قائمة الشفرات الوراثية

على الرغم من وجود أوجه تشابه كثيرة، فإن أجزاءً مختلفة من شجرة الحياة تستخدم شفرات وراثية مختلفة قليلاً . [ 1 ] عند ترجمة الجينوم إلى بروتين، يُعد استخدام الشفرة الوراثية الصحيحة أمرًا بالغ الأهمية. تُعد الشفرات الميتوكوندرية أمثلة معروفة نسبيًا على هذا التباين. يتبع جدول الترجمة أدناه الترقيم والتسمية المعتمدين من قِبل المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI). [ 2 ] اكتشف شولجينا وإيدي أربع شفرات وراثية بديلة جديدة في الجينومات البكتيرية باستخدام برنامجهما لتعيين الكودونات Codetta، وتم التحقق من صحتها من خلال تحليل مضادات الكودونات وعناصر التطابق في الحمض النووي الريبوزي الناقل (tRNA). [ 3 ] هذه الشفرات غير معتمدة حاليًا في المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI)، ولكنها مرقمة هنا من 34 إلى 37، وموضحة في الجدول أدناه.

  1. الكود القياسي
  2. الشفرة الميتوكوندرية للفقاريات
  3. الشفرة الميتوكوندرية للخميرة
  4. الشفرة الميتوكوندرية للعفن، والبروتوزوا، واللاسعات، وشفرة الميكوبلازما/السبيروبلازما
  5. الشفرة الميتوكوندرية لللافقاريات
  6. الشفرة النووية للهدبيات ، والدياتومات، والهيكساميتا
  7. تم حذف رمز الكينيتوبلاست ؛ انظر الجدول 4.
  8. تم الحذف، انظر الجدول 1.
  9. الشفرة الميتوكوندرية لشوكيات الجلد والديدان المسطحة
  10. الشفرة النووية اليوبلوتية
  11. الشفرة البلاستيدية للبكتيريا والعتائق والنباتات
  12. الشفرة النووية البديلة للخميرة
  13. الشفرة الميتوكوندرية للأسيديا
  14. الشفرة الميتوكوندرية البديلة للديدان المسطحة
  15. الشفرة النووية لبليفاريزما [ 4 ]
  16. الشفرة الميتوكوندرية للطحالب الخضراء
  17. (لا أحد)
  18. (لا أحد)
  19. (لا أحد)
  20. (لا أحد)
  21. الشفرة الميتوكوندرية للديدان المثقوبة
  22. كود الميتوكوندريا Scenedesmus obliquus
  23. الشفرة الميتوكوندرية لـ Thraustochytrium
  24. الشفرة الميتوكوندرية لـ Pterobranchia
  25. القسم المرشح SR1 ورمز البكتيريا الرشيقة
  26. الشفرة النووية لـ Pachysolen tannophilus
  27. الشفرة النووية المتبقية من النواة
  28. الشفرة النووية لـ Condylostoma
  29. الشفرة النووية للميزودينيوم
  30. الشفرة النووية المحيطية
  31. الشفرة النووية للبلاستوكريتيديا
  32. شفرة البلاستيدات الخاصة بعائلة Balanophoraceae [ 4 ] [ 5 ]
  33. الشفرة الميتوكوندرية لعائلة سيفالوديسيداي
  34. رمز الإنتيروسوما [ 3 ]
  35. شفرة الببتاسيتوباكتر [ 3 ]
  36. رمز Anaerococcus و Onthovivens [ 3 ]
  37. الشفرة الوراثية لبكتيريا Absconditabacterales [ 3 ]

تتضمن جداول الترجمة البديلة (من 2 إلى 37) عمليات إعادة تعيين الكودونات التي تم تلخيصها في جداول الكودونات الخاصة بالحمض النووي DNA والحمض النووي الريبي RNA .

ملخص الجدول

مقارنة جداول الترجمة البديلة لجميع الكودونات (باستخدام رموز الأحماض الأمينية IUPAC ):

الخصائص البيوكيميائية للأحماض الأمينيةغير قطبيبولارأساسيحمضيإنهاء العملية: كودون التوقف *
الكودونمعرف جدول الترجمة (انظر أعلاه)
1234569101112131415162122232425262728293031323334353637
TTTFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFF
TTCFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFF
TTAلللللللللللللللل*لللللللللللللل
تي تي جيللللللللللللللللللللللللللللللل
TCTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
TCCSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
TCASSSSSSSSSSSSSSS*SSSSSSSSSSSSSSS
لعبة بطاقات التداولSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
TATYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYY
تاكYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYYY
تي إيه إيه*****سؤال*****Y********سؤالسؤالYهـهـ*Y****
الوسم*****سؤال******سؤالل*ل****سؤالسؤالYهـهـدبليو*****
TGTججججججججججججججججججججججججججججججج
تي جي سيججججججججججججججججججججججججججججججج
TGA*دبليودبليودبليودبليو*دبليوج**دبليودبليو**دبليو**دبليوجي*دبليودبليو**دبليو*دبليو***جي
TGGدبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليودبليو
CTTللتيلللللللللللللللللللللللللللل
سي تي سيللتيلللللللللللللللللللللللللللل
دعوة للعملللتيلللللللللللللللللللللللللللل
CTGللتيللللللSلللللللللأللللللللللل
CCTPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP
CCCPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP
CCAPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP
مجموعة التكليف السريريPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPP
قطةححححححححححححححححححححححححححححححح
CACححححححححححححححححححححححححححححححح
هيئة الطيران المدنيسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤال
مراقب الحسابات المركزيسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤالسؤال
ضريبة أرباح رأس المالRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRR
CGCRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRR
محاسب قانوني معتمدRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRدبليو
CGGRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRRسؤالدبليودبليو
AT&Tأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأنا
مراقبة الحركة الجويةأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأنا
ATAأناممأنامأناأناأناأناأنامأناأناأنامأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأناأنا
ATGممممممممممممممممممممممممممممممم
يمثلتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتي
ACCتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتي
قانون الرعاية الصحية الميسرةتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتي
ACGتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتيتي
AATشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمال
التواصل المعزز والبديلشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمالشمال
AAAككككككشمالككككشمالككشمالكككككككككككككككك
مساعد المدعي العامككككككككككككككككككككككككككككككك
AGTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
AGCSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
أجاR*RRSRSRRRجيSRRSRRSRRRRRRRRSRRRR
AGGR*RRSRSRRRجيSRRSRRكRRRRRRRRكمRRR
جي تي تيVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVV
GTCVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVV
لعبة GTAVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVV
GTGVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVV
GCTأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأ
مجلس التعاون الخليجيأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأ
GCAأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأ
جي سي جيأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأأ
بوابةددددددددددددددددددددددددددددددد
GACددددددددددددددددددددددددددددددد
رابطة الألعاب الرياضية الغيليةهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـ
أسكتهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـهـ
جي جي تيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجي
جي جي سيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجي
جي جي إيهجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجي
GGGجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجيجي

ملحوظات

تتمتع ثلاثة جداول ترجمة بوضع خاص:

  • تم دمج الجدول 7 الآن في جدول الترجمة 4.
  • تم دمج الجدول 8 مع الجدول 1؛ جميع اختلافات البلاستيدات الخضراء النباتية ناتجة عن تعديل الحمض النووي الريبي.

لا تأخذ قائمة الشفرات الجينية التي يقدمها المركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية (NCBI) في الاعتبار الحمضين الأمينيين "الخاصين" اللذين يُنتجان البروتين:

تلعب آليات أخرى دورًا في عملية التخليق الحيوي للبروتين ، مثل التعديل ما بعد النسخ .

مراجع

  1. واتانابي، كيميتسونا؛ سوزوكي، تسوتومو (2001). "الشفرة الوراثية ومتغيراتها". موسوعة علوم الحياة . doi : 10.1038/npg.els.0000810 . ISBN 047001590X.
  2. إلزانوفسكي، أندريه؛ جيم أوستيل (7 يوليو 2010). "الشفرات الوراثية" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية . تم الاطلاع عليه في 6 مايو 2013 .
  3. 1 2 3 4 5 شولغينا، يكاترينا؛ إيدي، شون ر. (9 نوفمبر 2021). "فحص حاسوبي للرموز الجينية البديلة في أكثر من 250,000 جينوم" . eLife . 10 e71402 . doi : 10.7554/eLife.71402 . PMC 8629427. PMID 34751130 .  
  4. 1 2 "جدول الشفرة الوراثية NCBI بتنسيق ASN-1، مع سجل التغييرات: gc.prt" . GitHub .
  5. سو، هوي-جيون؛ باركمان، تود جيه؛ هاو، ويلونغ؛ جونز، صموئيل إس؛ ناومان، جوليا؛ سكيبينغتون، إليزابيث؛ وافولا، إريك كيه؛ هو، جير-مينغ؛ بالمر، جيفري دي؛ ديبامفيليس، كلود دبليو. (15 يناير 2019). "شفرة وراثية جديدة وغنى قياسي بالأدينين والثايمين في جينوم البلاستيدات المختزل للغاية لنبات بالانوفورا الطفيلي الكامل" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 116 (3): 934-943 . Bibcode : 2019PNAS..116..934S . doi : 10.1073/pnas.1816822116 . PMC 6338844. PMID 30598433 .  
  6. يوان، ج؛ باليورا، س؛ سالازار، ج.س؛ سو، د؛ أودونوغ، ب؛ هون، م.ج؛ كاردوسو، أ.م؛ ويتمان، و.ب؛ سول، د (12 ديسمبر 2006). "تحويل الفوسفوسيرين المعتمد على الحمض النووي الريبي إلى سيلينوسيستين في حقيقيات النوى والعتائق" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 103 (50): 18923-18927 . Bibcode : 2006PNAS..10318923Y . doi : 10.1073/pnas.0609703104 . PMC 1748153. PMID 17142313 .  
  7. هاينمان، إيلكا يو.؛ أودونوغ، باتريك؛ مادينجر، كاثرين؛ بينر، جاك؛ رانداو، لينارت؛ نورين، كريستوفر جيه.؛ سول، ديتر (15 ديسمبر 2009). "ظهور البيروليسين في غوانيل ترانسفيراز الهيستيدين في الحمض النووي الريبوزي الناقل عن طريق التطور المحايد" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم . 106 (50): 21103-21108 . doi : 10.1073/pnas.0912072106 . PMC 2795538. PMID 19965368 .  

انظر أيضاً

للمزيد من القراءة