ريبونوميكس
الريبونوميكس هو دراسة الأحماض النووية الريبية ( RNAs ) المرتبطة ببروتينات ربط الحمض النووي الريبي (RBPs). تم تقديم المصطلح من قبل روبرت سيدرجرين وزملائه [1] الذين استخدموا أداة بحث معلوماتية حيوية لاكتشاف ريبوزيمات جديدة وأنماط الحمض النووي الريبي الموجودة أصلاً في فيروس نقص المناعة البشرية . الريبونوميكس، مثل علم الجينوم أو علم البروتينات ، هو النهج واسع النطاق وعالي الإنتاجية لتحديد مجموعات فرعية من الحمض النووي الريبي من خلال ارتباطها بالبروتينات في الخلايا. نظرًا لأن العديد من الحمض النووي الريبي الرسول (mRNAs) مرتبط بعمليات متعددة، فإن هذه التقنية تقدم آلية سهلة لدراسة العلاقة بين الأنظمة المختلفة داخل الخلايا . تنظم بدائيات النوى الجينات المشتركة في العمليات الخلوية عبر أوبيرون متعدد السيسترون . نظرًا لأن النسخ في حقيقيات النوى ينتج بروتينات مشفرة للحمض النووي الريبي الرسول بطريقة أحادية السيسترون ، فيجب التعبير عن العديد من منتجات الجينات في نفس الوقت (انظر التعبير الجيني ) وترجمتها في وقت محدد. يُعتقد أن البروتينات الرابطة للحمض النووي الريبي [ بواسطة من؟ ] لتكون الجزيئات التي تنظم هذه الرسائل جسديًا وكيميائيًا إلى مواقع خلوية مختلفة حيث يمكن ترجمتها أو تدهورها أو تخزينها. لذلك يُعتقد أن دراسة النسخ المرتبطة بـ RBPs [ بواسطة من؟ ] مهمة في حقيقيات النوى كآلية لتنظيم الجينات المنسقة . العمليات الكيميائية الحيوية المحتملة التي تفسر هذا التنظيم هي التحلل السريع / المتأخر للحمض النووي الريبي. بالإضافة إلى التأثير على نصف عمر الحمض النووي الريبي، يُعتقد أيضًا أن معدلات الترجمة تتغير من خلال تفاعلات الحمض النووي الريبي والبروتين. عائلة ELAV في ذبابة الفاكهة ، [2] وعائلة Puf [3] في الخميرة ، وبروتينات La وRo و [4] وFMR [5] البشرية هي أمثلة معروفة على RBPs، مما يُظهر الأنواع والعمليات المتنوعة التي يرتبط بها تنظيم الجينات بعد النسخ.
انظر أيضا
مراجع
- ^ Bourdeau V, Ferbeyre G, Pageau M, Paquin B, Cedergren R (نوفمبر 1999). "توزيع أنماط الحمض النووي الريبي في التسلسلات الطبيعية". Nucleic Acids Res . 27 (22): 4457– 67. doi :10.1093/nar/27.22.4457. PMC 148730. PMID 10536156 .
- ^ "عائلة إيلاف" . تم الاسترجاع في 30 أغسطس 2019 .
- ^ Gerber AP, Herschlag D, Brown PO (مارس 2004). "الارتباط الواسع بين mRNAs المرتبطة وظيفيًا وخلويًا وبروتينات ربط RNA لعائلة Puf في الخميرة". PLOS Biol . 2 (3): E79. doi : 10.1371/journal.pbio.0020079 . PMC 368173. PMID 15024427 .
- ^ Kosmopoulou A, Vlassi M, Stavrakoudis A, Sakarellos C, Sakarellos-Daitsiotis M (يوليو 2006). "نظائر الخلايا التائية لمستضد ذاتي La/SSB: التنبؤ بناءً على نمذجة التماثل لـ HLA-DQ2/DQ7 مع مركب ببتيد الأنسولين-B/HLA-DQ8". J Comput Chem . 27 (9): 1033– 44. doi :10.1002/jcc.20422. PMID 16639700. S2CID 10167394.
- ^ MacKenzie JJ, Sumargo I, Taylor SA (يوليو 2006). "طفرة كاملة غامضة في ذكر يحمل نمطًا ظاهريًا كلاسيكيًا للكروموسوم X الهش". Clin. Genet . 70 (1): 39– 42. doi :10.1111/j.1399-0004.2006.00634.x. PMID 16813602. S2CID 38749866.
