UFM1

يُعدّ مُعدِّل طي اليوبيكويتين 1 ، المعروف أيضًا باسم UFM1 ، بروتينًا يتم ترميزه في البشر بواسطة جين UFM1 . ^[⁵^]^[⁶^]

يُعدّ UFM1 بروتينًا شبيهًا باليوبيكويتين ، يرتبط بالبروتينات المستهدفة بواسطة إنزيم التنشيط الشبيه بـ E1، UBA5 ، وإنزيم الاقتران الشبيه بـ E2، UFC1 . ^{[ 6 ]} تُعرف هذه العملية غالبًا باسم UFMylation . ^{[ 7 ]}

وظيفة

يشترك بروتين UFM1 في العديد من الخصائص مع اليوبيكويتين (Ub) والبروتينات الأخرى الشبيهة باليوبيكويتين (UBLs). يتميز UFM1 ببنية ثلاثية مشابهة لليوبيكويتين، ولكنه يفتقر إلى أي تشابه واضح في التسلسل . يُصنّع UFM1 على هيئة طليعة غير نشطة (pro-Ufm1) تحتوي على حمضين أمينيين إضافيين بعد حمض الجلايسين المحفوظ. آلية اقتران UFM1 مشابهة لآلية اقتران اليوبيكويتين. يحتوي UFM1 الناضج على جلايسين مكشوف في الطرف الكربوكسيلي، وهو ضروري لتنشيطه لاحقًا بواسطة بروتين E1 الخاص به (Uba5). تؤدي خطوة التنشيط هذه إلى تكوين رابطة ثيوإستر عالية الطاقة في وجود ATP. بعد ذلك، يُنقل UFM1 إلى إنزيمه الشبيه بـ E2 (Ufc1) عبر رابطة ثيوإستر مماثلة مع السيستين في الموقع النشط لـ E2. يرتبط بروتين Ufm1 بمجموعة متنوعة من البروتينات المستهدفة، ويُشكّل معقدات مع بروتينات لم تُحدد بعد. لذا، يُفترض وجود إنزيمات E3 ليغاز (لم يُحدد أي منها حتى الآن) لإتمام الخطوة الأخيرة في ارتباط Ufm1 بالأهداف ذات الصلة. كما أن تعديل البروتينات بواسطة Ufm1 قابل للعكس. وقد تم تحديد نوعين جديدين من بروتيازات السيستين حتى الآن ( UFSP1 و UFSP2 ) اللذان يقومان بفصل بروتين Ufm1-ببتيد المدمج من الطرف الكربوكسيلي، كما يُزيلان Ufm1 من المركبات الخلوية الداخلية الأصلية. لا تُظهر هذه البروتيازات أي تشابه واضح مع إنزيمات إزالة ارتباط اليوبيكويتين. جميع البروتينات المسؤولة عن ارتباط Ufm1 (Uba5 وUfc1 وUfm1) محفوظة في الحيوانات والنباتات (ولكن ليس في الخميرة)، مما يُشير إلى أدوار مهمة لها في الكائنات متعددة الخلايا. لم يُعرف بعد الدور الدقيق لتعديل Ufm1 في الجسم الحي ، ^[⁸^] ولكن يبدو أن الهدف الأساسي هو uL24/RPL26 في الخلايا البشرية. ^[⁷^]

مراجع

1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000120686 – Ensembl ، مايو 2017
1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000027746 – Ensembl ، مايو 2017
↑ "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
↑ "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .
↑ "Entrez Gene: UFM1 ubiquitin-fold modifier 1" .
1 2 كوماتسو م، تشيبا ت، تاتسومي ك، إيمورا س، تانيدا إ، أوكازاكي ن، وآخرون . (مايو 2004). " نظام جديد لربط البروتين بـ Ufm1، وهو مُعدِّل لطيّ اليوبيكويتين" . مجلة EMBO . 23 (9): 1977-1986 . doi : 10.1038/sj.emboj.7600205 . PMC 404325. PMID 15071506 .
1 2 والتشاك سي بي، ليتو دي إي، تشانغ إل، ريبي سي، مولر آر واي، داروزا بي إيه، وآخرون . (يناير 2019). "البروتين الريبوسومي RPL26 هو الهدف الرئيسي لعملية UFMylation" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 116 (4): 1299-1308 . doi : 10.1073/pnas.1816202116 . PMC 6347690. PMID 30626644 .
↑ "نظرة عامة على برنامج بوسطن بيوكيم UFM1" . مؤرشف من الأصل في 15 أكتوبر 2007. تم الاطلاع عليه في 21 مايو 2008 .

للمزيد من القراءة

تشانغ كيو إتش، يي إم، وو إكس واي، رين إس إكس، تشاو إم، تشاو سي جيه، وآخرون (أكتوبر 2000). "استنساخ وتحليل وظيفي للحمض النووي المكمل (cDNA) ذي الأطر المفتوحة للقراءة لـ 300 جين غير محدد سابقًا، معبر عنها في الخلايا الجذعية/الخلايا السلفية المكونة للدم CD34+" . أبحاث الجينوم . 10 (10): 1546-1560 . doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934. PMID 11042152 .
يو واي، تشانغ سي، تشو جي، وو إس، كو إكس، وي إتش، وآخرون . (أغسطس 2001). "تحليل التعبير الجيني في كبد الجنين البشري وتحديد الجينات الخاصة بالأنسجة والمراحل النمائية من خلال تجميع بيانات التعبير الجيني والاستنساخ الفعال لنسخ الحمض النووي التكميلي كاملة الطول" . أبحاث الجينوم . 11 (8): 1392-1403 . doi : 10.1101/gr.175501 . PMC 311073. PMID 11483580 .
كوماتسو م، تشيبا ت، تاتسومي ك، إيمورا س، تانيدا إ، أوكازاكي ن، وآخرون . (مايو 2004). "نظام جديد لربط البروتين بـ Ufm1، وهو مُعدِّل لطيّ اليوبيكويتين" . مجلة EMBO . 23 (9): 1977-1986 . doi : 10.1038/ sj.emboj.7600205 . PMC 404325. PMID 15071506 .
ساساكاوا إتش، ساكاتا إي، ياماغوتشي واي، كوماتسو إم، تاتسومي ك، كومينامي إي، وآخرون . (أبريل 2006). “بنية الحل وديناميكيات Ufm1، معدل يوبيكويتين 1”. الاتصالات البحثية البيوكيميائية والفيزيائية الحيوية . 343 (1): 21-26 . دوى : 10.1016/j.bbrc.2006.02.107 . بميد 16527251 .
إيوينغ آر إم، تشو بي، إليسما إف، لي إتش، تايلور بي، كليمي إس، وآخرون (2007). " رسم خرائط واسعة النطاق لتفاعلات البروتين-بروتين البشري باستخدام مطياف الكتلة" . بيولوجيا الأنظمة الجزيئية . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948. PMID 17353931 .

روابط خارجية

نظرة عامة على جميع المعلومات الهيكلية المتاحة في PDB لـ UniProt : P61960 (Human Ubiquitin-fold modifier 1) في PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSG00000120686 – Ensembl ، مايو 2017

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: إصدار Ensembl رقم 89: ENSMUSG00000027746 – Ensembl ، مايو 2017

[3] "مرجع PubMed البشري:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .

[4] "مرجع PubMed للفأر:" . المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، المكتبة الوطنية الأمريكية للطب .

[entrez-5] "Entrez Gene: UFM1 ubiquitin-fold modifier 1" .

[Komatsu_2004-6] 1 2 كوماتسو م، تشيبا ت، تاتسومي ك، إيمورا س، تانيدا إ، أوكازاكي ن، وآخرون . (مايو 2004). " نظام جديد لربط البروتين بـ Ufm1، وهو مُعدِّل لطيّ اليوبيكويتين" . مجلة EMBO . 23 (9): 1977-1986 . doi : 10.1038/sj.emboj.7600205 . PMC 404325. PMID 15071506 .

[Walczak_Leto_Zhang_Riepe_pp._1299–1308-7] 1 2 والتشاك سي بي، ليتو دي إي، تشانغ إل، ريبي سي، مولر آر واي، داروزا بي إيه، وآخرون . (يناير 2019). "البروتين الريبوسومي RPL26 هو الهدف الرئيسي لعملية UFMylation" . وقائع الأكاديمية الوطنية للعلوم في الولايات المتحدة الأمريكية . 116 (4): 1299-1308 . doi : 10.1073/pnas.1816202116 . PMC 6347690. PMID 30626644 .

[8] "نظرة عامة على برنامج بوسطن بيوكيم UFM1" . مؤرشف من الأصل في 15 أكتوبر 2007. تم الاطلاع عليه في 21 مايو 2008 .

[

[

[ 7 ]

[