جاكوار (برنامج)
جاغوار هو برنامج حاسوبي يُستخدم لإجراء حسابات كيمياء الكم من المبادئ الأولى لكل من الطورين الغازي والمحلولي. [ 1 ] وهو برنامج تجاري تسوقه شركة شرودنغر . نشأ البرنامج في مجموعات بحثية لريتشارد فريزنر وويليام غودارد ، وكان يُسمى في البداية PS-GVB (في إشارة إلى ما يُسمى بطريقة الرابطة التكافؤية المعممة شبه الطيفية التي اعتمدها البرنامج).
يُعدّ برنامج Jaguar مكونًا أساسيًا في منتجين آخرين من شركة Schrödinger: برنامج Maestro، الذي يوفر واجهة المستخدم الرسومية لبرنامج Jaguar، وبرنامج QM /MM المسمى QSite ، الذي يستخدم Jaguar كمحرك كيميائي كمي. الإصدار الحالي هو Jaguar 10.4 (2020).
سمات
من السمات المميزة لبرنامج جاغوار استخدامه لتقريب الطيف الزائف. [ 2 ] يمكن تطبيق هذا التقريب على العمليات التكاملية المكلفة حسابيًا والموجودة في معظم حسابات الكيمياء الكمومية. ونتيجة لذلك، تصبح الحسابات أسرع مع فقدان طفيف في الدقة. [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]
يتضمن الإصدار الحالي الوظائف التالية:
- هارتري-فوك ( RHF ، UHF ، ROHF ) ونظرية الكثافة الوظيفية ( LDA ، والوظائف المصححة بالتدرج، والوظائف المصححة بالتشتت، والوظائف الهجينة )
- نظرية الاضطراب من الدرجة الثانية المحلية لمولر-بليسيت (LMP2)
- حسابات الاقتران المثالي للرابطة التكافؤية المعممة (GVB-PP) و GVB-LMP2
- التنبؤ بالحالات المثارة باستخدام تفاعل التكوين (CIS) ونظرية الكثافة الوظيفية المعتمدة على الزمن (TDDFT)
- تحسين الهندسة والبحث عن حالة الانتقال
- حسابات الذوبان بناءً على معادلة بواسون-بولتزمان
- التنبؤ بأطياف الأشعة تحت الحمراء (IR) والرنين المغناطيسي النووي (NMR) والأشعة فوق البنفسجية (UV) وثنائي اللون الدائري الاهتزازي (VCD)
- توقع قيمة pKa
- توليد أسطح جزيئية متنوعة ( الجهد الكهروستاتيكي ، كثافة الإلكترون ، المدارات الجزيئية ، إلخ).
- التنبؤ بالخصائص الجزيئية المختلفة ( العزوم متعددة الأقطاب ، والاستقطابية ، والترددات الاهتزازية ، وما إلى ذلك).
انظر أيضاً
مراجع
- ↑ يونغ، ديفيد (2001). "الملحق AA2.5 جاغوار". الكيمياء الحاسوبية . وايلي-إنترساينس. ص 337.
- ↑ أورزاج، ستيفن أ. (سبتمبر 1972). "مقارنة بين التقريب الطيفي الزائف والتقريب الطيفي". دراسات في الرياضيات التطبيقية . 51 (3): 253-259 . doi : 10.1002/sapm1972513253 .
- ↑ فرايزنر، ر. أ. (أكتوبر 1991). "طرق جديدة لحسابات البنية الإلكترونية للجزيئات الكبيرة". المراجعة السنوية للكيمياء الفيزيائية . 42 (1): 341-367 . Bibcode : 1991ARPC...42..341F . doi : 10.1146 / annurev.pc.42.100191.002013 . PMID 1747190. S2CID 32730211 .
- ↑ فرايزنر، ريتشارد أ.؛ مورفي، روبرت ب.؛ بيتشي، مايكل د.؛ رينغنالدا، موركو ن.؛ بولارد، دبليو. توماس؛ دونيتز، باري د.؛ كاو، ييكسيانغ (أبريل 1999). "حسابات البنية الإلكترونية المترابطة من المبادئ الأولى للجزيئات الكبيرة". مجلة الكيمياء الفيزيائية أ . 103 (13): 1913-1928 . Bibcode : 1999JPCA..103.1913F . doi : 10.1021/jp9825157 .
- ↑ لادو، ف.؛ لومبا، إ.؛ لومبارديرو، م. (1995). "خوارزمية المعادلة التكاملية لسوائل الجزيئات غير المتجانسة تمامًا" (ملف PDF) . مجلة الفيزياء الكيميائية . 103 (1): 481. Bibcode : 1995JChPh.103..481L . doi : 10.1063/1.469615 .
روابط خارجية
- برامج الكيمياء الحاسوبية
- برامج تجارية احتكارية لنظام لينكس