عائلة مُنهي التضاعف Tus

تمثيل التركيب البلوري بالأشعة السينية لمركب بروتين Tus-Ter-DNA. (عرض Jmol للإحداثيات من [ 1 ] تظهر خيوط الحمض النووي باللونين الوردي والأخضر.)

بروتين Tus ( مادة استخدام النهاية )، المعروف أيضًا باسم بروتين ربط النهاية ، هو بروتين يرتبط بتسلسلات الإنهاء ويعمل كمضاد للهيليكاز عند ملامسته للهيليكاز المتقدم. [ 2 ] يوقف بروتين Tus المرتبط حركة بوليميراز الحمض النووي بشكل فعال . [ 2 ] يساعد Tus في إنهاء تضاعف الحمض النووي في بدائيات النوى . [ 2 ] يعمل Tus عن طريق الارتباط بتسلسلات إنهاء تضاعف الحمض النووي ، وبالتالي يمنع مرور شوكات التضاعف. [ 3 ] تتأثر كفاءة الإنهاء بتقارب بروتين معين مع تسلسل الإنهاء .

في بكتيريا الإشريكية القولونية ( P16525 )، يرتبط بروتين Tus بعشرة مواقع متقاربة مُشفّرة في الكروموسوم ، مع أن ستة منها فقط يُرجّح أن تُشارك في إنهاء عملية التضاعف. يتكون كل موقع من 23 زوجًا قاعديًا. تُسمى هذه المواقع بمواقع Ter ، ويُرمز لها بـ TerA ، TerB ، ...، TerG . هذه المواقع غير متناظرة، فعندما يصطدم مُركّب Tus-Ter (بروتين Tus مرتبط بموقع Ter) بشوكة التضاعف من اتجاهٍ ما، ينفصل المُركّب وتستمر عملية التضاعف (مُتساهل). أما عند الاصطدام من الاتجاه الآخر، يُشكّل مُركّب Tus-Ter حاجزًا حركيًا أكبر بكثير، مما يُوقف عملية التضاعف (غير مُتساهل). تتجه مواقع Ter المتعددة في الكروموسوم بحيث تتوقف شوكتا التضاعف المُتعاكستان في منطقة الإنهاء المطلوبة. [ 4 ]

تستخدم بكتيريا Bacillus subtilis بروتين إنهاء التضاعف (RTP) بدلاً من بروتين Tus. ينتمي هذا البروتين إلى عائلة بروتينية مختلفة، ويستخدم بنية مختلفة للارتباط بالحمض النووي DNA: InterPro : IPR003432 . 

بناء

يحتوي بروتين Ter على نطاقين. يتكون النطاق الطرفي N من حلزونات ألفا وصفيحة بيتا وثلاث حلقات. أما النطاق الطرفي C فيتكون من حلزونين ألفا وصفيحة بيتا واحدة . [ 5 ] وبدلاً من ذلك، يقسم CATH البنية إلى نطاق كبير يمتد على كامل التسلسل وإضافة صغيرة تبرز وتطوى كنطاق منفصل. [ 6 ]

وظيفة

يلعب طرف تضاعف الحمض النووي (Ter) دورًا في منع تقدم شوكة تضاعف الحمض النووي . [ 7 ] لذلك، يرتبط بروتينٌ مُرتبطٌ بموقع طرف تضاعف الحمض النووي بهذا الموقع، مما يُساعد على منع شوكة تضاعف الحمض النووي. يوجد جينان يتحكمان في نشاط الارتباط بطرف التضاعف، وهما tau و Tus . [ 3 ]

للمزيد من القراءة

  • "تفاعل بروتين إنهاء تضاعف الإشريكية القولونية (Tus) مع الحمض النووي: نموذج مستمد من دراسات ارتباط الحمض النووي للبروتينات المتحولة بواسطة رنين البلازمون السطحي." [ 8 ]
  • "إنهاء التضاعف في الإشريكية القولونية: بنية ونشاط مضاد الهيليكاز لمركب Tus-Ter." [ 9 ]
  • "مصيدة فئران جزيئية تحدد قطبية إنهاء تضاعف الحمض النووي في بكتيريا الإشريكية القولونية." [ 4 ]
  • "عزل وتوصيف طفرات Tus، وهو بروتين توقف التضاعف في Escherichia coli." [ 10 ]
  • "الخصائص الفيزيائية الحيوية لبروتين Tus، وهو بروتين توقف التضاعف في بكتيريا الإشريكية القولونية." [ 11 ]
  • "بنية بروتين إنهاء التضاعف المرتبط بالحمض النووي." [ 1 ]

مراجع

  1. 1 2 كامادا، ك.؛ هوريوكي، ت.؛ أوسومي، ك.؛ شيماموتو، ن.؛ موريكاوا، ك. (1996). "بنية بروتين مُنهي التضاعف المرتبط بالحمض النووي". نيتشر . 383 (6601): 598-603 . Bibcode : 1996Natur.383..598K . doi : 10.1038/383598a0 . PMID 8857533 . 
  2. 1 2 3 سلونكزوسكي، جوان، وجون واتكينز. فوستر. علم الأحياء الدقيقة: علم متطور. نيويورك: دبليو دبليو نورتون و، 2009. مطبوع.
  3. 1 2 هيداكا م، كوباياشي ت، تاكيناكا س، تاكيا ه، هوريوكي ت (ديسمبر 1989). "تنقية بروتين رابط لموقع نهاية تضاعف الحمض النووي (ter) في الإشريكية القولونية وتحديد الجين البنيوي" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 264 (35): 21031-7 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)30040-7 . PMID 2687269 . 
  4. مولكير، م.؛ شيفر، ب.؛ أوكلي، أ.؛ كروس، هـ.؛ نيلون، س.؛ هيل، ت.؛ ديكسون، ن. (2006). " مصيدة جزيئية تحدد قطبية إنهاء تضاعف الحمض النووي في الإشريكية القولونية" . الخلية . 125 ( 7): 1309-1319 . doi : 10.1016/j.cell.2006.04.040 . PMID 16814717 . 
  5. كامادا ك، هوريوكي ت، أوسومي ك، شيماموتو ن، موريكاوا ك (1996). "بنية بروتين مُنهي التضاعف المرتبط بالحمض النووي". نيتشر . 383 (6601): 598-603 . Bibcode : 1996Natur.383..598K . doi : 10.1038/383598a0 . PMID 8857533 . 
  6. "TED: موسوعة النطاقات" . ted.cathdb.info .
  7. هيداكا م، كوباياشي ت، هوريوكي ت (1991). "موقع إنهاء تضاعف الحمض النووي المكتشف حديثًا، TerE، على كروموسوم الإشريكية القولونية" . مجلة علم البكتيريا . 173 (1): 391-393 . doi : 10.1128/jb.173.1.391-393.1991 . PMC 207198. PMID 1824765 .  
  8. نيلون؛ براون، إس إي؛ كراليسيك، إيه في؛ مايلز، سي إس؛ لوف، سي إيه؛ ديكسون، إن إي (2000). "تفاعل بروتين إنهاء تضاعف الحمض النووي (Tus) في بكتيريا الإشريكية القولونية مع الحمض النووي: نموذج مستمد من دراسات ارتباط الحمض النووي للبروتينات الطافرة بواسطة رنين البلازمون السطحي" (ملف PDF) . الكيمياء الحيوية . 39 (39): 11989-11999 . doi : 10.1021/bi001174w . PMID 11009613 . 
  9. نيلون، سي.؛ كراليسيك، إيه في؛ هيل، تي إم؛ ديكسون، إن إي (2005). "إنهاء التضاعف في الإشريكية القولونية: بنية ونشاط مضاد الهيليكاز لمركب Tus-Ter" . مراجعات علم الأحياء الدقيقة والبيولوجيا الجزيئية . 69 (3): 501-26 . doi : 10.1128/MMBR.69.3.501-526.2005 . PMC 1197808. PMID 16148308 .  
  10. سكوكوتاس؛ وروبلسكي، م.؛ هيل، ت.م. (1994). "عزل وتوصيف طفرات بروتين Tus، وهو بروتين تثبيط تضاعف الحمض النووي في بكتيريا الإشريكية القولونية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 269 (32): 20446-20455 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)32013-6 . PMID 8051142 . 
  11. كوسكون-آري؛ سكوكوتاس، أ.؛ مو، ج. ر.؛ هيل، ت. م. (1994). "الخصائص الفيزيائية الحيوية لبروتين Tus، وهو بروتين تثبيط تضاعف بكتيريا الإشريكية القولونية" . مجلة الكيمياء البيولوجية . 269 (6): 4027-4034 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)41737-6 . PMID 8307958 .