ثنائي فوسفات الغوانوزين

ثنائي فوسفات الغوانوزين ، ويُختصر بـ GDP ، هو نيوكليوزيد ثنائي الفوسفات . وهو عبارة عن إستر لحمض البيروفوسفوريك مع نيوكليوزيد الغوانوزين . يتكون GDP من مجموعة بيروفوسفات ، وسكر خماسي الريبوز ، وقاعدة الغوانين . [ 1 ]

GDP هو نتاج إزالة الفوسفات من GTP بواسطة GTPases ، على سبيل المثال، البروتينات G التي تشارك في نقل الإشارة .

يتم تحويل GDP إلى GTP بمساعدة إنزيم البيروفات كيناز والفوسفينول بيروفات.

الناتج المحلي الإجمالي والناتج المحلي الإجمالي

تحلل GTP إلى GDP

تُسهّل إنزيمات GTPase عملية تحلل GTP إلى GDP ، حيث تستخدم هذه الإنزيمات وحدةً محفوظةً في موقعها النشط تُعرف باسم بروتين تنشيط GTPase (GAP). في البداية، يرتبط جزيء ماء ببقايا الأحماض الأمينية في الموقع النشط لإنزيم GTPase. يهاجم جزيء الماء مجموعة الفوسفات γ في GTP، مما يؤدي إلى تكوين حالة انتقالية خماسية التكافؤ. تُثبَّت هذه الحالة الانتقالية من خلال تفاعلات مع بقايا الأحماض الأمينية في الموقع النشط، بما في ذلك بقايا الأحماض الأمينية التحفيزية المحفوظة. ونتيجةً لذلك، تنفصل مجموعة الفوسفات γ، ويتحرر الفوسفات غير العضوي (Pi). تُسبب هذه الخطوة أيضًا تغييرًا في بنية الإنزيم، مما يُعزز تحرير GDP. [ 2 ]

الوظائف البيوكيميائية

الإشارات داخل الخلايا

يُشارك GDP في عمليات الإشارات داخل الخلايا، حيث يعمل كمنظم أساسي لنشاط إنزيمات GTPases. تعمل هذه الإنزيمات كمفاتيح جزيئية، إذ تتناوب بين حالة نشطة مرتبطة بـ GTP وحالة غير نشطة مرتبطة بـ GDP. يخضع التحول المتبادل بين GDP وGTP لرقابة دقيقة، ويعمل كمؤقت جزيئي لمسارات نقل الإشارة. عندما تُحفز إشارة خارجية تنشيط مستقبل مقترن بالبروتين G (GPCR)، يستبدل البروتين G المرتبط به جزيء GDP المرتبط به بـ GTP، مما يؤدي إلى تغيير في بنيته وتنشيط سلسلة من الإشارات اللاحقة. [ 3 ] يمكن لهذا التنشيط أن يُحفز مجموعة متنوعة من الاستجابات الخلوية، بما في ذلك تعديل التعبير الجيني، وإعادة ترتيب الهيكل الخلوي، وتنظيم الأنشطة الإنزيمية. يؤدي تحلل GTP إلى GDP بواسطة نشاط GTPase للبروتين G إلى استعادة الحالة غير النشطة، وبالتالي إنهاء عملية الإشارة. [ 4 ]

في نوع من الإشارات الخلوية يُعرف بعملية الاستيراد النووي، ترتبط بروتينات سيتوبلازمية مثل الإمبورتينات ألفا وبيتا بتسلسل التموضع النووي الموجود داخل البروتين، والذي يرتبط بدوره بمركب المسام النووية، مما يسمح بانتقاله إلى النواة. [ 5 ] يرتبط إنزيم RanGTPase بالإمبورتين بيتا، مما يؤدي إلى فصله عن المركب، يليه فصل الإمبورتين ألفا المرتبط أيضًا بإنزيم RanGTPase. أثناء ارتباط الإمبورتينات بإنزيم RanGTPase، تغادر النواة حيث يتم تحلل Ran، محولًا GTP المرتبط إلى GDP. يمكن لـ Ran-GDP العودة إلى النواة من خلال ارتباطه بعامل نقل نووي، حيث يقوم بروتين عامل تبادل النيوكليوتيدات الغوانينية بتحفيز تبادل GTP بـ GDP. نلاحظ أيضًا تحلل GTP في بروتينات Ras، حيث يحدث التفاعل نفسه. [ 6 ]

انظر أيضاً

مراجع

  1. كرين، لورا جيه؛ ميلر، ديفيد لي (1974). "ثلاثي فوسفات الغوانوزين وثنائي فوسفات الغوانوزين كجزيئات محددة للبنية. التفاعل التفاضلي لمسبار فلوري مع معقدات نيوكليوتيد الغوانوزين لعامل استطالة البكتيريا Tu". الكيمياء الحيوية . 13 (5): 933-939 . doi : 10.1021/bi00702a017 . PMID 4591619 . 
  2. كاليستو، آنا ر.؛ موريرا، كاتيا؛ بابيس، آنا؛ كوتينغ، كارستن؛ جيرويرت، كلاوس؛ روداك، تيل؛ كامرلين، شينا سي إل (10 يوليو 2019). "تحلل GTP بدون قاعدة في الموقع النشط: آلية موحدة لـ Ras وGTPases ذات الصلة" . مجلة الجمعية الكيميائية الأمريكية . 141 (27): 10684-10701 . doi : 10.1021/jacs.9b03193 . ISSN 0002-7863 . PMID 31199130 .  
  3. داونز، جي بي؛ غوتام، ن. (15-12-1999). "عائلات جينات الوحدات الفرعية لبروتين جي". علم الجينوم . 62 (3): 544-552 . doi : 10.1006/geno.1999.5992 . ISSN 0888-7543 . PMID 10644457 .  
  4. شميدت، أنيا؛ هول، آلان (1 يوليو 2002). "عوامل تبادل النيوكليوتيدات الغوانينية لبروتينات Rho GTPases: تشغيل المفتاح" . الجينات والتطور . 16 (13): 1587-1609 . doi : 10.1101/gad.1003302 . ISSN 0890-9369 . PMID 12101119 .  
  5. تومسون، مارلين إي. (15 يوليو 2018). "BRCA1 بعد 16 عامًا: عمليات استيراد وتصدير المواد النووية" . مجلة FEBS . 277 (15): 3072-3078 . doi : 10.1111/j.1742-4658.2010.07733.x . ISSN 1742-464X . PMID 20608972 .  
  6. شوتس، آدم؛ دير، تشانينغ ج. (2006-01-01). "القياس الفوري في المختبر لتحلل GTP الذاتي والوسيط بواسطة Ras GAP" . منظمات ومؤثرات GTPases الصغيرة: عائلة Ras . طرق في علم الإنزيمات. المجلد 407. مطبعة أكاديمية. الصفحات 9-22 . doi : 10.1016/s0076-6879(05)07002-3 . ISBN   978-0-12-182812-7PMID 16757310. تم الاطلاع عليه بتاريخ 25-04-2024 .