نازعة هيدروجين الغلوتامات

إنزيم نازع هيدروجين الغلوتامات (GLDH، GDH) هو إنزيم موجود في كل من بدائيات النوى وميتوكوندريا حقيقيات النوى . ينتج عن التفاعل المذكور الأمونيا، التي تُعالج في حقيقيات النوى كركيزة في دورة اليوريا . عادةً، لا يحدث تفاعل تحويل ألفا-كيتوغلوتارات إلى غلوتامات في الثدييات، لأن توازن نازع هيدروجين الغلوتامات يميل إلى إنتاج الأمونيا وألفا-كيتوغلوتارات. كما يتميز نازع هيدروجين الغلوتامات بانخفاض ألفته للأمونيا ( ثابت ميكايليس مرتفع).كم{\displaystyle K_{m}}(حوالي 1 ملي مولار)، وبالتالي يجب أن تكون مستويات الأمونيا سامة في الجسم لحدوث التفاعل العكسي (أي تحويل ألفا-كيتوغلوتارات والأمونيا إلى غلوتامات وNAD(P)+). في الدماغ، تشجع نسبة NAD+/NADH في ميتوكوندريا الدماغ على نزع الأمين التأكسدي (أي تحويل الغلوتامات إلى ألفا-كيتوغلوتارات والأمونيا). [ 1 ] في البكتيريا، يتم استيعاب الأمونيا في الأحماض الأمينية عبر الغلوتامات وإنزيمات ناقلة الأمين. [ 2 ] في النباتات، يمكن للإنزيم أن يعمل في كلا الاتجاهين اعتمادًا على البيئة والإجهاد. [ 3 ] [ 4 ] تتميز النباتات المعدلة وراثيًا التي تُنتج إنزيمات GLDH الميكروبية بتحسن في تحمل مبيدات الأعشاب ونقص المياه والعدوى المرضية. [ 5 ] كما أنها أكثر قيمة غذائية. [ 6 ]

يمثل هذا الإنزيم حلقة وصل أساسية بين مسارات الهدم والبناء ، ولذلك فهو موجود في جميع حقيقيات النوى. في البشر، تُسمى الجينات ذات الصلة GLUD1 ( نازعة هيدروجين الغلوتامات 1) و GLUD2 (نازعة هيدروجين الغلوتامات 2)، كما يوجد أيضًا ما لا يقل عن خمسة جينات كاذبة لـ GLDH في الجينوم البشري . [ 7 ]

وظيفة

يحفز الإنزيم التفاعل العكسي: [ 8 ]

التطبيق السريري

يمكن قياس إنزيم GLDH في المختبرات الطبية لتقييم وظائف الكبد. تشير المستويات المرتفعة من GLDH في مصل الدم إلى تلف الكبد، ويلعب هذا الإنزيم دورًا هامًا في التشخيص التفريقي لأمراض الكبد، خاصةً عند قياسه مع إنزيمات ناقلة الأمين . يتمركز إنزيم GLDH في الميتوكوندريا ، ولذلك لا يُفرز عمليًا في أمراض الكبد الالتهابية العامة، مثل التهاب الكبد الفيروسي. تتميز أمراض الكبد التي يكون فيها نخر الخلايا الكبدية هو الحدث السائد، مثل تلف الكبد السمي أو مرض الكبد الناتج عن نقص الأكسجة، بارتفاع مستويات GLDH في مصل الدم. يُعد GLDH مهمًا للتمييز بين التهاب الكبد الفيروسي الحاد ونخر الكبد السمي الحاد أو مرض الكبد الناتج عن نقص الأكسجة الحاد، خاصةً في حالة تلف الكبد المصحوب بارتفاع شديد في إنزيمات ناقلة الأمين. في التجارب السريرية ، يمكن استخدام GLDH كمقياس لسلامة الدواء.

يمكن استخدام اختبار المقايسة المناعية الإنزيمية (EIA) لإنزيم نازعة هيدروجين الغلوتامات (GDH) كأداة فحص للمرضى المصابين بعدوى المطثية العسيرة . يُعبَّر عن هذا الإنزيم بشكل دائم في معظم سلالات المطثية العسيرة، وبالتالي يمكن الكشف عنه بسهولة في البراز. ويتم تأكيد التشخيص عادةً بإجراء اختبار EIA لاحق للكشف عن سموم المطثية العسيرة A وB.

العوامل المساعدة

يُعدّ NAD + (أو NADP + ) عاملًا مساعدًا لتفاعل نازعة هيدروجين الغلوتامات، حيث ينتج عنه ألفا-كيتوغلوتارات والأمونيوم كمنتج ثانوي. [ 4 ] [ 9 ]

بناءً على العامل المساعد المستخدم، تُقسم إنزيمات نازعة هيدروجين الغلوتامات إلى الفئات الثلاث التالية:

  • EC 1.4.1.2: L-غلوتامات + H2O + NAD +{\displaystyle \rightleftharpoons }2-أوكسوغلوتارات + NH3 + NADH + H +
  • EC 1.4.1.3: L-glutamate + H 2 O + NAD(P) +{\displaystyle \rightleftharpoons }2-أوكسوجلوتارات + NH 3 + NAD(P)H + H +
  • EC 1.4.1.4: L-glutamate + H 2 O + NADP +{\displaystyle \rightleftharpoons }2-أوكسوغلوتارات + NH3 + NADPH + H +

دورها في تدفق النيتروجين

يتم دمج الأمونيا في الحيوانات والكائنات الدقيقة من خلال عمل إنزيمات نازعة هيدروجين الغلوتامات وسينثيتاز الغلوتامين . يلعب الغلوتامات دورًا محوريًا في تدفق النيتروجين لدى الثدييات والكائنات الدقيقة، حيث يعمل كمصدر ومستقبل للنيتروجين.

تنظيم نازعة هيدروجين الغلوتامات

في البشر، يُنظَّم نشاط إنزيم غلوتامات ديهيدروجينيز عبر عملية إضافة مجموعة ADP-ريبوزيل ، وهي تعديل تساهمي يُجريه جين sirt4 . ويخف هذا التنظيم استجابةً لتقييد السعرات الحرارية وانخفاض مستوى سكر الدم . في هذه الظروف، يرتفع نشاط إنزيم غلوتامات ديهيدروجينيز لزيادة كمية ألفا-كيتوغلوتارات المُنتَجة، والتي تُستخدم لتوفير الطاقة من خلال دخولها في دورة حمض الستريك لإنتاج جزيئات ATP في نهاية المطاف .

في الميكروبات، يتم التحكم في النشاط عن طريق تركيز الأمونيوم أو أيون الروبيديوم ذي الحجم المماثل، والذي يرتبط بموقع ألوستيري على GLDH ويغير قيمة K m ( ثابت ميكايليس ) للإنزيم. [ 10 ]

يُعدّ التحكم في إنزيم GLDH عبر عملية إضافة مجموعة ADP-ribose ذا أهمية خاصة في خلايا بيتا المنتجة للأنسولين . تفرز خلايا بيتا الأنسولين استجابةً لزيادة نسبة ATP إلى ADP ، وعندما يُحلّل إنزيم GLDH الأحماض الأمينية إلى ألفا-كيتوغلوتارات، ترتفع هذه النسبة، ما يؤدي إلى زيادة إفراز الأنسولين. يُعدّ SIRT4 ضروريًا لتنظيم استقلاب الأحماض الأمينية كوسيلة للتحكم في إفراز الأنسولين وتنظيم مستويات سكر الدم.

اكتشف كارل فريدن في أواخر الخمسينيات وأوائل الستينيات من القرن الماضي أن إنزيم نازع هيدروجين الغلوتامات في كبد الأبقار يُنظَّم بواسطة النيوكليوتيدات. [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] إضافةً إلى وصفه لتأثيرات النيوكليوتيدات مثل ADP وATP وGTP، فقد وصف بالتفصيل السلوك الحركي المختلف لـ NADH وNADPH. وبذلك، كان هذا الإنزيم من أوائل الإنزيمات التي أظهرت ما وُصف لاحقًا بالسلوك التغايري. [ 15 ]

لطالما عُرف تنشيط إنزيم نازع هيدروجين الغلوتامات (GDH) في الثدييات بواسطة الليوسين وبعض الأحماض الأمينية الكارهة للماء الأخرى، [ 16 ] إلا أن موقع الارتباط لم يكن واضحًا. ومؤخرًا فقط، تم تحديد موقع الارتباط التغايري الجديد لليوسين في إنزيم ثديي. [ 17 ]

تؤدي الطفرات التي تغير موقع الارتباط التآزري لـ GTP إلى التنشيط الدائم لإنزيم نازعة هيدروجين الجلوتامات، وتؤدي إلى متلازمة فرط الأنسولين وفرط أمونيا الدم .

أنظمة

التنظيم التآزري :

قد يستخدم هذا البروتين نموذج المورفين للتنظيم التآزري . [ 9 ] [ 18 ]

المثبطات الألوستيرية:

المنشطات:

مثبطات أخرى:

بالإضافة إلى ذلك، يُظهر إنزيم GLDH في الفئران تثبيطًا للركيزة، حيث ينخفض ​​نشاط GLDH عند تركيزات عالية من الغلوتامات. [ 9 ]

الأيزوزيمات

يُنتج البشر الإنزيمات المتماثلة التالية من نازعة هيدروجين الغلوتامات :

انظر أيضاً

مراجع

  1. ماكينا، إم سي، وفيريرا، جي سي (2016). "المركبات الإنزيمية المهمة لدورة الغلوتامات-الغلوتامين". دورة الغلوتامات/غابا-الغلوتامين . التقدم في علم الأحياء العصبي. المجلد  13. الصفحات 59-98 . doi : 10.1007/978-3-319-45096-4_4 . ISBN  978-3-319-45094-0PMID 27885627 
  2. لايتفوت، د. أ.، بارون، أ. ج.، ووتون، ج. س. (مايو 1988) . "يؤدي التعبير عن جين نازعة هيدروجين الغلوتامات من الإشريكية القولونية في البكتيريا الزرقاء سينيكوكوس PCC6301 إلى تحمل الأمونيوم". بيولوجيا النبات الجزيئية . 11 (3): 335-344 . Bibcode : 1988PMolB..11..335L . doi : 10.1007/BF00027390 . PMID: 24272346. S2CID : 21845538 .  
  3. مونغور ر، غلاس أ.د، غودينو د.ب، لايتفوت د.أ (يونيو 2005). "بصمة الأيض في نبات التبغ المعدل وراثيًا (Nicotiana tabacum) المتأثر بجين نازعة هيدروجين الغلوتامات من الإشريكية القولونية" . مجلة الطب الحيوي والتكنولوجيا الحيوية . 2005 (2): 198-214 . doi : 10.1155/JBB.2005.198 . PMC 1184043. PMID 16046826 .  
  4. 1 2 غرابوفسكا أ، نوفيكي م، كوينتا ج (2011). "إنزيم نازع هيدروجين الغلوتامات في بذور التريتيكال النابتة: التعبير الجيني، وتوزيع النشاط، والخصائص الحركية" . مجلة علم وظائف النبات . 33 (5): 1981-1990 . Bibcode : 2011AcPPl..33.1981G . doi : 10.1007/s11738-011-0801-1 .
  5. لايتفوت، د. أ.، برنهاردت، ك.، مونغور، ر.، نولتي، س.، أمزيان، ر.، كولتر، أ.، جونز، ك.، إقبال، م. ج.، فارسا، إ.، يونغ، ب. (2007). "تحسين تحمل الجفاف في نباتات الذرة المعدلة وراثيًا التي تعبر عن جين نازعة هيدروجين الغلوتامات (gdhA) من الإشريكية القولونية". يوفيتيكا . 156 ( 1-2 ): 103-116 . Bibcode : 2007Euphy.156..103L . doi : 10.1007/s10681-007-9357-y . S2CID 11806853 . 
  6. لايتفوت، د. أ. (2009). "جينات لتحسين كفاءة استخدام النيتروجين في المحاصيل". في: وود، أندرو، وماثيو أ. جينكس (محرران). جينات الإجهاد اللاأحيائي للنباتات . وايلي-بلاك ويل. ص 167-182 . ISBN  978-0-8138-1502-2.
  7. أليشينا، ي. أ.، وأليشين، ف. أ. (2024). "التغيرات التطورية في إنزيمات نازعة هيدروجين الغلوتامات 1 و2 لدى الرئيسيات تؤثر على تنظيم البروتين بواسطة الروابط، والاستهداف، والتعديلات ما بعد الترجمة" . المجلة الدولية للعلوم الجزيئية . 25 (8) 4341: 4341. doi : 10.3390/ijms25084341 . PMC 11050691. PMID 38673928 .  
  8. الإنزيم 1.4.1.2 في قاعدة بيانات مسارات KEGG .
  9. 1 2 3 بوتمن د، تيغشيلار و، فان نوردن سي جيه (نوفمبر 2014). "تحديد نشاط نازعة هيدروجين الغلوتامات وحركيتها في أنسجة الفئران باستخدام التخطيط الأيضي (الكيمياء النسيجية الكمية للإنزيم)" . مجلة الكيمياء النسيجية والخلوية . 62 (11): 802-812 . doi : 10.1369/0022155414549071 . PMC 4230541. PMID 25124006 .  
  10. ووتون، ج. س. (فبراير 1983). "إعادة تقييم ألفة أيونات الأمونيوم لإنزيمات نازعة هيدروجين الغلوتامات النوعية لـ NADP. تنشيط إنزيم نيوروسبورا كراسا بواسطة أيونات الأمونيوم والروبيديوم" . المجلة البيوكيميائية . 209 (2): 527-531 . doi : 10.1042/bj2090527 . PMC 1154121. PMID 6221721 .  
  11. فريدن، سي (أبريل 1959). "إنزيم نازع هيدروجين الغلوتاميك. الجزء الثاني: تأثير النيوكليوتيدات المختلفة على خصائص الارتباط والانفصال والحركية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 234 (4): 815-820 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)70181-6 . PMID 13654269 . 
  12. فريدن، سي (مايو 1962). "التثبيط غير المعتاد لإنزيم غلوتامات ديهيدروجينيز بواسطة ثنائي وثلاثي فوسفات الغوانوزين". مجلة بيوشيميكا وبيوفيزيكا أكتا . 59 (2): 484-486 . doi : 10.1016/0006-3002(62)90204-4 . PMID 13895207 . 
  13. فريدن سي (1963). نازعة هيدروجين الغلوتامات إل، في كتاب الإنزيمات، المجلد السابع . دار النشر الأكاديمية. الصفحات 3-24 . 
  14. فريدن، سي (مايو 1965). "إنزيم نازع هيدروجين الغلوتامات. السادس. دراسة تأثير نيوكليوتيدات البيورين وغيرها من التأثيرات على الإنزيم من مصادر مختلفة" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 240 (5): 2028-35 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)97420-X . PMID 14299621 . 
  15. مونود ج، وايمان ج، شانجيو جيه بي (1965). "حول طبيعة التحولات التغايرية: نموذج معقول". مجلة البيولوجيا الجزيئية . 12 : 88-118 . doi : 10.1016/s0022-2836(65)80285-6 . PMID 14343300 . 
  16. ييلدينغ كيه إل، تومكينز جي إم (1961). "تأثير ل-ليوسين والأحماض الأمينية الأساسية الأخرى على بنية ونشاط نازعة هيدروجين الغلوتاميك" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 47 ( 7): 983-989 . Bibcode : 1961PNAS...47..983L . doi : 10.1073/pnas.47.7.983 . PMC 221313. PMID 13787322 .  
  17. 1 2 3 أليشين، ف. أ.، بونيك، ف. إ.، بروش، إ. م.، بيلينزوني، م. (2022). "الأساس البنيوي لارتباط المنشطات التآثرية، الليوسين وADP، بإنزيم غلوتامات ديهيدروجينيز في الثدييات" . المجلة الدولية للعلوم الجزيئية . 23 (19) 11306. doi : 10.3390/ijms231911306 . PMC 9570180. PMID 36232607 .  
  18. سيلوود تي، جافي إي كيه (مارس 2012). "التفكك الديناميكي للوحدات المتجانسة والتحكم في وظيفة البروتين" . أرشيف الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية . 519 (2): 131-143 . doi : 10.1016/j.abb.2011.11.020 . PMC 3298769. PMID 22182754 .  
  19. 1 2 3 لي م، لي س، ألين أ، ستانلي س أ، سميث ت ج (2014-03-01). "إنزيم نازع هيدروجين الغلوتامات: بنيته، وتنظيمه التآزري، ودوره في استتباب الأنسولين" . أبحاث الكيمياء العصبية . 39 (3): 433-445 . doi : 10.1007/s11064-013-1173-2 . ISSN 1573-6903 . PMC 7808316. PMID 24122080 .   
  20. بورنورمحمدي س، غريمالدي م، ستريد م هـ، لافالارد ف، واجيبترسن هـ س، وولهايم س ب، ماخلر ب (يوليو 2017). "ينشط إيبيغالوكاتشين-3-غاليت (EGCG) إنزيم AMPK من خلال تثبيط نازعة هيدروجين الغلوتامات في العضلات وخلايا بيتا البنكرياسية: هل له تأثير مفيد محتمل في حالة ما قبل السكري؟" . المجلة الدولية للكيمياء الحيوية وبيولوجيا الخلية . 88 : 220-225 . doi : 10.1016/j.biocel.2017.01.012 . PMID 28137482 .