سكان الأشباح
السكان الوهميون هم سكان تم استنتاجهم باستخدام التقنيات الإحصائية. [ 1 ]
دراسات السكان
في عام ٢٠٠٤، اقتُرح استخدام مناهج الاحتمال الأقصى أو المناهج البايزية لتقدير معدلات الهجرة وأحجام السكان باستخدام نظرية الاندماج، وذلك بالاستفادة من مجموعات بيانات تحتوي على مجموعة سكانية غير مُدرجة بياناتها. يُشار إلى هذه المجموعة باسم "المجموعة السكانية الوهمية". تسمح هذه المعالجة باستكشاف تأثيرات غياب البيانات السكانية على تقدير أحجام السكان ومعدلات الهجرة بين مجموعتين سكانيتين محددتين. وتعتمد انحيازات معلمات السكان المُستنتجة على حجم معدل الهجرة من المجموعات السكانية المجهولة. [ ١ ] وقد لاقت تقنية استخلاص المجموعات السكانية الوهمية انتقادات لأنها ناتجة عن نماذج إحصائية، وما يترتب على ذلك من قيود. [ ٢ ]
علم الوراثة السكانية
البشر
في عام ٢٠١٢، استُخدم تحليل الحمض النووي والتقنيات الإحصائية للاستدلال على أن مجموعة بشرية منقرضة حاليًا في شمال أوراسيا قد تزاوجت مع أسلاف الأوروبيين ومجموعة سيبيرية هاجرت لاحقًا إلى الأمريكتين. أُطلق على هذه المجموعة اسم "المجموعة الشبحية" نظرًا لتحديد هويتها من خلال آثارها في الجينوم، وليس من خلال العظام أو الحمض النووي القديم. [ ٣ ] وفي عام ٢٠١٣، كشفت دراسة أخرى عن رفات أحد أفراد هذه المجموعة الشبحية، مؤكدةً بذلك التوقع السابق بوجودها. [ ٤ ] [ ٥ ]
وفقًا لدراسة نُشرت في عام 2020، هناك مؤشرات على أن 2% إلى 19% (أو حوالي 6.6 و7.0%) من الحمض النووي لأربع مجموعات سكانية في غرب إفريقيا ربما تكون قد أتت من نوع بشري قديم غير معروف انفصل عن سلف الإنسان العاقل (الإنسان الحديث) والنياندرتال بين 360 ألف سنة و1.02 مليون سنة مضت.
لم ينفصل سكان غرب أفريقيا الأوائل قبل انفصال إنسان نياندرتال عن الإنسان الحديث. [ 6 ] حتى قبل 300,000 إلى 200,000 سنة مضت، عندما انفصل أسلاف شعب سان الحديث عن باقي البشر المعاصرين، ربما كانت مجموعة سكان غرب أفريقيا الأوائل هي المجموعة التي انفصلت مبكرًا عن البشر المعاصرين . [ 6 ]
مع ذلك، تشير الدراسة أيضًا إلى أن جزءًا على الأقل من هذا الاختلاط الجيني القديم موجود لدى الأوراسيين/غير الأفارقة، وأن حدث أو أحداث هذا الاختلاط الجيني تتراوح بين 0 و124 ألف سنة قبل الحاضر، ما يشمل الفترة التي سبقت هجرة البشر من أفريقيا وقبل انقسام السكان بين الأفارقة والأوراسيين (مما يؤثر جزئيًا على الأسلاف المشتركين لكل من الأفارقة والأوراسيين/غير الأفارقة). [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] كما وجدت دراسة حديثة أخرى، كشفت عن كميات كبيرة من التباين الجيني البشري غير الموصوف سابقًا، تباينًا جينيًا سلفيًا لدى الأفارقة يسبق ظهور الإنسان الحديث، وقد فُقد لدى معظم غير الأفارقة. [ 10 ]
حيوانات أخرى
في عام 2015، وجدت دراسة لسلالة وهجرة الخنزير المنزلي المبكرة أن أفضل نموذج يتوافق مع البيانات يتضمن تدفق الجينات من مجموعة سكانية منقرضة خلال العصر البليستوسيني . [ 11 ]
تشير دراسة أجريت عام 2018 إلى أن السلف المشترك للذئب والقيوط ربما يكون قد تزاوج مع نوع غير معروف من الكلبيات مرتبط بالذئب الأحمر . [ 12 ]
انظر أيضاً
مراجع
- 1 2 بيرلي، ب. (2004). " تأثير المجموعات السكانية غير المشمولة بالعينات على تقدير أحجام السكان ومعدلات الهجرة بين المجموعات السكانية المشمولة بالعينات" . علم البيئة الجزيئية . 13 (4): 827-836 . doi : 10.1111/j.1365-294x.2004.02101.x . PMID 15012758. S2CID 18326408 .
- ↑ سكاتكين، م (2005). "رؤية الأشباح: تأثير المجموعات السكانية غير المشمولة بالدراسة على معدلات الهجرة المقدرة للمجموعات السكانية المشمولة بالدراسة". علم البيئة الجزيئية . 14 (1): 67-73 . doi : 10.1111/j.1365-294X.2004.02393.x . PMID 15643951. S2CID 17600283 .
- ↑ باترسون، ن . (2012). "الاختلاط القديم في تاريخ البشرية" . علم الوراثة . 192 (3): 1065-1093 . doi : 10.1534/genetics.112.145037 . PMC 3522152. PMID 22960212 .
- ↑ راغافان، م (2013). " يكشف جينوم العصر الحجري القديم العلوي في سيبيريا عن أصل مزدوج لسكان أمريكا الأصليين" . مجلة نيتشر . 505 (7481): 87-91 . Bibcode : 2014Natur.505...87R . doi : 10.1038/nature12736 . PMC 4105016. PMID 24256729 .
- ↑ كالاواي، إي (2015). ""السكان الأشباح" يشيرون إلى هجرة مفقودة منذ زمن طويل إلى الأمريكتين. مجلة نيتشر . doi : 10.1038/nature.2015.18029 . S2CID 181337948 .
- 1 2 سكوجلوند، بونتوس؛ وآخرون (2017). " إعادة بناء التركيبة السكانية الأفريقية في عصور ما قبل التاريخ" . الخلية . 171 ( 1 ): 59-71.e21. doi : 10.1016/j.cell.2017.08.049 . ISSN 0092-8674 . OCLC 7144495602. PMC 5679310. PMID 28938123. S2CID 1257429 .
- ↑ أرون دورفاسولا؛ سريرام سانكارارامان (2020). "استعادة إشارات التداخل الجيني القديم في السكان الأفارقة" . مجلة ساينس أدفانسز . 6 (7) eaax5097. Bibcode : 2020SciA....6.5097D . doi : 10.1126/sciadv.aax5097 . PMC 7015685. PMID 32095519 . تُظهر المجموعات السكانية غير الأفريقية (الصينيون الهان في بكين وسكان ولاية يوتا من أصول شمالية وغرب أوروبية) أنماطًا مماثلة في تحليل تسلسل الحمض النووي للمجموعات السكانية (CSFS)، مما يشير إلى وجود عنصر من الأصول القديمة مشترك قبل انفصال المجموعات السكانية الأفريقية وغير الأفريقية. أحد التفسيرات التي وثقناها لوقت التداخل الجيني الحديث هو أن الأشكال القديمة استمرت في أفريقيا حتى وقت قريب نسبيًا. بدلاً من ذلك، ربما تكون هذه المجموعة السكانية القديمة قد تداخلت في وقت سابق مع مجموعة بشرية حديثة، والتي تزاوجت بدورها مع أسلاف المجموعات السكانية التي حللناها هنا. النماذج التي استكشفناها هنا ليست حصرية، ومن المعقول أن يشمل تاريخ المجموعات السكانية الأفريقية مساهمات جينية من مجموعات سكانية متباينة متعددة، كما يتضح من الحجم الفعال الكبير للسكان المرتبط بالمجموعات السكانية القديمة المتداخلة. نظرًا لعدم اليقين في تقديراتنا لوقت التداخل الجيني، تساءلنا عما إذا كان تحليل تسلسل الحمض النووي للمجموعات السكانية (CSFS) من كل من سكان يوتا من أصول شمالية وغربية أوروبية (CEU) (سكان ولاية يوتا من أصول شمالية وغربية أوروبية) سيُسهم في فهم أفضل لتأثير التداخل الجيني. (والأصول الأوروبية الغربية) وجينومات YRI قد توفر دقة إضافية. في النموذج C، قمنا بمحاكاة التهجين قبل وبعد الانفصال بين السكان الأفارقة وغير الأفارقة، ولاحظنا اختلافات نوعية بين النموذجين في مجموعات الأليلات المشتقة عالية التردد لـ CSFS في السكان الأفارقة وغير الأفارقة (الشكل S40). باستخدام ABC لملاءمة مجموعات الأليلات المشتقة عالية التردد لـ CSFS في CEU وYRI (المعرفة بأنها تردد أكبر من 50٪)، وجدنا أن الحد الأدنى لفترة المصداقية 95٪ لوقت التهجين أقدم من الانفصال المحاكى بين CEU وYRI (2800 مقابل 2155 جيلًا قبل الحاضر)، مما يشير إلى أن جزءًا على الأقل من السلالات القديمة التي شوهدت في YRI مشتركة أيضًا مع CEU...
- ↑المواد التكميلية لاستعادة إشارات التداخل الجيني القديم في السكان الأفارقة، القسم "S8.2": "قمنا بمحاكاة البيانات باستخدام نفس المعلومات المسبقة في القسم S5.2، ولكننا حسبنا الطيف لكل من YRI [اليوروبا في غرب أفريقيا] وCEU [سكان من أصل أوروبي]. وجدنا أن أفضل معلمات المطابقة هي وقت الانقسام القديم قبل 27000 جيل (95% HPD: 26000-28000)، ونسبة الاختلاط 0.09 (95% HPD: 0.04-0.17)، ووقت الاختلاط قبل 3000 جيل (95% HPD: 2800-3400)، وحجم السكان الفعال 19700 فرد (95% HPD: 19300-20200). وجدنا أن الحد الأدنى لزمن الاختلاط يعود إلى فترة أقدم من الانفصال المُحاكى بين مجموعتي CEU وYRI (قبل 2155 جيلًا)، مما يُقدم بعض الأدلة التي تُرجّح حدوث حدث سابق لخروج أفريقيا. يُشير هذا النموذج إلى أن العديد من المجموعات السكانية خارج أفريقيا يجب أن تحتوي أيضًا على أنماط فردية من حدث التداخل هذا، على الرغم من صعوبة الكشف عنها نظرًا لأن العديد من الطرق تستخدم مجموعات خارجية غير مختلطة للكشف عن الأنماط الفردية المُتداخلة [Browning et al., 2018, Skov et al., 2018, Durvasula and Sankararaman, 2019] (5, 53, 22). من المُحتمل أيضًا أن بعض هذه الأنماط الفردية قد فُقدت خلال عنق الزجاجة الناتج عن خروج أفريقيا.
- ↑ دورفاسولا ، أرون؛ سانكارارامان، سريرام (2020). "استعادة إشارات التداخل الجيني القديم الخفي في السكان الأفارقة" . مجلة ساينس أدفانسز . 6 (7) eaax5097. رمز Bibcode : 2020SciA....6.5097D . doi : 10.1126/sciadv.aax5097 . PMC 7015685. PMID 32095519. S2CID 211472946 .
- ↑ بيرغستروم، أ؛ مكارثي، س؛ هوي، ر؛ المري، م؛ أيوب، ق (2020). "رؤى حول التباين الجيني البشري وتاريخ السكان من 929 جينومًا متنوعًا" . مجلة ساينس . 367 (6484) eaay5012. doi : 10.1126/science.aay5012 . PMC 7115999. PMID 32193295 . يُشير تحليل التسلسلات الجينية القديمة في المجتمعات الحديثة إلى وجود تنوع جيني سلفي في المجتمعات الأفريقية، يُرجح أنه يسبق ظهور الإنسان الحديث، وقد فُقد في معظم المجتمعات غير الأفريقية. وقد وجدنا كميات ضئيلة من أصول إنسان نياندرتال في جينومات غرب أفريقيا، مما يعكس على الأرجح اختلاطًا جينيًا مع سكان أوراسيا. وعلى الرغم من انخفاض مستويات هذه الأصول القديمة أو انعدامها، فإن المجتمعات الأفريقية تشترك في العديد من المتغيرات الجينية لإنسان نياندرتال وإنسان دينيسوفان، وهي متغيرات غائبة عن أوراسيا، مما يُظهر كيف تم الحفاظ على نسبة أكبر من التنوع الجيني البشري السلفي في أفريقيا.
- ↑ فرانز، ل. (2015). "أدلة على تدفق الجينات والانتقاء على المدى الطويل خلال عملية التدجين من تحليلات جينومات الخنازير البرية والمستأنسة في أوراسيا". علم الوراثة الطبيعية . 47 (10): 1141-1148 . doi : 10.1038/ng.3394 . PMID 26323058. S2CID 205350534 .
- ^ جوبالاكريشنان ، شيام. سيندينغ، ميكيل هولجر S .؛ راموس مادريجال، جازمين؛ نيمان، جوناس. سامانييغو كاسترويتا، خوسيه أ؛ فييرا، فيليبي جي؛ كاروي، كريستيان؛ مونتيرو، مارك دي مانويل؛ كوديرنا، لوكاس؛ سيريس، ايتور. غونزاليس باسالوت، فيكتور مانويل؛ ليو، يان هو؛ وانغ، قوه دونغ؛ ماركيز بونيت، توماس؛ ميراراب، سيافاش؛ فرنانديز، كارلوس؛ جوبيرت، فيليب؛ كوبفلي، كلاوس بيتر؛ بود، جين؛ رونيس، إيلي كنيسبل؛ هايد-يورجنسن، مادس بيتر؛ بيترسن، بنت؛ سيشيريتز بونتن، توماس؛ باخمان، لوتز؛ ويج، أويستين. هانسن، أندرس J .؛ جيلبرت، م. توماس ب. (2018). "تدفق الجينات بين الأنواع شكّل تطور جنس الكلب" . علم الأحياء الحالي . 28 (21): 3441-3449.e5. doi : 10.1016/j.cub.2018.08.041 . PMC 6224481. PMID 30344120 .
- علم الوراثة العرقي
