قائمة الشفرات الوراثية
على الرغم من وجود أوجه تشابه كثيرة، فإن أجزاءً مختلفة من شجرة الحياة تستخدم شفرات وراثية مختلفة قليلاً . [ 1 ] عند ترجمة الجينوم إلى بروتين، يُعد استخدام الشفرة الوراثية الصحيحة أمرًا بالغ الأهمية. تُعد الشفرات الميتوكوندرية أمثلة معروفة نسبيًا على هذا التباين. يتبع جدول الترجمة أدناه الترقيم والتسمية المعتمدين من قِبل المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI). [ 2 ] اكتشف شولجينا وإيدي أربع شفرات وراثية بديلة جديدة في الجينومات البكتيرية باستخدام برنامجهما لتعيين الكودونات Codetta، وتم التحقق من صحتها من خلال تحليل مضادات الكودونات وعناصر التطابق في الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). [ 3 ] هذه الشفرات غير معتمدة حاليًا في المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI)، ولكنها مرقمة هنا من 34 إلى 37، وموضحة في الجدول أدناه.
- الكود القياسي
- الشفرة الميتوكوندرية للفقاريات
- الشفرة الميتوكوندرية للخميرة
- الشفرة الميتوكوندرية للعفن، والبروتوزوا، واللاسعات، وشفرة الميكوبلازما/السبيروبلازما
- الشفرة الميتوكوندرية لللافقاريات
- الشفرة النووية للهدبيات ، والدياتومات، والهيكساميتا
- تم حذف رمز الكينيتوبلاست ؛ انظر الجدول 4.
- تم الحذف، انظر الجدول 1.
- الشفرة الميتوكوندرية لشوكيات الجلد والديدان المسطحة
- الشفرة النووية اليوبلوتية
- الشفرة البلاستيدية للبكتيريا والعتائق والنباتات
- الشفرة النووية البديلة للخميرة
- الشفرة الميتوكوندرية للأسيديا
- الشفرة الميتوكوندرية البديلة للديدان المسطحة
- الشفرة النووية لبليفاريزما [ 4 ]
- الشفرة الميتوكوندرية للطحالب الخضراء
- (لا أحد)
- (لا أحد)
- (لا أحد)
- (لا أحد)
- الشفرة الميتوكوندرية للديدان المثقوبة
- كود الميتوكوندريا Scenedesmus obliquus
- الشفرة الميتوكوندرية لـ Thraustochytrium
- الشفرة الميتوكوندرية لـ Pterobranchia
- القسم المرشح SR1 ورمز البكتيريا الرشيقة
- الشفرة النووية لـ Pachysolen tannophilus
- الشفرة النووية المتبقية من النواة
- الشفرة النووية لـ Condylostoma
- الشفرة النووية للميزودينيوم
- الشفرة النووية المحيطية
- الشفرة النووية للبلاستوكريتيديا
- شفرة البلاستيدات الخاصة بعائلة Balanophoraceae [ 4 ] [ 5 ]
- الشفرة الميتوكوندرية لعائلة سيفالوديسيداي
- رمز الإنتيروسوما [ 3 ]
- شفرة الببتاسيتوباكتر [ 3 ]
- رمز Anaerococcus و Onthovivens [ 3 ]
- الشفرة الوراثية لبكتيريا Absconditabacterales [ 3 ]
تتضمن جداول الترجمة البديلة (من 2 إلى 37) عمليات إعادة تعيين الكودونات التي تم تلخيصها في جداول الكودونات الخاصة بالحمض النووي DNA والحمض النووي الريبي RNA .
ملخص الجدول
مقارنة جداول الترجمة البديلة لجميع الكودونات (باستخدام رموز الأحماض الأمينية IUPAC ):
| الخصائص البيوكيميائية للأحماض الأمينية | غير قطبي | بولار | أساسي | حمضي | إنهاء العملية: كودون التوقف * |
| الكودون | معرف جدول الترجمة (انظر أعلاه) | ||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 | 33 | 34 | 35 | 36 | 37 | |
| TTT | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F |
| TTC | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F | F |
| TTA | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | * | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل |
| تي تي جي | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل |
| TCT | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
| TCC | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
| TCA | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | * | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
| لعبة بطاقات التداول | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
| TAT | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
| تاك | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
| تي إيه إيه | * | * | * | * | * | سؤال | * | * | * | * | * | Y | * | * | * | * | * | * | * | * | سؤال | سؤال | Y | هـ | هـ | * | Y | * | * | * | * |
| الوسم | * | * | * | * | * | سؤال | * | * | * | * | * | * | سؤال | ل | * | ل | * | * | * | * | سؤال | سؤال | Y | هـ | هـ | دبليو | * | * | * | * | * |
| TGT | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج |
| تي جي سي | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج | ج |
| TGA | * | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | * | دبليو | ج | * | * | دبليو | دبليو | * | * | دبليو | * | * | دبليو | جي | * | دبليو | دبليو | * | * | دبليو | * | دبليو | * | * | * | جي |
| TGG | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو | دبليو |
| CTT | ل | ل | تي | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل |
| سي تي سي | ل | ل | تي | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل |
| دعوة للعمل | ل | ل | تي | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل |
| CTG | ل | ل | تي | ل | ل | ل | ل | ل | ل | S | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | أ | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل | ل |
| CCT | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P |
| CCC | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P |
| CCA | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P |
| مجموعة التكليف السريري | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P | P |
| قطة | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح |
| CAC | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح | ح |
| هيئة الطيران المدني | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال |
| مراقب الحسابات المركزي | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال | سؤال |
| ضريبة أرباح رأس المال | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
| CGC | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R |
| محاسب قانوني معتمد | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | دبليو |
| CGG | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | R | سؤال | دبليو | دبليو |
| AT&T | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا |
| مراقبة الحركة الجوية | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا |
| ATA | أنا | م | م | أنا | م | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | م | أنا | أنا | أنا | م | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا | أنا |
| ATG | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م | م |
| يمثل | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي |
| ACC | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي |
| قانون الرعاية الصحية الميسرة | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي |
| ACG | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي | تي |
| AAT | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال |
| التواصل المعزز والبديل | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال | شمال |
| AAA | ك | ك | ك | ك | ك | ك | شمال | ك | ك | ك | ك | شمال | ك | ك | شمال | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك |
| مساعد المدعي العام | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك | ك |
| AGT | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
| AGC | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
| أجا | R | * | R | R | S | R | S | R | R | R | جي | S | R | R | S | R | R | S | R | R | R | R | R | R | R | R | S | R | R | R | R |
| AGG | R | * | R | R | S | R | S | R | R | R | جي | S | R | R | S | R | R | ك | R | R | R | R | R | R | R | R | ك | م | R | R | R |
| جي تي تي | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
| GTC | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
| لعبة GTA | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
| GTG | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
| GCT | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ |
| مجلس التعاون الخليجي | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ |
| GCA | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ |
| جي سي جي | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ | أ |
| بوابة | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د |
| GAC | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د | د |
| رابطة الألعاب الرياضية الغيلية | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ |
| أسكت | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ | هـ |
| جي جي تي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي |
| جي جي سي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي |
| جي جي إيه | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي |
| GGG | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي | جي |
ملحوظات
تتمتع ثلاثة جداول ترجمة بوضع خاص:
- تم دمج الجدول 7 الآن في جدول الترجمة 4.
- تم دمج الجدول 8 مع الجدول 1؛ جميع اختلافات البلاستيدات الخضراء النباتية ناتجة عن تعديل الحمض النووي الريبي.
لا تأخذ قائمة الشفرات الجينية التي يقدمها المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) في الاعتبار الحمضين الأمينيين "الخاصين" اللذين يُنتجان البروتين:
- يتطلب إدخال السيلينوسيستين (Sec أو U) آلية ترجمة معقدة نوعًا ما، تشمل عامل استطالة خاصًا وعنصر SECIS في الحمض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) . انظر: بروتين السيلينيوم § الإنتاج . [ 6 ]
- لا يتطلب إدخال البيروليسين (Pyl أو O) أي آلية خاصة طالما أن Pyl-tRNA Pyl متوفر. ونتيجة لذلك، يمكن أن يظهر في البروتينات من خلال طفرات خاطئة محايدة ، وقد ظهر بالفعل . [ 7 ]
تلعب آليات أخرى دورًا في عملية التخليق الحيوي للبروتين ، مثل التعديل ما بعد النسخ .
مراجع
- ↑ واتانابي، كيميتسونا؛ سوزوكي، تسوتومو (2001). "الشفرة الوراثية ومتغيراتها". موسوعة علوم الحياة . doi : 10.1038/npg.els.0000810 . ISBN 047001590X.
- ↑ إلزانوفسكي، أندريه؛ جيم أوستيل (7 يوليو 2010). "الشفرات الوراثية" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية . تم الاطلاع عليه في 6 مايو 2013 .
- 1 2 3 4 5 شولغينا، يكاترينا؛ إيدي، شون ر. (9 نوفمبر 2021). "فحص حاسوبي للرموز الجينية البديلة في أكثر من 250,000 جينوم" . eLife . 10 e71402 . doi : 10.7554/eLife.71402 . PMC 8629427. PMID 34751130 .
- 1 2 "جدول الشفرة الوراثية NCBI بتنسيق ASN-1، مع سجل التغييرات: gc.prt" . GitHub .
- ↑ سو، هوي-جيون؛ باركمان، تود جيه؛ هاو، ويلونغ؛ جونز، صموئيل إس؛ ناومان، جوليا؛ سكيبينغتون، إليزابيث؛ وافولا، إريك كيه؛ هو، جير-مينغ؛ بالمر، جيفري دي؛ ديبامفيليس، كلود دبليو. (15 يناير 2019). "شفرة وراثية جديدة وغنى قياسي بالأدينين والثايمين في جينوم البلاستيدات المختزل للغاية لنبات بالانوفورا الطفيلي الكامل" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 116 (3): 934-943 . Bibcode : 2019PNAS..116..934S . doi : 10.1073/pnas.1816822116 . PMC 6338844. PMID 30598433 .
- ↑ يوان، ج؛ باليورا، س؛ سالازار، ج.س؛ سو، د؛ أودونوغ، ب؛ هون، م.ج؛ كاردوسو، أ.م؛ ويتمان، و.ب؛ سول، د (12 ديسمبر 2006). "تحويل الفوسفوسيرين المعتمد على الحمض النووي الريبي إلى سيلينوسيستين في حقيقيات النوى والعتائق" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 103 (50): 18923-18927 . Bibcode : 2006PNAS..10318923Y . doi : 10.1073/pnas.0609703104 . PMC 1748153. PMID 17142313 .
- ↑ هاينمان، إيلكا يو.؛ أودونوغ، باتريك؛ مادينجر، كاثرين؛ بينر، جاك؛ رانداو، لينارت؛ نورين، كريستوفر جيه.؛ سول، ديتر (15 ديسمبر 2009). "ظهور البيروليسين في غوانيل ترانسفيراز الهيستيدين في الحمض النووي الريبوزي الناقل عن طريق التطور المحايد" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 106 (50): 21103-21108 . doi : 10.1073/pnas.0912072106 . PMC 2795538. PMID 19965368 .
انظر أيضاً
روابط خارجية
للمزيد من القراءة
- ستيفاني غابرييل ساميت؛ أوغو باستولا وماركوس بورتو (14 يونيو 2010). "مقارنة أحمال الترجمة للرموز الجينية القياسية والبديلة" . BMC Evol Biol . 10 (178): 178. Bibcode : 2010BMCEE..10..178S . doi : 10.1186/1471-2148-10-178 . PMC 2909233. PMID 20546599 .
- ليليانا توركوروما جارسيا؛ ناي ريبيرو ليتي؛ خوان د ألفونزو؛ أوتافيو هنريكي ثيمان (31 يوليو 2007). "آثار التريبانوزوما بروسي تريبتوفانيل-الحمض الريبي النووي النقال إسكات تخليق الحمض النووي الريبي" . م. انست. أوزوالدو كروز . 102 (6). ريو دي جانيرو.
- قوائم متعلقة بعلم الوراثة
- التعبير الجيني
