.؛ كريير، سيمون؛ كناب، مايكل؛ يو، دوغلاس و.؛ دي بروين، مارك (١ يونيو ٢٠١٤). "الحمض النووي البيئي لعلم الأحياء البرية ورصد التنوع البيولوجي". اتجاهات في علم البيئة والتطور . ٢٩ (٦): ٣٥٨-٣٦٧ . Bibcode : 2014TEcoE..29..358B . doi : 10.1016/j.tree.2014.04.003 . ISSN 1872-8383 . PMID 24821515 .  
  8. ↑ كو، شانجوان؛ ستيوارت، كاثرين أ. (18 فبراير 2019). "تقييم خيارات الرصد لأغراض الحفظ: مقارنة أدوات الحمض النووي التقليدية والبيئية لثديي مهدد بالانقراض بشدة" . مجلة علوم الطبيعة . 106 (3): 9. Bibcode : 2019SciNa.106....9Q . doi : 10.1007/s00114-019-1605-1 . hdl : 11245.1/d02ea724-b763-42b2-8f97-696ef88db996 . ISSN 1432-1904 . PMID 30778682. S2CID 66881381 .   
  9. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 تومسن، فيليب فرانسيس؛ ويلرسليف، إيسكي (1 مارس 2015). "الحمض النووي البيئي - أداة ناشئة في مجال الحفاظ على البيئة لرصد التنوع البيولوجي في الماضي والحاضر" . الحفاظ على البيئة . عدد خاص: الحمض النووي البيئي: أداة جديدة فعّالة للحفاظ على البيئة. 183 : 4-18 . Bibcode : 2015BCons.183....4T . doi : 10.1016/j.biocon.2014.11.019 .
  10. 1 2 3 تسوجي، ساتسوكي (2016). "تأثير درجة حموضة الماء ومعالجة البروتينيز K على كمية الحمض النووي البيئي المستخلص من عينات المياه". علم البحيرات . 18 : 1-7 . doi : 10.1007/s10201-016-0483-x . ISSN 1439-8621 . S2CID 44793881 .  
  11. 1 2 زيمر، كارل (7 ديسمبر 2022). "أقدم حمض نووي معروف يُلقي نظرة على منطقة القطب الشمالي الخصبة سابقًا - اكتشف العلماء في التربة الصقيعية في جرينلاند مادة وراثية عمرها مليونا عام من عشرات الأنواع النباتية والحيوانية، بما في ذلك الماموث والإوز والليمون والنمل" . صحيفة نيويورك تايمز . تم الاطلاع عليه في 7 ديسمبر 2022 .
  12. 1 2 كيير، كورت هـ.؛ وآخرون . (7 ديسمبر 2022). "نظام بيئي عمره مليونا عام في جرينلاند تم الكشف عنه بواسطة الحمض النووي البيئي" . مجلة نيتشر . 612 ( 7939): 283-291 . Bibcode : 2022Natur.612..283K . doi : 10.1038/s41586-022-05453-y . PMC 9729109. PMID 36477129. S2CID 254367944 .    
  13. 1 2 كاواكامي، تاتسويا؛ يامازاكي، آيا؛ أسامي، ماكي؛ غوتو، يوكو؛ ياماناكا، هيروكي؛ هيودو، سوسومو؛ أوينو، هيروميتشي؛ كاساي، أكيهيدي (2023). "تقييم جهد أخذ العينات للكشف عن الحمض النووي البيئي للأسماك في المحيط المفتوح باستخدام تقنية الترميز الفائق" . علم البيئة والتطور . 13 (3) e9921. Bibcode : 2023EcoEv..13E9921K . doi : 10.1002/ece3.9921 . ISSN 2045-7758 . PMC 10037434. PMID 36969932 .   
  14. ↑ بايلمانز، جوناس؛ جليسون، ديان م.؛ لينترمانز، مارك؛ هاردي، كريستوفر م.؛ بيتزل، ماثيو؛ جيليجان، دين م.؛ فورلان، إليز م. (31 ديسمبر 2018). "رصد مجتمعات الأسماك النهرية من خلال الترميز الفائق للحمض النووي البيئي: تحديد استراتيجيات أخذ العينات المثلى على طول تدرج الارتفاع والتنوع البيولوجي" . الترميز الفائق وعلم الجينوم البيئي . 2 e30457. doi : 10.3897/mbmg.2.30457 . ISSN 2534-9708 . 
  15. 1 2 فيسيتولا، جنتيلي فرانشيسكو؛ ميود، كلود؛ بومبانون، فرانسوا؛ تابيرليه، بيير (2008). "الكشف عن الأنواع باستخدام الحمض النووي البيئي من عينات المياه" . رسائل علم الأحياء . 4 (4): 423-425 . doi : 10.1098/rsbl.2008.0118 . PMC 2610135. PMID 18400683 .  
  16. 1 2 3 4 بارنز، ماثيو أ.؛ تيرنر، كاميرون ر. (2016). "بيئة الحمض النووي البيئي وآثارها على علم الوراثة الحفظية" . علم الوراثة الحفظية . 17 (1): 1-17 . Bibcode : 2016ConG...17....1B . doi : 10.1007/s10592-015-0775-4 . hdl : 2346/87600 . S2CID 14914544 . 
  17. ↑ دينر، كريستي؛ والسر، جان كلود؛ ماخلر، إلفيرا؛ ألترمان، فلوريان (2015). "يؤثر اختيار طرق الالتقاط والاستخلاص على الكشف عن التنوع البيولوجي للمياه العذبة من الحمض النووي البيئي" . الحفاظ البيولوجي . 183 : 53-63 . Bibcode : 2015BCons.183...53D . doi : 10.1016/j.biocon.2014.11.018 .
  18. 1 2 تابيرليه، بيير؛ كويساك، إريك؛ بومبانون، فرانسوا؛ بروخمان، كريستيان؛ ويلرسليف، إسكي (2012). "نحو تقييم الجيل القادم للتنوع البيولوجي باستخدام الترميز الفائق للحمض النووي". علم البيئة الجزيئية . 21 (8): 2045-2050 . Bibcode : 2012MolEc..21.2045T . doi : 10.1111/j.1365-294X.2012.05470.x . PMID 22486824. S2CID 41437334 .  
  19. 1 2 3 4 5 ستيوارت، كاثرين؛ ما، هونغجوان؛ تشنغ، جينسونغ؛ تشاو، جيانفو (2017). "استخدام الحمض النووي البيئي لتقييم استخدام المحميات المكانية والزمانية على مستوى السكان" . علم الأحياء الحفظي (بالإسبانية). 31 (5): 1173-1182 . Bibcode : 2017ConBi..31.1173S . doi : 10.1111/cobi.12910 . ISSN 1523-1739 . PMID 28221696. S2CID 3781648 .   
  20. 1 2 3 4 غولدبيرغ، كارين س.؛ تيرنر، كاميرون ر.؛ دينر، كريستي؛ كليموس، كاتي إي.؛ تومسن، فيليب فرانسيس؛ مورفي، ميلاني أ.؛ سبير، ستيفن ف.؛ ماكي، آنا؛ أويلر-ماكانس، سارة ج.؛ كورنمان، روبرت سكوت؛ لارامي، ماثيو ب.؛ ماهون، أندرو ر.؛ لانس، ريتشارد ف.؛ بيليود، ديفيد س.؛ ستريكلر، كاثرين م.؛ وايتس، ليسيت ب.؛ فريمير، ألكسندر ك.؛ تاكاهارا، تيروهيكو؛ هيردر، جيلجر إي.؛ تابيرليه، بيير (2016). "اعتبارات حاسمة لتطبيق طرق الحمض النووي البيئي للكشف عن الأنواع المائية" . طرق في علم البيئة والتطور . 7 (11): 1299– 1307. Bibcode : 2016MEcEv...7.1299G . doi : 10.1111/2041-210X.12595 . hdl : 20.500.11850/502281 . S2CID 89432389 . 
  21. 1 2 3 4 هيرينج، دانيال؛ بورخا، ملاك؛ جونز، جي إيوان؛ بونت، ديدييه؛ بوتس، بيتر؛ بوشيز، أغنيس. بروس، كات. دراكار، ستينا؛ هانفلينج، بيرند؛ كالرت، ماريا. ليز، فلوريان. مايسنر، كريستيان. ميرجن، باتريشيا؛ ريجول، يوريك. سيجورادو، بيدرو؛ فوجلر، ألفريد؛ كيلي ، مارتن (2018). "خيارات التنفيذ لتحديد الهوية المستندة إلى الحمض النووي في تقييم الحالة البيئية بموجب التوجيه الإطاري الأوروبي للمياه" . أبحاث المياه . 138 : 192– 205. بيب كود : 2018WatRe.138..192H . دوى : 10.1016/j.watres.2018.03.003 . بميد 29602086 . S2CID 5008250. مؤرشف من الأصل بتاريخ 24 أكتوبر 2023. تم الاطلاع عليه بتاريخ 3 فبراير 2021 .  
  22. 1 2 3 4 5 6 7 8 دينر، كريستي؛ بيك، هولي م.؛ ماشلر، إلفيرا؛ سيمور، ماثيو. لاكورسيير روسيل، أناييس؛ الترمات، فلوريان. كرير، سيمون. بيستا، إليانا؛ لودج، ديفيد م.؛ فير، ناتاشا؛ بفريندر، مايكل E.؛ بيرناتشيز، لويس (2017). "استقلاب الحمض النووي البيئي: تغيير كيفية مسح مجتمعات الحيوانات والنباتات" . البيئة الجزيئية . 26 (21): 5872–5895 . بيب كود : 2017MolEc..26.5872D . دوى : 10.1111/mec.14350 . اتش دي ال : 20.500.11850/455284 . PMID 28921802 . S2CID 8001074 .  
  23. ↑ بونك، إريك أ.؛ مايلز-غونزاليس، إميليا؛ زينسترا، ناثان؛ هانر، روبرت هـ. (24 فبراير 2026). "ما وراء ثراء الأنواع: مقارنة إحصائية دقيقة بين الحمض النووي البيئي وطرق أخذ عينات الأسماك التقليدية" . العلوم والتكنولوجيا البيئية . 60 (7): 5544-5558 . doi : 10.1021/acs.est.5c06266 . ISSN 0013-936X . PMC 12947614. PMID 41678297 .   
  24. 1 2 ما، هونغجوان؛ ستيوارت، كاثرين؛ لوغيد، ستيفن؛ تشنغ، جينسونغ؛ وانغ، يوكسيانغ؛ تشاو، جيانفو (1 ديسمبر 2016). "توصيف وتحسين والتحقق من صحة مؤشرات الحمض النووي البيئي (eDNA) للكشف عن الثدييات المائية المهددة بالانقراض". موارد علم الوراثة الحفظية . 8 (4): 561-568 . Bibcode : 2016ConGR...8..561M . doi : 10.1007/s12686-016-0597-9 . ISSN 1877-7260 . S2CID 1613649 .  
  25. بهينداركار ، موكيش؛ رودريغيز-إزبيليتا، نايارا (2024 ) . "استكشاف مناطق مجهولة: آفاق جديدة في الحمض النووي البيئي لإدارة مصايد الأسماك الاستوائية". الرصد والتقييم البيئي . 196 (617) 617. Bibcode : 2024EMnAs.196..617B . doi : 10.1007/s10661-024-12788-8 . PMID 38874640 . 
  26. 1 2 3 كويساك، إريك؛ رياض، طيبة؛ بوياندر، نيكولاس (2012). "تحديات المعلوماتية الحيوية لترميز الحمض النووي الفائق للنباتات والحيوانات" . علم البيئة الجزيئية . 21 (8): 1834-1847 . Bibcode : 2012MolEc..21.1834C . doi : 10.1111/j.1365-294X.2012.05550.x . PMID 22486822. S2CID 24398174 .  
  27. ↑ إيشميلر، جيسيكا جيه؛ بيست، سيندريا إي؛ سورنسن، بيتر دبليو (2016). "تأثيرات درجة الحرارة والحالة الغذائية على تحلل الحمض النووي البيئي في مياه البحيرة". العلوم والتكنولوجيا البيئية . 50 (4): 1859-1867 . Bibcode : 2016EnST...50.1859E . doi : 10.1021/acs.est.5b05672 . PMID 26771292 . 
  28. ↑ كارو، ميليسا إي.؛ بيتيغروف، فينسنت جيه.؛ ميتزلينغ، ليون؛ هوفمان، آري أ. (2013). "الرصد البيئي باستخدام تقنية التسلسل الجيني من الجيل التالي: التحديد السريع لأنواع المؤشرات الحيوية من اللافقاريات الكبيرة" . مجلة فرونتيرز إن زولوجي . 10 (1): 45. doi : 10.1186/1742-9994-10-45 . PMC 3750358. PMID 23919569 .  
  29. 1 2 3 4 كريير، سيمون؛ دينر ، كريستي؛ فراي ، سيريتا؛ بورازينسكا، دوروتا؛ تابيرليه، بيير؛ توماس، دبليو. كيلي؛ بوتر، كايتلين؛ بيك، هولي م. (2016). "دليل عالم البيئة الميداني لتحديد التنوع البيولوجي بناءً على التسلسل" . مناهج في علم البيئة والتطور . 7 (9): 1008-1018 . Bibcode : 2016MEcEv...7.1008C . doi : 10.1111/2041-210X.12574 . hdl : 20.500.11850/125378 . S2CID 87512991 . 
  30. ↑ "الحمض النووي الذاتي خارج الخلية يحذر النباتات من الخطر" . www.newphytologist.org . تم الاطلاع عليه بتاريخ 10 يناير 2022 .
  31. ↑ مازوليني إس، بونانومي جي، إنشيرتي جي، كيوزانو إم إل، تيرمولينو بي، مينغو إيه، سيناتوري إم، جيانينو إف، كارتيني إف، ريتكيرك إم، لانزوتي في. 2015أ. التأثيرات المثبطة والسامة للحمض النووي الذاتي خارج الخلية في المخلفات النباتية: آلية للتغذية الراجعة السلبية بين النبات والتربة؟ مجلة نيو فايتولوجيست 205: 1195-1210
  32. ↑ مازوليني إس، كارتيني إف، بونانومي جي، سيناتوري إم، تيرمولينو بي، جيانينو إف، إنسيرتي جي، ريتكيرك إم، لانزوتي الخامس، تشيوسانو إم إل. 2015 ب. التأثيرات المثبطة للحمض النووي الذاتي خارج الخلية: عملية بيولوجية عامة؟ عالم النبات الجديد 206: 127-132.
  33. ↑ فيريسوغلو، إس دي، أغيلار-تريغيروس، سي إيه، منصور، آي، ريليغ، إم سي 2015. الحمض النووي الذاتي: نعمة متنكرة؟ عالم النبات الجديد 207: 488-490.
  34. ↑ دوران-فلوريس، د، هايل، م. 2015. تثبيط النمو بواسطة الحمض النووي الذاتي: ظاهرة وتفسيراتها المتعددة. مجلة نيو فايتولوجيست 207: 482-485.
  35. ↑ براءة اختراع WO 2014/020624 A9
  36. 1 2 3 كو، شانجوان؛ ستيوارت، كاثرين أ.؛ كليمنتي-كارفاليو، روت؛ تشنغ، جينسونغ؛ وانغ، يوكسيانغ؛ غونغ، تشنغ؛ ما، ليمين؛ تشاو، جيانفو؛ لوغيد، ستيفن سي. (7 أكتوبر 2020). "مقارنة تنوع فرائس الأسماك لثديي مائي مهدد بالانقراض بشدة في محمية وفي البرية باستخدام الترميز الفائق للحمض النووي البيئي" . التقارير العلمية . 10 (1): 16715. doi : 10.1038/s41598-020-73648-2 . ISSN 2045-2322 . PMC 7542144. PMID 33028872 .   
  37. ↑ بانيرجي، بريتام؛ ستيوارت، كاثرين أ.؛ أنتوجنازا، كاترينا م.؛ بونهولي، إنغريد ف.؛ دينر، كريستي؛ بارنز، ماثيو أ.؛ ساها، سانتانو؛ فيردييه، هيلويز؛ دوي، هيديوكي؛ مايتي، جيوتي براكاش؛ تشان، مايكل واي؛ تشين، تشين ين (2022). "التفاعلات بين النباتات والحيوانات في عصر الحمض النووي البيئي (eDNA) - مراجعة" . الحمض النووي البيئي . 4 (5): 987-999 . doi : 10.1002/edn3.308 . hdl : 11383/2137932 . S2CID 248977497 . 
  38. ↑ فيسيتولا، جنتيلي فرانشيسكو؛ تابيرليه، بيير؛ كويساك، إريك (2016). "كيفية الحد من النتائج الإيجابية الخاطئة في الحمض النووي البيئي والترميز الفائق؟" . موارد علم البيئة الجزيئية . 16 (3): 604-607 . Bibcode : 2016MolER..16..604F . doi : 10.1111/1755-0998.12508 . PMID 27062589. S2CID 785279 .  
  39. ↑ يو، دوغلاس دبليو؛ جي، ينكيو؛ إيمرسون، برنت سي؛ وانغ، شياويانغ؛ يي، تشنغشي؛ يانغ، تشونيان؛ دينغ، تشاولي (2012). "حساء التنوع البيولوجي: الترميز الفائق للمفصليات لتقييم التنوع البيولوجي السريع والرصد البيولوجي" . مناهج في علم البيئة والتطور . 3 (4): 613-623 . Bibcode : 2012MEcEv...3..613Y . doi : 10.1111/j.2041-210X.2012.00198.x . hdl : 10261/193380 . S2CID 83095866 . 
  40. ↑ كريستيسكو، ميلانيا إي. (2014). "من الترميز الجيني للأفراد إلى الترميز الجيني الشامل للمجتمعات البيولوجية: نحو منهج تكاملي لدراسة التنوع البيولوجي العالمي". اتجاهات في علم البيئة والتطور . 29 (10): 566-571 . Bibcode : 2014TEcoE..29..566C . doi : 10.1016/j.tree.2014.08.001 . PMID 25175416. S2CID 18352572 .  
  41. ↑ جيبسون، جويل ف.؛ شوكرا الله، شادي؛ كاري، كولين؛ بيرد، دونالد ج.؛ مونك، ويندي أ.؛ كينغ، إيان؛ حاجي بابائي، مهرداد (2015). "الرصد البيولوجي واسع النطاق للنظم البيئية النائية والمهددة عبر التسلسل عالي الإنتاجية" . PLOS ONE . 10 (10) e0138432. Bibcode : 2015PLoSO..1038432G . doi : 10.1371/journal.pone.0138432 . PMC 4619546. PMID 26488407 .  
  42. ^ تشوا، فيسيليا يس؛ بورلات، سارة ج. فيرجسون، كاميرون؛ كورليفيتش، البتراء؛ تشاو، ليا؛ أكرم، توربيورن؛ ماير، رودولف. لونيتشاك، مارا KN (10 مارس 2023). “مستقبل مراقبة الحشرات المعتمدة على الحمض النووي”. الاتجاهات في علم الوراثة . 39 (7): 531-544 . دوى : 10.1016/j.tig.2023.02.012 . بميد 36907721 . S2CID 257470926 .  
  43. لينون ، جيه تي؛ موسكاريلا، إم إي؛ بلاسيللا، إس إيه؛ ليمكول، بي كيه (2018). "كيف ومتى وأين يؤثر الحمض النووي المتبقي على التنوع الميكروبي" . mBio . 9 ( 3) e00637-18. Bibcode : 2018mBio....937.18L . doi : 10.1128/mBio.00637-18 . PMC 6016248. PMID 29921664 .  تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  44. ↑ تاني ك، ناسو م (2010). "أدوار الحمض النووي خارج الخلية في النظم البيئية البكتيرية". في كيكوتشي ي، ريكوفا إي واي (محرران). الأحماض النووية خارج الخلية . سبرينغر. ص 25-38 . ISBN  978-3-642-12616-1.
  45. ↑ فلاسوف ، ف. ف.، لاكتيونوف، ب. ب.، ريكوفا، إ. ي. (يوليو 2007). "الأحماض النووية خارج الخلية". مقالات بيولوجية . 29 (7): 654-667 . doi : 10.1002/bies.20604 . PMID 17563084. S2CID 32463239 .  
  46. ↑ فينكل إس إي، وكولتر آر (نوفمبر 2001). " الحمض النووي كمغذٍّ: دور جديد لنظائر جينات الكفاءة البكتيرية" . مجلة علم البكتيريا . 183 (21): 6288-93 . doi : 10.1128/JB.183.21.6288-6293.2001 . PMC 100116. PMID 11591672 .  
  47. ↑ مولكاهي إتش، شارون-مازينود إل، ليوينزا إس (نوفمبر 2008). "يرتبط الحمض النووي خارج الخلية بالأيونات الموجبة ويحفز مقاومة المضادات الحيوية في الأغشية الحيوية لبكتيريا الزائفة الزنجارية" . مجلة PLOS للأمراض . 4 (11) e1000213. doi : 10.1371/journal.ppat.1000213 . PMC 2581603. PMID 19023416 .  
  48. ↑ بيرن سي، كيسيلا دي تي، برون واي في (أغسطس 2010). "يمنع الحمض النووي خارج الخلية البكتيري استقرار الخلايا الوليدة المتحركة داخل الغشاء الحيوي" . علم الأحياء الدقيقة الجزيئي . 77 (4): 815-29 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2010.07267.x . PMC 2962764. PMID 20598083 .  
  49. ↑ ويتشيرش سي بي، تولكر-نيلسن تي، راغاس بي سي، ماتيك جيه إس (فبراير 2002). "الحمض النووي خارج الخلية ضروري لتكوين الأغشية الحيوية البكتيرية". مجلة ساينس . 295 (5559): 1487. doi : 10.1126/science.295.5559.1487 . PMID 11859186 . 
  50. ↑ هو وآخرون (2012). "يبني الحمض النووي ويقوي المصفوفة خارج الخلوية في الأغشية الحيوية لبكتيريا ميكسوكوكس زانثوس من خلال التفاعل مع عديدات السكاريد الخارجية" . PLOS ONE . 7 (12) e51905. Bibcode : 2012PLoSO...751905H . doi : 10.1371/ journal.pone.0051905 . PMC 3530553. PMID 23300576 .  
  51. ↑ Foote AD, Thomsen PF, Sveegaard S, Wahlberg M, Kielgast J, Kyhn LA, et al. (2012). " دراسة الاستخدام المحتمل للحمض النووي البيئي (eDNA) للرصد الجيني للثدييات البحرية" . PLOS ONE . 7 (8) e41781. Bibcode : 2012PLoSO...741781F . doi : 10.1371/journal.pone.0041781 . PMC 3430683. PMID 22952587 .   
  52. ↑ "باحثون يكتشفون حيوانات برية باستخدام الحمض النووي في المسطحات المائية القريبة" .
  53. ↑ نون، جاك س .؛ شافي، توماس (2022). "بيانات موحدة حول المبادرات - STARDIT: نسخة تجريبية" . مطبوعات OSF الأولية . 8 ( 1): 31. doi : 10.31219/osf.io/w5xj6 . PMC 9294764. PMID 35854364. S2CID 242248848 .   
  54. 1 2 أرمبريشت، ليندا (2020). "إمكانات الحمض النووي القديم الرسوبي في إعادة بناء النظم البيئية للمحيطات في الماضي". علم المحيطات . 33 (2). Bibcode : 2020Ocgpy..33b.211A . doi : 10.5670/oceanog.2020.211 . S2CID 221020884 . تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  55. باس ، ديفيد (2015). "تطبيقات متنوعة لأساليب الحمض النووي البيئي في علم الطفيليات" . اتجاهات في علم الطفيليات . 31 (10): 499-513 . doi : 10.1016/j.pt.2015.06.013 . hdl : 20.500.11850/105112 . PMID 26433253 . 
  56. ↑ ويلرسليف، إسكي؛ هانسن، أندرس ج.؛ بن لادن، جوناس؛ براند، تينا ب.؛ جيلبرت، م. توماس ف.ب.؛ شابيرو، بيث؛ بونس، مايكل؛ ويوف، كارستن؛ جيليتشينسكي، ديفيد أ. (2 مايو 2003). " سجلات وراثية متنوعة للنباتات والحيوانات من رواسب الهولوسين والبليستوسين" . مجلة ساينس . 300 (5620): 791-795 . Bibcode : 2003Sci...300..791W . doi : 10.1126/science.1084114 . ISSN 0036-8075 . PMID 12702808. S2CID 1222227 .   
  57. ^ أندرسن ، كينيث. بيرد، كارين ليز؛ راسموسن، مورتن؛ هايل، جيمس. بريونينج مادسن، هنريك؛ كيرت هـ. أورلاندو، لودوفيتش؛ جيلبرت، م. توماس ب.؛ ويلرسليف ، إسكي (1 أبريل 2012). “التشفير الفوقي للحمض النووي” الترابي “من التربة يعكس التنوع البيولوجي للفقاريات”. البيئة الجزيئية . 21 (8): 1966–1979 . بيب كود : 2012MolEc..21.1966A . دوى : 10.1111/j.1365-294X.2011.05261.x . ISSN 1365-294X . بميد 21917035 . S2CID 43351435 .   
  58. ↑ نون، جاك (2020). "العلم للجميع - تقرير بحثي ممول من القطاع العام (يونيو 2018 - ديسمبر 2019)". فيجشير . doi : 10.26181/5eba630a64e08 .
  59. ↑ تيرنر، كاميرون ر. (2014). "يُعدّ الحمض النووي البيئي للأسماك أكثر تركيزًا في الرواسب المائية منه في المياه السطحية" . الحفاظ البيولوجي . 183 : 93-102 . doi : 10.1016/j.biocon.2014.11.017 . ISSN 0006-3207 . 
  60. ↑ غونغ؛ فان؛ لي؛ لي؛ تشانغ؛ غروميغ؛ سميث؛ دومان؛ بيرغر؛ آيزن؛ تيل؛ بيسكابورن؛ كوغلين؛ فيلهلمز؛ بروي؛ ليو؛ يانغ؛ لي؛ ليو؛ تالالاي (2019). "أخذ عينات لبية من الرواسب الجليدية في القطب الجنوبي" . مجلة علوم وهندسة البحار . 7 (6): 194. Bibcode : 2019JMSE....7..194G . doi : 10.3390/jmse7060194 .تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  61. شولتز ، مارتن ( 2015 ). "نمذجة حساسية المسوحات الميدانية للكشف عن الحمض النووي البيئي (eDNA)" . PLOS ONE . 10 ( 10): 1-16 . Bibcode : 2015PLoSO..1041503S . doi : 10.1371/journal.pone.0141503 . ISSN 1932-6203 . PMC 4624909. PMID 26509674 .   
  62. 1 2 ليتلفير، جوان إي.؛ هرينتشوك، لي إي.؛ بلانشفيلد، بول جيه.؛ ريني، مايكل دي.؛ كريستيسكو، ميلانيا إي. (2021). "التقسيم الحراري والتفضيل الحراري للأسماك يفسران التوزيعات الرأسية للحمض النووي البيئي في البحيرات". علم البيئة الجزيئية . 30 (13): 3083-3096 . Bibcode : 2021MolEc..30.3083L . bioRxiv 10.1101/2020.04.21.042820 . doi : 10.1111/mec.15623 . 
  63. ↑ "كيف ولماذا تتطبق طبقات البحيرات وتتقلب: نشرح العلم" . منطقة البحيرات التجريبية التابعة للمعهد الدولي للتنمية المستدامة . 16 مايو 2018. تم الاطلاع عليه بتاريخ 14 يوليو 2020 .
  64. 1 2 ستوكل، برنارد (2016). "الحمض النووي البيئي كأداة رصد لبلح البحر اللؤلؤي المهدد بالانقراض (Margaritifera margaritifera L.): بديل عن أساليب الرصد التقليدية؟". الحفاظ على البيئة المائية: النظم الإيكولوجية البحرية والمياه العذبة . 26 (6): 1120-1129 . Bibcode : 2016ACMFE..26.1120S . doi : 10.1002/aqc.2611 .
  65. 1 2 سوزا، ليزلي (2016). "يتأثر احتمال الكشف عن الحمض النووي البيئي (eDNA) بالنشاط الموسمي للكائنات الحية" . PLOS ONE . 11 ( 10): 1-15 . Bibcode : 2016PLoSO..1165273D . doi : 10.1371/journal.pone.0165273 . ISSN 1932-6203 . PMC 5077074. PMID 27776150 .   
  66. ↑ سايكو، ماتسوهاشي (2016). "تقييم طريقة الحمض النووي البيئي لتقدير توزيع وكتلة النباتات المائية المغمورة" . PLOS ONE . 11 ( 6): 1-14 . Bibcode : 2016PLoSO..1156217M . doi : 10.1371/journal.pone.0156217 . ISSN 1932-6203 . PMC 4909283. PMID 27304876 .   
  67. ^ تيدرسو، ليهو؛ بهرام، محمد؛ بولمي، سيرجي؛ كولجالج، أورماس؛ يورو، نورو س.؛ ويجيسونديرا، رافي؛ رويز، لويس فياريال؛ فاسكو بالاسيوس، عايدة م.؛ الخميس، فام كوانج (28 نوفمبر 2014). “التنوع العالمي وجغرافيا فطريات التربة” (PDF) . علوم . 346 (6213) 1256688. دوى : 10.1126/science.1256688 . اتش دي ال : 10447/102930 . ISSN 0036-8075 . بميد 25430773 . S2CID 206559506 .   
  68. ↑ ديثريدج، أندرو بول؛ كومونت، ديفيد؛ كالاغان، توني مارتن؛ بوسيل، جينيفر؛ براند، غراهام؛ غوين-جونز، ديلان؛ سكوليون، جون؛ غريفيث، غاريث وين (يونيو 2018). "تؤثر العوامل النباتية والترابية على سرعة استقرار مجتمعات فطرية متميزة في مواقع مخلفات الفحم السابقة" . علم البيئة الفطرية . 33 : 92-103 . Bibcode : 2018FunE...33...92D . doi : 10.1016/j.funeco.2018.02.002 . ISSN 1754-5048 . 
  69. ↑ جونز، ريس أليد؛ بروفي، بيتر م.؛ ديفيس، تشيلسي ن.؛ ديفيز، تيري إي.؛ إمبيرسون، هولي؛ ريس ستيفنز، بولين؛ ويليامز، هيفين وين (8 يونيو 2018). "الكشف عن الحمض النووي البيئي لـ Galba truncatula و Fasciola hepatica و Calicophoron daubneyi في مصادر المياه في المراعي، أداة مستقبلية لمكافحة الديدان الكبدية؟" . الطفيليات والنواقل . 11 (1): 342. doi : 10.1186/s13071-018-2928-z . ISSN 1756-3305 . PMC 5994096. PMID 29884202 .   
  70. بيرغمان ، بول س .؛ شومر، غريغ؛ بلانكنشيب، سكوت؛ كامبل، إليزابيث (2016). " الكشف عن سمك الحفش الأخضر البالغ باستخدام تحليل الحمض النووي البيئي" . PLOS ONE . 11 (4): 1-8 . Bibcode : 2016PLoSO..1153500B . doi : 10.1371/journal.pone.0153500 . ISSN 1932-6203 . PMC 4838217. PMID 27096433 .   
  71. ↑ "دليل الحمض النووي البيئي (eDNA) من Biomeme" . Biomeme .
  72. ↑ وانغ، شينكون (2016). تحليل بيانات التسلسل من الجيل التالي . بوكا راتون: مطبعة سي آر سي. رقم ISBN 978-1-4822-1788-9. OCLC 940961529 . {{cite book}}: CS1 maint: publisher location ( link )
  73. ↑ سيمور، ماثيو؛ دورانس، إيزابيل؛ كوسبي، برنارد جيه؛ رانسوم-جونز، إيما؛ دينر، كريستي؛ أورميرود، ستيف جيه؛ كولبورن، جون كيه؛ ويلجار، جريجوري؛ كارفاليو، جاري آر. (22 يناير 2018). "الحموضة تعزز تحلل الحمض النووي البيئي متعدد الأنواع في بيئات مائية جارية مصغرة" . مجلة كوميونيكيشنز بيولوجي . 1 (1): 4. doi : 10.1038/s42003-017-0005-3 . ISSN 2399-3642 . PMC 6123786. PMID 30271891 .   
  74. ↑ كولينز، روبرت أ.؛ وانغينستين، أوين س.؛ أوغورمان، إوين ج.؛ مارياني، ستيفانو؛ سيمز، ديفيد و.؛ جينر، مارتن ج. (5 نوفمبر 2018). "استمرار الحمض النووي البيئي في النظم البحرية" . مجلة اتصالات البيولوجيا . 1 (1): 185. doi : 10.1038 / s42003-018-0192-6 . ISSN 2399-3642 . PMC 6218555. PMID 30417122 .   
  75. ↑ ويلدون، لورا؛ أوليري، سيارا؛ ستير، مارك د.؛ نيوتن، لين؛ ماكدونالد، هيذر؛ سارجنت، ستيفاني أ. (25 يونيو 2020). "مقارنة تركيزات الحمض النووي البيئي لثعبان البحر الأوروبي (Anguilla anguilla) مع كميات الصيد بشباك الصيد في خمس بحيرات أيرلندية" . الحمض النووي البيئي . 2 (4): 587-600 . doi : 10.1002/edn3.91 . ISSN 2637-4943 . 
  76. ↑ "منصة TripleLock™ - الرصد البيولوجي الدقيق" . خدمات الحمض النووي البيئي . مؤرشف من الأصل في 13 فبراير 2019. تم الاطلاع عليه في 12 فبراير 2019 .
  77. ↑ هانتر، مارغريت إي.؛ دورازيو، روبرت إم.؛ باترفيلد، جون إس إس؛ ميغز-فريند، جايا؛ نيكو، ليو جي.؛ فيرانتي، جيسون إيه. (20 نوفمبر 2016). "حدود الكشف لاختبارات تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي والرقمي وتأثيرها في مسوحات وجود/غياب الحمض النووي البيئي" . موارد علم البيئة الجزيئية . 17 (2): 221-229 . doi : 10.1111/1755-0998.12619 . ISSN 1755-098X . PMID 27768244 .  
  78. ↑ ويليامز، مولي-آن؛ أوغرادي، جويس؛ بول، برنارد؛ كارلسون، ينس؛ إيتو، إلفيرا دي؛ ماكغينيتي، فيليب؛ جينينغز، إليانور؛ ريغان، فيونا؛ بارل-ماكديرموت، آن (2019). "تطبيق تقنية كريسبر-كاس لتحديد الأنواع المفردة من الحمض النووي البيئي" . موارد علم البيئة الجزيئية . 19 (5): 1106-1114 . Bibcode : 2019MolER..19.1106W . doi : 10.1111/1755-0998.13045 . hdl : 10468/8053 . ISSN 1755-0998 . PMID 31177615. S2CID 182949780 .   
  79. ↑ فرص في علوم المحيطات . واشنطن العاصمة: مطبعة الأكاديميات الوطنية. 1 يناير 1998. doi : 10.17226/9500 . ISBN 978-0-309-58292-6.
  80. ↑ كولين، بن؛ (عالمة حيوان)، مونيكا بوم؛ كيمب، راشيل؛ بيلي، جوناثان (2012). عديمات العمود الفقري: حالة واتجاهات اللافقاريات في العالم . ISBN 978-0-900881-70-1.
  81. ^ ديرزو، ر. يونغ، HS. جاليتي، م.؛ سيبالوس، ج.؛ إسحاق، نيوجيرسي؛ كولين، ب. (2014). “الانحطاط في الأنثروبوسين” (PDF) . علوم . 345 (6195): 401– 406. بيب كود : 2014Sci...345..401D . دوى : 10.1126/science.1251817 . بميد 25061202 . S2CID 206555761 .  
  82. ↑ القائمة الحمراء الأوروبية للنحل . مكتب المنشورات. 2014. ISBN 978-92-79-44512-5.
  83. ↑ سواي، كريس فان (2010). القائمة الحمراء الأوروبية للفراشات . الاتحاد الدولي لحفظ الطبيعة (IUCN). رقم ISBN 978-92-79-14151-5.
  84. ↑ ستورك، نايجل إي. (2018). "كم عدد أنواع الحشرات ومفصليات الأرجل الأرضية الأخرى الموجودة على الأرض؟" . المراجعة السنوية لعلم الحشرات . 63 : 31-45 . doi : 10.1146/annurev-ento-020117-043348 . PMID 28938083. S2CID 23755007 .  
  85. ^ هابل، جان كريستيان. دينجلر، يورغن. جانيسوفا، مونيكا؛ توروك، بيتر؛ ويلشتاين، كاميلا. ويزيك، ميشال (2013). "النظم الإيكولوجية للأراضي العشبية الأوروبية: النقاط الساخنة المهددة للتنوع البيولوجي" . التنوع البيولوجي والمحافظة عليه . 22 (10): 2131– 2138. بيب كود : 2013BiCon..22.2131H . دوى : 10.1007/s10531-013-0537-x . S2CID 15901140 . 
  86. ↑ يورن، أنتوني؛ لوز، أنجيلا ن. (2013). "الآليات البيئية الكامنة وراء تنوع أنواع المفصليات في المراعي". المراجعة السنوية لعلم الحشرات . 58 : 19-36 . doi : 10.1146/annurev-ento-120811-153540 . PMID 22830354 . 
  87. ↑ سيلفا، جواو بيدرو (2008). الحياة والمراعي الأوروبية: استعادة موطن منسي . مكتب المنشورات الرسمية للجماعات الأوروبية. ISBN 978-92-79-10159-5.
  88. ↑ بيسميير، جيه سي؛ روبرتس، إس بي؛ ريمر، إم؛ أوليمولر، آر؛ إدواردز، إم؛ بيترز، تي؛ شافرز، إيه بي؛ بوتس، إس جي؛ كلوكيرز، آر؛ توماس، سي دي؛ سيتيل، جيه؛ كونين، دبليو إي (2006). " انخفاضات متوازية في الملقحات والنباتات الملقحة بالحشرات في بريطانيا وهولندا" . مجلة ساينس . 313 (5785): 351-354 . Bibcode : 2006Sci...313..351B . doi : 10.1126/science.1127863 . PMID 16857940. S2CID 16273738 .  
  89. ↑ غولسون، د.؛ نيكولز، إ.؛ بوتياس، س.؛ روثيراي، إي. إل. (2015). "تراجع أعداد النحل نتيجةً للضغط المُجتمع الناتج عن الطفيليات والمبيدات الحشرية ونقص الأزهار" . مجلة ساينس . 347 (6229) 1255957. doi : 10.1126/science.1255957 . PMID 25721506. S2CID 206558985 .  
  90. ↑ بوتس، سيمون ج.؛ بيسميير، جاكوبوس س.؛ كريمن، كلير؛ نيومان، بيتر؛ شفايغر، أوليفر؛ كونين، ويليام إي. (2010). "تراجع أعداد الملقحات عالميًا: الاتجاهات والتأثيرات والعوامل المحركة". اتجاهات في علم البيئة والتطور . 25 (6): 345-353 . Bibcode : 2010TEcoE..25..345P . doi : 10.1016/j.tree.2010.01.007 . PMID 20188434 . 
  91. ↑ الوكالة الأوروبية للبيئة (2013). مؤشر فراشات المراعي الأوروبية: 1990-2011 . مكتب المنشورات. doi : 10.2800/89760 . ISBN 978-92-9213-402-0.
  92. ↑ أولرتون، جيف؛ وينفري، راشيل؛ تارانت، سام (2011). "كم عدد النباتات المزهرة التي تُلقَّح بواسطة الحيوانات؟". مجلة Oikos . 120 (3): 321-326 . Bibcode : 2011Oikos.120..321O . doi : 10.1111/j.1600-0706.2010.18644.x .
  93. ↑ برايس، بيتر دبليو؛ دينو، روبرت إف؛ يوبانكس، ميكي دي؛ فينكي، ديبورا إل؛ كابلان، إيان (2011). علم بيئة الحشرات . doi : 10.1017/CBO9780511975387 . ISBN 978-0-511-97538-7.
  94. ↑ هوبكنز، جي دبليو؛ فريكلتون، آر بي (2002). "انخفاض أعداد علماء التصنيف الهواة والمحترفين: الآثار المترتبة على الحفاظ على البيئة". الحفاظ على الحيوانات . 5 (3): 245-249 . Bibcode : 2002AnCon...5..245H . doi : 10.1017/S1367943002002299 . S2CID 86182871 . 
  95. ↑ سانغستر، جورج؛ لوكسنبورغ، يولاندا أ. (2015). "انخفاض معدلات وصف الأنواع لكل عالم تصنيف: تباطؤ في التقدم أم أثر جانبي لتحسين جودة التصنيف؟" . علم الأحياء المنهجي . 64 (1): 144-151 . doi : 10.1093/sysbio/syu069 . PMID 25190593 . 
  96. ↑ ويلر، كيو دي؛ رافين، بي إتش؛ ويلسون، إي أو (2004). "التصنيف: عائق أم وسيلة؟" . مجلة ساينس . 303 (5656): 285. doi : 10.1126/science.303.5656.285 . hdl : 1808/295 . PMID 14726557. S2CID 27481787 .  
  97. ^ بوش ، اليكس. سولمان، راحيل. الذبول، أندرياس. بوهمان، كريستين. كول، بيث؛ بالزتر، هيكو؛ مارتيوس، كريستوفر. زلينسكي، أندراس؛ كالفينياك سبنسر، سيباستيان؛ كوبولد، كريستينا أ؛ داوسون، تيرينس ب. إيمرسون، برنت سي؛ فيرير، سيمون. جيلبرت، م. توماس ب.؛ هيرولد، مارتن. جونز، لورانس. ليندرتز، فابيان H .؛ ماثيوز، لويز؛ ميلينجتون، جيمس دا؛ أولسون، جون ر. أوفاسكاينن، أوتسو؛ رافايلي، ديف؛ ريف، ريتشارد. رودل، مارك أوليفر. رودجرز، توري دبليو. سناب، ستيوارت؛ فيسيرين هاميكرز، إنغريد؛ فوجلر، ألفريد ب. الأبيض، بيران CL. وآخرون . (2017). "ربط رصد الأرض ببيانات التنوع البيولوجي عالية الإنتاجية" (ملف PDF) . مجلة Nature Ecology & Evolution . 1 (7): 176. Bibcode : 2017NatEE...1..176B . doi : 10.1038/s41559-017-0176 . PMID 28812589. S2CID 205564094 .   
  98. ↑ أريباس، باولا؛ أندوجار، كارميلو؛ هوبكنز، كيفن؛ شيبرد، ماثيو؛ فوغلر، ألفريد ب. (2016). "الترميز الجيني والتحليل الميتاجينومي للميتوكوندريا في مفصليات الأرجل الداخلية للكشف عن حيوانات التربة المتوسطة الحجم" . مناهج في علم البيئة والتطور . 7 (9): 1071-1081 . Bibcode : 2016MEcEv...7.1071A . doi : 10.1111/2041-210X.12557 . hdl : 10044/1/49935 . S2CID 51899316 . 
  99. ↑ إلبريشت، فاسكو؛ تابيرليه، بيير؛ ديجان، توني؛ فالنتيني، أليس؛ أوسيجليو-بولاتيرا، فيليب؛ بيزل، جان نيكولا؛ كويساك، إريك؛ بوييه، فريدريك؛ ليز، فلوريان (2016). "اختبار إمكانات مؤشر الريبوسوم 16S للترميز الجيني الفائق للحشرات" . PeerJ . 4 e1966 . Bibcode : 2016PeerJ...4e1966E . doi : 10.7717/peerj.1966 . PMC 4841222. PMID 27114891 .  
  100. ↑ حاجي بابائي، مهرداد؛ شكر الله، شادي؛ تشو، شين؛ سينغر، غريغوري أ.س؛ بيرد، دونالد ج. (2011). " الترميز البيئي: نهج تسلسل الجيل التالي لتطبيقات الرصد البيولوجي باستخدام قاع الأنهار" . PLOS ONE . 6 (4) e17497. Bibcode : 2011PLoSO...617497H . doi : 10.1371/journal.pone.0017497 . PMC 3076369. PMID 21533287 .  
  101. ↑ شو، تشارلز سي واي؛ ين، آيفي جيه؛ بومان، دين؛ تيرنر، كاميرون آر. (2015). " حمض نووي شبكة العنكبوت: منظور جديد لعلم الوراثة غير الغازي للمفترس والفريسة" . PLOS ONE . 10 (11) e0142503. Bibcode : 2015PLoSO..1042503X . doi : 10.1371/journal.pone.0142503 . PMC 4659541. PMID 26606730. S2CID 5331545 .   
  102. ↑ ديروكليس، ستيفان أ.ب.؛ إيفانز، دارين م.؛ نيكولز، بول س.؛ إيفانز، س. أيفيون؛ لونت، ديفيد هـ. (2015). " تحديد التفاعلات بين النباتات وحفار الأوراق والطفيليات: نهج الترميز الجيني" . PLOS ONE . 10 (2) e0117872. Bibcode : 2015PLoSO..1017872D . doi : 10.1371/journal.pone.0117872 . PMC 4339730. PMID 25710377 .  
  103. ↑ بليك، ماكس؛ ماكيون، نيال جيه؛ بوشيل، مارك إل تي؛ شو، بول دبليو (2016). "استخلاص الحمض النووي من خيوط العنكبوت" . موارد علم الوراثة الحفظية . 8 (3): 219-221 . Bibcode : 2016ConGR...8..219B . doi : 10.1007/s12686-016-0537-8 . hdl : 2160/43510 . S2CID 15122457 . 
  104. ↑ بيتليستون، ليونورا س.؛ بيكر، كريستوفر سي إم؛ سترومينجر، ليلا ب.؛ برينجل، آن؛ بيرس، نعومي إي. (2016). "الترميز الفائق كأداة لدراسة تنوع المفصليات في نباتات نيبينثيسبيتشير ". علم البيئة الأسترالي . 41 (2): 120-132 . Bibcode : 2016AusEc..41..120B . doi : 10.1111/aec.12271 .
  105. ↑ غامونال غوميز، نيريا؛ سورنسن، ديدي هيديغارد؛ تشوا، فيسيليا يينغ شي؛ سيغسغارد، لين (6 ديسمبر 2022). "تقييم تنوع المفصليات التي تزور الأزهار في بساتين التفاح من خلال الترميز الفائق للحمض النووي البيئي من الأزهار والمسح البصري" . الحمض النووي البيئي . doi : 10.1002/edn3.362 . ISSN 2637-4943 . S2CID 254391183 .  
  106. 1 2 تابيرليه، بيير؛ كويساك، إريك؛ حاجي بابائي، مهرداد؛ ريزبيرغ، لورين هـ. (2012). "الحمض النووي البيئي". علم البيئة الجزيئية . 21 (8): 1789-1793 . Bibcode : 2012MolEc..21.1789T . doi : 10.1111/j.1365-294X.2012.05542.x . PMID 22486819. S2CID 3961830 .  
  107. ^ تومسن، فيليب فرانسيس. كيلغاست، جوس؛ ايفرسن، لارس L.؛ ويف، كارستن؛ راسموسن، مورتن؛ جيلبرت، م. توماس ب.؛ أورلاندو، لودوفيتش؛ ويلرسليف، إسكي (2012). “مراقبة التنوع البيولوجي للمياه العذبة المهددة بالانقراض باستخدام الحمض النووي البيئي”. البيئة الجزيئية . 21 (11): 2565–2573 . بيب كود : 2012MolEc..21.2565T . دوى : 10.1111/j.1365-294X.2011.05418.x . بميد 22151771 . 
  108. ^ زنجر ، لوسي. تابيرليت، بيير؛ شيمان، هايدي. بونين، أوريلي؛ بوير، فريدريك. دي باربا، مارتا؛ غوشيه، فيليب؛ جيلي، لودوفيتش؛ جيجيت كوفيكس، شارلين؛ إريبار، أمايا؛ ريجو ميشين، ماكسيم؛ راي، جيل. ريو، دلفين. شيلينغ، فنسنت؛ تيمين، بليز. فيرز، جيروم؛ زويتن، كيرلس؛ ثويلر، ويلفريد. كويساك، اريك. تشاف ، جيروم (2019). "حجم الجسم يحدد تجمع مجتمع التربة في الغابة الاستوائية" . البيئة الجزيئية . 28 (3): 528– 543. بيب كود : 2019MolEc..28..528Z . doi : 10.1111/ mec.14919 . PMID 30375061. S2CID 53114166 .  
  109. ↑ خورادو-ريفيرا، خوسيه أ.؛ فوغلر، ألفريد ب.؛ ريد، كريس أ.م.؛ بيتي بيير، إدوارد؛ غوميز-زوريتا، خيسوس (2009). "الترميز الجيني لارتباطات الحشرات بالنباتات المضيفة" . وقائع الجمعية الملكية ب: العلوم البيولوجية . 276 (1657): 639-648 . doi : 10.1098 / rspb.2008.1264 . PMC 2660938. PMID 19004756 .  
  110. ↑ باولا، ديبورا ب.؛ لينارد، بنجامين؛ كرامبتون-بلات، أليكس؛ سريفاتسان، أمريتا؛ تيمرمانز، مارتين جيه تي إن؛ سوجي، إديسون ر.؛ بيريس، كارمن إس إس؛ سوزا، لوكاس م.؛ أندو، ديفيد أ.؛ فوغلر، ألفريد ب. (2016). " الكشف عن التفاعلات الغذائية في مفترسات المفصليات من خلال تسلسل الحمض النووي لمحتويات الأمعاء" . PLOS ONE . 11 (9) e0161841. Bibcode : 2016PLoSO..1161841P . doi : 10.1371/journal.pone.0161841 . PMC 5021305. PMID 27622637 .  
  111. ↑ بومان، كريستين؛ مونادجيم، آرا؛ ليمكول نوير، كريستينا؛ راسموسن، مورتن؛ زيل، مات آر كيه؛ كلير، إليزابيث؛ جونز، غاريث؛ ويلرسليف، إيسكي؛ جيلبرت، إم. توماس ب. (2011). "التحليل الجزيئي للنظام الغذائي لنوعين من الخفافيش الأفريقية حرة الذيل (Molossidae) باستخدام التسلسل عالي الإنتاجية" . PLOS ONE . 6 (6) e21441. Bibcode : 2011PLoSO...621441B . doi : 10.1371/journal.pone.0021441 . PMC 3120876. PMID 21731749 .  
  112. ↑ فيسترينين، إيرو جيه؛ ليلي، توماس؛ لاين، فيرونيكا ن؛ والبيرغ، نيكلاس (2013). "التسلسل الجيني للجيل التالي للحمض النووي البرازي يكشف عن التنوع الغذائي للخفاش دوبنتون (Myotis daubentonii)، وهو مفترس حشري واسع الانتشار، في جنوب غرب فنلندا" . PLOS ONE . 8 (11) e82168. Bibcode : 2013PLoSO...882168V . doi : 10.1371/journal.pone.0082168 . PMC 3842304. PMID 24312405 .  
  113. ↑ بيل، كارين ل.؛ فاولر، جولي؛ بورغيس، كيفن س.؛ دوبس، إميلي ك.؛ غرونوالد، ديفيد؛ لولي، برايس؛ موروزومي، كونور؛ بروسي، بيري ج. (2017). "تطبيق الترميز الفائق للحمض النووي لحبوب اللقاح لدراسة تفاعلات النباتات والملقحات" . تطبيقات في علوم النبات . 5 (6) 1600124. Bibcode : 2017AppPS...500124B . doi : 10.3732 / apps.1600124 . PMC 5499302. PMID 28690929. S2CID 6590244 .   
  114. ^ بورونون، أندريه؛ إسكارافاج، ناتالي؛ بوروس، مونيك. هولوتا، هيلين؛ خيمون، أوريلي؛ مارييت، جيروم. بيليزاري، شارلين؛ إريبار، أمايا؛ إتيان، روزلين؛ تابيرليت، بيير؛ فيدال، ماري. وينترتون، بيتر. زنجر، لوسي؛ أندالو، كريستوف (2016). "استخدام metabarcoding للكشف عن التفاعلات بين الملقحات النباتية وقياسها" . التقارير العلمية . 6 27282. بيب كود : 2016NatSR...627282P . دوى : 10.1038/srep27282 . بمك 4891682 . بميد 27255732 .  
  115. ↑ تابيرليه، بيير (2018). الحمض النووي البيئي: لأبحاث التنوع البيولوجي ورصده . أكسفورد. ISBN 978-0-19-876722-0.{{cite book}}: CS1 maint: موقع الناشر مفقود ( رابط )
  116. ↑ "أرنو لييه من الصندوق العالمي للطبيعة يتحدث عن قياس أعداد الحيوانات البرية" . الصندوق العالمي للطبيعة . تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 نوفمبر 2018 .
  117. ↑ "الحمض النووي البيئي - لم يعد مقتصراً على علماء الأحياء السمكية فقط" . wildlife.org . 8 ديسمبر 2017. تم الاطلاع عليه بتاريخ 26 نوفمبر 2018 .
  118. ↑ روث، آني (19 نوفمبر 2018). "كيف يساعد الحمض النووي من الثلج العلماء على تتبع الحيوانات المراوغة" . ناشيونال جيوغرافيك . مؤرشف من الأصل في 19 نوفمبر 2018. تم الاطلاع عليه في 26 نوفمبر 2018 .
  119. ↑ فرانكلين، توماس و.؛ ماكيلفي، كيفن س.؛ غولدينغ، جيسي د.؛ ماسون، دانيال هـ.؛ ديست، جوزيف س.؛ بيلغريم، كريستين ل.؛ سكوايرز، جون ر.؛ أوبراي، كيث ب.؛ لونغ، روبرت أ.؛ غريفز، صموئيل إ.؛ رالي، كاثرين م.؛ جاكسون، سكوت. ماكاي، بولا. لشبونة، جوشوا. ساودر، جويل د.؛ بروس، مايكل ت.؛ هيفينغتون، دون. شوارتز، مايكل ك. (2019). "استخدام أساليب الحمض النووي البيئي لتحسين المسوحات الشتوية للحيوانات اللاحمة النادرة: الحمض النووي من الثلج وتقنيات غير جراحية محسنة" . الحفاظ البيولوجي . 229 : 50-58 . Bibcode : 2019BCons.229...50F . doi : 10.1016/j.biocon.2018.11.006 . S2CID 91312879 . تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  120. ^ لينجارد ، كريستينا. بيرتلسن، مادس فروست؛ جنسن، كاسبر V.؛ جونسون، ماثيو س. فروسليف، توبياس غولدبرغ؛ أولسن، مورتن تانج؛ بوهمان ، كريستين (6 يناير 2022). "الحمض النووي البيئي المحمول جواً لرصد مجتمع الفقاريات الأرضية" . علم الأحياء الحالي . 32 (3): 701-707.e5. بيب كود : 2022CBio...32E.701L . دوى : 10.1016/j.cub.2021.12.014 . بمك 8837273 . بميد 34995490 . S2CID 245772800 .   
  121. ↑ كلير، إليزابيث ل.؛ إيكونومو، كلوي ك.؛ بينيت، فرانسيس ج.؛ داير، كايتلين إي.؛ آدامز، كاثرين؛ ماكروبي، بنجامين؛ درينكووتر، روزي؛ ليتلفير، جوان إي. (يناير 2022). "قياس التنوع البيولوجي من الحمض النووي في الهواء" . علم الأحياء الحالي . 32 (3): 693-700.e5. Bibcode : 2022CBio...32E.693C . doi : 10.1016/j.cub.2021.11.064 . PMID 34995488. S2CID 245772825 .  
  122. ↑ كلير، إليزابيث ل.؛ إيكونومو، كلوي ك.؛ فولكس، كريس ج.؛ جيلبرت، جيمس د.؛ بينيت، فرانسيس؛ درينكووتر، روزي؛ ليتلفير، جوان إي. (2021). "EDNAir: إثبات مفهوم إمكانية جمع الحمض النووي للحيوانات من عينات الهواء" . PeerJ . 9 e11030 . doi : 10.7717/peerj.11030 . PMC 8019316. PMID 33850648 .  تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  123. ↑ أصبح بإمكان الباحثين الآن جمع وتسلسل الحمض النووي من الهواء (لايف ساينس ، 6 أبريل 2021).
  124. ↑ ميتريس، كيمبرلي ل.؛ ميتريس، جيريمي (14 أبريل 2023). "مسوح الطائرات للحمض النووي البيئي الجوي: استكشاف التنوع البيولوجي في السماء" . PeerJ . 11 e15171. doi : 10.7717/peerj.15171 . ISSN 2167-8359 . PMC 10108859. PMID 37077310 .   
  125. 1 2 سميث، بافي؛ رانايفواريسوا، ج. فريدي؛ رهاريسون، جان لوك؛ أندرياماهيفا، توجو خوليو؛ فاكوفا، بافلينا؛ سافانتوجلو، أنجيليكي؛ ويلدون، لورا؛ ستير ، مارك د. (1 مايو 2026). "دراسة مقارنة بين iDNA وairDNA لتقييمات التنوع البيولوجي في أجزاء الغابات الاستوائية" . الحمض النووي البيئي . 8(3) هـ70285. دوى : 10.1002/edn3.70285 . ردمك 2637-4943 . 
  126. ↑ كينيث ت. فرانك؛ برايان بيتري؛ جاي س. تشوي؛ ويليام س. ليجيت (2005). "التفاعلات الغذائية المتسلسلة في نظام بيئي كان يهيمن عليه سمك القد سابقًا". مجلة ساينس . 308 (5728): 1621-1623 . Bibcode : 2005Sci...308.1621F . doi : 10.1126/science.1113075 . PMID 15947186. S2CID 45088691 .  
  127. ↑ والترز، كارل؛ ماغواير، جان جاك (1996). "دروس لتقييم المخزون السمكي من انهيار سمك القد الشمالي". مراجعات في بيولوجيا الأسماك ومصايد الأسماك . 6 (2): 125. Bibcode : 1996RFBF....6..125W . doi : 10.1007/BF00182340 . S2CID 20224324 . 
  128. ↑ المجلس الدولي لاستكشاف البحار (2018). "طلب من المجلس الوطني لبحوث مصايد الأسماك البحرية بشأن نصائح محدثة لسمك القد (Gadus morhua) في القسم الفرعي 5.ب.1 (هضبة فارو)" (ملف PDF) . doi : 10.17895/ices.pub.4651 .{{cite journal}}يتطلب الاستشهاد بالمجلة ( مساعدة )|journal=
  129. ↑ هيسن، هينك جيه إل؛ دان، نيلز؛ إليس، جيم آر. (سبتمبر 2015). أطلس أسماك البحر السلتي وبحر الشمال وبحر البلطيق: استنادًا إلى مسوحات سفن الأبحاث الدولية . بريل. ISBN 978-90-8686-878-0.
  130. ↑ بوسيدو، أ.؛ بيانشيلي، س.؛ مارتن، ج.؛ بويغ، ب.؛ بالانكيس، أ.؛ ماسك، ب.؛ دانوفارو، ر. (2014). "الصيد بشباك الجر القاعية المزمن والمكثف يُضعف التنوع البيولوجي في أعماق البحار ووظائف النظام البيئي" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 111 (24): 8861-8866 . Bibcode : 2014PNAS..111.8861P . doi : 10.1073/pnas.1405454111 . PMC 4066481. PMID 24843122 .  
  131. ↑ أريغوين-سانشيز، فرانسيسكو (1996). "قابلية الصيد: معيار أساسي لتقييم مخزون الأسماك". مراجعات في بيولوجيا الأسماك ومصايد الأسماك . 6 (2): 221. Bibcode : 1996RFBF....6..221A . doi : 10.1007/BF00182344 . S2CID 9589700 . 
  132. 1 2 3 4 سالتر، إيان؛ جونسن، موريس؛ كريستيانسن، ريجين؛ ستينغروند، بيتور؛ فيسترغارد، بول (2019). "ترتبط تركيزات الحمض النووي البيئي بالكتلة الحيوية الإقليمية لسمك القد الأطلسي في مياه المحيطات" . بيولوجيا الاتصالات . 2 (1) 461. بيب كود : 2019CmBio...2..461S . دوى : 10.1038/s42003-019-0696-8 . بمك 6904555 . بميد 31840106 .  تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  133. ↑ غولدبيرغ، كارين س.؛ بيليود، ديفيد س.؛ أركلي، روبرت س.؛ وايتس، ليسيت ب. (2011). "الكشف الجزيئي عن الفقاريات في مياه الجداول: عرض توضيحي باستخدام ضفادع جبال روكي ذات الذيل وسمندل أيداهو العملاق" . PLOS ONE . 6 (7) e22746. Bibcode : 2011PLoSO...622746G . doi : 10.1371/journal.pone.0022746 . PMC 3144250. PMID 21818382 .  
  134. ^ فالنتيني، أليس. تابيرليت، بيير؛ ميود، كلود؛ سيفادي، رافاييل؛ هيردر، جيلجر؛ تومسن، فيليب فرانسيس؛ بيليمين، إيفا؛ بيسنارد، أوريليان. كويساك، اريك. بوير، فريدريك. غابوريود، كولين؛ جان، بولين؛ بوليت، نيكولاس؛ روزيت، نيكولاس؛ كوب، جوردون H.؛ جينيز، فيليب؛ بونت، ديدييه؛ ارجيلير، كريستين؛ بودوان، جان مارك؛ بيروكس، تيفين. كريفيلي، آلان J .؛ أوليفييه، أنتوني؛ أكويبيرج، مانون؛ لو برون، ماتيو؛ مولر، بيتر ر. ويلرسليف، إسكي؛ ديجين ، توني (2016). “رصد الجيل التالي للتنوع البيولوجي المائي باستخدام ترميز الحمض النووي البيئي” (PDF) . البيئة الجزيئية . 25 (4): 929– 942. Bibcode : 2016MolEc..25..929V . doi : 10.1111/mec.13428 . PMID : 26479867. S2CID : 2801412. مؤرشف من الأصل (PDF) بتاريخ 27 أبريل 2019. تم الاطلاع عليه بتاريخ 1 فبراير 2021 .  
  135. ↑ غودوين، كيلي د.؛ طومسون، لوك ر.؛ دوارتي، برناردو؛ كالكي، تيم؛ طومسون، أندرو ر.؛ ماركيز، جواو س.؛ كاسادور، إيزابيل (2017). "تسلسل الحمض النووي كأداة لرصد الحالة البيئية البحرية" . مجلة فرونتيرز إن مارين ساينس . 4 107. Bibcode : 2017FrMaS...4..107G . doi : 10.3389/fmars.2017.00107 . hdl : 10453/125704 . S2CID 27034312 . 
  136. ↑ ستوكل، مارك ي.؛ سوبوليفا، ليوبوف؛ شارلوب-باورز، زاكاري (2017). "الحمض النووي البيئي المائي يكشف عن وفرة الأسماك الموسمية وتفضيل الموائل في مصب نهري حضري" . PLOS ONE . 12 (4) e0175186. Bibcode : 2017PLoSO..1275186S . doi : 10.1371/journal.pone.0175186 . PMC 5389620. PMID 28403183 .  
  137. ^ تومسن، فيليب فرانسيس. كيلغاست، جوس. ايفرسن، لارس لونسمان؛ مولر، بيتر راسك. راسموسن، مورتن؛ ويلرسليف، إسكي (2012). "الكشف عن حيوانات الأسماك البحرية المتنوعة باستخدام الحمض النووي البيئي من عينات مياه البحر" . بلوس واحد . 7 (8) هـ41732. بيب كود : 2012PLoSO...741732T . دوى : 10.1371/journal.pone.0041732 . بمك 3430657 . بميد 22952584 .  
  138. 1 2 تومسن، فيليب فرانسيس؛ مولر، بيتر راسك. سيجسجارد، إيفا إجيلينج؛ كنودسن، ستين فيلهلم؛ يورجنسن، أولي أنكيار؛ ويلرسليف، إسكي (2016). "الحمض النووي البيئي من عينات مياه البحر يرتبط بمصيد أسماك المياه العميقة وشبه القطبية" . بلوس واحد . 11 (11) هـ0165252. بيب كود : 2016PLoSO..1165252T . دوى : 10.1371/journal.pone.0165252 . بمك 5112899 . بميد 27851757 .  
  139. 1 2 سيجسجارد، إيفا إجيلينج؛ نيلسن، إيدا برومان؛ كارل، هنريك. كراج، ماركوس أندرس. كنودسن، ستين فيلهلم؛ شينغ، يينغشون. هولم هانسن، توري هيجل؛ مولر، بيتر راسك. تومسن، فيليب فرانسيس (2017). “الحمض النووي البيئي لمياه البحر يعكس موسمية مجتمع الأسماك الساحلية”. علم الأحياء البحرية . 164 (6): 128. بيب كود : 2017MarBi.164..128S . دوى : 10.1007/s00227-017-3147-4 . S2CID 89773962 . 
  140. ^ تاكاهارا، تيروهيكو؛ ميناموتو، توشيفومي؛ ياماناكا، هيروكي؛ دوي، هيديوكي؛ كواباتا ، زينيتشيرو (2012). "تقدير الكتلة الحيوية للأسماك باستخدام الحمض النووي البيئي" . بلوس واحد . 7 (4) هـ35868. بيب كود : 2012PLoSO...735868T . دوى : 10.1371/journal.pone.0035868 . بمك 3338542 . بميد 22563411 .  
  141. ↑ دوي، هيديوكي؛ أوتشي، كيميكو؛ تاكاهارا، تيروهيكو؛ ماتسوهاشي، سايكو؛ ياماناكا، هيروكي؛ ميناموتو، توشيفومي (2015). "استخدام تفاعل البوليميراز الرقمي القطري لتقدير وفرة الأسماك وكتلتها الحيوية في مسوحات الحمض النووي البيئي" . PLOS ONE . 10 (3) e0122763. Bibcode : 2015PLoSO..1022763D . doi : 10.1371/journal.pone.0122763 . PMC 4370432. PMID 25799582 .  
  142. ↑ لاكورسير-روسيل، أناييس؛ روزابال، مايكل؛ بيرناتشيز، لويس (2016). "تقدير وفرة الأسماك وكتلتها الحيوية من تركيزات الحمض النووي البيئي: التباين بين طرق الصيد والظروف البيئية". موارد علم البيئة الجزيئية . 16 (6): 1401-1414 . Bibcode : 2016MolER..16.1401L . doi : 10.1111 / 1755-0998.12522 . PMID 26946353. S2CID 4507565 .  
  143. ↑ ماروياما، أتسوكي؛ ناكامورا، كيسوكي؛ ياماناكا، هيروكي؛ كوندوه، ميتشيو؛ ميناموتو، توشيفومي (2014). " معدل إطلاق الحمض النووي البيئي من الأسماك اليافعة والبالغة" . PLOS ONE . 9 (12) e114639. Bibcode : 2014PLoSO...9k4639M . doi : 10.1371/journal.pone.0114639 . PMC 4257714. PMID 25479160 .  
  144. ↑ كليموس، كاتي إي؛ ريختر، كاثرين أ؛ تشابمان، دوان سي؛ بوكرت، كريغ (2015). "قياس معدلات إفراز الحمض النووي البيئي من سمك الكارب كبير الرأس الغازي (Hypophthalmichthys nobilis) وسمك الكارب الفضي (Hypophthalmichthys molitrix)". الحفاظ البيولوجي . 183 : 77-84 . Bibcode : 2015BCons.183...77K . doi : 10.1016/j.biocon.2014.11.020 .
  145. ↑ لي، جيانلونغ؛ لوسون هاندلي، لوري جيه؛ هاربر، لينسي آر؛ برايس، رين؛ واتسون، هايلي في؛ دي موري، كريستينا؛ تشانغ، شيانغ؛ هانفلينغ، بيرند (2019). "التشتت المحدود والتحلل السريع للحمض النووي البيئي في أحواض الأسماك كما استُنتج من خلال الترميز الفائق" . الحمض النووي البيئي . 1 (3): 238-250 . Bibcode : 2019EnDNA...1..238L . doi : 10.1002/edn3.24 . S2CID 198403033 . 
  146. ↑ سالتر، إيان (2018). "التغير الموسمي في استمرار الحمض النووي البيئي المذاب (EDNA) في نظام بحري: دور محدودية المغذيات الميكروبية" . PLOS ONE . 13 (2) e0192409. Bibcode : 2018PLoSO..1392409S . doi : 10.1371/journal.pone.0192409 . PMC 5825020. PMID 29474423 .  
  147. ↑ بوكستون، أندرو س.؛ غرومبريدج، جيم ج.؛ غريفيث، ريتشارد أ. (2018). "التغير الموسمي في الكشف عن الحمض النووي البيئي في عينات الرواسب والمياه" . PLOS ONE . 13 (1) e0191737. Bibcode : 2018PLoSO..1391737B . doi : 10.1371/journal.pone.0191737 . PMC 5774844. PMID 29352294 .  
  148. ↑ كولينز، روبرت أ.؛ وانغينستين، أوين س.؛ أوغورمان، إوين ج.؛ مارياني، ستيفانو؛ سيمز، ديفيد و.؛ جينر، مارتن ج. (2018). "استمرار الحمض النووي البيئي في النظم البحرية" . مجلة اتصالات البيولوجيا . 1 185. doi : 10.1038/s42003-018-0192-6 . PMC 6218555. PMID 30417122 .  
  149. 1 2 أندروسزكيويتش، إليزابيث أ.؛ كوسيف، جيفري ر.؛ فرينجر، أوليفر ب.؛ أويليت، نيكولاس ت.؛ لوي، آنا ب.؛ إدواردز، كريستوفر أ.؛ بوهم، ألكسندريا ب. (2019). "نمذجة نقل الحمض النووي البيئي في المحيط الساحلي باستخدام تتبع الجسيمات لاغرانجي" . مجلة فرونتيرز إن مارين ساينس . 6 477. Bibcode : 2019FrMaS...6..477A . ​​doi : 10.3389/fmars.2019.00477 . S2CID 199447701 . 
  150. ↑ إيشميلر، جيسيكا جيه؛ باجر، برزيميسلاف جي؛ سورنسن، بيتر دبليو (2014). "العلاقة بين توزيع الكارب الشائع وحمضه النووي البيئي في بحيرة صغيرة" . PLOS ONE . 9 (11) e112611. Bibcode : 2014PLoSO...9k2611E . doi : 10.1371/journal.pone.0112611 . PMC 4226586. PMID 25383965 .  
  151. ↑ غارغان، لورا م.؛ موراتو، تيلمو؛ فام، كريستوفر ك.؛ فيناريلي، جون أ.؛ كارلسون، جانيت إي إل؛ كارلسون، ينس (2017). "تطوير طريقة كشف حساسة لمسح التنوع البيولوجي في أعالي البحار باستخدام الحمض النووي البيئي والتفاعل التسلسلي الكمي للبوليميراز: دراسة حالة لسمكة شيطان البحر في الجبال البحرية" . علم الأحياء البحرية . 164 (5): 112. Bibcode : 2017MarBi.164..112G . doi : 10.1007/s00227-017-3141-x . S2CID 91149351 . 
  152. ^ ياماموتو، ساتوشي. مينامي، كينجي؛ فوكايا، كييتشي؛ تاكاهاشي، كوهجي؛ سوادا، هيديكي؛ موراكامي، هيرواكي؛ تسوجي، ساتسوكي؛ هاشيزومي، هيروكي؛ كوبوناجا، شو؛ هوريوتشي، تومويا؛ هونغو، ماساميتشي؛ نيشيدا، جو؛ أوكوغاوا، يوتا؛ فوجيوارا، أياكا؛ فوكودا، ميهو؛ هيداكا، شونسوكي؛ سوزوكي، كيتا دبليو؛ ميا، ماساكي؛ أراكي، هيتوشي؛ ياماناكا، هيروكي؛ ماروياما، أتسوشي؛ مياشيتا، كازوشي؛ مسعودة، ريجي؛ ميناموتو، توشيفومي؛ كوندو ، ميشيو (2016). "الحمض النووي البيئي باعتباره" لقطة سريعة "لتوزيع الأسماك: دراسة حالة للماكريل الياباني جاك في خليج مايزورو ببحر اليابان" . بلوس واحد . 11 (3 ) e0149786. Bibcode : 2016PLoSO..1149786Y . doi : 10.1371/ journal.pone.0149786 . PMC 4775019. PMID 26933889. S2CID 5168061 .   
  153. 1 2 كنودسن، ستين فيلهلم؛ إيبرت، راسموس باخ؛ هيسيلسو، مارتن؛ كونتكي، فرانزيسكا؛ هاسينجبو، جاكوب؛ مورتنسن، بيتر بوندجارد؛ تومسن، فيليب فرانسيس؛ سيجسجارد، إيفا إجيلينج؛ هانسن، بريان كليتغارد؛ نيلسن، اينار على سبيل المثال؛ مولر، بيتر راسك (2019). “الكشف والقياس الكمي للحمض النووي البيئي من الأسماك البحرية في بحر البلطيق”. مجلة البيولوجيا البحرية التجريبية وعلم البيئة . 510 : 31– 45. بيب كود : 2019JEMBE.510...31K . دوى : 10.1016/j.jembe.2018.09.004 . S2CID 92601423 . 
  154. ^ بهينداركار، موكيش. القنوات، أوريول. جورادو، كارلوس؛ منديبيل، إيناكي؛ أوريارتي، أينهيز؛ بورخا، ملاك؛ رودريغيز-إيزبيليتا، نايارا (2025). “تعزيز التقييم البيئي: نحو دمج ترميز eDNA في مؤشر أسماك مصبات الأنهار”. المؤشرات البيئية . 181 114464. بيب كود : 2025EcInd.18114464B . دوى : 10.1016/j.ecolind.2025.114464 . ISSN 1470-160X . 
  155. ١ ٢ ٣ ٤ ٥ ٦ كورينالديسي، سي.؛ تانغيرليني، إم.؛ مانيا، إي.؛ ديل أنو، إيه. (٢٠١٨). "الحمض النووي خارج الخلوي كمسجل جيني للتنوع الميكروبي في النظم البيئية القاعية في أعماق البحار" . التقارير العلمية . ٨ (١): ١٨٣٩. Bibcode : 2018NatSR...8.1839C . doi : 10.1038/ s41598-018-20302-7 . PMC 5789842. PMID 29382896 .  تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  156. 1 2 ديل أنو، أ.؛ دانوفارو، ر . (2005). "يلعب الحمض النووي خارج الخلية دورًا رئيسيًا في وظائف النظام البيئي في أعماق البحار". مجلة ساينس . 309 (5744): 2179. doi : 10.1126/science.1117475 . PMID 16195451. S2CID 39216262 .  
  157. ↑ كورينالديسي، سينزيا؛ ديل أنو، أنطونيو؛ دانوفارو، روبرتو (2007). "العدوى الفيروسية تلعب دورًا رئيسيًا في ديناميكيات الحمض النووي خارج الخلية في الأنظمة البحرية اللاهوائية" . علم البحيرات والمحيطات . 52 (2): 508-516 . Bibcode : 2007LimOc..52..508C . doi : 10.4319/lo.2007.52.2.0508 . S2CID 85601366 . 
  158. ↑ ديل أنو، أنطونيو؛ كورينالديسي، سينزيا؛ دانوفارو، روبرتو (2015). "يُسهم تحلل الفيروسات إسهامًا هامًا في وظائف النظام البيئي القاعي في أعماق البحار" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 112 (16): E2014– E2019 . Bibcode : 2015PNAS..112E2014D . doi : 10.1073/pnas.1422234112 . PMC 4413343. PMID 25848024 .  
  159. ↑ نيلسن، كاري م.؛ جونسن، بال ج.؛ بنساسون، دودا؛ دافونشيو، دانييلي (2007). "إطلاق الحمض النووي خارج الخلية واستمراريته في البيئة" . بحوث السلامة البيولوجية البيئية . 6 ( 1-2 ): 37-53 . doi : 10.1051/ebr:2007031 . PMID 17961479 . 
  160. ↑ كولين، ماركو جيه إل؛ أوفرمان، يورغ (1998). "تحليل البقايا الجزيئية شبه الأحفورية لبكتيريا الكبريت الأرجوانية في رواسب بحيرة" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 64 (11): 4513-4521 . Bibcode : 1998ApEnM..64.4513C . doi : 10.1128/AEM.64.11.4513-4521.1998 . PMC 106678. PMID 9797316 .  
  161. ↑ كولين، م.؛ مويزر، جيرارد؛ ريبسترا، و. إيرين س.؛ شوتين، ستيفان؛ فولكمان، جون ك.؛ سينينغه دامستيه، ياب س. (2004). "تحليلات الحمض النووي والدهون المدمجة للرواسب تكشف عن تغيرات في تجمعات الهابتوفايت والدياتومات في العصر الهولوسيني في بحيرة قطبية جنوبية". رسائل علوم الأرض والكواكب . 223 ( 1-2 ): 225-239 . Bibcode : 2004E & PSL.223..225C . doi : 10.1016/j.epsl.2004.04.014 .
  162. 1 2 كولين، إم جيه إل؛ أورسي، دبليو دي؛ بالكيما، سي؛ كوينس، سي؛ هاريس، كيه؛ سيلفا، إس بي؛ فيليبوفا-مارينوفا، إم؛ جيوسان، إل. (2013). "تطور باليوم العوالق في البحر الأسود من العصر الجليدي إلى الأنثروبوسين" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 110 (21): 8609-8614 . Bibcode : 2013PNAS..110.8609C . doi : 10.1073/pnas.1219283110 . PMC 3666672. PMID 23650351 .  
  163. 1 2 كورينالديسي، سي.؛ تانغيرليني، إم.؛ لونا، جي إم؛ ديل أنو، إيه. (2014). "يمكن للحمض النووي خارج الخلية أن يحافظ على البصمات الوراثية لأحداث العدوى الفيروسية الحالية والسابقة في الأحواض العميقة شديدة الملوحة والخالية من الأكسجين" . وقائع الجمعية الملكية ب: العلوم البيولوجية . 281 (1780). Bibcode : 2014PBioS.28133299C . doi : 10.1098/ rspb.2013.3299 . PMC 4027399. PMID 24523277. S2CID 1214760 .   
  164. 1 2 بوير، أرجان سي؛ ريبسترا، دبليو. إيرين سي؛ دي لانج، جيرت جيه؛ مالينفيرنو، إليسا؛ سينينغ دامستي، ياب إس؛ كولين، ماركو جيه إل (2011). "استكشاف بصمات الحمض النووي المحفوظة للدينوفلاجيلات والهابتوفيتات الأحفورية لاستنتاج التغيرات البيئية والإيكولوجية أثناء ترسب السابروبيل S1 في شرق البحر الأبيض المتوسط" (ملف PDF) . علم المحيطات القديمة . 26 (2) 2010PA001948: غير متوفر. رمز Bibcode : 2011PalOc..26.2204B . doi : 10.1029/2010PA001948 . S2CID 53599204 . 
  165. ↑ كولين، إم جيه إل؛ سيبيونكا، إتش؛ ساس، إيه إم؛ ساس، إتش؛ أوفرمان، جيه. (2002). "التعديل المستمر لرواسب السابروبيل البليستوسينية في البحر الأبيض المتوسط ​​بوساطة بدائيات النوى". مجلة ساينس . 296 (5577): 2407-2410 . رمز Bibcode : 2002Sci...296.2407C . doi : 10.1126/science.1071893 . PMID 12089447. S2CID 33722848 .  
  166. ↑ كولين، ماركو جيه إل؛ أوفرمان، يورغ (2007). "تسلسلات الحمض النووي لبكتيريا الكبريت الخضراء في رواسب السابروبيل المتوسطية، والتي يعود تاريخها إلى 217000 عام، وآثارها على إعادة بناء البيئة القديمة". علم الأحياء الدقيقة البيئية . 9 (1): 238-249 . Bibcode : 2007EnvMi...9..238C . doi : 10.1111/j.1462-2920.2006.01134.x . hdl : 1912/1506 . PMID 17227428 . 
  167. ↑ كولين، ماركو جيه إل؛ فولكمان، جون كيه؛ عباس، بن؛ مويزر، جيرارد؛ شوتين، ستيفان؛ سينينغه دامستيه، ياب إس. (2007). "تحديد مصادر المادة العضوية في رواسب المضايق البحرية الكبريتية في أواخر العصر الهولوسيني في القطب الجنوبي من خلال تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوزي الأحفوري" . علم المحيطات القديمة . 22 (2): PA2211. Bibcode : 2007PalOc..22.2211C . doi : 10.1029/2006PA001309 . hdl : 1912/3447 .
  168. ↑ كولين، ماركو جيه إل؛ ساينز، جيمس بي؛ جيوسان، ليفيو؛ تروبريدج، نان واي؛ ديميتروف، بيتكو؛ ديميتروف، ديميتار؛ إيجلينتون، تيموثي آي. (2009). "السجلات الطبقية الجزيئية للحمض النووي والدهون لتتابع الهابتوفايت في البحر الأسود خلال الهولوسين". رسائل علوم الأرض والكواكب . 284 ( 3-4 ): 610-621 . Bibcode : 2009E & PSL.284..610C . doi : 10.1016/j.epsl.2009.05.029 .
  169. ↑ ديل أنو، أنطونيو؛ كورينالديسي، سينزيا؛ ستافراكاكيس، سبيروس؛ ليكوسيس، فاسيليس؛ دانوفارو، روبرتو (2005). "الترابط بين الطبقات السطحية والقاعية وتكوين الأحماض النووية في هامش قاري في أعماق البحار ونظام منحدر مفتوح في شرق البحر الأبيض المتوسط" . علم الأحياء الدقيقة التطبيقي والبيئي . 71 (10): 6070-6076 . Bibcode : 2005ApEnM..71.6070D . doi : 10.1128/AEM.71.10.6070-6076.2005 . PMC 1265925. PMID 16204523 .  
  170. ^ ليفين ، ليزا أ. ليو، كون كي؛ إيميس، كاي كريستيان؛ بريتبورج، دينيس L.؛ كلويرن، جيمس؛ الألمانية، كيرتس. جياني ميشيل. جوفارت، آن. هوفمان، إيلين E.؛ الأشقر، زهير؛ ليمبورغ، كارين؛ ليو، سو مي؛ مونتيس، إنريكي؛ نقفي، وجيه؛ راجينو، أوليفييه؛ رابوي، كريستوف؛ ساركار، سانتوش كومار؛ سواني، دينيس P .؛ واسمان، بول؛ ويشنر، كارين ف. (2015). “الكيمياء الحيوية المقارنة – النظام البيئي – التفاعلات البشرية على الهوامش القارية الديناميكية” . مجلة النظم البحرية . 141 : 3– 17. بيب كود : 2015JMS...141....3L . doi : 10.1016/j.jmarsys.2014.04.016 . S2CID 7139186 . 
  171. ↑ يورغنسن، بو باركر؛ بوتيوس، أنتي (2007). "الوفرة والندرة - الحياة الميكروبية في قاع البحر العميق". مجلة نيتشر ريفيوز مايكروبيولوجي . 5 (10): 770-781 . doi : 10.1038/nrmicro1745 . PMID 17828281. S2CID 22970703 .  
  172. ↑ أوركوت، بي إن؛ سيلفان، جيه بي؛ كناب، إن جيه؛ إدواردز، كيه جيه (2011). "علم البيئة الميكروبية للمحيط المظلم فوق قاع البحر، وعند قاعه، وتحته" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 75 (2): 361-422 . doi : 10.1128/MMBR.00039-10 . PMC 3122624. PMID 21646433 .  
  173. ↑ كورينالديسي، سينزيا (2015). "آفاق جديدة في علم البيئة الميكروبية القاعية في أعماق البحار" . مجلة فرونتيرز إن مارين ساينس . 2 : 17. Bibcode : 2015FrMaS...2...17C . doi : 10.3389/fmars.2015.00017 . S2CID 2350681 . 
  174. ↑ زينجر، لوسي؛ أمارال-زيتلر، ليندا أ.؛ فورمان، جيد أ.؛ هورنر-ديفاين، م. كلير؛ هوس، سوزان م.؛ ويلش، ديفيد ب. مارك؛ مارتيني، جينيفر ب. هـ.؛ سوغين، ميتشل؛ بوتيوس، أنتي؛ راميت، ألبان (2011). " الأنماط العالمية للتنوع البيولوجي البكتيري في النظم البيئية لقاع البحر ومياه البحر" . PLOS ONE . 6 (9) e24570. Bibcode : 2011PLoSO...624570Z . doi : 10.1371/journal.pone.0024570 . PMC 3169623. PMID 21931760 .  
  175. ↑ بينهولد، كريستينا؛ بوتيوس، أنتي؛ راميت، ألبان (2012). "العلاقة بين الطاقة والتنوع في المجتمعات البكتيرية المعقدة في رواسب أعماق البحار القطبية" . مجلة ISME . 6 (4): 724-732 . Bibcode : 2012ISMEJ...6..724B . doi : 10.1038/ismej.2011.140 . PMC 3309351. PMID 22071347 .  
  176. ↑ زينجر، ل.؛ بوتيوس، أ.؛ راميت، أ. (2014). "علاقات التحلل بين التصنيفات البكتيرية والمساحة والمسافة في البيئات البحرية" . علم البيئة الجزيئية . 23 (4): 954-964 . Bibcode : 2014MolEc..23..954Z . doi : 10.1111/mec.12640 . PMC 4230465. PMID 24460915 .  
  177. ↑ دروموند، أليكسي جيه؛ نيوكومب، ريتشارد دي؛ باكلي، توماس آر؛ شي، دونغ؛ دوفهايد، أندرو؛ بوتر، بنجامين سي إم؛ هيلد، جوزيف؛ روس، هوارد إيه؛ تومان، ليا؛ غروسر، ستيفاني؛ بارك، داكشول؛ ديميتراس، نيكولاس جيه؛ ستيفنز، مارك آي؛ راسل، جيمس سي؛ أندرسون، ساندرا إتش؛ كارتر، آنا؛ نيلسون، نيكولا (2015). "تقييم نهج الحمض النووي البيئي متعدد الجينات لتقييم التنوع البيولوجي" . GigaScience . 4 s13742-015-0086-1: 46. doi : 10.1186/s13742-015-0086-1 . PMC 4595072. PMID 26445670 . S2CID 28846124 .   
  178. ↑ كورينالديسي، سي.؛ بيولشيني، إف.؛ ديل أنو، أ. (2008). "معدلات تلف وتحلل الحمض النووي خارج الخلية في الرواسب البحرية: دلالات على حفظ تسلسلات الجينات". علم البيئة الجزيئية . 17 (17): 3939-3951 . Bibcode : 2008MolEc..17.3939C . doi : 10.1111/ j.1365-294X.2008.03880.x . PMID 18643876. S2CID 22062643 .  
  179. ^ بيدرسن، ميكيل وينتر. أوفربال-بيترسن، سورين؛ إرميني، لوكا؛ سركيسيان، كليو دير؛ هايل، جيمس. هيلستروم، ميكايلا؛ سبينز ، يوهان. تومسن، فيليب فرانسيس؛ بوهمان، كريستين. كابيليني، إنريكو؛ شنيل، إيدا بيرهولم؛ ويلز، ناثان أ. كاروي، كريستيان؛ كامبوس، باولا ف. شميدت، أستريد MZ. جيلبرت، م. توماس ب.؛ هانسن، أندرس J.؛ أورلاندو، لودوفيتش؛ ويلرسليف، إسكي (2015). "الحمض البيئي القديم والحديث" . المعاملات الفلسفية للجمعية الملكية ب: العلوم البيولوجية . 370 (1660). دوى : 10.1098/rstb.2013.0383 . بمك 4275890 . PMID 25487334 .  
  180. ↑ باردوتشي، لورا؛ بينيت، كيث د.؛ فيسيتولا، جنتيلي فرانشيسكو؛ ألسوس، إنجر جريف؛ سوياما، يوشيهيسا؛ وود، جيمي ر.؛ بيدرسن، ميكيل وينثر (2017). "الحمض النووي النباتي القديم في رواسب البحيرات" . مجلة نيو فايتولوجيست . 214 (3): 924-942 . Bibcode : 2017NewPh.214..924P . doi : 10.1111/nph.14470 . hdl : 10023/13063 . PMID 28370025 . 
  181. ↑ أرمبريشت، ليندا هـ.؛ كولين، ماركو جيه إل؛ ليزيروفيتش، فرانك؛ جورج، سيمون سي.؛ نيغاندي، كاريتا؛ سوزوكي، يوهي؛ يونغ، جينيفر؛ فوستر، نيكول آر.؛ أرماند، ليان كيه.؛ كوبر، آلان؛ أوستروفسكي، مارتن؛ فوكاردي، أمارانتا؛ ستات، مايكل؛ مورو، جون دبليو.؛ ويريتش، لورا إس. (2019). "الحمض النووي القديم من الرواسب البحرية: احتياطات واعتبارات لأخذ عينات من قاع البحر، ومعالجة العينات، وتوليد البيانات". مراجعات علوم الأرض . 196 102887. Bibcode : 2019ESRv..19602887A . doi : 10.1016/j.earscirev.2019.102887 . hdl : 10453/134221 . S2CID 198406152 . 
  182. ↑ دي فارغاس، سي.؛ وآخرون (2015). " تنوع العوالق حقيقية النواة في المحيط المُضاء بأشعة الشمس" . مجلة ساينس . 348 (6237) 1261605. doi : 10.1126/science.1261605 . hdl : 10261/117736 . PMID 25999516. S2CID 12853481 .   
  183. ↑ إيفرسن، إم إتش؛ بلوغ، إتش. (2010). "معادن الصابورة وتدفق الكربون الغارق في المحيط: معدلات التنفس النوعية للكربون وسرعة غرق تجمعات الثلج البحري" . علوم الأرض الحيوية . 7 (9): 2613-2624 . Bibcode : 2010BGeo....7.2613I . doi : 10.5194/bg-7-2613-2010 .
  184. ↑ تاكاهاشي، كوزو؛ بي، آلان دبليو إتش (1984). "المنخربات العوالقية: العوامل المتحكمة في سرعات الغرق". أبحاث أعماق البحار، الجزء أ. أوراق بحثية في علم المحيطات . 31 (12): 1477-1500 . رمز Bibcode : 1984DSRA...31.1477T . doi : 10.1016/0198-0149(84)90083-9 .
  185. 1 2 دي شيبر، ستيجن؛ راي، جيسيكا L.؛ سكار، كاترين ساندنيس؛ ساداتسكي، هنريك. إعجاز، عمر Z.؛ شتاين، روديجر. لارسن، أود (2019). "إمكانات الحمض النووي القديم الرسوبي لإعادة بناء تطور الجليد البحري في الماضي" . مجلة ISME . 13 (10): 2566– 2577. بيب كود : 2019ISMEJ..13.2566D . دوى : 10.1038/s41396-019-0457-1 . بمك 6776040 . بميد 31235841 .  
  186. بارينيتشيا أنجيليس ، إينيس؛ ليزيروفيتش، فرانك؛ كوردييه، تريستان؛ شيبليتز، جانين؛ كوتشيرا، ميخال؛ أريزتيغي، دانيال؛ باولووسكي، يان؛ مورارد، رافائيل (2020). " بصمة الحمض النووي البيئي للفورامينيفيرا العوالقية المترسبة على قاع البحر محفوظة بعد دفنها في الرواسب البحرية" . التقارير العلمية . 10 (1): 20351. doi : 10.1038/s41598-020-77179-8 . PMC 7684305. PMID 33230106 .  تم نسخ النص المعدل من هذا المصدر، وهو متاح بموجب ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 International License .
  187. 1 2 بريغز، ليزا (2020). "أبحاث الحمض النووي القديم في علم الآثار البحرية وتحت الماء: المخاطر والآفاق والتوجهات المستقبلية" . مجلة العصر الرباعي المفتوح . 6 3. doi : 10.5334/oq.71 . S2CID 213677121 . 
  188. 1 2 مورارد، رافائيل؛ ليزيروفيتش، فرانك؛ دارلينج، كيت ف.؛ ليكروك-بينيت، بياتريس؛ وينثر بيدرسن، ميكيل؛ أورلاندو، لودوفيك؛ باولووسكي، يان؛ موليتزا، ستيفان؛ دي فارغاس، كولومبان؛ كوتشيرا، ميخال (2017). "يحافظ الحمض النووي البيئي المستخلص من المنخربات العوالقية من رواسب الأعماق على أنماط علم البيئة الكلية للعوالق" . علوم الأرض الحيوية . 14 (11): 2741-2754 . Bibcode : 2017BGeo...14.2741M . doi : 10.5194/bg-14-2741-2017 . hdl : 10023/11053 . S2CID 55213856 . 
  189. 1 2 كورينالديسي، سي.؛ بيولشيني، إف.؛ ديل أنو، إيه. (2008). "معدلات تلف وتحلل الحمض النووي خارج الخلية في الرواسب البحرية: الآثار المترتبة على حفظ تسلسلات الجينات". علم البيئة الجزيئية . 17 (17): 3939-3951 . Bibcode : 2008MolEc..17.3939C . doi : 10.1111/ j.1365-294X.2008.03880.x . PMID 18643876. S2CID 22062643 .  
  190. 1 2 كورينالديسي، سينزيا؛ ديل أنو، أنطونيو؛ دانوفارو، روبرتو (2007). "التحول المبكر والدور الغذائي للحمض النووي خارج الخلية في النظم البيئية القاعية المختلفة" . علم البحيرات والمحيطات . 52 (4): 1710-1717 . Bibcode : 2007LimOc..52.1710C . doi : 10.4319/lo.2007.52.4.1710 . S2CID 53631156 . 
  191. 1 2 كورينالديسي، سي.؛ باروكا، إم.؛ لونا، جي إم؛ ديل أنو، إيه. (2011). "حفظ وأصل وبصمة الحمض النووي خارج الخلية في رواسب أعماق البحار الخالية من الأكسجين بشكل دائم". علم البيئة الجزيئية . 20 (3): 642-654 . Bibcode : 2011MolEc..20..642C . doi : 10.1111/j.1365-294X.2010.04958.x . PMID 21155913. S2CID 22920579 .  
  192. ↑ غيو، لور؛ وآخرون (2012). "قاعدة بيانات مرجعية للريبوسومات الأولية (PR2): فهرس لتسلسلات الحمض النووي الريبوزي للوحدة الفرعية الصغيرة في حقيقيات النوى وحيدة الخلية مع تصنيف مُدقَّق" . أبحاث الأحماض النووية . 41 (عدد قواعد البيانات): D597– D604. doi : 10.1093/nar/gks1160 . PMC 3531120. PMID 23193267 .   
  193. ^ شيبل، رالف. هيمليبن ، كريستوف (17 فبراير 2017). المنخربات البلانكية في المحيط الحديث . سبرينغر. رقم ISBN 978-3-662-50297-6.
  194. ↑ مورارد، رافائيل؛ دارلينج، كيت ف.؛ ماهي، فريدريك؛ أوديك، ستيفان؛ أوجيي، يوريكا؛ وينر، أغنيس ك.م.؛ أندريه، أورور؛ سيرز، هايدي أ.؛ ويد، كريستوفر م.؛ كويلفير، فريدريك؛ دوادي، كريستوف ج.؛ إسكارجويل، جيل؛ دي جاريديل-ثورون، تيبو؛ سيشا، مايكل؛ كوتشيرا، ميشال؛ دي فارغاس، كولومبان (2015). "PFR2: قاعدة بيانات مُنسقة للحمض النووي الريبوزي 18S للعوالق من نوع فورامينيفيرا كمورد لدراسات بيئة العوالق وجغرافيتها الحيوية وتطورها" (ملف PDF) . موارد علم البيئة الجزيئية . 15 (6): 1472– 1485. doi : 10.1111/1755-0998.12410 . PMID 25828689 . S2CID 39066123 .  
  195. ↑ مورارد، رافائيل؛ فولمار، نيلي م.؛ غريكو، ماتيا؛ كوتشيرا، ميخال (2019). "التنوع غير المصنف للمنخربات العوالقية من التسلسل البيئي الذي تم الكشف عنه كأنواع معروفة ولكنها مهملة" . PLOS ONE . 14 (3) e0213936. Bibcode : 2019PLoSO..1413936M . doi : 10.1371/journal.pone.0213936 . PMC 6428320. PMID 30897140 .  
  196. ↑ روثرفورد، سكوت؛ ديهوندت، ستيفن؛ بريل، وارن (1999). "العوامل البيئية المؤثرة على التوزيع الجغرافي لتنوع العوالق الحيوانية" . مجلة نيتشر . 400 (6746): 749-753 . Bibcode : 1999Natur.400..749R . doi : 10.1038/23449 . S2CID 4418045 . 
  197. ↑ سيتشا، مايكل؛ كوتشيرا، ميخال (2017). "ForCenS، قاعدة بيانات مُنسقة لإحصاءات تعداد المنخربات العوالقية في عينات رواسب سطح البحر" . البيانات العلمية . 4 170109. Bibcode : 2017NatSD...470109S . doi : 10.1038/sdata.2017.109 . PMC 5566098. PMID 28829434 .  
  198. ↑ ليزيروفيتش، فرانك؛ إسلينغ، فيليب؛ ماجيفسكي، فويتشخ؛ شتشوتشينسكي، ويتولد؛ ديسيل، يوهان؛ أوباديا، سيريل؛ أربيزو، بيدرو مارتينيز؛ باولووسكي، يان (2013). " يكمل الحمض النووي القديم سجل الأحافير الدقيقة في رواسب قاع البحر العميقة" . رسائل علم الأحياء . 9 (4). doi : 10.1098/rsbl.2013.0283 . PMC 3730641. PMID 23658006 .  
  199. ^ بافلوسكا، ج.؛ ليزيروفيتش، ف؛ إسلنج، ب. Szczuciński، W .؛ زاجيكوفسكي، م.؛ باولوفسكي، ج. (2014). “الحمض النووي القديم يلقي ضوءًا جديدًا على السجل الأحفوري لسفالبارد المنخربات في الألفية الماضية”. الجيولوجيا . 12 (4): 277–288 . بيب كود : 2014Gbio...12..277P . دوى : 10.1111/gbi.12087 . بميد 24730667 . S2CID 205140049 .  
  200. ^ بافلوسكا، جوانا؛ زاجنكوفسكي، ماريك؛ لاكا، ماجدالينا؛ ليزيروفيتش، فرانك؛ إسلنج، فيليب؛ باولوفسكي، يناير (2016). "التغيرات في علم المحيطات القديمة في مضيق هورنسوند (سبيتسبيرجين، سفالبارد) على مدى الألفية الماضية: رؤى جديدة من الحمض النووي القديم" . مناخ الماضي . 12 (7): 1459– 1472. بيب كود : 2016CliPa..12.1459P . دوى : 10.5194/cp-12-1459-2016 . S2CID 43985949 . 
  201. ^ شتشوسينسكي، فيتولد؛ بافلوسكا، جوانا؛ ليزيروفيتش، فرانك؛ نيشيمورا، يويتشي؛ كوكوسينسكي، ميكوواج؛ ماجوسكي، فويتشخ؛ ناكامورا، يوغو؛ باولوفسكي، يناير (2016). "الحمض النووي الرسوبي القديم يكشف عن رواسب تسونامي السابقة" . الجيولوجيا البحرية . 381 : 29– 33. بيب كود : 2016MGeol.381...29S . دوى : 10.1016/j.margeo.2016.08.006 .
  202. ↑ نون، جاك (2020). "العلم للجميع - تقرير بحثي ممول من القطاع العام (يونيو 2018 - ديسمبر 2019)". فيجشير . doi : 10.26181/5eba630a64e08 .

مراجع إضافية