PSMC5

الوحدة التنظيمية 8 لبروتياز 26S ، والمعروفة أيضًا باسم الوحدة الفرعية Rpt6 لإنزيم AAA-ATPase في بروتيازوم 26S ، هي إنزيم يُشفَّر في البشر بواسطة جين PSMC5 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] يُعد هذا البروتين أحد الوحدات الفرعية الأساسية التسع عشرة لمركب بروتيازوم 19S المُجمَّع بالكامل. [ 8 ] تُشكِّل ست وحدات فرعية من إنزيم AAA-ATPase في بروتيازوم 26S ( Rpt1 ، Rpt2 ، Rpt3 ، Rpt4 ، Rpt5 ، وRpt6 (هذا البروتين))، بالإضافة إلى أربع وحدات فرعية غير ATPase ( Rpn1 ، Rpn2 ، Rpn10 ، و Rpn13 )، المُركَّب الفرعي الأساسي للجسيم التنظيمي 19S لمركب البروتيازوم . [ 8 ]

جين

يشفر جين PSMC5 إحدى وحدات ATPase الفرعية، وهي عضو في عائلة ATPases الثلاثية-A التي تتمتع بنشاط مشابه للبروتينات المرافقة. بالإضافة إلى مشاركتها في وظائف البروتيازوم، قد تشارك هذه الوحدة الفرعية في تنظيم النسخ، إذ ثبت تفاعلها مع مستقبل هرمون الغدة الدرقية ومستقبل الريتينويد X-ألفا. [ 7 ] يتكون جين PSMC5 البشري من 13 إكسونًا ويقع على الشريط الكروموسومي 17q23.3.

بروتين

يبلغ حجم الوحدة التنظيمية 8 لبروتين 26S البشري 45.6 كيلو دالتون، ويتكون من 406 حمض أميني. وتبلغ قيمة الرقم الهيدروجيني النظري المحسوب لهذا البروتين 8.23. [ 9 ]

تجميع معقد

يتكون معقد البروتيازوم 26S عادةً من جسيم أساسي 20S (CP، أو بروتيازوم 20S) وجسيم تنظيمي واحد أو اثنين 19S (RP، أو بروتيازوم 19S) على جانب واحد أو كلا جانبي الجسيم 20S ذي الشكل الأسطواني. يتميز كل من الجسيم الأساسي والجسيمات التنظيمية بخصائص بنيوية ووظائف بيولوجية مختلفة. باختصار، يُظهر معقد 20S ثلاثة أنواع من الأنشطة البروتينية، تشمل أنشطة شبيهة بالكاسبيز، وأخرى شبيهة بالتربسين، وثالثة شبيهة بالكيموتريبسين. تقع هذه المواقع النشطة للتحلل البروتيني في الجانب الداخلي لحجرة تتكون من أربع حلقات متراصة من وحدات 20S الفرعية، مما يمنع التفاعل العشوائي بين البروتين والإنزيم والتحلل غير المنضبط للبروتين. تستطيع الجسيمات التنظيمية 19S التعرف على البروتين الموسوم باليوبيكويتين كركيزة للتحلل، وفك طي البروتين إلى شكل خطي، وفتح بوابة الجسيم الأساسي 20S، وتوجيه الركيزة إلى حجرة التحلل البروتيني. لتلبية هذا التعقيد الوظيفي، تحتوي الجسيمة التنظيمية 19S على 18 وحدة فرعية أساسية على الأقل. يمكن تصنيف هذه الوحدات الفرعية إلى فئتين بناءً على اعتمادها على الأدينوسين ثلاثي الفوسفات (ATP): وحدات فرعية معتمدة على ATP ووحدات فرعية غير معتمدة على ATP. وفقًا لتفاعلات البروتين والخصائص الطوبولوجية لهذا المركب متعدد الوحدات الفرعية، تتكون الجسيمة التنظيمية 19S من قاعدة وغطاء. تتكون القاعدة من حلقة من ستة إنزيمات ATPase من نوع AAA (الوحدات الفرعية Rpt1-6، وفقًا للتسمية المنهجية) وأربع وحدات فرعية غير ATPase ( Rpn1 ، Rpn2 ، Rpn10 ، و Rpn13 ). بالتالي، تُعد الوحدة الفرعية التنظيمية الرابعة للبروتياز 26S (Rpt2) مكونًا أساسيًا لتكوين القاعدة في الجسيمة التنظيمية 19S. لتجميع معقد القاعدة الفرعي 19S، حددت أربع مجموعات بحثية بشكل مستقل أربع مجموعات من البروتينات المرافقة المحورية للتجميع (Hsm3/S5b، وNas2/P27، وNas6/P28، وRpn14/PAAF1، وفقًا لتسميتها في الخميرة/الثدييات). [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] ترتبط جميع هذه البروتينات المرافقة المخصصة لقواعد جسيم 19S التنظيمي بوحدات ATPase الفرعية الفردية عبر المناطق الطرفية C. على سبيل المثال، يرتبط Hsm3/S5b بالوحدة الفرعية Rpt1 وRpt2 (هذا البروتين)، ويرتبط Nas2/p27 بالوحدة الفرعية Rpt5 ، ويرتبط Nas6/p28 بالوحدة الفرعية Rpt3 ، ويرتبط Rpn14/PAAAF1 بالوحدة الفرعية Rpt6 (هذا البروتين)، على التوالي. بعد ذلك، تتشكل ثلاث وحدات تجميع وسيطة على النحو التالي: وحدة Nas6/p28-Rpt3-Rpt6-Rpn14/PAAF1، ووحدة Nas2/p27-Rpt4-Rpt5، ووحدة Hsm3/S5b-Rpt1-Rpt2-Rpn2. في النهاية، تتجمع هذه الوحدات الثلاث معًا لتشكيل الحلقة السداسية غير المتجانسة المكونة من 6 أطلس مع Rpn1. تشير الإضافة النهائية لـ Rpn13 إلى اكتمال تجميع المركب الفرعي لقاعدة 19S.8 ]

وظيفة

يُعدّ مُركّب البروتيازوم (البروتيازوم 26S) آليةً أساسيةً في الحفاظ على استتباب البروتينات الخلوية، إذ يُشكّل ما يقارب 70% من عمليات التحلل البروتيني داخل الخلايا . [ 16 ] وبناءً على ذلك، يجب إزالة البروتينات المطوية بشكل خاطئ والبروتينات التالفة باستمرار لإعادة تدوير الأحماض الأمينية اللازمة لتخليق بروتينات جديدة. في الوقت نفسه، تؤدي بعض البروتينات التنظيمية الرئيسية وظائفها البيولوجية عبر التحلل الانتقائي. علاوة على ذلك، تُهضم البروتينات إلى ببتيدات لعرض مستضدات معقد التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الأولى (MHC class I). ولتلبية هذه المتطلبات المعقدة في العمليات البيولوجية عبر التحلل البروتيني المكاني والزماني، يجب التعرّف على ركائز البروتين، واستقطابها، ثم تحللها بطريقة مُحكمة. ولذلك، يمتلك الجسيم التنظيمي 19S مجموعةً من القدرات المهمة لمواجهة هذه التحديات الوظيفية. وللتعرّف على البروتين كركيزة مُحددة، يحتوي مُركّب 19S على وحدات فرعية قادرة على التعرّف على البروتينات التي تحمل علامة تحلل خاصة، وهي اليوبيكويتين. كما أنها تحتوي على وحدات فرعية يمكنها الارتباط بالنيوكليوتيدات (مثل ATPs) لتسهيل الارتباط بين جسيمات 19S و 20S، وكذلك لإحداث تغييرات في تأكيد النهايات C للوحدة الفرعية ألفا التي تشكل مدخل الركيزة لمركب 20S.

تتجمع وحدات ATPases الفرعية في حلقة سداسية بتسلسل Rpt1–Rpt5–Rpt4–Rpt3–Rpt6–Rpt2، والتي تتفاعل مع الحلقة ألفا السباعية للجسيم الأساسي 20S، وتُنشئ واجهة غير متناظرة بين 19S RP و20S CP. [ 17 ] [ 18 ] تندمج ثلاثة ذيول طرفية كربونية تحمل أنماط HbYX لوحدات Rpt ATPases المختلفة في جيوب بين وحدتين فرعيتين ألفا محددتين من CP، وتنظم فتح بوابات القنوات المركزية في حلقة ألفا CP. [ 19 ] [ 20 ] أظهرت الأدلة أن الوحدة الفرعية Rpt5 من إنزيم ATPase، إلى جانب وحدات فرعية أخرى من البروتيازوم 19S المُيوبيكويتينية ( Rpn13 ، Rpn10 ) وإنزيم إزالة اليوبيكويتين Uch37، يمكن أن تخضع لعملية اليوبيكويتين في الموقع بواسطة إنزيمات اليوبيكويتين المرتبطة بالبروتيازوم. ويمكن أن يُنظّم يوبيكويتين الوحدات الفرعية للبروتيازوم نشاط البروتيازوم استجابةً لتغير مستويات اليوبيكويتين الخلوية. [ 21 ]

التفاعلات

ثبت أن PSMC5 يتفاعل مع:

الأطفال المصابون بطفرات PSMC5

حتى عام ٢٠٢١، لم يُسجّل سوى ١٨ حالة لأطفال مصابين بطفرات في جين PSMC5. توجد مؤسسة واحدة تُجري أبحاثًا على الأطفال المصابين بهذه الطفرات، تُدعى مؤسسة PSMC5 ( www.psmc5.org ). تهدف المؤسسة إلى إيجاد علاجات وفهم كيفية معالجة المشكلات المرتبطة بهذه الطفرات. وتشمل الآثار الشائعة تأخر النمو، بدءًا من تأخر الحركة وصولًا إلى ضعف القدرة على التعبير اللغوي.

مراجع

  1. 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000087191 Ensembl ، مايو 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000020708 Ensembl ، مايو 2017
  3. "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  4. "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
  5. تاناهاشي ن، سوزوكي م، فوجيوارا ت، تاكاهاشي إ، شيمبارا ن، تشونغ تش، تاناكا ك (مارس 1998). "التحديد الكروموسومي والتحليل المناعي لعائلة من إنزيمات ATPases البروتيازومية 26S البشرية". مجلة بحوث الاتصالات في الكيمياء الحيوية والفيزياء الحيوية . 243 (1): 229-232 . doi : 10.1006/bbrc.1997.7892 . PMID 9473509 . 
  6. هويل جيه، تان كيه إتش، فيشر إي إم (مارس 1997). "تحديد موقع الجينات المشفرة لاثنين من أعضاء عائلة AAA أحادية النطاق البشري: PSMC5 (بروتين التفاعل مع مستقبل هرمون الغدة الدرقية، TRIP1) وPSMC3 (بروتين ربط Tat، TBP1)". علم الوراثة البشرية . 99 (2): 285-288 . doi : 10.1007/s004390050356 . PMID 9048938. S2CID 29818936 .  
  7. 1 2 "Entrez Gene: PSMC5 proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 5" .
  8. 1 2 3 غو زد سي، إينينكل سي (ديسمبر 2014). "تجميع البروتيازوم" . علوم الحياة الخلوية والجزيئية . 71 (24): 4729-4745 . doi : 10.1007 / s00018-014-1699-8 . PMC 11113775. PMID 25107634. ​​S2CID 15661805 .   
  9. "Uniprot: P62195 - PRS8_HUMAN" .
  10. لو تاليك ب، بارو إم بي، غيروا ر، كاريه ت، بيروش أ (فبراير 2009). "يشارك Hsm3/S5b في مسار تجميع الجسيم التنظيمي 19S للبروتيازوم" . الخلية الجزيئية . 33 (3): 389-399 . doi : 10.1016/j.molcel.2009.01.010 . PMID 19217412 . 
  11. فوناكوشي م، تومكو ر.ج، كوباياشي هـ، هوخستراسر م (مايو 2009). "تتحكم بروتينات التجميع المتعددة في التكوين الحيوي لقاعدة جسيم تنظيم البروتيازوم" . الخلية . 137 ( 5): 887-99 . doi : 10.1016/j.cell.2009.04.061 . PMC 2718848. PMID 19446322 .  
  12. بارك إس، رولوفس جيه، كيم دبليو، روبرت جيه، شميدت إم، جيجي إس بي، فينلي دي (يونيو 2009). " يتم توجيه التجميع السداسي لإنزيمات ATPases البروتيازومية من خلال نهاياتها الكربوكسيلية" . نيتشر . 459 (7248): 866-70 . Bibcode : 2009Natur.459..866P . doi : 10.1038/nature08065 . PMC 2722381. PMID 19412160 .  
  13. رولوفس ج، بارك س، هاس و، تيان ج، ماكاليستر ف.إ، هو ي، لي ب.ه، تشانغ ف، شي ي، غيغي س.ب، فينلي د (يونيو 2009). "مسار تجميع الجسيمات التنظيمية للبروتيازوم بوساطة البروتينات المرافقة" . نيتشر . 459 (7248): 861-865 . Bibcode : 2009Natur.459..861R . doi : 10.1038/nature08063 . PMC 2727592. PMID 19412159 .  
  14. سايكي واي، توه-إي إيه، كودو تي، كاوامورا إتش، تاناكا كيه (مايو 2009). "بروتينات متعددة تتفاعل مع البروتيازوم تساعد في تجميع الجسيم التنظيمي 19S في الخميرة" . مجلة الخلية . 137 (5): 900-913 . doi : 10.1016/j.cell.2009.05.005 . PMID 19446323. S2CID 14151131 .  
  15. كانيكو تي، هامازاكي جيه، إيمورا إس، ساساكي كيه، فوروياما كيه، ناتسومي تي، تاناكا كيه، موراتا إس (مايو 2009). " مسار تجميع المُركّب الفرعي القاعدي للبروتيازوم في الثدييات يتوسطه العديد من البروتينات المرافقة المتخصصة" . مجلة Cell . 137 (5): 914-925 . doi : 10.1016/j.cell.2009.05.008 . PMID 19490896. S2CID 18551885 .  
  16. روك كيه إل، غرام سي، روثستين إل، كلارك كيه، شتاين آر، ديك إل، هوانغ دي، غولدبيرغ إيه إل (سبتمبر 1994). "مثبطات البروتيازوم تمنع تحلل معظم بروتينات الخلية وتكوين الببتيدات المعروضة على جزيئات معقد التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الأولى". مجلة الخلية . 78 (5): 761-771 . doi : 10.1016/s0092-8674(94)90462-6 . PMID 8087844. S2CID 22262916 .  
  17. تيان جي، بارك إس، لي إم جيه، هوك بي، ماكاليستر إف، هيل سي بي، جيجي إس بي، فينلي دي (نوفمبر 2011). "واجهة غير متناظرة بين الجسيمات التنظيمية والأساسية للبروتيازوم" . مجلة نيتشر للبيولوجيا التركيبية والجزيئية . 18 (11): 1259-1267 . doi : 10.1038/nsmb.2147 . PMC 3210322. PMID 22037170 .  
  18. لاندر جي سي، إسترين إي، ماتيسكيلا إم إي، باشور سي، نوغاليس إي، مارتن إيه (فبراير 2012). " البنية الكاملة للوحدات الفرعية للجسيم التنظيمي للبروتيازوم" . نيتشر . 482 (7384): 186-191 . Bibcode : 2012Natur.482..186L . doi : 10.1038/nature10774 . PMC 3285539. PMID 22237024 .  
  19. جيليت تي جي، كومار بي، طومسون دي، سلوتر سي إيه، ديمارتينو جي إن (نوفمبر 2008). " أدوار متباينة لنهايات الكربوكسيل لوحدات AAA الفرعية من PA700 (منظم 19S) في التجميع غير المتماثل وتنشيط البروتيازوم 26S" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 283 (46): 31813-31822 . doi : 10.1074/jbc.M805935200 . PMC 2581596. PMID 18796432 .  
  20. سميث دي إم، تشانغ إس سي، بارك إس، فينلي دي، تشينغ واي، غولدبيرغ إيه إل (سبتمبر 2007). "ارتباط النهايات الكربوكسيلية لإنزيمات ATPases البروتيازومية في الحلقة ألفا للبروتيازوم 20S يفتح بوابة دخول الركيزة" . الخلية الجزيئية . 27 (5): 731-744 . doi : 10.1016/ j.molcel.2007.06.033 . PMC 2083707. PMID 17803938 .  
  21. ^ جاكوبسون أد، ماكفادين أ، وو زي، بنغ جي، ليو سي دبليو (يونيو 2014). "التنظيم التلقائي للبروتيزوم 26S عن طريق التواجد في الموقع" . البيولوجيا الجزيئية للخلية . 25 (12): 1824–35 . دوى : 10.1091/mbc.E13-10-0585 . بمك 4055262 . بميد 24743594 .  
  22. إيشيزوكا تي، ساتوه تي، موندين تي، شيبوساوا إن، هاشيدا تي، يامادا إم، موري إم (أغسطس 2001). "بروتين ربط Tat-1 لفيروس نقص المناعة البشرية من النوع 1 هو منشط نسخ مشترك خاص بمستقبلات هرمون الغدة الدرقية" . علم الغدد الصماء الجزيئي . 15 (8): 1329-1343 . doi : 10.1210/mend.15.8.0680 . PMID 11463857 . 
  23. Rual JF، Venkatesan K، Hao T، Hirozane-Kishikawa T، Dricot A، Li N، Berriz GF، Gibbons FD، Dreze M، Ayivi-Guedehoussou N، Klitgord N، Simon C، Boxem M، Milstein S، Rosenberg J، Goldberg DS، Zhang LV، Wong SL، Franklin G، Li S، Albala JS، Lim J، Fraughton C، Llamosas E، Cevik S، Bex C، Lamesch P، Sikorski RS، Vandenhaute J، Zoghbi HY، Smolyar A، Bosak S، Sequerra R، Doucette-Stamm L، Cusick ME، Hill DE، Roth FP، Vidal M (أكتوبر 2005). “نحو خريطة بروتينية لشبكة التفاعل بين البروتين والبروتين البشري”. طبيعة . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038 / nature04209 . PMID 16189514. S2CID 4427026 .  
  24. إيوينغ آر إم، تشو بي، إليسما إف، لي إتش، تايلور بي، كليمي إس، ماك بروم-سيراجيفسكي إل، روبنسون إم دي، أوكونور إل، لي إم، تايلور آر، دارسي إم، هو واي، هيلبوت إيه، مور إل، تشانغ إس، أورناتسكي أو، بوخمان واي في، إيثيير إم، شينغ واي، فاسيلسكو جيه، أبو فرحة إم، لامبرت جيه بي، دويل إتش إس، ستيوارت آي آي، كويل بي، هوغ كيه، كولويل كيه، جلادويش كيه، موسكات بي، كيناش آر، آدامز إس إل، موران إم إف، مورين جي بي، توبالوغلو تي، فيجيس دي (2007). "رسم خرائط واسعة النطاق لتفاعلات البروتين-بروتين البشري بواسطة مطياف الكتلة" . بيولوجيا الأنظمة الجزيئية . 3 : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .  
  25. سو ك، يانغ إكس، روس إم دي، باترسون إيه جيه، كودلو جيه إي (يونيو 2000). "يشارك بروتين Sug1/p45 البشري في التحلل البروتيني لـ Sp1 المعتمد على البروتيازوم" . مجلة الكيمياء الحيوية. 348. الجزء 2 (2): 281-289 . doi : 10.1042/0264-6021:3480281 . PMC 1221064. PMID 10816420 .  
  26. وانغ واي تي، تشوانغ جيه واي، شين إم آر، يانغ دبليو بي، تشانغ دبليو سي، هونغ جيه جيه (يوليو 2008). "يؤدي تعديل بروتين التخصص 1 بواسطة السومو إلى زيادة تحلله عن طريق تغيير موضعه وزيادة عملية التحلل البروتيني لبروتين التخصص 1". مجلة البيولوجيا الجزيئية 380 (5): 869-885 . doi : 10.1016/j.jmb.2008.05.043 . PMID 18572193 . 
  27. ويدا جي، روسينيول إم، فريزر آر إيه، وينكلر جي إس، فيرمولين دبليو، فان ت فير إل جيه، ما إل، هويجماكرز جيه إتش، إيجلي جيه إم (يونيو 1997). "تتفاعل الوحدة الفرعية XPB لعامل الإصلاح/النسخ TFIIH مباشرةً مع SUG1، وهي وحدة فرعية من البروتيازوم 26S وعامل نسخ محتمل" . مجلة أبحاث الأحماض النووية . 25 (12): 2274-2283 . doi : 10.1093/nar/25.12.2274 . PMC 146752. PMID 9173976 .  

للمزيد من القراءة