الزائفة الكلورورافية

تُستخدم بكتيريا Pseudomonas chlororaphis كملقّح للتربة في الزراعة والبستنة. ويمكنها أن تعمل كعامل مكافحة بيولوجية ضد بعض مسببات الأمراض الفطرية النباتية عن طريق إنتاج مضادات حيوية من نوع الفينوزين . [ 1 ] وبناءً على تحليل الحمض النووي الريبوزي 16S ، تم تصنيف أنواع مشابهة ضمن مجموعتها. [ 2 ]

في دراسة جينومية مقارنة ودراسة جينومية تطورية أُجريت عام 2020، تم تحليل 494 جينومًا كاملًا من جنس الزائفة بأكمله ، منها 43 سلالة من نوع الزائفة الكلورورافية . [ 3 ] في هذه الدراسة، تم تحديد نوع الزائفة الكلورورافية بناءً على أحاديته الوراثية ومعيار متوسط ​​تطابق النيوكليوتيدات. يقع هذا النوع ضمن مجموعة أنواع الزائفة المتألقة الأوسع ، كما تم تحديده في [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] . تراوح عدد البروتينات ومحتوى GC لسلالات هذا النوع بين 5599 و6401 (المتوسط: 6076) وبين 61.9 و64% (المتوسط: 62.8%) على التوالي. [ 3 ] بالإضافة إلى ذلك، احتوت البروتينات الـ 43 لبكتيريا Pseudomonas chlororaphis على 3587 بروتينًا أساسيًا (مشتركة بين جميع سلالات هذا النوع)، منها 11 بروتينًا أساسيًا خاصًا بهذه المجموعة، وبالتالي غائبة عن جميع سلالات جنس Pseudomonas الأخرى . [ 3 ] اثنان من هذه البروتينات الأساسية الـ 11 الخاصة بالمجموعة هما بكتيريوسين من عائلة الهولين وبروتين حيوي شبيه بالميتوميسين، وقد يمنحانها ميزة تنافسية ضد أنواع البكتيريا الأخرى التي تستعمر الجذور. [ 3 ]

مجموعة Pseudomonas chlororaphis

تُطلق بكتيريا Pseudomonas chlororaphis اسمها على مجموعة فرعية ضمن جنس Pseudomonas . أما الأعضاء الآخرون في المجموعة الفرعية P. chlororaphis فهم P. aurantiaca و P. aureofaciens و P. fragi و P. lundensis و P. taetrolens . [ 2 ]

مراجع

  1. تشين-أ-وونغ تي إف، وآخرون  (2000). "استعمار الجذور بواسطة بكتيريا Pseudomonas chlororaphis PCL1391 المنتجة للفينزين-1-كربوكساميد ضروري للمكافحة البيولوجية لمرض تعفن جذور الطماطم" . تفاعلات النباتات مع الميكروبات الجزيئية . 13 (12): 1340-1345 . Bibcode : 2000MPMI...13.1340C . doi : 10.1094/MPMI.2000.13.12.1340 . hdl : 1887/62881 . PMID 11106026 . 
  2. 1 2 أنزاي؛ كيم، هـ؛ بارك، جيه واي؛ واكاباياشي، هـ؛ أويزو، هـ؛ وآخرون . (يوليو 2000). "التصنيف التطوري للبكتيريا الزائفة بناءً على تسلسل الحمض النووي الريبوزي 16S". المجلة الدولية لعلم الأحياء الدقيقة المنهجي والتطوري . 50 (4): 1563-1589 . doi : 10.1099/00207713-50-4-1563 . PMID 10939664 .  
  3. 1 2 3 4 5 نيكولايديس، ماريوس؛ موسيالوس، ديميتريس؛ أوليفر، ستيفن ج.؛ أموتزياس، غريغوريوس د. (24 يوليو 2020). "تحليل مقارن للبروتينات الأساسية بين المجموعات التطورية الرئيسية لبكتيريا الزائفة يكشف عن تكيفات خاصة بالأنواع لبكتيريا الزائفة الزنجارية وبكتيريا الزائفة الكلورورافية" . التنوع . 12 (8): 289. Bibcode : 2020Diver..12..289N . doi : 10.3390/d12080289 . hdl : 11615/77193 . ISSN 1424-2818 . 
  4. موليه، ماجدالينا؛ لالوكات، خورخي؛ غارسيا-فالديس، إيلينا (مارس 2010). "تحليل أنواع الزائفة باستخدام تسلسل الحمض النووي" . علم الأحياء الدقيقة البيئية . 12 (6): 1513-1530 . Bibcode : 2010EnvMi..12.1513M . doi : 10.1111/j.1462-2920.2010.02181.x . PMID 20192968 . 
  5. سكيلز، بريتان س.؛ ديكسون، روبرت ب.؛ ليبوما، جون ج.؛ هافناغل، غاري ب. (أكتوبر 2014). "علم الأحياء الدقيقة، وعلم الجينوم، والأهمية السريرية لمجموعة أنواع الزائفة المتألقة، وهي مستعمرة غير معروفة للإنسان" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة السريرية . 27 (4): 927-948 . doi : 10.1128/CMR.00044-14 . ISSN 0893-8512 . PMC 4187640. PMID 25278578 .